Las enzimas son molculas de naturaleza proteica que catalizan reacciones qumicas, siempre que sean termodinmicamente posibles:

Una enzima hace que una reaccin qumica que es energticamente posible (ver Energa libre de Gibbs), pero que transcurre a una velocidad muy baja, sea cinticamente favorable, es decir, transcurra a mayor velocidad que sin la presencia de la enzima. En estas reacciones, las enzimas actan sobre unas molculas denominadas sustratos, las cuales se convierten en molculas diferentes denominadas productos. Casi todos los procesos en las clulas necesitan enzimas para que ocurran a unas tasas significativas. A las reacciones mediadas por enzimas se las denomina reacciones enzimticas. Debido a que las enzimas son extremadamente selectivas con sus sustratos y su velocidad crece slo con algunas reacciones, el conjunto (set) de enzimas sintetizadas en una clula determina el tipo de metabolismo que tendr cada clula. A su vez, esta sntesis depende de la regulacin de la expresin gnica. Como todos los catalizadores, las enzimas funcionan disminuyendo la energa de activacin (G) de una reaccin, de forma que se acelera sustancialmente la tasa de reaccin. Las enzimas no alteran el balance energtico de las reacciones en que intervienen, ni modifican, por lo tanto, el equilibrio de la reaccin, pero consiguen acelerar el proceso incluso millones de veces. Una reaccin que se produce bajo el control de una enzima, o de un catalizador en general, alcanza el equilibrio mucho ms deprisa que la correspondiente reaccin no catalizada. Al igual que ocurre con otros catalizadores, las enzimas no son consumidas por las reacciones que catalizan, ni alteran su equilibrio qumico. Sin embargo, las enzimas difieren de otros catalizadores por ser ms especficas. Las enzimas catalizan alrededor de 4.000 reacciones bioqumicas distintas. No todos los catalizadores bioqumicos son protenas, pues algunas molculas de ARN son capaces de catalizar reacciones (como la subunidad 16S de los ribosomas en la que reside la actividad peptidil transferasa). Tambin cabe nombrar unas molculas sintticas denominadas enzimas artificiales capaces de catalizar reacciones qumicas como las enzimas clsicas. La actividad de las enzimas puede ser afectada por otras molculas. Los inhibidores enzimticos son molculas que disminuyen o impiden la actividad de las enzimas, mientras que los activadores son molculas que incrementan dicha actividad. Asimismo, gran cantidad de enzimas requieren de cofactores para su actividad. Muchas drogas o frmacos son molculas inhibidoras. Igualmente, la actividad es afectada por la temperatura, el pH, la concentracin de la propia enzima y del sustrato, y otros factores fsico-qumicos. Algunas enzimas son usadas comercialmente, por ejemplo, en la sntesis de antibiticos y productos domsticos de limpieza. Adems, son ampliamente utilizadas en diversos

procesos industriales, como son la fabricacin de alimentos, destincin de jeans o produccin de biocombustibles. ESTRUCTURAS Y MECANISMOS

Diagrama de cintas que representa la estructura de una anhidrasa carbnica de tipo II. La esfera gris representa al cofactor zinc situado en el centro activo. Las enzimas son generalmente protenas globulares que pueden presentar tamaos muy variables, desde 62 aminocidos como en el caso del monmero de la 4-oxalocrotonato tautomerasa, hasta los 2.500 presentes en la sintasa de cidos grasos. Las actividades de las enzimas vienen determinadas por su estructura tridimensional, la cual viene a su vez determinada por la secuencia de aminocidos. Sin embargo, aunque la estructura determina la funcin, predecir una nueva actividad enzimtica basndose nicamente en la estructura de una protena es muy difcil, y un problema an no resuelto. Casi todas las enzimas son mucho ms grandes que los sustratos sobre los que actan, y solo una pequea parte de la enzima (alrededor de 3 a 4 aminocidos) est directamente involucrada en la catlisis. La regin que contiene estos residuos encargados de catalizar la reaccin es denominada centro activo. Las enzimas tambin pueden contener sitios con la capacidad de unir cofactores, necesarios a veces en el proceso de catlisis, o de unir pequeas molculas, como los sustratos o productos (directos o indirectos) de la reaccin catalizada. Estas uniones de la enzima con sus propios sustratos o productos pueden incrementar o disminuir la actividad enzimtica, dando lugar as a una regulacin por retroalimentacin positiva o negativa, segn el caso. Al igual que las dems protenas, las enzimas se componen de una cadena lineal de aminocidos que se pliegan durante el proceso de traduccin para dar lugar a una estructura terciaria tridimensional de la enzima, susceptible de presentar actividad. Cada secuencia de aminocidos es nica y por tanto da lugar a una estructura nica, con propiedades nicas. En ocasiones, protenas individuales pueden unirse a otras protenas para formar complejos, en lo que se denomina estructura cuaternaria de las protenas.

