ambiente

Ecologa microbiana
ecologa:
ambiente

otros organismos

microorganismos

estudia las interrelaciones entre los organismos y el

Se divide en autoecologa: estudio de una especie en particular y el ambiente y sinecologa: estudia las interacciones de los organismos de un determinado lugar y el ambiente

La ecologa microbiana estudia amplio rango de organismos tanto macro como microorganismos tipos encontrados en distintas situaciones, asi como su nmero y diversidad las actividades realizadas por los organismos en el suelo y sus efectos en la fertilidad del suelo y crecimiento vegetal las interrelaciones entre organismos, con las plantas y los animales y con el ambiente

Biologa del suelo y fertilidad

Mientas la vida, obviamente no puede existir sin el agua, quiz, los componentes ms esenciales de los suelos superficiales sean los organismos que contiene A pesar de nuestras realizaciones, nuestra sofisticacin, nuestras pretensiones artsticas, debemos nuestra existencia a la capa de 15 cm del suelo superficial y al hecho de que llueva citado por Hartel (1998)

Relaciones entre la biologa y la fertilidad del suelo con el crecimiento vegetal Los organismos del suelo por su actividad: # reciclan nutrientes unidos inicialmente a la fraccin orgnica del suelo # cambian el estado de disponibilidad de elementos especficos para las plantas # compiten con las plantas y entre ellos por los nutrientes esenciales para el crecimiento # pueden realizar simbiosis con plantas,incrementan la capacidad de stas para adquirir N o P # son importantes agentes de bioremediacin # pueden actuar como agentes de biocontrol de fitopatgenos

Temas de inters en ecologa del suelo

Polucin ambiental
* Detergentes biodegradables, contaminacin canales, cauces de agua, derrames de petrleo * Polucin de nitratos en aguas subterrneas, abonos orgnicos, zonas de agotamientos de O2

Liberacin de microorganismos alterados por ingeniera gentica

* Daos por el congelamiento, bioremediacin, fijacin del nitrgeno

* * * *

Metano a partir de residuos Resistencia a los antibiticos Vida microbiana en ambientes inusuales Calentamiento global y sus consecuencias

Niveles de organizacin en ecologa microbiana

Ecosistema: rea delimitada para su estudio que se diferencia de los alrededores, con un ambiente especfico y poblaciones Comunidad: poblaciones de macro- y microorganismos que viven y interactan en un habitat especfico Grupos fisiolgicos: poblaciones de diferentes organismos en una habitat especfico que depende de las mismos recursos Poblacin: grupos de organismos vinculados taxonmicamente o por actividades Individuos: clulas bacterianas, esporas, hifas

Hbitat: es un rea que posee cierto grado de uniformidad, es un trmino ms especfico que ambiente Un hbitat rene ciertas condiciones que pueden ser favorables y desfavorables para el desarrollo de microorganismos Los microorganismos en la naturaleza
Se encuentran en todos los ambientes

Terrestres Acuticos

* Factores que afectan el crecimiento y distribucin de los miroorg. : - caractersticas de los propios microorganismos - disponibilidad de nutrientes. - factores fsicos - interacciones con otros micoorganismos - interacciones con otros organismos (plantas, animales)

Bacterias
* grupo muy importante en el suelo, en todas las condiciones ecolgicas * descomposicin de materia orgnica, reciclaje de nutrientes, transformaciones bioqumicas, agentes antagnicos a patgenos, produccin de sustancias promotoras del crecimiento vegetal, fijacin biolgica de nitrgeno

algas
* predominan en suelos con luminosidad y humedad elevada * principales microorganismos fotosintetizadores: productores de MO * algunas especies se pueden desarrollar heterotrficamente en capas profundas del suelo

Hongos Hongos
* 70-80 % de la biomasa microbiana total del suelo * predominan en suelos ricos en materia orgnica y pH cidos * actividad heterotrfica sobre los restos vegetales, relaciones simbiticas, parsitos, agentes controladores de otros hongos y de nemtodos * degradacin de la materia orgnica, predacin, diseminacin de esporas * se desarrollan en suelos con pH neutro y elevada humedad

protozoos

El suelo como habitat para los microorganismos

Caractersticas generales de la distribucin de los microorganismos en el suelo

Estn en fase acuosa
Generalmente se adhieren a superficies (procariotas) Actan en comunidades o consorcios (B y H)

