TEMA 8 TRANSCRIPCION 1. Enumere los productos finales de la transcripcin. Cmo se relacionan stos con la sntesis de protenas Productos finales.

RNA mensajero (RNam): transporta el mensa!e para la sntesis de protenas. RNA de transferencia (RNAt): transporta los amino"cidos durante la sntesis de protenas. RNA ribosomales (RNAr): Son componentes estructurales de los ri#osomas. Para la sntesis de rotenas se re!uieren: $ Su#unidades ri#osmicas pe%ue&as ' (randes $ Cadena de ARN mensa!ero )ARNm*+ %ue es el portador de las instrucciones codificadas %ue especifican la secuencia de amino"cidos $ ARN de transferencia )ARNt* encar(ado de transportar los amino"cidos a los ri#osomas para incorporarlos a las protenas+ Estos ARNt forman enlaces co,alentes con los amino"cidos+ con los %ue forman aminoacil ARNt+ mediante reacciones catali-adas por en-imas especficos. Esto si(nifica %ue a cada ARNt le corresponde su propio amino"cido. Cada ARNt contiene+ adem"s+ un anticodn %ue reconoce el codn del ARNm %ue corresponde al amino"cido del %ue es portador. Todo este proceso de sntesis proteica o traduccin a partir de una molcula de RNAm+ re%uiere %ue pre,iamente se .a'a producido la transcripcin+ mediante la cual a partir de una molcula de /NA se ori(ina una de RNAm+ %ue lue(o ser,ir" de 0molde0 para la sntesis de nue,as protenas.

". In,esti(ue %ue determina la identidad de una #acteria o clula eucariota. 1as Protenas presentes en una clula determinan la identidad de una clula. #. E2pli%ue por%ue la clula necesita sinteti-ar como molde para construir las protenas+ una molcula de RNA idntica en la secuencia de #ases al /NA. Por %u el /NA no se utili-a como molde directamente 1a clula necesita sinteti-ar como molde por%ue la secuencia de #ases del A/N contiene se&ales para el inicio ' terminacin de la sntesis del RNA3 unidad de transcri ci$n.

El A%N no se uede utili&ar como molde directamente + 'a %ue este de#e duplicarse en cada ciclo celular para %ue cada clula .i!a manten(a la misma cantidad ' cualidad de informacin. Esta replicacin se produce durante la fase S del ciclo celular+ es decir %ue cada clula antes de di,idirse a tra,s del proceso conocido como mitosis+ debe du licarse ara !ue cada c'lula (ija ten)a e*actamente la misma cantidad de A%N !ue la c'lula madre ' adem"s de#e tener el A/N intacto es decir no .a#er sufrido mutaciones para %ue am#as clulas .i!as sean i(uales. El A/N para poder duplicarse+ cada una de las .e#ras de la do#le .lices sir,e de molde para la sntesis de una nue,a.

+. E2pli%ue como la estructura de la clula procariota ' eucariota determinan las caractersticas del proceso de transcripcin en cada una de estas clulas. En las bacterias la transcripcin tiene lu(ar en el citoplasma #acteriano. /e#ido a eso son catali-adas por una 4nica RNA olimerasa. Tienen una reaccin similar a la catali-ada por la /NA polimerasa. 1a ATP+ 5TP+ CTP 6 7TP son utili-ados para producir una copia de RNA complementaria a la secuencia molde de A/N. En las eucariotas la transcripcin tiene lu(ar en el n4cleo. 8a' reportado tres tipos de RNA Pol eucarsticas3 RNA P,-.MERA/A .: Sinteti-a precursores de la ma'ora de los RNA ri#osmicos+ con e2cepcin del 9S. RNA P,-.MERA/A ..: Sinteti-a precursores de los RNA mensa!eros. RNA P,-.MERA/A ...: Sinteti-a los RNA de transferencia+ precursores de los RNAr 9S ' RNAs pe%ue&os. 0. /i#u!e una cadena de /NA en proceso de transcripcin e indi%ue los elementos principales del proceso.

