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Taxonoma. f.

Ciencia que trata de los principios, mtodos y fines


de la clasificacin. Se aplica en particular, dentro de la biologa, para la ordenacin jerarquizada y sistemtica, con sus nombres, de los grupos de animales y de vegetales.
TAXONOMIA Taxonoma, ciencia que estudia la clasificacin de animales y plantas. Es probable que el primer estudio cientfico sobre plantas consistiera en el intento de catalogarlas. Las primeras clasificaciones del mundo vegetal eran artificiales, debido a los escasos conocimientos sobre la estructura de las plantas. La ms antigua estableca tres grupos: hierbas, arbustos y rboles. Estas categoras tan simples y arbitrarias sirvieron, no obstante, como material de partida para una clasificacin basada en las relaciones existentes entre los organismos. Las clasificaciones taxonmicas modernas an se basan en estos mismos criterios naturales, que constituyeron el mtodo ideado por el botnico sueco Carl von Linneo, en el siglo XVIII. Desde entonces, el sistema de Linneo se ha utilizado para clasificar animales y vegetales, y slo se ha modificado para incluir los nuevos conocimientos sobre morfologa, evolucin y gentica. Los mtodos genticos de clasificacin cobran especial importancia en el caso de la taxonoma bacteriana. Adems de clasificar a las bacterias en funcin de sus caractersticas morfolgicas, fisiologa, metabolismo, poder patgeno y necesidades nutricionales, se aplican mtodos de taxonoma fenotpica (estudia caractersticas fisiolgicas que surgen en condiciones ambientales estandarizadas) y de taxonoma genotpica (comparacin de la homologa entre el ADN de distintas bacterias por mtodos de hibridacin cromosmica).

Biologa molecular
1 INTRODUCCIN Biologa molecular, ciencia que se ocupa del estudio de la bases moleculares de la vida; es decir, relaciona las estructuras de las biomolculas con las funciones especficas que desempean en la clula y en el organismo. 2 LA ESTRUCTURA DEL ADN La presentacin del modelo estructural del cido desoxirribonucleico (ADN) por Francis Harry Compton Crick y James Dewey Watson en 1953, fue el verdadero inicio de la biologa molecular. La importancia de este hecho se

debe, por un lado a que es la molcula que transmite la informacin hereditaria de generacin en generacin (vase Gentica), y por otro a que la propia estructura muestra cmo lo logra. El ADN es una molcula de doble hlice, compuesta por dos hebras complementarias unidas entre s por enlaces entre las bases: adenina (A), guanina (G), citosina (C) y timina (T). La A de una hebra se aparea siempre con la T de la hebra complementaria, y del mismo modo, la G con la C. Durante la replicacin o duplicacin, las dos hebras simples se separan y cada una de ellas forma una nueva hebra complementaria, incorporando bases, la A se unir a la T de la hebra molde, la G lo har con la C y as sucesivamente. De esta manera se obtiene otra molcula de ADN, idntica a la original y por tanto, el material gentico se ha duplicado. Este material incluye toda la informacin necesaria para el control de las funciones vitales de las clulas y del organismo. Durante la divisin celular, las dos clulas hijas reciben igual dotacin gentica; de este mismo modo se reparte el material hereditario a la descendencia, cuando se reproduce un organismo. A partir del ADN se produce ARN y a partir del ARN se producen 2.1 protenas La copia precisa de la informacin gentica contenida en el ADN nos lleva a la cuestin de cmo esta informacin modela las actividades de la clula. El siguiente paso necesario para la comprensin de este proceso fue el conocimiento de la transcripcin, mecanismo mediante el cual, el ADN forma la molcula de cido ribonucleico (ARN) correspondiente, formada por una sola cadena. Tal como ocurre en la replicacin del ADN, la informacin gentica se transcribe de forma fiel mediante la adicin de bases complementarias. Despus, el ARN mensajero (ARNm) se traslada a los orgnulos celulares llamados ribosomas, donde se lleva a cabo la traduccin de protenas. El cdigo gentico gobierna la traduccin, que se basa en la correspondencia que existe entre 3 bases o triplete de la secuencia del ARN y un aminocido especfico de la secuencia proteica. El triplete ACC provoca la adicin de treonina en la secuencia proteica que se est formando, CCC la de prolina y as sucesivamente. Por lo tanto la informacin contenida en la secuencia lineal de bases del ADN codifica la sntesis de una secuencia lineal de aminocidos de una protena. De tal manera, que un cambio en las bases del ADN conlleva un cambio en la protena correspondiente. Por ejemplo, un cambio de la base A por C en el triplete ACC producira la adicin de prolina en lugar de treonina. Las protenas son muy especficas, es decir, tienen funciones biolgicas muy concretas, con lo cual un cambio que afecte a la funcin que realizan, provocara una