La mayora de las enzimas, al igual que el resto de las protenas, pueden ser desnaturalizadas si se ven sometidas a agentes desnaturalizantes como el calor, los pHs extremos o ciertos compuestos como el SDS. Estos agentes destruyen la estructura terciaria de las protenas de forma reversible o irreversible, dependiendo de la enzima y de la condicin.

MODELO DE LA "LLAVE-CERRADURA"
Las enzimas son muy especficas, como sugiri Emil Fischer en 1894. Con base a sus resultados dedujo que ambas molculas, enzima y sustrato, poseen complementariedad geomtrica, es decir, sus estructuras encajan exactamente una en la otra, por lo que ha sido denominado como modelo de la "llave-cerradura", refirindose a la enzima como a una especie de cerradura y al sustrato como a una llave que encaja de forma perfecta en dicha cerradura. Sin embargo, si bien este modelo explica la especificidad de las enzimas, falla al intentar explicar la estabilizacin del estado de transicin que logran adquirir las enzimas Modelo del encaje inducido

Diagrama que esquematiza el modo de accin del modelo del encaje inducido. En 1958 Daniel Koshland sugiere una modificacin al modelo de la llave-cerradura: las enzimas son estructuras bastante flexibles y as el sitio activo podra cambiar su conformacin estructural por la interaccin con el sustrato. [28] Como resultado de ello, la cadena aminoacdica que compone el sitio activo es moldeada en posiciones precisas, lo que permite a la enzima llevar a cabo su funcin cataltica. En algunos casos, como en las glicosidasas, el sustrato cambia ligeramente de forma para entrar en el sitio activo.[29] El sitio activo continua dicho cambio hasta que el sustrato est completamente unido. Mecanismos Las enzimas pueden actuar de diversas formas, aunque, como se ver a continuacin, siempre dando lugar a una disminucin del valor de G

Reduccin de la energa de activacin mediante la creacin de un ambiente en el cual el estado de transicin es estabilizado (por ejemplo, forzando la forma de un

sustrato: la enzima produce un cambio de conformacin del sustrato unido el cual pasa a un estado de transicin, de modo que ve reducida la cantidad de energa que precisa para completar la transicin). Reduciendo la energa del estado de transicin, sin afectar la forma del sustrato, mediante la creacin de un ambiente con una distribucin de carga ptima para que se genere dicho estado de transicin. Proporcionando una ruta alternativa. Por ejemplo, reaccionando temporalmente con el sustrato para formar un complejo intermedio enzima/sustrato (ES), que no sera factible en ausencia de enzima. Reduciendo la variacin de entropa necesaria para alcanzar el estado de transicin (energa de activacin) de la reaccin mediante la accin de orientar correctamente los sustratos, favoreciendo as que se produzca dicha reaccin. Incrementando la velocidad de la enzima mediante un aumento de temperatura. El incremento de temperatura facilita la accin de la enzima y permite que se incremente su velocidad de reaccin. Sin embargo, si la temperatura se eleva demasiado, la conformacin estructural de la enzima puede verse afectada, reduciendo as su velocidad de reaccin, y slo recuperando su actividad ptima cuando la temperatura se reduce. No obstante, algunas enzimas son termolbiles y trabajan mejor a bajas temperaturas.

Cabe destacar que este efecto entrpico implica la desestabilizacin del estado basal, y su contribucin a la catlisis es relativamente pequea. momento en el cual queda determinada la forma y la carga final.

