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Educ Md Salud, Vol. 14, No.

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Enseanza por medio de la simulacin en gentica


DR. MARCOS PALATNIK l, SR. CLAUDIO L. AMORIM 2 Y DR. JORGE GALPERIN 3

INTRODUCCION Los intentos de actualizar los mtodos didcticos en el campo de la biologia son ms frecuentes en el nivel primario y secundario que en el universitario. La clase magistral no ha sido deslazada de los currculos de biologa, incluso en aquellas carreras en que la experimentacin cientfica- que exige mayor integracin en el trabajo de laboratorio entre docente y alumno -es necesaria para la capacitacin del futuro profesional mdico, biomdico, bilogo, farmacutico, bioqumico y genetista. La clase magistral est tan arraigada en la mentalidad de profesores y alumnos que el propsito de colocarla en un segundo plano en relacin con una mayor intensificacin de la labor experimental entre estudiantes y docentes auxiliares an cuenta con fuerte resistencia, no solo por parte de los profesores sino tambin de los alumnos. Aparentemente, la enseanza a travs de la observacin y reproduccin del fenmeno biolgico, con sus consiguientes actividades de prueba y error, discusin y anlisis de los resultados en la propia sala de experiencias, requiere an, en nuestro medio, de la participacin del profesor dictando su clase magistral, de predominio informativo y ordenador de los conocimientos, obligando al alumno a asumir una funcin pasiva de agente. En una encuesta realizada a propsito de un intento piloto de introdu-

Profesor Titular Visitante, Instituto de Biologa, Departamento de Gentica, Universidad Federal de Ro de Janeiro, Brasil. 2 Jefe del Sector de Computacin, Ncleo de Tecnologa Educacional para la Salud (Universidad Federal de Ro deJaneiro)/Centro Latinoamericano de Tecnologa Educacional para la Salud (NUTES/CLATES), Organizacin Panamericana de la Salud, Ro de Janeiro. 3 Director, Centro Latinoamericano de Tecnologa Educacional para la Salud, Ro de Janeiro.

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cir al alumno en el trabajo experimental, a travs de una experiencia real y no por medio del ortodoxo trabajo prctico de tipo demostrativo, se pudo observar que en muchas circunstancias el alumno interpret el camino de prueba y error- que es la esencia de la dinmica del experimento biolgico - como un hecho de improvisacin o falta de coherencia didctica de los docentes auxiliares (1) Con el empleo de la computadora como recurso didctico se abren nuevos horizontes en la enseanza de la biologa. La gentica, y en especial la gentica de poblaciones, se ven favorecidas y estimuladas por el desarrollo de nuevas tcnicas de enseanza de diversos modelos matemticos.

El presente trabajo se refiere al desarrollo de un programa de instruccin por simulacin acerca del fenmeno de deriva gentica, que actualmente se est utilizando en un curso de posgrado en gentica. El programa se propone facilitar la comprensin de un proceso evolutivo de difcil desarrollo en clases tericas o prcticas convencionales, adems de crear una actitud positiva de docentes y alumnos en relacin con el uso sistemtico de los modelos de computacin. Esta simulacin ofrece oportunidad al alumno de trabajar, en un corto perodo de tiempo, con resultados que en la realidad llevaran meses para ser observados. LOS MODELOS MATEMATICOS EN BIOLOGIA Los fenmenos biolgicos pueden analizarse a travs de dos tipos de modelos: el deterministico y el estocstico. Es el modelo en s el que se define como determinstico o estocstico, independientemente de la naturaleza del fenmeno en estudio. La descripcin del fenmeno por medio de las ecuaciones que lo rigen y despreciando las fluctuaciones al azar constituye un modelo deterministico. El modelo estocstico es un ejemplo de algo ms general que es el "proceso estocstico". Proceso estocstico es la abstracin matemtica de un proceso emprico cuyo desarrollo est gobernado por las leyes de las probabilidades (2). Los procesos empiricos estocsticos o aleatorios abundan en la naturaleza, por ejemplo, el recorrido de una particula dotada de movimiento browniano o el crecimiento de una colonia de bacterias, y se les halla en medicina, biologa, fsica, oceanografa, economa y psicologa (3). El uso de las probabilidades para examinar el fenmeno no significa

