Discussion des

approches méthodologiques
dans un cas concret
d’épidémiologie écologique
L’infertilité saisonnière des truies

Vincent Auvigne & Philippe Leneveu

 L’infertilité saisonnière :une réalité
87

86
F. Hiver
85 Moyenne : 85%
Fertilité

84

83
Variation
saisonnière F. été
82
2

1
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17
-1

-1

-1

-2

-2

-2

-3

-3

-3

-3

-4

-4

-4

-5
-3

-6

-9

10

13

16

19

22

25

28

31

34

37

40

43

46

49
Bande
1

Semaine 2
 Un origine encore discutée

Température ambiante élevée

Photopériode
Autres facteurs saisonniers
 Disponibilité en main d’œuvre
 Perte des soies
 Qualité des céréales, mycotoxines
 Matériel
DEPT_SEL par Région
Est-BZH (2)

 
Finistere (1)
Nord-Pdc (3)
Sud-Loire (5)

Nombre de visites


 12 000






6 000

 1 200


 

 
Pb 2005 


 

Échographies






2003 à 2007
 266 élevages 



 610 117 inséminations

4
Des questions méthodologiques

Différencier température et photopériode

Quelle est l’unité statistique pertinente ?

L’impact du choix d’un indicateur

Comment quantifier l’effet élevage ?

Différencier température et photopériode

Nº jours > 25º par semaine Durée

Durée duàjour
du jour Rennes
19
16

Chaleur 14
? 12
9 Photo-
7 période?
4
2
0

Rennes – moyenne des 5 ans 6

 7

2007-17
2007-16
2007-15
2007-14
2007-13
2007

2007-12
2007-11
2007-10
2007-09
2007-08
2007-07
2007-06
2007-05
2007-04
2007-03
Répétabilité et variabilité

2007-02
2007-01
2006-17
2006-16
Différencier température et photopériode

2006-15
2006-14
2006-13
2006
2006-12
2006-11
2006-10
2006-09
2006-08
2006-07
2006-06
2006-05
2006-04
2006-03
Baisse chaque été

2006-02
2006-01
2005-17
2005-16
2005-15
2005-14
2005-13

2005
2005-12

Bande
2005-11
2005-10
2005-09
2005-08
2005-07
2005-06
2005-05
2005-04
2005-03
2005-02
2005-01
2004-17
2004-16
2004-15
2004-14
2004-13

2004
2004-12
2004-11
2004-10
2004-09
2004-08
2004-07
2004-06
2004-05
2004-04
2004-03
2004-02
2004-01
2003-17
2003-16
2003-15
2003-14
2003-13

2003
2003-12
2003-11
2003-10
2003-09
2003-08
2003-07
2003-06
2003-05
2003-04
2003-03
2003-02
2003-01

86

84

82

80

78

76
Fertilité
Quelle unité statistique pertinente ?
80 80
70
Est-Bzh 70 Finistère
60 60 Nº de días
50 50
Nº de días

Nº de días

10
20
30
40
50
60
70
80
0
40 40
30 30
20 20

2003
10 10
0 0
2003 2004 2005 2006 2007 2003 2004 2005 2006 2007
Año Año

2004
80 80
Sud
70
Nord 70

m >18ºC y M ≥ 32°C
M ≥ 25°C
60 60
50 50
Nº de días

Nº de días
2005
Año

40 40
30 30
20 20
10 10
2006

0 0
2003 2004 2005 2006 2007 2003 2004 2005 2006 2007
Año Año

8
2
 Quelle unité statistique ?
Lien chaleur / infertilité
Une constatation sans statistique
2003
 Est l’année la plus chaude
 Et
 Est statistiquement différente des autres années (plus
d’infertilité)

2007
 Est l’année la plus fraiche
 Et
 N’est pas différente des autres années
 L’impact du choix d’un indicateur
Le niveau de fertilité de référence
<=80.8 % >80.8 - 85.1 % >86 - 88.8 % >88.8 % <=81.7 >81.7 - 86.2 >86.2 - 90.1 >90.1
0 0
Infertilité saisonnière

Infertilité saisonnière
-1 -1

-2 -2

-3 -3

-4 -4

-5 -5

-6 -6
Fertilité moyenne de l'année Fertilité hivernale de l'année

<=82,6 % >82,6 - 86,2 % >86 - 89,4 % >89,4 %

0
Infertilité saisonnière

-1

-2

-3

-4

-5

-6
Fertilité hivernale des 5 années
Comment quantifier l’effet élevage ?

Hypothèse
Il y a un effet élevage dans la variation saisonnière
de fertilité
Dans un élevage la conduite de la reproduction est
relativement stable

Le niveau de variation saisonnière d’une année

donnée est corrélé à celui de l’année précédente

11
 Comment quantifier l’effet élevage ?
Un effet élevage mineur

Modèle 11
Modèle Modèle 22
Modèle
Variation
Variation Fertilité
Fertilité
AA expliquer
expliquer saisonnière
saisonnière hivernale
hivernale
2006
2006 2006
2006
Variation
Variation Fertilité
Fertilité
Par
Par saisonnière
saisonnière hivernale
hivernale
2005
2005 2005
2005
pp <0.001
<0.001 <0.001
<0.001
22
R
R 7%
7% 39%
39%

12
Des questions méthodologiques

Différencier température et photopériode

Quelle est l’unité statistique pertinente ?

L’impact du choix d’un indicateur

Comment quantifier l’effet élevage ?

La discussion est ouverte !