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Gentica - 1 Lista de Exerccios

Natureza e Funo do Material Gentico

1. Que propriedades qumicas possuem o DNA e as protenas que permitem a marcao especfica de uma ou de outra destas macromolculas com um istopo radioativo? 2. Qual a contribuio do experimento realizado por Hershey e Chase para a Gentica? Como o objetivo oi alcanado? 3. Considere uma partcula viral contendo uma molcula de DNA com 200000pb (pares de bases). a) Quantos nucleotdeos devem estar presentes? b) Quantos tomos de fsforo? 4. Foi demonstrado experimentalmente que a maioria das seqncias altamente repetitivas de DNA de cromossomos eucariotos no so transcritas. O que isso indica a respeito da funo deste tipo de DNA? 5. O que voc entende por orientao antiparalela das fitas de DNA? 6. Os cidos nuclicos so constitudos por cadeias polinucleotdicas. Descreva resumidamente este tipo de composto. 7. Cite as principais diferenas entre RNA e DNA quanto estrutura de nucleotdeos. 8. Quais as principais caractersticas da molcula de DNA? 9. Explique o que e porque ocorre a complementaridade de bases nitrogenadas. 10. Se uma fita de desoxirribonucleotdeos tiver a constituio 5ATAAGCGTTAG 3, como ser a molcula de DNA? 11. O DNA do fungo Neurospora crassa tem um contedo de A+T de 37%; qual o contedo de cada uma das quatro bases isoladas? 12. O DNA da bactria Bacillus hipoteticus tem um contedo de C+T de 46%; qual o contedo de cada uma das quatro bases isoladas? 13. Num organismo diplide um pesquisador verificou que uma molcula de DNA continua com 22% de GUANINA. Com base nestas informaes determine qual o percentual de cada uma das outras bases. 14. Se o contedo d A + T em uma molcula de DNA de 36%, quais so os contedos de todas as bases? 15. Um vrus, cujo material consiste de uma fita de RNA, tem aproximadamente 22% de seus RNA nucleotdeos constitudos de URACIL. Qual a freqncia de ADENINA?
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16. Se um RNAm sinttico conter 35% de ADENINA e 65% de GUANINA posicionados ao longo do polinucleotdeo, que aminocidos so esperados para serem incorporados no polipeptdio e em que propores? 17. Porque surgem os fragmentos de Okasaki? 18. Qual a importncia do empacotamento do DNA e como ele se processa? 19. O istopo radioativo do nitrognio N15 pode ser usado para marcar radioativamente compostos que possuam nitrognio na sua composio, como o caso dos cidos nuclicos. Uma cultura de Escherichia coli cresceu em um meio contendo exclusivamente N15 at que todo o DNA estivesse marcado. Ento transferiu-se a colnia para um meio contendo nitrognio comum N14 e deixou-s que crescesse por, exatamente, duas geraes. Fazendo-se ento uma avaliao do DNA, quanto deveria ser encontrado contendo: a) Somente N15? b) Hbrido (uma fita N14 e outra N15)? c) Somente N14?

RESPOSTAS

1. Isto possvel pelo fato e o DNA ser rico em fsforo e no possuir enxofre, enquanto que as protenas so ricas em enxofre e no possuem fsforo. 2. Eles acompanharam a trajetria dos componentes virais (protenas e DNA), marcando com istopos radioativos em um processo normal de infeco, constatando que apenas o DNA penetra na clula infectada e transmitido aos descendentes. Comprovaram assim que o material que possui atividade gentica o DNA. 3. a) 400000 b) 400000

