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總校閱序
在過去幾年,醫學分子檢驗技術的發展,有多項技術已廣泛應用於各
大醫院及生技公司,其結果可作為病人疾病之診斷、治療及預防之參考。如
海洋性貧血、血友病、蠶豆症及唐氏症的診斷及篩選,腫瘤標誌的診斷及篩
選,結核分枝桿菌及細菌抗藥性基因的快速診斷等,都已有良好成效。目前
國內各大專院校在生科及醫農相關科系皆有開授分子檢驗及生物技術的相關
課程,雖然國內外已有多本撰寫得相當好的生物技術中英文書籍,九十二年
教育部顧問室在生物技術科技教育改進計畫中也曾出版《分子檢驗》專書,
然而分子檢驗技術發展快速,國內亟需一本最新醫學分子檢驗初階的中文教
科書。
遺傳疾病、腫瘤標誌及感染性疾病是目前醫學分子檢驗最重要的領域,
也已廣泛的應用於疾病的診斷、治療及預防。本書共邀請 34 位國內各領域
專家學者一起參與撰寫,書中涵蓋四大領域:分子檢驗技術、遺傳疾病、腫
瘤標誌及感染性疾病之分子檢驗,是引領初學者的重要學習指南。本書的特
點,除以淺顯易懂的文字表達外,所採用的圖片均自行繪製、拍攝或由國內
各領域專家提供,彌足珍貴。相關章節的討論及參考文獻也大多引用國內學
者的學術論文期刊,讓初學者了解台灣的現狀。同時本書很多章節內容以精
簡的方式書寫,並不涵蓋所有醫學分子檢驗的項目,而以常用之分子檢驗為
主。有興趣的學習者可以善用參考文獻,進一步查閱。本書除提供醫技系初
學者外,也適合醫學系學生、生命科學相關科系學生、生技研發人員、醫師
及相關醫護人員學習使用。
本書能如期出版,首先要感謝孫光蕙教授、趙崇義教授及李宏謨教授
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的鼎力支持,在他們的邀約下獲得多位老師慨允共襄勝舉。此外,楊燿榮醫
師、顏經洲醫師、周如文研究員、蘇玲慧老師提供寶貴的圖片,五南圖書出
版公司在編輯上的協助,在此一併感謝。本書雖經再三修正,仍恐有疏漏之
處,煩請各位先進給予指正。
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總校閱簡介
吳俊忠
• 現職
成功大學特聘教授
成功大學醫學院副院長
成功大學醫學院分子醫學研究所教授
成功大學醫學院醫學檢驗生物技術學系教授
成功大學醫學院附設醫院病理部醫檢師
教育部生物及醫學科技人才培育先導型計畫醫衛分子檢驗組召集人
國家衛生研究院臨床研究組兼任研究員
• 學歷
美國賓州費城天普大學微生物暨免疫研究所博士
美國賓州費城湯姆斯傑佛遜大學臨床微生物研究所碩士
美國賓州費城湯姆斯傑佛遜大學醫事技術系學士
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主編者簡介
吳俊忠
• 現職
成功大學特聘教授
成功大學醫學院副院長
成功大學醫學院分子醫學研究所教授
成功大學醫學院醫學檢驗生物技術學系教授
成功大學醫學院附設醫院病理部醫檢師
教育部生物及醫學科技人才培育先導型計畫醫衛分子檢驗組召集人
國家衛生研究院臨床研究組兼任研究員
• 學歷
美國賓州費城天普大學微生物暨免疫研究所博士
美國賓州費城湯姆斯傑佛遜大學臨床微生物研究所碩士
美國賓州費城湯姆斯傑佛遜大學醫事技術系學士
李宏謨
• 現職
中臺科技大學校長
台北醫學大學醫學檢驗暨生物技術學系教授
• 學歷
美國田納西大學生化學博士
孫光蕙
• 現職
陽明大學醫學生物技術暨檢驗學系教授
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教育部醫學教育委員會醫技教育組召集人
• 學歷
陽明大學微生物暨免疫學研究所博士
陽明醫學院微生物暨免疫學研究所碩士
趙崇義
• 現職
長庚大學醫學生物技術暨檢驗學系教授兼研發長
• 學歷
美國加州大學戴維斯分校生化學博士
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作者簡介
王聖帆
• 現職
陽明大學博士後研究
• 學歷
陽明大學醫學生物技術暨檢驗學系博士
朱大成
• 現職
長庚大學醫學生物技術暨檢驗學系副教授
