MICROBIOLOGIA. MUNDO MICROBIANO. TAXONOMIA.

NOMENCLATURA

Antes del descubrimiento de los microorganismos se crea que todos los seres vivos que existan eran plantas o animales, ya que se desconoca la existencia de otros tipos de transicin. Sin embargo durante el siglo XIX se comprob que los microorganismos renen propiedades de las plantas y los animales en todas las combinaciones posibles, por lo que al tratar de inclurlos en uno de los dos reinos existentes, se lograban resultados ilgicos.

En 1866, Haeckel propuso que los microorganismos se incluyeran en un reino separado, el de los Protistas, que inclua a: algas, hongos, protozoarios y bacterias. Sin embargo a mediados del siglo XX las nuevas tcnicas de microscopa electrnica, revelaron que las bacterias por su estructura celular difieren fundamentalmente de los otros tres grupos. Estos ltimos comparten con las clulas de las plantas y de los animales, la estructura de tipo evolucionada llamada eucaritica, las bacterias poseen un tipo de estructura celular mas primitiva llamada procaritica. Carl Von Linneo (1707-1778) un estudioso de la botnica nacido en Suecia y considerado el padre de la taxonoma, categoriz un enorme grupo de especies estableciendo as divisiones que las agrupaban para su estudio. Muchas de esas categoras son usadas en la actualidad. La clasificacin Linneana se basaba en el principio de que las especies de animales y vegetales eran la unidad viva menor y se agrupaban dentro de categoras superiores denominadas Gneros. Linneo llama a este tipo de agrupacin o clasificacin Nomenclatura binominal y usa el latn, lengua culta de la poca, para nombrar las diferentes especies y gneros que iba clasificando, establecindose as un lenguaje cientfico adoptado internacionalmente. Se define entonces un nuevo reino, el de los Protistas, que incluye a los microorganismos eucariotas, como las algas y los protozoos. En un cuarto reino se situarn a las bacterias y a un tipo de organismos llamados algas verdeazules o cianobacterias, por presentar clulas procariotas, es decir sin ncleo ni orgnulos definidos, el Reino Monera . Las bacterias incluyen dos grupos: Chlamydiae y Ricketsiae, que difieren de las eubacterias, en que son mas pequeas y son parsitos intracelulares obilgados. Quedaban los hongos por situar en algn gran grupo y no son plantas aunque parezcan, poseen clulas eucaritas con su ncleo y paredes celulares definidas pero carentes de pigmentos fotosintticos como los englobados en el Reino Plantae y fueron ubicados entonces en un quinto reino por el cientfico norteamericano R. H. Whittaker, denominndolo Reino Fungi , esto apenas en 1969. Finalmente, la mayor parte del mundo cientfico utiliza hoy estos cinco reinos propuesto por R.H.Whitaker para clasificar al mundo de la diversidad biolgica: Mneras, Protistas, Hongos, Plantas y Animales.

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Los virus tambin son clasificados como microorganismos, pero se incluyen en un Reino aparte, el Reino de los Virus, ya que ellos se diferencian con precisin de todas las formas celulares de vida, porque no son organismos celulares. Una partcula viral es una macromolcula qumica constituida por una molcula de cido nucleico, DNA o RNA, cubierta por una capa de protena o cpside. Existen otros microorganismos infecciosos para las plantas, los animales y el hombre, que se diferencian de todos los anteriormente mencionados. Numerosas enfermedades transmisibles de las plantas son provocadas por viroides, molculas pequeas de RNA circular. La enfermedad de la vaca loca y el prurigo lumbar de las ovejas, entre otras enfermedades, son causadas por partculas infecciosas denominadas priones , son de naturaleza proteica, y carecen de material gentico.

Taxonoma

La ciencia de clasificacin de los seres vivos recibe el nombre de taxonoma Comprende: 1- La clasificacin, que es la ordenacin de los seres vivos en grupos otaxones en funcin de semejanzas o parentesco evolutivo. 2- La nomenclatura, que se ocupa de asignar nombres a los grupos taxonmicos de acuerdo con normas establecidas. 3- La identificacin, es el proceso para determinar que un aislamiento particular pertenece a un taxn reconocido (es el lado prctico de la taxonoma). La Taxonoma, taxis= rango, atiende a desarrollar un sistema para ordenar y catalogar grupos de individuos relacionados Al preparar un sistema de clasificacin, se ubican todos los microorganismos en grupos homogneos, que a su vez pertenecen a otro grupo ms extenso siguiendo una estructura jerrquica sin superposiciones. Una categora de cualquier rango une grupos de nivel inferior en funcin de propiedades comunes. En la taxonoma bacteriana los niveles o rangos utilizados son los siguientes (en orden ascendente):

ESPECIE GNERO FAMILIA ORDEN CLASE REINO

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DOMINIO

Esta es la llamada ordenacin jerrquica, porque cada categora, en la serie descendente, agrupa un nmero cada vez mayor de unidades taxonmicas, basndose en un nmero cada vez menor de propiedades compartidas. El grupo taxonmico bsico es la especie, es un grupo de poblaciones naturales que se reproducen entre si y que estn aisladas de otros grupos desde el punto de vista de la reproduccin. Para los microbilogos,especie bacterianaes una coleccin de cepas que comparten numerosas propiedades estables y que difieren de forma significativa de otros grupos de cepas. Unacepa es una poblacin de microorganismos que desciende de un nico organismo o de un aislamiento en cultivo puro. Cada especie se asigna a un gnero, el siguiente rango de la jerarqua taxonmica. Ungnero es un grupo bien definido de una o ms especies que est claramente separado de otros gneros.

