Objetivos

QUMICA DE LIPDIOS
1 Reconhea a importncia dos lipdios quanto as suas funes? Em muitos organismos so a principal forma de armazenamento de energia e, mesmo em pequenas qtds, tm papeis fundamentais como enzimas, tambm constituem as membranas celulares, so hormnios e mensageiros celulares. Ainda.. cofatores, pigmentos,ag emulsificantes. 2 Caracterize estruturalmente os triacilglicerois e explique sua importncia para o metabolismo energtico e vantagem em relao ao glicognio como combustvel. Os triacilgliceris ou triglicerdeos so lipdeos compostos por um lcool (glicerol) mais 3 cidos graxos podendo ser classificado em simples ou misto. Ele mais adequado ao armazenamento quando comparado aos carboidratos devido ao seu maior rendimento energtico e sua apolaridade sendo seu armazenamento diferente dos carboidratos j que esses tem q juntamente armazenar gua.

3 Quais as principais classes de lipdios de membrana? Diferencie estruturalmente estas classes. Na membrana encontramos trs tipos glicerofosfolipideos, os esfingolipideos e os esteris. de lipdeos; os

GLICEROFOSFOLIPIDEOS: um lcool glicerol mais 2 cidos graxos. A terceira hidroxila ocupada por um composto altamente polar. As ligaes so do tipo ster e em geral no C-1 tem um acido saturado e no C-2 um insaturado. ESFINGOLIPIDEOS: contem a esfigosina como lcool estrutural, formando uma unidade estrutural fundamental a ceramida. Contem ainda um acido carboxlico de caideia longa e uma unidade polar e hidroflica. ESTEROIDES: composto formado por quatro anis cclicos fundidos, sendo 3 com seis carbonos e um com cinco carbono. So sintetizados a partir do isopreno. 4 Defina e comente a funo de:

os glicolipdios neutros e os gangliosdios possuem um ou mais acares em seu grupo cabea, diretamente
a) glicoesfigolipdios;

conectados ao OH em C-1 da poro ceramida; eles no contm fosfato. Esto envolvidos em vrios eventos de reconhecimento na superfcie celular. Por exemplo, so determinantes dos grupos sanguneos humanos ABO.
b) cerebrosdeos; possuem um nico acar ligado ceramida; aqueles

com galactose so caracteristicamente encontrados nas membranas plasmtica das clulas dos tecidos neurais (bainha de mielina) e aqueles com glicose nas membranas plasmticas das clulas de tecidos no-nervosos.(tipo de glicoesfingolipideo)
c) globosdeos; apresentam dois ou mais acares ligado ao OH (tipo

de glicoesfingolipideo) d) gangliosdeos. so os esfingolipdios mais complexos e contem cabeas polares muito grandes confeccionas com varias unidades de acar. Uma ou mais unidades terminais de gangliosdios o acido N-acetil-neuramnico, tambm chamado cido silico. Os gangliosdios perfazem cerca de 6% da substancia cinzenta do crebro e eles esto presentes em pequenas quantidades na membrana da maioria dos tecidos animais no-neurais.

5 Explique a importncia dos glicoesfingolipdios na superfcie dos eritrcitos no sistema ABO. Os glicoesfingolipideos participam do processo de reconhecimento celular a partir do tipo de oligossacardeo presente na sua molcula que fica exposto na superfcie celular, definindo assim os tipos sanguneos A, B e O. 7 Quanto aos esterides: a) quais suas funes? ESTERIS: sua estrutura um ncleo esteride

consistindo de quatro anis fundidos, trs com seis tomos de carbono e um com cinco. O colesterol o mais importante esterol nos tecidos animais. Os esteris de todas as espcies so sintetizados a partir de unidades simples de isopreno. Em adio ao seu papel de constituinte da membrana, os esteris servem como precursores para uma variedade de produtos com atividades biolgicas especficas. Os cidos biliares tm uma cadeia lateral hidroflica que emulsiona gorduras. Uma grande variedade de hormnios esteris so tambm produzidas a partir do colesterol. Os esteris tambm funcionam como sinalizadores celulares. b) explique seu papel como sinalizadores celulares, entende-se: hormnios: Os maiores grupos de hormnios esterides so os

hormnios sexuais masculinos e femininos e os hormnios do crtex adrenal, cortisol e aldosterona. Todos esses hormnios contem um ncleo esteride intacto. Eles so produzidos em um tecido e transportados pela corrente sangunea para tecidos-alvo, onde se unem s protenas receptoras altamente especficas e desencadeiam transformaes na expresso gnica e no metabolismo. Devido afinidade muito alta desses receptores pelos hormnios, concentraes muito baixas desses so suficientes para produzir seus efeitos nos tecidos-alvo. O fosfatidilinositol e seus derivados fosforilados, componentes das membranas plasmticas de todas as clulas eucariotas, servem como reservatrio de molculas mensageiras que so liberadas no interior das clulas quando certos sinais extracelulares interagem com receptores especficos na membrana plasmtica. O inositol-1,4,5-trifosfato provoca a liberao de Ca2+ seqestrado nos compartimentos ligados membrana da clula, dispara respostas hormonais e a ativao de varias enzimas dependentes de Ca2+. O diacilglicerol liga-se a uma enzima e a ativa, a protena quinase C que transfere grupos fosfatos do ATP para varias protenas citoslicas, alterando desta forma suas atividades enzimticas.

