Tema6 Acidnucleicos

TEMA 6: CIDOS NUCLEICOS 1. Composicin de los cidos nucleicos 2. cido desoxirribonucleico (ADN) 2.1 Estructura del ADN .
Estructura primaria . Estructura secundaria . Estructura terciaria 2.2 El ADN en las clulas procariotas y eucariotas 2.3 Desnaturalizacin del ADN 3. cido ribonucleico (ARN) 3.1 Tipos de ARN . ARN mensajero . ARN ribosmico . ARN transferente . ARN nucleolar 4. Nucletidos no nucleicos. 1. COMPOSICIN DE LOS CIDOS NUCLEICOS Los cidos nucleicos (ADN y ARN) son macromolculas formadas por la unin de muchos monmeros denominados nucletidos. Los nucletidos son molculas compuestas por la unin de 3 unidades: una molcula de cido fosfrico, un monosacrido (una pentosa) y una base nitrogenada. O HO - P - OH OH
- Una molcula de cido fosfrico (H3PO4):
- Un azcar de 5 tomos de C, que puede ser ribosa o desoxirribosa, cicladas en forma de D-ribofuranosa y -D-2-desoxirribofuranosa.
- Una base nitrogenada (estructura cclica que contiene C y N). Existen dos tipos de bases nitrogenadas:
Pricas. Derivan de la purina (dos anillos). Son dos: adenina (A) y guanina (G). Pirimidnicas. Derivan de la pirimidina (un anillo). Son citosina (C), timina (T) y uracilo (U).
__________________________________________________________________________________________________________ ____________ Biologa. cidos nucleicos
La unin entre la pentosa y una base nitrogenada da lugar a un nuclesido. El enlace que une ambas molculas se llama N-glucosdico y se produce entre el C-1' de la pentosa y un N de la base (el N-1 si es pirimidnica o el N-9 si es prica) con la prdida de una molcula de agua. Los nuclesidos se nombran aadiendo al nombre de la base la terminacin -osina si es una base prica (ej. adenosina), o la terminacin -idina si se trata de una base pirimidnica (ej. citidina). Si la pentosa es la desoxirribosa, se coloca delante el prefijo desoxi- (ej. desoxiadenosina). Si a un nuclesido se le une una molcula de cido fosfrico, se forma un nucletido. La unin se realiza mediante un enlace tipo ster entre el -OH del C-5' de la pentosa y el cido fosfrico, perdindose una molcula de agua. Los nucletidos se nombran como el nuclesido del que proceden eliminando la "a" final y aadiendo a continuacin el lugar de unin a la pentosa (5') y el
nmero de fosfatos unidos. Por ejemplo, desoxiadenosin-5'-monofosfato (dAMP).
Reacciones de formacin de nuclesidos y nucletidos. En estas molculas los carbonos de las pentosas se numeran como 1, 2, 3, 4 y 5, para diferenciarlos de los carbonos de las bases.
Los grupos -OH unidos a los tomos de P aparecen como -O-. Esto es debido a que a pH fisiolgico esos grupos se encuentran ionizados (en forma de in fosfato PO3-4). La unin de 2 nucletidos forma un dinucletido. Dicha unin se realiza mediante enlace fosfodister entre el grupo fosfato situado en posicin 5' de un nucletido y el grupo hidroxilo que se encuentra en el C-3' de otro nucletido. Se libera una molcula de agua. El dinucletido se puede unir a ms nucletidos y formar trinucletidos, tetranucletidos, etc. La unin de cientos o miles de nucletidos constituye un polinucletido, tambin llamado cido nucleico. En todos los polinucletidos existe un extremo (llamado extremo 5'), donde se localiza un grupo fosfato libre unido al C-5' de una pentosa, y otro extremo (denominado extremo 3') con una pentosa con el grupo -OH del C-3' libre. Es decir, ambos extremos son distintos.
2. CIDO DESOXIRRIBONUCLEICO (ADN) El ADN es un polmero de desoxirribonucletidos (contienen desoxirribosa). En cuanto a las bases nitrogenadas pueden aparecer adenina, guanina, citosina y timina, pero nunca uracilo. 2.1 ESTRUCTURA DEL ADN. En el medio acuoso celular, el ADN adopta (igual que las protenas) una estructura tridimensional en la que se pueden describir varios niveles de complejidad creciente, son las estructuras primaria, secundaria y terciaria. - Estructura primaria.
