Definición: 

La proteómica es el estudio y caracterización de todo el

conjunto de proteínas expresadas de un genoma (proteoma). Las técnicas
de proteómica abordan el estudio de este conjunto de proteínas. La
Proteómica permite identificar, categorizar y clasificar las proteínas con
respecto a su función y a las interacciones que establecen entre ellas. De
este modo, se pueden caracterizar las redes funcionales que establecen
las proteínas y su dinámica durante procesos fisiológicos y patológicos. La
proteómica se está aplicando en la identificación de nuevos marcadores
para el diagnóstico de enfermedades, la identificación de nuevos
fármacos, la determinación proteínas involucradas en al patogenia de
enfermedades y el análisis de procesos de transducción de señales.

La proteómica es el estudio y caracterización del conjunto de proteínas

expresadas de un genoma (proteoma). El proteoma de una célula varía
según el estado en el que se encuentre la célula, si se encuentra en una
situación de estrés, bajo el efecto de fármacos o de una hormona. Así, en
cada momento y en cada tipo celular el perfil de proteínas expresadas
será diferente. La proteómica es útil para estudiar estas diferencias.
Existen tres ramas en la proteómica que tratan de caracterizar el
proteoma estudiando distintos aspectos del mismo:

 La proteómica de expresión se encarga del estudio de la abundancia

relativa de las proteínas y de sus modificaciones
postranscripcionales

 La proteómica estructural se encarga de la caracterización de la

estructura tridimensional de las proteínas

 La proteómica funcional se encarga de la localización y distribución

subcelular de proteínas y de las interacciones que se producen entre
las proteínas y otras moléculas con el fin de determinar su función

La Proteómica permite identificar, categorizar y clasificar las

proteínas con respecto a su función y a las interacciones que
establecen entre ellas. De este modo, se pueden caracterizar las
redes funcionales que establecen las proteínas y su dinámica
durante procesos fisiológicos y patológicos.

Las aplicaciones de la proteómica son múltiples, pero actualmente se

destacan las siguientes:
  Identificación de nuevos marcadores para el diagnóstico de
enfermedades

 Identificación de nuevos fármacos

 Determinación de mecanismos moleculares involucrados en la

patogenia de enfermedades

 Análisis de rutas de transducción de señales

Las técnicas más usadas en proteómica se basan en la electroforesis y en

la espectrometría de masas. Dependiendo del objetivo del estudio
podemos agrupar las técnicas de proteómica en los siguientes grupos:

 Técnicas empleadas para analizar globalmente el proteoma y

separar sus proteínas. Cabe destacar la electroforesis bidimensional,
DIGE (Difference In Gel Electrophoresis: electroforesis diferencial en
gel), ICAT (Isotope-Coded Affinity Tags: marcaje isotópico
diferencial) y MudPIT(Multidimensional Protein Identification
Technology: tecnología de identificación de proteínas
multidimensional)

 Técnicas usadas para analizar individualmente las proteínas. Con

este objetivo se utilizan distintos tipos de espectrometría de masas,
como el MALDI-TOF (Matrix-assisted laser desorption/ionization
Time Of Flight: desorción/ionización mediante láser asistida por
matriz en “tiempo de vuelo”), SELDI-TOF-MS (Surface Enhanced
Laser Desorpcion Ionization Time Of Flight Mass Spectrometry:
espectrometría de masas en "Tiempo de Vuelo" mediante
desorción/ionización por láser de superficie), MS/MS (Mass
Spectrometry/ Mass Spectrometry: espectrometría de masas en
tándem). Con estas técnicas se obtiene la huella peptídica (peptide
mass fingerprint). La huella peptídica es el conjunto de fragmentos
peptídicos que se obtienen tras tratar una proteína concreta con una
proteasa determinada. La huella peptídica es característica de cada
proteína y depende de la enzima con la que se fragmente.
Actualmente hay numerosas bases de datos que recogen las huellas
peptídicas de multitud de proteínas conocidas. Estas bases de datos
se pueden rastrear usando programas bioinformáticos para buscar
la huella peptídica que corresponda con la huella peptídica de la
proteína que se esté estudiando y por tanto poder identificarla.
  Técnicas que se usan para estudiar interacciones entre proteinas,
como los sistemas “yeast two hybrids” de alto rendimiento o y la
técnica “Phage Display”. La técnica “Phage Display” permite
averiguar con qué proteínas interacciona una proteína problema o
sonda. Esta técnica consiste en la expresión en la superficie de un
fago de las proteínas que se quieren analizar. La proteína problema
o sonda se inmoviliza sobre un soporte o membrana de tal modo
que los fagos que expresan las proteínas que se unen a la sonda
quedan inmovilizados sobre el soporte. Estos fagos se pueden
recuperar fácilmente de la membrana y pueden ser empleados para
la expresión de la proteína en Escherichia coli y su posterior
identificación.


El análisis y la interpretación de los datos obtenidos con las técnicas de

proteómica descritas anteriormente, especialmente cuanto se utilizan a
gran escala, necesita herramientas bioinformáticas. Durante los últimos
años la genómica, la proteómica y la bioinformática se han desarrollado
de forma sinérgica experimentando un desarrollo sorprendente que está
aportando grandes avances a la medicina.