UNIVERSIDAD DISTRITAL FRANCISCO JOSE DE CALDAS FACULTAD DE MEDIO AMBIENTE Y RECURSOS NATURALES SYLLABUS Elis INGENIERIA AMBIENTAL NOMBRE DEL DOCENTE: LENA CAROLINA ECHEVERRY PRIETO, MSc ESPACIO ACADEMICO (Asignatura): MICROBIOLOGIA Obligatorio (X) : Basico (X) Complementario ( _) cODIGO: 2710 Electivo (_) :intrinsecas (_) Extrinsecas (_) NUMERO DE ESTUDIANTES: Se trabajan grupos maximo de 20 personas porsu | GRUPOS:541- 54a connotacién teérico-practico. NUMERO DE CREDITOS: [TIPODE CURSO; __TEORICO[—] PRACTICOL] TEO-PRAG!] x Allernativas metodolégicas: Clase Magisiral ( X ), Seminario ( _}, Seminario ~ Taller (_), Taller ( X ), Practicas ( X ), Proyectos tutoriados ( ), Otro: HORARIO: DIA HORAS SALON LUNES: 6:00 - 8:00 am. Aula 103 - Grupo 543 y 544 8:00 ~ 10:00 p.m. Aula 103 - Grupo 541 y 542 10:00 - 12:00 p.m. LAB. MICROBIOLOGIA Grupo 543 6:00-8:00 a.m. LAB. MICROBIOLOGIA = Grupo 541 VIERNES 8:00 - 10:00 am LAB. MICROBIOLOGIA - Grupo 544 12:00 p.m.~ 2:00 pm LAB. MICROBIOLOGIA - Grupo 542 T JUSTIFICACION DEL ESPACIO ACADEMICO Ta mmicrobiclogia és Ta ciendia que se ocupa del estudio de los organismos demasiado pequefios para poder ser observados a simple vista, y cuya visualizacién requiere el empleo del microscopio. Esta definicidn implica que el objeto material de la microbiologia viene delimitado por el tamafio de los seres que investiga, lo que supone que abarca una ‘enorme heterogeneidad de tipos estructurales, funcionales y taxonémicos: desde particulas no celulares como los virus, viroides y priones, hasta organismos celulares tan diferentes como las bacterias, los protozoos, parte de las algas y de los hongos. Esta variedad de organismos se desenvuelven en los diferentes niveles de! medio ambiente y su estudio en cl proyecto curricular de ingenieria ambiental es pertinente para que los estudiantes conozean y comprendan la relacién entre [os microorganismos y el medio ambiente (aire, suelo y agua), tanto en su aspecto de contaminantes, patégenos, ‘oportunistas, antagonistas como en su utizacién para la descontaminacién medioambiental. Es importante recalcar que esté materia hace parte dal ciclo bésico para los estudiantes de ingenieria ambiental en la Universidad Distrital Francisco José de Caldas, la cual le dard al estudiante las herramientas necesarias para aislar, identiicar y mantener los microorganismos de interés, igualmente conocer las aplicaciones de los microorganismos sobre el medio ambiente, el desarrollo de tecnologias aplicadas a este campo y el control, manejo y prevencién de los mismos. Aportando al ciclo profesional para las asignaturas: tecnologias apropiadas y salud ambiental Il PROGRAMACION DEL CONTENIDO ‘OBJETIVO GENERAL Conocer y diferenciar los grupos de organismos mictoscépicos, estudiando sus eslructuras celulares, crecimiento, metabolismo, prevencién, manejo y control, mediante la manipulacién in Vitro e in Situ, identificar el impacto sobre el medio ambiente y la salud piiblica, conocer los avances de la microbiologia encaminados a la bio-recuperacion ambiental, bio-prevencién y procesos de biotecnologia ambiental. ‘OBJETIVOS ESPECIFICOS Conoser fos fundamentos de la microbiologia y su aplicacion al medio ambiente Manejar las técnicas basicas de aislamiento, recuento, mantenimiento e identilicacién de los microorganismos ‘Adquirir fa habilidad manual en la ejecucién de los métodos microbiolégicos Estudiar de manera tedrica y practica el mundo de los organisms microscépicos, a partir del reconocimiento y andlisis de las estructuras celulares, el metabolismo y el crecimiento microbiano in vitro e in-situ, asi como las diferentes técnicas de manejo y control. + Conocer la importancia de los