Es la secuencia de nucletidos unidos por enlaces fosfodister. Una cadena de ADN presenta dos extremos libres: el 5', unido al grupo fosfato, y el 3', unido al hidroxilo. Como todos los nucletidos contienen fosfato y desoxirribosa, la diferencia entre las molculas de ADN de los distintos organismos radica nicamente en el orden de las bases nitrogenadas que cuelgan de las pentosas. Cuando se representa una cadena de ADN normalmente slo se indica la secuencia de desoxirribonucletidos de manera abreviada. As un polinucletido como el representado en la figura se abreviara como 5' AGTC 3'.
- Estructura secundaria: el modelo de Watson y Crick. La estructura espacial del ADN fue establecida en 1953 por Watson y Crick, basndose en dos descubrimientos previos: . En 1950, Chargaff, tras estudiar gran cantidad de muestras de ADN, pertenecientes a diversas especies de organismos, observ que el nmero de adeninas siempre es igual al de timinas, y el de guaninas, al de citosinas. %A = %T %C = %G
. Por otra parte, en esta misma poca, Franklin y Wilkins aplicaron el mtodo de difraccin de rayos X al ADN y dedujeron que esta molcula posee una estructura helicoidal y que en ella existen detalles estructurales repetidos cada 0,34 nm y cada 3,4 nm.
A partir de estos datos, Watson y Crick propusieron un modelo de doble hlice del ADN que an sigue vigente. Este modelo presenta las siguientes caractersticas: El ADN est constituido por dos cadenas de polinucletidos unidas entre s. Las dos cadenas son antiparalelas, es decir, que el extremo 3' de una de ellas se enfrenta con el extremo 5' de la otra. La unin entre las cadenas se realiza por medio de puentes de H entre las bases nitrogenadas, concretamente, la adenina forma 2 de estos puentes con la timina y la guanina 3 con la citosina. Se dice que las dos cadenas son complementarias.
Las dos cadenas estn enrolladas en espiral formando una doble hlice alrededor de un eje imaginario. Las bases nitrogenadas quedan en el interior de la doble hlice, mientras que los esqueletos pentosafosfato se sitan en la parte externa. Los planos de las bases nitrogenadas enfrentadas son paralelos entre s y perpendiculares al eje de la hlice. El enrollamiento de las dos cadenas es dextrgiro (hacia la derecha) y plectonmico (las cadenas no se pueden separar sin desenrollarlas). El dimetro de la doble hlice es de 2 nm, la longitud de cada vuelta es de 3,4 nm y cada 0,34 nm se encuentra un par de bases complementarias. Por lo tanto existen 10 pares de nucletidos por cada vuelta.
La configuracin espacial descrita por Watson y Crick se denomina forma B y durante mucho tiempo fue considerada como la nica. En la actualidad se conocen otros dos tipos de estructura en doble hlice:
o La forma A, que tambin es dextrgira pero con los pares de base inclinados respecto al eje
de la hlice. Esta forma se obtiene por desecacin de la forma B y nunca se encuentra en condiciones fisiolgicas, slo se ha observado en el laboratorio. Es ms ancha y ms corta que la B. La forma Z es ms larga y estrecha que la B, aqu la doble hlice es levgira y presenta irregularidades en forma de de zig-zag.
Aunque in vivo predomina el B-ADN, se ha podido observar la presencia de algunas regiones Z en el genoma de clulas eucariotas. Su funcin, an por confirmar, parece estar relacionada con los mecanismos de regulacin de la expresin de los genes. - Estructura terciaria. El ADN no se encuentra en las clulas en la forma extendida correspondiente a su estructura secundaria, sino plegado sobre si mismo, es decir, superenrollado, dando lugar a un tercer nivel estructural. El superenrollamiento (enrollar algo que ya est enrollado) del ADN es necesario, entre otras razones, porque las largas cadenas de ADN deben alojarse en el interior de la clula (procariotas) o del ncleo (eucariotas), de dimensiones muy inferiores a la longitud del ADN. Por ejemplo:
2.2 EL ADN EN LAS CLULAS PROCARIOTAS Y EUCARIOTAS. . Recuerda que los organismos procariotas son clulas (bacterias) de tamao pequeo (0,2 a 5 m de dimetro), con membrana plasmtica y generalmente con una pared celular rgida, pero carecen de membrana nuclear, de orgnulos y de cualquier otro tipo de compartimentacin interna. En procariotas existe una molcula de ADN circular, es decir, con sus extremos cerrados, que recibe el nombre de cromosoma bacteriano, localizado en el citoplasma, en la llamada zona nuclear o nucleoide, sin membrana que la delimite. Es frecuente encontrar, adems, otras molculas circulares ms pequeas llamadas plsmidos. . Las clulas eucariotas son ms variadas y complejas. Son de mayor tamao (10- 50 m), poseen membrana plasmtica, pueden tener pared celular (plantas), tienen citoesqueleto interno, y muestran una gran compartimentacin citoplasmtica, con diferentes tipos de orgnulos (mitocondrias, cloroplastos, lisosomas, ...) y otras estructuras membranosas (retculo endoplasmtico, complejo de Golgi, ...). El ncleo tiene como caracterstica esencial la presencia de una doble membrana nuclear. En el interior del ncleo, el ADN se presenta como largas molculas lineales de doble hebra, estrechamente asociadas a protenas bsicas (histonas). Cada molcula de ADN, con sus protenas asociadas, forma una fibra visible al microscopio electrnico. El conjunto de todas estas fibras constituye la cromatina (interfase). Cuando la clula se va a dividir, cada fibra de cromatina se compacta y forma los cromosomas. Aunque la mayor parte del ADN (ms del 90%) de las clulas eucariotas est en el ncleo, en las mitocondrias y cloroplastos tambin hay ADN, que codifica algunas de las protenas de estos orgnulos. Este ADN est organizado en cromosomas circulares, al igual que el de procariotas, aunque de menor longitud. . En los virus, el ADN puede adoptar mltiples formas. Los virus contienen una sola molcula de ADN que puede ser monocatenaria o bicatenaria, segn est compuesta de una sola hebra de
ADN o de dos. Adems ambos tipos pueden presentarse de forma lineal o circular. 2.3 DESNATURALIZACIN DEL ADN. Cuando el ADN se somete a temperaturas elevadas o a cambios de pH, las dos cadenas de polinucletidos se separan al romperse los puentes de hidrgeno entre las bases nitrogenadas. Este proceso, denominado desnaturalizacin, es reversible siempre que el tratamiento aplicado no haya sido muy drstico. El proceso por el que se recupera la doble hlice, se denomina renaturalizacin. 3. ACIDO RIBONUCLEICO (ARN) El ARN est formado por la unin de ribonucletidos (contienen ribosa) de adenina, guanina, citosina y uracilo (no hay timina), mediante enlaces fosfodister en sentido 5' 3'. En algunos tipos de ARN, como el ARN transferente, adems de las 4 bases (A,C,G,U) pueden aparecer otras derivadas de stas (dihidrouracilo, metilguanina, etc), aunque son siempre minoritarias (un 10%). La cadena de ARN es ms corta que las de ADN y puede localizarse tanto en el ncleo como en el citoplasma celular. Excepto en los reovirus, el ARN est constituido por una nica cadena, aunque en el ARN transferente hay tramos bicatenarios por apareamiento de bases. La funcin del ARN es extraer la informacin del ADN y dirigir la sntesis de protenas a partir de esta informacin. 