La clasificacin de virus Las clasificaciones intentan describir la diversidad de virus dndoles nombre y agrupndolos segn sus semejanzas.

En 1962, Andr Lwoff, Robert Horne y Paul Tournier fueron los primeros en desarrollar una forma de clasificacin de los virus, basada en el sistema jerrquico linneano.[113] Este sistema basa la clasificacin en filos, clases, rdenes, familias, gneros y especies. Los virus fueron agrupados segn sus propiedades compartidas (no las de sus huspedes) y el tipo de cido nucleico del que se compone su genoma.[114] Posteriormente se form Comit Internacional de Taxonoma de Virus. [editar] Clasificacin del ICTV El Comit Internacional de Taxonoma de Virus (ICTV) desarroll el sistema de clasificacin actual y escribi pautas que daban ms importancia a ciertas propiedades de los virus para mantener la uniformidad familiar. Un sistema universal para clasificar los virus y una taxonoma unificada han sido establecidos desde 1966. El 7 Informe del ICTV formaliz por primera vez el concepto de especie vrica como el taxn ms bajo de una jerarqua ramificada de taxones de virus.[n. 4] [115] Sin embargo, actualmente slo se ha estudiado una pequea parte de toda la diversidad de los virus, y anlisis de muestras obtenidas de humanos revelan que aproximadamente un 20% de secuencias vricas recuperadas no han sido observadas anteriormente. Muestras del ambiente, como sedimentos marinos y ocenicos, revelan que la gran mayora de secuencias son completamente nuevas.[116] La estructura general de la taxonoma es la siguiente: Order (-virales) Familia (-viridae) Subfamilia (-virinae) Gnero (-virus) Especie (-virus)

La taxonoma actual del ICTV (2008) reconoce cinco rdenes: los caudovirales, los herpesvirales, los mononegavirales, los nidovirales y los picornavirales. El comit no distingue formalmente entre subespecies, cepas y aislamientos. En total, hay cinco rdenes, 82 familias, 11 subfamilias, 307 gneros, 2.083 especies y unos 3.000 tipos que an no han sido clasificados.[117] [118] [editar] Clasificacin Baltimore

Esquema de la clasificacin Baltimore de los virus. El bilogo ganador del Premio Nobel David Baltimore dise el sistema de clasificacin de Baltimore.[37] [119] El sistema de clasificacin del ICTV es utilizado en combinacin con el sistema de clasificacin de Baltimore en la clasificacin moderna de los virus.[120] [121] [122] La clasificacin de Baltimore de los virus se basa en el mecanismo de produccin de ARNm. Los virus deben generar ARNm de su genoma para producir protenas y replicarse, pero cada familia de virus utiliza mecanismos diferentes. El genoma de los virus puede ser monocatenario (ss) o bicatenario (ds), de ARN o ADN, y pueden utilizar o no la transcriptasa inversa. Adems, los virus ARN monocatenarios pueden ser o positivos (+) o negativos (-). Esta clasificacin reparte los virus en siete grupos: * I: Virus dsDNA (ej., adenovirus, herpesvirus, poxvirus) * II: Virus ssDNA (ej., parvovirus) * III: Virus dsARN (ej., reovirus) *IV: Virus (+)ssRNA (ej., picornavirus, togavirus) * V: Virus (-)ssRNA (ej., Ortomixovirus, rabdovirus) * VI: Virus ssRNA-RT (ej., retrovirus) * VII: Virus dsDNA-RT (ej., herpesviridae) Como ejemplo de la clasificacin vrica, el virus de la varicela, varicela zoster (VZV), pertenece al orden de los herpesvirales, la familia de los Herpesviridae, la

subfamilia de los Alphaherpesvirinae y el gnero Varicellovirus. El VZV se encuentra en el grupo I de la clasificacin de Baltimore porque es un virus ADN bicatenario que no utiliza la transcriptasa inversa. Diversidad: variedad de organismos vivos

