Chapitre III La vie dans les ocans : La biodiversit

L. GUENTAS

Chapitre III , Master 2 Hano

2012

I Dfinition
Mot cr en 1985 = contraction de diversit biologique

Assimil la diversit spcifique = ensemble des espces vivantes dun milieu + que la seule diversit spcifique : Inclue espce et abondance relative

En pratique : espce est utilise pour mesurer la biodiversit unit de monnaie car comptabilisable et identifiable

I 1. Gnes, espces, cosystmes

Biodiversit = information gntique de chaque unit lmentaire de Gnes Biologiste : Biodiversit dfinie par diversit soit individu, espce ou population Espces
Ecosystme 4 problmatiques autour du terme biodiversit:

Etude des mcanismes biologiques fondamentaux : expliquer la diversit des espces et leur spcificits mcanismes de spciation et de lvolution Ecologie fonctionnelle : tude des flux de matire et dnergie, cycles biogochimiques Etude de la valeur utile de la nature : substances haute valeur ajoute Stratgie de conservation : prserver et maintenir le patrimoine naturel

Sommet de la Terre sur lenvironnement et le dveloppement (1992, Rio) / NU Biodiversit la conqute des Sciences humaines et sociales, mdias, politiques et grand public Signature de la convention internationale sur la diversit biologique (188 pays) Protection des espces Prise en compte des cosystmes Prise en compte du patrimoine gntique Utilisation durable des ressources naturelles Dbat scientifique Politiques

I 2. Domaines marins
En mer, nous pouvons distingus diffrents domaines marins: Le milieu plagique = le large Le milieu benthique = le fond

Lensemble du supralittoral, du mdiolittoral et de linfralittoral forment le littoral dlimitant notre zone de plonge.

I 3. Biomasses
Diversit spcifique reconnue dans les ocans = 13% des espces vivantes actuelles dcrites. 275000 (93000 pour les systmes coralliens) / 1.8 millions connues 16000 espces nouvelles dcrites/an dont 1600 marines !!!! Peu face au volume marin 2 raisons : Sous estimation de la biodiversit ocanique car connaissances partielles des zones profondes Systme marin continu moins de disposition lendmisme strict la plupart des niches natteignent pas la richesse des terrestres mais Biomasses peuvent tre importantes.

Diversit spcifique faible mais diversit en grand groupe considrable

33 phylums animaux connus dont 14 nont jamais quitt locan Phylum Placozoaires Ctnophores Kinorhynques Priapulides Lorcifres Pogonophores Echiuriens Phoronidiens Brachiopodes Echinodermes Chaetognathes Hmichords Cphalochords Tuniciers plagique benthique

I 4. Evnements cls
Evnement dterminants : Apparition de la sexualit : explosion de la biodiversit/ brassage gntique 800-900
Membranes nuclaires Capture des cyanobactries ambiantes = symbiontes et organites

Production dO2 Les grandes tapes de lvolution (chelle de temps daprs H. Tazieff)

II Phylognie du monde vgtal

Le rgne vgtal
Dans leau, nous pouvons rencontrer 3 types dalgues micro ou macroscopique: 1. 2. 3. Les algues vertes Les algues rouges Les algues brunes

et des plantes comme les posidonies.

Les algues :
Concerne : cyanobactries, eucaryotes mono ou pluricellulaires ayant en commun la photosynthse Photosynthse : Processus physiologique par lequel les vgtaux qui contiennent certains pigments chlorophyllien transforment lnergie lumineuse en nergie chimique afin de fabriquer de la matire organique partir de CO2 gazeux ou dissous dans leau. Ce phnomne est accompagn dun dgagement dO2.

Lnergie chimique forme est stocke interconvertibles de polysaccharides :

sous

formes

non

Polysaccharides de rserve : forme de stockage dnergie rutilisables en fonction des besoins de lorganisme. Amylose

Polysaccharides de soutien : rle purement mcanique de maintien de la plante, non rutilisables.

