Setiap perkara mempunyai risiko penggunaannya tersendiri termasuklah system
pneumatic yang kita gunakan. Walaupun system pneumatic mempunyai pelbagai kebaikan atau kelebihan yang baik namun risikok semasa menggunakan system ini tetap ada. Hal ini kerana, media yang digunakan dalam system adalah udara. Udara yang bertekanan merupakan sesuatu yang berbahaya. Udara yang bertekanan tinggi boleh menyebabkan kerosakan kepada harta benda. Malah, boleh menyebabkan kecederaan pada tubuh badan sehingga boleh menyebabkan kehilangan nyawa. Dalam aplikasi system pneumatic terutamanya di industry, system pneumatic boleh digunakn sehingga menghasilkan udara yang bertekanan sehingga 3000 psi. Terdapat banyak kemalangan yang telah berlaku ketika mengendalikan system pneumatic kerana pekerja cuai semasa melakukan pengendalian. Misalnya, pekerja akan sesak nafas dan buta mata kerana gas nitrogen yang terdapat di dalam udara telah dimampatkan dan tidak dapat membantu proses pernafasan apabila gas ini dilepaskan ke sekeliling. Gas nitrogen yang banyak juga akan menyebabkan asphyxia iaitu kekurangan kandungan oksigen dan berlaku pertambahan kandungan gas karbon dioksida di dalam darah. Hal ini boleh menyebabkan sesak nafas atau berlaku kegagalan dalam bernafas sehingga boleh menyebabkan kematian. Oleh sebab itu, pengendalian system pneumatic haruslah sentiasa dialkukan dengan berhati-hati dan mengikut prosedur yang betul agar tidak berlaku sebarang kemalangan yang tidak diingini.