3.1 TIPOS DE ARN. - ARN mensajero (ARNm). Constituye entre el 3 y el 5% del total de ARN celular. Es una larga cadena de ribonucletidos con una estructura lineal. Su funcin es copiar la informacin gentica del ADN (transcripcin) y transportarla desde el ncleo hasta los ribosomas, para que se sinteticen las protenas. El ARNm tiene una vida muy corta, de algunos minutos, ya que rpidamente es destruido por la accin de unas enzimas llamadas ribonucleasas, pues de lo contrario el proceso de sntesis proteica continuara indefinidamente. - ARN ribosmico (ARNr). Es el tipo ms abundante, ya que constituye entre el 80 y el 85% del ARN celular total. Las molculas de ARNr son largas y monocatenarias, aunque en algunas regiones puede presentar una estructura de doble cadena por apareamiento entre bases nitrogenadas complementarias. Varias molculas de este ARN, asociadas a un conjunto de protenas bsicas, forman las dos subunidades de los ribosomas (orgnulos en los que se sintetizan las protenas). - ARN transferente (ARNt). El ARNt constituye, aproximadamente, un 10% del ARN celular total. El ARNt est formado por pocos nucletidos (entre 70 y 90). Su funcin es transportar los aminocidos presentes en el citoplasma celular hasta los ribosomas, para que all se unan y formen las protenas. Hay un ARNt especfico para cada aminocido. Las diferencias entre los distintos ARNt se deben fundamentalmente, a una secuencia de 3 bases nitrogenadas denominada anticodn.
Las molculas de ARNt tienen una estructura secundaria muy caracterstica, en la que 8
existen tramos de doble hlice (denominados brazos). En los extremos de tres de los brazos hay zonas sin emparejar que forman los denominados bucles. En el extremo 5' siempre hay guanina y un cido fosfrico libre. El extremo 3'est formado por la secuencia de bases CCA. Al nucletido terminal de adenina se une el aminocido que va a ser transportado. La estructura extendida del ARNt tiene forma de hoja de trbol, aunque en la realidad los brazos se disponen plegados, formando una L invertida, que recibe el nombre de "estructura en boomerang".
- ARN nucleolar (ARNn). Se encuentra asociado a diferentes proteinas formando el nucleolo de las clulas eucariotas. Tiene un elevado Pm y su funcin es romperse para dar lugar a los diferentes tipos de ARNr. 4. NUCLETIDOS NO NUCLEICOS Adems de los nucletidos que constituyen los cidos nucleicos existen otros que se encuentran libres en las clulas, se denominan nucletidos no nucleicos, y llevan a cabo funciones bsicas para los seres vivos. Podemos destacar: los nucletidos de adenina y los nucletidos que actan como coenzimas. 4.1 NUCLETIDOS DE ADENINA. . ADP y ATP. El ADP (adenosn difosfato) y el ATP (adenosn trifosfato) son las molculas transportadoras de energa ms importantes. En las clulas hay muchas reacciones que producen enega (exotrmicas). Si esta energa
se desprendiera libremente apenas tendra utilidad para el organismo. Resulta ms eficaz disponer de un sistema capaz de acumular la energa liberada, de manera que pueda ser utilizada posteriormente. Cuando se libera energa en una reaccin, se utiliza para formar ATP a partir de ADP y cido fosfrico. El enlace as constituido es altamente energtico, es decir, que para su formacin se requiere una cantidad considerable de energa (7 kcal/mol). Lgicamente la rotura de este enlace liberar la misma cantidad de energa. Por eso en aquellas reacciones que de la hidrlisis del ATP en ADP y cido fosfrico.
Es habitual representar los enlaces ricos en energa, que existen entre los grupos fosfatos con el smbolo ( ~ ), en lugar de la notacin usual ( ) de los enlaces.
