METABOLISME PROTEIN

ASAM AMINO
H
2
N
Amino
group
C
Side chain
R
H
C
O
OH
Carboxyl
group
Non-ionized form
STRUCTUR ASAM AMINO
H
H H H
H H H O O O H H O H H O
N C C N N C C C C
H CH
3
CH
2
OH
N-terminus
N C C
CH
2
C
O
OH
CH
2
N C C
CH
CH
3
H
3
C
CH
2
OH
H H O
N C C
H H O
N C C
H H O
N C C
CH
2
SH
OH
C-terminus
POLYPEPTIDE CHAIN
Menurut Bond (1979), seperti hal hewan-hewan lain
ikan membutuhkan komponen-komponen nutrisi
seperti protein, karbohidrat, lemak, vitamin, mineral
dan air.
Berdasarkan Weatherly et al . (1987) kandungan
nutrisi akan berpengaruh pasda tingkah laku,
kesehatan, fungsi fisiologis, reproduksi dan
pertumbuhan ikan. Zat-zat gizi oleh ikan akan
digunakan untuk menghasilkan tenaga, mengganti
sel-seltubuh yang rusak, dan juga untuk tumbuh.

Protein merupakan unsur yang sangat dibutuhkan oleh tubuh
ikan, terutama untuk menghasilkan energi maupun untuk
pertumbuhan(Watanabe, 1988)
Menurut Fujaya (1999), kebutuhan protein untuk ikan berbeda-
beda menurut spesiesnya dan pada umumnya berkisar antara
20%--60%
Suprayudi et al . (1994) variasi dan kebutuhan akan protein
dipengaruhi oleh jenis ikan, umur ikan, daya cerna ikan, kondisi
lingkungan, kualitas protein, temperatur air, dan sumber protein
tersebut.

Ikan, terutama karnivora membutuhkan kandungan
protein dalam pakannya mencapai sekitar 300%
lebih tinggi dari pada kebutuhan protein pakan untuk
hewan darat dan burung (NRC, 1983; Tacon &
Cowey, 1985; Zonneveld et al ., 1991; Pillay, 1993)
Tingginya kebutuhan protein pakan bagi ikan
disebabkan karena ikan cenderung menggunakan
protein sebagai sumber energi dibandingkan
karbohidrat dan lemak (Tacon & Cowey, 1985;
Halver, 1989).

Protein
Asam amino merupakan sumber utama untuk glukosa
melalui jalur glukoneogenesis, tetapi gliserol dari
trigliserida juga dapat digunakan.
Glukoneogenesis dan glikogenolisis penting untuk
memback up sumber glukosa pada saat puasa.
Asam amino dalam tubuh terutama digunakan untuk
sintesis protein. Tetapi, jika asupan glukosa rendah, asam
amino dapat diubah menjadi glukosa melalui jalur yang
disebut glukoneogenesis yaitu pembentukan glukosa
baru dari prekursor nonkarbohidrat
Struktur supramolekul


Protein asam nukleat polisakarida lipid



Asam amino nukleotida gula sederhana*) gliserol
asam lemak


- ketoacids ribosa pyruvat(C3) asetat (C2)
C3, C4, C5 nitrogen pyruvat (C3)



Karbon (C), hidrogen (H), oksigen (O)
Nitogen (N), fosfor (P), sulfur (S)
Makanan
(protein)
Asam Amino
HATI
ASAM KETO
UREA
S. AS SITRAT
SEL TUBUH
ESENSIAL

Protein dalam
makanan
Asam Amino
A. A dalam darah
A.A. dl HATI
(ektrasel)
A.A. Dalam darah
A. A. dl Hati
(intra sel)
PROTEIN
Senyawa N lain
A. A. ektra sel
A. A. intra sel
PROTEI
N
A. Keto Asam lemak
S
urea
Sik. A. Sitrat
A. Keto NH3
pencernaan
absorbsi
karbohidrat lipid protein

