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Serie Didctica N 36 Gua terico prctica de Qumica Biolgica

Dra. Evangelina Gonzlez. Ing. Adriana Corzo-Facultad de Ciencias Forestales-UNSE



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Presentacin

El presente material esta dirigido a los estudiantes de la Facultad de
Ciencias Forestales de la Universidad Nacional de Santiago del Estero y
corresponde a la programacin de las asignaturas que se dictan en la
ctedra de Qumica Orgnica y Biolgica.
La organizacin implica guas de problemas y ejercicios relacionados con
los conceptos bsicos de Qumica Biolgica. En cada tema se incluyen
los conceptos tericos bsicos los cuales simplemente resumen los
conceptos previamente desarrollados en las clases tericas. Al igual que
la correspondiente serie de problemas relacionados con la Qumica
Orgnica, los problemas y ejercicios estn seleccionados con la intencin
de facilitar la comprensin y asimilacin de los diferentes temas,
abarcando desde las biomolculas hasta llegar a su participacin en el
metabolismo celular. En cada tema se incluyen como datos anexos las
correspondientes estructuras como as tambin algunos parmetros
relacionados con las propiedades de cada biomolculas.
Finalmente, solo cabe expresar el deseo de que este material sea til y
cumpla con los objetivos propuestos como as tambin dejar una puerta
abierta a sugerencias y/o correcciones que desde ya sern agradecidas.

La ctedra
Serie Didctica N 36 Gua terico prctica de Qumica Biolgica
Dra. Evangelina Gonzlez. Ing. Adriana Corzo-Facultad de Ciencias Forestales-UNSE

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Tabla de contenidos

Presentacin ..................................................................................................... 1
Gua N 1 ............................................................................................................ 4
Tema: LIPIDOS ................................................................................................. 4
Introduccin terica ........................................................................................ 4
Problemas y ejercicios .................................................................................... 6
Gua N 2 .......................................................................................................... 11
Tema: HIDRATOS DE CARBONO .................................................................. 11
Introduccin terica ...................................................................................... 11
Problemas y ejercicios .................................................................................. 17
Gua N 3 .......................................................................................................... 25
Tema: AMINOCIDOS Y PROTENAS ........................................................... 25
Introduccin terica ...................................................................................... 25
Problemas y ejercicios .................................................................................. 30
Gua N 4 .......................................................................................................... 36
Tema: ENZIMAS ............................................................................................. 37
Introduccin terica ...................................................................................... 37
Problemas y ejercicios .................................................................................. 42
Gua N 5 .......................................................................................................... 53
Tema: CIDOS NUCLEICOS .......................................................................... 53
Introduccin terica ...................................................................................... 53
Problemas y ejercicios .................................................................................. 57
Gua N 6 .......................................................................................................... 61
Tema: BIOENERGTICA Y METABOLISMOS ............................................... 61
Introduccin terica ....................................................................................... 61
Problemas y ejercicios .................................................................................. 65
Gua N 7 ......................................................................................................... 71
Tema: METABOLISMO DE LOS LPIDOS ..................................................... 71
Problemas y ejercicios .................................................................................. 71
Bibliografa ...................................................................................................... 75


















Serie Didctica N 36 Gua terico prctica de Qumica Biolgica
Dra. Evangelina Gonzlez. Ing. Adriana Corzo-Facultad de Ciencias Forestales-UNSE

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GUA N 1
Tema: LIPIDOS
OBJETIVOS:
- Conocer la estructura, clasificacin y propiedades de los lpidos.
- Comprender la importancia de los lpidos en la estructura y el
metabolismo celular

INTRODUCCIN TERICA
Los lpidos son un conjunto muy heterogneo de biomolculas cuya
caracterstica distintiva, aunque no exclusiva ni general, es la
insolubilidad en agua siendo, por el contrario, solubles en disolventes
orgnicos (benceno, cloroformo, ter, hexano, etc.). Su estructura qumica
es fundamentalmente hidrocarbonada con gran cantidad de enlaces C-H y
C-C.
La naturaleza de estos enlaces es 100% covalente y su momento
dipolar es mnimo. El agua, al ser una molcula muy polar, con gran
facilidad para formar puentes de hidrgeno, no es capaz de interaccionar
con estas molculas.
Son molculas de almacenamiento de energa, usualmente en forma de
grasa o aceite. Adems cumplen funciones estructurales, como en el
caso de los fosfolpidos, glucolpidos y ceras y algunos desempean
papeles principales como " mensajeros" qumicos, tanto dentro de las
clulas como entre ellas.

cidos Grasos: son cidos carboxlicos, (-COOH) unidos a una
larga cadena hidrocarbonada (12-22 tomos de C) normalmente no
ramificada. Existen dos tipos de cidos grasos: saturados (solo enlaces
simples) e insaturados (dos o mas enlaces dobles por molcula, no
conjugados)
En la nomenclatura IUPAC, los cidos grasos saturados se nombran de la
misma manera que los cidos carboxlicos. En la nomenclatura comn se
utilizan letras griegas, el carbono adyacente al carbono carboxlico se
Clasificacin
Lpidos simples
Ceras
Glicridos
Lpidos compuestos
Esfingolpidos
Fosfolpidos
Glicolipidos
esteres de cidos grasos y un
alcohol
esteres de cidos grasos, un
alcohol y otras sustancias
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designa o, y el resto en orden alfabtico, la letra omega (O) se utiliza para
especificar el tomo de carbono mas lejano al grupo carboxilo.
Para los cidos grasos insaturados las posiciones de los dobles enlaces
se indican por el smbolo AN donde N seala el tomo de carbono de
nmero menor que lleva la doble ligadura. Una forma de identificacin
simplificada consiste en utilizar dos nmeros separados por dos puntos: el
primer nmero se refiere al nmero total de tomos de carbono y el
segundo al nmero de dobles enlaces

Propiedades qumicas de los cidos grasos
1. Propiedades que dependen del grupo carboxilo:
1.1 Acidez: el grupo carboxilo es el responsable del carcter cido. Sin
embargo como la mayora son insolubles en agua, no pueden liberara
H
+
y por lo tanto no manifiestan el carcter cido. Al aumentar el n de
tomos de carbono disminuye el carcter cido
1.2 . Formacin de sales: jabones
Ejemplo:
CH
3
(CH
2
)
16
COOH + NaOH CH
3
(CH
2
)
16
COO
-
Na
+

Ac. Esterico estearato de sodio
1.3. Formacin de esteres: los cidos grasos por reaccin con alcoholes
dan lugar a la formacin de esteres
Ejemplo:
CH
3
(CH
2
)
16
COOH + CH
3
CH
2
OH CH
3
(CH
2
)
16
COOCH
2
CH
3

Ac. Esterico etanol estereato de etilo
2. Propiedades que dependen de la cadena carbonada
2.1. Oxidacin: los cidos grasos insaturados se oxidan mas fcilmente
en presencia de oxigeno atmosfrico. La presencia de dobles enlaces en
la molcula de los cidos grasos los hace susceptibles del ataque por el
oxgeno provocando cambios qumicos complejos.
Resumen de la constitucin de los lpidos
Lpidos
Partes constituyentes
Clasificacin Tipo
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Lpidos
simples
Triglicridos Glicerol + cido(s) graso(s)
Ceras Alcohol + cido graso (ambos de cadena larga)
Lpidos
Compuestos
Fosfolpidos
a- Cefalinas
b- Lecitinas


a- Esfingosina + cido graso + HPO
4
2-
+ etanolamina
b- Esfingosina + cido graso + HPO
4
2-
+ colina
Esfingolpidos
(esfingomielina)
Esfingosina + acido graso + HPO
4
2-
+ colina
Glicolpidos
a. Cerebrsidos
b. Gangliosidos


a. esfingosina + cido graso + azcar simple
b. esfingosina + cido graso + 2-6 azucares simples

PROBLEMAS Y EJERCICIOS
1. Cmo definira un lpido? Clasifquelos, indicando las funciones
biolgicas de cada categora lipdica.
2. Entre las siguientes molculas orgnicas, indique cuales corresponden
a lpidos:
a) glucosa b) maltosa c) fosfatidilcolina
d) glucgeno e) caroteno f) quitina
g) triglicrido h) esteroide.
3. Escriba la estructura general para las siguientes sustancias:
a) una grasa b) un jabn comn c) un fosfolpido.
d) un terpeno e) una cera f) un esteroide.
4. Seleccione las respuestas correctas:
- Un aceite esta formado por cidos grasos insaturados de cadena corta.
- Un aceite contiene cidos grasos saturados de cadena larga.
- Una grasa contiene cidos grasos insaturados de cadena corta.
- Una grasa esta formada por cidos grasos saturados de cadena larga.
- Un aceite esta formado por cidos grasos insaturados de cadena larga.
5. Indique si las siguientes afirmaciones son verdaderas o falsas.
En un cido graso los dobles enlaces estn conjugados.
Los cidos grasos se encuentran, generalmente, en configuracin cis.
Los dobles enlaces de los cidos grasos son muy poco reactivos.
Los dobles enlaces de los cidos grasos hacen que disminuya el punto
de fusin con respecto al homlogo.
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6. En la tabla que se muestra debajo se enumeran los puntos de fusin de
algunos cidos grasos. Basndose en estos datos explique la diferencia
fsica entre grasas y aceites.
cido Punto de Fusin
cido Linoleico - 5.0
cido Linolenico -10.0
cido Mirstico 53.9
cido Oleico 13.4
cido Palmitito 63.1
cido Esterico 69.6

7. Nombre los siguientes cidos grasos e indique si son saturados o no
saturados Cuales sern slidos y cuales lquidos a temperatura
ambiente?
a) CH
3
(CH
2
)
10
COOH
b) CH
3
(CH
2
)
4
CH=CHCH
2
CH=CH(CH
2
)
7
COOH
c) CH
3
(CH
2
)
14
COOH
d) CH
3
(CH
2
)
7
CH=CH(CH
2
)
7
COOH
8. Escribe en formula de lneas y ngulos las estructuras de los siguientes
cidos:
a) Acido palmitoleico: (C
16:1
)A
9
b) Acido laurico (C
12:0
)
c) Acido araquidnico (C
20:4
)A
5,8,11,14
d) Acido miristico (C
14:0
)
9. Para el hombre los cidos grasos poliinsaturados son esenciales, como
el cido linoleico (6) y el linolnico (3). Estos cidos son abundantes
en aceites vegetales y de pescados. Qu entiende por cidos grasos
esenciales?
10. Escriba la frmula estructural para las sustancias nombradas a
continuacin. Indique a qu tipo de lpidos corresponde y prediga cual
ser su estado fsico a temperatura ambiente:
a) trilaurato de glicerilo b) miristato de linolelo
b) palmitolaurooleato de glicerilo d) araquidato de metilo.
11. Las grasas estn constituidas por mezclas de triglicridos que se
diferencian por sus cidos grasos. En la tabla que aparece abajo se
muestra la composicin de tres lpidos simples.
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a) A partir de los datos de la tabla: cmo explica los diferentes estados
fsicos de cada uno de ellos a temperatura ambiente?
b) Qu ocurre con el punto de fusin de un aceite si se realiza una
hidrogenacin parcial del mismo? Explique.

Porcentaje de cidos grasos
Saturados No saturados
C
4
-C
12
C
14
C
16
C
18
C
16
+C
18

Aceite de Oliva <2 <2 13 3 80
Manteca 11 10 26 11 40
Grasa <2 <2 29 21 46

12. La trimiristina es una grasa slida que se encuentra en la nuez
moscada. Su hidrlisis alcalina da como productos un equivalente de
glicerol y tres equivalentes de c. mirstico.
a) Proponga una ecuacin para esta reaccin.
b) Cmo se denomina este proceso y a qu debe esa denominacin?
13. Escriba la ecuacin para la saponificacin del trilinoleato de glicerilo.
14. Formular ecuaciones que muestren las reacciones del estearato de
sodio con:
a) Ca
2+
b) Mg
2+
c) Fe
3+

15. a) Qu diferencia estructural existe entre un detergente y un jabn?
b) Qu ventaja funcional presentan los detergentes con respecto a los
jabones?
c) Realice un esquema que represente a una gotita de aceite emulsificada
por el detergente alquilbencenosulfonato de sodio.
16. Dibuje la estructura del lpido intacto que correspondera a cada una
de las siguientes mezclas de productos, obtenidos de la hidrlisis
completa del mismo. Diga, adems, a qu clase de lpidos pertenece (por
ej: glicrido, cera, fosfolpido, etc. ):
a) glicerol, cido palmtico, ac. Esterico, fosfato inorgnico.
b) glicerol, c. Palmitoleico, ac. Olico, etanolamina, fosfato inorgnico.
c) esfingosina, ac. Palmitico, fosfato inorgnico.
d) esfingosina, glucosa, ac. Olico.
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17. Cul tendr mayor carcter anfiptico, un glucocerebrsido o una
esfingomielina? Explique.
18. Por qu las grasas animales y los aceites vegetales se ponen
rancios cuando se exponen al aire?
19. Qu sucede fsicamente cuando se hidrogena un aceite? Por qu
tiene este proceso una gran importancia comercial?
20. Completa las siguientes reacciones y escribe la frmula de todos los
compuestos involucrados en las mismas:
a) trioelato de glicerilo + 3H
2


b) dipalmitolilonelato de glicerilo + H
2

c) estearopalmitooleato de glicerilo + 3 NaOH
d) c. olico + O
2

e) lauromiristolinoleato de glicerilo + O
2

f) alcohol laurlico + c. sulfrico + NaOH
21. Escriba la estructura general para los siguientes lpidos complejos
a. Fosfoglicerido b. Esfingomielina
22. Indique cual de las siguientes afirmaciones es correcta:
a) La lecitina es un derivado del cido fosfatdico con colina.
b) La lecitina es un derivado del c. fosfatdico con serina.
c) La lecitina es un derivado de la esfingosina.
23. Elija la respuesta correcta. Un cerebrsido es.....
a) Ceramida + glucosa o galactosa b)Ceramida + c. fosfrico.
c) Una esfingomielina.
24. Consultando en su libro de texto, escriba las estructuras
correspondientes a los terpenos que se indican debajo. Indique el nmero
de unidades de isopreno y clasifquelos como monoterpeno, diterpeno y
exprese, cuando corresponda, la importancia biolgica de los mismos.
a) mirceno b) limoneno c) mentol
d) -caroteno e) vitamina A f) retinal
25. Esquematice la estructura de los esteroles y enuncie la importancia
biolgica de los mismos.
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CH
2
CH
2
N(CH
3
)
3
+
CH
2
CH
2
NH
3
+
CH
2
CH
CH
2
OH
OH
OH
CH
C
C
CH
2
OH
NH
2
H
OH H
CH(CH
2
)
12
CH
3
colina
etanolamina

glicerol
esfingosina
COOH
COOH
COOH
COOH
COOH
COOH
COOH
COOH
COOH
COOH
Nombre Estructura RCOOH
(contenido de carbono) (descritas como frmulas lineales)
10 9
Acidos completamente saturados
Acido Larico (C
12
)
Acido Mirstico (C
14
)
Acido Palmtico (C
16
)
Acido Esterico (C
18
)
Acido Araquidnico (C
20
)
Acidos Insaturados
a

