6.

1 Introduccin a los enzimas

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travs de la interaccin con enzimas. Los enzimas se lian convertido en herramientas prcticas importantes, no slo en medicina sino tambin en la industria qumica, en el tratamiento de los alimentos y en la agricultura. El capitulo empieza con la descripcin de las propiedades de los enzimas y los principios fundamentales de su poder cataltico. Sigue una introduccin a la cintica enzimtica, disciplina que proporciona gran parte del marco necesario para cualquier discusin sobre los enzimas. Se dan seguidamente algunos ejemplos de mecanismos enzimticos que ilustran los principios introducidos previamente en el captulo. Acabamos con lina discusin sobre los enzimas reguladores.

las interacciones por enlaces dbiles entre el enzima y su sustrato podran ser utilizadas para catalizar la reaccin. Esta brillante idea est en el centro de nuestro conocimiento actual sobre la catlisis enzimtica. La investigacin sobre los enzimas ha sido muy intensa desde la ltima parte del siglo xx. Esto ha conducido a la purificacin de millares de enzimas, a la elucidacin de la estructura y mecanismo qumico de muchos de ellos y a un conocimiento general sobre su modo de accin.

La mayora de enzimas son protenas

Con la excepcin de un pequeo grupo de molculas de RNA cataltico (Captulo 26), todos los enzimas son protenas. Su actividad cataltica depende de la integridad de su conformacin proteica nativa. Si se desnaturaliza o disocia un enzima en sus subunidades, se suele perder la actividad cataltica. Si se descompone un enzima en sus aminocidos constituyentes, siempre se destruye su actividad cataltica As, las estructuras primara, secundaria, terciaria y cuaternaria de las protenas enzimticas son esenciales para su actividad cataltica. Los enzimas, al igual que otras protenas, tienen masas moleculares relativas que van desde unos 12.000 hasta ms de 1 milln. Algunas enzimas no requieren para su actividad ms grupos qumicos que sus residuos aminocidos. Otros requieren un componente qumico adicional llamado cofactor. El cofactor puede ser uno o varios iones inorgnicos tales como Fe 24, Mg2^, Mn2* o Zn2+ (Tabla 6-1) o una molcula orgnica

6.1 Introduccin a los enzimas

Gran parte de la historia de la bioqumica es la historia de la investigacin sobre los enzimas. Los catalizadores biolgicos se reconocieron y fueron descritos por primera vez a finales del siglo xviii, en estudios sobre la digestin de la carne por secreciones del estmago; la investigacin continu a principios del siglo xix examinando la conversin del almidn en azcar por la saliva y diversos extractos vegetales. Hacia 1850 Louis Prist e i ir lleg a la conclusin de que la fermentacin del azcar a alcohol por la levadura estaba catalizada por fermentos. Postul que tales fermentos son inseparables de la estructura de las clulas de levadura vivas; este punto de vista, denominado vitalismo, se mantuvo durante dcadas. El descubrimiento de Eduard Buchner en 1897 de que los extractos de levadura pueden fermentar el azcar a alcohol demostr que las molculas que intervienen en la fermentacin pueden continuar funcionando cuando se separan de la estructura de las clulas vivas. Frederick W. KUhne denomin estas molculas enzimas. Al rechazarse las nociones vitalistas de la vida, el aislamiento de nuevos enzimas y la investigacin de sus propiedades permiti el avance de la ciencia bioqumica. El aislamiento y cristalizacin de la ureasa por James Sumner en 1926 proporcion un gran impulso a los primeros estudios sobre los enzimas. Sumner hall que los cristales de ureasa consistan exclusivamente en protena y postul que todos los enzimas son protenas. A falta de otros ejemplos esta idea fue discutida durante algn tiempo. La conclusin de Sumner slo se acept ampliamente cuando ms tarde, en la dcada de 1930, John Northrop y Moses Kunitz cristalizaron la pepsina, la tripsina y otros enzimas digestivos y hallaron que tambin eran protenas. Durante este perodo, J. B. S. Haldane escribi un tratado denominado 'Enzimas". Aunque an no estaba clara la naturaleza molecular de los enzimas, este libro contena la notable sugerencia de que

TABLA 6-1 Algunos elementos inorgnicos que actan como cofactores por enzimticos
Cu2* Fe2* o Fe3* K+ Mg2* Mn2+ Mo
NP
+

Citocromo oxidasa Citocromo oxidasa, cata lasa, peroxidasa Piruvato quinasa Hexoquinasa, glucosa 6-fosfatasa, piruvato quinasa Argjnasa, ribonucletido reductasa Dinitrogenasa Ureasa Glutatfn peroxidasa Carbnico anhidrasa, alcohol

