Bsqueda bibliogrfica

en PubMed
Viernes 7 de febrero de 2014
Seminario:
Bsquedas en PubMed
Ponentes/monitores:
n M. Jess Esparza Olcina
Pediatra de Atencin Primaria. CS Barcelona.
Mstoles, Madrid.
n Juan Ruiz-Canela Cceres
Pediatra de Atencin Primaria.
CS Virgen de frica. Sevilla.
n Eduardo Ortega Pez
Pediatra de Atencin Primaria. UGC Maracena.
Distrito Metropolitano. Granada.
n Miguel del Ro Garca
Servicio de Cuidados Intensivos Peditricos.
Hospital Infantil Universitario La Paz. Madrid.
Textos disponibles en

www.aepap.org

Cmo citar este artculo?

Esparza Olcina MJ, Ruiz-Canela Cceres J, Ortega Pez
E, del Ro Garca M. Bsqueda bibliogrfica en
PubMed. En AEPap ed. Curso de Actualizacin
Pediatra 2014. Madrid: Exlibris Ediciones; 2014.
p. 177-85.

M. Jess Esparza Olcina

Pediatra de Atencin Primaria. CS Barcelona. Mstoles, Madrid.
mjesparza8@gmail.com
Juan Ruiz-Canela Cceres
Pediatra de Atencin Primaria. CS Virgen de frica. Sevilla.
jruizcanela@gmail.com
Eduardo Ortega Pez
Pediatra de Atencin Primaria. UGC Maracena. Distrito
Metropolitano. Granada.
edortegap@gmail.com
Miguel del Ro Garca
Servicio de Cuidados Intensivos Peditricos. Hospital Infantil
Universitario La Paz. Madrid.

RESUMEN
La bsqueda eficiente de informacin es uno de los pilares de la
toma de decisiones en la prctica mdica.
La base de datos MEDLINE est accesible a travs del portal de
internet PubMed, y manejar con soltura esta herramienta es importante para nuestra independencia en la formacin continuada
peditrica.
La bsqueda en PubMed no tiene por qu ser la nica herramienta de bsqueda de informacin ni tiene por qu ser la primera, ya
que nos va a proporcionar fundamentalmente artculos originales,
sin filtrar, lo que requiere habilidades de lectura y valoracin crtica. No obstante, MEDLINE es la mayor base de datos de informacin biomdica existente y PubMed es una herramienta muy
potente y con muchas posibilidades que conviene conocer.
Este taller se desarrolla a travs de la plataforma virtual Moodle,
donde se puede acceder a material didctico en forma de textos
y de vdeos de tipo tutorial y ejercicios prcticos que sern comentados por los tutores, y se complementa con el taller presencial.
Los objetivos que nos hemos marcado en el taller de bsqueda
en PubMed son:

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Actualizacin

en

Pediatra

n C
 apacitar al alumno a formular una pregunta clnica
eficiente mediante el sistema PICO, partiendo de un
escenario clnico dado.

Despus planteamos la pregunta clnica estructurada y

obtenemos de ella las palabras clave para nuestra bsqueda.

n U
 na vez que se ha realizado la pregunta clnica, el
alumno debe ser capaz de realizar la bsqueda en
PubMed bajo dos formas distintas:

El siguiente paso sera acudir a fuentes de informacin

filtradas (secundarias) o no filtradas (primarias, como
PubMed) donde, con la mecnica adecuada, encontraramos el/los artculos de inters.

Bsqueda libre y mediante filtros metodolgicos.

Bsqueda avanzada mediante MeSH.

n C
 apacitar al alumno a gestionar la bibliografa encontrada as como su almacenamiento.
El texto que se publica en este libro es una gua prctica
que invita a todos los lectores a practicar, a probar, a
consultar los tutoriales de la propia pgina de PubMed,
con la seguridad de que van a descubrir muchas posibilidades interesantes. PubMed est en constante cambio;
su pgina se actualiza con mejoras con cierta frecuencia,
por lo que lo que hoy presentamos puede que maana
sea ligeramente diferente, y mejor.

INTRODUCCIN
Buscar informacin, seleccionar la informacin encontrada y gestionarla, son actividades necesarias para el pediatra de Atencin Primaria.
Necesitamos dar respuesta a las dudas que surgen en la
prctica diaria y dar una respuesta actualizada, precisa, y
muchas veces necesitamos una respuesta rpida.
La gestin de la informacin puede ser una tarea imposible si no tenemos en cuenta una serie de normas bsicas para simplificarla y hacerla ms eficiente.
En primer lugar, para qu queremos la informacin?; es
para dar respuesta a una cuestin prctica del da a da?,
o por el contrario, estamos estudiando de forma exhaustiva un tema determinado? Buscaremos de distinta
forma segn se trate de una situacin u otra.