rbol filogentico de los seres vivos basado en datos sobre su rARN. Los tres reinos principales de seres vivos aparecen claramente diferenciados: bacterias, archaea y eucariotas tal y como fueron descritas inicialmente por Carl Woese. Otros rboles basados en datos genticos de otro tipo resultan similares pero pueden agrupar algunos organismos en ramas ligeramente diferentes, presumiblemente debido a la rpida evolucin del rARN. La relacin exacta entre los tres grupos principales de organismos permanece todava como un importante tema de debate. A pesar de la unidad subyacente, la vida exhibe una asombrosa diversidad en morfologa, comportamiento y ciclos vitales. Para afrontar esta diversidad, los bilogos intentan clasificar todas las formas de vida. Esta clasificacin cientfica refleja los rboles evolutivos (rboles filogenticos) de los diferentes organismos. Dichas clasificaciones son competencia de las disciplinas de la sistemtica y la taxonoma. La taxonoma sita a los organismos en grupos llamados taxa, mientras que la sistemtica trata de encontrar sus relaciones. Tradicionalmente, los seres vivos se han venido clasificando en seis reinos: * Eubacteria * Archaea * Protista * Fungi * Plantae * Animalia Sin embargo, actualmente este sistema de seis reinos se cree desfasado. Entre

las ideas ms modernas, generalmente se acepta el sistema de tres dominios: * Archaea (originalmente Archaebacteria) * Bacteria (originalmente Eubacteria) * Eucariota Estos mbitos reflejan si las clulas poseen ncleo o no, as como las diferencias en el exterior de las clulas. Hay tambin una serie de "parsitos" intracelulares que, en trminos de actividad metablica son cada vez "menos vivos": * Virus * Viroides * Priones El reciente descubrimiento de una nueva clase de virus, denominado mimivirus, ha causado que se proponga la existencia de un cuarto dominio debido a sus caractersticas particulares, en el que por ahora slo estara incluido ese organismo. AUDESIRK, Teresa y AUDESIRK, Gerald. BIOLOGA La vida en la Tierra. Ed.Prentice Hall Hispanoamericana, S.A. Mxico . 1996 CURTIS, Helena y BARNES, Sue. BIOLOGA Ed.Mdica Panamericana. Madrid. Espaa. 2000 HICKMAN, Cleveland Jr. ZOOLOGA Principios Integrales Ed. Interamericana Mc Graw Hill. Mxico 1994. MARGULIS, Lynn, SCHWARTZ, Karlene Cinco Reinos. Ed. Labor S.A. Espaa 1982

Taxonoma Es la parte de la Sistemtica que proporciona los principios (reglas) y procedimientos para realizar una clasificacin, ya que siguiendo diferentes principios podemos obtener diferentes clasificaciones. El trmino taxonoma fue acuado por DE CANDOLLE en 1813, en el herbario de Gnova (taxonomie), para referirse a la teora de la clasificacin de las plantas. Inicialmente los sistemas de clasificacin se basaban en criterios de utilidad para el hombre. Siglo XVII: Carl von Linneo (1707-1778) inicia la taxonoma moderna. Basada en criterios cientficos. Tras la aparicin de la teora de la evolucin (s. XIX), se elaboraron clasificaciones que reflejaban las relaciones reales de parentesco entre organismos procedentes de antecesores comunes. Su desarrollo constituye la sistemtica o taxonoma evolutiva. La nomenclatura cientfica aplica nombres a los distintos organismos aplicando unas normas perfectamente establecidas
CLASIFICACIN DE LOS VIRUS El sistema internacional acordado para la clasificacin de los virus est basado en la estructura/composicin de la partcula viral (virin) y en caractersticas relacionadas con el cido. a) Caractersticas primarias usadas en la clasificacin. Los virus se clasifican de acuerdo a la naturaleza de su genoma y su estructura. Estructura del virin Morfologa (icosadrica, helicoide, compleja) Envoltura o no Nmero de capsmeros cido nucleico ARN o ADN Cadena sencilla o cadena doble