El suelo se define como una capa de rocas meteorizadas con adicin de materia orgnica Contiene minerales y los nutrientes para el crecimiento microbiano Se forma por la interaccin de: Clima (temperatura y lluvias) Material mineral original Topografa (elevacin y pendiente) Tiempo

La mayora de las bacterias estn en microcolonias Existen muchos microambientes definidos por gradientes espaciales y temporales (interior de agregados, rizosfera) Sus actividades pueden ser muy importantes para organismos superiores (mineralizacin, reacciones redox) Muchos productos de su metabolismo son gases, que se pierden en la atmsfera (CH4, N2, H2, CO2, SH2, xidos de N)

Factores que afectan el nmero y la diversidad de los organismos en el suelo

Profundidad del perfil #disponibilidad de materia orgnica y niveles de O2 Labranzas

# aereacin/compactacin # distribucin de la materia orgnica # disponibilidad de agua # temperaturas del suelo en primavera
Aplicacin restos vegetales o abonos Sistema de cultivo y rotaciones Propiedades fsicas y qumicas del suelo, incluyendo disponibilidad de agua Polucin

Materia orgnica y microorganismos del suelo

Fuentes:
# # # # # mantillo de plantas compost o abonos verdes aguas residuales restos animales pesticidas

Mtodos de estudio
Densidades microbianas Recuentos de viables: grupos fisiolgicos: celulolticos, fijadores de N2, amilolticos, solubilizadores de fosfatos. Biomasa microbiana C-N-P-biomasa (kg/ha) i) Recuentos y peso de cada microorganismo ii) Mtodo de fumigacin-incubacin: diferencias en flujo de CCO2 entre muestras fumigadas y no fumigadas con cloroformo y reinoculadas con suelo fresco Actividad biolgica global Respiracin (CO2, O2), enzimas (deshidrogenasas, fosfatasas, ureasas, metabolitos finales (amonio, nitrato), iniciales Componentes celulares cidos nuclecos, perfil de cidos grasos, de protenas, hidratos de C

Variacin en:
Composicin, facilidad de degradacin, nivel de metales txicos Puede no estar disponible a los organismos Puede adsorber nutrientes pesticidas y aun arcillas

Respiracin del suelo y biomasa microbiana

Medida de la biodiversidad
Organismos del suelo pueden realizar procesos necesarios para la salud del mismo Verificar que al menos algn organismo ser tolerante a factores de estrs del suelo Para macrofauna usualmente se mide la riqueza de especies (ndice de diversidad) Para microorganismos, la identificacin es ms difcil y muchos no se cultivan Se usan anlisis de perfil c. grasos, PCR uso de (CH2O)

Perfil de cidos grasos en cromatografa de gases

Indicadores fsicos, qumicos y biolgicos de la calidad del suelo Indicadores qumicos C orgnico total
pH conductividad elctrica N, P, K extrables

Nmero aproximado y biomasa (kg/ha de suelo) de organismos en el suelo Nmero 3-500 millones/g 1-20 5.000-100.000/g 1.000-100.000/g 1.000-100.000/g 1.000-100.000/g 1010-1011 10-100 Biomasa 300-3.000 300-3.000 500-5.000 100-5.000 10-1.500 5-200 1-100 10-1000

Indicadores biolgicos
biomasa microbiana N mineralizable respiracin diversidad microbiana actividades enzimticas cidos nuclecos bacterias actinomicetes hongos levaduras algas protozoos virus (bacterifagos) nemtodos lombrices

Indicadores fsicos
textura capacidad de campo profundidad densidad

Diferencias en propiedades fsicas, qumicas y microbiolgicas entre labranza mnima y convencional en suelos en 6 localidades relacin labranza mnima/convencional
Corg.total Ntotal densidad espacio poroso con agua aerobios totales bacterias hongos anaerobios facultativos anaerobios totales (0-7,5cm) 1,41 1,29 1,04 1,28 1,35 1,41 1,35 1,31 1,27 (7,5-15,0cm) 0,99 1,01 1,05 1,11 0,66 0,68 0,55 0,96 1,05