Acido Palmitoleico (C
16:1
)A
9
Acido Oleico (C
18:1
)A
9
Acido Linoleico (C
18:2
)A
9,12
Acido Linolnico (C
18:3
)A
9,12,15
Acido Araquidnico (C
20:4
) A
5,8,11,14
a
En C
x::y
D
z
: donde x es el contenido de carbonos; y es el numero dobles enlaces y z la ubicacion de los dobles enlaces,
el carbono del grupo COOH es el numero 1
Datos Anexos
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GUA N 2
Tema: HIDRATOS DE CARBONO
OBJETIVOS:
- Conocer las estructuras, propiedades y clasificacin de los hidratos de
carbono.
- Comprender su funcin en el mantenimiento de la vida tanto en
vegetales como en animales.

INTRODUCCIN TERICA
Los carbohidratos, o hidratos de carbono, constituyen una de las cuatro
clases principales de biomolculas (molculas biolgicamente activas).
Los carbohidratos son componentes importantes de los seres vivos.
Desde el punto de vista qumico son aldehdos o cetonas polihidroxilados,
o bien los productos derivados de ellos por oxidacin, reduccin,
sustitucin o polimerizacin. El termino carbohidrato deriva de su
formula general: C
n
(H
2
O)
m
.
En general, y tal como se muestra a continuacin, los carbohidratos
pueden clasificarse de acuerdo a su estructura:
















Tamao de la
cadena carbonada
Triosas
Tetrosas
Pentosas
Hexosas
3 tomos de C
4 tomos de C
5 tomos de C
6 tomos de C
Localizacin
del grupo C=O
Aldosas
Cetosas
aldehdo
cetona
Dos unidades de azucares
Numero de
unidades de azcares
Monosacrido
Disacrido
Oligosacridos
Azcar simple
Tres a diez unidades
Polisacridos
Mas de diez
Estereoqumica
Serie D
Serie L
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Ismeros pticos
Son compuestos idnticos en la mayora de sus propiedades fsicas y
qumicas, pero que difieren en el comportamiento en los sistemas
biolgicos y tambin frente a la luz polarizada. Los ismeros pticos
tienen, por lo menos, un carbono quiral. Para que una molcula presente
isomeria ptica debe contener por lo menos un carbono quiral . (para un
mayor detalle de este tema ver la serie didctica Estereoisomeria
Bsica)
Un carbono es quiral (o tambin llamado asimtrico) cuando est unido
a 4 sustituyentes distintos. Los carbonos quirales se denotan en la
molcula con un asterisco (*).
La disposicin tridimensional de los cuatro sustituyentes en un carbono
quiral es lo que se conoce como configuracin. Para una molcula con
un carbono quiral es posible escribir dos ordenaciones o configuraciones
que generan dos formas isomricas denominadas enantimeros. Estos
ismeros son imgenes especulares entre s pero no son superponibles.
De manera general es posible predecir el nmero de estreoismeros de
una molcula:
Si tiene un nico carbono quiral, slo puede existir un par de
enantimeros.
Si tiene dos carbonos quirales tiene un mximo de cuatro
estereoismeros (dos pares de enantimeros).
En general, una molcula con n carbonos quirales tiene un nmero
mximo de 2
n
estereoismeros posibles.
Una vez obtenidos los estereoisomeros, se podr observar que existen
algunas configuraciones que no son imgenes especulares y que se
denominan diastereoismeros. Estos ismeros pueden diferir en todas
las propiedades fsicas.

Representacin de enantimeros
Para identificar los enantimeros de forma inequvoca es necesario un
sistema que indique la quiralidad de la molcula. La notacin R, S fue
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desarrollado por Cahn, Ingold y Prelog la cual esta extensamente
desarrollada en la serie didctica Estereoisomeria Bsica
Ejemplo:
Br
CH
3
CH
2 CH
3
H
C
Br
C H
3 CH
2
CH
3
H
C
(S)-2-bromobutano (R)-2-bromobutano


Azucares D y L
El gliceraldehdo, la aldosa ms sencilla, tiene un tomo de carbono
quiral y por lo tanto dos ismeros pticos (2
1
= 2). Estos son enantimeros
o imgenes especulares.
CH
C*
CH
2
OH
O
OH H
CH
C*
CH
2
OH
O
H O H

Estos ismeros, si bien pueden escribirse utilizando cuas, como en el
ejemplo anterior, pueden escribirse de una manera mas conveniente
mediante una representacin en dos dimensiones. Emil Fischer desarrollo
una forma muy til para estas representaciones; las formulas reciben el
nombre de proyecciones de Fischer . En este tipo de representaciones
se dibuja la molcula en forma de cruz, con el carbono asimtrico en el
punto de interseccin. Las lneas horizontales representan enlaces
dirigidos hacia el observador; las lneas verticales representan enlaces
que se alejan del observador.







C OH H
CH
2
OH
CH=O
OH H
CH
2
OH
CH=O
R-(+)-gl i c er al dehdo Fo r mul a d e Fi s cher Grupos
hacia
adelante
Grupos hacia atrs
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Fischer tambin introdujo una nomenclatura estereoqumica que precedi
al sistema R, S y que aun es de uso comn: la nomenclatura D y L. La
letra D indica la configuracin del (+)-gliceraldehdo que tiene el grupo
hidroxilo hacia la derecha. Su enantimero con el grupo hidroxilo hacia la
izquierda se designa como L. El carbono mas oxidado (CHO) se coloca
en la parte superior.





Los signos (+) y (-) se refieren al sentido de rotacin del plano de la luz
polarizada (+: dextrgiro; -: levgiro)
El sistema de Fischer se puede utilizar para los otros monosacridos de la
siguiente manera: si el carbono quiral mas alejado del grupo aldehdo o
cetona tiene la misma configuracin que el D-glicerladehdo el compuesto
es un D-azcar; si la configuracin de dicho carbono es la misma que la
del L-gliceraldehdo ser un L-azcar.

Estructuras cclicas, hemiacetlicas de los monosacridos
La representacin de la glucosa en proyecciones lineales como la de
Fischer no explica todas las caractersticas qumicas de la glucosa. Esto
es debido a que los monosacridos se encuentran principalmente en
forma cclica, hemiacetalica.
En la glucosa y otras aldohexosas, el hemiacetal forma un anillo de 6
tomos (5C+O). Esta estructura recibe el nombre de glucopiranosa por
su semejanza al heterociclo pirano.
C OH H
CH
2
OH
CHO
H O H
CH
2
OH
CHO
D-(+)-gl i ceral dehdo L-(-)-gl i ceral dehi do
OH H
OH H
CH
2
OH
OH H
CHO
OH H
OH H
CH
2
OH
H O H
CHO
C
OH H
CH
2
OH
OH H
CH
2
OH
O C
OH H
CH
2
OH
H O H
CH
2
OH
O
D-aldosa L -aldosa D-cetosa L -cetosa
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Para las aldopentosas y cetohexosas la ciclacin intramolecular origina
anillos de 5 tomos (4C+O). En este caso, se aade al nombre del azcar
el sufijo -furanosa, por semejanza con el heterociclo del furano.
El qumico britnico W.N. Haworth introdujo una forma muy til para
representar la forma cclica de los azucares. En una proyeccin de
Haworth el anillo se representa como si fuera plano, se visualiza con un
borde, con el oxigeno colocado en la parte de arriba, a la derecha. Los
carbonos se acomodan numricamente en el sentido de las agujas del
reloj, con el C-1 a la derecha. Los sustituyentes que estn unidos al anillo
se encuentran arriba o abajo del plano
Como convertir una proyeccin de Fischer en una de Haworth?
Los grupos hidroxilos que estn hacia la derecha en la proyeccin de
Fischer aparecen abajo en la proyeccin de Haworth (y a la inversa). Para
los D-azucares el grupo -CH
2
OH terminal se encuentra arriba en la
proyeccin de Haworth, mientras que para los L-azucares se encuentra
hacia abajo.
El enlace hemiacetlico crea un nuevo centro de asimetra en el carbono
1, con lo que cada molcula en forma abierta puede originar dos tipos de
formas cerradas.
Estos epmeros (difieren nicamente en un centro estereognico)
reciben el nombre de anmeros. Se distinguen los anmeros o y | que
tienen configuracin idntica en todos los C excepto en el C-1. El
anmero o es aquel que presenta el grupo hidroxilo hacia abajo y el | es
el que lo tiene hacia arriba.

O
H
OH
CH
2
OH
H
H
OH H
OH
H OH
C
C
C
C
C
CH
2
OH
O H
OH H
H O H
OH H
OH H
O
H
OH
CH
2
OH
H
OH
OH H
H
H OH
1
2
3
4
5
6
1
6
1
6
anmero o
anmero |
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Propiedades qumicas
1. Mutarrotacin

1. Esterificacin




2. Eterificacin





3. Reduccin




4. Oxidacin




5. Preparacin e hidrlisis de glicsidos
O
H
OH
CH
2
OH
H
H
OH H
OH
H OH
O
H
CH
2
OH
H
H
H
H
OH
OH
OH
OR
O
H
OH
CH
2
OH
H
H
OH H
OH
H OH
ROH
H
+
H
2
O, H
+
+ ROH

O
H
OH
CH
2
OH
H
H
OH H
OH
H OH
OH
H
OH
CH
2
OH
H
OH H
H OH
CHO
O
H
OH
CH
2
OH
H
OH
OH H
H
H OH
anomero o de la glucosa anomero | de la glucosa
O
H
OH
CH
2
OH
H
H
OH H
OH
H OH
O
H
OAc
CH
2
OAc
H
H
OAc H
OAc
H OAc
CH
3
COOCOCH
3
Ac = CH
3
CO
O
H
OH
CH
2
OH
H
H
OH H
OH
H OH
O
H
CH
2
OMe
H
H
H
H
OMe
OMe
OMe
OMe
CH
3
I, Ag
2
O
(CHOH)n
CH
2
OH
CHO
(CHOH)n
CH
2
OH
CH
2
OH
H
2
, catalizador
NaBH
4
aldosa alditol
(CHOH)n
CH
2
OH
CHO
(CHOH)n
CH
2
OH
COOH
(CHOH)n
COOH
COOH
Br
2
, H
2
O
Ag
+
o Cu
+2
acido aldrico aldosa acido aldnico
HNO
3
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Dra. Evangelina Gonzlez. Ing. Adriana Corzo-Facultad de Ciencias Forestales-UNSE

17

PROBLEMAS Y EJERCICIOS
1.a) Indique, debajo de cada molcula, cules son glcidos (G), Aldehdos
(A), cidos orgnicos (AO), hidrocarburos (H) y cetonas (C).
b) Reconozca las molculas glucdicas entre las formuladas y marque con
un recuadro la aldosa y la cetosa.





2. Segn el nmero de carbonos y grupos funcionales, cmo denomina
los monosacridos que aparecen a continuacin?






3. Escriba la formula estructural de:
a. una aldotriosa b. una cetohexosa c. una aldopentosa
4. Seleccione, entre las siguientes alternativas, como definiras a la
Ribosa:
CH
3
CH
2
CH
3
CH
2
CH
3
COOH CH
3
CH
2
C
CH
3
O
CH
2
OH
C
COH
O
CH
2
OH
CH
2
CH
3
CHO
CHOH
CH
2
OH
CHO
C
CHOH
CH
2
OH
CHOH
CH
2
OH
O CHOH
CH
2
OH
CHO
C
CH
CHO
CHOH
CH
2
OH
O
CH
2
OH
O H
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18
- Monosacridos del tipo aldohexosa que tiene un grupo aldehdo y 6
carbonos.
- Es una cetopentosa que posee un grupo cetona y 5 carbonos en su
estructura.
- Un monosacrido del tipo aldopentosa con un grupo aldehdo y 5
carbonos
5.a) Entre los siguientes monosacridos, indique cuales de ellos son
formas y cual es
b) Indique cuales son hexosas y cuales pentosas





6. Por qu tienen carcter reductor los Monosacridos? Marque con una
cruz la respuesta correcta.
- Por la presencia del grupo carbonilo (aldehdo y cetona).
- Por la presencia del grupo amino.
- No tienen carcter reductor.
7. Indique las diferencias que existen entre los trminos constitucin (o
composicin), configuracin y conformacin.
8. Seleccione la respuesta correcta: Cundo se dice que un carbono es
asimtrico?
- Cuando presenta sus cuatro sustituyentes iguales.
- Cuando presenta sus cuatro sustituyentes iguales dos a dos.
- Cuando presenta sus cuatro sustituyentes distintos.
9. Cuntos ismeros pticos se espera que tenga el 3-bromo-2-butanol?
Y el 2,3-dibromobutano? Escriba las estructuras correspondientes
10. Cul de las siguientes molculas puede existir como enantimeros?
a. 1,1-dietilciclohexano
O
H
OH
CH
2
OH
H
H
OH H
OH
H OH
O
CH
2
OH
H
H
OH
OH
H
OH
CH
2
OH
O
CH
2
OH
H
H
OH
H
H
OH
H
O
H
OH
H
H
H
OH OH
OH
H H
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19
F H
OH
CH
3
NH
2
H
Cl
CHO
b. cis-1,2-dibromociclopropano
c. 3-bromopentano
d. 1,1,2-tribromociclohexano
11. Complete en cada recuadro la estereoqumica del estereocentro (R /
S) que se indica (deja el recuadro en blanco si procede):




12. Complete las siguientes imgenes





13.a) Exprese su concepto acerca de los siguientes trminos:
- actividad ptica.
- dextrgiro.
- enantimero.
- rotacin especfica
- Quiralidad.
- Levgiro.
- Diasteremero.
b) Escribe la estructura, de los dos ismeros posibles para el
gliceraldehdo. Indica qu tipo de ismeros pticos son y como se
denominan.
14. Las siguientes estructuras muestran las frmulas de proyeccin de
Fischer de varios monosacridos.
a. Identifquelos segn la serie D o L
Cl
H O H
Cl
Br H
O H
Br
Cl
Br
Cl
H
Cl
OH
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20
b. Clasifquelos segn la naturaleza de su grupo carbonilo y su nmero de
tomos de carbono.
c. Indique su nombre
d. Indique cuales son sus carbonos quirales
e. Formule y nombre su correspondiente enantimero, si ste existe.