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que l se desarrolle por casualidad sino que aparenta ser tan irregular que puede ser bien descrito como si fuera aleatorio; por ello se dice que el modelo estocstico sirve para interpretar la variabilidad de los datos observados en fenmenos de variacin irregular cuasi-aleatorios(4). LOS MODELOS ESTOCASTICOS Y SU SIMULACION EN GENETICA HUMANA Y DE POBLACIONES La gentica de poblaciones est relacionada con las consecuencias estadsticas del mendelismo en un grupo de individuos o de familias; estudia el fenmeno de la herencia a nivel poblacional y est particularmente enfocada hacia las poblaciones mendelianas, que son aquellas constituidas por individuos de reproduccin sexuada, fecundacin cruzada y apareamiento al azar. De este modo, la gentica de poblaciones est ntimamente ligada a la evolucin, que no es sino el cambio acumulativo de las caractersticas hereditarias de la especie, o dicho de otra manera, el cambio en la frecuencia de los genes (5). El modelo estocstico permite estudiar el comportamiento de la poblacin cuando se deja actuar la fluctuacin al azar de los genes. Considerando que la mayora de las poblaciones son finitas y que la evolucin opera a travs de un enorme perodo de tiempo en un medio ambiente siempre cambiante, se hace imprescindible considerar el factor aleatorio. De ah que el proceso de alteracin de las frecuencias de los genes a travs del tiempo pueda ser descrito como un proceso estocstico y analizado mediante un modelo estocstico (6). Para ello se recurre a la simulacin, que es la elaboracin, con diferentes tcnicas, de situaciones problema que imitan tanto como sea posible una situacin real y permiten la interaccin con ellas. Una situacin sencilla que puede utilizarse aqu como ejemplo y que fue desarrollada para alumnos de un curso de biologa general para las carreras de farmacia y del doctorado en bioqumica (7), merece ser analizada. El programa se propone simular el equilibrio de genes en una poblacin y comprobar el ajuste de los resultados obtenidos por el modelo con datos de poblaciones reales. Se consider un locus diallico sin dominancia y una poblacin de tamao grande dotada de una serie de caractersticas sumamente simplificadas en relacin con la realidad. As, las diversas generaciones no se superponen; est permitida solo la monogamia; no hay viudez pero s sol-

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teria; todos los individuos potencialmente alcanzan la edad reproductiva; todos los embarazos llegan a trmino; no hay mortalidad diferencial de los cigotos; est permitido el casamiento consanguneo de cualquier grado, excepto el incesto. El programa fue escrito en lenguaje Fortran II para la computadora IBM-1620. La simulacin estocstica consisti esencialmente en la generacin de nmeros al azar mediante una rutina adecuada y su comparacin con las probabilidades de ocurrencia de los diversos fenmenos familiares y demogrficos que sustentan el modelo. Adjudicacin del genotipo de cada progenitor: si el nmero aleatorio es menor que la probabilidad del genotipo Al A 1, se selecciona un progenitor con dicho genotipo; si el nmero es mayor o igual, se pregunta si es menor que la suma de las probabilidades A1 A 1 + A A 2; si lo es, se selecciona un progenitor heterocigtico Al A2 ; si no lo es, se selecciona un homocigtico A 2 A 2 Determinacin de la cantidad de hijos de un matrimonio: la cantidad de hijos por matrimonio sigue, en primera aproximacin, una distribucin de Poisson con una media, que se estima a partir del censo demogrfico de la poblacin en estudio. Si el nmero al azar es menor que la probabilidad Po = e`x, del matrimonio de ser estril, dicho matrimonio se considerar estril; si es mayor, se pregunta si es menor que la probabilidad de tener un hijo y as sucesivamente. Cantidad de hijos de cada sexo por matrimonio: el sexo de los hijos sigue una distribucin binomial y con la filosofa descrita para los precedentes parmetros se escoge el sexo de cada hijo. Caractersticas genticas de los hijos: si el nmero al azar es menor que la frecuencia del genotipo posible, de acuerdo con las leyes de Mendel para un matrimonio dado, se asigna dicho genotipo al hijo. ASPECTOS DIDACTICOS DEL TRABAJO Poblacin objeto La poblacin objeto est constituida por alumnos regulares del curso de posgrado en gentica, cumpliendo la disciplina de gentica de poblaciones. Durante el desarrollo de la disciplina el alumno analiza y se ejercita sobre las aplicaciones en gentica de la distribucin normal, binomial y de Poisson. En actividades anteriores al trabajo con la computadora, se discuten temas acerca de modelos determinsticos y estocsticos y se resuelven pro-

