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Introduccin Los aminocidos (aa) son compuestos qumicos formados por un grupo amino y un grupo carboxilo, cuando 2 aminocidos

se combinan forman un di pptido, tres aminocidos un tri pptido y un mayor numero conforman un poli pptido. Cuando el poli pptido consta de ms de medio centenar de aminocidos se denomina protena. Las clulas han desarrollado diversas estrategias para aislar y organizar sus reacciones qumicas. Una de ellas es la congregacin en un solo complejo grande de protenas las enzimas requeridas para catalizar sus reacciones. Estos complejos multiproticos se emplean en la sntesis de DNA y RNA y protenas. El dogma central de la biologa establece que la informacin puede fluir de un cido nuclicos a una protena pero no de la protena a otra protena, mucho menos de un protena a un acido nuclico. Sin embargo en el mundo biolgico las excepciones son muy significativas y reveladoras de los procesos vitales cuya pluralidad no se ajusta a leyes universales, tal es el caso de la transcripcin del DNA a partir de RNA mediante la intervencin de la enzima transcriptasa inversa. Jacob y Monod contribuyeron a establecer la relacin precisa entre el DNA, el RNA y las protenas y a dilucidar los mecanismos de trascripcin por la cual se forma RNA a partir de DNA, y la traduccin en donde la secuencia de bases en el mRNA. Cdigo gentico Las protenas tienen 20 tipos de aminocidos pero el DNA y RNA tienen solo 4 tipos de nucletidos (adenina A, guanina G, citosina C, timina T o uracilo U), si un nucletido codificara un aa entonces solo 4 aa podran se especficos para las 4 bases nitrogenadas. El cdigo gentico es una clave que permite interpretar la codificacin de aa presentes, como un lenguaje que le indica a la clula como fabricar protenas necesarias para cumplir sus funciones. Caractersticas del cdigo gentico
aa = Aminocido (s) ER = Retculo endoplsmico e- = Electrones

Esta organizado en tripletes.

Por medio de conceptos matemticos se podra deducir que la combinacin de 2 nucletidos especificara un aminocido podra haber un nmero mximo de 16 aa distintos, esto resultara insuficiente pues son 20 aa. Por lo tanto, al menos 3 nucletidos(43), en secuencia deben especificar cada aa esto dara por resultado 64 combinaciones posibles, que resultan ms que suficientes a este cdigo de tripletes se les llama Codones cada uno de los cuales indica que aa es necesario para fabricar una protena, por ejemplo CUA=leucina, CCG=prolina, UUC=fenilalanina. Es degenerado.

El cdigo gentico est formado por 64 combinaciones de codones y sus correspondientes aminocidos, donde cada aminocido puede estar codificado por ms de un triplete es decir existen codones sinnimos .Esta degeneracin es en base a 2 motivos: Algunos aa pueden ser transportados por distintos tipos de ARN de transferencia que contienen distinto anti codones. Algunos pueden incorporar un aa especfico. Esto representa cierta seguridad ate posible cambios de nucletidos por mutaciones, o por error en la transcripcin (el codn resultante puede tener el mismo significado aun conteniendo bases distintas a las del codn original). Es unidireccional, no es solapado o sin superposiciones

Los tripletes se interpretan uno tras otro en el sentido 5 3 de manera que una base no puede pertenecer a ms de un triplete ni quedar suelta sin pertenecer a ninguno. Es decir un nucletido solo pertenece a un solo codn, en caso de formar parte de ms de uno tendra un cambio de ms de un aminocido.
aa = Aminocido (s) ER = Retculo endoplsmico e- = Electrones

Es universal porque lo utilizan casi todos los seres vivos conocidos, tiene el mismo significado en todas las clulas. Solo existen algunas excepciones en unos pocos tripletes en bacterias y en el cdigo gentico mitocondrial. Mecanismo de traduccin, sntesis del RNA mensajero