15. Escriba la formula de proyeccin de Fischer de:
a. L-eritrosa b. L-treosa c. L-glucosa
16.a) Cmo determina la cantidad de ismeros pticos que puede
presentar un compuesto?
b) Cuntos ismeros pticos presenta la glucosa? Escribe la estructura
de sus ismeros D y L
17. Indicar si cada uno de los siguientes pares de azcares son, entre s,
anmeros, epmeros o parejas aldosa - cetosa:
a. D - gliceraldehdo y D - dihidroxiacetona.
b. D - glucosa y D - fructosa.
c. D - glucosa y D - manosa.
d. - D - glucosa y - D - glucosa.
e. D - ribosa y D - ribulosa.
f. D- galactosa y D glucosa
CH
2
OH
OH
OH
OH
CHO
OH
OH
CHO
CH
2
OH
OH
CHO
CH
2
OH
O H
O H
O H
CHO
CH
2
OH
O H
O H
OH
OH
CHO
O H
OH
O H
OH
CH
2
OH
OH
OH
CHO
O H
CH
2
OH
A B C
D E F
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21
18. Consultando el cuadro anexo diga cules son los pares de D-
pentosas que son epmericas en C-3?
19. Complete las siguientes reacciones y escriba la estructura de todos
los compuestos involucrados:
a. glucosa + ........... c. glucrico.
b. galactosa + Br
2
+ H
2
O .............
c. ............. + ........... ribitol.
d. fructosa + Cu
++
o Ag
+
..............
20. La hidrlisis del polisacrido pectina (de frutas y bayas) d
principalmente cido D- galacturnico; la hidrlisis del polisacrido algina
(de algas) da cido D- manurnico. Escriba la estructura de estos cidos
urnicos.
21. El D-manitol, que se encuentra en la naturaleza en las aceitunas,
cebollas y hongos se puede obtener mediante la reduccin de la D-
manosa con NaBH
4
. Dibuje su estructura
22. Escriba una ecuacin para la reaccin de D-manosa con el reactivo
de Fehling (Cu
2+
) para formar el cido D-mannico
23. A continuacin se representa la ciclacin de la D glucosa en las
formas y .








a. Indique el enlace
hemiacetal y explique
cmo se form.
b. Reconozca la forma y
.
c. Puede
O
H
OH
CH
2
OH
H
H
OH H
OH
H OH
C
C
C
C
C
CH
2
OH
O H
OH H
H O H
OH H
OH H
O
H
OH
CH
2
OH
H
OH
OH H
H
H OH
1
2
3
4
5
6
1
6
1
6
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22
transformarse la D-glucosa en D-glucosa?
24.a) Cicle la molcula de fructosa en su forma : los carbonos que
reaccionan son el 2 y el 5.
b) Identifique el carbono anomrico y el enlace hemiacetal.






25. El siguiente monosacrido es la xilosa. Obtener de ella los derivados
ciclados en configuracin D y L, indicando el nombre del compuesto
formado y el tipo de enlace formado. Indica los carbonos quirales y
anomricos.





26. Dibuje la proyeccin de Haworth para la estructura
cclica de seis miembros de la D-manosa
27. Dibuje las proyecciones de Haworth de las formas y de la alosa
28. Escriba una ecuacin para la reaccin, catalizada por cido, de la -D-
galactosa con metanol.
29. a) Qu entiende por enlace glicosdico
b) Cul es la importancia biolgica de los enlaces glicosdicos?
c) Cuntos tipos de enlaces glicoscos conoce? Explique, y muestre en
una frmula, como se forma cada uno de ellos.
30. Complete, llenando los espacios en blanco, cada una de las
siguientes afirmaciones:
a. la maltosa es un ............ compuesto por dos molculas de ..............
unidas mediante enlaces glicosdicos ............
b. la .............. es un disacrido constituido por ...... molculas de glucosa
unidas por enlaces glicosdicos (14)
CH
2
OH
C
C
C
C
CH
2
OH
O
O H H
H OH
H OH
CH
2
OH
OH
O H
OH
CH
2
OH
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23
c. La isomaltosa es un ................ formado por la unin de ....... molculas
de ..............., unidas mediante un enlace glicosdico ................
d. La ................... resulta de la unin de una molcula de glucosa y una
de fructosa a travs de un enlace glicosdico ..............
31. Indique cuales de los oligosacridos nombrados en el ejercicio
anterior son reductores y cuales no. En cada caso justifique su respuesta.
32. Cul es la frmula molecular de la (+) sacarosa que resultara si el C-
1 de la glucosa estuviera unido al C-4 de la fructosa, por ejemplo, y el C-2
de la fructosa estuviera unido al C-4 de la glucosa? Sera reductor el
azcar as formado?
33. Si tanto la celulosa cono el almidn se encuentran constituidos por
unidades de glucosa, qu es lo que determina que sean dos
polisacridos estructural y funcionalmente tan diferentes?
34. Considrese una cadena de amilosa de 4000 unidades de glucosa.
En cuantos lugares se debe producir una ruptura para reducir la longitud
promedio a:
a. 2000 unidades?
b.1000 unidades?
c. 400 unidades?
d. Qu porcentaje del total de uniones glicosdicas se hidroliza en cada
caso?
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24
Datos anexos
Estructura de la familia de D-azucares







aldotriosa
D-gliceraldehdo
aldotetrosas
D-eritrosa D- treosa
aldopentosas
D-ribosa D- Arabinosa D-Xilosa D-Lixosa
aldohexosas
D-Allosa D- Altrosa D-Glucosa D-Manosa D-Gulosa D-Idosa D-Galactosa D-Talosa
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25
GUA N 3
Tema: AMINOCIDOS Y PROTENAS
OBJETIVOS
Que el estudiante comprenda la qumica de los compuestos orgnicos
polifuncionales, particularmente de los aminocidos y protenas.

INTRODUCCIN TERICA
Los aminocidos (aac) son compuestos que contienen un grupo carboxilo
y un grupo amino unidos al mismo tomo de carbono.



De los 20 aminocidos que constituyen las protenas todos son o-
aminocidos puesto que la amina est en el carbono vecino al grupo
carboxlico (carbono o).
La diferencia entre un aminocido y otro se basa en las diferencias en sus
cadenas o grupos laterales (grupo R), los cuales pueden variar tanto en
estructura, tamao, carga elctrica.
Todos los aminocidos, excepto glicina, tienen unido al tomo de carbono
o cuatro grupos diferentes, por lo tanto este carbono es un centro quiral
y presenta estereoismeros. De la misma manera que para los
azcares, para los aminocidos es posible hablar de L-aminocidos
y D-aminocidos.
Los L-aminocidos son aquellos que presentan el grupo amino a la
izquierda y los de la serie D son los que lo presentan a la derecha, por
analoga con el gliceraldehdo. Los aminocidos constituyentes de las
protenas son exclusivamente ismeros L.
Clasificacin de aminocidos de acuerdo al grupo R
Los aminocidos se pueden agrupar en cinco clases de acuerdo a las
propiedades del grupo R
1- No polares: grupos R alifticos (hidrofbicos)
2- Aromticos: grupos R (hidrofbicos)
3- Polares (Grupos R sin carga)
4- Cargados Positivamente (Grupos R Bsicos)
R
H N H
2
COOH
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26
5- Cargados Negativamente (Grupos R cidos)
Propiedades cido-base de los aminocidos
Dado que todos los aminocidos poseen un grupo cido (-COOH) y un
grupo bsico (-NH
2
), todos los aminocidos libres presentan
caractersticas cido-base.
En disolucin acuosa, los grupos ionizables de los aminocidos permiten
que la molcula ceda o capte iones protones, segn el pH del medio, al
igual que ocurre con todos los cidos y bases dbiles.
En medio acido (pH acido), la molcula del aminocido tiende a captar H
+
,
y queda cargada positivamente.
A pH bsico el aminocido tiende a libera H
+
y queda cargado
negativamente. Para cada aminocido existe un pH en el cual las cargas
positiva y negativa estn exactamente equilibradas, por lo que la carga
neta de la molcula es cero. Este pH se le llama isoelctrico o punto
isoelctrico (pI) del aminocido.
Cada grupo disociable de un aminocido tiene un pK caracterstico. Al
final de esta gua se presenta una tabla con los valores de pK de los
aminocidos constituyentes de las protenas. Conocido el pK, se puede
estimar la proporcin de molculas disociadas y no disociadas a un pH
cualquiera.
Ejemplo: equilibrios de ionizacin de glicina
C H
NH
3
+
H
HOOC C H
NH
3
+
H
C H
NH
2
H
- H
+
+ H
+
-
OOC
- H
+
+ H
+
-
OOC
pK
a1
aprox.= 2 pK
a2
aprox.= 9-10
catinico neutro aninico
carga neta = +1 carga neta = 0 carga neta = -1

Se puede calcular un valor aproximado de pI tomando como promedio los
valores de pK al pasar de la forma 0 a la +1 y el pK al ir de la forma 0 a la
-1.
2
) 1 0 ( ) 0 1 ( + +
+
=
pK pK
pI
Pptidos
Los aminocidos se unen entre si para formar polmeros que alcanzan
grandes dimensiones. Si estos polmeros contienen menos de 100
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27
aminocidos se denominan pptidos si contienen entre 200-300
aminocidos se denominan protenas.
Los aminocidos se encuentran unidos linealmente por medio de uniones
peptdicas (enlaces covalentes). Estas uniones se forman por la reaccin
de sntesis (va deshidratacin) entre el grupo carboxilo del primer
aminocido con el grupo amino del segundo aminocido.
N H
2
C C OH
R1
O H
N C C OH
R2
O H
H
H
N H
2
C C
R1
O H
N C C OH
R2
O H
H
+
H
2
O
H
2
O
enlace peptidico
amino carboxilo
terminal terminal
Dipeptido: dos aminoacidos

Pptidos: el enlace disulfuro
Adems del enlace peptdico, el otro nico tipo de enlace covalente entre
los aminocidos en los pptidos y las protenas es el enlace disulfuro. No
es comn a todas las protenas.
COO-
CH
CH
2
SH
H
3
N
SH
CH
2
CH
COO-
NH
3
COO-
CH
CH
2
S
H
3
N
S
CH
2
CH
COO-
NH
3
+
+
2 H
+
+ 2 e
-
2 H
+
+ 2 e
-
puente disulfuro
cistena
cistena
Cistina

Pptidos: nomenclatura
1- Cada posicin en un pptido se denomina residuo de aminocido
2- Dependiendo del nmero de residuos de aminocidos tendremos:
Dipptido, tripeptido, polipeptido (+ de 10 residuos)
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28
3- Los pptidos lineales de secuencia conocida se nombran comenzando
por el N-terminal (amino terminal) y utilizando las abreviaturas o letras de
cdigos que identifican los aminocidos

La secuencia de residuos es el factor que determina la forma
tridimensional global de la molcula y a su vez es la caracterstica
estructural que determina como funcionara esa molcula
Electroforesis de aminocidos y pptidos
Puesto que los aminocidos tienen cargas a ciertos valores de pH se
mueven si se aplica un campo elctrico, es decir polos o electrodos
elctricos, (+) y (), a la solucin. La forma cationica (+) se mueve al polo
negativo y viceversa. La forma neutra no se mueve en absoluto.









