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Artículo Original

Estandarización de una Técnica para la Detección de


Salmonella spp. útil para Manipuladores de Alimentos
Mediante Técnica de Amplificación Molecular
STANDARDIZATION OF A TECHNIQUE FOR THE DETECTION OF SALMONELLA SPP. USEFUL FOR FOOD
HANDLERS BY MOLECULAR AMPLIFICATION TECHNIQUE

Mauricio Urrutia1 T. M.; Eugenio Reyes1 T.M. PhD (c) Tecnología; Cecilia Melo2 E.U; Manuel Henríquez3 T.M.; Jorge Pineda4;
Andrea Sakurada5; MD
1. Laboratorio de Biotecnología FUCYT-ACHS, Santiago Chile.
2. Servicio Exámenes Preventivos Hospital del Trabajador-ACHS, Santiago, Chile.
3. Laboratorio Microbiología NESTLE Chile.
4. Laboratorio ACHS ARAUCO, Santiago, Chile.
5. Hospital JJ Aguirre, Santiago, Chile.

RESUMEN ABSTRACT
El problema de las toxoinfecciones alimentarias es un problema de Alimentary toxicoinfections is a global level health problem. Among
salud a nivel mundial, entre las que se encuentran las producidas por these we find those produced by Salmonella spp. Prevalence of
Salmonella spp.; la prevalencia de sus especies ha cambiado en los Salmonella species has changed in the last years, as well as the low
últimos años, además del bajo nivel de sensibilidad de los métodos sensitivity level of traditional methods of isolation such as the case
tradicionales de aislamiento como es el caso del coprocultivo. Debido of coproculture. Due to this, the objective of this work was to stan-
a esto el objetivo de este trabajo fue estandarizar una metodología dardize a molecular methodology (PCR) for this pathogen from feces
molecular (PCR) para este patógeno a partir de muestras fecales; los samples. The results showed a great sensitivity and specificity, mak-
resultados mostraron gran sensibilidad y especificidad, haciendo ing its use feasible in food handlers.
factible su utilización en manipuladores de alimentos.
Descriptors: SALMONELLA; SALMONELLA FOOD POISONING/EPI-
(Urrutia M, Reyes E, Melo C, Henríquez M, Pineda J, Sakurada A.2006. DEMIOLOGY; POLYMERASE CHAIN REACTION; FOOD HANDLING/
Estandarización de una Técnica para la Detección de Salmonella spp. MANPOWER TECHNIQUES; MOLECULAR DIAGNOSTIC; CHILE.
Útil para Manipuladores de Alimentos Mediante Técnica de
Amplificación Molecular. Cienc Trab. Oct-dic;8(22): 164-166).

Descriptores: SALMONELLA, INTOXICACIÓN ALIMENTARIA POR


SALMONELLA/EPIDEMIOLOGIA, REACCIÓN EN CADENA DE LA
POLIMERASA, MANIPULACIÓN DE ALIMENTOS/RECURSOS
HUMANOS; TÉCNICAS DE DIAGNÓSTICO MOLECULAR;CHILE.

INTRODUCCIÓN nales, principalmente diarreas, que incluso pueden llevar a la


muerte si no son tratadas debidamente (Álvarez et al. 2004).
Múltiples patógenos han sido involucrados en las Toxoinfecciones Las diarreas por Salmonella spp., llamadas salmonelosis, son
alimentarias; entre éstas, una enterobacteria involucrada en causadas principalmente por especies zoonóticas, con brotes de
grandes problemas de salud a nivel mundial, tanto en países indus- origen alimentario; en un 50% hay productos avícolas involu-
trializados como en países en vías de desarrollo es Salmonella spp. crados. Pueden causar generalmente diarreas secretoras, aunque
Según el CDC, la incidencia de Salmonella spp. es de 14,43 casos puede haber casos disentéricos; en América Latina las diarreas por
por 100.000 habitantes (CDC 2006). En Chile es endémica y está Salmonella corresponden de 0,5 a 4% de los episodios. Desde 1994
asociada principalmente a consumo de alimentos y aguas conta- la frecuencia de aislamientos de Salmonellas cambió de S. thypi a
minadas. Esta bacteria es causante de enfermedades gastrointesti- S. Enteritidis. Actualmente esta última especie posee la de mayor
frecuencia de aislamiento, con un 47%, aproximadamente
(Woodward et al. 1997; Fica et al. 2001).
En la Región Metropolitana la ocurrencia de brotes de enferme-
dades transmitidas por alimentos es de 20 brotes mensuales, y la
realidad puede superar la cifra, debido a la subnotificación existente
Correspondencia / Correspondence:
Eugenio Reyes Arenas (Prado et al. 2002).
Laboratorio de Biotecnología Fundación Científica y Tecnológica Salmonelosis es una enfermedad que puede ser asintomática, lo que
Asociación Chilena de Seguridad genera un gran problema porque es una enfermedad altamente
Diagonal Paraguay 29, piso 4, Santiago contagiosa, debido a la baja dosis infectante necesaria.
Tel.: (56-2) 685 3604 • Fax (56-2) 6852963 Principalmente, esto es de gran interés en manipuladores de
e-mail: fctera@achs.cl alimentos, los cuales podrían ser portadores y diseminar la enfer-
Recibido: 02 de octubre de 2006 / Aceptado: 11 de diciembre de 2006. medad (Fica et al. 2001).