Segmentados o no-segmentados linear o circular Si el genoma es de ARN de cadena sencilla, puede funcionar como ARNm? Si el genoma es diploide (se encuentra en retrovirus)

b) Caractersticas secundarias. Algunas veces, en un grupo de virus que aparenta ser un grupo nico segn los criterios antes mencionados, se encuentran subgrupos de virus que fundamentalmente se diferencian en su estrategia de replicacin. Polimerasa de virin

Morfologa
ADN PARVOVIRIDAE HEPADNAVIRIDAE PAPILLOMAVIRIDAE * POLYOMA-VIRIDAE * ADENOVIRIDAE HERPESVIRIDAE ICOSADRICA ICOSADRICA

Envoltura

Tamao

20nm 42nm +

ICOSADRICA

40-60nm

ICOSADRICA ICOSADRICA ICOSADRICA

40-60nm 80nm 190nm 200nm x 350nm

POXVIRIDAE

COMPLEJA

ARN DE SENTIDO POSITIVO

PICORNAVIRIDAE CALICIVIRIDAE TOGAVIRIDAE FLAVIVIRIDAE

ICOSADRICA ICOSADRICA ICOSADRICA ICOSADRICA

+ +

30nm 35nm 60-70nm 40-55nm 75160nm 100nm

CORONAVIRIDAE

HELICOIDE

RETROVIRIDAE ARN DE SENTIDO NEGATIVO

ICOSADRICA

RHABDOVIRIDAE

HELICOIDE

60 x 180nm 150300nm 0-120nm 95nm 50300nm 80nm x 800900nm

PARAMYXOVIRIDAE

HELICOIDE

ORTHOMYXOVIRIDAE BUNYAVIRIDAE

HELICOIDE HELICOIDE

+ +

+ +

ARENAVIRIDAE

HELICOIDE

FILOVIRIDAE

HELICOIDE

ARN DE CADENA DOBLE REOVIRIDAE ICOSADRICA 75nm +

c) Clasificacin taxonmica del Comit Internacional de Taxonoma de Virus (ICTV).

Las clasificaciones intentan describir la diversidad de virus, dndoles nombre y agrupndolos segn sus semejanzas. Rasgos como la morfologa (tamao, forma, cpsida o no), propiedades fsico-qumicas (masa molecular, densidad flotante, pH, trmicas, estabilidad inica), genoma (RNA, DNA, secuencia segmentada, mapa de restriccin, modificaciones etc), macromolculas (composicin y funcin de la protena), propiedades antignicas, biolgicas propiedades (hospedador, tropismo de transmisin etc) son todos considerados.Esta clasificacin hace posibles predicciones sobre detalles de la replicacin, patognesis y transmisin. El ICTV desarroll el sistema de clasificacin en 1966. La estructura general de la taxonoma es la siguiente: orden familia subfamilia gnero especie cepa/tipo

La taxonoma actual del ICTV (2008) reconoce cinco rdenes: los caudovirales, los herpesvirales, los mononegavirales, los nidovirales y los picornavirales. El comit no distingue formalmente entre subespecies, cepas y aislamientos. En total, hay cinco rdenes, 82 familias, 11 subfamilias, 307 gneros, 2.083 especies y unos 3.000 tipos que an no han sido clasificados. Por el momento la clasificacin solo es importante por debajo del nivel de las familias. Todas las familias tienen el sufijo viridae e.g.