El mRNA lleva la informacin que dicta los aminocidos que formaran la protena que se va a sintetizar el tRNA y el rRNA forman parte de la maquinaria de sntesis proteica. Los 3 tipos estn codificados por genes distintos. La transcripcin es el proceso por el cual se sintetiza RNA a partir de una de las 2 cadenas de DNA segn el principio de apareamiento de las bases que gobiernan la rplica del DNA. Al igual que una cadena de DNA, cada molcula de RNA tiene una secuencia 53 como tambin ocurre en la sntesis DNA los ribo nucletidos presentes en la clula como trifosfatos son aadidos por una enzima, la RNA polimerasa que cataliza la adicin de ribo nucletidos uno a uno al extremo 3 de la cadena de RNA en crecimiento. Las bacterias tienen solo un tipo de RNA polimerasa que sintetiza no solo el mRNA sino tambin los otros tipos de RNA que actan en la sntesis proteica, en contraste, los eucariontes tienen 3 tipos de esta enzima en su ncleo numeradas I, II y III. La empleada para la sntesis de mRNA es la RNA polimerasa II, los otros 2 tipos transcriben molculas de RNA que no se traducen en protenas. Burbuja transcripcional y elongacin En clulas eucariontes la RNA polimerasa se une al DNA en una secuencia especifica llamada promotor o caja TATA (5-TATAAAA-3), donde se define el punto exacto de inicio de la transcripcin y la direccin hacia la cual avanza la RNA polimerasa. Una vez unida al DNA la RNA polimerasa abre uno pequea regin de la doble hlice y expone unos nucletidos, luego la enzima va aadiendo ribo nucletidos, desenrollando la hlice y exponiendo nuevas regiones con las que se aparean los ribo nucletidos complementarios. En procariotas, el proceso de elongacin de la nueva cadena de mRNA continua hasta que la enzima encuentra una secuencia especial en la nueva molcula es decir la seal de terminacin de la transcripcin. Esta terminacin puede clasificarse de 2 formas: una independiente de rho () y otra dependiente de . Terminacin Los terminadores independientes de que tienen una secuencia consenso: un palndromo o repeticin invertida rica en G-C muy estable que precede a una secuencia de 6-7 residuos de U en la cadena de RNA. Por otro lado, los
aa = Aminocido (s) ER = Retculo endoplsmico e- = Electrones

terminadores dependientes de contienen residuos de regularmente en una regin relativamente poco estructuradas.

distribuidos

aa = Aminocido (s) ER = Retculo endoplsmico e- = Electrones

Traduccin o sntesis de un poli pptido dirigido por el RNA En los procariontes los ribosomas se unen a una molcula de mRNA en crecimiento y su traduccin a protena comienza aun antes de que se haya completado en crecimiento. Por el contrario, en los eucariontes la transcripcin y la traduccin estn separadas no solo en el tiempo sino tambin en el espacio, la transcripcin ocurre en el ncleo y la traduccin en el citoplasma. Mas alla de esa diferencia los siguientes pasos del proceso son muy similares. Una vez sintetizados los mRNA, tiene lugar la siguiente etapa en el flujo de informacin, la traduccin. Los participantes son los mRNA, los rRNA y los tRNA, si bien los 3 tipos de RNA difieren en su estructura y su funcin, todos se transcriben de la misma manera. El rRNA. Forma los ribosomas, cada uno es una aglomeracin de varios rRNA. Los ribosomas son una maquinaria de sntesis de poli pptidos constituido por 2 subunidades de diferente tamao. Durante este proceso el mRNA que transporta el mensaje y los tRNA se une a las subunidades mayores y su funcin es catalizar la formacin de la unin peptdica entre los aminocidos. Existen 3 zonas en las subunidades a los que se une en tRNA: el sitio A, el sitio E y el sitio P. El tRNA. Son molculas pequeas de 70 a 90 nucletidos, cada uno con 2 sitios de unin. Uno de ellos el Anti codn se une a codo de la molcula de mRNA, el otro sitio de unin se acopla a un aa particular. As el tRNA permite que el mRNA se alinee de acuerdo a una secuencia de aa, con lo que constituye el eslabn entre cidos nuclicos y protenas. Depende de un grupo de enzimas las aminoacil-tRNA sintasas. La iniciacin de la sntesis Comienza con la formacin del complejo de iniciacin, consta de la subunidad ribosomal pequea, el mRNA y el tRNA iniciador. Esta subunidad se acopla a una cadena de mRNA cerca del extremo 5. Luego el primer tRNA (iniciador) aparea su anti codn con el primer codn del mRNA. La energa para este paso la suministra la hidrolisis del trifosfato de guanosina (GTP).

aa = Aminocido (s) ER = Retculo endoplsmico e- = Electrones

Elongacin del poli pptido Una vez ensamblado el ribosoma, comienza la etapa de elongacin. En esta el sitio A del ribosoma (cuyo sitio P se ha ocupado por el tRNA con la cadena peptdica en crecimiento o por tRNA iniciador) es ocupado transitoriamente por sucesivos aminoacil-tRNA. La unin del aminoacil-tRNA requiere su unin previa con una protena llamada cofactor de elongacin, que en su forma activa est unida al GTP. El primer tRNA se desplaza hacia el sitio de salida E y se libera, el ribosoma se mueve a un codn a lo largo de la cadena de mRNA; en consecuencia el segundo tRNA se transfiere de la posicin A a la posicin P. Un tercer aminoacil-tRNA se ubica en el espacio vacante de la posicin A apareado al tercer codn del mRNA y se repite el paso. La posicin P acepta el tRNA que porta la cadena peptdica creciente.