c) podem ser precursores de que molculas (3 exemplos no mnimo)

Vitamina A: um pigmento essencial para a viso. A deficincia de vitamina A provoca uma variedade de sintomas nas pessoa e nos

animais experimentais, que inclui pele seca, xeroftalmia, membranas mucosas secas, desenvolvimento e crescimento retardado, esterilidade em machos e cegueira noturna. Vitamina D: o precursor de um hormnio essencial para o metabolismo do clcio e do fosfato. A vitamina D3 tambm chamada colecalciferol, forma-se normalmente na pele, mas no biologicamente ativa, mas o precursor da 1,25-diidroxicolecalciferol que regula a absoro de clcio no intestino e o equilbrio entre liberao e deposio de clcio e fsforo nos ossos. A deficincia de vitamina D provoca raquitismo. Vitamina E: um nome coletivo para um grupo de lipdios intimamente relacionados chamados tocoferois, que tem a capacidade de prevenir o dano oxidativo aos lipdios das membranas celulares. Vitamina K: a vitamina K age na formao da protrombina, uma protena do plasma sanguneo essencial na formao do coagulo sanguneo.

8. Cite as enzimas e suas doenas relacionadas aos lipdios. O metabolismo dos esfingolipideos de membranas depende muito das enzimas envolvidas em sua degradao, quando devido um problema gentico essas enzimas no produzida corretamente esses esfingolipdios tendem a se acumular nas membranas causando diversas doenas. Niemann-Pick: defeito na enzima hidroltica esfingomielinase. Tay-Sachs: falta da enzima lisossmica hexosaminidase.

MEMBRANAS
1 Reconhea a funo das protenas, lipdios e carboidratos nas membranas biolgicas. OK. Lembrado simplesmente q ambos participam da composio da membrana, seus arranjos do flexibilidade e todas as outras caractersticas das membranas tais como a de reconhecimento celular. Os lipidios formam uma bicamada apolar que permite a passagem de diversas partculas pelo processo de difuso. As protenas servem de canal entre o meio extra e intracelular facilitando a passagem de produtos no transportados pela

bicamada lipdica. E os carboidratos compem o glicoclice, estrutura extracelular que de reconhecimento. 2 Como podem se apresentar os carboidratos nas estruturas dos glicoconjugados nas membranas biolgicas. Eles esto ligados covalentemente a lipdios e protenas formando respectivamente glicolipideos (componente de bicamada lipdica) e glicoproteinas ( componente do glicoclice). 3 Descreva o modelo do mosaico fluido de membranas e sua importncia. O modelo mosaico fluido definido por uma bicamada lipdica com extremidades polar e interior apolar onde protenas e lipdios individuais se deslocam relativamente livre pela membrana graas s interaes no covalentes com a membrana. Esse modelo permite a clula uma maior mobilidade, podendo sofrer fuso e se reorganizar quando conveniente. 4 Explique o comportamento dos lipdios em uma soluo aquosa. Destacar as interaes entre eles e a gua. Quando misturados com a gua os lipdios formam agregados espontaneamente, agrupando-se com suas pores hidrofbicas se contactando mutuamente e seus grupos hidroflicos interagindo com a gua q o cerca. Lembrando q o agregado reduz a quantidade da superfcie hidrofbica exposta gua, tornando-o mais estvel. Podero ser encontradas em forma de micela, bicamada e lipossomos. 5 Descreva o que so protenas perifricas e integrais e suas classificaes. As protenas perifricas, so extrnsecas, associam-se a membrana por foras eletrostticas e pontes de hidrognio com os domnios hidroflicos das protenas integrais e com os grupos cabea polares dos lipdeos de membranas e so de fcil remoo. As integrais so intrnsecas, muito firmemente associadas com a membrana, removveis apenas com agentes que interferem nas interaes hidrofbicas, como detergentes, solventes orgnicos ou desnaturantes.

6 Relacione as propriedades das membranas e seus componentes. Propriedades: flexibilidade, permeabilidade seletiva, ncleo hidrofbico formado pelas caudas dos lipdios, cabea polar voltada pra fora, capacidade de fuso com outras membranas, realiza diversas atividades atravs das estruturas aderidas superfcie, como transporte ativo, difuso facilitada, ...

Componentes: fosfolipdios, esfingolipdios, esteroides, protenas conjugadas ou no, carboidratos ligados a lipdios ou protenas.