4. Que estas seqncias no codificam protenas, no possuindo atividade gentica conhecida. 5. Significa que as duas cadeias polinucleotdicas de uma mesma molcula de DNA so invertidas uma e relao outra, isto , se em uma extremidade de uma delas se encontrar o radical fosfato (que ocupa a posio 5 do nucleotdeo), na mesma extremidade da outra ser encontrado o radical oxidrila (da posio 3). 6. Cada nucleotdeo constitudo por uma base cclica nitrogenada ligada a uma pentose. Na posio 3 da pentose encontra-se uma oxidrila e na posio 5 um radical fosfato. A unio de vrios nucleotdeos entre si promovida por ligaes fosfodister entra a oxidrila 3 de um nucleotdeo e o grupamento fosfato 5 do seguinte. 7. A pentose do RNA uma ribose enquanto que a do DNA uma desoxirribose, tendo perdido a oxidrila da posio 2. No RNA encontra-se pirimidina uracil, que no DNA substituda pela timina. 8. A molcula de DNA constituda por duas cadeias polinucleotdicas , complementares uma outra, orientadas antiparalelamente e espiraladas para a direita, formando uma dupla hlice. Possui a pirimidina timina e no uracila, alm de seu acar ser uma desoxirribose. 9. A unio das bases entre as duas fitas de DNA sempre especfica ocorrendo os pareamentos C-G e T-A. Tal especificidade provocada pela habilidade de formao de pontes de hidrognio (duas entre T e A e trs entre C e G). 10. 5 ATAAGCGTTAG 3 3 TATTCGCAATC 5 11. A= 18,5%; T= 18,5%; C= 31,5%; G= 31,5% 12. No possvel determinar uma vez que T e C no so complementares. 13. T= 28%; A= 28%; G= 22%; C= 22% 14. T= 18%; A= 18%; G= 32%; C= 32% 15. No possvel determinar, pois o RNA uma fita simples onde suas bases no so pareadas.

16. AAA 4,28%; AGA 7,96%; AAG 7,96%; AGG 14,78%; GAA 7,96%; GGA 14,78%; GAG 14,78%; GGG 27,46% 17. Quando ocorre a replicao do DNA, esta se d bidirecionalmente, porm as DNA polimerases s conseguem trabalhar no sentido 5 para 3. Ento, a polimerizao no sentido 3 para 5 ocorre pela sntese de pequenos fragmentos 5 para 3, os quais se chamam fragmentos de Okasaki. 18. O empacotamento necessrio pra permitir que molculas extremamente longas caibam em um espao muito pequeno como o ncleo. Este processo inicia-se com a formao da dupla hlice pela espiralizao das duas fitas. A dupla hlice roda em torno do octmero de histonas formando um nucleossomo. Este se condensa sobre ele mesmo e forma um solenide, que em seu grau mximo de condensao forma as cromtides dos cromossomos. 19. a) Nenhum b) 50% c) 50%

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Gentica - 2 Lista de Exerccios
Sntese Protica

1. Compare e contraste a replicao, a transcrio e a traduo de procariontes e eucariontes? 2. Considere o segmento de fita de DNA abaixo: 3 AAAGAACGATGATTTCGGATTT 5 a) Qual a seqncia de bases do RNAm correspondentes? b) Quais os anti-cdons dos tRNAs acima considerados? c) Qual a seqncia de aminocidos codificados pelo RNAm? 3. Uma nica adio de nucleotdeos e uma deleo aproximadamente 15 pontos distantes do DNA causam a mudana na seqncia de uma protena de: LYS SER PRO SER LEU ASN ALA ALA LYS LYS VAL HIST HIST LEU MET ALA ALA LYS a) Quais as seqncias de nucleotdeos do RNA velho e do novo? b) Que tipo de RNA ? c) Qual o nucleotdeo que foi deletado e qual foi adicionado? 4. Explique o processo de exciso de ntrons ou SPLICING 5. Porque apenas 61 trincas (seqncias de nucleotdeos) codificam aminocidos? 6. Considere a seqncia de bases nitrogenadas abaixo como parte de uma molcula de acido nuclico: 5 UGA AUG 3 a) De que acido nuclico ela faz parte? b) Quais os outros cidos nuclicos relacionados com tal seqncia e suas respectivas bases nitrogenadas? c) Se a seqncia dada resultar um segmento de protena, quais os aminocidos que estariam presentes? 7. Como a transcrio iniciada e terminada? 8. Considerando-se a seqncia de cdons 5 AUG CGA 3 responda justificando: a) De que molcula o cido nuclico faz parte?
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para

