BIOGEOGRAFÍA CLADISTICA

COMPARACIÓN DE LOS DIFERENTES MÉTODOS EN BIOGEOGRAFÍA CLADÍSTA

Elizabeth A. Martínez Salazar y Rogelio Rosas Valdez

Objetivos
Describir y comparar los diferentes métodos de la biogeografía cladística.

Unidad de Conocimiento
Un análisis biogeográfico cladístico consta básicamente de tres partes, a partir de la selección de
cladogramas de taxones monofiléticos distribuidos en las áreas de estudio: 1) Construcción de
cladogramas taxonómicos de áreas; 2) Obtención de cladogramas resueltos de áreas y 3)
Obtención de los cladogramas generales de áreas. Se han propuesto alrededor de 14 métodos en
biogeografía cladística. Cada método aborda la obtención de cladogramas generales de áreas de
diferente manera; en algunos casos tratan de resolver las inconsistencias que pueden presentar
los cladogramas taxonómicos de áreas (áreas ausentes, distribuciones redundantes y taxones
ampliamente distribuidos).

Bibliografía recomendada
Brooks, D. R. 2005. Historical biogeography in the age of complexity: Expansion and integration.
Revista Mexicana de Biodiversidad 76 (1): 79-94. (Antes Anales del Instituto de Biología).
Crisci J. V., L. Katinas y P. Posadas. 2003. Historical Biogeography. Harvard University Press.
Cambridge, Massachesetts. London, England. 250pp.
Goyenechea I., O Flores V., y J. J. Morrone. 2001. Introducción a los Fundamentos y métodos de la
Biogeografía Cladística. En: Llorente B. J. y J .J. Morrone (eds.) Introducción a la Biogeografía en
Latinoamérica: Teorías, Conceptos, Métodos y Aplicaciones. Las Prensas de Ciencias, Facultad de
Ciencias, UNAM. México D. F. pp. 225-243.
Humphries, C. J. y L. R. Parenti. 1999. Cladistic biogeography: Interpreting patterns of plant and
animal distributions. Segunda Edición. Oxford Biogeography Series 12, Oxford University Press.
Morrone, J. J. 2004. Homología Biogeográfica. Las coordenadas espaciales de la vida. Cuadernos
del Instituto de Biología 37. 199 p.
Morrone, J. J., and J. M. Carpenter. 1994. In search of a method for cladistic biogeography: an
empirical comparison of component analysis, Brooks parsimony analysis, and three-area statements.
Cladistics 10: 99-153.
Morrone, J. J. y J. V. Crisci. 1995. Historical biogeography: introduction to methods. Annu. Rev. Ecol.
Syst. 26: 373-401.
Organista, D. E., J. J. Morrone., J. Llorente B, y O. Flores V. 2002. Introducción al análisis de
patrones en biogeografía histórica. Las Prensas de Ciencias, Facultad de Ciencias, UNAM. 133pp.
Wojcicki, M., and D. R. Brooks. 2005. PACT: an efficient and powerful algorithm for generating
area cladograms. Journal for Biogeography 32: 755-774

Unidad de acción
1. A partir de la bibliografía recomendada completa el cuadro 1.
2. Compara los diferentes métodos en la biogeografía cladística (ventajas y/o desventajas).
2. Discute brevemente cuál o cuáles métodos en Biogeografía Cladistica consideras más
adecuados para obtener patrones generales de áreas y por qué.
Cuadro 1. Comparación de los diferentes métodos en biogeografía Cladista. Señala: V= Ventaja D= Desventaja.

Método Año y Pasos particulares del método Ventajas y/o desventajas

representantes
Reducción de Permite encontrar un cladograma general de
Cladogramas de áreas o áreas, aun cuando hubo procesos de dispersión o
Cladograma reducido de extinción ___
áreas
No resuelve las inconsistencias, puesto que no
las puede explicar, solo las elimina __

Método de mapas Wiley Examina si los elementos inconsistentes

primarios o Mapas de (1980; 1981) se deben causas o modos de especiación
Especies Ancestrales (dispersión, fragmentación de áreas
grandes o aislamiento periférico)

Análisis de Componentes

Biogeografía filogenética Mickevich, 1981 No aplican ningún supuesto para resolver

cuantitativa inconsistencias en los cladogramas taxonómicos
de áreas___
No transforman los cladogramas taxonómicos de
áreas en matrices para ser analizadas por el
algoritmo de parsimonia ___
Análisis de Parsimonia o Este encuentra el cladograma general de áreas
simplicidad de Brooks más parsimonioso, señalando (en forma de
(BPA primario) homoplasias) cómo puede contrastarse la
hipótesis nula de vicarianza __