7 Cite e explique a importncia de protenas de membrana relacionadas a processos de reconhecimento celular. a historia das glicoconjugadas cuja especificidade ta justamente na parte do acar, servindo para reconhecimento celular, encaixe de anticorpos.... 8 Descreva os tipos de transporte atravs de membranas. Destaque o uso de transportadores e a difuso facilitada. Difuso simples: usa simplesmente a fora de difuso osmtica, sem gasto de energia. A passagem atravs da matriz lipdica. Dif facilitada: semelhante simples, com a diferena de que a passagem atravs de canais proticos, passando molculas que no passariam pelos lipdios. Transporte ativo primrio: utiliza transportadores alimentados com energia para transportar molculas CONTRA o gradiente de concentrao. Transporte ativo secund: igual ao primrio, a diferena que ao invs de pegar diretamente a molcula que interessa, o transportador primeiro joga uma outra pra fora. Vai haver uma osmtica fora para essa molcula voltar e equilibrar a concentrao, e quando ela volta traz consigo de carona a molcula que realmente interessa. 9. Qual a importncia do processo de fuso de membranas. Destaque os eventos onde isto ocorre. H vrios eventos que ocorrem com a fuso de membranas. Ex: exocitose quando a clula vai secretar algo atravs de uma vescula, a membrana dessa vescula se funde com a da clula e joga o contedo pra fora. Endocitose a clula engloba algo, fundindo uma parte dela prpria pra fazer uma vescula. Infeco por vrus a membrana do vrus se combina com estruturas especificas de reconhecimento da membrana e se funde a ela, inserindo seu material. Fecundao o espermatozide funde sua membrana com a do vulo.

LEMBRAR: as protenas integrais so preferencialmente hidrofbicas, compostas pos aminocidos apolares. So presas na estrutura da membrana. As protenas perifricas associam-se reversivelmente.

QUMICA DE NUCLEOTDEOS
1 Reconhecer a importncia dos nucleotdeos. Os nucleotdeos participam de uma variedade de etapas metablicas na clula. So elementos qumicos essenciais na resposta celular a hormnios e outros estmulos extracelulares, moedas de troca energtica como, por exemplo, no ATP e, principalmente, constituem as molculas de DNA e RNA. Funcionam ainda como cofatores enzimticos e intermedirios metablicos. 2 Destacar as diferenas estruturais entre nucleotdeos pricos e pirimidnicos. 2.1 Bases pricas (adenina e guanina) apresentam 2 anis em sua estrutura j as pirimdicas apresentam apenas um anel, lembrando que a timina presente apenas no DNA apresenta um radical metil ao contrario dos demais. A citosinina tambm apresenta uma diferena: contm um radical amina a mais. + As bases pricas possuem um leve enrugamento enquanto as bases pirimdicas so planas 3 Reconhecer as diversas funes dos nucleotdeos. Citar exemplos de eventos bioqumicos em que esto envolvidos. Os nucleotdeos desempenham um conjunto de diversas funes importantes nas clulas. Como subunidades dos cidos nuclicos eles transportam a informao gentica ( DNA e RNA) e sintetizam protenas ( RNAs). So tambm os transportadores primrios de energia qumica nas clulas ( ligados a fosfatos formando ATP, GTP, CTP e outros) componentes estruturais de muitos co-fatores enzimticos ( acetil COA, NAD, FAD) e mensageiros secundrios celulares(AMPc). 4 Reconhecer o ATP como molcula de barganha energtica . Formado por adenosina, ribose e trs molculas de fosfato o ATP se mostra como uma estrutura de certa forma instvel no que se refere a repulso dos fosfatos; tal energia utilizada para mant-los unidos obtida pelo organismo aps a retirada de um daqueles, conferindo assim ao ATP o ttulo de moeda de barganha energtica. O ATP (adenosina trifosfato) o transportador central de energia qumica das clulas. A ligao dos trs fosfatos se d a partir da extremidade 5 da ribose. Com o primeiro fosfato se realiza uma ligao ester, entre os prximos tem-se ligao anidro do cido fosfrico. Quanto mais perto da ribose mais energia a ligao vai liberar.

5. Reconhecer a nomenclatura dos nucleotdeos quanto aos seus componentes estruturais. Olhando s o acar e a base nitrogenada, o nucleoSIDIO pode ser classificado: Com ribose - adenina+ribose=adenosina ; guanina+ribose=guanosina; ........ Com dexoxiribose - adenina+desx=desoxiadenosina ; desoxi-numseiquel, a vai.... juntando com o fosfato fica assim ex: se o fosfato tiver no C5 da adenina, o nucleoTIDIO se chama "desoxiadenosina-5' fosfato"