El proceso de someter aminocidos y protenas o cualquier especie con
carga a un campo elctrico se conoce como electroforesis. Para poder
predecir la direccin del movimiento de un aminocido o pptido en un
aparato de electroforesis capilar lo primero que debe hacerse es calcular
el valor de pI del mismo, a pH inferiores a pI casi todas las molculas se
encuentran en forma cationica (+) y migraran al electrodo negativo. A pH
superiores al pI las molculas sern aninicas (-) y migraran al
electrodo positivo.
Reacciones de los aminocidos
Arg-Ala-Gly-Arg-Glu-Ala-Met-Lys
N-terminal C-terminal
polo
-
+
polo
aa
1
aa
2
aa
3
carga carga carga
neta (-) neta (0) neta (+)
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29
1. Reaccin con ninhidrina: Es un reactivo til para detectar aminocidos
y determinar la concentracin de sus soluciones






2. Reaccin con FDNB (1-fluoro-2,4-dinitrobenceno): marca
cuantitativamente los grupos amino en los aminocidos y pptidos







Protenas: estructura
Las protenas existen en diferentes niveles de estructura.
Comnmente se definen cuatro niveles de estructura:
Estructura primaria:
Se refiere a:
- La Identidad de los aminocidos
- La cantidad relativa de cada aminocido
- La secuencia aminoacidica
Estructura secundaria:
Se refiere a la orientacin geomtrica de la cadena (hlice alfa o lamina
beta).
Estructura terciaria:
Se refiere a la arquitectura tridimensional de la protena, incluyendo la
orientacin de cualquier grupo prosttico (protenas globulares o fibrosas).
Estructura cuaternaria:
Se refiere al la agregacin no covalente de dos o mas cadenas
polipeptdicas
Secuenciacin de aminocidos de una protena
O
O
OH
OH
R C COO-
H
NH
3
+
O
O
N
O
O
+ + RCHO + CO
2
+ 3H
2
O + H
+
ninhidrina
anin violeta
F
NO
2
NO
2
R C
H
NH
2
COOH
N
NO
2
H
C H R
COOH
NO
2
+
+
HF
FDNB
2,4-dinitrofenilaminoacido
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30
Pasos:
1- La protena es cortada en fragmentos especficos ya sea por mtodos
qumicos o enzimticos. (la ruptura de los enlaces peptdicos debe ocurrir
con cierto grado de especificidad)
2- Si estn presentes enlaces disulfuros deben romperse ya que
interfieren en la secuenciacin.
3- Cada fragmento se purifica y se determina la secuencia por el mtodo
de Edman (marca y separa nicamente el residuo amino-terminal dejando
el resto del pptido intacto).
4- Finalmente se determina el orden de los fragmentos en la protena
original y se localizan los enlaces disulfuro.

Problemas y ejercicios
1. Marque con una cruz la respuesta correcta para la siguiente afirmacin:
Las protenas son macromolculas constituidas bsicamente por:
a) C, H, O, P.
b) C, H, O, N.
c) C, H, O, Fe.
2. Los o-L- aminocidos se caracterizan por:
a) la disposicin del grupo carboxilo a la izquierda del carbono o.
b) la disposicin del grupo amino a la derecha del carbono o.
c) la disposicin del grupo amino a la izquierda del carbono o.
3. El comportamiento anftero de los aminocidos se refiere a que:
a) El pH de una solucin acuosa determina su ionizacin.
b) El pH de una solucin acuosa determina su actividad ptica.
c) El pH impide que se solubilicen en una disolucin acuosa
4. D una definicin o ilustre cada uno de los siguientes trminos:
a- enlace peptdico b- ion bipolar
c- configuracin L de los aminocidos d- dipptido
e- aminocido con grupo R no polar f- compuesto anfoterito
g- punto isolelctrico h- ninhidrina

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Dra. Evangelina Gonzlez. Ing. Adriana Corzo-Facultad de Ciencias Forestales-UNSE

31
C H
NH
2
CH
2
HOOC
CH
2
NH
2
C H
NH
2
CH
2
HOOC
CH
2
CH
2
CH
2
CH
2
CH
3
C H
NH
2
CH
2
HOOC
C CH
COOH
CH
3
A B C
3
C H
NH
2
CH
2
HOOC
CH
CH
3
NH
2
C H
NH
2
CH
2
HOOC
CH
2
CH
CH
CH
3
NH
2
COOH
D E F
5. Clasifique cada uno de los siguientes o-aminocidos como polares o
apolares:













6. Formule la L- serina y L- cistena e indique:
a. Carbono o.
b. Grupo carboxilo.
c. Grupo amino.
d. Radical R.
7. Escriba la formula de cada uno de los siguientes aminocidos en su
forma inica bipolar:
a- valina b- serina c- prolina d-triptofano
8. Calcular el pI de la Histidina sabiendo que:
pK
1
= 1,82; pK
2
= 6,00; pK
3
= 9,17
9. Escriba la estructura de la leucina:
a) en el pI b) a pH alto c) a pH bajo
10. Usando los valores de los pI, provistos en la hoja anexa, indique la
direccin de migracin de cada uno de los componentes de una mezcla
de asparagina, histidina y cido asprtico a pH = 6 en un aparato de
electroforesis.
11. Cul de los grupos carboxilo es mas fuerte como cido en la forma
totalmente protonada del cido asprtico?
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32
12. En solucin muy alcalina, un aminocido contiene dos grupos bsicos:
-NH
2
y COO Cul es el ms bsico? A qu grupo se unir
preferentemente un protn si a la solucin se le agrega cido? Cul es el
producto?
13. Dibuje todas las formas estereoismeras posibles para el aminocido
treonina. La treonina natural deriva su nombre de su relacin con la
tetrosa treosa. Basndose en esto, cul es la configuracin correcta para
la treonina natural?
14. Indique la direccin de migracin (electrodo positivo o negativo) en un
aparato de electroforesis de:
a) alanina a pH = 5.
b) glicinia y lisina a pH = 7
c) fenilalanina, leucina y prolina a pH = 10
15. Escriba la estructura predominante de cada uno de los siguientes
aminocidos al pH que se indica. Si se colocaran en un campo elctrico:
hacia cual de los electrodos (+ o -) migrara cada aminocido
a- metionina a su pI b- serina a pH bajo c- fenilalanina a pH alto
16. Escriba las estructuras de los dipptidos que se pueden formar al unir
alanina y glicina mediante un enlace peptdico. Que estructura se espera
a pH = 3 y a pH= 9?
17. Escriba la formula estructural completa para: Gly-Ala-Ser
18. Usando las abreviaturas de tres letras, enumere todos los tripptidos
que pueden formarse con los aminocidos: alanina, metionina y
asparagina.
19. Escriba las ecuaciones para eliminar el pptido alanilglicilcalina por el
mtodo de Edman. Cul es el nombre del dipptido que queda?
20. La tripsina es una enzima proteoltica que hidroliza los enlaces
peptdicos cuando el grupo carboxilo lo aporta la lisina o la arginina.
Indique en el polipptido formulado a continuacin:
a. Con un crculo, el grupo amino terminal y el grupo carboxilo terminal.
b. Con un recuadro, los enlaces peptdicos.
c. Con una flecha los puntos de hidrlisis cuando el pptido es tratado con
tripsina.
d. Por cuntos aminocidos est formado este polipptido?
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33

21. Escriba los fragmentos formados por la accin de la tripsina sobre los
siguientes pptidos:
a. Lys-Phe-Glu-Ala-Ala-Glu-Ser-Glu
b. Ala-Ala-His-Arg-Glu-Lys-Phe-Ile-Gly-Gly-Gly-Glu
c. Tyr-Cys-Lys-Ala-Arg-Arg-Gly
Cada uno de los fragmentos producidos por el tratamiento con tripsina se
hacen reaccionar a continuacin de 2,4-dinitrofluorobenceno, seguido de
la hidrlisis de los enlaces peptdicos. Escriba los correspondientes
aminocidos 2,4-dinitrofenilados formados a partir de cada uno de los
pptidos
22. El aspartame (Nutrasweet) es un ster dipeptdico con un sabor muy
dulce. La hidrlisis completa del aspartame produce fenilalanina, cido
asprtico y metanol. Una incubacin suave con carboxipeptidasa no tiene
efectos sobre este ster. El tratamiento con fenil isotiocianato seguido por
hidrlisis suave produce la feniltiohidantona del cido asprtico. Proponer
una estructura para el aspartame.
23. El anlisis de los productos de la hidrlisis de la salmina, un
polipptido del semen del salmn, dio los resultados siguientes:
Aminocido salmina
g/100g
Isoleucina 1,28
Alanina 0,89
Valina 3,68
Glicina 3,01
Serina 7,29
Prolina 6,90
Arginina 86,40
C C N CH C N C C N CH C H
3
N
H
CH
2
OH
O
H
CH
2
CH
2
CH
2
CH
2
NH
3
O
H
CH
3
H O
H
CH
2
CH
2
CH
2
C
NH
2
NH
2
N C COO-
O
H
CH
2
H
CH
CH
3
CH
3
+
+
+
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Cules son los nmeros relativos de los diversos residuos de
aminocido en salmina, es decir, cual es su formula emprica? Por qu
los pesos suman ms de 100 gr?
24. Los cidos, bases, metales pesados, solventes, entre otros, son
agentes desnaturalizantes.
a. Explique para dos de ellos que fuerzas estabilizadoras de la protena
afectan.
b. Qu diferencia hay entre hidrlisis y desnaturalizacin?
25. La adicin de etanol u otros disolventes orgnicos a una solucin
acuosa de una protena globular produce su desnaturalizacin. Dicho
tratamiento tambin tiende a deshacer las micelas de jabn, por ejemplo.
Qu proceso fundamental opera en ambos casos?
26. Elija la respuesta correcta para la siguiente afirmacin: El termino
configuracin o lmina plegada, de una protena se refiere a:
a) su estructura primaria.
b) su estructura secundaria.
c) su estructura terciaria.
27. Elija la respuesta correcta. La forma tridimensional total de una
protena y, por lo tanto su funcin, depende de:
a) la cantidad relativa de cada uno de los aminocidos que la componen.
b) de la secuencia de los aminocidos constituyentes.
c) la identidad de los aminocidos que la forman.
28. Si la mioglobina es una protena formada por un nico polipptido,
puede tener estructura cuaternaria?
a) nunca
b) si
c) a veces
29. Marca con una cruz la(s) respuesta(s) correcta(s) para la siguiente
aseveracin: Cuando una protena se desnaturaliza.....
a) las cadenas polipeptdicas que la forman se separan total o
parcialmente.
b) los aminocidos que la forman quedan libres.
c) recupera su conformacin nativa.
d) pierde su conformacin original.
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e) la(s) cadena(s) polipeptidica(s) que la forman de despliega(n).
30. Una pequea muestra de cierta sustancia fue sometida a
cromatografa en capa delgada. Despus del secado, la placa se roci
con solucin de ninhidrina y se someti al calor. El aspecto de la placa,
despus de calentarla, es el que se muestra en la figura. Cul es el valor
del R
f
de este material, en el sistema de solventes que se emple?










Datos anexos
Tabla: Propiedades y convenciones asociadas con los aminocidos
comunes

Abreviatura Smbolo
Valores pK
a

pK
1

(-COOH)
pK
2
(-NH
3
+
)
pK
R
grupo R
Glicina Gly G 2.34 9.60 -
Alanina Ala A 2.34 9.69
Prolina Pro P 1.99 10.96
Valina Val V 2.32 9.62
Leucina Leu L 2.36 9.60
Isoleucina Ile I 2.36 9.68
Metionina Met M 2.28 9.21
Grupos R aromticos
Fenilalanina Phe F 1.83 9.13
Tirosina Tyr Y 2.20 9.11 10.07
Triptofano Trp W 2.38 9.39
Grupos R polares sin carga
Serina Ser S 2.21 9.15
Treonina Thr T 2.11 9.62
Cisteina Cys C 1.96 10.28 8.18
Asparagina Asn N 2.02 8.80
Glutamina Gln Q 2.17 9.13
Grupos R cargados positivamente
Lisina Lys K 2.18 8.95 10.53
Histidina His H 1.82 9.17 6.00
siembra
muestras
Distancia hasta
donde migro el
solvente
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36
Arginina Arg R 2.17 9.04 12.48
Grupos R cargados negativamente
Aspartato Asp D 1.88 9.60 3.65
Glutamato Glu E 2.19 9.67 4.25












Grupos R aromticos
Grupos R alifticos
Glicina Alanina Prolina
Leucina Isoleucina
Grupos R polares sin carga
Grupos R cargados
Grupos R cargados
Serina Treonina
Asparagina
Fenilalanina Tirosina
Lisina Arginina
Aspartato
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Gua N 4
Tema: ENZIMAS
Objetivos
Que el estudiante conozca las protenas con actividades enzimticas y su
importancia en las diversas reacciones bioqumicas.

Introduccin terica
Las enzimas son biocatalizadores de naturaleza proteica (catalizan
reacciones bioqumicas que de otro modo se llevaran a cabo a
velocidades extremadamente lentas).
Desde el punto de vista qumico son protenas globulares, tienen pesos
moleculares que oscilan entre 12.000 y un milln.
Nomenclatura
Antiguamente las enzimas fueron nombradas atendiendo al compuesto
sobre el que actuaban, aadindole el sufijo -asa o haciendo referencia
a la reaccin catalizada.
As tenemos:
- ureasa, cataliza la hidrlisis de la urea
- amilasa, la hidrlisis del almidn
- lipasa, la hidrlisis de lpidos
- ADNasa, la hidrlisis del ADN
- ATPasa, la hidrlisis del ATP, etc.
En la actualidad, se ha adoptado una clasificacin y nomenclatura
sistemtica, en la que cada enzima tiene un nmero de clasificacin que
la identifica.
Clasificacin de las enzimas de acuerdo a su complejidad
De acuerdo a su complejidad las enzimas se clasifican como:
enzimas
simples conjugadas
formadas por una o mas
cadenas polipetidicas
contienen por lo menos un grupo no
proteico enlazado a la cadena
polipeptidica polipetidicas
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38
En las protenas conjugadas podemos distinguir dos partes:
- Apoenzima: Es la parte polipeptdica de la enzima.
- Cofactor: Es la parte no proteica de la enzima.
La combinacin de la apoenzima y el cofactor forman la holoenzima.
Los cofactores pueden ser:
* Iones metlicos: Favorecen la actividad cataltica general de la enzima,
si no estn presentes, la enzima no acta. Estos iones metlicos se
denominan activadores. Ejemplos: Fe
2+
, Mg
2+
, Cu
2+
, K
+
, Na
+
y Zn
2+

* La mayora de los otros cofactores son coenzimas las cuales
generalmente son compuestos orgnicos de bajo peso molecular, por
ejemplo, las vitaminas del complejo B son coenzimas que se requieren
para una respiracin celular adecuada.
Clasificacin de las enzimas segn su actividad
Tipo de enzimas Actividad
Hidrolasas Catalizan reacciones de hidrlisis.
Isomerasas
Catalizan las reacciones en las cuales un ismero se
transforma en otro, es decir, reacciones de
isomerizacin.
Ligasas Catalizan la unin de molculas.
Liasas
Catalizan las reacciones de adicin de enlaces o
eliminacin, para producir dobles enlaces.
Oxidorreductasas
Catalizan reacciones de xido-reduccin. Facilitan la
transferencia de electrones de una molcula a otra.
Transferasas
Catalizan la transferencia de un grupo de una
sustancia a otra.
Las propiedades de las enzimas derivan del hecho de ser protenas y de
actuar como catalizadores.
Como protenas, poseen una conformacin natural ms estable que las
dems conformaciones posibles. As, cambios en la conformacin suelen
ir asociados en cambios en la actividad cataltica. Los factores que
influyen de manera ms directa sobre la actividad de un enzima son:
pH: (asociados a la protonacin o deprotonacin de los grupo
carboxilos -COOH; amino -NH2; tiol -SH, etc.).
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Temperatura: asociados desnaturalizacin de las protenas (perdida
de la conformacin) por el calor.
Presencia o ausencia de cofactores
Modo de accin de las enzimas
La enzima (E), se combina con el substrato (S) formando el complejo de
transicin, enzima-substrato (E-S), mediante una reaccin reversible,
cuya energa de activacin es menor que la de la reaccin no catalizada.
Cuando se forma el producto de la reaccin (P), se regenera de nuevo la
enzima (E) de forma libre, la que puede combinarse de nuevo con otra
molcula de substrato (S).