La valoracin de la informacin encontrada est fuera

del mbito de este taller.
Finalmente podemos almacenar, imprimir o enviar las
referencias encontradas, y tambin podemos guardar la
estrategia de bsqueda para repetirla a lo largo del
tiempo (sumamente interesante para mantener actualizado un tema de inters).
Por qu PubMed? PubMed es el portal a travs del cual,
entre otros recursos, se realiza la bsqueda en MEDLINE,
que es la mayor base de datos de informacin biomdica mundial. No tiene por qu ser el nico sitio donde
busquemos ni tampoco tiene por qu ser el primero,
pero conocer la mecnica de la utilizacin de esta base
de datos es importante para el mdico. En ella vamos a
encontrar informacin no filtrada (artculos originales),
que van a requerir habilidades de valoracin crtica.

CMO ESTRUCTURAR UNA PREGUNTA CLNICA

El acrnimo PICO nos facilita la tarea (Tabla 1).
La pregunta podra formularse, pues, de la siguiente
manera: En nios que padecen diarrea, la administracin
de probiticos produce una disminucin de la intensidad
y/o de la duracin de la enfermedad?.
Y de esta pregunta podemos obtener las palabras clave
que necesitamos para llevar a cabo nuestra bsqueda. En
el ejemplo podran ser: diarrea y probiticos. Luego
podremos delimitar la bsqueda a lactantes, a efecto
teraputico, etc., si precisamos estrechar ms la bsqueda.

Bsqueda bibliogrfica en PubMed

Tabla 1. Estructura de una pregunta clnica

P

Pacientes

Intervencin o factor de riesgo Comparacin

Lactantes con diarrea Administracin de probiticos

No administracin de probiticos

Pero PubMed est en ingls. Para ver los correspondientes trminos clave en ingls, a partir de palabras en espaol, es muy til la pgina web: http://decs.bvs.br/E/homepagee.htm. Pulsamos en Consulta al Decs y
obtenemos la pgina de la Fig. 1.

CMO BUSCAR EN MEDLINE A TRAVS

DE PUBMED
El acceso es gratuito a travs de: http://www.ncbi.nlm.nih.
gov/pubmed (Fig. 2).
PubMed solo trabaja en ingls.
Podemos hacer la bsqueda por la ventana de la pgina
inicial (sencilla y avanzada), a partir de la pgina de la base
de datos MESH, o con la herramienta Clinical Queries.

Outcomes (resultados)
Disminucin de la intensidad y
duracin del episodio

Depender de nuestras preferencias, del tipo de pregunta o del objetivo de nuestra bsqueda.

Bsqueda sencilla (Fig. 3)

Si incluimos ms de una palabra, PubMed lo interpreta
como si estuvieran separadas por AND. A medida que
escribimos aparecen opciones de bsquedas que se han
realizado antes en PubMed (sistema also try). Para
buscar una frase completa, hay que introducirla entre
comillas.Tambin podemos poner nosotros los trminos
AND, OR, NOT (siempre en maysculas) para limitar
nuestra bsqueda. Y podemos usar el truncamiento, que
es colocar un asterisco (*) al final de un trmino o raz
de palabra, con lo que PubMed buscar todas las palabras que empiecen por esa raz (por ejemplo, si ponemos neurol* buscar neurology, neuroleptic, neurologic

Figura 1. Pgina de Descriptores en Ciencias de la Salud: http://decs.bvs.br/E/homepagee.htm

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Figura 2. Pgina de entrada en PubMed

Bsqueda avanzada
Clicando en la palabra Advanced de debajo de la ventana
de bsqueda sencilla vamos a la pgina de bsqueda
avanzada (Fig. 4).
Esta opcin nos permite construir la bsqueda (Search
Builder). Desplegando la casilla donde por defecto aparece All fields (todos los campos) podemos optar por
cualquier opcin; entre ellas MeSH Terms, con lo que
estaramos construyendo la bsqueda ya directamente
con trminos MeSH, que suele ser la opcin preferible
(tambin aqu podemos seleccionar subdescriptores
[subheadings]). Adems, a la derecha de la casilla de
bsqueda pulsando en Show index list, PubMed nos
ofrece la posibilidad de buscar ah los trminos necesarios y los incluye entrecomillados.
Aadimos una palabra en cada casilla y van apareciendo
nuevas casillas sucesivamente por debajo. En el despleFigura 3. Caja de bsqueda sencilla en PubMed

gable en que por defecto aparece AND, podemos seleccionar OR o NOT segn nuestras necesidades.
Finalmente pulsamos Search y PubMed nos devolver
nuestra bsqueda, sin haber aplicado lmites.
En History se van almacenando nuestras bsquedas, que
podemos combinar formando una nueva bsqueda ms
compleja.

