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醫學影像處理
── 分 析 與 操 作

展 奇 工 作 室 著

許 志 宇 審訂
中山醫學大學醫學影像技術學系

印行

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作者序

醫學科技的進步,使醫學影像處理的需求更為殷切,隨著醫學影像技
術的不斷發展,醫院對醫學影像系統軟體的需求也越來越高,因此醫學影
像系統軟體的教學成了刻不容緩的工作。本書的誕生要感謝展奇工作室的
各位同仁:陳啟仁先生、黃勇盛先生及戴士桀先生,因為他們的努力,才
使得這一本醫學影像處理的書能夠問世。
本書所附的相關軟體教材與影像的相關資訊可以在我們所架設的教學
網站中查詢。要進入此教學網站可以利用在本書版權頁上所刊登的網址及
通行碼進入,本教學網站並設有討論區,提供讀者一個互相交流學習心得
的園地。
在此要感謝中山醫學大學醫學影像技術學系的全體師生,因為有你們
的建議與鼓勵,使得這本醫學影像處理的書更加完善。

許志宇
2006 年 3 月

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目 錄

第1章 緒 論 1

1.1 出書動機 3
1.2 醫學影像共享軟體簡介 3
1.3 學習重點 4
1.4 學習目標 4

第2章 PACS 系統及 DICOM 影像檔案介紹 7

2.1 PACS 簡介 9
2.2 DICOM 影像檔案介紹 10
2.3 OsiriX 醫學影像 PACS 軟體之介紹 12
2.4 本書開發的 PACS 使用範例 146

第3章 影像檔案介紹 159

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醫學影像處理──分析與操作

第4章 醫學影像共享軟體操作 169

4.1 MRIcro 介紹 171


4.2 ImageJ 介紹 176
4.3 mrGray 介紹 181
4.4 Gdicom 介紹 182
4.5 SPM99 介紹 184

第5章 認識影像前處理功能 187

5.1 轉檔 189
5.2 明亮/對比 201
5.3 旋轉/調整 216
5.4 影像平滑化 224

第6章 Metlab 程式設計在醫學影像的應用 231

6.1 影像平滑化之 Metlab 程式設計 233


6.2 MRI 3D 重建影像的 Metlab 程式設計 236

第7章 影像的選取與分析 265

7.1 以 MRIcro 軟體進行 ROI 的選取 267


7.2 以 ImageJ 軟體進行 ROI 的選取 283
7.3 以 mrGray 軟體進行 VOI 選取白質、灰質、CSF 287

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目 錄

7.4 以 SPM 將頭部影像分割成白質、灰質、CSF 部分 300

第8章 範例操作 305

8.1 Simple Overlay / Showing Functional Overlays 307


8.2 DNA 長度測量 314
8.3 影像 3D 重建 318
8.4 SPM Realign 330
8.5 Area Measurements of a Complex Object 346
8.6 Particle Counting and Analysis 349
8.7 腦部活化 PET 影像與接受外在聽覺刺激的關係 354