6 Reconhecer as foras de estabilizao entre nucleotdeos de molculas diferentes e dentro de uma mesma molcula As bases de um nucleotdeo unem-se covalentemente por meio de uma ligao n-glicosdica ao carbono 1 da pentose, e o fosfato est esterificado( ligao ester) ao carbono 5 da pentose. Os nucleotdeos sucessivos do DNA e RNA so ligados covalentemente por meio de pontes de grupos fosfato, em que o grupo fosfato de um nucleotdeo( que est no carbono 5) une-se ao grupo 3- hidroxila do nucleotdeo seguinte por uma ligao fosfodister. Para o DNA na dupla hlice o pareamento de bases complementares formado por pontes de hidrognio dentro de hlice (A T 2 pontes, C G 3 pontes) e os esqueletos hidroflicos acar fosfato so localizados no exterior. 7 Reconhecer o sentido de sntese de 5- 3 no DNA e RNA A extremidade 5 sempre contem um grupo fosfato e na extremidade 3 tem- se uma hidroxila onde pode ser adicionados mais nucleotdeos, considerado ento o final da cadeia. 8 Porque o DNA tem timina e no uracila? Nucleotdeos e cidos nuclicos sofrem transformaes no enzimticas que costumam ser muito lentas, como exemplo a desaminaao da citosina formando a uracila, guanina formando xantina e a metilao da citosina formando timina. Acontece que a reao de transformao da citosina em uracila um processo que ocorre com um nmero muito grande de citosina ( cerca de 107 citosinas em 24hrs). Quando a citosina se transforma em uracila no DNA, este logo reconhecido como estranho e removido por um sistema de

reparo. Se o DNA normalmente contivesse uracila, o reconhecimento das uracilas no-reparadas levariam s alteraes permanentes de seqncia quando fossem pareadas com adeninas durante a replicao. A desaminao da citosina levaria gradualmente a um decrecimo nos pares GC e um aumento dos pares AU. Ao longo de milnios os pares CG deixariam de existir. 9 Reconhecer a existncia de precursores de nucleotdeos

AMINOCIDOS E PEPTDEOS
1. Saber a frmula geral dos aminocidos e a localizao dos grupos: amino e carboxlico.

2. Reconhecer os tipos de isomeria que os aminocidos apresentam. Todos os aminocidos (exceto a glicina, que possui um H como radical, portanto no tem os quatro ligantes diferentes) apresentam isomeria tica. As duas formas de cada par so denominadas estereoismeros, ismeros ticos, ou enantimeros. Nas protenas, todos os aminocidos so encontrados na configurao L. A configurao D pode ser vista apenas em alguns antibiticos e em paredes celulares bacterianas.

3. Classificar os aminocidos de acordo com o radical. De acordo com o radical, os aminocidos podem ser classificados em apolares, aromticos, polares sem carga, polares positivamente carregados, e polares negativamente carregados.

4. Identificar os aminocidos apolares, aromticos, polares sem carga e polares com carga positiva e negativa.

Apolares: glicina, alanina, prolina, valina, leucina, isoleucina, metionina Aromticos: fenilalanina, tirosina, triptofano Polares sem carga: serina, treonina, cistena, asparagina, glutamina Polares com carga positiva: lisina, arginina, histidina Polares com carga negativa: aspartato, glutamato

5. Reconhecer alguns aminocidos raros, como hidroxiprolina, hidroxilisina, desmosina, etc. e a importncia dos mesmos na estrutura e funo das protenas. A hidroxiprolina e a hidroxilisina so aminocidos presentes no colgeno, no podendo ser encontradas em muitas outras protenas. Estes resduos so resultam da hidroxilao de prolina e de lisina. So muito importantes na estabilizao da tripla hlice do colgeno. J a desmosina encontrada na elastina. Ela resulta da ligao cruzada de quatro cadeias laterais de lisina (de quatro cadeias separadas de elastina) formando assim uma rede elstica de extensamente interconectada, dando assim elasticidade ao tecido conjuntivo. 6. Saber que os nomes dos aminocidos podem ser indicados pelas trs primeiras letras ou unicamente por uma das letras do alfabeto. As abreviaes vm do nome em ingls.

7. Calcular os pontos isoeltricos dos aminocidos monoamino, monocarboxlicos, diamino, monocarboxlicos e monoamino, dicarboxlicos a partir de seus pKs. Para calcular o ponto isoeltrico de um aminocido basta fazer a media entre os seus dois pKs. Se o radical tambm se ionizar, haver um 3 pK. O que se deve fazer ento , no caso de o aminocido ter carter acido, usar os dois pKs mais cidos. Se o aminocido for bsico (caso apenas da lisina, arginina e histidina, j que os polares sem carga tambm tm carter cido), deve-se ento usar os dois pKs mais bsicos.

8. Indicar porque a tirosina e o triptofano servem para determinar a presena de protenas em uma soluo. A tirosina e principalmente o triptofano so usados para detectar a presena de protenas pois absorvem grande quantidade de luz ultravioleta, sendo o pico de absoro aproximadamente 280 nm. Alm disso, a tirosina e o triptofano esto presentes em grande parte das protenas.

9. Mostrar a reao de formao de cistina a partir da cistena. Quando 2 cistenas so aproximadas (mesmo podendo estar separadas por muitos aminocidos na seqncia primria, ou at estando em duas cadeias diferentes) elas podem formar uma ponte dissulfeto (uma ligao covalente formada pelo grupo sulfidrila (-SH)) e formar uma cistina pela reduo dos dois resduos de cistena.