microorganismos y su aplicacién en Ingenieria Ambiental + Dotar al estudiante de herramientas necesarias que le permitan profundizar en los diferentes campos relacionadoscon la formacion Ambiental. + Reconocer el impacto que ejercen los microorganismos en I las biotranstormaciones. relacion "hombre-microorganismo” en salud pilbica y COMPETENCIAS DE FORMACION 1. CONTEXTO ‘a, Cullurales: el estudiante estar en la capacidad de considerar su entorno como un mundo donde los fenémenos que transcurren son explicables y tienen soluciones desde el punto de la microbiologta b. Fortalecer la capacidad del trabajo en equipo y colaborativo ©. Mejorar la comunicacién oral y escrita 4d. Desarrollar conciencia sobre ia disciplina y cumplimiento de normas e,_Estimular al estudiante para que se reconozca como sujeto de conacimiento y como ciudadano. 2. BASICAS a. El estudiante tendré el conocimiento fundamental de la microbiologia para comprender, analizar y hacer ppropuestas para la resolucién de problemas ambientales en diferentes entomos a los cuales el haga frente b. Intetpretativa: estimular al estudiante en la interpretacién de graficas, tablas figuras e iconos, andlisis y recuentos en medios de cultivo, entre otros. ¢. Argumentativa: mediante los conocimientos bésicos tedricos y practicos desarrollados en el espacio académico, el estudiante podra sostener un dialogo fluido y técnico sobre los temas en referencia. d. Propositiva: generar en el estudiante mejores procesos criticos frente a problemas planteados o necesidades planteadas. 3. LABORALES ‘a. Como promisorios ingenieros ambientales podran desarrollar apropiadamente: labores relacionadas a los temas tratados en la asignatura de microbiologia como también el poder desenvolverse interdisciplinariamente para desarrollar su profesién en el ambiente laboral b. Manejo apropiado de la microscopia Sptica compuesta PROGRAMA SINTETICO: UNIDAD DIDATICA | Biotransformaciones (SEMANAS 1 ala 9) Relacién hombre-microorganismos-ambienta, teniendo en cuenta la céiula metabolismo y biomoléculas ‘SEMANA 1: INTRODUCCION (Agosto 3) Viernes 7 - Festivo + Presentacién y entrega del Syllabus + Contexto de la Microbiologia en la Ingenieria Ambiental + Discusién acerca de la mecanica interna + Normatividad del trabajo en el laboratorio y Bioseguridad ‘SEMANAS 2 - 4: PRINCIPIOS DE LA MICROBIOLOGIA (Agosto 10 -28) Lunes 17 - Festiv + DEFINICIONES: Historia de la microbiologia. Morfologia macrosoépica y microscépica, células eucariontes y procariontes, microestructuras, microscopia, caloraciones, colonias y sistemas de siembra in-Vitro, medios de cultvo. ‘SEMANA 5: DIVERSIDAD METABOLICA Y MICROBIANA (Agosto 31 - Septiembre 4) + Definiciones: Metabolismo primario ‘SEMANA 6: Primer corte parcial (Septiembre 4 ‘SEMANAS: 7 y 8: DIVERSIDAD MICROBIANA (Septiembre 14 - 25) + Definiciones: Hongos, Virus, Pardsitos y algas. ‘SEMANA 9: CONTROL DEL CRECIMIENTO MICROBIANO (Septiembre 25 - Octubre 2) + Definiciones: Control fisico y quimico de microorganismos. Resistencia a sustancias quimicas bidticas y/o abiélicas. UNIDAD DIDACTICA II: COLOGIA MICROBIANA (SEMANAS de la 10 ala 18) SEMANA 10: GENETICA BACTERIANA (Octubre 5 ~ 9) “SEMANA UNIVERSITARIA”+ Definiciones: Conjugacién, transduccion y transformacion. SEMANA 11- 12: GENETICA BACTERIANA y BIOLOGIA MOLECULAR APLICADA AL MEDIO AMBIENTE (Octubre 12 - 23) Lunes 12 - Festivo + Definiciones: Conjugacién, transduccién y transformacion, / Genémica, proteémica, técnicas moleculares como: PCR, RFLP, Electroforesis, SoutherBioth, NortherBloth, entre otros. ‘SEMANAS 13: Segundo corte parcial (Octubre 26 - 30) - Teoria y Laboratori ‘SEMANA 14: MICROBIOLOGIA AGRICOLA (Noviembre 