Adems del ATP y el ADP, tambin intervienen en algunas reacciones metablicas los nucletidos de guanina GTP y GDP. . AMP cclico (AMPc). El adenosn monofosfato cclico es un nucletido de adenina, ribosa y un fosfato que se une a los carbonos 3' y 5' de la ribosa, formando una estructura cclica. El AMPc se forma en las clulas a partir del ATP intracelular, mediante una reaccin catalizada por la adenilato ciclasa que se localiza en la membrana celular. Esta enzima se activa cuando determinadas hormonas se unen a la membrana plasmtica a receptores especficos. adenilato ciclasa ATP -------------------------> AMPc + P-P El AMPc activa enzimas que actan en numerosas reacciones metablicas. Por esto, se le denomina "segundo mensajero", ya que transmite en el interior de la clula las seales que le llegan a travs de la sangre mediante las hormonas, que son los "primeros mensajeros". 7.2 NUCLETIDOS CON FUNCIN COENZIMTICA. Los coenzimas son molculas orgnicas no proteicas que intervienen en las reacciones catalizadas enzimticamente actuando, generalmente, como transportadores de electrones. Muchos de ellos son nucletidos. . Piridn-nucletidos. Son dinucletidos formados por la unin mediante enlace fosfodister del nucletido de 10
nicotinamida y el de adenina. La nicotinamida, tambin llamada vitamina B3 o niacina, es una base nitrogenada derivada de la piridina. Existen dos nucletidos de piridina: NAD: nicotinamn adenn dinucletido. NADP: nicotinamn adenn dinucleti-do fosfato. Su frmula es igual a la del NAD, pero lleva un grupo fosfato en el nucletido de adenina. Son coenzimas de las deshidrogenasas, enzimas que catalizan las reacciones de oxidacin-reduccin. En estas deshidrogena-ciones toman H+ y electrones de algunas molculas, quedando en estado reducido, como NADH o NADPH. . Flavn-nucletidos. Estn formados por una base nitrogenada, la flavina, y como pentosa, un derivado de la ribosa, el ribitol. Al unirse ambos para formar el nuclesido, constituyen un compuesto denominado riboflavina o vitamina B2. Los nucletidos de flavina son dos: - FMN: flavn-mononucletido. La riboflavina est unida a un grupo fosfato. - FAD: flavn-adenn-dinucletido, formado por una molcula de FMN unida mediante enlace fosfodister a otro de AMP (adenosn mono-fosfato). Ambos son tambin coenzimas de deshidrogenasas. Se pueden encontrar tanto en forma oxidada (FMN y FAD) como en forma reducida (FMNH2 y FADH2). Para pasar de una forma a otra captan o ceden hidrgenos, oxidando o reduciendo el sustrato.
11
. Coenzima A. El coenzima A est formado por ADP, cido pantotnico o vitamina B5, y una cadena corta de etilamina unida a un grupo tiol (-SH). Se designa abreviadamente con el trmino CoA, o bien con el de CoA-SH. Gracias a este grupo(-SH) puede unirse a los grupos acilo (R-CO-), radicales de cidos orgnicos, y transportarlos por la clula.
ACTIVIDADES 1.- Cules son las macromolculas biolgicas y sus monmeros respectivos? Nombra los enlaces que se establecen entre los monmeros para originar los polmeros correspondientes. 2.- Formula el adenosn-5'-difosfato (ADP). 3.- Cmo nombraras el siguiente compuesto? 4.- Escribe un nucletido que forme parte exclusivamente del ADN y otro del ARN. Qu diferencia hay entre ellos? 5.- Dibuja el trinucletido dAMP-dTMP-dCMP y seala todos los enlaces de tipo ster que hay. Para facilitar el dibujo simboliza las bases nitrogenadas con las letras A, T y C. Dibuja de la misma forma la hebra complementaria. Recuerda que son antiparalelas. Seala en el dibujo si hay dos o tres enlaces entre las bases nitrogenadas y de qu tipo son. 6.- Cul es la secuencia de ADN complementaria de 5'-TACCTCACT- 3'? 7.- Si una molcula de ADN posee un 30% de guanina, averigua en que proporcin se encuentran las restantes bases. 8.- En algunos organismos el ADN es monocatenario, en otros puede ser bicatenario circular. De qu organismos se trata? 9.- Qu agente fsico puede producir la separacin de las dos hebras de la doble hlice de ADN? Cmo
12