Cintica de las reacciones enzimticas
La cintica enzimtica estudia la velocidad de las reacciones catalizadas
por enzimas. Estos estudios proporcionan informacin directa acerca del
mecanismo de la reaccin cataltica y de la especificidad de la enzima
La primera clave en cuanto al comportamiento enzimtico lo aportaron
Henri y Michaelis y Menten. Durante su trabajo observaron que cuando
mantenan constante |E| y variaban la |S| obtenan una relacin
hiperblica entre la velocidad y la |S|








La expresin matemtica de esta curva viene dada por la denominada
ecuacin de Michaelis-Menten, donde se muestra la relacin entre la
velocidad inicial (Vo) y la concentracin de sustrato, S.


E + S ES E + P
v
e
l
o
c
i
d
a
d
d
e
r
e
a
c
c
i

n
concentracin de sustrato
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Los trminos V
max
(velocidad mxima) y K
m
(constante de Michaelis) son
dos parmetros cinticos caractersticos de cada enzima, que pueden
determinarse experimentalmente.
La velocidad mxima (V
max
) es la expresin de la eficiencia del
funcionamiento enzimtico. La constante de Michaelis (K
m
) indica la
concentracin de sustrato a la cul la velocidad de reaccin es la mitad de
la velocidad mxima. Este parmetro es independiente de la
concentracin de enzima, y es caracterstico de cada enzima segn el
sustrato utilizado (si tiene varios). La K
m
tambin indica la afinidad que
posee la enzima por el sustrato, siendo sta mayor, cuanto menor es la
K
m
.
Hay enzimas que no obedecen la ecuacin de Michaelis-Menten. Se dice
que su cintica no es Michaeliana. Esto ocurre con los enzimas
alostricos (enzimas que contienen centros de unin para el sustrato y el
metabolito regulador), cuya grfica v frente a [S] no es una hiprbola, sino
una sigmoide.
Clculo de la K
m
y V
max


Para determinar grficamente los valores de K
m
y V
max
es ms sencillo
utilizar la representacin doble recproca (1/v
0
frente a 1/[S]
0
), ya que es
una lnea recta. Esta representacin doble recproca recibe el nombre de
representacin de Lineweaver-Burk. En la recta que se obtiene de este
grafico:
La pendiente es K
m
/ V
max

La abscisa en el origen (1/v
0
= 0) es -1/ K
m

La ordenada al origen (1/[S]
0
= 0) es 1/V
max







| |
max 0 max
1 1 1
V V
K
v
+ =
S
M
o
pendiente = K
m
/ V
max

ordenada
al origen = 1/V
max

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Inhibicin enzimtica
Existen sustancias que pueden impedir que la enzima desarrolle su
actividad cataltica, ralentizando o paralizando la reaccin enzimtica. A
estas sustancias se las denomina inhibidores enzimticos.
Se conocen dos tipos principales de inhibicin: la reversible y a la
irreversible. La primera implica una unin no covalente del inhibidor y,
por lo tanto, siempre puede revertirse. En la inhibicin irreversible, el
inhibidor se une al enzima de forma covalente y permanente.
Inhibicin reversible: los distintos modelos de inhibicin reversible
implican la inhibicin competitiva la no competitiva.
El inhibidor competitivo, es una sustancia similar en estructura al
sustrato, con quien compite por el sitio activo de la enzima. Como
consecuencia, aunque la velocidad mxima no se altera, para alcanzarla
sera necesario poner ms cantidad de sustrato en el medio de reaccin,
lo que se refleja, en la correspondiente curva de Michaelis, como un
aparente aumento de la K
m
. La representacin de dobles inversos permite
observar claramente este tipo de inhibicin.
El inhibidor no competitivo puede combinarse tanto con la enzima libre
como con el complejo enzima-sustrato, sin afectar al sitio activo de la
enzima. Al no unirse el inhibidor al sitio activo, no se afecta la afinidad de
la enzima por el sustrato y en este caso la K
m
no se altera y la V
max

disminuye, como puede observarse en la representacin de dobles
inversos el punto de corte de las rectas ahora esta sobre el eje X, (cuando
y=0), mientras que hay distintos punto de corte con el eje Y, como se
aprecia la V
max
disminuye con el inhibidor.
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N H
2
C NH
2
O
CH
2
C HOOC
NH
2
COOH
CH CH HOOC COOH
CH
3
C CH
3
O
CH
3
C H
O
CH
3
C H
O
H
2
O
CO
2
+ 2 NH
3
+ NH
3
a)
b)
c)
d)
E
CoE
+ CO
2
+ NADH CH
3
CH
2
OH + NAD
+
E

Problemas y ejercicios
1. Indique cual o cuales de las siguientes afirmaciones son correctas:
a) Las enzimas estn compuestas primariamente de polipptidos, que son
polmeros de aminocidos.
b) Las enzimas estn constituidas por glcidos simples unidos mediante
enlaces glicosdicos.
c) las enzimas estn constituidas por cidos grasos unidos por unin
estrica a un polialcohol
2) Indique cuales de las siguientes alternativas son correctas:
a) Apoenzima = Holoenzima + coenzima o cofactor.
b) Holoenzima= cido graso + alcohol polihidroxilado + base nitrogenada.
c) Holoenzima = Apoenzima + coenzima o cofactor.
d) La apoenzima le asigna especificidad sobre el sustrato.
e) La coenzima aporta especificidad de funcin.
f) La apoenzima aporta especificidad de funcin.
g) La coenzima asigna especificidad sobre el sustrato.
3. Cmo se clasifican las enzimas y qu funciones cumplen?
4. En cada una de las siguientes reacciones identifique la enzima como
oxidorreductasa, transferasa, hidrolasa,
liasa,
isomerasa o ligasa
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(CoE significa coenzima).
5. Defina los siguientes trminos:
a) ES e) oxidorreductasa.
b) cofactor. f) estreoespacificidad.
c) coenzima. g) sitio activo.
d) deshidrogenasa. h) teora del acoplamiento inducido.
6. Marque la respuesta correcta: Para sobrepasar la barrera energtica
entre reactivos y productos, se debe proveer energa para que la reaccin
comience. Esta energa se denomina:
a) Energa de activacin
b) Energa de iniciacin
c) Energa de reaccin
d) Energa cintica
e) Energa potencial
7. Indique cual, o cuales, de las afirmaciones presentadas son correctas
para completar la siguiente expresin: La actividad biolgica de los
enzimas:
a) No se ve afectada por cambios de pH
b) Vara con los cambios de temperatura
c) No se ve afectada por cambios de temperatura
d) Es alterada por cambios de pH
8. Indique cual ecuacin, entre las propuestas, representa a las
reacciones catalizadas por enzimas:
9. Describa la teora llave-cerradura y el modelo de ajuste inducido
10. La grfica muestra los resultados de la velocidad de reaccin frente a
la concentracin del sustrato para:
a. una enzima en presencia de un inhibidor competitivo
b. una enzima en presencia de un inhibidor no-competitivo
E
a) - A
+
B
E
C
+
D
b) -
+
R
E
+ P
c) - E
+
S ES E
+
d) - E
+
S EP E
+ P
e) - S
E
P
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c. una enzima alostrica
d. una enzima en presencia de un inhibidor acompetitivo
e. dos enzimas compitiendo por el mismo sustrato
11. La grfica que se muestra a continuacin representa la variacin de la
velocidad de reaccin frente a la concentracin del sustrato.
Analizando la misma, responda: la razn por la que la curva alcanza una
meseta y la velocidad no sigue aumentando para mayores
concentraciones de sustrato es porque
a. El centro activo del enzima est saturado de sustrato.
b. Hay un inhibidor competitivo presente.
c. Hay un inhibidor no competitivo presente.
d. La enzima alostrica est bloqueada en una conformacin inactiva.
e. Todo el sustrato ha sido convertido en producto.
12. Si dos enzimas tienen la misma V
max
, para una cantidad dada de
enzimas, cual de ellas tendr mayor afinidad por los sustratos de la
reaccin, la de mayor o la de menor K
M
?
13. En la determinacin experimental del valor de la V
max
para una
determinada enzima (PM= 20000) se hallo que era 28 moles por minuto
para 10 g de muestra del enzima. Calcule el nmero de recambio.
14. En presencia de una cantidad saturante de sustrato, 1.4 mg de una
enzima dan una velocidad de 6.2 milimoles de producto formado por
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minuto. Si el PM de la enzima es 52500 g/mol Cul es la actividad de la
enzima?
15. En el estudio de la actividad cataltica de una enzima se obtuvieron los
siguientes datos experimentales, a partir de los cuales deben
determinarse los valores de K
M
y V
max

S
(mM)
Producto formado
(mg/min)
1.5 0.21
2.0 0.24
3.0 0.28
4.0 0.33
8.0 0.40
16 0.45

16. La tabla a continuacin muestra los resultados obtenidos de la cintica
de una enzima en funcin de la concentracin del sustrato y en presencia
y ausencia de un inhibidor (I) de concentracin 2mM (1 mM = 1 x 10
-3
M)







S
(M)
Velocidad
(M/min)
Sin inhibidor Con inhibidor
1 2.5 0.77
2 4.0 1.25
5 6.3 2.00
10 7.6 2.50
20 9.0 2.86
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a) Cules son los valores de K
M
y V
max
en ausencia de inhibidor?
b) De que tipo de inhibicin se trata?
17. A partir de los siguientes datos de una reaccin enzimtica
determnese si el inhibidor se comporta de modo competitivo o no
competitivo.






18. La siguiente tabla contiene 3 conjuntos de datos para una reaccin
catalizada por 10 pg (picogramos) de enzima. El primer conjunto
pertenece a la reaccin enzima-sustrato solamente y los otros dos
corresponden a la reacci6n en presencia de dos inhibidores diferentes.
Representar los datos segn Michaelis (v en funcin de [S]) y las inversas
(1/v en funcin 1/[S]
a) Indicar K
M
de la enzima y para cada inhibidor.
b) Indicar que tipo de inhibiciones son.
c) Calcular V
max
. para cada caso.
S
(mM)
Velocidad
(pmoles/min)
Sin inhibidor Inhibidor (A) Inhibidor (B)
1 2.5 1.17 0.77
2 4.0 2.10 1.25
5 6.3 4.00 2.00
10 7.6 5.70 2.50
20 9.0 7.20 2.86

S
(mM)
Velocidad
(M/h)
Sin inhibidor Con inhibidor
2.0 13.9 8.8
3.0 17.9 12.1
4.0 21.3 14.9
10.0 31.3 25.7
15.0 37.0 31.3
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19. Se ha purificado una enzima a partir de hgado de rata. En la
purificacin se parti de 500 ml de extracto crudo que contena 2.000 mg
de protena. 50 l de ese extracto crudo catalizaban, en condiciones
ptimas de ensayo, la produccin de 1 nmol de producto en 1 segundo.
Tras varios pasos de purificacin se obtuvieron 2 ml de una preparacin
de enzima pura que contena 3 mg de protena por mililitro y presentaba
una actividad total de 120 U.
a) Calcular la concentracin de la enzima en el extracto crudo en U/ml y
katales/ml.
b) Determinar la actividad especfica, en U/mg de protena, en el extracto
crudo.
c) Calcular la recuperacin del proceso de purificacin y el nmero de
veces que se ha purificado la enzima.
20. La descarboxilacin enzimtica de un |-cetocido, ensayada en 1 ml
de mezcla de reaccin, procede con las siguientes velocidades iniciales a
las concentraciones de sustrato que se citan. A partir de estos datos
calcular V
mx
y K
M
de esta reaccin enzimtica.