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blemas de simulacin estocstica mediante muestreo aleatorio. La generacin de nmeros aleatorios es practicada mediante una minicalculadora tipo Hewlett-Packard HP-25 o mediante el uso de tablas. Los alumnos no estaban familiarizados con el trabajo en la computadora ni con las tcnicas de instruccin por computacin. Simulacin de la oscilacin gentica Mediante las tcnicas de instruccin por simulacin el alumno interacta con el programa y realiza un aprendizaje activo y de autoinstruccin con frecuente retroalimentacin ("feedback") que le permite mejorar su aprendizaje (8). Por otra parte, consideramos que esta tcnica constituye el nico camino para ensear un proceso de gran complejidad-como es la deriva gentica-que no puede ser aprendido con facilidad en clases tericas, y cuyas prcticas en laboratorios precisaran de largo tiempo para obtener resultados. Merece destacarse aqu un aspecto semntico. Empleamos un mtodo didctico de simulacin para la enseanza de un modelo de simulacin estocstica de un proceso biolgico cuasi-aleatorio. De igual manera podramos haber aplicado la tcnica de instruccin por simulacin para explicar un modelo determinstico de deriva gentica. El programa desarrollado se basa en el de Cavalli-Sforza y Bodmer (9), que da como informacin de salida la media y la variancia de la frecuencia de los genes para el total de poblaciones simuladas. Nosotros hemos introducido una variante que consiste en agregar a la informacin de salida los valores de las frecuencias de los genes por cada poblacin y desarrollamos su uso para fines didcticos.

DESCRIPCION DEL TRABAJO Cada alumno trabaja individualmente con una terminal de computadora y una vez "llamado" el programa se le presenta el cuadro 1 con las siete opciones iniciales, que pueden ser utilizadas en cualquier orden. La descripcin de cada opcin es resumida, pero lo suficientemente explcita como para que el alumno pueda pasar al trabajo a travs de los diversos parmetros del modelo (cuadros 2 a 7). La diferencia entre la opcin 6 y la 7 radica en que, a partir de esta ltima, las respuestas son evaluadas en cuanto al tiempo que el alumno tarda en resolverlas. Como puede verse en el cuadro 3, existe una serie de datos que el

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Cuadro 1. Opciones iniciales. Usted desea: 1) 2) 3) 4) 5) 6) 7) Identificar el objetivo del programa. Verificar el plan de trabajo. Consultar bibliografia. Conocer los fundamentos del programa. Revisar conceptos. Practicar la simulacin. Iniciar la evaluacin.

Cuadro 2. Identificar el objetivo del programa.