10. Explicar o comportamento de um aminocido na presena de solues cidas e de alcalinas. Na presena de uma soluo cida, o aminocido fica protonado. Quando em soluo bsica, os aminocidos fica desprotondo (liberam os seus H + . )

11.

Explicar as curvas de titulao dos aminocidos.

A curva de titulao apresenta 2 (ou 3 se o R tambm se ionizar) estgios distintos, correspondendo cada um desprotonao de cada grupo. Cada um pode ser analisado individualmente, lembrando a curva de dissociao de um cido monoprtico. Num pH muito baixa, a espcie predominante a totalmente protonada. No ponto mdio do 1 estgio (no qual o grupo carboxila perde o seu prton), esto presentes concentraes equimolares da forma doadora de prtons (COOH) e da forma receptora de prtons (COO-). Neste instante, o pH igual ao pKa (do grupo carboxila). O prximo ponto importante aparece um pouco depois, numa outra inflexo. Nesse ponto, a remoo do hidrognio da carboxila est completa. Nesse pH, o aminocido encontra-se principalmente como um on dipolar (ponto isoeltrico), possuindo um grupamento COO - e um grupamento NH3+. ento iniciada a 2 fase da titulao, com a remoo do hidrognio do NH 3+. O pH no ponto mdio desse estgio o pKa (ou pK 2) do grupamento amino. Quando a titulao est completa, a forma predominante do aminocido a desprotonada, com os grupamentos COO- e NH2.

12. Escrever a reao de formao de uma ligao peptdica. A ligao peptdica formada liberando uma molcula de gua. Ela pode, ento, ser quebrada por hidrlise.

13. Identificar a nomenclatura dos peptdeos e dar exemplos. Por conveno, a extremidade amino livre da cadeia peptdica escrita esquerda, e a extremidade carboxila livre direita. Assim, todas as seqncias de aminocidos so lidas do N- para o C-. Quando dado um nome a um polipeptdio, todos os resduos de aminocidos cujos nomes terminam em ina, -ano, -ico ou ato tm as terminaes alteradas para il, com exceo do aminocido C terminal. Por exemplo, um tripeptdeo composto de uma valina N terminal, uma glicina e uma leucina C terminal denominado valilglicileucina.

14. Saber que as protenas so polipeptdeos, que variam entre si quanto ao peso molecular, nmero de resduos de aminocidos, nmero de cadeias polipeptdicas e composio de aminocidos. Ok

15.

Definir protenas conjugadas e dar exemplos.

Protenas simples contm apenas resduos de aminocidos. Entretanto, existem protenas que possuem outros componentes qumicos permanentemente associados alm dos aminocidos. Essas protenas so chamadas protenas conjugadas. A poro no-aminocida de uma protena conjugada denominada grupo prosttico. Essas protenas so classificadas de acordo com a natureza qumica de seu grupo prosttico. Por exemplo, as lipoprotenas contm lipdios, as glicoprotenas contm aucares, e as metaloprotenas contm um metal especfico.

ESTRUTURA PROTEICA
1. Reconhecer que existem dois grandes grupos de protenas, as solveis (globulares) e as estruturais (fibrosas). 2. Entender que as protenas globulares so estudadas atravs de quatro nveis de organizao estrutural. A organizao das protenas globulares pode ser estudada atravs da estrutura primria, secundria, terciria e quaternria.

3. Explicar porque as ligaes peptdicas so rgidas e planares e que os carbonos alfa rotacionam livremente entre duas ligaes peptdicas. A ligao peptdica tem um carter parcial de dupla ligao:mais curta que a simples, portanto rgida e planar. J os carbonos alfa rotacionam livremente, o que permite cadeia polipeptdica assumir uma srie de conformaes diferentes.

4. Saber o que se considera como estrutura primria de uma protena. A estrutura primria e a estrutura mais bsica de uma protena. Ela se refere seqncia dos aminocidos que formam a protena.

5. Entender que as protenas podem sofrer modificaes pstraduo para incorporao de aminocidos raros. Aminocidos raros podem ser incorporados protena mesmo aps a traduo. Exemplos disso so a hidroxiprolina e a hidroxilisina incorporadas ao colgeno (a hidroxiprolina tambm existe na elastina) pela hidroxilao da prolina e da lisina presentes inicialmente na estrutura. Outro aminocido raro, a desmosina, incorporada elastina aps a traduo, pela unio covalente de quatro lisinas (de quatro cadeias separadas de elastina), formando assim ligaes cruzadas.

6. Saber que muitas protenas so sintetizadas na forma de precursores inativos. Algumas protenas so sintetizadas na forma de precursores inativos, muitas vezes para evitar danos ao organismo. Exemplo disse a tripsina, que liberada inativa para evitar a digesto do prprio organismo, sendo ativada apenas quando necessrio.