• 學歷
美國阿拉巴馬州立大學伯明罕分校醫學遺傳博士
江倪全
• 現職
成功大學醫學檢驗生物技術學系博士後研究員
• 學歷
成功大學基礎醫學研究所博士
成功大學微生物及免疫學研究所
吳俊忠
• 現職
成功大學特聘教授
成功大學醫學院副院長
成功大學醫學院分子醫學研究所教授
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成功大學醫學院醫學檢驗生物技術學系教授
成功大學醫學院附設醫院病理部醫檢師
教育部生物及醫學科技人才培育先導型計畫醫衛分子檢驗組召集人
國家衛生研究院臨床研究組兼任研究員
• 學歷
美國賓州費城天普大學微生物暨免疫研究所博士
美國賓州費城湯姆斯傑佛遜大學臨床微生物研究所碩士
美國賓州費城湯姆斯傑佛遜大學醫事技術系學士
李宏謨
• 現職
中臺科技大學校長
台北醫學大學醫學檢驗暨生物技術學系教授
• 學歷
美國田納西大學生化學博士
吳芳姿
• 現職
疾病管制局研究檢驗中心副研究員
• 學歷
陽明大學醫學生物技術暨檢驗學系博士班進修中
李建宏
• 現職
長庚大學醫學生物技術暨檢驗學系兼任講師
長庚醫療財團法人林口長庚紀念醫院檢驗醫學科教學醫檢師
• 學歷
台灣大學毒理學研究所碩士
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何鴻耀
• 現職
長庚大學醫學生物技術暨檢驗學系助理教授
• 學歷
國防醫學院生命科學研究所博士
林文昌
• 現職
中央研究院生醫所副研究員
• 學歷
美國凱斯西儲大學分子生物學及微生物學博士
林佳霓
• 現職
台灣大學醫學檢驗暨生物技術學系博士後研究員
• 學歷
台灣大學醫學檢驗暨生物技術學系博士
林淑容
• 現職
中原大學生物科技系助理教授
• 學歷
台灣大學分子醫學研究所博士
林淑華
• 現職
台灣大學醫學檢驗暨生物技術學系教授
• 學歷
美國北卡羅萊納大學教堂山分校博士
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台灣大學微生物研究所碩士
林景堉
• 現職
台北醫學大學醫學檢驗暨生物技術學系助理教授
• 學歷
台灣大學農業化學研究所生化博士
施浤彰
• 現職
中國醫藥大學附設醫院檢驗醫學部分子醫學科醫檢師
• 學歷
中興大學獸醫學系獸醫學博士
中興大學生命科學院理學碩士
孫光蕙
• 現職
陽明大學醫學生物技術暨檢驗學系教授
教育部醫學教育委員會醫技教育組召集人
• 學歷
陽明大學微生物暨免疫學研究所博士
陽明醫學院微生物暨免疫學研究所碩士
陳佑誠
• 現職
台塑生醫醫學技術事業部顧問
• 學歷
台灣大學農業化學所微生物組博士
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張長泉
• 現職
成功大學醫學院醫學檢驗生物技術學系教授
• 學歷
台灣大學農業化學系生化組博士
台灣大學醫學院生化學研究所碩士
陳盈汝
• 現職
長庚大學醫學生物技術暨檢驗學系博士後研究員
• 學歷
長庚大學生物醫學研究所博士
張建國
• 現職
高雄醫學大學附設醫院檢驗醫學部主任
• 學歷
高雄醫學院醫學系學士
陳桂添
• 現職
長庚大學醫學生物技術暨檢驗學系博士後研究員
• 學歷
交通大學生物科技研究所博士
許蕙玲
• 現職
國防醫學院助理研究員
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• 學歷
陽明大學醫學生物技術暨檢驗學系博士班進修中
張懿欣
• 現職
中山醫學大學醫學檢驗暨生物技術學系教授兼系主任
• 學歷
陽明大學微生物暨免疫學研究所博士
高雄醫學大學醫學技術學系學士
黃智生
• 現職
陽明大學醫學生物技術暨檢驗學系副教授
• 學歷
美國德州大學蓋維斯頓醫學分校實驗病理學博士
楊正芬
• 現職
行政院衛生署疾病管制局研究檢驗中心病媒病毒及立克次體實驗室助理研究員
• 學歷
陽明大學醫學生物技術暨檢驗學系博士班進修中
楊雅倩
• 現職
台灣大學醫學檢驗暨生物技術學系助理教授
• 學歷
台灣大學醫學院微生物學研究所博士
台灣大學醫學院微生物學研究所碩士