Se Zn2+

deshidrogenasa, carboxipeptidasas Ay B

192 Captulo 6 Enzimas

192 Captulo 6 Enzimas

o rnelaloorgnica compleja denominada coenzima (Tabla recibieron nombres muy generales, antes de que se

TABLA 6-2 Algunos coenzimas que actan como portadores transitorios de tomos o grupos funcionales
C02

Coenzima Biocitina

Ejemplos de grupos qumicos transferidos Biotina Precursor en la dieta para los mamferos

Coenzima A 5'-Desoxiadenosilcobalamina (coenzima B12) Flavina adenina dinucletido Lipoato Nicotinamida adenina dinucletido Piridoxal fosfato Tetrahidrofolato Tiamina pirofosfato

Grupos acilo tomo de H y grupos alquilo Electrones Fectrones y grupos ado Ion hidruro (:H~) Gmpos amino Grupos monocarbonados Aldehidos

cido pantotnico y otras molculas Vitamin B12 Riboflavina (vitamina B2) No se requiere en la dieta cido nicotnico (niacina) Piridoxina (vitamina B6) Folato Tiamina (vitamina B,)
supiera cul era su reaccin especfica. Por ejemplo, un enzima que actuaba en la digestin de la co mida se llam pepsina, del griego pepsis, digestin, y el liso- zima recibi su nombre por su capacidad de Usar las paredes celulares bacterianas. Otros recibieron el nombre en virtud de su origen o el modo como se obtuvieron: la tripsina, que recibi su nombre del griego tryein, desgastar", se obtuvo frotando tejido pancretico con glicerina. A veces el mismo enzima t iene dos o ms nombres, o dos enzimas diferentes tienen el mismo nombre. Debido a tales ambigedades y al n mero constantemente creciente de enzimas descubiertos, se ha adoptado por acuerdo internacional un sistema de nomenclatura y clasificacin de los enzimas. Este sistema distribuye los enzimas en seis clases principales, caria una de ellas con diferentes subclases, segn el tipo de reaccin catalizada (Tabla 6-3). A cada enzima se le asigna un nmero clasificatorio de cuatro apartados y un nombre sistemtico que identifica la reaccin catalizada. Por ejemplo, el nombre sistemtico formal del enzima que cataliza la reaccin ATP + D-glucosa ----- ADP + D-glucosa 6-fosfato es la ATPiglucosa fosfotransferasa, lo que indica que cataliza la transferencia de un gmpo fosfato del ATP a la glucosa. El nmero de clasificacin de est e enzima (numen) E.C., por fnzyme

Not la estructura y modo de accin de estos coenamas se cesdbe n la Parte II de este liara

6-2). Algunos enzimas requieren tanto un coenzima como uno o ms iones metlicos para su actividad. Un coenzima o ion metlico unido covalentemente o de manera muy fuerte a la protena enzimtica se denomina grupo prosttico. Un enzima completo catalticamente activo junto con su coenzima y/o iones metlicos se denomina holoenzima. La pane proteica de tal enzima se denomina apocnzhna o apoprotena. Los coenzimas actan como transportadores transitorios de grupos fun dnales especficos. La mayora de ellos son derivados de las vitaminas, nutrientes orgnicos requeridos en pequeas cantidades en la dieta. Los coenzimas se considerarn ms detalladamente a medida que se encuentren en la discusin de las rutas roetablicas en la Parte II de este libro. Finalmente, algunos enzimas son modificados covalentemente por fosforilacin, glucosilacin y otros procesos. Gran parte de estas alteraciones intervienen en la regulacin de la actividad enzimtica.

Los enzimas se clasifican segn las reacciones que catalizan

Muchos enzimas se han bautizado aadiendo el sufijo asa" al nombre de su sustrato o a una palabra o frase que describe su actividad As, la ureasa cataliza la hidrlisis de la urea y la DNA polimerasa cataliza la polimerizacin de nucletidos en la sntesis del DNA. Otros enzimas

TABLA 6-3 Clasificacin internacional de los enzimas

N. 1 2 3 4 5 6 Clase Oxidorreductasas Transferasas Hidrolasas Uasas Isomerasas Ligasas Tipo de reaccin catalizada Transferencia de electrones (iones hidruro o tomos de H) Reacciones de transferencia de grupos Reacciones de hidrlisis (transferencia de grupos funcionales al agua) Adicin de grupos a dobles enlaces, o formacin de dobles enlaces por eliminacin de grupos Transferencia de grupos dentro de molculas dando formas isomricas Formacin de enlaces CC, CS. C0 y CN mediante reacciones de condensacin

acopladas a la rotura de ATP