Transcri ci$n del A%N. En el punto de unin de la en-ima RNA polimerasa+ la do#le .lice de /NA se a#re '+ a medida %ue la RNA polimerasa a,an-a a lo lar(o de la molcula de /NA+ se separan las dos cadenas. 1os ri#onucletidos+ %ue constitu'en los #lo%ues estructurales+ se ensam#lan en la direccin 9: a ;: a medida %ue la en-ima lee la cadena molde de /NA. Ntese %ue la cadena de RNA recin sinteti-ada complementaria+ no idntica+ a la cadena molde a partir de la cual se transcri#e< su secuencia+ sin em#ar(o+ es idntica a la cadena codificante de /NA )no transcripta*+ e2cepto por un detalle3 en el RNA+ la timina )T* se reempla-a por uracilo )7*. E1 RNA recin sinteti-ado se separa de la cadena molde. 1. Cu"les son las caractersticas (enerales de la sntesis de RNA )transcripcin* => Sinteti-ado so#re un templado o cadena molde de /NA ' catali-ado por un RNA polimerasa dependiente de /NA. ?> 1os nucletidos trifosfatos ATP+ 5TP+ CTP 6 7TP son re%ueridos+ as como @(?A ;> No se re%uiere un primer de RNA. B> 1a cadena de RNA es sinteti-ada en la direccin 9: ;: ' el nucletido en el e2tremo 9: de la cadena retiene su (rupo trifosfato )ppp*. 9> 1a secuencia de #ases del /NA contiene se&ales para el inicio ' terminacin de la sntesis del RNA3 unidad de transcripcin. 2. @encione las caractersticas de la cadena codificante ' la cadena molde+ durante el proceso de transcripcin.

1a secuencia del transcrito )RNA* es complementaria a la cadena molde e idntica a la cadena codificante. 8. A partir de las si(uientes secuencias determine la secuencia de la cadena molde+ la secuencia codificante ' la secuencia del RNA mensa!ero+ se(4n corresponda3

a. Cadena codificante3 9CATC55T55CAAT5T555CCCT5ACT5TAC5T ;C Cadena molde3 ;: >TA5CCACC5TTACACCC555ACT5ACAT5CA9:

RNAm3 9:> A7C55755CAA757555CCC75AC757AC57>;:

b. RNA mensa!ero3 9D>A7C55C7AC755CA7CA7CCCAA5>;D

Cadena codificante3 9D>ATC55CTACT55CATCATCCCAA5>;D

Cadena molde3 ;:>TA5CC5AT5ACC5TA5TA555TTC>9:

c. Cadena molde3 9D>AT5TC5ACT5ATC5TA55TC5ATC5A>;D

Cadena codificante3 ;:>TACA5CT5ACTA5CATCCA5CTA5CT>9:

RNAm3 ;:>7ACA5C75AC7A5CA7CCA5C7A5C7>9:

d. Cadena molde3 ;D>AT555CTC5ATCTTA55CT5ATC5ATAA>;D

Cadena codificante3 ;: >TACCC5A5CTA5AATCC5ACTA5CTATT>;:

RNAm3 ;: >7ACCC5A5C7A5AA7CC5AC7A5C7A77>;:

e. RNA mensa!ero3 ;D>A7C5C7A5C7A5C77C7C7A555A>;D

Cadena codificante3 ;D>ATC5CTA5CTA5CTTCTCTA555A>;D

Cadena molde ;:> TA5C5ATC5ATC5AA5A5ATCCCT>;:

3. /efina. a. 7nidad de transcripcin. 7na unidad de transcri ci$n es un fra(mento de /NA %ue se e2presa a tra,s de la produccin de una sola molcula de RNA ' puede incluir m"s de un (en. 1a 7T est" definida por la accin de la RNA polimerasa cuando se une a una re(in especial al principio del (en llamada romotor %ue encierra el primer par de #ases %ue se transcri#e en RNA el cual se conoce como unto de iniciaci$n. /esde este punto+ la RNA polimerasa se mue,e a lo lar(o del molde sinteti-ando el RNA .asta %ue lle(a a la secuencia terminadora. b. Re(in promotora. -a re)i$n romotora es una porcin del A/N situada al principio del (en ' %ue+ sin codificar nin(4n amino"cido+ sir,e para %ue las en-imas %ue reali-an la transcripcin recono-can el principio del (en. 4. Re(in terminadora. Es una secuencia de /NA dentro del (en %ue se&ala a la RNA polimerasa el final de la transcripcin del RNA. d. Operon+ Es un (rupo de (enes %ue son transcritos !untos a partir de un 4nico promotor e. RNA poli(enico.

@olcula de RNA mensa!ero %ue codifica para la secuencia de amino"cidos de dos m"s cadenas polipeptdicas de (enes estructurales ad'acentes. Son frecuentementes encontrados en Eacterias ' Ar%ueas.

f. Factor de transcripcin.