Mulut: pencernaan mekanik & cairan ludah (enzim saliva)

poli/oligo/disakarida lipid prot & polipeptida


Lambung: enzim pepsin & lipase; asam lambung (HCl)

poli/oligo/disakarida lipid/trigliserida prot & polipeptida


Usus halus: cairan pankreas (tripsin, kimotripsin, karboksipeptidase, amilase, lipase,
ribonuklease, deoksiribonuklease, kolesterol esterase); cairan empedu/hati; enzim
kelenjar usus (aminopeptidase, dipeptidase, sukrase, mltase, laktase, fosfatase,
glukosidase); bakteri usus halus



monosakarida gliserol,as.lemak asam amino
(gluk,frukt,galaktosa) as.fosfat
Amino Acids

20 Amino
Acids

Note:
Variable
R Group
Asam amino dalam darah
Jumlah asam amino dalam darah tergantung jumlah
yang diterima dan jumlah yang digunakan
Proses absorbsi asam amino dalam dingding usus
adalah proses transport aktif yang memelukan
energi
Dalam keadaan berpuasa. Konsentrasi asam amino
dalam darah 3.5-5 mg/ 100ml darah. Setelah ada
asupan makanan menjasi 5-10mg/100ml darah. Dan
turun kembali setelah 6 jam.
Alanine carries amino groups from muscle to the
liver for excretion
Ala
-keto-
glutarate
pyruvate
CO
2
-
C=O
CH
3
Glu
NH
4
+
glucose
CO
2
-
+
H
3
N C H
CH
3
urea
liver
Ala
-keto-
glutarate
muscle
protein
pyruvate
CO
2
-
C=O
CH
3
Glu
amino acids
glucose
CO
2
-
+
H
3
N C H
CH
3
muscle blood
O
H
2
N-C-NH
2

Reaksi metabolisme asam amino
Meliputi reaksi pelepasan gugus asam amino
Kemudian perubahan kerangka karbon
A1. transaminasi : Proses katabolisme asam amino
berupa pemindahan gugus amino darisuatu asam
amino ke senyawa lain (keto. Asam piruvat,
ketoglutarat atau oksaloasaetat). Sehingga
(keto)senyawa tersebut dirubah menjadi asam
amino. Sedangkan asam amino dirubah menjadi
senyawa keto)
The first step in catabolism of most amino acids is transamination
-ketoglutarate glutamate
-keto
acid
amino acid
The main function of transamination is to funnel amino groups
into a small number of amino acids, particularly Glu & Asp.
Some amino transferases (transaminases) are specific for
-ketoglutarate and Glu; others use oxaloacetate and Asp.
CO
2
-
CO
2
-
C=O
CH
2
CH
2
CO
2
-
CO
2
-
+
H
3
N C H
CH
2
CH
2
CO
2
-
+
H
3
N-C-H
R
CO
2
-
R
C=O
Enzim utama rekasi transaminasi adalah:
Alanin transaminase alanin
Glutatamat transaminase glutamat
A.2 Deaminasi oksidatif:
Asam glutamat dapat mengalami deaminasi
oksidatif mengunakan glutamat
dehidrogenase, menghasilkan NH4+
NADP NAD sebagai akseptor elektron
The amino groups of glutamic acid and glutamine
can be released as ammonia in liver mitochondria
H
2
O NAD
+
or
NADP
+
Glu
-keto
acids
cellular
protein
ingested
protein
NADH or
NADPH + H
+
-keto-
glutarate
CO
2
-
+
H
3
N C H
R
CO
2
-
CO
2
-
C=O
CH
2
CH
2
CO
2
-
CO
2
-
+
H
3
N C H
CH
2
CH
2
CO
2
-
C=O
R
amino
acids
Gln from
muscle &
other tissue
NH
4
+

But ammonia is toxic,
particularly to neural tissue.
Organisms must get rid of it.
CONH
2
CO
2
-
+
H
3
N C H
CH
2
CH
2
transaminases
glutamate
dehydrogenase
NH
4
+

Pembentukan Asetil koenzim A
Merupakn senyawa penghubung antra
metabolisme asam amino dengan sikulus
asam sitrat(merubah menjadi energi)
1. jalur asam piruvat
2. jalur asam asetoasetat