7. Reconhecer as principais formas de estruturas secundrias apresentadas pelas protenas (-hlice, folha -pregueada ou conformao e -curvatura). A alfa-hlice uma estrutura em espiral. Ela estabilizada por vrias pontes de hidrognio entre os oxignios da carbonila e os hidrognios da amida. A folha beta-pregueada ou conformao beta uma estrutura na qual todos os componentes da ligao peptdica esto envolvidos nas pontes de hidrognio. As superfcies das beta-folhas parecem dobradas. J a betacurvatura revertem a direo de uma cadeia polipeptdica.

8. Saber o tipo de ligao que se forma entre os grupos amino e carboxlico das ligaes peptdicas para estabilizar a estrutura secundria. Formam-se pontes de hidrognio entre os grupos amino e carboxlico.

9. Entender que a estrutura terciria uma forma tridimensional de arranjo protico que envolve interao entre os radicais dos diferentes aminocidos que formam a protena.

A estrutura das protenas globulares muito compacta. Ela organizada de maneira que as cadeias laterais hidrofbicas ficam enterradas no centro da estrutura, enquanto as hidroflicas geralmente so encontradas na superfcie da molcula.

10.

Definir motivo ou estrutura supersecundria.

As estruturas supersecundrias so produzidas pelo agrupamento das cadeias laterais de elementos estruturais secundrios adjacentes. As alfahlices e as beta-curvaturas, por exemplo, que so adjacentes na seqncia de aminocidos, normalmente tambm so adjacentes na conformao final da protena dobrada.

11.

Saber o que significa o termo domnio de uma protena.

Domnios so unidades funcionais fundamentais de uma protena. O centro de um domnio normalmente formado pela combinao de estruturas supersecundrias. Cada domnio tem caractersticas de uma protena globular pequena, que estruturalmente independente dos outros domnios.

12.

Conceituar estrutura quaternria de uma protena e entender o papel funcional das mesmas.

Muitas protenas consistem de mais de uma cadeia polipeptdica. O arranjo dessas cadeias a estrutura quaternria. As subunidades so mantidas juntas por interaes no-covalentes (interaes hidrofbicas, pontes de hidrognio, ligaes inicas). As subunidades podem trabalhar independentemente, ou cooperativamente, como na hemoglobina, onde a ligao do oxignio a uma unidade aumenta a afinidade das outras ao oxignio tambm. 13. Calcular o peso molecular aproximado de uma protena considerando o peso mdio dos aminocidos. O peso mdio dos aminocidos 110 Kda.

Modificaes proticas ps-traducionais

OK (respostas xerocada)

1. Mostrar detalhadamente todas as etapas envolvidas na formao de uma protena para exportao. Pelo ribossomo livre no citoplasma inicia-se a traduo. Ao ser produzido o peptidio sinal hidrofbico, ele se liga a uma partcula de reconhecimento do sinal (SRP) cessando a traduo. Esse complexo se move at o reticulo endoplasmtico rugoso (ER), onde se liga a um receptor de SRP localizado na face externa da membrana do ER. O ribossomo encaminhado para um translocon, receptor de ribossomos que faz uma comunicao entre o meio externo e interno, deixando dirigir outros ribossomos ao ER. O bloqueio da traduo causado pelo SRP removido e a passagem do translocon destapada para permitir a entrada da protena nascente. Terminada a traduo a peptidase sinal, protena integral com face voltada para o interior do ER, exclui o peptdio sinal da protena. A protena agora est pronta para chegar sua estrutura final e ser secretada pelo complexo de golgi. 2. Demonstrar que a glicosilao um processo que envolve a participao do retculo endoplasmtico e do complexo de Golgi. 3. Explicar a biossintese de glicoprotenas com oligossacardeos N-ligados. 4. Indicar os principais tipos de oligossacardeos presentes nas glicoprotenas. 5. Entender como a preproinsulina se transforma em proinsulina e finalmente, na insulina (hormnio ativo). A preproinsulina transportada para o ER onde sofre o processo de clivagem e perde o peptidio sinal sendo assim transformada em prinsulina, aps a clivagem a prinsulina se dobra afim de formar as pontes disulfeto corretas, se dirige para o complexo de golge onde por protelise um peptdeo interno de conexo retirado, e assim pode ser secretada. 6. Explicar o mecanismo de ativao de zimognios. A protelise especifica o mecanismo pelo qual os zimognios so ativados. Acontece com a clivagem de uma ou mais ligaes peptdicas por enzimas especificas. 7. Demonstrar como vrios aminocidos podem sofrer modificaes aps a sua incorporao s protenas, gerando importantes radicais funcionais.