[cetocido]
(M)
v
o

(moles CO
2
/min)
2.50 x 10
-3
0.588
1.00 x 10
-3
0.500
0.71 x 10
-3
0.417
0.53 x 10
-3
0.370
0.25 x 10
-3
0.252

21. La velocidad inicial de una reaccin enzimtica se determin a
distintas concentraciones de sustrato. Calcular K
M
y V
max
por los distintos
mtodos grficos a partir de los datos que se relacionan a continuacin:
[S]
(M)
v
o
(mmol/l min)
2.3 x 10
-3
0,95
3.0 x 10
-3
1,13
4.5 x 10
-3
1,42
12.0 x 10
-3
2,14
38.0 x 10
-3
2,64

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22. Para estimar los parmetros cinticos de una determinada enzima se
realizaron una serie de ensayos utilizando 20 l de una preparacin de la
misma y distintas concentraciones de su sustrato. Los valores de v
o

obtenidos se recogen en la tabla siguiente:
[S]
(M)
v
o

(nmol/ml min)
3.15 10.0
4.16 12.5
8.30 20.0
12.50 25.0
Calcular las actividades total y especfica de la preparacin enzimtica,
sabiendo que su volumen total era de 10 ml y su contenido en protena de
200 g/ml.
23. Se dispone de una preparacin de una enzima de la que se quiere
conocer sus parmetros cinticos. Para ello se realizan varios ensayos en
los que se cambia la concentracin del sustrato y se obtienen los
siguientes resultados:
[S] (mM) v
o

(nmoles. ml
-1
. min
-1
)
0,33 24,98
0,50 33,33
1,00 50,00
2,00 66,67
Cules son la K
M
y la V
mx
de la enzima? Si para los ensayos se haba
utilizado 20 l de la preparacin enzimtica y se sabe que sta tiene una
concentracin de protena de 5 mg/ml, cul es la actividad especfica de
dicha preparacin? qu volumen de ella se habr de aadir a 1 ml de
mezcla de reaccin con [S] = 0,2 M para que se formen 4,5 moles de
producto en 10 min?
24. La K
M
de cierta enzima para su sustrato es 75 M. Cuando se ensaya
con una concentracin inicial de sustrato de 50 mM, se observa que al
cabo de 15 minutos se ha transformado el 30% de sustrato.
a) Calcular la velocidad mxima de la reaccin
b) Cuando se ensaya la actividad con distintas concentraciones de
sustrato, en presencia de un cierto inhibidor a una concentracin de 50
M, y se representan grficamente los resultados mediante la
representacin de dobles inversos, la pendiente de la recta obtenida es la
misma que cuando el experimento se hace en ausencia del inhibidor, pero
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49
la ordenada en el origen aumenta al doble. Qu tipo de inhibicin se ha
producido? Calcular la K
i
.
c) Calcular el grado de inhibicin cuando el ensayo se hace con una
concentracin de sustrato de 150 M, en presencia de 100 M del
inhibidor anterior.
25. Una reaccin enzimtica se lleva a cabo, a distintas [S], en ausencia
y presencia de dos inhibidores diferentes (I
a
e I
b
. Decir qu tipo de
inhibidor es cada uno y hallar todos los parmetros cinticos.
[S]
(mM)
v
0

(mol/l min)
v
a
'
(+ I
a
= 1,5 mM)
(mol/l min)
v
b
'
(+ I
b
= 1,5 mM)
(mol/l min)
0.2 1.67 0.62 0.83
0.4 2.86 1.18 1.43
0.8 4.44 2.11 2.22
1.6 6.15 3.48 3.08
3.2 7.62 5.16 3.81

26. Una enzima se ensay a distintas concentraciones de su sustrato
especfico en ausencia y presencia de un inhibidor ([I]= 1 mM),
obtenindose los resultados que se presentan en la tabla. Calcular la K
M
y
la Vm
x
en ambos casos y la Ki para el inhibidor.

[S]
(mM)
v
0

sin Inhibidor
(mol/ min)
v'
0

con Inhibidor
(mol/ min)
0,02 8,33 6,25
0,05 16,67 10,00
0,10 25,00 12,50
0,50 41,67 15,62
0,80 44,44 16,00

27. Al ensayar la actividad de una enzima con concentraciones saturantes
de sustrato se obtuvo una velocidad de catlisis de 300 mol/l. min en
ausencia de inhibidores, y de 160 mol/l min en presencia de 10 M de un
cierto inhibidor no competitivo. Para [S] = 10 mM y en ausencia del
inhibidor se obtuvo una velocidad de 125 mol/l min. Calcular K
M
y V
mx
,
K'
M
, Ki y el grado de inhibicin para [I] = 10 M y [S] = 10 mM. Qu
concentracin de inhibidor conseguira un grado de inhibicin de 0,9 para
la misma [S]?
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50
28. Se ha estudiado cinticamente la reaccin catalizada por la
muermasa. Tras llevar a cabo una serie de ensayos enzimticos los datos
de concentracin de sustrato y v
o
fueron analizados mediante una
representacin de dobles inversos y se obtuvo una recta que cortaba al
eje Y en el valor 0,8 (M/min)
-1
y al eje X en el valor -0,02 (M)
-1
. Se ha
estudiado igualmente el efecto del |-muermol y la muermirulina,
sustancias supuestamente inhibidoras, sobre el transcurso de la reaccin.
En ambos casos la representacin de los datos por el mtodo de dobles
inversos daba como resultado una recta que cortaba al eje Y en el valor
1,6 (M/min)
-1
. Las rectas se diferenciaban en el valor de sus pendientes,
que era de 40 min para el |-muermol y de 80 min para la muermirulina.
a) Cules son la K
M
y la V
mx
de la reaccin sin inhibidor?
b) Qu tipo de inhibidores son la muermirulina y el |-muermol?
c) Si para los ensayos con inhibidor la concentracin de stos era de 5
mM (en ambos casos) cules son los valores de las Ki de estos
inhibidores?
d) Calcula el grado de inhibicin a una concentracin de sustrato de 0,1
mM para el caso del -muermol.
29. Un extracto enzimtico crudo contiene 20 mg de protena/ml. 20 l de
ese extracto crudo catalizan la produccin de 3 moles de producto en 1
min, en condiciones ptimas de ensayo. Calcular
a) la concentracin de la enzima en el extracto crudo en U/ml
b) la actividad especfica de esta enzima en el extracto en U/mg de
protena
c) la actividad total del extracto si tenemos 100 ml del mismo.
30. Se dispone de dos preparaciones distintas de una enzima cuyo PM=
40.000. Una de las preparaciones constituye un extracto crudo celular y
en ella la actividad especfica que se detecta es de 0,4 U/mg de protena.
La otra constituye una preparacin de la enzima pura y su actividad
especfica es de 65 U/mg protena. Cul de las dos preparaciones
utilizaras para calcular el nmero de recambio de la enzima? Justifica tu
respuesta. Calcula el valor del mismo.
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51
31. Una preparacin enzimtica de glutamato deshidrogenasa (P.M.=
60.000) contiene 10 mg de protena por ml. Si 20 l de esta preparacin
se ensayan en condiciones estndar ptimas, pero variando la
concentracin de sustrato, se obtienen las velocidades que se indican en
la tabla para los casos de ausencia y presencia de un inhibidor ([I] = 2
mM).
[S]
(mM)
v
o
(mol/ml min)
Sin Inhibidor
Con Inhibidor
(2 mM)
0,25 2,00 0,47
0,33 2,48 0,63
0,50 3,33 0,91
1,00 5,00 1,67
2,00 6,67 2,8

a) Determinar la V
mx
y la K
M
de la enzima en presencia y ausencia del
inhibidor. Decir de qu tipo de inhibicin se trata.
b) Calcular la actividad enzimtica de la preparacin de glutamato
deshidrogenasa, expresada como U/ml.
c) Cul es la actividad especfica de la glutamato deshidrogenasa en la
preparacin enzimtica?
d) Considerando que la preparacin enzimtica es pura, calcular el
nmero de recambio de la glutamato deshidrogenasa.
e) Se llevan a ensayo 50 l de la preparacin enzimtica, en presencia de
0,5 M de sustrato. Calcular la cantidad de sustrato desaparecido en 3 min
(el volumen estndar de reaccin es de 1 ml).










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53
Gua N 5
Tema: CIDOS NUCLEICOS
Objetivos
Que el estudiante conozca la estructura y funciones de los cidos
nucleicos para comprender el mecanismo de la herencia en los seres
vivos.

Introduccin terica
Los cidos nucleicos, cido desoxirribonucleico ADN y cido
ribonucleico ARN, son las molculas encargadas de almacenar y
transferir la informacin gentica.
Ambos cidos son polmeros de unidades denominadas nucletidos.
Los nucletidos o mononucletidos contienen tres componentes
caractersticos:
1) Una base nitrogenada

2) Un azcar de cinco tomos de
carbono: ribosa (ARN) o desoxiribosa
(ADN)

3) Un grupo fosfato

La molcula sin el grupo fosfato se denomina nuclesido.
Componentes de los nucleotidos
Bases nitrogenadas: se encuentran dos clases de bases nitrogenadas:
las bases pricas (adenina: y guanina) y las bases pirimidnicas
(citosina, timina, uracilo)
Azucares componentes: se encuentran presentes solo dos azucares de
cinco tomos de carbono o pentosas:
D-Ribosa: presente en los mononucletidos derivados del ARN
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54
2-Desoxi-D-Ribosa: mononucletidos derivados del ADN

























Nuclesidos: la unin entre la base nitrogenada y el azcar ocurre en N-
1 de las de las pirimidinas o el N-9 de las purinas con el tomo de C-1 de
la pentosa.
Todos los nuclesidos derivados de los cidos nucleicos son | anmeros
Nucleotidos: Son esteres fosfricos de los nuclesidos en los que el
cido fosfrico esterifica a uno de los grupos hidroxilos libres de la
pentosa. Puesto que en las pentosas existen dos o mas grupos hidroxilos
libres, el grupo fosfato puede hallarse en mas de una posicin:
N
C H
N
CH
CH
C
H
N
C H
N
C
H
C
C
N
H
N
CH
N
C H
N
C
C
C
N
H
N
CH
NH
2
N H
C
N
C
C
C
N
H
N
CH
O
N H
2
OH
OH
O
CH
2
OH
H
H H
H
H
1'
2'
3'
4'
5'
OH
OH
O
CH
2
OH
H
H H
OH
H
1'
2'
3'
4'
5'
N
C
N
H
CH
CH
C
NH
2
O
N H
C
N
H
CH
C
C
O
O
CH
3
N H
C
N
H
CH
CH
C
O
O
1
2
3
4
4
5
6
Pirimidina Purina
1
2
3
4
4
5
6
7
8
9
|-D-ribosa |-2-Desoxi-D-Ribosa
Bases Pricas
Adenina Guanina
Bases Pirimidinicas
Citosina Timina Uracilo
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55
Ribonucletidos: existen tres posiciones: 2, 3, 5. En las celulas
predominan los grupos en posicion 5.
Desoxirribonucletidos: solo dos posiciones: 3 y 5. Ambas existen
biolgicamente.
Acidos nucleicos (polinucleotidos)
Los polinucletidos son mononucletidos unidos covalentemente
mediante
una unin fosfodiester. Los grupos 5-monofosfato se unen al grupo
hidroxilo en
posicin C-3 del nucletido vecino.

















Por convencin la estructura de una porcin de acido nucleico se escribe
desde el extremo 5 hacia el extremo 3.
Algunas representaciones simples de polinucleotidos son:
pA-C-G-T-AOH, pApCpGpTpA, pACGTA
ADN: Apareamiento de las bases
En las hebras enfrentadas adenina (A) se complementa con timina (T), y
guanina (G) se complementa con citosia (C). A menudo los pares de
N
NH
O
O
C H
3
O
CH
2
H
H
OH
H
H
H
O P
O
-O
O
N
NH
N
N
O
CH
2
H
H H
H
H
O P
O
-O
O
N
N
NH
2
O
CH
2
H
H H
H
H
O P
O
-O
O
N
N
N
N
O
CH
2
H
H H
H
H
O P
O
-O
O
NH
2
O
O
NH
2
1'
2'
3'
4'
5'
extremo 5'
1'
2'
3'
4'
5'
1'
2'
3'
4'
5'
1'
2'
3'
4'
5'
Adenina
Citosina
enlace
fosfodiester
extremo 3
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bases son mencionados como A-T o G-C, adenina a timina y guanina a
citosina.
A-T estn unidas por dos puentes Hidrgeno y C-G por tres.

