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台灣大學醫事技術學系學士
詹爾昌
• 現職
長庚大學醫學生物技術暨檢驗學系教授
• 學歷
美國普度大學生物技術博士
趙崇義
• 現職
長庚大學醫學生物技術暨檢驗學系教授兼研發長
• 學歷
美國加州大學戴維斯分校生化學博士
鄭恩加
• 現職
長庚大學醫學生物技術暨檢驗學系教授
• 學歷
美國德州大學安德生癌症中心腫瘤生物學博士
鄧麗珍
• 現職
台灣大學醫學院醫學檢驗暨生物技術學系教授兼主任
台灣微生物學會常務理事
• 學歷
台灣大學微生物學研究所碩士
台灣大學醫事技術學系學士
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蕭明裕
• 現職
弘光科技大學醫護學院護理系(所)副教授兼基礎醫學組總召集人
• 學歷
中山醫學大學醫學研究所博士
高雄醫學大學醫學研究所碩士
高雄醫學大學醫學技術學系學士
鍾明怡
• 現職
陽明大學生命科學系暨基因體科學研究所副教授
• 學歷
美國明尼蘇達大學病理生物博士(人類遺傳)
美國明尼蘇達大學臨床實驗科學碩士(臨床生化)
台灣大學醫事技術學系學士
羅時燕
• 現職
慈濟大學醫學檢驗生物技術學系教授兼主任
• 學歷
美國南加州大學分子微生物免疫研究所博士
羅梅真
• 學歷
台北醫學大學醫學科學研究所博士候選人
蘇怡寧
• 現職
台灣大學醫學院臨床基因醫學研究所副教授
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台灣大學醫學院附設醫院基因醫學部暨婦產部主治醫師
台灣大學醫學院附設醫院基因醫學部分子遺傳暨細胞遺傳研究室主持人
• 學歷
台灣大學醫學院臨床醫學研究所博士
台灣大學醫學系學士
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目錄
第一單元 分子檢驗技術(孫光蕙教授 主編)
第一章 分子檢驗基本技術 3
(吳芳姿、王聖帆、許蕙玲 、楊正芬、黃智生、孫光蕙 著)
等位基因特異性寡核 酸雜交 5
原位螢光雜交法 5
脈衝式電泳分析 8
限制片段長度多形性 10
聚合 連鎖反應 13
單股結構多形性 19
增幅阻礙突變系統 22
增幅限制 切位點 23
突變分辨聚合 連鎖反應 25
化學切割錯誤的鹼基 26
變性梯度膠體電泳法 28
應用核酸序列的放大反應 30
轉錄介導的擴增法 32
連接 連鎖反應 35
分枝 DNA 訊號放大技術 39
DNA 甲基化分析技術 41
總結 50
學習評估 50
參考文獻 50
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第二章 微衛星標記分析與應用(楊雅倩 著) 59
前言 61
何謂微衛星標記 61
微衛星的基因變異 63
微衛星標記分析 65
微衛星標記在生物醫學上的用途 67
總結 68
學習評估 68
參考文獻 68
(蕭明裕、張懿欣 著)
前言 73
單一核 酸多型性 73
SNP 檢測技術之基礎原理 74
SNP 檢測技術 77
SNP 在醫學領域的應用 86
學習評估 89
參考文獻 89
第四章 生物資訊在分子檢驗之應用(林文昌 著) 93
前言 95
生物資訊學與基因體計畫資料庫 95
資訊搜尋與序列比對 97
序列比對生物資訊工具之分子檢驗實例 102
學習評估 107
參考文獻 107
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第五章 生物晶片(陳佑誠、陳桂添、詹爾昌 著) 109
生物晶片的簡介 111
生物晶片的種類 111
生物晶片製造與偵測原理 116
生物晶片的應用 119
學習評估 124
參考文獻 124
第二單元 基因疾病之分子檢驗(趙崇義教授 主編)
(李建宏、朱大成、施浤彰、張建國 著)
甲型海洋性貧血簡介 131
台灣常見甲型海洋性貧血基因型 131
甲型海洋性貧血基因型的偵測方法 133
甲型海洋性貧血帶因者的篩檢流程 133
產前診斷甲型海洋性貧血 135
乙型海洋性貧血簡介 136
血紅素的形成及其功能 137
乙型海洋性貧血之基因診斷 138
乙型變異血紅素 146