IV. Mtodos de isolamento e purificao de protenas

1. Definir o termo: protemica. - Analogamente genmica, protemica o estudo das diversas protenas sintetizadas por um organismo suas funes nele, assim como suas relaes com os elos evolutivos 2. Identificar como a protemica pode ajudar no diagnstico, tratamento e preveno de doenas. - Como as protenas so a linguagem principal de expresso das clulas, estudos qualitativos e quantitativos podem revelar diversos detalhes sobre os estado e funcionamento do organismo. Ex clssico: um dos sinais do infarto das clulas do miocrdio a presena no sangue de quantidades grandes de uma determinada enzima dessas clulas. 3. Saber que as protenas podem ser separadas de acordo com suas propriedades, como tamanho, carga, afinidade e outras propriedades. - ok 4. Entender que as protenas podem ser separadas e caracterizadas por tcnicas de eletroforese mono- e bidimensional. - Esse processo o seguinte: geralmente se comea fazendo a eletroforese unidimensional, que consiste em colocar mistura de protena numa tira graduada com pH e botar um campo eltrico pra arrastar ela e precipit-la no seu pH especfico, fazendo com fiquem varias faixas, que so misturas de protenas com mesmo pI mas peso diferente. Depois se coloca essa tira horizontalmente em cima de um retngulo cheio de gel, e coloca-se um campo vertical que faz as protenas sejam arrastadas pra baixo. As mais pesadas ficam pra trs, enquanto as mais leves vo mais pra frente, terminando assim a separao por pI e peso molecular. 5. Saber que as protenas podem ser identificadas e seqenciadas por espectrometria de massa. Ok?

QUMICA DE CARBOIDRATOS

Objetivos:

1. Conceituar carboidrato. Os carboidratos so, predominantemente, poliidroxialdedo ou poliidroxicetonas cclicos, ou substancias q liberam esses compostos por hidrolise. Sua oxidao a principal via metablica fornecedora de energia para a maioria das clulas no-fotosintticas. Polmeros insolveis funcionam como elementos estruturais das paredes celulares de bactrias e vegetais e nos tecidos conjuntivos de animais. Tambm podem servir de lubrificantes das articulaes esquelticas e participam do reconhecimento e da coeso entre clulas. 2. Classificar os carboidratos de acordo com o nmero de unidades monossacardicas que apresentam. Os monossacardeos, ou aucares simples, consistem em uma nica unidade poliidroxialdedo ou cetona. Os oligossacardeos so compostos de cadeia curtas de unidades monossacardicas unidas entre si por ligaes caractersticas, denominadas glicosdicas. Os mais abundantes so os dissacardeos, formadas por duas unidades monossacardicas. J aqueles q possuem mais de 20 unidades monossacardicas so chamados de polissacardeos. 3. Classificar os monossacardeos de acordo com o nmero de tomos de carbono e de acordo com a funo aldedica ou cetnica . Se o grupo carbonila est em uma das extremidades da cadeia carbnica (um aldedo), o monossacardeo uma aldose; se o grupo carbonila est em qualquer outra posio (uma cetona) chamado de cetose. Os monossacardeos mais simples so as duas trioses com trs carbonos: o gliceraldeido, uma aldotriose, e a diidroxicetona, uma cetotriose. Os monossacardeos com quatro, cinco, seis e sete tomos de carbono so chamados respectivamente de tetroses, pentoses...

4. Identificar as sries D e L das aldoses e das cetoses. Excetuando a diidroxicetona todos os monossacardeos possui um ou mais carbonos quirais. Por conveno uns enantiomeros so chamados de ismeros D e outros de ismeros L, q n necessariamente desviam o plano da luz para esquerda ou direita. A classificao D e L vo estar relacionadas com a posio da penltima hidroxila; para a direita ser D; para a esquerda ser L.

D-gliceraldeido

L-gliceraldeido

5. Explicar porque os monossacardeos apresentam isomeria tica e o nmero de ismeros possveis quando um novo carbono assimtrico for introduzido no monossacardeo. Os monossacardeos apresentam carbonos assimtricos q ora desviam o plano da luz para esquerda ora para direita. O numero de ismeros possveis de um monossacardeo segue a formula 2 n, onde n o numero de carbonos assimtricos. 6. Reconhecer as estruturas dos seguintes monossacardeos: D-gliceraldeido, dihidroxiacetona, D-ribose, D-frutose, Dglicose, D-galactose e D-manose. Olhe na Xerox , tem direitinho lah 7. Saber o que so epmeros e exemplificar. Dois aucares q diferem apenas na configurao ao redor de um nico tomo de carbono so chamados de epmeros. A d-manose e a d-galactose so epmeros da d-glicose. Olhe a figura na Xerox... 8. Mostrar que os monossacardeos em soluo aquosa apresentam estruturas cclicas do tipo piranosdica ou furanosdica. Em solues aquosas as aldotetroses e todos os monossacardeos com cinco ou mais tomos de carbono na cadeia ocorrem, predominantemente, como estruturas cclicas nas quais o grupo carbonila forma uma ligao covalente com o oxignio de um grupo hidroxila ao longo da cadeia, esse carbono da carbonila chamado de carbono hemiacetal ou anmerico. Lembrando q hemiacetais so o produto de um grupo aldedo ou cetona reagido com um lcool ao longo da cadeia e anmeros so monossacardeos q diferem apenas na configurao ao redor do carbono hemiacetal.

Depois de formada a ligao hemiacetal os monossacardeos podero adquirir duas formas, a piranosidica e a furanosidicas, que so definidas assim devido a semelhana com os compostos pirano e furano respectivamente.