Ltude biochimique des 3 paramtres : pigments, polysaccharides (rserve/soutien) + autres paramtres biologiques 5 grandes classes
PROCARYOTES

Cyanophytes (algues bleues) Pigments photosynthtiques -carotne Xanthophylles Phycobilines type c Cyanophycine (amidon particulier) Peptidoglycane base dacide muramique

Prochlorophytes -carotne Zaxanthine Glucane proche dun amidon Peptidoglycane base dacide muramique

Polyholosides de rserve Polyholosides de soutien

EUCARYOTES

Chlorophytes (algues vertes)

Pigments photosynthtiques Chlorophylles a et b -carotne Xanthophylles amidons

Rhodophytes (algues rouges)

Chlorophylles a et -carotne Xanthophylles Phycobiline de type R Amidons floriden, floridoside, isofloridoside

Chromophytes Dinophytes Phophytes

Chlorophylles a et c et -carotne Xanthophylles

Polyholosides de rserve

Dinamidon

Laminarane (Phaeophyceae) Chrysolaminarane (Diatome) Cellulose Ac. Alginiques Fucodanes

Polyholosides de soutien

Cellulose(s)

Cellulose, carraghnanes, agars

Cellulose(?)

Ligne #erte cyanobactries Algues bleues cyanophytes

Algues rouges Algues #ertes Algues brunes Plantes terrestres (Phnophyces, diatomes"

endosymbiose

Ligne brune

haptophytes Algues dores (dinobiontes" Al#obiontes apicomple$s

Au cours de l'#olution, seule l'algue #erte ( sui#i les ) grandes tapes : ocan, eau douce, terre* +onc impossible de produire par cultures les mtabolites originau$ &u'elles contiennent*
Phylognie simplifie des algues (Lecointre et le Guyader, 2 !"

cilis

%rganismes non photosynthti&ues

P%,- LA .C/01C0 - N 3 ! "#CE$%RE &!!'

Algue verte dictyota

Algue rouge chondrus

Algue brune padine

Plante posidonie

Cyanophytes

Dinophytes

Ale$andrium

Ale$andrium

+inophysis

http:22333*algaebase*org2search2images2#ie324img5id6)7898

Chlorophytes
Phylum : Chlorophyta Classe : Chlorophyceae Ordre :Siphonocladales Famille : Valoniaceae Genre : Valonia
Caule(pa (acemosa

Cette espce est vert-fonc et peut dpasser 5cm! ressemble du marbre vert avec une lueur rflchissante lumineuse. Cette algue peut se trouver jusqu' 80 mtres, solitaire ou dans des colonies denses.
Caule(pa ta)i*olia
http:22pagesperso:orange*fr2sula3esi*biologie*sous:marine2;0G0<A,=2pre#ie3pages2pre#ie3page>*html

Rhodophytes
O(d(e des N,maliales.amille /ala)au(aceae-

Petite algue rouge filamenteuse non identifie*+Ginette ALLA-+ ?!) <%,LA,+"

Il s'agit d'une algue rouge calcaire, caractrise par des tubes creux arborescents et dichotomiques. Sur les tombants, dans les endroits peu clairs. Identification par Jean-Pierre Castillo, Valence.
Petite algue rouge globuleuse ( surface filamenteuse non identifie*
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Phophytes

Embranchement : Chromophytes Famille:Dictyotaces Classe:Fucophyces Cystoseira sp. Genre:Dictyota Ordre: Dictyotales

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III - Phylognie du monde animal

Les animaux : sont htrotrophes sont des producteurs 2ndaires = consommateurs

III 1. Biodiversit animale

80% des ordres zoologiques sont marins
Sur les 28 grands groupes danimaux :

2> sont a&uati&ues 8 e$clusi#ement marins

Sur terre : 85% des espces mais seulement 20% des ordres Dans la mer : 80% des ordres mais seulement 15% des espces connues
@iodi#ersit animale marine (d'aprs Cuenot, !972A <try, !9>)"

EPON/ES ou SPON/0A0RES
Les ponges sont des animaux dits filtreurs. Ils se nourrissent de petites particules qui se trouve dans leau.

ponge orange

Les ponges figurent parmi les animaux les plus primitifs. Assemblage de cellules spcifiques, soutenues par une sorte de charpente constitue de spicules dont la forme et la composition 2 grands groupes : Les ponges calcaires et les ponges siliceuses (demosponges)

P,t(osia +demosponge3 1eucetta p(imigenia2

,ponge calcai(e

Clath(ina sp-2 ,ponge calcai(e

CNIDAIRES

Ce groupe compte deux types danimaux diffrencis par leur forme : Les polypes ( les coraux) Les mduses Les anmones