學習評估 147
參考文獻 150
血液凝固的機轉 157
血友病 157
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第八因子蛋白質及基因 158
A 型血友病患之基因異常及診斷 159
第九因子蛋白質及基因 164
B 型血友病患之基因異常及診斷 165
總結 166
學習評估 166
參考文獻 167
唐氏症簡介 171
產前篩檢唐氏症 171
現行細胞遺傳學方法之唐氏症診斷 172
分子診斷唐氏症 180
學習評估 180
參考文獻 180
(何鴻耀、趙崇義 著)
前言 185
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病例 206
學習評估 206
參考文獻 207
第三單元 腫瘤標誌之分子檢驗(李宏謨教授 主編)
前言 219
腫瘤標誌臨床效益的評估 219
腫瘤標誌的發展歷史 222
血液中的蛋白類腫瘤標誌 223
血液中的核酸類腫瘤標誌 229
學習評估 230
參考文獻 230
前言 233
致癌基因的發現 233
原型致癌基因的活化 234
致癌基因的分類 235
抑癌基因 242
學習評估 247
參考文獻 247
前言 251
組織的腫瘤標誌各論 251
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學習評估 268
參考文獻 268
(陳盈汝、鄭恩加 著)
蛋白質體學導言 271
二維電泳分析 271
定量二維電泳分析 273
磁珠親和分離法 274
腫瘤蛋白標誌的研發現況 281
學習評估 282
參考文獻 282
前言 287
蛋白質晶片的原理 287
蛋白質晶片的種類 290
蛋白質晶片的檢測平台 295
蛋白質晶片應用於癌症的研究與檢測 298
總結 300
學習評估 300
參考文獻 300
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第四單元 感染性疾病之分子檢驗(吳俊忠教授 主編)
前言 307
聚合 連鎖反應或其延伸技術 310
探針雜交反應法 311
前言 313
真菌傳統鑑定方法 314
血清學鑑定方法 315
寡核 酸微陣列晶片技術 318
學習評估 319
參考文獻 319
前言 329
常用於檢測病毒感染的分子鑑定法 329
常見病毒感染的檢測 332
總結 349
學習評估 350
參考文獻 350
前言 357
細菌抗藥基因檢測 357
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總結 370
學習評估 370
參考文獻 370
前言 383
基因型分型法 383
聚合 連鎖反應相關分型法 392
核酸定序相關之分型法 401
總結 402
學習評估 403
參考文獻 403
索引 421
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第二章 微衛星標記分析與應用
(Analysis and application of
microsatellite markers)
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本章大綱 學習目標
前言 1. 微衛星標記的特性及其發生多形性的
散布重複DNA 機轉。
串聯重複DNA 2. 微衛星分析方法。
何謂微衛星標記(microsatellite markers) 3. 微衛星標記在生物醫學上的用途。
微衛星的基因變異(genetic alteration)
微衛星不穩定性
微衛星失異合性
微衛星標記分析
微衛星標記在生物醫學上的用途
人類身分及親源鑑定
疾病相關基因的搜尋
腫瘤診斷與治療上的應用
總結
學習評估
參考文獻
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第二章 微衛星標記分析與應用 61
前言 何謂微衛星標記(Microsatellite
markers)
人類基因體(genome)約含有 30 億鹼