b) Qual o anti-cdon correspondente? c) De que molcula a resposta b) faz parte? d) Qual a seqncia template (sense ou molde) correspondente? e) e a no templante? f) A que molcula as duas ultimas respostas pertencem? 9. Molculas de rRNA so relativamente estveis, enquanto que o mRNA degradado rpidamente. Discuta possveis causas e conseqncias desse fato. 10. Diga o que voc sabe sobre as fitas sense e anti-sense do DNA. 11. Discuta as principais caractersticas do cdigo gentico. 12. Explique como o tRNA assegura a correta traduo de acordo com as leis do cdigo gentico. 13. O cromossomo de E. coli contm 4,7 milhes de pares de bases de DNA. Se a sntese de cada forquilha de replicao ocorrer a uma taxa de 1000 nucleotdeos por segundo, quanto tempo levar para completar a replicao do cromossomo de E. coli na replicao teta? 14. O que replicao semiconservativa? 15. Desenhe uma molcula de DNA sofrendo replicao teta. Em seu desenho identifique (1) origem, (2) polaridade (pontas 5 e 3) de todos os filamentos molde e filamentos recm-sintentizados, (3) filamentos leading e lagging, (4) fragmentos de Okasaki e (5) localizao dos primers. 16. Que similaridades e diferenas existem nas atividades enzimticas das DNA polimerase I, II e III? Qual a funo de cada tipo de DNA polimerase nas clulas bacterianas? 17. Por que necessria a primase para a replicao? 18. Que partes do DNA constituem uma unidade de transcrio? 19. Descreva a estrutura da RNA polimerase bacteriana. 20. Desenhe e denomine um promotor bacteriano tpico. 21. Quais os dois tipos bsicos de finalizadores encontrados nas bactrias? Descreva a estrutura de cada. 22. A seguinte seqncia de nucleotdeos encontrada em um molde de DNA unifilamentar: ATTGCCAGATCATCCCAATAGAT Suponha que a RNA polimerase percorra esse molde da esquerda para a direita: a) Qual ponta do molde de DNA 5 e qual ponta 3? b) Cite as seqncias e marque as pontas 5 e 3 do RNA copiado desse molde.

23. Os seguintes nucleotdeos de DNA so encontrados prximos ponta de uma unidade de transcrio. Encontre o finalizador dessa seqncia e diga se esse finalizador dependente de r ou independente de r. 3 AGCATACAGCAGACCGTTGGTCTGAAAAAAGCATACA 5 24. Quais so os trs elementos principais nas seqncias de mRNA nas bactrias? 25. Qual a funo da seqncia de consenso de Shine-Dalgarno? 26. O que cap de 5? Como o cap de 5 adicionado ao pr-mRNA eucaritico? Qual a funo do cap de 5? 27. Como a cauda poli-A adicionada ao pr-mRNA? Qual a finalidade da cauda poli-A? 28. O que constitui o sliceossomo? Qual a funo do sliceossomo? 29. Explique o processo da processamento do pr-mRNA nos genes nucleares. 30. Explique como o tRNA processado. 31. Defina os seguintes termos no modo com que se aplicam ao cdigo gentico: (a) matriz de leitura; (b) cdigo superposto; (c) cdigo no-superposto; (d) cdon de iniciao; (e) cdon de trmino; (f) cdon com sentido; (g) cdon sem sentido; (h) cdigo universal; (i) cdons no-universais. 32. Como estabelecida a seqncia de nucleotdeos de uma matriz de leitura? 33. Como os tRNA so ligados a seus aminocidos correspondentes? 34. Que papel tem os fatores de iniciao na sntese de protenas? 35. Como o processo de iniciao difere em bactrias e clulas eucariticas? 36. Cite os fatores de alongamento usados na traduo bacteriana e explique o papel desempenhado por cada fator na traduo. 37. Que eventos causam o trmino da traduo? 38. Explique como alguns antibiticos funcionam afetando o processo de sntese de protenas?

RESPOSTAS 1. Procariontes - Realizada no citoplasma; - Desenrolamento do DNA por atuao de enzimas em uma ponta. - A molcula de RNA j constitui o RNAm, o qual utilizado para a produo de protenas e depois degradado.O RNA no processado - Enzimas especificas de iniciao, elongamento e terminao prprias. - ribossomo 70S Eucariontes - Realizada no ncleo - Desenrolamento do DNA ocorre em vrios Pontos no mesmo momento. - mais complexo, onde h vrias modificaes do RNA antes que ele possa ser traduzido (so retirados os ntrons e restam os exons). - Enzimas especificas de iniciao, enlogamento e terminao prprias. -ribossomo 80S