Caracterizacin de las especies

De un modo ideal, las especies deberan caracterizarse basndose en la descripcin completa de sus fenotipos o incluso de sus genotipos. La prctica taxonmica no llega a estos ideales ya que en la mayor parte de los grupos de seres vivos la descripcin del fenotipo es fragmentaria y la caracterizacin del genotipo es incompleta. Los caracteres fenotpicos de ms fcil determinacin son los estructurales y anatmicos que pueden observarse directamente. La clasificacin de las bacterias constituye una excepcin dada su extrema simplicidad estructural, esto hace que se disponga de un rasgo demasiado reducido de caracteres para poder hacer una caracterizacin adecuada. Por ello, los taxnomos bacterianos se vieron forzados a buscar otros tipos de propiedades, bioqumicas, fisiolgicas, ecolgicas, para aadir a las propiedades estructurales. La clasificacin de las bacterias se basa en atributos funcionales, la mayor parte de las bacterias slo pueden identificarse por lo que hacen y no simplemente por su apariencia. Esto representa un problema adicional para el taxnomo bacteriano, el estudio de estas propiedades funcionales conlleva a la realizacin de experimentos, por lo tanto ste nunca podr estar seguro de haber llevado a cabo los experimentos adecuados con fines taxonmicos: podra ocurrir que omitiera la realizacin de ciertos experimentos que indicaran la existencia de agrupamientos significativos dentro de una coleccin de cepas. Sin embargo, est tomando auge una nueva alternativa que podra resolver pronto el problema, son las tcnicas moleculares para la caracterizacin genotpica bacteriana, que proporcionan una posible base objetiva para la definicin de especie bacteriana.

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Nomenclatura

De acuerdo con la convencin que establece el sistema binomial de nomenclatura,ideado por Linneo,cada especie biolgica lleva un nombre, en latn, que consiste en dos palabras: la primera indica el gnero al que pertenece la especie, y la segunda palabra indica la especie de ese gnero: por ejemplo, Escherichia coli, Escherichia (nombre genrico gnero) y coli (nombre especfico especie). La primera palabra se escribe con mayscula inicial, y corresponde al gnero al que pertenece el organismoLa segunda palabra se escribe con minscula, y corresponde a la especie. Existe slo un nombre correcto para un microorganismo o para cualquier organismo vivo Deben rechazarse nombres que ocasionen error o confusin.

Clasificacin filogentica

El reconocimiento del hecho de la evolucin biolgicas aadi una nueva dimensin al concepto de la clasificacin natural. Para los bilogos del siglo XVIII los agrupamientos basados en la tipologa expresaban simplemente parecidos, sin embargo para los postdarwinianos, indicaron relaciones. En el siglo XIX el concepto de sistema natural cambi y pas a ser el agrupamiento de los organismos en funcin de sus afinidades evolutivas. "La jerarqua taxonmica, en algn sentido, llego a ser el reflejo de un rbol genealgico y la taxonoma adquiri de repente una nueva meta: la reestructuracin de las jerarquas para acomodarlas a relaciones evolutivas". Este sistema taxonmico recibe el nombre de clasificacin filogentica

Nuevos sistemas de clasificacin taxonmica

El desarrollo de la biologa molecular abri posibilidades para la caracterizacin de los organismos, cosa que tiene gran impacto en la taxonoma bacteriana.Se pueden realizar varios tipos de anlisis sobre cidos nucleicos aislados que proporcionan informacin acerca del genotipo: la determinacin de la composicin de bases del DNA, el estudio de la hibridacin gnica de cidos nucleicos aislados de organismos diferentes y la secuenciacin de cidos nucleicos. En el caso de las bacterias, como organismos simples que son en cuanto a su estructura

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morfolgica, hoy, gracias a las herramientas que nos provee la biologa molecular como as tambin la ingeniera gentica est a nuestro alcance poder ampliar ese orden jerrquico utilizando las tcnicas que nos permiten conocer y estudiar el genoma de estos organismos y de esta forma poder ordenarlos y clasificarlos de acuerdo a un criterio mucho ms amplio y no solamente limitarnos a ordenarlos por su morfologa, fisiologa y/o por estudios bioqumicos como por ejemplo, el metabolismo del organismo.

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