基對(3×109 base pairs, bp)的遺傳物質, 微衛星,亦稱為短串聯重複 (short
其中,具「功能性的 DNA 序列」(包 tandem repeats, STRs; simple sequence repeats,
括:25,000∼30,000 個基因及其轉錄調控 SSRs) 3 ,其是由 1∼5 個核 酸為重複
的序列、維持染色體結構與完整性的區 單位的重複性序列(圖 2-1),例如雙
域等)約占1/4,而真正會轉譯成蛋白質 核 酸(dinucleotide)之 CA 重複序列:
的序列則僅約 2∼3%;反之,人類染色 (CA) n ,n 即是代表其重複次數 (repeat
體中存在大量的重複 DNA 序列(repetitive number), 在 5∼100 之間。一般而言,
DNA sequences),約占整個人類基因體的 微衛星常見的重複次數在 10 次以下,如
1
55%,其又可分為兩類 : 重複在 10 次以上,則此微衛星容易出現
「長度」的多形性(polymorphism),也就
散布重複 DNA(Interspersed repeti- 是說其 n 值在不同個體間可能不同,即有
tive DNA) 所謂「不同的對偶基因(alleles)」。參核
約占人類基因體 45%,此種重複 酸(trinucleotide)重複序列有 CAG, CGG,
DNA 乃一個一個地分布在各染色體中, CTG 等,而肆核 酸(tetranucleotide)重複
最著名的是靈長類動物特有的 Alu 重複 序列有 AGAT, AAAG, GATA 等。目前對人
(Alu repeat),此一由約 280 bp 組成的重 類微衛星的命名有一套標準方式,例如:
複 DNA 在人類基因體中重複高達約 75 萬 D4S3360,4 代表其位於第四條染色體,
次,平均每 4 kb(kilo base pairs)就有一 而 3360 則為其獨特之代號。
個 Alu 重複,其總長度約占整個基因體的 原核細胞及真核細胞皆有微衛星,
5%。 而微衛星 DNA 乃廣泛地分布於生物體
的基因體中。目前,人類基因體已鑑定
串聯重複 DNA(Tandem repetitive 出約 3 萬個微衛星,約占人類基因體的
DNA) 3%4,其多數無生物功能,但有些微衛星
約占人類基因體 10%,顧名思義, 可能會細微影響附近基因的表現;另外,
此類重複 DNA 乃一個接一個地聚集在 已知一些參核 酸重複與人類的疾病相
染色體的某一處,而其依每一個重複單 關,特別是已有超過 20 種不穩定的微衛
位 (repeating unit)之序列的長度及總長 星重複序列被報告與人類神經性疾病相
度,又可分為衛星 (satellites)、小衛星 關 5,例如(CAG)n 重複序列的重複次數
(minisatellites)及微衛星(microsatellites) 增加與 Huntington's disease 疾病的發生相
三種亞群重複 DNA(表 2-1)2。 關,而(CGG)n 重複次數增加則與 fragile X
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62 醫學分子檢驗
5’ CA CA CA 3’
5’ CA CA CA CA 3’
5’ CA CA CA CA CA 3’
5’ CA CA CA CA CA CA 3’
5’ CA CA CA CA CA CA CA 3’
5’ CA CA CA CA CA CA CA CA 3’
Flanking sequences
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第二章 微衛星標記分析與應用 63
5' CA CA CA CA 3'
3' GT GT GT GT GT GT GT 5'
環狀結構
(Loop structure)
CA
5' CA CA CA 3'
3' GT GT GT GT GT GT GT 5'
MLH1 PMS2
1
MSH2 MSH6
2-5
MLH1 PMS2
MSH2 MSH3
11 Y : 11 • CRC57N/CRC57
*