Sesga mucho las soluciones hacia las opciones

derivadas por el supuesto 0 _

El algoritmo de parsimonia debe aplicarse durante

el proceso de selección de hipótesis, no durante
su formulación __
Cuadro 1. Continuación…
Método
Análisis de Parsimonia de
Brooks secundario
(BPA secundario)
Enunciados de Tres Áreas
(TAS)
Árboles Reconciliados
Compatibilidad de
componentes
Cuantificación del análisis
de componentes
Año y Pasos particulares del método
representantes
(Brooks, 1990)
Nelson y Ladiges
(1991)
Los taxones ampliamente distribuidos
codifican en una matriz de datos binaria.
Las matrices se analizan de manera
separada para obtener cladogramas de
áreas individuales. Todos los caracteres se
adicionan al cladograma y aquellos que
concuerdan con el cladograma general de
áreas se consideran como caracteres de
soporte. Se elige el cladograma de áreas
más parsimonioso (número de caracteres
contradictorios menos el número de
caracteres de apoyo).
Humphries et al.,
1988
Ventajas y/o desventajas
Tiende a sobrestimar los eventos de dispersión,
ya que en ocasiones señala a los mismos en
los ancestros de especies terminales que se
dispersaron; y puede sobrestimar los eventos
de extinción _
Integra los elementos incongruentes, eligiendo
al cladograma general de áreas que postule el
números menor de áreas duplicadas, cada de
las cuales representa una contrastación de la
hipótesis nula __
Al codificar los datos, se desarrolla la menor
unidad de relación posible (los enunciados de
tres áreas) __
Considerar que las duplicaciones son eventos
menos probables que la vicarianza__
Se sobreestima las duplicaciones y subestima
la dispersión __
Al aplicar los supuestos 1 y 2, omiten el
tratamiento a las distribuciones redundantes __
Aplican el supuesto 1 y 2 para resolver
inconsistencias en los cladogramas
taxonómicos de áreas __
Cuadro 1. Continuación….

Método Año y Pasos particulares del método Ventajas y/o desventajas

representantes
Análisis de Subárboles Se reduce en uno o más cladogramas
Libres de Paralogía complejos a un subárbol libre de paralogía,
(TASS) iniciando del nodo más terminal hacia la
raíz del cladograma.

Filogeografía comparada Arbogast y Kenagy Tiene como objeto analizar patrones

(2001) filogeográficos (estudio de los principios y
procesos que gobiernan la distribución
geográfica de los linajes genealógicos de
nivel intraespecífico de varias especies
codistribuidas, con el objeto de establecer
patrones en común. Se han empleado
métodos de la biogeografía cladística e .g.
BPA; partiendo de filogenias o genealogías
de genes de mtDNA, e integrando la
información geográfica de las poblaciones
muestreadas para cada una de las
especies analizadas.
Análisis de Dispersión- Se asignan costos a los eventos de vicarianza,
Viacarianza (DIVA) dispersión y extinción
Cuadro 1. Continuación….
Método
representantes
Análisis filogenético para
comparar árboles (PACT)
Año y Pasos particulares del método
Los cladogramas de áreas, se convierten
en diagramas de Venn. Se elige cualquier
cladograma de áreas del conjunto de
cladogramas de áreas a estudiar
(cladograma de área plantilla), para ser
analizado y se determinan sus elementos.
Se selecciona otro cladograma y se
determinan sus elementos. Se
inspeccionan los cladogramas de áreas: si
hay elementos compartidos entre el
segundo cladograma de área y el
cladograma de área plantilla. Una vez que
los nuevos elementos del segundo
cladograma áreas se han integrado al
cladograma de áreas plantilla, se ve si
cualquiera de ellos puede combinarse más
allá. Se repite los pasos para el resto de los
cladogramas de áreas a analizar.
Ventajas y/o desventajas
No subestima los eventos de dispersión, no
elimina información____
No especifica costos, pesos o probabilidades de
los procesos biogeográficos.___
No necesita convertir los cladogramas de áreas
en matrices de código binario_____
No emplea el algoritmo de parsimonia en su
análisis____
Solo compara dos árboles a la vez (cladograma
de áreas plantilla y el cladograma de áreas que
se integra al cladograma de áreas plantilla)____