2 - 6) Lunes 2 - Festive + Definiciones: Ecologia de los habitats microbianos. ‘SEMANAS 15 y 16: MICROBIOLOGIA AMBIENTAL Y BIOTECNOLOGIA (Noviembre 9 - 20) Lunes 16 - Festive + Definiciones: Ingenieria genética, Procesos industriales biotecnolégicos ‘SEMANA 17: EXAMEN FINAL (Noviembre 23) ~ Teoria y Laboratorio de todo el curso SEMANA 18: HABILITACIONES ~ ESTA ASIGNATURA NO ES HABILITABLE PLAN DE PRACTICAS Practica UNIDAD sem | PN. TEMA ‘OBJETIVO Racacacal (NAF Normatividad y Elestudiante conozea la 2 * Bioseguridad en el mecénica y las normas en el 1 ‘Ago. 10-14 laboratorio. laboratorio de microbiologia Cuestionario 02 Elestudiante conozca los medios 4 1 | Métodos de siembra— | de cultivo y la forma de obtener 1 Ago. 24-28 Parte A UFC cuscomroce [Roane nase Parte B Sep. 04 ‘ los microorganismos al Coloracién simple ‘microscopio Elestudiante logre distinguir Coloracién compuesta | microorganismos y algunas Cuestionario 03 estructuras de los mismos con a”? | sempcaae monger | solorscomes wigs esperttiens I Senet microscépicos Aprender a aislar hongos filamentosos. El estudiante logre distinguir 7 3 _ | Coloraciones microorganismos y algunas i Sen 58 especiales. estructuras de los mismos con coloraciones mas especificas. Coloracion y El estudiante logre distinguir los observacion cuerpos fructiferos de los hongos microscépica de al microscopio y asi conocer el 2 4 hongos, género de los mismos. ' Sep. 21-25 Cuestionario 04 Conocer cémo crecen y se Siembrade medios _| diferencian los microorganismos diferenciales y por su crecimiento en mediosselectivos on sustanclas especficas de seleccién segun el grupo de microorganismos a trabajar Siembra de pruebas | Aprender a obtener el género de bioquimicas. un microorganismo, usando su 9 | 4¥5 | Lectura de medios metabolismo bioquimico i Sep. 28- diferenciales y detectindolo con pruebas y Oct. 2 selectivos medios de cultivos especificos. El estudiante conozca y aprenda 10 5 vecturatae! es a interpretar las tablas de 1 Oct.5-9 Feagciones Diogquimicas | i dentificacion bioguimica Guestionariods Observar el efecto de los factores 2 6 | Control del extrinsecos sobre el crecimiento " Oct. 19-23 crecimiento de los microorganismos. microbiano Determinar Ta presencia de 6 Lectura practica 6. extremofilos y sus estrategias de a supervivencia Cuestionario 09 Observar en un microambiente " Oct 26-30 8 Pruebas de_ las interacciones de los antagonismo microorganismos. Lectura: Pruebas de Determinar el tipo de relacion 15 8 | antagonism ue se present ene u Nov.9-13 microambiente. Ti. ESTRATEGIAS Metodologia Pedagégica y Didactica: Las técnicas de ensefianza-aprendizaje que se emplean en el curso van acorde a los objetivos de la misma y su area de estudio, profundizando en temas concretos de la misma. Algunas clases se manejan expositivamente dando inicio al estudio de un tema, combindndola con la intervencién de los estudiantes, ayudas visuales y uso del aula virtual. Se realizan discusiones en grupo o de corrilos para que los estudiantes y el docente intercambien ideas, opiniones y conocimientos sobre un tema determinado, abordando asi un problema y llegar a una conclusién, algunos temas se ‘rabajan analizando articulos cientificos que previamente los estudiantes buscan en las bases de datos cientificas. Esta materia por el hecho de ser prdctica, pretende en los estudiantes inculcar el desarrollo de una metodologia cientifica al desarrollar précticas de laboratorio en el transcurso del curso por parejas. El método cientifico es la aplicacién de la logica a los hechos observados, llevando en si un conjunto de procedimientos que ponen a prueba las hipdtesis y los instrumentos de trabajo investigativo, conjugando la induccién y la deduccion. La investigacién cientifica que se maneja es la descriptiva, porque esta “comprende la descripcion, registro, analisis e interpretacion de la naturaleza actual y la composicion o procesos de los fenomenos” (Tamayo y Tamayo. 