A travs de un modelo estocstico de variacin de las frecuencias de los genes en un conjunto de poblaciones de igual tamao, constituidas por individuos de reproduccin sexuada, se simula la accin de la deriva gentica aleatoria (random genetic drift). Se pretende que el alumno profundice y fije los conceptos fundamentales del proceso que, aunque sea de notoria significacin biolgica, es de naturaleza estadstica.

alumno debe completar, como por ejemplo "dar valores a T, M, etc". Luego la computadora le dar los resultados obtenidos por la deriva gentica estocstica a partir de los cuales el alumno podr analizar las tendencias de la media y la variancia. En el cuadro 7 se muestra, como ejemplo, una secuencia del trabajo del alumno, con los posteriores caminos que sigue el programa, y en el 8 se expone un tipo de retroalimentacin para posibles respuestas del alumno. Por la misma ndole estocstica del modelo, cada estudiante obtiene resultados siempre diferentes cada vez que repite el ejercicio, aunque idnticos valores de parmetros que escoja tambin sern distintos de los valores obtenidos por sus colegas.

Enseanza por simulacin en gentica Cuadro 3. Verificar el plan de trabajo.

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El modelo de simulacin estocstica permite determinar, por parte del alumno, las siguientes condiciones: Nmero de generaciones (T): mximo 100 Nmero de poblaciones (M): minimo 2, mximo 50 Nmero de genes (N): mnimo 4, mximo 50 Frecuencia gnica inicial (Po): mnimo 0.0, mximo 1.0 Intervalo de impresin (en generaciones): mnimo 1, mximo igual a (T) Recuerde que cuanto mayores fueran los valores utilizados mayor ser el tiempo de respuesta de la computadora. Atencin: el smbolo // indica que usted puede sustituir el valor sugerido por otro que le sea conveniente.
PLAN DE TRABAJO

1) Dar valores a T, M, N, Po y al intervalo de impresin, para analizar la tendencia de los valores de la media y de la varzancia. 2) Dar valores bajos a (M) y a (N), entre 4 y 8, para analizar la tendencia de los valores de la media y de la variancia. 3) Al ser provistas las informaciones de las frecuencias de los genes por poblacin, el alumno debe calcular el porcentaje de poblaciones con genes fijados y perdidos en cada generacin.

Cuadro 4. Consultar bibliografa.

* L.L. Cavalli-Sforza y W.F. Bodmer. The Genetics of Human Populations. San


Francisco, W.H. Freeman and Co., 1971.

* C.C. LI.Population Genetics.Chicago, The University of Chicago Press, 1955.


* Clases tericas y textos recomendados sobre aplicacin en gentica de las distribuciones normal, binomial y de Poisson. * Problemas y ejercicios sobre simulacin estocstica desarrollados en clases tericas.

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Cuadro 5. Conocer los fundamentos del programa.

De forma anloga a como se simul el fenmeno de oscilacin de los genes en la clase terica mediante el uso de nmeros aleatorios, este programa genera nmeros al azar entre O y 1. Para escoger un alelo A de modo estocstico, el programa compara el valor del nmero con la probabilidad o frecuencia allica de A en la generacin inmediatamente anterior; si fuera menor elige A, si fuera mayor o igual escoge su alelo antittico a. Este proceso se realiza para todas las poblaciones y para cada uno de los loci. El alumno podr observar y estudiar la media y la varzancia de un conjunto de poblaciones del mismo tamao y tambin tendr disponibles las informaciones de cada poblacin, todas ellas evolucionando por accin de la deriva gentica.

Cuadro 6. Revisar conceptos.

Deriva gentica. La deriva gentica aleatoria corresponde a la fluctuacin aleatoria de las frecuencias de los genes en una poblacin de tamao finito. Se sabe que en una poblacin de gran tamao, las frecuencias de los genes en el equilibrio se mantienen constantes de generacin en generacin y que al limitarse su tamao, dichas frecuencias sern sometidas a un cambio. Este cambio no depende de la mutacin, migracin y seleccin natural. Es de naturaleza estadstica y es producido por el efecto de muestreo. Para un locus dado, las frecuencias de A y a en la generacin 1 dependen de una muestra de los gametos de la generacin 0. El tamao de dicha muestra es igual al doble del nmero de individuos adultos de la poblacin. La frecuencia Pl del alelo A en la generacin 1 debera ser idntica a la frecuencia Po de dicho alelo en la generacin O (por el equilibrio de Hardy-Weinberg), lo que no sucede por el proceso de muestreo. En la simulacin hecha por usted en el desarrollo de la clase terica se lleg a demostrar que este proceso conduce a la fijacin de un gen y a la prdida del otro en un nmero dado de generaciones.