se denomina este fenmeno? Qu tipos de enlaces se ven afectados en dicho proceso? Es reversible dicho fenmeno? 10.- Qu diferencias hay entre el ADN y el ARN? En cuanto a estructura, funcin y localizacin celular. 11.- Si se compara la sntesis de protenas con la construccin de un edificio, qu tipo de ARN representara el papel de arquitecto? Y el de albail que coloca los ladrillos para levantar una pared? Qu molcula correspondera a los ladrillos?. Razona tus respuestas. 12.- La secuencia de bases de una molcula de ARNm es: AAUUUGCCA... a) Escribe la doble cadena de nucletidos del ADN de la que se copi. b) Indica cul de las dos sirvi de molde. c) Esribe los anticodones correspondientes. 13.- En forma lineal, la longitud total del ADN de una clula humana somtica sera de unos 2 metros. Cunto mide el ADN de un gameto? 14.- Tras el anlisis cuantitativo y cualitativo del genoma de tres tipos de virus, se ha obtenido el resultado que se adjunta en la tabla: VIRUS A B C A (%) 20 20 20 T (%) 20 0 28 G (%) 30 30 29 C (%) 30 25 23 U (%) 0 25 0
A la vista de estos resultados, indica como son sus genomas: ADN, ARN, de cadena doble, ... 15.- La temperatura a la cual se separan las dos hebras de ADN vara segn el ADN. Se necesitar alcanzar la misma temperatura para desnaturalizar un ADN en el que predomina la base nitrogenada guanina que otro ADN donde hay abundancia de adenina? Razona tu respuesta. 16.- Sabras explicar por qu suele denominarse al ATP "moneda energtica"? 17.- Qu semejanzas y diferencias existen entre el ADP y el NADP? 18.- Escribe la frmula de la molcula de ATP (utiliza la abreviatura A para simbolizar la base nitrogenada). La energa liberada por la hidrlisis de ciertos enlaces de esta molcula est acoplada con reacciones energticamente desfavorables. Indica qu enlaces son stos. ACTIVIDADES P.A.U. 19.- Describa de forma detallada la composicin y estructura general de los nucletidos y enumere tres de sus funciones biolgicas. (Junio 2003- Opcin A) 20.- El anlisis del cido nucleico de un virus ha dado los siguientes resultados: A 24%, G 31%, T 33% y C 12%. Qu conclusiones se pueden obtener acerca del tipo de cido nucleico del virus? Razone la respuesta. 21.- Describa la frmula general de los nucletidos que forman los cidos nucleicos y cite las diferencias bsicas de composicin qumica entre los nucletidos del ARN y del
13
ADN. (Septiembre 2004- Opcin A) 22.- Usando los smbolos adjuntos, dibuje una cadena de ADN que tenga la secuencia 5-ATCG-3 [0,5]. Dibuje tambin una molcula de ARN con la secuencia. Complementaria a la molcula de ADN anterior [0,5]. (Septiembre 2005- Opcin A)
14

Tema6 Acidnucleicos

Uploaded by

Document Information

Original Title

Copyright

Available Formats

Share this document

Share or Embed Document

Sharing Options

Did you find this document useful?

Is this content inappropriate?

Copyright:

Available Formats

Tema6 Acidnucleicos

Uploaded by

Copyright:

Available Formats

TEMA 6: CIDOS NUCLEICOS 1. Composicin de los cidos nucleicos 2. cido desoxirribonucleico (ADN) 2.1 Estructura del ADN .

- Una molcula de cido fosfrico (H3PO4):

______________________________________________________________________________________________ Biologa. cidos nucleicos

nmero de fosfatos unidos. Por ejemplo, desoxiadenosin-5'-monofosfato (dAMP).

______________________________________________________________________________________________ Biologa. cidos nucleicos

______________________________________________________________________________________________ Biologa. cidos nucleicos

______________________________________________________________________________________________ Biologa. cidos nucleicos

______________________________________________________________________________________________ Biologa. cidos nucleicos

You might also like