1os factores de transcripcin son protenas %ue coordinan ' re(ulan la e2presin de un (en o de un (rupo de (enes. En muc.os casos re(ulan su propia e2presin ' tam#in es frecuente %ue re(ulen a otros factores de transcripcin. 1os factores de transcripcin interaccionan con re(iones especficas del A/N+ con elementos de la ma%uinaria de transcripcin como la ARN polimerasa+ con otros factores de transcripcin o con molculas %ue acti,an o in.i#en su acti,idad. Conectan los estmulos e2ternos e internos con las respuestas #iol(icas actuando como transductores de se&ales. El con!unto de los factores de transcripcin de una clula di#u!a una red transcripcional cu'as cone2iones determinan el con!unto de (enes %ue se e2presan en un determinado momento )transcriptoma*

). Secuencia A=

(. Ca!a Pri#noG.

Secuencia de H pares de #ases en e2tremo 9I del sitio de inicio de la transcripcin de (enes en procariontes+ el cual es reconocido por la su#unidad di(ma de la RNA polimerasa. 1a secuencia consenso de esta ca!a es TATAAT. Tam#in conocido como ca!a TATA.

15. /i#u!e un (en procariota e indi%ue3 re(in promotora+ secuencia A=+ ca!a Pri#noG+ secuencia >;9+ re(in codificante+ terminador.

11. @encione el papel del factor si(ma en el proceso de replicacin. In,esti(ue %ue tipo de (enes transcri#e el factor si(ma JK. Lu otros tipos de factor si(ma e2isten en la clula #acteriana ' %u tipo de (enes transcri#en El factor si)ma reconoce el sitio de iniciacin de la transcripcin ' por ello puede .a#er diferentes si(mas. Reconoce secuencias especficas llamadas centros promotores. 7na ,e- %ue la RNA pol lle,a iniciados dos o tres NTP se suelta si(ma ' si(ue el n4cleo+ este factor si(ma se une a otro n4cleo ' contin4a la transcripcin .asta %ue encuentra la se&al de terminacin %ue son diferentes. Su masa total son BMK N/a. 6actor si)ma 25. Es el m"s com4n+ interact4a con la ma'ora de los promotores procariontes. Es re(ulado por represores ' acti,adores %ue se encuentran cercanos al promotor. Al(unos e!emplos de promotores reconocidos por la ARN Polimerasa>O son el del o er$n lac ' del o er$n tr . 6actor si)ma 0+. 1a ARN polimerasa>O9B reconoce secuencias %ue son re(uladas e2clusi,amente por acti,adores %ue se encuentran unidos a secuencias amplificadoras locali-adas cientos o miles de pares de #ases )p#* del promotor corriente arri#a.= 7n e!emplo de promotor reconocido por la ARN Polimerasa> O es el del (en (lnA.

O =P (6E4.) > el factor si(ma citrato frrico+ re(ula el (en de la fec de transporte de .ierro O ?B (R oE) > el estrs si(ma factor calor e2trac'toplasmic Q e2tremo O ?M (RP,6) > el factor si(ma fla(elar O ;? (R o7) > el factor si(ma de c.o%ue de calor+ %ue se enciende cuando se e2pone al calor O ;M (RP,) > el .am#re Q estacionaria si(ma factor de fase

O 9B (R oN) > el factor si(ma>limitacin de nitr(eno

1". Realice un dia(rama del proceso de inicio de la transcripcin+ es decir cuando la RNA pol se une a la re(in promotora+ en clulas procariotas ' eucariotas. @encione las diferencias encontradas en am#os modelos as como las similitudes. PROCARIOTAS E7CARIOTAS

Re)i$n romotora ara la acti8idad de ARN olimerasa . Para el caso particular de la ARN polimerasa I %ue sinteti-a el ARN ri#osomal. En el (en )A/N* para el rARN presenta una re(in promotora de =9K pares de #ases+ u#icada en la posicin >=B? ' AH. Sin em#ar(o+ e2isten copias imperfectas del lar(o total del promotor en posiciones >=?KK ' >?;KK pares desde el sitio de inicio de la transcripcin ' entre estas re(iones .a' m4ltiples copias de HK M= pares de #ases de la re(in promotora ) ,er Fi(. M*.