AMINO ACID DEGRADATION INTERMEDIATES
CO
2
CO
2
Pyruvate
Acetyl-CoA Acetoacetate
Citrate
Isocitrate
-ketoglutarate
Succinyl-CoA
Fumarate
Oxaloacetate
Citric
Acid
Cycle
CO
2
Glucose
Ala Ser
Cys Thr*
Gly Trp*
Ile*
Leu

Lys

Thr*
Leu

Trp*
Lys

Tyr*
Phe*
Asn
Asp
Asp
Phe*
Tyr*
Ile*
Met
Val
Arg His
Glu Pro
Gln
Glucogenic
Ketogenic
* Both Glucogenic and Ketogenic
Purely Ketogenic
JALUR BIOKIMIA PRODUKSI
ENERGI
Most mammals convert amino-
acid nitrogen to urea for excretion
NH
4
+

ammonium ion
uric acid
H
2
N-C-NH
2

urea
O
NH
4
+

O
O
HN
N
H
N
H
N
H
O
most terrestrial
vertebrates
birds & reptiles
fish & other aquatic
vertebrates
Some animals
excrete NH
4
+
or
uric acid.
amino acids
The carbon chains are
broken down to molecules
that feed into the TCA cycle.
AMINO ACID BIOSYNTHESIS OVERVIEW
(USE OF COMMON INTERMEDIATES)
GLUCOSE GLUC-6-PHOSPHATE RIB-5-PHOS HIS


3-PHOSPHOGLYCERATE SERINE

GLYCINE
E-4-PHOS + PEP
CYSTEINE

PHETYR PYRUVATE ALA
TRP VAL
CITRATE LEU,
ILE

OXALOACETATE, -KETOGLUTARATE
ASP, ASN, GLU, GLN, PRO, ARG, LYS, THR, MET
Biosintesa protein
DNA RNA
Protein
Replikasi
transkripsi translasi
RNA terdiri atas : mRNA (mesenger RNA)(5%)
rRNA (ribosomal RNA) (70%)
t RNA ( transfer RNA


Copyright 2008 John Wiley &
Sons, Inc.
Protein Synthesis
6-18
Gene expression: information coded in a gene is used to
synthesize a producta protein or a molecule of RNA.



H
2
N
H
H
C C
O
OH
Carboxyl
group
H
2
N
H
CH
3
C C
O
OH
Amino
group
H
2
N
H
H
C
O
C N
C C
H H
CH
3
OH
O
Peptide
bond
+ H
2
O +
FORMATION OF A DIPEPTIDE BY WAY OF A PEPTIDE BOND
H
H H H H H H O O O H H O H H O
N C C N N C C C C
H CH
3
CH
2
OH
N-terminus
N C C
CH
2
C
O
OH
CH
2
N C C
CH
CH
3
H
3
C
CH
2
OH
H H O
N C C
H H O
N C C
H H O
N C C
CH
2
SH
OH
C-terminus
H
2
N
H
H
C C
O
OH
Carboxyl
group
H
2
N
H
CH
3
C C
O
OH
Amino
group
H
2
N
H
H
C
O
C N C C
H H
CH
3
OH
O
Peptide
bond
+ H
2
O
H
2
N Gly Ala Ser Asp
N-terminus
2 1 3 5 4 6 7 8
Phe Val Tyr Cys
C-terminus
COOH
+
SUMMARY OF PROTEIN STRUCTURE
TABLE 3.2 A Summary of Protein Structure
Level Description
Primary
Secondary
Tertiary
The sequence of
amino acids
Formation of
-helices and
-pleated sheets
Overall three-
dimensional shape
of a polypeptide
Quaternary Shape produced by
combinations of
polypeptides
Stabilized by:
Peptide bonds
Hydrogen bonding between
peptide groups along the
peptide backbone
Bonds and other interactions
between R-groups, or
between R-groups and the
peptide backbone
Bonds and other interactions
between R-groups, and
between peptide backbones
of different polypeptides
Gly Ser Asp Gls
Example: Hemoglobin
PROTEIN STRUCTURE
Several common functional
groups in a single biomolecule.