Cmo filtrar o poner lmites

Este paso se realiza desde la pgina de resultados de la
bsqueda.
En una bsqueda sin filtrar suele ser excesivo el nmero
de referencias que obtenemos, y nos interesa reducir y
focalizar nuestra bsqueda. Para ello, a la izquierda de la
pgina de resultados tenemos una lista de filtros que
PubMed nos muestra por defecto, pero podemos au-

Bsqueda bibliogrfica en PubMed

Figura 4. Bsqueda avanzada en PubMed

mentarla pulsando Show additional filters. Marcamos los

filtros que interese, por ejemplo de edad del paciente,
de fecha de publicacin, de tipo de estudio, etc. y
PubMed va aplicando los filtros a tiempo real, sin tener
que pulsar ninguna tecla adicional (Figs. 5 y 6).

En el ejemplo (diarrhea[MeSH Terms]) AND

probiotics[MeSH Terms], obtenamos 624 referencias.
Tras aplicar los filtros: Clinical Trial, Systematic Reviews,
Abstract Available, last 5 years, Humans, Infant y Preschool
Child, quedan 39 referencias, nmero ms adecuado para

Figura 5. Cmo poner filtros en la bsqueda

Figura 6. Cmo poner filtros en la bsqueda

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en

Pediatra

poder revisar ttulos y abstracts en busca del o de los

documentos que ms se adapten a nuestra pregunta.

cin que nos pueden interesar, como el nmero de referencias por pgina y el orden de visualizacin.

Es importante saber que los filtros seleccionados se

quedan activados para toda la sesin. Si nos interesa
quitarlos pulsaramos en Clear all o bien quitaramos
solo alguno pulsando sobre su ttulo.

A la derecha de la pgina, en Search Details (Fig. 8) se

detalla cul ha sido nuestra estrategia de bsqueda, con
ms datos y posibilidades si pulsamos en See more.

Informacin en la pgina de resultados

Adems de los filtros ya comentados, las referencias
podemos verlas con distintos formatos, a travs del
desplegable Display Settings (Fig. 7), que por defecto
nos muestra el formato Summary que es el que vemos en las Figs. 5 y 6. El formato ms til, cuando ya
tenemos seleccionados qu artculos nos interesan
despus de leer los ttulos, es el formato Abstract o
bien el formato Abstract (text), que nos permiten leer
el resumen.
Para cambiar de formato seleccionaremos los ttulos
clicando en el cuadrado que precede a cada uno, y
posteriormente, desplegando Display Settings, clicaremos en Abstract o Abstract (text). En este mismo
desplegable vemos que hay otras opciones de visualiza-

Figura 7. Formato de la pgina de resultados

Gestin de las citas

Podemos hacer varias cosas con las citas encontradas,
imprimirlas, enviarlas, guardarlas
En la parte superior de la pgina de resultados encontramos el desplegable Send to, que nos permite guardar
las referencias en un archivo (file), enviarlas a un gestor
bibliogrfico (citation manager), enviarlas por correo
electrnico (E-mail), guardarlas en el portapapeles (clipboard). Las otras dos opciones Colections y My
Bibliography hacen referencia a My NCBI.
My NCBI es un archivo virtual personalizado que
PubMed ofrece gratuitamente y que nos permite:
n T ener guardadas referencias en My Bibliography a
modo de gestor bibliogrfico.

Bsqueda bibliogrfica en PubMed

Figura 8. Detalles de la estrategia de bsqueda

te las citas encontradas en tres apartados: Clinical Study

Category, Systematic Reviews y Medical Genetics.
En la categora del estudio clnico hay dos desplegables,
uno nos permite seleccionar la categora: etiologa (etiology), diagnstico (diagnosis), teraputica (therapy), pronstico (prognosis) y guas clnicas (clinical prediction guides). El desplegable inmediatamente inferior a este nos
permite la posibilidad de hacer una bsqueda amplia o
sensible (broad) o bien una bsqueda ms precisa, especfica (narrow).

n G
 uardar colecciones de referencias por temas en
Colections.
n G
uardar estrategias de bsqueda en Saved
Searches que podemos refrescar cuando queramos
o bien podemos pedir que nos enven peridicamente por e-mail los artculos nuevos que vayan
apareciendo con esa bsqueda en particular.

