Cintica Qumica y Modelos Dinmicos

Exmenes parciales
1: 14 de septiembre 2: 19 de octubre 3: 30 de noviembre

1. INTRODUCCIN 1.1. Historia

La cintica qumica es el estudio de la velocidad de las reacciones y la comprensin de los mecanismos de las mismas L. Wilhelmy (1850), estudi la hidrlisis de una solucin de sacarosa. Esta fue la primer reaccin qumica cuya velocidad fue estudiada cuantitativamente

1.1. Historia
Gouldber y Waage (1863) y vant Hoff: Demostraron que una reaccin qumica en equilibrio est sufriendo cambios en uno y otro sentido y a la misma velocidad Ostwald observ que los catalizadores (sustancias que aumentan o disminuyen la velocidad de una reaccin sin consumirse) que afectan la velocidad de una reaccin no tienen efecto sobre la posicin del equilibrio

1.1. Historia

Hermann von Helmholtz (1821-1894)

Desarroll el mtodo ms ingenioso para medir la contraccin muscular y la conduccin de seales en fibras nerviosas Sus contribuciones ms importantes fueron en la fsica de la visin (1856) y del odo (1854) Asociado con Gibbs (1839-1903) en la formulacin de algunas de las ms importantes leyes en qumica termodinmica y electroqumica, usadas en la interpretacin del mecanismo de transmisin de seales en fibras nerviosas y otros procesos fisiolgicos.

Thomas Young (1773-1829) y Sir Georges Stokes (1819-1903)

Contribuyeron a nuestro conocimiento de la visin del color y pigmentos respiratorios, respectivamente, a travs del desarrollo de tcnicas espectroscpicas

Schrdinger (1944)
A travs de su libro What is life?, inspir a los principales iniciadores de la biologa molecular (Delbruck, Crick y muchos otros)

1.1.2. Cintica qumica y biologa

Arrhenius (1859-1927), vant Hoff (18841911) y Hood (1885)

Dependencia de la temperatura en la velocidad y equilibrio de las reacciones qumicas relacin logartmica

Arrhenius
Premio Nobel 1903: Teora de soluciones de electrolitos Teora de influencia de iones en las velocidades de reaccin Escribi Quantitative Laws in Biological Chemistry (1915)

Cintica qumica y biologa

Hinshelwood (1946)
Estudio de reacciones biolgicas Cintica de crecimiento y adaptacin de bacterias Descubrimiento de la doble hlice Reconocimiento del DNA como el transmisor de informacin gentica

Eyring (1974)
Teora de velocidad de reaccin absoluta a travs de estados de transicin

Cintica qumica y biologa

Kramers (1940)
Descripcin de reacciones en trminos de una difusin dependiente de la viscosidad considerando la barrera de energa Dinmica de molculas de protenas e interacciones protena-ligando

Atkins (1982)
Distincin entre la cintica qumica y el campo de la dinmica qumica de los pasos individuales

1.1.2.1.Aplicaciones de la Cintica qumica

Reacciones qumicas sencillas Fotosntesis Visin Reacciones nucleares Dinmica de poblaciones Balances y cambios ecolgicos Contaminacin atmosfrica Degradacin biolgica de desperdicios

Aplicaciones de la Cintica qumica

Contraccin muscular Procesos de divisin y rplica celular Muerte de los organismos Metabolismo Evolucin gentica Adaptacin a modificaciones del ambiente Crecimiento bacteriano

1.2.Cintica y problemas biolgicos

1.

2.

3.

