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6. ENZIMAS.
6.1. Concepto y estructura.
6.2. Mecanismo de accin enzimtica.
6.3. Cintica enzimtica.
6.4. Regulacin de la actividad enzimtica: temperatura, pH, inhibidores.
6.5. Nomenclatura y clasificacin de las enzimas.
6.1. Concepto y estructura.
Son las molculas protecas ms abundantes. Se encuentran en todo tipo de clulas y catalizan las
reacciones qumicas de los seres vivos (biocatalizadores).Un catalizador es una sustancia que
aumenta la rapidez o velocidad de una reaccin qumica, sin verse alterada ella misma en el
proceso global. Son por tanto, las responsables del metabolismo celular. Son especficas de las
reacciones que catalizan y de los sustratos que intervienen.
Los enzimas son catalizadores muy potentes y eficaces (aumentan la velocidad de las reacciones
entre 103 y 109 veces). No llevan a cabo reacciones que sean energticamente desfavorables,
no modifican el sentido de los equilibrios qumicos, sino que aceleran su consecucin.
Simplemente se alcanza ms rpido el estado de equilibrio.
Podemos apreciar el poder de la catlisis enzimtica con un ejemplo: la descomposicin del perxido
de hidrgeno en agua y oxgeno (2H2O2 2H2O + O2). Esta reaccin aunque fuertemente
favorecida termodinmicamente, es muy lenta, a menos que sea catalizada. Se puede comprar una
botella de una solucin de H2O2 y guardarla en un armario durante meses antes de que se degrade.
Si aadiramos un trocito de in frrico (como FeCl3) la velocidad de la reaccin aumentara unas
1000 veces. La hemoglobina, que contiene hierro, es an ms eficaz para incrementar la velocidad
de la reaccin. Si uno aplica la solucin a un corte de un dedo, observa un burbujeo inmediato de O2
liberado: la reaccin se est produciendo ahora un milln de veces ms rpidamente que el proceso
sin catalizar. Pero pueden alcanzarse velocidades an ms altas. La catalasa, una enzima que
tienen muchas clulas, aumenta la velocidad de descomposicin del H2O2 aproximadamente mil
millones de veces. El H2O2 se produce en algunas reacciones celulares y es un peligroso oxidante,
por lo que la catalasa ha evolucionado para defenderse de l.
Qumicamente son protenas simples de estructura terciaria o cuaternaria (globulares) o
protenas conjugadas; en ste ltimo caso, la parte proteca se denomina apoenzima (inactiva,
carece de los componentes qumicos apropiados para la actividad que debe realizar) y necesitan de
un cofactor, que puede ser un in metlico o una molcula orgnica. La molcula orgnica si se une
fuertemente a la apoenzima recibe el nombre de grupo prosttico, si se une dbilmente se llama
coenzima. Al conjunto de apoenzima y cofactor se le denomina holoenzima.
Los coenzimas actan como un sustrato ms y participan en la reaccin modificndose
qumicamente con ella; sin embargo, al considerar la secuencia de reacciones globales, el coenzima
se recupera en los pasos siguientes. La mayor parte de los coenzimas son vitaminas, o las
vitaminas forman parte de ellas, particularmente las del grupo B. No son especficas de un solo tipo
de apoenzimas, dndose casos de algunas que pueden unirse a ms de 100 apoenzimas diferentes.
El apoenzima presenta una regin llamada centro activo en la que se acopla el sustrato y suele
tener forma de hendidura o bolsillo, rodeada por cadenas laterales de aminocidos que facilitan la
unin del sustrato y por otras cadenas laterales que intervienen en la catlisis. La compleja estructura
terciaria de las enzimas hace posible que en este bolsillo se ajuste el sustrato de manera muy
estrecha lo que explica la extraordinaria especificidad de la catlisis enzimtica. Los aminocidos
que constituyen el centro activo pertenecen a zonas muy distantes de la cadena y representan una
pequea fraccin del nmero total de aminocidos de la protena. El resto de la molcula es
necesaria para mantener la molcula en posicin correcta y para suministrar lugares de unin
adicionales con funcin reguladora (centros reguladores).
6.2. Mecanismo
de
accin enzimtica.
La caracterstica peculiar que
diferencia las enzimas del resto
de las protenas es que inducen
modificaciones qumicas en los
sustratos a los que se unen, ya
sea por rotura, formacin o
redistribucin de sus enlaces
covalentes, ya por introduccin
o prdida de algn grupo
funcional.