alteracin estructural o fisiolgica en el organismo. Estas diferencias en la informacin gentica del ADN, son las responsables de las diferencias heredadas entre individuos, tales como el color de ojos o las enfermedades genticas como la hemofilia. A partir del ADN se sintetiza ARN y a partir del ARN se sintetizan protenas, ste es el llamado dogma central de la biologa molecular. 2.2 Clonacin gnica e hibridacin Aunque el gran avance de la biologa molecular fue durante la dcada de 1950, la verdadera expansin de esta ciencia comenz en la dcada de 1960 con el descubrimiento de la clonacin de genes. Esta tcnica permiti aislar fragmentos libres de ADN puro a partir del genoma. As, fue posible secuenciar fragmentos de ADN, en los cuales estaban incluidos los genes. Todo esto se complet con la puesta en marcha de la tcnica de la hibridacin, que consiste en el marcaje con istopos radiactivos de una molcula clnica de ADN, de la cual se conserva slo una hebra (ADN desnaturalizado o monocatenario). Despus de este tratamiento, el fragmento sonda se emplea para detectar secuencias complementarias en presencia de ADN o ARN. Ed Southern, puso en marcha un procedimiento que se llama absorcin de Southern y que se describe a continuacin. Un ADN genmico que contiene un gen X, se corta en fragmentos que se separan segn su tamao, y se transfieren a un filtro. Al filtro con los fragmentos de ADN, se le aplica ARN o ADN marcado radiactivamente, de secuencia complementaria a la del gen X (fragmento sonda), que delatar al gen X al unirse a l. El mtodo de absorcin de Nothern es similar al anterior, el ADN que contiene el gen X, se une al ARN sonda de distintos tejidos, permitiendo as detectar el gen y cuantificarlo en los distintos tejidos. Estas tcnicas han hecho posible recopilar una gran cantidad de informacin sobre la estructura y la expresin gnica. 2.3 Genes interrumpidos El empleo del mtodo de absorcin de Southern para el estudio de la estructura gnica condujo a un importante hallazgo en el campo de la biologa molecular. ste consiste en el descubrimiento de la existencia, en los organismos eucariotas (plantas y animales), de regiones del ADN llamadas exones (que se expresan), que contienen informacin para la codificacin de protenas y estn interrumpidas por otras secuencias del ADN, llamadas intrones (que no se expresan). Estos intrones se transcriben junto a los exones a molculas de ARN y son eliminados durante el proceso

de maduracin del ARN. Este proceso ocurre en el interior del ncleo celular y el resultado es una molcula de ARNm sin interrupciones, es decir, slo con los exones. Este ARNm maduro se traslada al citoplasma celular y se une a los ribosomas, donde tiene lugar la traduccin o sntesis de protenas. El significado de los intrones no est claro, pero permiten diferentes combinaciones de los exones presentes en el ARN inmaduro, que se procesar de distinta manera segn los tipos de clulas. Este sistema de maduracin alternativa produce protenas relacionadas pero diferentes a partir del mismo gen. 2.4 Control de la transcripcin La tcnica de absorcin de Nothern se puede emplear para detectar la presencia de molculas de ARNm, procedentes de genes determinados, en extractos de tejido intacto. Estos estudios se complementan con la hibridacin in situ, que detecta el ARNm en clulas individuales, y de esta forma se conoce su distribucin en el tejido. La conclusin es que, en la mayora de los casos, el ARNm codificador de una protena especfica, est presente slo en los tejidos y en las clulas donde se expresa la protena. De forma similar, los precursores inmaduros de molculas de ARN que contengan an intrones, no son detectados en los tejidos si no estn presentes el ARNm o las protenas. En consecuencia, en la mayora de los casos, la produccin de protenas diferentes en los distintos tejidos est regulada por los genes que se han transcrito en cada tejido, lo cual determina a su vez la eliminacin de intrones y la traduccin de protenas. Esto se demuestra midiendo la proporcin de transcripcin de un gen especfico en diferentes tejidos, donde la protena puede estar presente o ausente. La sntesis de protenas distintas en los tejidos es vital para la comprensin de las diferencias funcionales de los mismos y est controlada por la transcripcin. Adems, la transcripcin est regulada por factores de transcripcin, los cuales se unen a secuencias especficas del ADN (las regiones reguladoras) y activan este proceso. Puede ser que cada tejido tenga los factores especficos que activan la transcripcin de genes concretos, pero tambin es posible que estn presentes, de forma inactiva, en todas las clulas. En ese caso se activaran por seales especficas, como una modificacin posterior a su sntesis, por ejemplo por adicin de residuos