Corail rouge

Mduse

Anmone

HYDROZOAIRES
Hydraires Colonie arbuste fix Siphonophores Colonie libre

SCHYPHOZOAIRE

ANTHOZOAIRES
Octoco(alliai(e +4 cloisons3 co(ail (ouge2 /o(gone2 Alcyonai(es 7 B des espces de cnidaires, Pas de phase mduses : polype uni&uement* /ls sont tous fi$s et ont une ca#it gastri&ue cloisonne

Co(ail (ouge

Pa(amucea

Alcyon (ouge

5e)aco(alliai(e Polype 6 ' tentacules ou un multiple0ls sont solitai(es2 sociau) ou coloniau)-

Si on se limite aux groupes les plus importants du point de vue chimique:

La branche gauche de larbre = Echinodermes, Tuniciers et les vertbrs. Tendance un endosquelette minral, imprgns de sels calcaires lexception des tuniciers (polysaccharides) Pigments respiratoires base de fer (hmoglobine) Les animaux sont pineuriens (systme nerveux dorsal) Pas ou peu de parasitisme (parasits par la branche droite)

@iodi#ersit animale marine (d'aprs Cuenot, !972A <try, !9>)"

EC50NO"ER$ES
Animaux exclusivement marins, la peau pineuse (d'o leur nom) avec 1 squelette interne. Seul embranchement des invertbrs possdant 1 squelette interne calcaire. Les astrides ( toile de mer ) Les chinides (oursins) Les crinodes ( comatules )

"iadema setosum

O)ycomanthus bennetti

.(omia monilis Culcita no7aeguineae T(ipneustes g(atilla

Comanthina sp-

EC50NO"ER$ES
Les ophiurides : animaux trs mobiles, les plus rapides des chinodermes.

Ophiu(e

Gorgonocphale, tCte de mduse

1es holothu(ides +holothu(ies ou concomb(es de me(3

%ohadschia ma(mo(ata

Neothyonidium magnum

TUN0C0ERS 8 les ascidies

Animaux fixs, exclusivement marins. Animaux solitaires, grgaires ou coloniaux. Forme voquant une outre 2 ouvertures : les siphons = Animaux filtreurs. Corps entour par une tunique cellulosique.

Eudistoma hospitale Cla7elina deto(ta

espce coloniale Ascidie rouge

5E$0C5OR"ES
Embranchement d'animaux incluant 1 classe importante de fossiles, les graptolites, la plupart d'entre eux disparus au carbonifre. Espce survivante : Cephalodiscus graptolitoides. Toutes les autres formes modernes sont des vers marins Diviss en 2 classes : Enteropneusta (mobile) Pterobranchia (sessiles et coloniaux ).

Ptrobranche Saccoglossus cambrensis.

1a b(anche d(oite de l9a(b(e : Ann,lides polych;tes2 b(yo<oai(es2 mollus=ues et c(ustac,s* Tendance un exosquelette organique de chitine (crustacs) ou coquille de calcaire (Pigments coquillages ) (espi(atoi(es 6 base de cui7(e
+h,mocyanine3

Les animaux sont hyponeuriens (systme nerveux ventral)

Parasitisme frquent ( vers , crustacs, insectes), inconnu chez bryozoaires.

@iodi#ersit animale marine (d'aprs Cuenot, !972A <try, !9>)"

VERS : plathelminthes(vers plats), annlides (polychtes), nmertiens,

Vers reprsent sous la mer / plusieurs milliers despces. Leur forme = 4 embranchements : Vers plats, ronds, rubans et annels.

Plathelminthe- Polycladid,- >e( plat

.ilog(anella elatensis
>e(s- Annelid,- Polych;teSe(pulid,- +7e(s 6 tubes calcai(es 3N,me(te 8

1ineus 7i(idis

BRACHIOPODES
Organisme filtrant Coquille compose de 2 valves de formes et de tailles diffrentes: 1 valve dorsale plus petite 1 valve ventrale plus grande, munie d'un crochet +/- recourb et perfor. L'orifice laisse passer le pdoncule, une sorte de pied avec lequel l'animal vit gnralement fix sur le substrat,

ECHIURIENS
Embranchement d'animaux mtazoaires classs parmi les vers marins qui vivent le plus souvent enfoncs dans le sable ou la vase
@onella