Replicao

Transcrio

Traduo

2. a) 5 UUU CUU GCU ACU AAA GCC UAA 3 b) 3 AAA GAA CGA UGA UUU CGG AUU 5 c) FEN LEU ALA THR LIS ALA - TYR 3. a) velho: AAA AGU CCA UCA CUU AAU GCU GCU AAA novo: AAA GUC CAU CAC UUA AUG GCU GCU AAA b) mRNA c) Foi deletado o primeiro nucleotdeo (A) do segundo cdon e adicionado o ltimo nucleotdeo do sexto cdon (G). 4. O RNAm produzido pela transcrio em eucariotos contm regies codificantes (exons) e nocodificantes (ntros), sendo que este sofrer um processamento no qual so cortadas as seqncias ntrons, para formar o RNAm final que ser traduzido e formar uma enzima ou protena. 5. Porque dos 64 cdons, os 3 cdons (UAA, UAG, UGA) codificam fim da sntese de protenas e so denominados sem sentido. Eles so reconhecidos pelos fatores de liberao de protenas, que promovem a ejeo das subunidades de ribossomos. 6. a) mRNA b) DNA molde 3 ACT TCA 5 c) FIM e MET

7. a) A RNA polimerase reconhece e acopla-se seqncia promotora do DNA. b) A RNA polimerase reconhece uma seqncia de terminao no DNA, desconectando-se desta. 8. a) RNAm b) 5 UAC GCU3 c) RNAt d) 3 TAC GCT 5 e) 5 ATG CGA 3 f) DNA

9. O RNAr necessrio permanentemente nas clulas pois participa de todo e qualquer processo de sntese. J uma molcula de RNAm s necessria para a sntese de uma determinada protena quando esta for requerida pelo organismo. A degradao do RNAm impede o acmulo excessivo tanto do prprio RNAm como tambm do seu produto especfico. 10. A fita da molcula de DNA que serve de molde para a sntese de RNAm a fita sense. Cada gene usa sempre a mesma fita como sense ou template, mas genes diferentes podem ser copiados de diferentes fitas da mesma molcula. 11. O cdigo gentico assegura a colinearidade de informaes entra a molcula de DNA e a cadeia polipeptdica, isto , a correspondncia corretamente seqenciada. degenerado, o que significa que cada aminocido pode ser codificado por mais de um cdon, mas no ambguo e universal (cada cdon codifica sempre o mesmo aminocido, mesmo em diferentes espcies). No existe qualquer tipo de separao entre cdons contguos nem sobreposies, mas existem sinais especficos de inicio e fim de traduo (dois cdons de iniciao e trs de terminao). 12. O RNAt apresenta especificidade tanto para o aminocido como para o cdon, sendo complementar e antiparalelo. Deste modo, garante a insero correta do aminocido na cadeia polipeptdica, de acordo com a seqncia de cdons presentes no RNAm. 13. 39,17 minutos. 14. Quando uma fita de DNA replicada, formam-se duas fitas hbridas, isto , as duas partes da velha fita pareiam com as novas fitas, formando dois novos DNA. Cada um dos filamentos iniciais de nucleotdeos permanecem intactos ( conservados ), porm no sero combinados na mesma molcula. 16. As DNA polimerases sintetizam DNA no sentido 5 um filamento nucleotdico em crescimento. 3 adicionando novos nucleotdeos ponta 3 de

DNA polimerase I Remove primers de RNA e os substitui com DNA. DNA polimerase II Reparo do DNA; reinicia replicao aps DNA danificado parar a sntese. DNA polimerase III Alonga um novo filamento de nucleotdeos a partir do grupo 3-OH dado pelo primer. 17. A primase responsvel pela produo do primer, o qual fornece o 3-OH para que o DNA polimerase III reconhea e inicie a replicao. 18. Uma unidade de transcrio um trecho de DNA que codifica uma molcula de RNA e as seqncias necessrias para a transcrio. A unidade de transcrio inclui um promotor, uma regio codificante de RNA e um finalizador. 19. A RNA polimerase bacteriana uma grande enzima multimrica. No seu centro esto quatro subunidades que constituem a cerne da enzima: duas copias de uma subunidade chamada alfa, uma cpia de beta e uma cpia de beta primo. O fator sigma controla a ligao de RNA polimerase ao promotor.
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21. H um finalizador que causa o trmino da transcrio por presena de uma protena R e outro causa o trmino na ausncia da protena R. 22. a) 3 5