1995). Horas Horas Total Horas 5 Horas | profesor/semana | Estudiante/semana | Estudiante/semestre | “™eatos Tipo oe, S8]TD Tc |TA |(TD + TC) (TD+TC+TA) |X 16 semanas Teorico practico | 2 | ? | § 4 9 144 3 ‘Trabajo Presencial Directo (TD): trabajo de aula con plenaria de todos los estudiantes. Trabajo Mediado Cooperative (TC): Trabajo de tutoria del docente a pequerios grupos o de forma individual a los estudiantes. Trabajo Auténomo (TA): Trabajo del estudiante sin presencia del docente, que se puede realizar en distintas instancias: ‘en grupos de trabajo o en forma individual, en casa o en biblioteca. 1. RECURSOS, Clases magistvales, tallerés y quicas evaluables por contenido tematico, trabajos en grupo, exposiciones de 10s‘estudiantes sobre profundizacion de los temas tralados, Lectura, analisis y presentacion de arffculos relacionados con los temas tratados por parte de los estuciantes que permita profundizar en conceptos y aspectos de interés para el estudiante y permita desarrollar la lectura cientifica. Algunos controles de lectura se harén usando el Aula Virlual de la Asignatura. Experiencias de laboratorio para que los alumnos puedan conceptualizar de manera activa los temas vistos en clase y desarrollo de una bitécora de laboratorio donde aprender a tomar datos, interpretar y discutir. Dos examenes parciales y un examen final donde se evaluaran respectivamente los temas vistos en clase teérica y practica segun el programa académico. Se maneja un aula virtual donde se colocaran las lecturas, los trabajos y talleres que los alumnos deben ir desarroliando para complementar los temas vistos en clase. Recursos fisicos como un retroproyector de acetatos y un video beam y un PC con Microsoft Oifice. Charlas magistrales por parte del docente, exposiciones de los estudiantes, seminarios-talleres. BIBLIOGRAFIA TEXTOS GUIAS + MADIGAN, MICHAEL T; MARTINKO, JOHN M, STAHL, DAVID & CLARK, DAVID P. Brock Biology of microorganisms. 13a Edition. Pearson Prentice Hall. 2012. + PRESCOTT, LANSING M. Microbiology. 5th Edition. McGraw-Hill. 2002 + SYLVIA, D. M., FUHRMANN, J. J., HARTEL, P. G. AND ZUBERER, D. A. 1998. Principles and Applications of Soil Microbiology. Prentice Hall, Inc. New Jersey. US.A + TORTORA, GERARD J; FUNKE, BERDELL R & CASE, CHRISTINE L. Microbiology: an introduction. 11a Edition. Pearson. 2013, TEXTOS COMPLEMENTARIOS * BLACK, J.G. Microbiology Principles and Applications. Third Edition. 2000. United States of America. Prentice Hall BRADSHAW, L. J. Microbiologia de Laboratorio; Editorial el Manual Moderno; México, 1973. BROCK, T. Dy MADIGAN, M. T. Microbiologia. Sexta edicién. Prentice Hall ispanoamericana. México, D. F. 1993, CARPENTER, P. Microbiologia; Editorial Interamericana; Barcelona, 1973. GEBHART, L. P. Microbiologia: Editorial Interamericana; México, 1972. GLAZER, A. N. AND NIKAIDO, H. 1995. Microbial Biotechnology. Freeman and Company. United States of America, + LEVIN M. AND GEALT M. A. 1997. Biotratamiento de Residuos Téxicos y Peligrosos. MoGraw-HillInteramericana de Espafia, S. A. U. + MADIGAN, M. T., MARTINKO, J. M., PARKER, J. Biology of Microorganisms. Eighth Ecition, 2000. United States of America. Prentice Hall CARPENTER, P. Microbiologia; Editorial Interamericana; Barcelona, 1973. BRADSHAW, L. J. Microbiologia de Laboratorio: Editorial el Manual Moderno; México, 1973. GEBHART, L. P. Microbiologia; Editorial Interamericana; México, 1972 LICHSTEIN, H. C. Experimental Physiology; Editorial Freema; San Francisco, 1985. MERCK, E. Handbook Culture Media Merck; Darmstadt. E, Merck, 1981 OXOID. Oxoid Sellective Microbiology. Oxoid Limited. London, 1980. APHA. Standard Methods for Examination of Water and Wastewater; Apha; Washintong, 1975. HAWKER, L. E. Elementos de Microbiologia General. Introduccién a la Microbiologia de los Microorganismos. Editorial ACRIBIA; Zaragoza. 