Bsqueda en Clinical Queries (Fig. 9)

Es una opcin de bsqueda que ya lleva incorporados
una serie de filtros metodolgicos, de modo que reparFigura 9. Clinical Queries

Base de datos MESH (MESH database)

MeSH es el acrnimo de Medical Subject Headings
(Descriptores de Ciencias de la Salud) y es un vocabulario controlado segn el cual estn indizados los artculos en la base de datos MEDLINE. Como se ve en la Fig.
2, la entrada a la base de datos MeSH se encuentra a la
derecha de la pgina de inicio de PubMed.
Desde aqu (Fig. 10) se puede realizar tambin toda la
bsqueda. En la caja de bsqueda vamos introduciendo
una a una las palabras clave, pulsando seguidamente

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Actualizacin

en

Pediatra

Figura 10. Caja de bsqueda de la base de datos MeSH

Figura 11. Pgina que devuelve los trminos MeSH que contienen la palabra introducida en la caja de bsqueda,
con su definicin

Search. MeSH database nos devuelve todos los trminos MeSH que contienen la palabra, con su definicin (Fig.
11). Elegimos la que corresponde con nuestra pregunta
y la introducimos en la caja PubMed Search Builder
clicando en Add to Search Builder. Seguimos con una
segunda palabra clave, y una tercera si queremos, pero al
aadirlas a la caja de construccin de la bsqueda ya
hemos de selecciona AND, OR o NOT. En la caja de
bsqueda tambin podemos usar truncamientos con (*).

Single citation matcher (Fig. 13)

Si clicamos sobre la palabra Mesh seleccionada, se nos

muestran los subencabezamientos (Subheadings) (Fig. 12),
que podemos seleccionar antes de mandar el trmino a
la caja de construccin de la bsqueda y tambin podemos hacer ms restrictiva la bsqueda si clicamos en
Restrict to MeSH Major Topic (tema principal del artculo).

CONCLUSIONES

Finalmente pulsamos en Search PubMed y la pgina de

resultados la tratamos como en el caso de la bsqueda
sencilla o avanzada, aplicando lmites, etc.

Esta es una herramienta muy til cuando estamos buscando una cita incompleta, incorrecta, etc. Se accede
desde la pgina inicial de PubMed y nos muestra la posibilidad de buscar un artculo introduciendo solo la revista y el autor, el ao de publicacin, o la pgina inicial,
o palabras del ttulo, o una combinacin de estos datos.

Poseer habilidades de bsqueda bibliogrfica es esencial

para el mdico en general y para el pediatra en particular. La base de datos MEDLINE, a travs de la pgina
PubMed nos permite realizar bsquedas eficientes si
conocemos algunos conceptos bsicos, consultamos
manuales sencillos como pretende ser este escrito, y
sobre todo, si curioseamos y probamos con nuestro
ordenador.

Bsqueda bibliogrfica en PubMed

Figura 12. Subencabezamientos (Subheadings) de la palabra MeSH seleccionada

La pgina de PubMed nos ofrece muchsima ms informacin de la que se ha explicado en estas pginas, desde
donde solo hemos querido plasmar lo que posiblemente es lo ms bsico y til, para a partir de ah seguir
ampliando el aprovechamiento que nos ofrece.

va a facilitar nuestra tarea diaria y nuestra formacin

continuada.

En PubMed se puede buscar de varias maneras, todas

ellas vlidas. Es bueno familiarizarse con las distintas posibilidades que presenta esta potente herramienta que

Finalmente queremos recomendar encarecidamente el

visionado de los tutoriales que estn accesibles en la
pgina de PubMed, y que de una manera muy didctica,
en pequeas dosis, informan detalladamente de los distintos aspectos y herramientas disponibles en este sitio
web.

Figura 13. Single Citation Matcher

BIBLIOGRAFA
1. Sobrido M, Gonzlez Guitin C. Buscar en Medline
con Pubmed. Santiago de Compostela: BiblioSade.
2011. Actualizada octubre 2013. [Fecha de acceso
22 dic 2013]. Disponible en http://bibliosaude.sergas.
es/DXerais/438/gu%C3%ADa%20de%20uso%20
medline%20-%2002.pdf
2. Tutoriales de PubMed. [Fecha de acceso 22 dic
2013]. Disponible en http://www.nlm.nih.gov/bsd/
disted/pubmed.html

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