b) RNAm 5 UAA CGG UCU AGU AGG GUU AUC UA 3 23. Finalizador independente de r. 24. As molculas de RNA mensageiro contem trs regies principais: uma regio 5 no-traduzida, uma regio codificante de protena e uma regio 3 no-traduzida. AS regies 5 e 3 no-traduzidas no codificam os aminocidos de uma protena. 25. A regio Shine Dalgarno responsvel por regular o inicio da traduo. Ela possibilita a unio do ribossomo a regio 5 do RNAm, o que facilita o reconhecimento do cdon no incio da sntese de protenas. 26. a adio de um nucleotdeo ponta 5 do RNAm e metilao pela adio de um grupo metil base do nucleotdeo recm - adicionado. O Cap - 5 funciona no incio da traduo e aumenta a estabilidade do RNAm. 27. So adicionados aproximadamente 10 nucleotdeos adenina e aps uma protena de ligao Poli-A aumentando a velocidade de poliadenilao. A estabilidade conferida pela cauda Poli A dependente das protenas que se ligam cauda. A cauda Poli- A confere estabilidade ao RNAm, aumentando o tempo em que ele permanece disponvel para a traduo antes ser degradado pelas enzimas celulares. 28. O sliceossomo um complexo grande, onde ocorre a recombinao, consiste de vrias molculas de RNA e muitas protenas. 29. A processamento do RNA tem lugar no ncleo e deve ocorrer antes que o RNA possa se mover para o citoplasma. No processo de recombinao o pr-RNAm cortado em duas etapas distintas. Na primeira etapa, o pr-RNAm cortado no stio de corte em 5; este corte libera o exon 1 do intron, o intron dobra-se sobre si mesmo (sobre a Adenina), formando uma estrutura chamada de lao. Na segunda etapa, feito um corte no stio de corte 3 e, simultaneamente, a ponta 3 do exon 1 torna-se covalentemente ligada a ponta 5 do exon 2. 30. Os genes que produzem o tRNA podem ser dispersos pelo genoma ou podem estar em grupos. Os tRNAs contem bases modificadas ( xantina, hipoxantina entre outras) e so amplamente processados aps transcrio tanto em clulas bacterianas quanto eucariticas.O tRNA se liga ao aminocido especfico ao seu anticdon,pela aminoacil sintetase especfica com gasto de energia ( ATP). 31. Matriz de leitura: cada modo diferente de ler a seqncia de nucleotdeos. Cdigo superposto: um cdigo em que um nico nucleotdeo includo em mais de um cdon. So encontrados em vrus.
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Cdigo no-superposto: Cada nucleotdeo pertence a apenas um cdon. Cdon de iniciao: o primeiro cdon do RNAm a especificar o aminocido. Cdon de termino: No codificam aminocidos e indicam o final da protena. Cdon com sentido: So todos os cdons, menos o cdon de termino. Cdon sem sentido: tambm denominado de cdon de termino. Cdigo universal: cada cdon especifica o mesmo aminocido em todos os organismos. Cdigo no-universal: o cdon especifica aminocidos diferentes em organismos diferentes. Os mais comuns so os finalizadores. 32. As matrizes de leitura tm conjuntos completamente diferentes de cdons e, portanto iro especificar protenas com seqncias de aminocidos totalmente diferentes. 33. Os aminocidos so ligados a RNAt especficos pela aminoacil-tRNA sintetase em uma reao de duas etapas que requer ATP. 34. Os fatores de iniciao so essenciais para o incio da traduo. O fator de iniciao 1, acentua a dissociao das subunidades maior e menor dos ribossomos. O fator de iniciao 2, forma um complexo com o GTP. O fator de iniciao 3, liga-se a subunidade menor do ribossomo e impede a ligao da subunidade maior durante a iniciao. 35. Eucaritica: requer mais fatores de iniciao, o Cap 5 do RNAm tem funo e iniciao da traduo e a cauda Poli A tambm. Procaritica: As seqncias do RNAr 16S da subunidade menor liga-se a seqncia Shine Dalgarno do RNAm. 36. Os Fatores de alongamento Tu e Ts participam da primeira etapa do alongamento, que levar o RNAt carregado para o stio A. Fator de Alongamento G participa da terceira etapa, que posicionar o ribossomo no cdon seguinte. 37. O termino ocorre quando o ribossomo atinge o cdon de trmino (UAA, UAG, UGA). Os fatores de liberao ligam-se ao cdon de trmino, causando a liberao da protena do ltimo RNAt, o RNAt do ribossomo e o RNAm do ribossomo. 38. A traduo o alvo dos antibiticos, pois ela essencial para os organismos e difere entra bactrias e clulas eucariticas. Os antibiticos ligam-se aos ribossomos bacterianos e inibem varias etapas da traduo.