Se aparean una base prica con una pirimdinica
ARN: tipos
ARN mensajero (ARN
m
)
Se sintetiza sobre un molde de ADN en el ncleo, por el proceso de
trascripcin, y pasa al citoplasma sirviendo de pauta para la sntesis de
protenas (traduccin).
ARN de transferencia (ARN
t
):
Participa en la sntesis de protenas transportando los aminocidos libres
del citoplasma hacia el lugar de ensamblado de protenas. Existen ARNt
especficos para cada uno de los aminocidos. Son los mas pequeos
ARN ribosomal (ARN
r
)
Est presente en los ribosomas, orgnulos intracelulares implicados en la
sntesis de protenas. Su funcin es leer los ARN
m
y formar la protena
correspondiente.
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El cdigo gentico y la biosntesis de protenas
Cdigo gentico: relacin entre la secuencia de bases del ADN o su
trascripcin en el ARN y la secuencia de aminocidos de una protena
Una secuencia de tres bases, denominada codon, corresponde a un
aminocido
Cada codon corresponde a un aminocido, hay 4 bases entonces hay 64
posibilidades de combinacin, pero solo hay 20 aminocidos, por lo tanto
el cdigo esta degenerado, (algunos codones diferentes pueden
corresponder a un mismo aminocido).
De los 64 codones, tres codifican para la terminacion (UAA, UAG, UGA).
El codon AUG tiene una funcin doble, es el codon iniciador y codifica
para el aminoacido Met,
Tabla: El cdigo gentico; conversin de los codones en aminocidos

Primera base
(extremo 5)
Segunda
base
Tercera base (extremo 3)
U C A G
U
U Phe Phe Leu Leu
C Ser Ser Ser Ser
A Tyr Tyr Final Final
G Cys Cys Final Trp
C
U Leu Leu Leu Leu
C Pro Pro Pro Pro
A His His Gln Gln
G Arg Arg Arg Arg
A
U Ile Ile Ile Met (inicio)
C Thr Thr Thr Thr
A Asn Asn Lys Lys
G Ser Ser Arg Arg
G
U Val Val Val Val
C Ala Ala Ala Ala
A Asp Asp Glu Glu
G Gly Gly Gly Gly

Problemas y ejercicios
1. Dibuje la formula estructural de cada uno de los siguientes nuclesidos
a) citidina b) desoxiadenosina c) uridina d) desoxigaunosina
Indique: tipo de nucletido y tipo de base nitrogenada
2. Escriba la estructura de 5-monofosfato de guanosina
3. Escriba la estructura para dCMP y dGMP
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4. Dibuje la estructura de los siguientes nucletidos derivados del ADN:
a. A-T b. G-T c. A-C
5. Suponga la siguiente secuencia de bases, para una de las ramas del
ADN: AGCCATGT (descritas desde 5 hasta 3) Cul ser la secuencia
de bases de la otra rama?
6. Como se unen los cordones en el ADN, segn Watson y Crick?
7. lndicar que uniones contribuyen a la formacin de un cido nucleico.
8. En que se diferencian el ADN y el ARN?
9. Que significa "bases complementarias"?
10. Escribir la secuencia complementaria de:
a) GATCAA b) ACGCGT c) TCGAAC d) TACCAT
11. Que es el cdigo gentico?
12. Que es una mutacin?
13.a) Nombre las bases pricas y pirimidnicas que forman parte del DNA.
b) Indique la principal diferencia entre los tipos de bases pricas y
pirimidnicas.
14. En la figura se presenta una hebra simple de DNA:
a. Identifique un nucletido.
b. Cmo reconoce que la hebra es de DNA?
c. Indique los extremos 3' y 5' y los grupos de cada extremo.
N
NH
O
O
C H
3
O
CH
2
H
H
OH
H
H
H
O P
O
-O
O
N
NH
N
N
O
CH
2
H
H H
H
H
O P
O
-O
O
N
N
NH
2
O
CH
2
H
H H
H
H
O P
O
-O
O
N
N
N
N
O
CH
2
H
H H
H
H
O P
O
-O
O
NH
2
O
O
NH
2
1'
2'
3'
4'
5'
extremo 5'
1'
2'
3'
4'
5'
1'
2'
3'
4'
5'
1'
2'
3'
4'
5'
Adenina
Citosina
Guanina
Timina
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d. Seale un enlace fosfodister.
15. Cules son las fuerzas estabilizadoras de la doble hlice?
16. Si el contenido en C de un DNA doble hebra es de 15%, cul ser el
contenido de A?
17. La composicin (en unidades de fraccin molar) de una de las
cadenas de ADN de doble hlice es: A = 0.30 y G= 0.24. Qu puede
decirse de las bases T y C de la misma cadena?
18. Con los datos del % C-G y A-T, ordene las molculas de DNA segn
su T
m
(temperatura media de fusin) de menor a mayor. Indique en que
se bas para ordenarlas
DNA 1. Contenido C-G 80%
DNA 2. Contenido A-T 40%
DNA 3. Contenido A-T 20%
DNA 4. Contenido G-C 40%
19. Dado el siguiente oligonucletido de RNA, Qu tipo de
rompimiento(si lo hay) ocurrira en este segmento si el RNA es tratado con:
a) NaOH b) ribonucleasa pancretica A c) Ribonucleasa T1
d) Nucleasa S1 e) exonucleasa III.
pGpGpCpUpApCpGpUpApGpApUpCpA
20. Se preparo un polirribonulceotido a partir del tetranucleotido UAUC.
Cuando se someti a las condiciones de sntesis de pptidos, se obtuvo el
polipptidos (Tyr-Leu-Ser-Ile) Cules son los codones para estos cuatro
aminocidos?
21. Una rama de ADN tiene la siguiente secuencia:
5 3
-CCAUGCAGGAUGCCAAACUAAUUAACUAGC-
Cul es el pptido que producir?
(no olvide los codones de iniciacin y terminacin)
22. La cadena polipeptidica de la mioglobina contiene 153 residuos de
aminocidos; entonces cuantos pares de bases estarn presentes en el
gen que especifica la configuracin de este polipptido?
23. Escriba la secuencia de nucletidos, dentro de un gen de ADN, que
especificar la siguiente secuencia de aminocidos en el polipptido
codificado por el gen:
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.ala-asp-trp-gli-pro
Qu sucedera si se borrase la primera U de la secuencia?





























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61
Gua N 6

Tema: BIOENERGTICA Y METABOLISMO DE CARBOHIDRATOS
Objetivos:
Que el estudiante:
- Conozca los principios que rigen el metabolismo celular.
- Interprete la manera como ocurre la distribucin, asimilacin y
almacenamiento de los productos de la fotosntesis

Introduccin terica
La bioenergetica es el estudio cuantitativo de las transformaciones de
energa que permite mantener los organismos vivos, o sea los cambios
energticos que ocurren en el ambiente celular.
La bioenergtica utiliza los conceptos de la termodinmica, especialmente
la energia libre de Gibbs AG. La energa libre representa la cantidad de
energa libre capaz de realizar un trabajo a temperatura y presin
constante.




AG y espontaneidad de las reacciones
De acuerdo al signo de AG es posible predecir si una reaccin podr
ocurrir espontneamente o no:
AG < 0: reaccin exergnica, libera energa, termodinmicamente favorable
(espontneas)
AG > 0: reaccin endergnica, necesita energa, termodinmicamente
desfavorables (no espontneas)
AG = 0: sistema esta en equilibrio, no hay tendencia a experimentar ningn
cambio neto posterior.
Cambios de energa libre estndar: AG
0

El smbolo AG
0
se refiere al cambio de energa libre estndar, donde las
concentraciones de los reactivos y productos son 1M y solo depende de
los cambios en temperatura y presin.

Reactivos Productos
estado inicial estado final
G
i
G
f
AG= G
f
- G
i
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AG
0
y la constante de equilibrio de una reaccin estn relacionadas segn
las ecuacin:


donde R: constante universal de los gases (0.082 l.atm/K.mol) y T
temperatura en grados kelvin.
Si AG = 0 (en el equilibrio): AG = -RT ln K
eq

Para las reacciones de oxido-reduccin: AG
0
= -nF c
0
AG
0
= -nFc
0

Donde c: potencial de celda (V), n: numero de elctrones, F: constante de
Faraday.
Muchas reacciones, especialmente las bioqumicas, implican la presencia
de iones H
+
en estos casos se define AG
0
que corresponde a soluciones
de pH=7.
Acoplamiento energetico
Si una reaccin exergnica ocurre en presencia de una reaccin
endergnica la produccin de energa de la primera sirve para llevar a
cabo la segunda, este hecho se conoce como acoplamiento energetico
En las celulas existen compuestos de alto contenido energtico, que se
caracterizan por tener enlaces que al romperse liberan una alta cantidad
de energa la cual sirve para que se lleven a cabo otras reacciones que la
precisan. Dichos compuestos se conocen como molculas de alta
energa:
Adenosin trifosfato (ATP): conocida como la moneda energtica de la
clula. Molcula transportadora de grupos fosfato. Al formar ATP las
clulas conservan la energa qumica liberada en las reacciones qumica
que la producen y luego, por degradacin del ATP utilizan esta
bioenergia para mantener los eventos de sntesis y otros procesos
celulares.
Nicotinamida adenin dinucleotido (NADH): molcula transportadora de
electrones, rica en energa y tomos de hidrgeno, participa en muchas
reacciones en el citoplasma
| | | |
| | | |
b a
d c
0
B A
D C
ln RT G G + =
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Flavin-adenin-dinucletido (FADH
2
): Transportador de electrones, rico
en energa e hidrgeno, participa en reacciones que se llevan a cabo en
la mitocondria.
Metabolismo
Se denomina metabolismo a la suma total de todas las reacciones que
tienen lugar en las clulas.
El metabolismo tiene lugar a travs de secuencias de reacciones
consecutivas catalizadas enzimticamente utilizando muchos
intermediarios qumicos
Caractersticas
Las reacciones enzimticas estn organizadas en las rutas metablicas
Un precursor se convierte en producto a travs de intermediarios:
metabolitos.
Cada reaccin ocasiona un pequeo cambio especfico en la
estructura qumica.
Funciones:
Degradar molculas nutrientes para obtener energa qumica y para
convertirlas en molculas propias de la clula.
Polimerizar precursores monomricos en macromolculas tipo
biopolmeros.
Sintetizar y degradar biomolculas con funciones especializadas y
necesarias para la clula
Clasificacin de los procesos metablicos
El metabolismo puede clasificarse en:
Procesos catablicos (exergnicos): Son todos lo que degradan, en el
caso de los humanos, alimentos: carbohidratos, protenas y lpidos.
Procesos anablicos (endergonicos): toman molculas pequeas y
sintetizan macromolculas.
Ambos son interdependientes y sus actividades estn coordinadas, tal
como lo muestra el siguiente esquema:

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64


Rutas metablicas
En el esquema siguiente se resumen las vas principales del catabolismo
y el anabolismo en la clula.

METABOLISM
Anabolism Catabolismo
Nutrientes
conteniendo energa

Carbohidratos
Lpidos
Protenas
Productos finales
sencillos

CO
2
H
2
O
NH
3


Cat abol i smo
energa
qumica
Macromoleculas

Protenas
Polisacridos
Lpidos
cidos Nucleicos


Anabol i smo
Molculas precursoras

Aminocidos
Carbohidratos
cidos grasos
Bases nitrogenadas
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Problemas y ejercicios
1. Explique el termino Reacciones Acopladas. Cul es su utilidad?
2. a) A que se denominan compuestos ricos en energa o de Alta
energa. Ejemplos.
b) Que papel desempean en el metabolismo?
3.a) En la molcula de ATP indique los enlaces de alta energa.
b) La hidrlisis del ATP en AMP + 2Pi cuntas Kcal. libera?
c) Por qu el AMP no es usado como fuente de energa?
4. Qu significa que una reaccin tenga AG negativo (AG < 0) o AG
positivo (AG > 0)?
5. Calcular las variaciones de energa libre estndar de las siguientes
reacciones catalizadas por enzimas metablicamente importantes, a 25C
y pH 7, a partir de las constantes de equilibrio dadas.
a) Glutamato + oxalaceto aspartato + o-cetoglutarato K
eq
= 6.8
Aspartato
aminotransferasa

b) Dihidroxiacetona fosfato gliceraldehdo-3-fosfato K
eq
= 0.0475
Triosafosfato
isomerasa

c) Fructosa-6-fosfato + ATP fructosa-1,6-bifosfato + ADP K
eq
= 254
fosfofructo
quinasa

6. Resuma las caractersticas del NAD y FAD e indique que funciones
cumplen
7. En las reacciones siguientes se representa la sntesis e hidrlisis del
ATP. a. Complete en cada caso el signo de AG. b. Cul es el valor en
Kcal. de G de cada reaccin?
8. Al sintetizar ATP las clulas conservan parte de la energa qumica
obtenida de reacciones de degradacin que liberan energa. Al hidrolizar
el ATP se obtendr energa que ser usada en diversos procesos
celulares. D ejemplos de dos procesos biolgicos de este tipo.
ADP + P ATP + H
2
O AG
ATP + H
2
O ADP + P AG
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9. Cul de las siguientes afirmaciones en relacin con el ATP NO es
cierta?
a) El ATP es la moneda energtica que enlaza procesos biolgicos
productores de energa (catabolismo) y consumidores de energa
(anabolismo)
b) La variacin de energa libre en la hidrlisis de ATP es grande y
positiva (G=30kJ/mol)
c) Otros compuestos con energa de hidrlisis elevada son: 1,3-
bifosfoglicerato (1,3BPG); fosfoenol piruvato (PEP); tiosteres (acetil-CoA,
succinil-CoA)
d) La transferencia de un grupo fosfato desde un compuesto de alta
energa para sintetizar ATP se denomina fosforilacin a nivel de sustrato
e) En la fosforilacin oxidativa se produce la transferencia de electrones al
O
2
acoplado a la biosntesis de ATP en la membrana mitocondrial
10. Defina metabolismo e indique las diferencias entre anabolismo y
catabolismo desde el punto de vista de la variacin de energa libre.
11. En la gliclisis hay dos reacciones que precisan una molcula de ATP
y otras dos que producen una molcula de ATP. Siendo esto as cmo
puede la gliclisis ofrecer, en la degradacin de glucosa a lactato, una
produccin neta de dos molculas de ATP por cada una de glucosa?
12. En cierto proceso metablico se producen seis molculas de
gliceraldehido tres fosfato que se incorporan a la glucolisis. Cuntas
molculas de piruvato se forman?
13. Dos molculas de maltosa son hidrolizadas y los productos
resultantes se incorporan a la glucolisis. Cuntas molculas de piruvato
se originan?
14. Cunto ATP se produce en la oxidacin completa de tres molculas
de acetil-CoA?
15 A continuacin se muestra un esquema simplificado de la gliclisis:
a) Identificar los enzimas que catalizan cada una de las reacciones de la
gliclisis;
b) Qu reacciones requieren energa en forma de ATP?
c) Cules son fosforilaciones a nivel de sustrato?
d) Cuales reducen NAD+?
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glucosa
glucosa-6-fosfato
fructosa-6-fosfato
fructosa-1,6-bisfosfato
gliceradehdo-3-fosfato dihidroxiacetona fosfato
1,3-bisfosfoglicerato
2-fosfoglicerato
fosfoenolpiruvato
3-fosfoglicerato
piruvato
e) Cuales son irreversibles?
f) Cules estn catalizadas por enzimas reguladoras?