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Se ha demostrado la excreción fecal de Salmonella spp. Buchwald Debido a las causas antes mencionadas es necesario validar una
y Blazen, encontró que pacientes que presentaron Salmonella spp., técnica para la detección de Salmonella spp. en portadores (mani-
luego de cuatro semanas, seguían excretándola (Buchwald y Blazer puladores de alimentos) más sensible y más rápida que las actuales
1984). Murase y cols. 2000 realizó un estudio de una toxicoinfec- disponibles en laboratorios de rutina.
ción por Salmonella spp. en un casino de colegio en Japón y
demostró la presencia de Salmonella spp. en personas sin sintoma-
tología. (Murase et al. 2000) OBJETIVO
Los métodos tradicionales de detección están basados en el uso de
medios de cultivo selectivos y posterior caracterización de colonias El trabajo fue estandarizar la técnica de PCR y objetivar su sensi-
sospechosas por test bioquímicos y serológicos. El método estándar bilidad, especificidad, valor predictivo positivo, negativo y repro-
de oro es el coprocultivo, el cual tiene gran valor en estudios epide- ducibilidad en el estudio de muestras clínicas (coprocultivos)
miológicos; sin embargo, estudios de síndromes diarreicos en todo obtenidas de manipuladores de alimentos de empresas asociadas
paciente son cuestionados, ya que la gran mayoría de los cuadros a la ACHS.
son autolimitados.
El coprocultivo es una muestra que por su carga de trabajo, costo y
volumen, suele ser de bajo rendimiento y bajo costo-efectividad. La MATERIAL Y MÉTODO
positividad es de 1,8% a 4,4%. De esta misma forma el porcentaje
de recuperación de los medios de cultivo (Mac Conkey - Hektoen) Se recolectaron 208 coprocultivos en el laboratorio ACHS-
es de 4% a 10%. Los métodos de identificación tradicional sólo ARAUCO, provenientes del Servicio de Exámenes Preventivos
detectan una pequeña fracción de los casos de salmonelosis. La baja (SEP) en el primer semestre del período 2005.
sensibilidad de los métodos tradicionales es debida a un bajo Todas las muestras eran de manipuladores de alimentos y otras
número de microorganismos causales, debido a la competición de de la rutina del laboratorio.
los otros organismos comensales, como también a unos inapro- Las muestras fueron preenriquecidas 15 a 18 horas en Selenito y
piados cambios en la temperatura medioambiental y pH durante el se ensayó, en paralelo, a partir de una alícuota, la técnica tradi-
transporte del espécimen. Además se debe tomar en cuenta que se cional (coprocultivo) y la reacción en cadena de la polimerasa
necesita individuos altamente entrenados en el diagnóstico de estos (PCR) a partir de las heces de los pacientes,
patógenos. Se utilizaron medios de cultivo tradicionales (Mac Conkey y
Actualmente las técnicas moleculares han sido utilizadas amplia- Hecktoen), además de medios selectivos (XLD y S-S), se incu-
mente como herramienta epidemiológica y clínica. La utilidad de la baron por 15 a 18 horas y a 5 colonias sospechosas presentes en
amplificación genómica (PCR) como herramienta diagnóstica de la placa se les realizó aislamiento e identificación por pruebas
identificación de patógenos ha sido bien documentada en la litera- bioquímicas (TSI, LIA, MIO, UREA de Christensen, CITRATO de
tura mundial, siendo utilizada ampliamente en muestras de Simmons).
matrices alimentarías, medioambientales y clínicas en forma Se extrajo el DNA de 1mL del Selenito previamente enriquecido
creciente. La PCR ha sido utilizada como herramienta de investiga- y se amplificó con un partidor escogido de la literatura.
ción de focos de brotes alimentarios y la identificación de agentes El partidor es específico para Salmonella spp. y codifica para una
etiológicos responsables. Esta técnica presenta alta sensibilidad, porina de membrana externa (proteína) de todas las Salmonellas.
especificidad y menor tiempo de proceso. La realización de la detec- Se estandarizaron las condiciones de reacción de la Técnica de
ción por el método de la PCR depende, en parte, de la extracción Amplificación Genómica (MgCl2, KCl, dNTPs, Primers, y pH del
del DNA, y la especificidad de los partidores. Las matrices ambien- buffer).
tales, alimentarías y clínicas son muy complejas, debido principal- Los DNAs fueron amplificados en un termociclador Eppendorf. La
mente a la elevada cantidad de proteínas, glúcidos y lípidos exis- electroforesis fue realizada en una cámara tipo, y se corrió con
tentes, como la presencia de otros microorganismos presentes; esto una fuente de poder a 120 volts por 40 minutos.
contribuye a limitaciones de la técnica. Para eliminar o disminuir la Se reveló la electroforesis previa exposición en Bromuro de
cantidad de inhibidores, se han probado distintos tipos de extrac- Etidio 1 ug/mL en transluminador uv.
ción; entre ellos existe la utilización de diferentes detergentes para
romper las membranas celulares, como Tritón, SDS, CTAB,
β−mercaptoetanol, entre otros. Las concentraciones de los dife- RESULTADOS Y CONCLUSIONES:
rentes reactivos deben ser probadas de acuerdo a experimentos
empíricos, puesto que las matrices utilizadas son diferentes y se La especificidad comparativa de la técnica con el Gold Estandar
debe priorizar una técnica que deba ser costo/efectiva. resultó en un 98% (Figura 1). La PCR no tuvo reacción cruzada con
Los inhibidores son una de las problemáticas mayores dentro de los ningún DNA de otras enterobacterias.
análisis hechos por la PCR; para esto se han ideado pasos de preen- La sensibilidad comparativa de la técnica con el Gold Estándar
riquecimiento de las muestras a analizar, el Selenito es de elección resultó en un 100% (Figura 2). La capacidad de resolución de la
en clínica. Tetrationato y Rappaport-Vassidialis han sido utilizados técnica de PCR es una unidad formadora de colonia previo enri-
principalmente en los laboratorios de alimentos. La finalidad de quecimiento en Selenito, tras las 15 a 18 horas.
estos medios es diluir los interferentes y aumentar la cantidad de De las 208 muestras procesadas, 204 fueron negativas por ambas
microorganismos viables, con lo cual aumentan el número de metodologías y 1 fue positiva por ambas técnicas. El valor predic-
copias de DNA aumentando la sensibilidad de la técnica (Carli et al. tivo positivo fue de 25% y el valor predictivo negativo 100%. Hubo
2001; Gentry-Weeks et al. 2002; Fukushima et al. 2003; Aranda et 3 discordancias, siendo positivas por PCR y negativas por copro-
al. 2004). cultivo (Tabla1).