1as copias HKQM= estimulan la transcripcin del ,erdadero promotor ' puede estar in,olucrado en la unin de un factor presente en cantidades limitadas. 1as copias totales de los promotores pero imperfectos son capaces de iniciar la sntesis de ARN+ pero este efecto termina antes de alcan-ar la ,erdadera re(in promotora.

Re)i$n romotora

ara la ARN olimerasa ...

1os (enes transcritos por la polimarasa II producen los ARN mensa!eros. Estos inclu'en los (enes %ue codifican a las protenas %ue son e2presadas constituti8amente )%ue siempre son e2presadas* en todos los te!idos ' a%uellos (enes %ue solamente son e2presados en un te!ido particular de un or(anismo multicelular o %ue esta re(ulado por la presencia o ausencia de un sustrato particular+ .ormona o estmulo am#iental.

1os promotores para la ARN polimerasa II est"n locali-ados en el lado 9: del sitio de inicio de la transcripcin.

Estas secuencias tienen la funcin de unir los factores de transcripcin especficos en ,e- de diri(ir los puntos de contacto con la ARN polimerasa II+ como ocurre en procariontes. Rarios promotores %ue est"n relati,amente cercanos al punto de inicio de la transcripcin+ son necesarios pero normalmente insuficientes para %ue se realice una eficiente e2presin de los (enes por la en-ima ARN polimerasa II. Adem"s e2isten otros tipos de secuencias en el A/N molde llamadas S EN7AN4ERT %ue no tienen acti,idad promotora por si mismas+ pero %ue pueden estimular la transcripcin ' pueden actuar so#re considera#les distancias de ,arios Nilo#ases del sitio de inicio de la transcripcin. 7na

caracterstica de los Sen.ancerT es %ue reali-an su accin independiente de la orientacin %ue ellos ten(an.

Es%uema de la posicin del SEn.ancerT con respecto a promotor.

El transcrito primario de la ARN polimerasa II+ son conocidas colecti,amente como ARNs nucleares .etero(neos. Ellas pueden lle(ar a ser (randes molculas )so#re =K Nilo#ases* de#ido %ue contiene a4n los intrones )secuencia %ue no son traducidas a protena* en la secuencia de ARN+ pero ellas no estar"n presentes en el ARN maduro. Re)i$n Promotora ara la acci$n ARN olimerasa ....

El control de transcripcin me!or estudiada es del (en rARN 9S+ %ue inesperadamente tiene una secuencia promotora dentro de su secuencia transcrita. Se .a determinado %ue la re(in interna promotora esta entre las posiciones A 9K ' A MB+ %ue mostr ser esencial para la transcripcin de los (enes rARN 9S )fi(. ==*. En la re(ulacin de las sntesis de rARN 9S e2isten factores llamados3 TFIIIA+ TFIIIC+ %ue son re%ueridos para una transcripcin eficiente.

1#. E2pli%ue los dos modelos de terminacin de la transcripcin en #acterias3 dependientes e independientes de la protena R.o. Terminaci$n inde endiente del factor r(o . Esto es distin(uido por la presencia de una secuencia rica 5C en el A/N se(uido por cinco o seis adeninas. E1 ARN transcriptos l(icamente tam#in posee esta re(in rica en 5C+ re(in %ue es capa- de formar un SloopT o estructura de .or%uilla como resultado de interaccin entre #ases complementarias. Adem"s se(uido de esta re(in rica en 5C+ en el e2tremo ;: del ARN aparece una secuencia rica en uracilo. Se .a o#ser,ado %ue la unin 7racilo con Adenina de la .e#ra de A/N molde es menos esta#le ' as el ARN es capa- de disociarse ) ,er fi(. H *. Por consi(uiente el duple2 A/N>ARN se suelta ' se li#era el ARN sinteti-ado.

Terminaci$n de endiente del factor r(o. Tam#in re%uiere la presencia de la estructura de .or%uilla )re(in rica en 5C*. Sin em#ar(o+ la secuencia rica en 7 est" ausente. El factor r.o+ es una protena compuesta por seis su#> unidades idnticas de BH U/a ' tiene una alta afinidad por ARN de .e#ra simple. Cuando se une al ARN+ el factor r.o .idroli-a ATP ' la ener(a li#erada es capa- de mo,er este comple!o proteico )factor r.o* a lo lar(o del ARN %ue se est" sinteti-ando en direccin de la #ur#u!a de transcripcin. Cuando lle(a a dic.a #ur#u!a+ el factor r.o disocia el .#rido A/N>ARN por un mecanismo desconocido+ li#erando el ARN al citoplasma ),er fi(. J*.