16. En la siguiente reaccin qumica:

a. Qu reactivo pierde electrones y quin los gana?
b. Qu tipo de reaccin es?
17. Escribe la reaccin de formacin de la glucosa-1-fosfato a partir de
glucosa y ATP. De qu tipo de reaccin qumica se trata?
18. Que localizacin intracelular tiene el ciclo de Krebs?
19. Que reacciones del ciclo del cido ctrico (o ciclo de Krebs) se
corresponden con la secuencia lineal siguiente:
compuesto saturado compuesto insaturado alcohol cetona
Ilustrar con formulas.
CH
3
C
O
COOH CH
3
CH
OH
COOH + XH
2
+ X
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C
CH
2
COO-
O
COO-
oxalacetato
CH
2
C
COO-
CH
2
COO-
COO- O H
citrato
CH
3
COSCoA
Acetil
HSCoA
CH
2
C H
COO-
CH
COO-
COO-
O H
isocitrato
CH
2
CH
2
COO-
C
COO-
O
o-cetoglutarato
NAD
NADH.H
CO
2

CH
2
CH
2
COO-
C
O
SCoA
succinil-CoA
NAD
NADH.H
HSCoA
CO
2

CH
2
CH
2
COO-
COO-
succinato
GDP
GTP
HSCoA
CH
C H
COO-
COO-
fumarato
CH
CH
2
COO-
COO-
O H
FAD
FADH.H
malato
NAD
NADH.H
20. La reaccin de abastecimiento ms importante del Ciclo de Krebs, si
bien no la nica, es la condensacin de la acetil-CoA con el oxalacetato
(OAA), un cido dicarboxlico de 4C. En el siguiente esquema del Ciclo de
Krebs:
a. Identifique con un recuadro, sobre la molcula de citrato, los carbonos
provenientes de la acetil CoA.
b. Identifique las reacciones catalizadas por deshidrogenasas.
c. Las coenzimas reducidas por las deshidrogenasa identificadas en b.
cmo se reoxidan?
d. Indique cuntos ATP se forman como consecuencia de la actividad de
las deshidrogenasas?
e. Se produce fosforilacin en el ciclo de Krebs? (a nivel sustrato)

21. Qu funcin tiene la cadena de transporte electrnico en la
mitocondria? En que lugar se localiza?
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NADH(H
+
) FMN CoQH
2
Fe
3+
Fe
2+
Fe
3+
Fe
2+
O
2
NAD
+
FMNH
2
CoQ Fe
2+
Fe
3+
Fe
2+
Fe
3+
H
2
O
c
0
-0.32 -0.12 +0.10 +0.04 +0.22 +0.25 +0.29 +0.82
(fp) cit b cit c1 cit c cit a,a3
2 H
+

FAD
+
FADH
2
2 H
+

22. Teniendo en cuenta el esquema de la cadena respiratorial que se
tiene en cuenta la diferencia de potencial entre sus componentes. Indique:
a. Por qu los electrones pasan a travs de los transportadores en el
orden representado en el esquema?
b. Cual es el aceptor final de electrones?
c. El consumo de O
2
vara segn el dador de electrones sea NAD o
FAD? Explique.
23. Realice el balance de la degradacin total de la molcula de glucosa.
Fundamente el balance.
24. Completa el siguiente esquema con las frmulas de las especies
qumicas que corresponden a lo expresado dentro de cada recuadro.

Reactivos de los
organismos
fotosintticos
( ...... + ........)
Productos de los
organismos fotosintticos
(.............+ ........ )
Productos de los
organismos aerobios
no fotosintticos
(....... + .......)
Reactivos de los
organismos aerobios no
fotosintticos
( .............. + ..... )
Energa solar
Se convierten en
Se convierten en
CICLO DEL
CARBONO Y
OXGENO
1
2
Energa
metablica

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Clorofila*
(estado excitado de alta energa)
NADP
transferencia
de electrones
ATP
Clorofila
(estado original de baja energa)
Absorcin de
energa
Clorofila
+


(estado oxidado)
transferencia
de electrones
O
2

25. Resume, por medio de un esquema los acontecimientos que ocurren
en la etapa luminosa de la fotosntesis.
26. Indique las semejanzas y diferencias entre los procesos de
fotosntesis y respiracin
27. Escriba en los cuadros en blanco las especies qumicas faltantes.











28. Indica a que etapa de la fotosntesis corresponden las siguientes
ecuaciones, compltalas e indica como se denomina el proceso que
representa cada una de ellas:
a. H
2
O (.......+ 2e) + O
2

b. ........... + 2H
+
+ 2e NADPH + .......
c. ADP + ......... ATP
29. Indica cual de las siguientes expresiones simboliza la reaccin de
inicio del Ciclo de Calvin. Nombra y escribe la estructura del aceptor inicial
del CO
2
y del producto inmediato resultante, en la opcin correcta:
a. C
2
+ CO
2
C
3
b. C
5
+ CO
2
2C
3








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Gua N 7
Tema: METABOLISMO DE LOS LPIDOS
Objetivos:
Comprender las vias metabolicas que conducen a la degradacion y
sntesis de acidos grasos

Problemas y ejercicios
1. El cido graso activado una vez en
la matriz mitocondrial puede sufrir -
oxidacin, va que aparece
representada.
a. Identifique en el acil-CoA el carbono
o y el carbono .
b. Qu molculas se obtienen como
consecuencia de una vuelta de -
oxidacin?.
c. Cuntas vueltas de -oxidacin
deben ocurrir para oxidar al cido
palmtico (16C)?.
d. Identifique las reacciones donde
participan oxidoreductasas e indique
cuntas coenzimas reducidas (FADH
2

y NADH.H) se generan por vuelta y
cuntas en total para un cido graso
de 16 C?
e. Cuntas molculas de acetilCoA
se forman a partir de ese cido graso?
f. Qu destino tendrn las molculas
de acetilCoA en condiciones de
demanda energtica?
g. Ahora puede expresar el balance
en ATP de la oxidacin total del
palmtico. Complete el cuadro al final de la pregunta que le ayudar a
reconocer que procesos debe considerar para realizar este clculo.
R
C
H
2
C
H
2
C
H
2
S
CoA
O
R
C
H
2
C
H
C
H
S
CoA
O
R
C
H
2
C
C
H
2
S
CoA
O
H
O H
R
C
H
2
C
C
H
2
S
CoA
O O
C
H
3
S
CoA
O
C
H
2
S
CoA
O
R
acil CoA
FAD
FADH
2
trans-N-enoil CoA
H
2
O
oxidacin
hidratacin
L-3-hidroxiacil CoA
NAD+
NADH + H+
oxidacin
3-cetoacil CoA
HS-CoA
tiolosis
+
acil CoA acetil CoA
(-2C)
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2. En condiciones de bajo nivel de ATP celular los cidos grasos se usan
para obtener ATP a travs de un proceso metablico denominado -
oxidacin.
a. Los cidos grasos antes de la -oxidacin deben sufrir un proceso
denominado activacin. Esquematice la reaccin de activacin de un
cido graso e indique la localizacin celular de dicho proceso.
b. La activacin y la -oxidacin ocurren en compartimentos separados.
Identifique los compartimentos celulares y la molcula clave en el pasaje
de los cidos grasos activados de un compartimento a otro.
3. En la oxidacin del cido palmtico, cuntas molculas de acetil-Co A
se incorporan al ciclo de Krebbs? El palmtico tiene 16 carbonos.
4. En que caso la produccin de ATP es mayor: para un acido graso
saturado o para uno insaturado de igual numero de carbonos?
Fundamente su respuesta
5. Qu productos se obtendrn da la beta oxidacin del acido
nonanoico?
6. Cul ser la ecuacin total del proceso de beta oxidacin del cido
miristico a acetil CoA?
7. Cul ser el balance energtico (rendimiento de ATP) correspondiente
a la oxidacin del acido miristico a CO
2
y H
2
O?
8.a) Describa la reaccin que a aparece a continuacin e indique su
importancia en la sntesis de cidos grasos.





b) La acetil CoA se produce principalmente en la matriz mitocondrial.
Realice un esquema del mecanismo que permite la salida de los grupos
CH
3
C SCoA
O
-OOC CH
2
C
O
SCoA
ATP ADP + P
i
HCO
3
-
~ ~
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acetilo (-OOC-CH3) al citosol para formar la acetil CoA citoslica. (Puede
encontrar este mecanismo con el nombre de lanzadera del citrato).
9. La va de sntesis de los cidos grasos se inicia con la reaccin de
unin de la acetil CoA y la
malonil CoA a un complejo
multienzimtico. Las
unidades del complejo son
incapaces de actuar por
separado: estn unidas a la
protena, ACP (protena
portadora de acilos). La
acetill CoA y la malonil CoA
se unen al complejo
formando un compuesto de
4 carbonos con liberacin
de 2 molculas de H
2
SCoA
(Coenzima A) y CO
2
.
Analice el esquema e
indique:
a. Compuesto que se forma
la reaccin 1 (recuadro
vaco).
b. Qu molcula se une al
compuesto de 4C resultante
de la reaccin 4 para formar un cido graso de mayor nmero de C?
c. Cuntas veces deben repetirse estas reacciones para formar el cido
palmtico (16 C)?
d. Las reacciones donde participan oxidoreductasas e indique qu va
metablica suministra dicho poder reductor.
e. La enzima clave en la regulacin de la sntesis es la acetil CoA
carboxilasa Cules son los moduladores positivos de esta enzima?

CH
3
C S
O
ACP
CH
2
C S
O
ACP
COO-
CH
3
C CH
2
H
OH
C S
O
ACP
CH
3
C C C S
O
ACP
H
H
CH
3
CH
2
CH
2
C S
O
ACP
ACP, CO
2
Malonil-ACP
Acetil-ACP
|-cetoacetil ACP
sintasa
S-ACP
|-cetoacetil-ACP
NADPH + H
+
NADP
+
|-cetoacetil-ACP
reductasa
3-hidroxiacil-ACP
H
2
O
trans-A
2
-enoil-ACP
3-hidroxiacil-ACP
deshidratasa
NADPH + H
+
NADP
+
enoil-ACP
reductasa
butiril-ACP
1
2
3
4
~
~
~
~
~
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10. La glucosa y el cido caproico son compuestos de seis tomos de
carbono Cul de estas dos molculas producir mas ATP al ser
oxidados completamente a CO
2
y H
2
O? Fundamente su respuesta.
Realice un esquema entre las diferencias entre la oxidacin y la sntesis
de cidos grasos
11. Completa la siguiente secuencia de pasos, a travs de los cuales se
lleva a cabo el Catabolismo de los cidos grasos, por medio de la -
oxidacin:
(A) DESHIDROG. (dependiente de FAD) (B) ............... (C)
DESHIDROG. (dependiente de NAD) (D)........... (E) RECICLAJE
REPETITIVO DE LA ACIL-SCoA (acortada por los pasos A y D).
12.a) Escriba la ecuacin balanceada para la degradacin del cido
esterico por -oxidacin.
b. Porqu la conversin de este cido en nueve unidades de Acetil-
ScoA requiere nueve unidades de Coenzina A, en vez de ocho?
13. Calcule el nmero de moles de ATP producidas durante la oxidacin
del cido caprlico (6 C). A qu se debe que la produccin en ATP por
cada seis carbonos de cido graso sea superior al de los seis carbonos
de una hexosa? (Considere, por supuesto, que en ambos casos el
catabolismo es completo hasta CO
2
).
14. Realice el balance energtico para la degradacin, por -oxidacin, de
una molcula de cido lurico y comprelo con el correspondiente a la
oxidacin de dos molculas de glucosa.
15. En base a los datos provistos a continuacin calcule el rendimiento
energtico (o eficiencia) de la oxidacin del cido caprilico (6 C). Realice
el mismo clculo para la glucosa. Qu opinin o conclusin le sugieren
los resultados obtenidos?
Datos: a. Energa liberada en la combustin completa de una molcula de
cido caprilico en una bomba calorimtrica = 1.170Kcal/mol
b. Energa producida por la combustin completa de una molcula de
glucosa en una bomba calorimtrica = 686 Kcal/mol




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Bibliografa

- HART, H. HART, D., CRAINE, L. Qumica Orgnica. Novena Edicin. Mc
Graw-Hill. 1995.
- WADE, L.G. Jr. Qumica Orgnica. Segunda Edicin. Prentice-Hall
Hispanoamericana. 1993.
- MORRISON y BOYD. Qumica Orgnica. Quinta Edicin, Addison-Wesley
Iberoamericana, 1990.
- MEISLICH, H; NECKAMKIN, H; SHAREFKIN, J. Quimica Organica. Segunda
Edicion. Mac Graw-Hill
- BLANCO, A. Qumica Biolgica. Tercera Edicin. Editorial Gonzlez Truccone.
1986.
- LEHNINGER, A. Curso Breve de Bioqumica. Ediciones Omega. 1983.
- BOHINSKY, R. Bioqumica. Addison Wesley. Iberoamericana S.A. Quinta
Edicin. 1991
- STRYER, L. Bioqumica. Tercera Edicin. Tomo 1. Editorial Revert. 1990
- HORTON, H. R.; MORAN, L. A.; OCHS, R.; RAWN, J. D.;
SCRIMGEOUR, K. Bioqumica. Editorial Prentice-Hall Hispanoamericana.
1993
- FERNANDEZ CIRELLI, A.; DELUCA, M. E.; DU MORTIER, C.
Aprendiendo Qumica Orgnica. Segunda Edicion. Editorial Eudeba.
2005.
- GARRIDO PERTIERRA, A.; TIEJON RIVERA, J. M.; GAITAN, D. B.;
VILLAVERDE GUTIERREZ, C.; MENDOZA OLTRAS, C.; RAMIREZ
RODRIGO, J. Fundamentos de Qumica Metablica. Primera Edicin.
Editorial Alfaomega grupo editor. 2005.
- CORZO A. G. Gua de estudio y ejercitacin sobre nomenclatura
organica. Serie Didctica N 18. Ctedra de Qumica Orgnica y
Biolgica. Facultad de Ciencias Forestales. Universidad Nacional de
Santiago del Estero. 2005.

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