fosfato (fosforilacin). Esto activar la transcripcin de los genes que respondan a la seal. 2.5 Secuenciacin del ADN Al igual que se estudia la expresin y la estructura de los genes se puede conocer, mediante el sistema de secuenciacin de ADN, su orden lineal de bases. El mtodo ms utilizado fue ideado por Frederick Sanger en 1977. Gracias a esta tcnica se puede conocer, utilizando el cdigo gentico, la secuencia lineal de las cuatro bases, AGCT y por consiguiente, la secuencia de aminocidos de la protena correspondiente. Esta metodologa ha permitido al Proyecto Genoma Humano obtener el orden o secuencia de las bases nitrogenadas en el ADN humano. Es ms sencillo secuenciar el ADN que hacerlo en la protena correspondiente, por lo tanto en la actualidad, la secuencia de aminocidos se determina de forma indirecta a partir del gen correspondiente. La utilidad de este mtodo se pone de manifiesto con el estudio de enfermedades genticas. Se secuencia un gen involucrado en una enfermedad, en individuos sanos y en individuos enfermos y al comparar ambas secuencias se descubre la alteracin de la protena que provoca la enfermedad. La variacin de tan slo una base puede provocar la sustitucin de un aminocido por otro, e incluso puede daar un segmento del ADN, alterando as la porcin correspondiente de protena. Los cientficos han conseguido secuenciar el genoma de varios organismos, como la bacteria Escherichia coli, la levadura Saccharomyces cerevisiae, y el nematodo Caenorhabditis elegans. En el ao 2000 se descifr la secuencia del genoma de la mosca del vinagre (Drosophila melanogaster) y el de la bacteria Vibrio cholerae, responsable del clera. En diciembre de ese mismo ao se dio a conocer la secuencia completa del genoma de la planta Arabidopsis thaliana. En mayo de 2002, cientficos del Consorcio para la Secuenciacin del Genoma del ratn completaron el mapa gentico de ese animal. Ese mismo ao, se secuenciaron tambin el genoma del arroz, concretamente de dos variedades de este cereal, as como del protozoo Plasmodium falciparum y del mosquito Anopheles gambiae, causantes de la mayora de los casos de malaria. Pero, sin lugar a dudas, el acontecimiento ms importante dentro de estos estudios de secuenciacin, fue el desciframiento completo del genoma humano, en abril de 2003, dos aos antes de lo que inicialmente se haba previsto. 3 ESTRUCTURA Y FUNCIN DE LAS PROTENAS

La funcin biolgica de una protena est determinada por la secuencia de aminocidos que la componen y por la configuracin espacial (estructura plegada en el espacio). En la dcada de 1960, John Kendrew, propuso el modelo de estructura espacial de la mioglobina, a partir de la protena purificada y mediante cristalografa de rayos X. A continuacin, Max Peratz lo hizo con una molcula ms compleja, la hemoglobina. La hemoglobina est compuesta por cuatro subunidades tipo mioglobina. Para conocer el orden de aminocidos de una protena se secuencia ADN, sin embargo, el anlisis estructural de la misma se realiza sintetizando protena a partir de un gen clnico (gen idntico, que se inserta por ejemplo, en el genoma de una bacteria). De este modo se obtiene protena en gran cantidad. Adems se pueden introducir cambios especficos en el ADN genmico, mediante una mutacin localizada, para que la bacteria sintetice una protena alterada. Los estudios de protenas alteradas, han logrado demostrar la relacin de la secuencia de aminocidos con la estructura y funcin de la protena resultante. 4 DE LA INVESTIGACIN A LA APLICACIN TERAPUTICA La produccin de grandes cantidades de protena se realiza mediante la expresin del ADN correspondiente en grandes cantidades. Este mtodo se utiliza con fines teraputicos, en individuos que sufren alguna enfermedad causada por la ausencia de protenas especficas. La labor de purificacin de tales protenas se realiza a partir de animales o de cadveres humanos. ste ha sido el planteamiento empleado para producir insulina en el tratamiento de la diabetes y de hormona del crecimiento en el enanismo. En la actualidad, los intentos han estado encaminados a prescindir de la fase de produccin de protenas y a tratar a los individuos con enfermedades genticas aportando los genes funcionales, de modo que la protena necesaria la sintetice el individuo afectado. La terapia gnica aplicada desde la infancia ofrece a los afectados la esperanza de un futuro mejor. 5 PERSPECTIVAS DE FUTURO La biologa molecular ha avanzado mucho en los cuarenta aos siguientes al descubrimiento de la estructura del ADN. Estos progresos ofrecen la posibilidad real de conseguir un tratamiento eficaz de las enfermedades humanas. Para ello es necesaria la comprensin de fenmenos tan complejos como el desarrollo embrionario o el funcionamiento del organismo adulto. Aunque quedan muchos retos por superar, la biologa molecular ha alcanzado

una gran importancia en nuestros das, tanto es as, que hace 20 aos no hubiera merecido un artculo en una enciclopedia general.

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