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Gentica - 3 Lista de Exerccios
Regulao Gnica e Mutao

1. Porque o mecanismo do triptofano dito negativo e da lactose dito positivo? 2. O modelo do operon, formulado por Jacob e Monod, serve para explicar a regulao gnica das enzimas que degradam a lactose em E. coli. Explique o que ocorre se houvesse: a) A presena de triptofano no meio celular; b) Uma mutao do tipo substituio de bases silenciosa do gene operador (O); c) Uma mutao do tipo deleo de base nos genes estruturais (Z, Y, A); d) Presena de glicose no meio celular; e) Uma mutao de sentido errado no primeiro gene estrutura. 3. Considerando os operons Lac e Trp como modelos de induo e represso, respectivamente,descreva: a) A condio mais freqente de cada um destes operons; b) As alteraes ocorridas quando molculas efetoras esto presentes. 4. Os operon, que regulam eficientemente a expresso de conjuntos de genes estruturais relacionados entre si so comuns em bactrias, mas ausentes em eucariotos, isto implica que estes no controlam a expresso de seus genes? Justifique. 5. Uma mutao a alterao na seqncia de nucleotdeos de um gene, de um promotor ou de um operador.
Explique os efeitos de cada uma das mutaes abaixo no operon lac da E. coli:

a) Mutao no operador, impedindo a ligao do repressor; b) Mutao em lac i (gene regulador), impedindo a sua transcrio; c) Mutao no promotor impedindo o acoplamento da RNA polimerase; d) Mutao em lac i, inibindo o acoplamento do repressor lactose; e) Mutao sem sentido em lac y; f) Mutao de localizao desconhecida, que impede a degradao de RNAm lac. 6. Diferencie repressores e indutores. 7. O operon triptofano responsvel pela produo de enzimas que participam da reao metablica de sntese de triptofano e constitudo por 5 genes estruturais, um operador que responde um complexo

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repressor/co-repressor, e um promotor. O seu gene regulador situa-se em um outro ponto do DNA. Na ausncia de triptofano ocorre sntese enzimtica? Porqu? 8. Em E. Coli o operon da lactose compreende 3 genes estruturais: galk, galt e gal, cujos produtos esto envolvidos no metabolismo do acar galactose. Galr codifica um repressor e a galactose um indutor do sistema. Descreva a sequencia de processos: a) Na ausncia de galactose; b) Na presena de galactose.
9. Existem 40 cromossomos nas clulas somticas do rato. a) Quantos cromossomos um rato deve receber de sua me? b) Qual o numero haplide do rato? 10. O numero haplide de um organismo 12. Quantos cromossomos devem ser encontrados em: a) Um monossmico? b) Um trissmico? c) Um tetrassmico? d) Um trissmico duplo? e) Um mulissico? f) Um monoplide (ou haplide)? g) Um triplide? h) Um tetraplide? 11. Considerando um cromossomo normal com a sequencia de bandeamento 12345678, determine o tipo de alterao e o provvel esquema de pareamento com o homlogo normal em casa uma das situaes abaixo: a) 12365478; b) 125678; c) 1234345678; d) 12345876. 12. Classifique os arranjos cromossmicos simbolizados abaixo: a) n b) 2n c) 2n + 1 d) 2n 1 13