第9章 醫學影像的未來趨勢 379

9.1 醫學影像的未來趨勢 381

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醫學影像處理──分析與操作

2.4 本書開發的 PACS 使用範例

本書中的 PACS 系統以 WEB 介面建構,因此醫師可以直接在線上會


診,而且 PACS 系統以數位方式儲存資料,所以就不必像傳統的方式,以
膠片去紀錄醫學影像,可以節省儲存空間、耗材成本(如 X 光膠片、片
匣、沖片藥水、片袋等)、人力(如檔案管理人員、傳送膠片人員等),
因此可有以下幾個優點:
影像檢查作業自動排程
即時取得醫學影像
多位醫師同時線上檢視同一張影像
醫師不受時間與空間的限制檢閱影像
檢查報告製作效率提升
人工輸入錯誤率降低
本書開發的 PACS 系統和其它 PACS 系統相較,本書中所架構的 PACS
系統最大特點在於:
結合多套 Open Source 軟體,有效減低開發的成本,功能卻不致降
低,且因本套系統亦屬於 Open Source 的範疇,因此使用者可依自己所需
去做更新、修改,以符自己的需求。
以 WEB 介面及 JAVA 程式所架構的系統,因此在任何平台上皆可
使用本系統,時間空間不受限,只需在安裝有 JAVA 平台的客戶端即可連
上並使用本系統,可以節省更新的成本。
本系統因結合 ImageJ 軟體,因此不需再額外開發影像的開啟和修
改的功能,即可直接使用其已開發好的物件,達到所需功能。
本書所完成的 PACS 系統是一個 WEB 的操作介面,且以 JAVA 為基
礎的醫學影像儲存系統,使用者只需透過支援 JAVA 平台的瀏覽器即可連

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PACS 系統及 DICOM 影像檔案介紹
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上本系統,本系統以 GPL 授權發行為 Open Source 的軟體,使用者可依自


己的需求修改程式碼以符合特殊功能的需求,可以有效降低開發成本、開
發風險,且在更新、維護上,更加便利、經濟。
為了實現線上會診及能讓使用者在不同平台上都能使用,因此我們選
用 Java Server Pages(JSP)來開發網頁,JSP 是一種整合 HTML 及 Java 程
式的技術,目前有許多網頁都是以 Java 程式建構而成,Java 程式具有跨
平台、物件導向等特性,因此可在不同的平台上執行,達到我們跨平台的
需求。
在伺服器選擇上,Apache Web Server 為目前世界上佔有率最高的網頁
伺服器,其中,Jakarta-Tomcat 是屬於 Apache 下的一個計劃,目標是用來
建立一個開放原始碼的 Java 開發平台,主要可以用來處理 Servlet 及 JSP
的引擎。
作為一個醫學影像管理系統,有時需要對影像做些處理,以便能做出
更精準的診斷。再者,要考量到能支援 DICOM 的格式,因此本系統整合
以 Java 為基礎所開發的影像處理軟體 ImageJ 來做影像的處理,ImageJ 亦
為一 Open Source Code 的軟體,它是由美國的 NIH(National Institutes of
Health)機構所開發,ImgeJ 可以支援 BMP、GIF、JPEG 及 DICOM 等圖
檔格式,並設計有一些功能可以對這些圖檔做處理,對於病情診斷有相當
大的助益。
本書所架構之 PACS 系統,可分為病歷查詢層、病患診療層以及醫學
影像查詢處理層,系統架構如下圖,以下將分別介紹子系統。

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Browser

Tomcat Apache Server + JSP

醫學
病歷 病患 影像
查詢 診療 查詢
層 層 處理

MySQL 資料庫

病歷資料 醫學影像資料

系統架構圖

在病歷查詢層主要是顯示所欲查詢的病患的基本資料,依序如下:病
歷號、病患姓名、病患生日、病患性別、病患的診療記錄個數、與病患的
影像個數。
查詢介面可以讓使用者選取如:病歷號、病患姓名、儀器類別、性
別、擷像日等數個或是單一條件的查詢。

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圖 2-131 查詢介面

病患診療層顯示出該名病患的看診記錄,經由上一層所查詢的病患,
將診療記錄詳細列出,其中包含:診療日期、診療時間、Accession Num-
ber、診療號碼、開立醫生姓名、診療描述、病患年齡、病患身高、病患
體重資料、其他診療記錄號碼。

圖 2-132 整體介面

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圖 2-133 影像顯示處理介面

醫學影像顯示處理層是 PACS 系統重點之所在,在上一層中可點選病


患的其中一筆診療記錄,在這一層即顯示屬於該次診療記錄的所有醫學影
像,選取影像後即可透過呼叫 ImagJ 的 class 來開啟 DICOM 檔。下圖即為
查詢後所得到之畫面,在圖形右邊的按鈕,是利用 ImageJ 定義好的類別,
可對圖形進行處理,以方便醫生診斷病情。