Proporcionar informacin acerca de las velocidades a las que proceden diversos procesos biolgicos y cmo forman estructuras temporales Mostrar lo que la cintica puede decirnos acerca del mecanismo de funciones complejas Explorar los sistemas a diferentes niveles de organizacin, desde aquellos ms simples, hasta eventos fisiolgicos complejos

Cintica y problemas biolgicos

Muchos

procesos en fisiologa celular slo sern entendidos, cuando se conozcan las velocidades y equilibrio de los pasos involucrados en la reaccin (Ogden, 1988)

1.2.1. Dinmica de poblaciones

Curvas de crecimiento exponencial para poblaciones (procedentes de las ecuaciones para describir reacciones qumicas) La Demografa es una aplicacin de la dinmica cuantitativa de poblaciones, de gran importancia para la planeacin adecuada de recursos para servicios pblicos y para la correcta distribucin de primas de seguro

Dinmica de poblaciones

Verhulst (1804-1849): ecuaciones de velocidad de crecimiento Gompertz (1779-1865): ecuaciones de supervivencia Graunt (1620-1674): estadsticas de nacimientos y muertes

Dinmica de poblaciones
Curva de crecimiento logstica (Verhulst)
N (t)=K/{1+exp(-bt)}
1 00

C urva d e crecimient o d e Go mp ert z

N(t)=N(0)exp{-exp(a+kt)}
100 80

Poblacin

80

Poblacin

60 40 20 0 0 2 4 6 8 10

60 40 20 0 0 2 4 6 8 10

Tiempo

Ti e mpo

Ecuacin logstica (Verhulst)

Utilizada para analizar reacciones autocatalticas como la activacin proteoltica de proteasas y la activacin de protenas fosfoquinasas por autofosforilacin Los modelos de dinmica de poblacin y cintica de reacciones en sistemas organizados involucran fenmenos de difusin

1.2.2. Cintica y Fisiologa

Fuortes & Hodgkin (1964) Transcurso del tiempo de la primera respuesta elctrica en la retina despus de blanquear el pigmento visual rodopsina. Relacin entre los pasos de la hidrlisis de ATP por la miosina y los cambios estructurales y mecnicos durante la contraccin muscular.

1.2.2.1. Objetivos del estudio de la velocidad de procesos en sistemas biolgicos

Describir:
Velocidad de contraccin de diferentes tipos de msculos Velocidad de conduccin de una seal a travs de un nervio Velocidad de respuesta de una clula ante un mensajero qumico

Analizar:
Cul es el paso o pasos responsables de las
diferencias en la velocidad de contraccin de msculos rpidos y lentos El efecto de un cambio en las condiciones (T, composicin del medio) para encontrar los factores controladores y las condiciones ptimas de proceso

1.3. Investigaciones Cinticas

Experimento preliminar Propuesta de modelo Simulacin del modelo Predicciones

Proceso

MODELO CORRECTO

Iterativo

MTODOS PARA EL ESTUDIO DE VELOCIDAD DE PROCESOS

SISTEMA BIOLGICO
ESTADO DE EQUILIBRIO

1.4. Desarrollos tcnicos y escalas de tiempo

Criterios para la determinacin del tiempo de un tcnica para seguir la velocidad de un proceso:
1. Precisin en la determinacin del tiempo 0 2. Tiempo de respuesta promedio del sensor y del sistema utilizado para la amplificacin y registro de la seal

Desarrollos tcnicos y escalas de tiempo

Los mtodos ms provechosos para estudios cinticos en funciones bioqumicas y fisiolgicas, son aquellos que pueden ser aplicados en sistemas a diferentes niveles de organizacin

Desarrollos tcnicos y escalas de tiempo

Las tcnicas de flujo rpido iniciadas por Harttridge y Roughton (1923) extendieron considerablemente la escala de tiempo de los mtodos para el estudio de reacciones en solucin

Desarrollos tcnicos y escalas de tiempo

Ejemplos de aplicaciones de tcnicas de flujo rpido :

Reacciones de hemoglobina con O2 Reacciones enzima-sustrato Respiracin celular Estudios de suspensin de mitocondrias y clulas enteras

Desarrollos tcnicos y escalas de tiempo

Tcnicas de perturbacin equilibrio (Hill, 1934)

del

Cambio de intensidad de los parmetros: temperatura, presin, campo elctrico Activacin fotoqumica Ampliamente aplicadas en la fisicoqumica de protenas y amino cidos

Desarrollos tcnicos y escalas de tiempo

Otras tcnicas desarrolladas en los ltimos aos:

Alteracin de presin Ultrasonido Resonancia magntica Tcnicas de correlacin y anlisis de ruido Tcnicas cristalogrficas de rayos X