e) 2n + 2 f) 3n g) 4n h) 2n + 1 + 1 i) 2n 2 13. Desenhe um quadro ilustrando a estrutura geral de um operon e identifique suas partes. 14. O que RNA anti-sentido? Como ele controla a expresso gnica? 15. Que mudanas ocorrem na estrutura da cromatina e que papel estas mudanas tm na regulao gnica eucaritica? 16. Explique resumidamente como as protenas ativadoras transcricionais e os repressores afetam o nvel de transcrio de genes eucariticos. 17. O que um insulador? 18. O que um elemento de resposta? Como os elementos de resposta causam a expresso coordenada de genes eucariticos? 19. Defina silenciamento do RNA. 20. Como surgem as inseres e as delees? 21. Como os anlogos de bases levam a mutaes? 22. Que tipos de mutaes so produzidos pela radiao ionizante e radiao UV? 23. Cite pelo menos trs tipos diferentes de reparo de DNA e explique resumidamente como cada um feito. 24. Um cdon que especifica o aminocido Gli sofre uma substituio de uma s base para se tornar uma mutao sem sentido. De acordo com o cdigo gentico, essa mutao uma transio ou uma transverso? Em que posio do cdon ocorre a mutao?

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RESPOSTAS
1. Porque o operon s estar ativado na presena de lactose e desativado na ausncia de triptofano, ou seja, a lactose indutora e o triptofano um repressor. 2. a)No ocorreria nada no operon da lac. b) Nada ocorreria pois foi uma mutao silenciosa, continuando a ler os genes Z, Y e A e degradao da lactose, pois tanto o cdon mutante quanto o original codificam o mesmo aminocido, no alterando a leitura. c) A degradao da lactose no ocorreria, pois a produo das determinadas enzimas estaria impedida. d) Com a presena de glicose, o operon lac no ser ativado e no haver produo das enzimas pelos genes Z, Y e A. e) A lactose no ser degradada. 3. a) Lac O operon permanece inativado porque a protena repressora, sintetizada pelo gene regulador, se liga ao stio operador, inibindo o promotor. Isto impede o acoplamento da RNA polimerase, e deste modo, no h transcrio nem traduo. Trp A protena reguladora inativa, no sendo capaz de se ligar ao sitio operador do operon. Assim, a RNA polimerase acopla-se ao promotor, ocorrendo transcrio e traduo. b) Lac Se a lactose est presente, estabelece um complexo com a protena reguladora, inativando-a. Esta perde a capacidade de se ligar ao operador, liberando assim o promotor, o que faz com que haja transcrio e traduo. Trp O triptofano age como co-repressor que se liga ao repressor ativando-o. O complexo repressor/co-repressor ocupa o sitio operador, inibindo o promotor, que no aceita a ligao da RNA polimerase. No h traduo nem transcrio. 4. Os operons so sistemas de regulao que respondem a estmulos diretos do meio externo. Sendo eficientemente tamponados contra a maioria das influencias externas os eucariotos no necessitam de mecanismos de resposta direta mas, por outro lado, uma vez que comportam reaes metablicas muito mais complexas, tambm necessitam de sistemas de regulao gnica muito mais elaborados, o que assegurados pelos chamados circuitos pr programados de expresso gnica. Nestes, que comportam vrios escales de gene, a ativao sempre ocorre em cadeia, e a regulao processa-se tanto a nvel de transcrio como de processamento de hnRNA. 5. a) Ocorrer a produo contnua das enzimas de degradao da lactose, na ausncia ou presena desta, gastando energia desnecessria quando a lactose no estiver presente. b) Idem, pois a protena reguladora no ser produzida. c) o operon da lactose no funcionar, pois no ser possvel ocorrer transcrio e traduo para a produo das enzimas de degradao da lactose. d) Idem, pois a protena reguladora estar sempre ativa, ligando-se ao operador e impedindo a ligao da RNA polimerase. e) Pra a transcrio, no transcrevendo completamente a permease e no totalmente a transacetilase. f) Acumulo de mRNA na clula, ocorrendo produo contnua de - galactosidase, permease e transacetilase. 6. Repressor uma protena sintetizada pelos genes reguladores e especifica para cada operon. A sua funo ligar-se ao sitio operador inibindo a expresso do operon.