Enseanza por simulacin en gentica Cuadro 7. Eleccin de los parmetros de la simulacin.


Parmetro Respuesta del alumno 10 Retroalimentacin

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Nmero de generaciones (T), 10//* Nmero de poblaciones (M) Nmero de genes (N) Frecuencia gnica inicial (PO), 0.5//* Intervalo de impresin 1//*

El alumno acept el valor sugerido, el programa pasa a la prxima secuencia Intente entre 2 y 50 Intente entre 4 y 50 El alumno acept el valor sugerido, el programa pasa a la prxima secuencia El alumno acept el valor sugerido, comienza la simulacin

1 1 0.5

*El signo // indica que usted puede sustituir el valor por otro que fuera conveniente.

Cuadro 8. Tendencia de la media y de la variancia de las frecuencias de los genes.


Pregunta 1 Respuesta del alumno Usted concluy que la media: AUMENTA DISMINUYE SE 2 MANTIENE PRACTICAMENTE CONSTANTE Usted concluy que la variancia: AUMENTA Retroalimentacin

NO CONCUERDO! Repita la simulacin NO CONCUERDOI Repita la simulacin MUY BIEN! Prxima secuencia (pregunta 2) MUY BIEN! Prxima secuencia es el punto 2) del Plan de trabajo NO CONCUERDO! Repita la simulacin NO CONCUERDOI Repita la simulacin

DISMINUYE SE MANTIENE PRACTICACAMENTE CONSTANTE

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Como son varios los alumnos que ejercitan la simulacin y algunos lo hacen ms de una vez, se reune una gran cantidad de informacin que ser llevada a una discusin conjunta coordinada por el profesor. En esa ocasin se analizan y comparan los trabajos amplindose el tratamiento estadstico de los datos. Esta ltima actividad permite mostrar cmo el ejercicio individual con un programa en una terminal de computadora puede ser usado de base para un desarrollo colectivo y creativo que se realiza a travs del trabajo en grupo.

RESUMEN Con la introduccin de la computadora como recurso didctico, se abren nuevos caminos para la enseanza de la biologa. El desarrollo de tcnicas de enseanza que emplean diversos modelos matemticos ha favorecido y estimulado al estudio de la gentica, y en especial la gentica de poblaciones. Este articulo se refiere al desarrollo de un programa de instruccin por simulacin del fenmeno de deriva gentica, el cual permite al alumno utilizar resultados que en la realidad llevara mucho tiempo observar. Los autores consideran que este tipo de mtodo didctico es el nico camino eficiente para la enseanza del mencionado fenmeno, ya que, por su complejidad, resulta muy dificil de ser explicado a travs de la clase magistral o el trabajo prctico convencional. El programa se est utilizando en un curso de posgrado en gentica, pero se estima que puede ser adaptado para otros campos de las ciencias de la salud, en funcin de los respectivos conocimientos previos de los alumnos.

REFERENCIAS (1) Palatnik, M., N.E. Fink de Cabutti y H.A. Caferra. Aspectos didcticos de la enseanza universitaria de la biologia. Cienc Invest (B Air) 28:281, 1972. (2) Bharucha-Reid, A.T. Elements of the Theory of Markov Processes and their Applications. Nueva York, McGraw-Hill Book Co., 1960. (3) Parzen, E. Procesos estocsticos. Madrid, Paraninfo, 1972. (4) Ehrenberg, A.S.C. Data Reduction. Analising and Interpreting Statistical Data. Londres, John Wiley and Sons, 1975.