COFACTORES Y COENZIMAS
Cofactores Algunas enzimas no precisan ningn componente adicional para mostrar una total actividad. Sin embargo, otras enzimas requieren la unin de molculas no proteicas denominadas cofactores para poder ejercer su actividad. Los cofactores pueden ser compuestos inorgnicos, como los iones metlicos y los complejos ferrosulfurosos, o compuestos orgnicos, como la flavina o el grupo hemo. Los cofactores orgnicos pueden ser a su vez grupos prostticos, que se unen fuertemente a la enzima, o coenzimas, que son liberados del sitio activo de la enzima durante la reaccin. Las coenzimas incluyen compuestos como el NADH, el NADPH y el adenosn trifosfato. Estas molculas transfieren grupos funcionales entre enzimas. Un ejemplo de una enzima que contiene un cofactor es la anhidrasa carbnica, en la cual el zinc (cofactor) se mantiene unido al sitio activo, tal y como se muestra en la figura anterior (situada al inicio de la seccin "Estructuras y mecanismos"). Estas molculas suelen encontrarse unidas al sitio activo y estn implicadas en la catlisis. Por ejemplo, la flavina y el grupo hemo suelen estar implicados en reacciones redox. Las enzimas que requieren un cofactor pero no lo tienen unido son denominadas apoenzimas o apoprotenas. Una apoenzima junto con cofactor(es) es denominada holoenzima (que es la forma activa). La mayora de los cofactores no se unen covalentemente a sus enzimas, pero s lo hacen fuertemente. Sin embargo, los grupos prostticos pueden estar covalentemente unidos, como en el caso de la tiamina pirofosfato en la enzima piruvato deshidrogenasa. El trmino "holoenzima" tambin puede

ser aplicado a aquellas enzimas que contienen mltiples subunidades, como en el caso de la ADN polimerasa, donde la holoenzima es el complejo con todas las subunidades necesarias para llevar a cabo la actividad enzimtica. COENZIMAS

Modelo tridimensional de esferas de la coenzima NADH. Las coenzimas son pequeas molculas orgnicas que transportan grupos qumicos de una enzima a otra. Algunos de estos compuestos, como la riboflavina, la tiamina y el cido flico son vitaminas (las cuales no pueden ser sintetizados en cantidad suficiente por el cuerpo humano y deben ser incorporados en la dieta). Los grupos qumicos intercambiados incluyen el ion hidruro (H-) transportado por NAD o NADP+, el grupo fosfato transportado por el ATP, el grupo acetilo transportado por la coenzima A, los grupos formil, metenil o metil transportados por el cido flico y el grupo metil transportado por la S-Adenosil metionina. Debido a que las coenzimas sufren una modificacin qumica como consecuencia de la actividad enzimtica, es til considerar a las coenzimas como una clase especial de sustratos, o como segundos sustratos, que son comunes a muchas enzimas diferentes. Por ejemplo, se conocen alrededor de 700 enzimas que utilizan la coenzima NADH.[49] Las coenzimas suelen estar continuamente regenerndose y sus concentraciones suelen mantenerse a unos niveles fijos en el interior de la clula: por ejemplo, el NADPH es regenerado a travs de la ruta de las pentosas fosfato y la S-Adenosil metionina por medio de la metionina adenosiltransferasa. Esta regeneracin continua significa que incluso pequeas cantidades de coenzimas son utilizadas intensivamente. Por ejemplo, el cuerpo humano gasta su propio peso en ATP cada da.

APLICACIONES INDUSTRIALES
Las enzimas son utilizadas en la industria qumica, y en otros tipos de industria, en donde se requiere el uso de catalizadores muy especializados. Sin embargo, las enzimas estn limitadas tanto por el nmero de reacciones que pueden llevar a cabo como por su ausencia de estabilidad en solventes orgnicos y altas temperaturas. Por ello, la ingeniera de protenas se ha convertido en un rea de investigacin muy activa donde se intentan crear enzimas con propiedades nuevas, bien mediante diseo racional, bien