9. Explicar o fenmeno de mutarrotao dos monossacardeos e os dois tipos de ismeros possveis de serem encontrados em soluo aquosa. Estando na forma cclica um monossacardeo pode conter dois tipos de configuraes ao redor do carbono hemiacetal, essas duas formas so denominadas anmeros e . A interconvero dos anmeros e chamada de mutarrotao. 10. Mostrar que os monossacardeos podem sofrer reaes de oxidao, aminao, desidrogenao e esterificao. Em adio s hexoses simples como a glicose, a galactose e a manose existe um grande numero de seus derivados, nos quais um grupo hidroxila no composto original trocado por um outro grupo substituinte, ou um tomo de carbono oxidado a acido carboxlico. 11. Saber escrever uma reao de formao de uma ligao glicosdica.

12. Identificar os componentes e o tipo de ligao glicosdica encontrada nos seguintes dissacardeos: lactose, sacarose, maltose e celobiose. Lactose: galactose c1beta - glicose c4 alfa Sacarose: glicose c1alfa frutose c2 alfa Maltose: glicose c1alfa glicose c4 alfa Celobiose: glicose c1beta glicose c4 alfa

13. Classificar os polissacardeos de acordo com os tipos de resduos glicosdicos que apresentam. Os Polissacarideos podem ser chamados de homopolissacarideos quando possuem apenas um nico tipo de unidade monomrica ou heteropolissacarideo, qd cotm dois ou mais tipos diferentes de unidades monomricas. Ambos podem ser ramificados ou lineares. 14. Explicar as estruturas do amido, do glicognio e da celulose. Amido: Contm dois tipos de polmeros da glicose de alta massa molecular, a amilose e a amilopectina. O primeiro consiste de cadeias longas, noramificadas de unidades de D-glicose conectadas por ligaes (1_4). A amilopectina diferente da amilose altamente ramificada. Glicogenio: Tambm um polmero de subunidades da glicose porm mais intensamente ramificado e mais compacto q o amido. Celulose: um homopolmero linear e no-ramificado, de 10 mil a 15 mil unidades de D-Glicose. A diferena mais importante que na celulose as unidades de glicose tem configurao e so unidas por ligaes glicosdicas do tipo (1_4). 15. Definir o termo glicosaminoglicano.

 uma famlia de polmeros lineares compostos por unidades repetitivas de dissacardeos, onde um deles sempre a N-acetilglucosamina ou a Nacetilgalactosamina. Em alguns glicosaminoglicanos, uma ou mais das hidroxilas do acar aminado esto estereficadas com sulfato. O padro caracterstico das unidades sulfatadas e no-sulfatadas nos glicosaminoglicanos estabelece um reconhecimento especifico por uma variedade de protenas ligantes q se associam eletrostaticamente com essas molculas. Os glicosaminoglicanos esto ligados a protenas extracelulares pra formar o proteoglicanos. 16. Reconhecer as estruturas dos principais glicosaminoglicanos e saber suas principais funes e locais de ocorrncia. ACIDO HIALURNICO: contem unidades alternada de cidos D- hialurnico e N-acetilglicosamina; forma a matriz extracelular dos tecidos animais. 17. Explicar a proteoglicanos. estrutura dos peptdeosglicanos e dos

Proteoglicanos: So macromolculas da superfcie da clula ou da matriz extracelular, nos quais uma ou mais cadeias de glicosaminoglicanos esto ligados covalentemente a uma protena de membrana ou a uma protena secretada. Peptdiosglicanos: consiste de um heteropolmero lineares com unidades alternantes entrecruzados por peptdeos pequenos. 18. Mostrar como os proteoglicanos interagem com as superfcies celulares. Proteoglicanos so protenas extracelulares ligadas a glicosaminoglicanos (estruturas que possuem um dos acares aminados e normalmente sulfatados). Os glicosaminoglicanos possuem alta quantidade de carga negativa, e por isso acabam atraindo uma nuvem de ctions, onde o mais atrado o sdio que traz com ele molculas de gua. Essa capacidade dos glicosaminoglicanos de atrair ctions e gua confere aos proteoglicanos a funo de dar a matriz extracelular uma caracterstica hidratada. Alm disso, os proteoglicanos tm a funo de dar rigidez a matriz, resistindo compresso e preenchendo espaos. Alguns proteoglicanos ainda podem estar ancorados na membrana, podendo se ligar a fatores de crescimento e a outras protenas servindo como sinal para as clulas. Eles tambm podem formar gis que atuam como um filtro para regular a passagem de molculas atravs do meio extracelular, e ainda, podem bloquear, ativar ou guiar a migrao celular atravs da matriz. 19. Diferenciar glicoprotena de proteoglicano.

As fraes oligossacaridicas das glicoproteinas so menos repetitivas, elas so ricas em informaes, compondo stios altamente especficos para o reconhecimento e a ligao de alta afinidade com outras protenas.

20.

Indicar as formas de ligao entre protena e carboidratos.

Podem ser O ligao ou N-ligao