Poxviridae Herpesviridae Parvoviridae Retroviridae

Los miembros de la familia Picornaviridae se trasmiten generalmente va fecal/oral por medio del aire. El gnero tiene el sufijo virus . Por ejemplo en el Picornaviridaehay 5 gneros:

Especie Especie Especie Especie Especie

Enterovirus e.g. poliovirus 1, 2, 3 Cardiovirus e.g. mengovirus Rhinovirus e.g. Rhinovirus 1a Apthovirus e.g. FMDV-C Hepatovirus s e.g. virus Hepatitits A

La definicin de especie es difcil de hacer porque hay un elemento de subjetividad en ello. Considerando el gnero Lentivirus , es conocido por contener muchas especies distintas incluyendo las siguientes:

HIV-1, Human Immunodeficiency Virus 1 HIV-2, Human Immunodeficiency Virus 2 SIV, Simian Immunodeficiency Virus FIV, Feline Immunodeficiency Virus BIV, Bovine Immunodeficiency Virus Visna (oveja) EIAV (caballos) CAEV (cabras)

d) Clasificacin Baltimore El bilogo ganador del Premio Nobel David Baltimore dise el sistema de clasificacin de Baltimore. El sistema de clasificacin del ICTV es utilizado en combinacin con el sistema de clasificacin de Baltimore en la clasificacin moderna de los virus. La clasificacin de Baltimore de los virus se basa en el mecanismo de produccin de ARNm. Los virus deben generar ARNm de su genoma para producir protenas y replicarse, pero cada familia de virus utiliza mecanismos diferentes. El genoma de los virus puede ser monocatenario (ss) o bicatenario (ds), de ARN o ADN, y pueden utilizar o no la transcriptasa inversa. Adems, los virus ARN monocatenarios pueden ser o positivos (+) o negativos (-). Esta clasificacin reparte los virus en siete grupos: I: Double-stranded (bicatenario) ADN (Adenoviruses; Herpesviruses; Poxviruses, etc) II: Single-stranded (monocatenario) (+)sentido ADN (Parvoviruses) III: Double-stranded ARN (bicatenario) (Reoviruses; Birnaviruses) IV: Single-stranded (bicatenario) (+)sense ARN (Picornaviruses; Togaviruses, etc) V: Single-stranded(monocatenario) (-)sentido ARN (Orthomyxoviruses, Rhabdoviruses, etc) VI: Single-stranded(monocatenario) (+)sentido ARN with ADN intermediate in life-cycle (Retroviruses) VII: Double-stranded (bicatenario) ADN con ARN intermedio (Hepadnaviruses)

Clasificacin de ICTV
El Comit Internacional de la Taxonoma de Virus comenz a idear y poner en prctica reglas para el nombramiento y la clasificacin de virus a principios de los aos 1970, un esfuerzo que sigue para el da de hoy. El ICTV es el nico cuerpo cobrado por la Unin internacional de Sociedades Microbiolgicas (IUMS) con la tarea de desarrollo, refinado y mantenimiento de una taxonoma del virus universal. El sistema comparte muchos rasgos con el sistema de clasificacin de organismos celulares, como la estructurade taxon. Sin embargo, este sistema de la nomenclatura se diferencia de otros cdigos taxonmicos de varios puntos. Un punto menor es que los ttulos de pedidos y familias se ponen en bastardilla, a diferencia de en el Cdigo Internacional de la Nomenclatura para algas, hongos, y plantas y Cdigo Internacional de la Nomenclatura Zoolgica. La clasificacin viral comienza al nivel de pedido y sigue como as, con los sufijos taxon dados en la cursiva: :Order (-virales)