BRYOZOAIRES
Animaux coloniaux. Colonies de quelques millimtres quelques dizaines de centimtres souvent constitues dun grand nombre dindividus : les zodes (squelette calcaire ou chitine)

Catenicella sp

%(yo<ai(e calci*i,

.pongiaires +iplobasti&ues

E mtaDoaires F

Cnidaires

protostomiens <riplobasti&ues 0umtaDoaires

+eutrostomien

Cette classification en Y est reprsente diffremment en fonction du dveloppement embryonnaire (nombres de feuillets la blastula)

MOLLUSQUES
Dans ce groupe on trouve : les gastropodes ( coquillages, nudibranches ) les bivalves les cphalopodes

Gastropode : ormeau

Gastropode : nudibranche

Bivalve : moule Cphalopode : poulpe Cphalopode : seiche

CRUSTACES
Les crustacs sont des animaux articuls ayant une carapace.

Bernard-LHermite

Crabe

Crevette nettoyeuse

Langouste

REPTILES
Ce sont des vertbrs rampants avec ou sans pattes.

Tortue verte

POISSONS
Dans ce groupe nous distinguerons les poissons cartilagineux ( requins, raies ) des poissons osseux.

Rascasse

Murne

Mrou

Poisson clown

Poisson coffre

Poisson papillon

MAMMIFERES

Dauphin

Orque

Baleine

III 2. Le poumon de la Terre : Le plancton

Cest lO2 quil produit qui a permis loxygnation de la Terre et lapparition de la vie. Il est animal ou vgtal = 1er maillon chane alimentaire, produit plu de nourriture que les vgtaux et les bovins terrestres.
Phytoplancton

Plancton vgtal : Algues unicellulaires ou assemblage de cellules Fabrique sa propre MO grce photosynthse Plancton animal : ufs, larves, tre glatineux, petits crustacs, Krill) Cest lindicateur de limpact des activits humaines Cest un vagabond (planctos) : re au gr des courants
Krill : crevettes microscopiques des eaux froides consommes par la baleine bleue dans lantarctique

III 3. Le btisseur : le corail

2011 Km de long et 70 Km de large : la grande barrire de corail (6 000 000 Km2) Construction visible de lespace ralise par le polype corallien qui cohabite avec la zooxanthelle

Image satellite de la grande barrire de corail, NASA, MIRS, 2000

Coraux se dveloppent jamais plus de 50 m dans les mers chaudes (22-28C) A partir de la lumire du soleil : la algue ralise la photosynthse et est capture / polypes La nuit : la zooxanthelle fournie le CO2 ncessaire la formation du squelette calcaire du corail La zooxanthelle fournie galement la coloration du corail = SYMBIOSE Il existe + de 2500 espces de corail dont 700 dans le seul ocan pacifique

Rle vital pour la vie marine, la plante et lhomme : Pare-chocs : protge de la violence des intempries ; protge les ctes du ressac, rempart contre lrosion du littoral et des rivages A lorigine du dveloppement des herbiers et des mangroves dans les lagons qui favorisent la fixation des sdiments, loxygnation, lutte contre lrosion ctire. Pouponnire : abrite ressources de pche (15t /Km2, 12% ressources de pche), protge et nourrit environ 5000 espces de poisson et + dun million dindividus. Le corail 0.2% des fonds des ocans mais abrite 25% des espces marines dpositaire de la biodiversit marine Laboratoire pharmaceutique : produits des traitements mdicaux Il permet les greffes osseuses et dentaires en cas daccidents graves Il pourrait gurir le cancer (sang et peau), la maladie dAlzheimer/ Parkinson et les maladies virales (Herps 1, HIV1)

III 4. Caractristiques biochimiques des animaux sessiles

Animaux sessiles donc benthiques spcifiques du milieu marin Animaux htrotrophes 1) Doivent trouver alimentation dans leau qui les entoure 2) Filtreurs ou microphages ; nourritures = bactries ou phytoplancton 3) Prsence de marqueurs spcifiques de cette alimentation (AG, phospholipides, strols) 4) Beaucoup vivent en symbiose avec un organisme photosynthtique

(ex : gorgone + zooxanthelle) mtabolites intressants

Gorgone

Zooxanthelle (algue unicellulaire)

La plupart des organismes sessiles possdent des armes chimiques contre les prdateurs et attaques bactriennes source de substances mdicamenteuses.