1980, + PROBISHER, M. Fundamentals of Microbiology; and Introduction to the Microorganims With Special Reference to the Procaryons; Saunder; London, 1968. REVISTAS + Applied and environmental microbiology = Research in microbiology + Revista latinoamericana de microbiologia - Current opinion in microbiology + Annual Review Of Microbiology - Applied microbiology and biotechnolog) DIRECCIONES DE INTERNET htio:/medioambiente.udistrital.edu.cofaulas/ - FAMARENA Aulas Virluales httov/www.mnicrobiologytext.comy - The Microbial World htov/nww hhm.ora/biointeractive/ - Howard Hughes Medical Institute — Biointeractive htto:/nwww.blackwellpublishina com/wagner/animation asp - Basic Virology httov/www.celisalive.com’ - Cells Alive htto:/nww.aw-be.comfbrock! - Brock Biology of Microorganisms Gateway hito:/nww.pasteur [rip/easysite/qo/03b-00002)-000/ -Institut Pasteur hito/nww.microbeworld.ora/ - Microbe World | [httov/www.koshland-science-museumorgiindexisp - Science Museumhitp/environmental-microbiclogy.suite101.com/ - Environmental Microbiology httpv/commtechlab.msu.edu/sites/cle-me/- Microbial Ecology hilip:/inwwasm.org) - American Sociely for Microbiology hitos/iww.biblioweb.dasca. unam,mxlibros/microbios/index.htm| - Microbios en linea hitoz/www2uah.es/biomodel/biomodel-misc/aninvelfo/gel_electrophoresis.swi - Electroforesis Virtual V. ORGANIZACION 7 TIEMPOS V. ORGANIZACION / TIEMPOS Espacios, Tiempos, Agrupamientos: PRIMER PACIAL: SEMANA 6 SEGUNDO PACIAL: SEMANA 13, EXAMEN FINAL: SEMANA 17 Vi. EVALUACION Se le evaltian las capacidades que tiene o adquiere los estudiantes para comprender y consultar los contenidos tratados, as ‘como para poder asociar conceplos y de esta forma elucidar las relaciones existentes entre cada uno de los principios qu contempla la microbiclogia y a aplicabilidad tecnolégica que se pueda generar de los temas tratados. Otros aspectos que si tendran en cuenta para evaluar el estudiante son: La participacién individual y grupal, la recursividad aspectos que se rela en la responsabilidad, el respeto y cumplimiento de cada una de las actividades realizadas las précticas y en general en ¢ curso. CORTE ‘ACTIVIDAD. PORCENTAJE FECHA PRIMER CORTE PARCIAL | 20% SEMANA 6 (35%) TABORATORIO 10% Septiembre 19 Talleres y Quices 5% ‘SEGUNDO CORTE PARCIAL Il 20% ‘SEMANA 13 (35%) TABORATORIO 10% Noviembre 21 Talleres y Quices 5% EXAMEN FINAL (30%) EXAMEN FINAL 30% SEMANA 17 “ASPECTOS A EVALUAR DEL CURSO En el curso se realizaré Ta valuacion: el desempenio docente, de los aprendizajes de los estudiantes en sus dimensione: individual/grupo, tebrica/practica, oralfeserita; Autoevaluacion; Coevaluacién del curso: de forma oral entre estudiantes docente, DATOS DEL DOCENTE NOMBRE: LENA CAROLINA ECHEVERRY PRIETO PREGRADO: MICROBIOLOGIA INDUSTRIAL POSTGRADO: MAESTRIA EN CIENCIAS BIOLOGICAS CON ENFASIS EN BIOTECNOLOGIA INDUSTRIAL FIRMA DE ESTUDIANTES NOMBRE FIRMA CODIGOTe 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23. 24, 25. 26. 27. 28. 29. 30. 31. 32. 33. 34, 35. 36. 37. 38. 39. 40. a. 44, 46. 47. 48. 49. 50. 51 52. 53. 54, 55. 56. 57. 58. 59. 60. 61. 62. 63. 64. 65. 66. 67. 68. FIRMA DEL DOCENTE: FECHA DE ENTREGA: Agosio de 2075 ELABORO: LENA CAROLINA ECHEVERRY PRIETO, MSc.