STRUKTUR DNA DAN RNA

ASAM NUKLEAT

Asam nukleat polimer yang dibentuk oleh mononukleotida Fungsi menyimpan, mereplikasi dan mentranskripsi informasi genetika

NUKLEOSIDA
Merupakan seny. N-glikosida dr bs purin dan pirimidin yg dihubungkan oleh ikt glikosida antara atom karbon-1 dr pentosa dg atom nitrogen 1(N 1) dr pirimidin atau nitrogen 9 (N -9) dr purin

BASA PURIN DAN PIRIMIDIN

NUKLEOTIDA
Nukleotida (nukleosida fosfat) adl ester asam fosfat dr nukleosida merupakan nukleosida yg terfosforilasi. Berperan serta dlm sejumlah besar proses biokimiawi peran yg paling dikenal adl sbg prekursor monomer RNA dan DNA
HO NH2

N
N O P O
5

N N

Basa (adenin)

OCH2
4 3

O
1 2

OH

OH

H3C

Timin

Subunit Nukleotida dari DNA

Subunit Nukleotida dari RNA

POLINUKLEOTIDA

Polimer mononukleotida Deoksi asam ribonukleat (DNA) Asam ribonuklaet (RNA)

DNA
DNA merupakan struktur yang dibangun oleh KH pentosa (deoksiribosa), fosfat dan suatu basa dalam bentuk polimer dan berkombinasi membentuk helix ganda. Blok pembangun DNA adalah 5-carbon sugar deoxyribose yang saling dihubungkan oleh ikatan fosfodiester sehingga terbentuk dua untai ganda dengan tulang punggungnya dibentuk dari ikatan KH-fosfat pada bagian luar helix.

STRUKTUR DNA

 Kedua strand dari helix saling merupakan komplemeternya masing-masing.

Setiap pentosa-nya juga terikat pada salah satu dari keempat basa yang terdiri dari adenine (A), guanine (G), cytosine (C) atau thymine (T). Gula deoksiribosa dan fosfat yg menyusun DNA terletak dibgn luar molekul, sdgkan bs purin dan pirimidin tletak di sebelah dlm untaian (heliks)

 Strand yang berlawanan diikat oleh suatu ikatan non kovalen diantara dua basa yang selalu berpasangan G dengan C oleh tiga ikatan hidrogen dan A dipasangkan dengan T oleh dua ikatan hidrogen. Terdapat dua posisi dari pentosa yang terikat pada gugus fosfat yaitu pada ujung 5-P dan ujung 3-OH.

Crick

Menurut James Watson & Francis

Ukuran jarak antara pasangan basa 0,34 nm (3,4 oA) Setiap putaran untaian td 10 ps basa dan jarak satu putar heliks 3,4 nm Diameter untaian DNA 2,0 nm

Bentuk Fisik Struktur DNA

Bdsrkan jml ps basa bbrp tipe (bentuk)
Tipe A B C D E Z Pasangan bs/putaran 11 10 9,33 8 7,5 12 Diameter heliks (nm) 2,3 1,9 1,9 1,8

 Untaian (strand) DNA td dua lekukan (groove)

lekukan besar (major groove) lekukan kecil (minor groove) lekukan pada tipe B lebih mudah mikat protein drpd tipe A ( lebih dalam)

DNA (Gen) terdiri dari tiga struktur penting yaitu :

Bagian yang disebut gene regulatory segment mngdung srtuktur yang terlibat pada proses inisiasi dan pengaturan proses transkripsi. Exon bagian yang mengandung codon untuk ditranslasikan oleh mRNA menjadi protein. Intron bagian struktur yang tidak mengandung codon (intervening sequence).

KROMOSOM

KROMATIN

NUKLEOSOM

RNA
Spt pd DNA molekul RNA dibentuk oleh nukleotida yang saling dihubungkan menjadi satu rantai KH pada DNA deoksiribosa. Sedangkan RNA KH-nya adalah ribosa. Basa timin diganti oleh urasil pada RNA

STRUKTUR RNA
DNA terdiri dari dua untai yang

saling komplementer membentuk helix ganda, ttp RNA hanya terdiri dari satu untai tunggal, akan tetapi dapat melipat lipat dirinya dalam suatu aturan tertentu.

Basa pada RNA sama spt DNA, kecuali timin diganti oleh urasil.

3 macam RNA penting

mRNA (messenger-RNA) yg melakukan tranfer

informasi mengenai deretan asam amino pada protein yang akan dibangun sesuai dengan urutan kode pada DNA asal. rRNA (ribosomal-RNA) yang membangun ribosom bersama dengan protein
tRNA (transfer-RNA) yang mentransfer asam amino ke ribosom untuk sintesis protein.

mRNA

rRNA

rRNA

tRNA

tRNA
Td 75 bh nukleotida Td 4 lengan utama lengan akseptor lengan antikodon lengan D lengan T C lengan tambahan Fungsi sbg penyelaras utk translasi

FAKTOR YANG MEMPENGARUHI KESTABILAN DNA

Kestabilan struktur DNA Tumpukan (stacking) basa nukleotida pd satu rantai interaksi hidrofobik antara basa-basa nukleotida hilang krn panas & reagensia struktur tdk teratur : serapan cahaya Ikatan hidrogen antara basa-basa yg berpasangan pd rantai ganda terutama pada ps antara C dan G makin >> ps C-G, makin stabil struktur

Denaturasi DNA
Pecahnya ikatan hidrogen antara ps basa pada rantai ganda rantai tunggal (single Stranded) Penyebab Denaturasi Panas ikt hidrogen stacking Asam basa asam protonasi ggs N dr A,G dan C basa deprotonasi ggs N dr G dan C

Tingkat denaturasi DNA tgantung pd tinggi suhu pubahan tk denaturasi DNA suhu btingkat absorban 260 makin > pgeseran str, mk makin > nilai absorban cahaya efek hiperkromik denaturasi lengkap DNA suhu > 90oC

Renaturasi
Proses pbentukan kembali str untai ganda dr keadaan terdenaturasi