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(5) Sinnot, E.W., L.C. Dunn y T. Dobzhansky. Principles of Genetics, 5' ed. Nueva York, McGraw-Hill Book Co., 1958. (6) Crow, J.F. y M. Kimura. An Introduction to Population Genetics Theory. Nueva York, Harper and Row, 1970. (7) Palatnik, M., J. Gordon y G.A. Gerardi. Equilibrio de genes en poblaciones humaArgentinas de Computacin nas. Modelo de simulacin. Anales de las PrimerasJornadas 2:1827, 1969. (8) Jouval Jr., H.E. y L.C. Galvo Lobo. O uso de tcnicas de simulacao em educaao mdica. Educ Med Salud 8(2):158, 1974. (9) Cavalli-Sforza, L.L. y W.F. Bodmer. The Genetics of Human Populations. San Francisco, W.H. Freeman and Co., 1971. (10) Galvo Lobo, L.C. Uso de computadores em educao. Revista Brasileira de Teleducacdo, Ano 5, No. 12, pg. 15, 1976.

INSTRUCTION BY SIMULATION IN GENETICS (Summary)

With the advent of the computer as an educational tool, new avenues have been opened in the teaching of biology. The development of instructional techniques using a variety of mathematical models has assisted and stimulated the study of genetics, particularly that of populations. This article refers to an instructional program by simulation of the genetic drift phenomenon, which enables the student to utilize results that would otherwise take a long time to observe. The authors feel that this teaching method is the only efficient way to teach the phenomenon, since its very complexity makes it very difficult to explain in the postgraduate classroom or through the conventional practical task. The program is being used in a graduate course in genetics; however it is felt that it can be applied to other health sciences fields and adopted to the levels of understanding of the students.

ENSINO MEDIANTE SIMULA(AO EM GENTICA (Resumo) Com a introduo do computador como recurso didtico, abrem-se novos caminhos para o ensino de biologia. O desenvolvimento de tcnicas de ensino que empregam diversos modelos matemticos favoreceu e estimulou o estudo da gentica e, de modo especial, a gentica de populaoes.

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Este artigo refere-se elaboraco de um programa de instruao mediante simulaao do fen6meno de deriva gentica, que permite ao aluno utilizar resultados cuja observaao na realidade levaria muito tempo. Consideram os autores que esse tipo de mtodo didtico o nico caminho eficiente para o ensino do fenomeno mencionado, uma vez que, dada sua complexidade, muito dificil sua explicacao em aula comum ou no trabalho prtico convencional. O programa est sendo utilizado num curso de ps-graduaao em gentica, mas possvel que possa ser adaptado a outros campos das ciencias da sade, em funco dos conhecimentos prvios aplicveis dos alunos.

L'ENSEIGNEMENT AU MOYEN DE LA SIMULATION EN GNETIQUE (Rsum) Avec l'introduction de l'ordinateur comme ressource didactique, l'enseignement de la biologie s'ouvre de nouveaux chemins. L'volution de techniques d'enseignement qui utilisent diffrents modeles mathmatiques a facilit et stimul l'tude de la gntique et, en particulier, de la gntique des populations. Le prsent article traite de l'laboration d'un programme d'instruction par simulation du phnomne de drivation gntique, lequel permet l'lve d'employer des rsultats dont l'observation en exigerait dans la ralit beaucoup de temps. Les auteurs sont d'avis que ce type de mthode didactique est la seule voie efficace pour l'enseignement du phnomne mentionn puisque, de par sa complexit, il est tres difficile de l'expliquer au moyen d'un cours thorique ou d'un travail pratique conventionnel. Le programme est utilis dans un cours post-universitaire de gntique mais on estime qu'il est possible de l'adapter d'autres domaines des sciences de la sant, et ce, en fonction de l'tat pralable des connaissances que possedent les tudiants.

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