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Indutor uma molcula efetora que atua nos sistemas de induo e, uma vez presente, forma um complexo com o repressor, impedindo a sua ligao ao operador, deprimindo assim o operon. 7. Sim, pois em sua ausncia h produo de 3 enzimas para formar triptofano a partir de corismato. S ser inibida a produo destas na presena de triptofano, o qual se ligaria a protena reguladora, ativando-a e impedindo a transcrio e traduo das enzimas. 8. a) Galr sintetiza o repressor que se liga ao operador, isto provoca a inibio do promotor, que no aceita a ligao da RNA polimerase e, portanto, no h expresso do operon, pois no haver transcrio nem traduo. b) Como indutor, a galactose liga-se ao repressor sintetizado p galr, impedindo sua ligao ao operador. Logo haver o acoplamento da RNA polimerase e a conseqente transcrio e traduo do operon. 9. a) 20 10. a) 23; b) 25; b) 20 c)26; d) 26; e) 22; f) 12; g) 36; h) 48.

11. a) Inverso intercalar heterozigota; b) Deleo intercalar heterozigota; c) Duplicao intercalar heterozigota; Inverso terminal heterozigota. 12. a) Haploidia ou monoploidia; b) Diploidia; c) Trissomia; d) Monossomia; e) Tetrassomia; f) Triploidia; g) Tetraploidia; h) Dupla trissomia; i) Nulissomia. 14. O RNa anti-sentido completar a outro RNA ou a seqncia de DNA. Ele controla a expresso gnica ligando-se a seqncias no RNAm e inibindo a traduo. 15. Aumento na sensibilidade da cromatina degradao pela DNase I. Acetilao, a adio de grupos acetil a protenas histonas.. Metilao das bases citosina (do DNA), que produz 5- metilcitosina. A sensibilidade digesto com DNase I sugere que o DNA transcrito adota uma configurao aberta antes da transcrio. A acetilao das protenas histona perturba a estrutura do nucleossomo e pode facilitar a transcrio. A ativao da transcrio em geral precedida pela desmetilao do DNA. As seqncias metiladas podem atrair desacetilases, que removem os grupos acetil das protenas histona, estabilizando a estrutura da cromatina e reprimindo a transcrio. 16. As protenas ativadoras transcricionais estimulam a transcrio facilitando a montagem ou a ao do aparelho basal de transcrio no cerne promotor. Elas so capazes de se ligar ao DNA em uma seqncia especifica de bases. Tambm tem a habilidade de interagir com outros componentes do aparelho transcricional e influenciar a taxa de transcrio. 17. So seqncias de DNA que bloqueiam ou insulam o efeito dos acentuadores de um modo dependente da posio. 18. So seqencias de DNA regulatrias em comum nos promotores ou acentuadores. 19. O silenciamento do RNA iniciado por molculas bifilamentares de RNA que so cortadas e processadas. Os pequenos RNA interferentes resultantes ligam-se a seqncias complementares no RNAm e causam seu corte e decomposio. Os pequenos RNA interferentes tambm podem estimular a metilao de seqncias complementares no DNA. 20. Surgem por adio ou a remoo, de um ou mais pares de nucleotdeos.

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21. Anlogos de bases so substancias com estruturas similares s de qualquer uma das quatro bases padres de DNA. As DNA polimerases no podem distinguir esses anlogos das bases padres. Assim, se o anlogo de base estiver presente durante a replicao, ele pode ser incorporado em molculas de DNA recm-sintetizadas. 22. Radiaes ionizantes (raio X , raios gama...): danificam o DNA deslocando eltrons dos tomos, sendo que esses eltrons ento quebram ligaes fosfodister e alteram a estrutura das bases. Luz ultravioleta: causa mutaes primariamente produzindo dmeros de pirimidina que perturbam a replicao e a transcrio. 23. O sistema permite que o bloqueio da replicao seja superado, mas, no processo, comete muitos erros e aumenta muito a taxa de mutao. 24. Reparo de mau pareamento: detecta bases incorretamente pareadas, corrige pequenas alas no-pareadas no DNA. Reparo direto: mudam os nucleotdeos de volta a suas estruturas originais.. Reparo por exciso de Bases: as bases modificadas so primeiro excisadas e ento todo nucleotdeo substitudo. 25. uma transverso. Ocorre uma mutao na primeira base do cdon, de G para U, trocando GGA por UGA.

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