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Figura 1. Figura 2.
Especificidad de la técnica de amplificación molecular PCR con cepas Sensibilidad de la técnica de amplificación molecular desde concen-
de referencias ATCC: traciones de 108 UFC hasta 1 UFC. 1-16 PM= Estándar 100bp; C (+)
Control positivo; C(-) Control negativo.

1.Salmonella enteritidis 2.Shigella flexneri 3.Salmonella typhi


4.Klebsiella oxytoca 5.Escherichia coli 6.Enterococcus fecalis.
7.Providencia stuartii 8.Pseudomonas aeruginosa. 9.Proteus mirabilis
10.Control negativo de amplificación 11.Control positivo de amplificación.

Tabla 1. CONCLUSIONES
Comparación de la técnica tradicional para el diagnóstico de Salmonella
spp versus la técnica de amplificación genómica. La técnica de PCR estandarizada a partir de muestras de heces
demostró alta sensibilidad y especificidad. La correlación con las
COPROCULTIVO Total muestras procesadas por ambos métodos evidenció buena correla-
Positivo Negativo ción con los resultados negativos; en relación a las discordancias de
P Positivo 1 3 4 los casos positivos la técnica molecular mostró mayor número
C respecto a la técnica tradicional que presenta baja sensibilidad. La
R Negativo 0 204 204 biología molecular permitirá al laboratorio de rutina disminuir el
costo de material, personal y tiempo dedicado al diagnóstico de
Total 1 207 208
Salmonella disminuyendo el tiempo de respuesta. La caracterización
en forma precoz de Salmonella es de utilidad tanto en clínica como
en estudios de manipuladores de alimentos para implementar los
tratamientos y medidas preventivas en forma adecuada.

REFERENCIAS
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