L T L T L T
異合子(Heterozygote)
L T
同合子(Homozygote)
圖 2-6 傳統微衛星標記分析—同位素標記及放射性自動顯像(Autoradiography)
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第二章 微衛星標記分析與應用 67
微衛星標記在生物醫學上的用途 腫瘤診斷與治療上的應用
目前對於癌發生(carcinogenesis)的
遺傳學理論有一個共同的看法:腫瘤是由
人類身分及親源鑑定 於體細胞經遺傳而來,或是自然發生之基
微衛星是非常好的遺傳標記(genetic 因突變的累積,使得細胞生長不受管制而
markers),因為它們的數目相當多,遍布 成為癌。細胞在致癌過程的初期,可能會
人類每一條染色體中,同時,比起染色體 成為一個突變者(mutator),使這個細胞
的其他位置,微衛星的重複次數有相當明 本身的遺傳性質變得不穩定,因而就可能
顯的多形性,而一個人從父親及母親所遺 根據遺傳物質(DNA)的變化來判斷癌細
傳到的同一個微衛星標記就可能是兩種不 胞。
同的對偶基因,因此使用數個不同位置的 近幾年研究發現:在遺傳性非息肉性
微衛星標記,於臨床檢驗上已作為親子鑑 大腸直腸癌 (hereditary non-polyposis
定的依據,或是看骨髓移植病人是否長出 colorectal cancer; HNPCC)及其它特發的腫
捐贈者的血液細胞,抑或白血病病人在骨 瘤中,若干微衛星標記經常發生突變,
髓移植成功後是否有復發的跡象。在法醫 此現象與癌細胞的前身是一個突變者的假
學上則可用來辨識受害者的身分或是判別 說不謀而合13。其最初是在大腸直腸癌發
可能的嫌疑犯,在近年來的幾起空難事件 現微衛星不穩定性14-16,之後,陸續在不
中亦用以鑑定罹難者的身分。於人類學方 同的腫瘤中也發現了相似的變化。目前已
面的研究,利用微衛星多形性的特性亦可 清楚地了解:遺傳性非息肉性大腸直腸癌
10
探討不同族群之間的親源關係 。 主要是 DNA 錯誤配對修復基因 hMSH2,
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68 醫學分子檢驗
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第二章 微衛星標記分析與應用 69
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70 醫學分子檢驗
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醫學分子檢驗/王聖帆等著. --一版.--臺北
市:五南, 2009.11
面; 公分
含參考書目及索引
ISBN 978-957-11-5842-6(平裝)
1. 檢驗醫學
415.12 98020631
5J32
醫學分子檢驗
總 校 閱 / 吳俊忠(66.3)
主 編 者 / 吳俊忠 李宏謨 孫光蕙 趙崇義(依姓名筆劃排序)
作 者 / 王聖帆 朱大成 江倪全 吳俊忠 李宏謨 吳芳姿
李建宏 何鴻耀 林文昌 林佳霓 林淑容 林淑華
林景堉 施浤彰 孫光蕙 陳佑誠 張長泉 陳盈汝
張建國 陳桂添 許蕙玲 張懿欣 黃智生 楊正芬
楊雅倩 詹爾昌 趙崇義 鄭恩加 鄧麗珍 蕭明裕
鍾明怡 羅時燕 羅梅真 蘇怡寧(依姓名筆劃排序)
發 行 人 / 楊榮川
總 編 輯 / 龐君豪
責任編輯 / 許杏釧 李志宏
封面設計 / 斐類設計公司
出 版 者 / 五南圖書出版股份有限公司
地 址 / 106臺 北 市 大 安 區 和 平 東 路 二 段 3 3 9 號 4 樓
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法律顧問 / 元貞聯合法律事務所 張澤平律師
出版日期 / 2 0 0 9 年 1 1 月 初 版 一 刷
定 價 / 新 臺 幣 6 8 0 元
※版權所有.欲利用本書內容,必須徵求本公司同意※
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