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反轉(invert)

一張圖上每一個點都是一個 0 到 255 的值,代表該點的明亮程度,而


Invert 功能,即是將 255 減去每一點的值,得到一張反相的圖。

圖 2-134 Invert 執行後的結果

表 2-1 Invert 運算結果


初值(X) Invert 後(Y)
0 255
1 254
2 253

運算式:Y = 255 - X

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翻轉(Flip)

將影像以通過影像中心的水平線上下翻轉(鏡射)。

圖 2-135 Flip 執行後的結果

旋轉(Rotate)

將圖形做角度的翻轉,最後的像素點(Pixel)會取其已翻轉(菱形)
的像素點值做儲存。

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圖 2-136 Rotate 執行後的結果

亮度調整(Lighten、Darken)

改變像素點值,使圖片的亮度提昇或下降。

圖 2-137 Lighten 執行後結果

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圖 2-138 Darken 執行後結果

縮放(Zoom)

就是將所有像素點值的座標乘以某數,乘上大於一的數就是放大,乘
上小於一的正數就是縮小。

圖 2-139 Zoom In 執行後的結果

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圖 2-140 Zoom Out 執行後的結果

Smooth(平滑化)

將影像模糊化.,這種過濾方式會將圖片上每一個像素點值換成鄰近
的 3x3 格的平均值。

圖 2-141 Smooth 執行後結果

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Sharpen(銳角化)

加強對比,以強調細節,但也有可能加強到雜訊。這種濾波器會將每
一個像素點值及其臨近點的灰階值乘上比重係數後取代該像素點的灰階
值,其比重係數如下:
-1 -1 -1
-1 12 -1
-1 -1 -1

圖 2-142 Sharpen 執行後結果

閥值(Threshold)

影像二值化,把影像轉成只有 0 與 1,主要是將影像對比度拉大,影

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像在單純的亮暗分明下,可以很清楚的分辨出輪廓來。利用選取一個門檻
值(threshold)將影像的灰階度作分類。選取 threshold 目的就是將影像灰
階值區分成只有 0 與 1 兩種數值,大於門檻值會被設為 1,小於門檻值則
設為 0。對於門檻值的選取,一般來說是藉由觀察影像的直方圖(histo-
gram)找尋適合的門檻值,再根據此截止值所分隔出來的影像圖以人為的
方式判斷是否為理想中的結果。若不滿意結果,則必須重新調整,再找下
一個適當的截止值,重覆進行煩索的實驗直到滿意為止。

圖 2-143 Threshold 執行後的結果

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國家圖書館出版品預行編目資料
醫學影像處理:分析與操作/展奇工作室 著. -- 初版.
-- 臺北市:五南, 2006[民 95]
面; 公分
ISBN 957-11-4280-8(平裝)

凝煉知識‧品味閱讀 1.影像診斷 - 電腦程式 2.影像處理(電腦)

415.216029 95003476

5J17

醫學影像處理—分析與操作 I S B N 957-11-4280-8

作 者 展奇工作室
審 訂 許志宇(235.1)
文字編輯 龐涵怡
責任編輯 陳玉卿
封面設計 陳世鵬
發 行 人 楊榮川
總 編 輯 王秀珍
主 編 翁千雅
出 版 者 五南圖書出版股份有限公司
地 址 台北市大安區(106)和平東路二段 339 號 4 樓
電話:(02)2705-5066 傳真:(02)2706-6100
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劃撥帳號 01068953 戶名:五南圖書出版股份有限公司
法律顧問 財團法人資訊工業策進會科技法律中心
出版日期 2006 年 3 月初版一刷
定 價 新臺幣 490 元

※版權所有.欲利用本書全部或部分內容,必須徵求本公司同意※

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