En toda reaccin qumica se da
que las sustancias iniciales (S)
se transforman en las
sustancias finales (P),
S
La energa de activacin puede ser el calor. Aumenta el movimiento de las molculas y la energa, con lo
que el nmero de molculas activadas se eleva y la reaccin se acelera (en muchas reacciones la
velocidad se duplica por cada 10 C). En las clulas, la temperatura producira la muerte de la materia
viva y adems se aceleraran indiscriminadamente millares de reacciones.
Las enzimas reducen la energa de activacin de las reacciones que pueden sufrir los sustratos y las
clulas verifican sus reacciones a gran velocidad y temperatura relativamente bajas.
Una enzima es incapaz de hacer posible una reaccin que por s sola no lo es, modifica la velocidad, pero
sin alterar el equilibrio.
Las enzimas consiguen velocidades extremadamente altas con gran especificidad y rendimiento.
Esta eficacia puede ser atribuida a varios factores:
una vez unidas las molculas de sustrato al enzima pasan por una serie de formas
intermedias de geometra y distribucin electrnica muy inestables que origina su
transformacin en los productos de la reaccin. Las enzimas ayudan a sus sustratos a
alcanzar un estado de transicin particular acelerando marcadamente la velocidad (al
unirse el sustrato al enzima se debilitan los enlaces del sustrato y no hace falta tanta
energa para romperlos).
Para calcular esta constante, deberamos conocer la (E) y (ES), valores que no se pueden establecer
directamente. No obstante, cuando la velocidad de la reaccin sea la mitad de la mxima, se cumple
que (E) = (ES), o sea, el nmero de molculas de enzimas libres es igual al de molculas de enzimas
ocupadas. En estas circunstancias, la Ke = (S).
La constante as obtenida se llama constante de Michaelis-Menten o KM, en honor a los pioneros
en formular una teora global de la accin enzimtica y su cintica, y se define como la
concentracin de sustrato para la cual la reaccin alcanza la mitad de la velocidad mxima.
La KM es caracterstica de cada enzima y cuanto menor sea
su valor, mayor afinidad tendr la enzima por el sustrato,
ya que se alcanza antes la mitad de la velocidad mxima.
6.4. Regulacin de la actividad
temperatura, pH, inhibidores.
enzimtica:
un descenso de la velocidad enzimtica, debido a cambios elctricos en los radicales de los aminocidos
que configuran el centro activo. Por debajo y por arriba del pH ptimo se produce la desnaturalizacin de
la enzima anulndose su actividad. Algunos enzimas presentan variaciones peculiares. La pepsina del
estmago, presenta un ptimo a pH = 2, y la fosfatasa alcalina del intestino un pH = 12.
Los inhibidores. Determinadas sustancias van a poder actuar sobre las enzimas disminuyendo o
impidiendo su actuacin. Estas sustancias son los inhibidores. Se trata de molculas que se unen a la
enzima impidiendo que sta acte sobre el substrato.
La inhibicin puede ser irreversible, cuando el inhibidor, llamado en este caso veneno metablico, se une
covalentemente al enzima, alterando su estructura e inutilizndola de forma permanente (los insecticidas
organofosforados inhiben la acetilcolinesterasa, o el cianuro a la citocromo oxidasa).
La inhibicin reversible, ms comn, tiene lugar cuando la enzima vuelve a tener actividad una vez
eliminada la sustancia inhibidora. En este caso, la unin del inhibidor con el enzima se realiza por enlaces
no covalentes, ms fciles de romper. Existen dos tipos de inhibicin reversible:
1. xido-reductasas
( Reacciones de oxido-reduccin).
Si una molcula se reduce, tiene que haber otra que se oxide
2. Transferasas
(Transferencia de grupos funcionales)
3. Hidrolasas
(Reacciones de hidrlisis)
grupos aldehidos
gupos acilos
grupos glucosilos
grupos fosfatos (kinasas)
4. Liasas
(Adicin a los dobles enlaces)
Entre C y C
Entre C y O
Entre C y N
5. Isomerasas
(Reacciones de isomerizacin)
6. Ligasas
(Formacin de enlaces, con aporte de
ATP)
Entre C y O
Entre C y S
Entre C y N
Entre C y C