:: Familia (-viridae) ::: Subfamilia (-virinae) :::: Gnero (-virus) ::::: Especies Los nombres de especies generalmente toman la forma de [Enfermedad] virus. El establecimiento de un pedido est basado en la inferencia que las familias del virus contenidas dentro de un pedido solo han evolucionado con la mayor probabilidad de un ancestro comn. La mayora de familias del virus permanece no colocada. Actualmente (2011) 6 pedidos, 87 familias, 19 subfamilias, 349 gneros y 2,284 especies del virus se han definido. Seis pedidos han sido establecidos hasta ahora por el ICTV: Caudovirales, Herpesvirales, Mononegavirales, Nidovirales, Picornavirales y Tymovirales. Estos pedidos atraviesan virus con grupos del anfitrin variados. Caudovirales se siguen dsDNA (grupo I) bacteriophages. Herpesvirales contiene virus dsDNA eucariticos grandes. Mononegavirales incluye no segmentado (-) varan ssRNA (Grupo V) virus vegetales y animales. Nidovirales se forma de (+) varan ssRNA (Grupo IV) virus con anfitriones vertebrados. Picornavirales contiene pequeo (+) varan virus ssRNA que infectan una variedad de planta, insecto y multitudes de animales. Tymovirales contiene monopartite (+) ssRNA virus que infectan plantas. Otras variaciones ocurren entre los pedidos: Nidovirales, por ejemplo, se aslan para su diferenciacin en la expresin de protenas estructurales y no estructurales por separado.

Clasificacin de Baltimore
La clasificacin de Baltimore (primero definido en 1971) es un sistema de clasificacin que coloca virus en uno de siete grupos segn una combinacin de su cido nucleico (ADN o ARN), strandedness (de un solo hilo o dos veces varado), Sentido y mtodo de la rplica. Nombrado por David Baltimore, un bilogo

Premiado Nobel, estos grupos son nombrados por nmeros romanos y discriminan virus segn su modo de la rplica y tipo del genoma. Otras clasificaciones son determinadas por la enfermedad causada por el virus o su morfologa, ninguno de los cuales son satisfactorios debido a virus diferentes causar la misma enfermedad o mirar muy similar. Adems, las estructuras virales a menudo son difciles de determinar bajo el microscopio. La clasificacin de virus segn su genoma significa que aquellos en una categora dada se comportarn todos de una moda similar, ofreciendo alguna indicacin de cmo seguir con nuevas investigaciones. Los virus se pueden colocar en uno de los siete despus de grupos:

Virus del ADN

Grupo I: los virus poseen el ADN dos veces varado. Grupo II: los virus poseen el ADN de un solo hilo.

Virus del ARN

Grupo III: los virus poseen genomas del ARN dos veces varados, p.ej rotavirus. Estos genomas siempre se segmentan. Grupo IV: los virus poseen el sentido positivo genomas del ARN de un solo hilo. Muchos virus conocidos se encuentran en este grupo, incluso el picornaviruses (que es una familia de virus que incluye virus famosos como la Hepatitis Un virus, enteroviruses, rhinoviruses, poliovirus, y virus de la fiebre aftosa), el virus de SARS, el virus de la hepatitis C, el virus de la fiebre amarillo y el virus del sarampin. Grupo V: los virus poseen el sentido negativo genomas del ARN de un solo hilo. Los virus de Marburg yEbola mortales son miembros conocidos de este grupo, junto con virus de la gripe, sarampin, paperas yrabia.

Virus de transcripcin inversos

Grupo VI: los virus poseen genomas del ARN de un solo hilo y se reproducen utilizacin invierten transcriptase. Los retroviruses se incluyen en este grupo, del cual el VIH es un miembro. Grupo VII: los virus poseen genomas del ADN dos veces varados y se reproducen utilizacin invierten transcriptase. El virus de la hepatitis B se puede encontrar en este grupo.

Clasificacin de Holmes

Holmes (1948) el sistema de Carolus Linnaeus usado de nomenclatura de dos trminos para clasificar virus en 3 grupos segn una orden, Virales. Se colocan as: Grupo I: Phaginae (ataca bacterias) Grupo II: Phytophaginae (ataca plantas) Grupo III: Zoophaginae (ataca animales)

Sistema de LHT de clasificacin del virus

El Sistema LHT de la Clasificacin del Virus est basado en caracteres qumicos y fsicos como el cido nucleico (ADN o ARN), Simetra (Helical o Icosahedral o Complejo), la presencia del sobre, dimetro de capsid, nmero de capsomers. Esta clasificacin fue aprobada por el Comit Provisional de la Nomenclatura del Virus (PNVC) de la Asociacin Internacional de Sociedades Microbiolgicas (1962). Es as:

Phylum Vira (dividido en 2 subphyla)

:*Subphylum Deoxyvira (virus del ADN) ::*Class Deoxybinala (simetra dual) :::*Order Urovirales :::::*Family Phagoviridae ::*Class Deoxyhelica (Simetra helicoidal) :::*Order Chitovirales :::::*Family Poxviridae ::*Class Deoxycubica (simetra cbica) :::*Order Peplovirales :::::*Family Herpesviridae (162 capsomeres) :::*Order Haplovirales (ningn sobre) :::::*Family Iridoviridae (812 capsomeres) :::::*Family Adenoviridae (252 capsomeres) :::::*Family Papiloviridae (72 capsomeres)

:::::*Family Paroviridae (32 capsomeres) :::::*Family Microviridae (12 capsomeres) :*Subphylum Ribovira (virus del ARN) ::*Class Ribocubica :::*Order Togovirales :::::*Family Arboviridae :::*Order Lymovirales :::::*Family Napoviridae :::::*Family Reoviridae ::*Class Ribohelica :::*Order Sagovirales :::::*Family Stomataviridae :::::*Family Paramyxoviridae :::::*Family Myxoviridae :::*Order Rhabdovirales ::::*Suborder Flexiviridales :::::*Family Mesoviridae :::::*Family Peptoviridae ::::*Suborder Rigidovirales :::::*Family Pachyviridae :::::*Family Protoviridae :::::*Family Polichoviridae

Agentes subvirales

Los agentes siguientes son ms pequeos que virus, pero tienen algunas de sus propiedades.

Viroids

Familia Avsunviroidae Gnero Avsunviroid; escriba a mquina especies: Aguacate sunblotch viroid Gnero Pelamoviroid; escriba a mquina especies: Melocotn mosaico latente viroid Gnero Elaviroid; escriba a mquina especies: Berenjena viroid latente' Familia Pospiviroidae Gnero Pospiviroid; escriba a mquina especies: tubrculo del huso de patatas viroid Gnero Hostuviroid; escriba a mquina especies: truco de salto viroid Gnero Cocadviroid; escriba a mquina especies: Coco cadang-cadang viroid Gnero Apscaviroid; escriba a mquina especies: piel de la cicatriz de Apple viroid Gnero Coleviroid; escriba a mquina especies: Coleus blumei viroid 1

Satlites
Los satlites dependen de la co-infeccin de una clula del anfitrin con un virus del ayudante para la multiplicacin productiva. Sus cidos nucleicos tienen secuencias nucleotide considerablemente distintas de su virus del ayudante o de anfitrin. Cuando un agente subviral de satlite codifica la protena del abrigo en la cual se encapsula, se llama entonces un virus de satlite.

Virus de satlite Virus del satlite del ARN de un solo hilo Subgrupo 1: virus del satlite de la parlisis de la abeja crnico Subgrupo 2: virus del satlite de la necrosis de tabaco cidos nucleicos de satlite ADNs de satlite de un solo hilo Satlite dos veces varado RNAs Satlite de un solo hilo RNAs Subgrupo 1: satlite grande RNAs Subgrupo 2: pequeo satlite lineal RNAs Subgrupo 3: satlite circular RNAs (virusoids)

Prions

Prions, llamado para su descripcin como "partculas proteicas e infecciosas", carecen cualquiera detectable (desde 2002) cidos nucleicos o partculas parecidas a un virus. Resisten a procedimientos inactivation que normalmente afectan cidos nucleicos. Prions mamfero: Agentes de encefalopatas en forma de una esponja Prions fungoso: PSI + prion de Saccharomyces cerevisiae URE3 prion de Saccharomyces cerevisiae RNQ/PIN + prion de Saccharomyces cerevisiae

Het-s prion de Podospora anserina