1a transcripcin puede ser #lo%ueada por in(ibidores es ecficos9 llamados com4nmente anti#iticos. Por e!emplo+ el anti#itico rifam icina in.i#e la iniciacin de la sntesis de ARN+ mientras %ue la actinomicina % #lo%uea la elon(acin del ARN. 1+. @encione las principales diferencias entre la transcripcin procariota ' eucariota.

10. @encione los principales productos de cada una de las RNA polimerasas eucariotas.

11. /i#u!e un (en eucariota e indi%ue3 elementos del promotor+ e2on+ intron+ secuencia se&al de terminacin )sitio de adicin de colas de A*. Comp"relo con el di#u!o reali-ado en la pre(unta H.

4om araci$n. El proceso de transcripcin tanto en clulas eucariotas como en clulas procariotas es mu' similar+ sal,o %ue en las clulas procariotas no se lle,a ca#o el proceso de maduracin en el cual del ARNm se eliminan los e2ones+ mediante un proceso en el %ue formas una especie de #ur#u!a %ue se separa del ARN ' se elimina+ %uedando 4nicamente los intrones %ue contienen la informacin necesaria %ue se ser" traducida posteriormente en la la fase de traduccin. Tam#in durante el proceso de maduracin en clulas eucariotas la se&al de inicio ' de final de mensa!e %uedan modificadas. 12. @encione ' descri#a los tres tipos de modificaciones postranscripcional %ue sufren los RNA mensa!ero eucariotas.

18. In,esti(ue en %u consiste el proceso de splicin( )corte ' empalme*. es un proceso post>transcripcional de maduracin del ARN del cual eliminan ciertos fra(mentos secuenciales. Este proceso es mu' com4n en eucariotas+ pudindose dar en cual%uier tipo de ARN aun%ue es m"s com4n en el ARNm. Tam#in se .a descrito en el ARNr ' ARNt de procariotas ' #acterifa(os. Normalmente consiste en eliminar los intrones del transcrito primario ' posteriormente unir los e2ones< aun%ue e2isten otros tipos de a!uste donde se eliminan e2ones 'Qo retienen intrones
El s licin) de ARN o em alme de ARN

El splicin( del pre>RNA ocurre en un comple!o (rande denominado spliceosoma )partcula procesadora* compuesta por pe%ue&as ribonucleo roteinas. El Splicin( de los RNAm es catali-ado por el Spliceosoma+ formado por pe%ue&as ri#onucleoproteinas )snRPNps*. 1os RNAs encontrados en los snRNPs son denominados 7=+ 7?+ 7B+ 79 ' 7H )snRNAs*.

13. @encione el papel de cada una de los ri#onucleoprotenas %ue forman el spliceosoma. 4om lejo E: :1 se une a la secuencia consenso 57 del e2tremo 9: del sitio de corte del intrn+ !unto con las protenas accesorias ASFQSF?+ 7?AF+ SF=QEEP. 4om lejo A: :" se une al sitio de ramificacin e .idroli-a ATP. El sitio de ramificacin se sit4a a una distancia de ?K>BK nucletidos del e2tremo ;: del intrn ' en l se locali-a la secuencia consenso C7RA6. 4om lejo ;1: 79+ 7B ' 7H trimeri-an+ ' 79 se une al e2n 9: ' 7H a 7?. 4om lejo ;" < 7= es li#erado+ 79 pasa del e2n al intrn ' 7H se une al e2tremo 9: del sitio de corte. 4om lejo 41: 7B es li#erado+ 79 se une al sito de empalme del e2tremo ;: del e2n+ 7H ' 7? catali-an la reaccin de transesterificacin ' el e2tremo 9: del intrn es cortado< como resultado se forma una estructura en la-o caracterstica denominada lariat. 4om lejo 4": el e2tremo ;: del intrn es cortado lo %ue pro,oca la li#eracin del la-o de ARN. A continuacin los e2ones son li(ados+ lo %ue conlle,a (asto de ATP. Por 4ltimo+ el comple!o se disocia. "5. @encione los tipos de modificaciones postranscripcionales %ue sufren los RNAr ' RNAt en la clula.

"1. @encione tres ri#o-imas %ue participan en el proceso de transcripcin. Lu funcin tienen cada una de ellas Ri#o-ima RNAsaP+ ' aminoacil> tARN>sintetasas