mediante evolucin in vitro. Estos esfuerzos han comenzado a tener algunos xitos, obtenindose algunas enzimas que catalizan reacciones no existentes en la naturaleza. A continuacin se muestra una tabla con diversas aplicaciones industriales de las enzimas: Aplicacin Procesado de alimentos Enzimas utilizadas Usos Amilasas de hongos y Produccin de azcares plantas. desde el almidn, como por ejemplo en la produccin de jarabe de maz.[80] En la coccin al horno, cataliza la rotura del almidn de la harina La amilasa cataliza la en azcar. La degradacin del almidn en fermentacin del azcar azcares sencillos. llevada a cabo por levaduras produce el dixido de carbono que hace "subir" la masa. Proteasas Los fabricantes de galletas las utilizan para reducir la cantidad de protenas en la harina. Alimentos para bebs Tripsina Para pre-digerir el alimento dirigido a bebs. Elaboracin de cerveza Las enzimas de la cebada Las enzimas liberadas son liberadas durante la degradan el almidn y fase de molido en la las protenas para elaboracin de la cerveza. generar azcares sencillos, aminocidos y pptidos que son usados por las levaduras en el proceso de fermentacin. Enzimas de cebada Ampliamente usadas en producidas a nivel la elaboracin de Cebada germinada utilizada para industrial cerveza para sustituir las la elaboracin de malta. enzimas naturales de la cebada. Amilasa, glucanasa y Digieren polisacridos y proteasas protenas en la malta. Betaglucanasas y Mejoran la filtracin del arabinoxilanasas mosto y la cerveza. Amiloglucosidasas y Produccin de cerveza pululanasas baja en caloras y ajuste de la capacidad de fermentacin. Proteasas Eliminan la turbidez producida durante el

Acetolactatodecarboxilasa (ALDC)

Zumos de frutas Industria lctea

Celulasas, pectinasas

Queso de Roquefort. Digestin de carne

Industria del almidn

Glucosa.

Fructosa. Industria del papel

Renina, derivado del estmago de animales rumiantes jvenes (como terneros y ovejas). Enzimas producidas por Actualmente, cada vez bacterias ms usadas en la industria lctea. Lipasas Se introduce durante el proceso de produccin del queso Roquefort para favorecer la maduracin. Lactasas Rotura de la lactosa en glucosa y galactosa. Papana Ablandamiento de la carne utilizada para cocinar. Amilasas, Conversin del almidn amiloglucosidasas y en glucosa y diversos glucoamilasas azcares invertidos. Glucosa isomerasa Conversin de glucosa en fructosa durante la produccin de jarabe de maz partiendo de sustancias ricas en almidn. Estos jarabes potencian las propiedades edulcorantes y reducen las caloras mejor que la sacarosa y manteniendo el mismo nivel de dulzor.

almacenamiento de la cerveza. Incrementa la eficiencia de la fermentacin mediante la reduccin de la formacin de diacetilo.[81] Aclarado de zumos de frutos. Produccin de queso, usada para hidrolizar protenas.

Amilasas, xilanasas, Degradacin del almidn celulasas y ligninasas para reducir su viscosidad, aadiendo apresto. Las xilanasas reducen el blanqueador necesario para la decoloracin; las celulasas alisan las fibras, favorecen el drenaje de agua y Una fbrica de papel en Carolina

del Sur.

Industria del biofuel

Celulasas

Ligninasas Celulosa en 3D. Detergentes biolgicos

promueven la eliminacin de tintas; las lipasas reducen la oscuridad y las ligninasas eliminan la lignina para ablandar el papel. Utilizadas para degradar la celulosa en azcares que puedan ser fermentados. Utilizada para eliminar residuos de lignina.

Limpiadores contacto

de

lentes

Industria del hule

Industria fotogrfica

Biologa molecular

Principalmente proteasas, Utilizadas para ayudar en producidas de forma la eliminacin de tintes extracelular por bacterias. proteicos de la ropa en las condiciones de prelavado y en las aplicaciones directas de detergente lquido. Amilasas Detergentes de lavadoras para eliminar residuos resistentes de almidn. Lipasas Utilizadas para facilitar la eliminacin de tintes grasos y oleosos. Celulasas Utilizadas en suavizantes biolgicos. de Proteasas Para eliminar restos proteicos de las lentes de contacto y as prevenir infecciones. Catalasa Para generar oxgeno desde el perxido, y as convertir el ltex en hule espumoso. Proteasa (ficina) Disolver la gelatina de las pelculas fotogrficas usadas, permitiendo as la recuperacin de su contenido en plata. Enzimas de restriccin, Utilizadas para manipular ADN ligasa y polimerasas el ADN mediante ingeniera gentica. De gran importancia en farmacologa, agricultura, medicina y criminalstica. Esenciales para

ADN de doble hlice.

digestin de restriccin y para la reaccin en cadena de la polimerasa.