Phyllum : <uniciers(Ascidies", @ryoDoaires, Cnidaires et &uel&ues mollus&ues (certains ( mobilit trs rduite : mduses, aplysies"

IV - Rpartition des organismes marins

IV 1. Hirarchie des niveaux cologiques
CO$$UNAUTE ? CO$$UNAUTE &

POPU1AT0ON
%rganismes (indi#idus" %rganismes (indi#idus" %rganismes (indi#idus"

POPU1AT0ON
%rganismes (indi#idus" %rganismes (indi#idus" %rganismes (indi#idus"

%0OCENOSE 8 est l'ensemble des tres vivants coexistant dans un espace dfini ECOSYSTE$E : habitat entie( a7ec biotopes +plage2 mang(o7e2 (oche(3 Biotope : un type de lieu de vie dfini par des caractristiques physiques et chimiques dtermines relativement uniformes

IV 2. Rpartition spatiale des organismes marins

P0LAG%. : mammifres, poissons, certains mollus&ues, organismes flottant, plancton: phytoplancton(cyanobactrie, dinoflagells diatomes" et Dooplancton (lar#es animales, crustacs (Jrill""

Emb(uns
#tage sup(alitto(al : <one sup(atidale

$a(,es
#tage m,diolitto(al : <one inte(tidale

Pleine eau +@one p,lagi=ue3

#tage in*(alitto(al : <one in*(atidale

Ni7eau benthi=ue +*ond3

-partition des franges cGtires (LHning, !99 "

0spces fi$es ou mobiles mais incapables de nager en pleine mer : @01<I%.

IV 3. Relations interspcifiques
Le commensalisme : le commensal vit sur son hte ou dans son voisinage pour dtourner son profit une partie de sa nourriture. Ne concerne que les animaux : Eponge, Cnidaire, Echinoderme, Mollusque, Crustacs et Ascidie. La symbiose : Association permanente de 2 organismes appartenant des rgnes diffrents, indispensable pour au moins lun des 2 et utile ou indiffrente pour lautre. Symbiose et commensalisme sont & aspects du $utualisme +: association oA aucun des pa(tenai(es ne l;se l9aut(e3 1e pa(asitisme : dpendance totale du parasite #is:(:#is de l'hGte et au dtriment de ce dernier*

V - Rpartition des organismes marins

V 1. Dpendance la lumire
Vgtaux : grande dpendance car chlorophyllien (surface 40m de profondeur) Animaux herbivores : zones les + claires Espces ncessitant de la lumire = photophiles Espces sensibles la lumire : sciaphiles obscurit des failles, grottes @one photi=ue : comp(ise ent(e su(*ace et p(o*ondeu( ma)imale oA la photosynt;se est enco(e possible-

V 2. Dpendance la temprature
Affecte surtout les animau$ Eu(ythe(me 8 peu sensible au) 7a(iations de temp,(atu(e St,nothe(me 8 tB ?!C 5om,othe(me 8 (,gule leu( temp,(atu(e PoCDilothe(me 8 t : t de l9en7i(onnement

2 types dorganismes animau$ ou #gtau$

V 3. Dpendance la salinit
Eu(yhaline 8 peu sensible au) 7a(iations de salinit, St,nohaline 8 T(;s sensible au) 7a(iations de salinit, 5ype(haline 8 S t(;s ,le7,e 5ypohaline 8 S peu ,le7,e +estuai(es3

Adaptation 6 la salinit, : adaptation au) 7a(iations de p(ession osmoti=ue-

P(oduction d9osmolites

VI - Estimation de la biomasse
Zones maritimes
Ocan Atlantique Mer Mditerrane Ocan Indien Ocan Pacifique Totaux

Algues rouges
510

Algues brunes
3650 50 650

1000
220 880 2610

8150
12500

Estimation biomasse 7,g,tale +en million de tonnes3- $ichaneD ?EF

Zone ocanique Plateaux continentaux 200m Etage Bathyal 200<x<3000 Etage Abyssal 3000

Superficie (106 Km2) 27, 5 soit 7,6% 55,2 soit 15,3% 17,3 soit 77,1%

Biomasse (106 t) 1100 soit 82,7% 220 soit 16,5% 10 soit 0,8%

Estimation biomasse animale- Nienhuis2 ?E4?