Terminacin de la sntesis En el final de la secuencia de la molcula de mRNA hay un codn que acta como Seal de terminacin. Se conocen 3 codones de terminacin: UAG, UAA y UGA. No existe ningn tRNA cuyo anti codn se aparee con esos codones, para ello existen ciertos factores de liberacin que se unen a cualquier codn de terminacin que alcance el sitio A del ribosoma. Estas protenas alteran la actividad de la peptidiltransferasa lo que provoca que el poli pptido se separe del tRNA. As, cuando se alcanza un codn de terminacin, se detiene la traduccin, la cadena polipeptdica se desprende y las 2 subunidades ribosmicas se separan.

aa = Aminocido (s) ER = Retculo endoplsmico e- = Electrones

Durante la sntesis de protenas, las cadenas polipeptdicas comienzan a plegarse. En muchos casos un grupo de protenas denominadas Chaperonas que ayudan al plegamiento correcto. Existen 2 tipos de Chaperonas: las chaperonas moleculares que con gasto de energa se unen y estabilizan las protenas en formacin e impiden su degradacin, otro grupo denominado chaperoninas facilita el plegamiento. Regulacin de la expresin gentica: el modelo Operon. La regulacin implica interacciones entre el ambiente qumico de la clula y ciertas protenas codificadas por genes reguladores. El conocimiento acerca de la regulacin de la transcripcin se basa en el modelo del opern. De acuerdo con este modelo, lo grupos de genes que codifican protenas con funciones relacionadas se disponen en unidades. El segmento de DNA que codifica para un poli pptido especfico se conoce como gen estructural. Un opern es un grupo de genes estructurales cuya expresin est regulada por elementos de control o genes (promotor y operador) y genes reguladores. Un opern consiste en:

El promotor es el sitio del ADN en donde se adhiere la ARN polimerasa para ser transcripto. Es un sitio de unin sobre el DNA y no se transcribe. Un operador es un sitio de unin que controla el acceso de la RNA polimerasa al promotor, no se transcribe al igual que el promotor. Un gen regulador para controlar el tiempo y velocidad de transcripcin de otros genes. Codifica para que una protena se pegue al operador, obstruyendo al promotor (y la transcripcin) del gen estructural. Cuando se remueve la protena represora puede producirse la transcripcin. Un gen estructural que codifica las enzimas relacionadas o las protenas estructurales.

aa = Aminocido (s) ER = Retculo endoplsmico e- = Electrones

Los operones son inducibles o reprimibles de acuerdo al mecanismo de control. El opern lactosa, abreviado LAC es un sistema inducible pues la protena reguladora, producto del gen regulador, que impide la expresin de los genes estructurales en ausencia del inductor, que en este caso es la lactosa. Cuando un producto del metabolismo como el Triptfano esta en cantidades suficientes la bacteria puede dejar de fabricar las enzimas que lo sintetizan, en este sistema el producto funciona como correpresor unindose al represor y de ese modo detiene la sntesis proteica. Tanto la represin como la induccin son ejemplo de control negativo, es decir cuando el producto del gen regulador reprime o impide la expresin de los genes, dado que la protena represora detiene la transcripcin. Si el producto del gen regulador activa la expresin de los genes se dice entonces que se trata de un control positivo. Operon LAC. Cuando hay lactosa en el medio (intestinos de un mamfero durante la lactancia), sta funciona como inductor, se une al represor cambiando su forma lo que evita que se pueda unir al operador, de este modo la polimerasa puede transcribir los genes correspondientes. Cuando no hay lactosa en el medio, la protena represora se encuentra unida al operador impidiendo la unin de la ARNpolimerasa a la regin promotora y, como consecuencia la transcripcin de los genes estructurales para las enzimas que metabolizan la lactosa.

aa = Aminocido (s) ER = Retculo endoplsmico e- = Electrones

La lactosa, el azcar de la leche, es hidrolizada por la enzima betagalactosidasa. Esta enzima es inducible: solo se produce en grandes cantidades cuando la lactosa, el sustrato sobre el cual opera, est presente. Operon TRP. Es un sistema de tipo represible, ya que el aminocido triptfano (Correpresor) impide la expresin de los genes necesarios para su propia sntesis cuando hay niveles elevados de triptfano. En cambio, las enzimas para la sntesis del aminocido triptfano se producen continuamente a menos que el triptfano est presente en el medio de cultivo, se dice en este caso que las enzimas sintetizadoras de triptfano estn reprimidas. Cuando hay ausencia de
triptfano, o cuando hay muy poco, la protena reguladora producto del gen regulador de TRP no es capaz de unirse al operador de forma que la ARN-polimerasa puede unirse a la regin promotora y se transcriben los genes.

Transporte intracelular Cada compartimento contiene un solo conjunto de protenas que debe transferirse desde el citosol, donde se fabrica, hasta el compartimento en el que ser utilizado. Esta transferencia, tambin llamada distribucin proteica, depende de seales establecidas en la secuencia de aminocidos de las protenas. En las clulas
aa = Aminocido (s) ER = Retculo endoplsmico e- = Electrones

eucariontes ciertos compartimentos delimitados por membranas se comunican con otros mediante la formacin de pequeos sacos membranosos o vesculas que se desprenden de un compartimento, se mueven a travs del citosol y se fusionan con otros en un proceso denominado transporte vesicular que consiste en un medio por el cual las macromolculas son transportadas. Este trfico vesicular da origen a las principales vas de liberacin de protenas desde la clula por medio del proceso de exocitosis y para capturarlas desde el exterior por endocitosis. Los compartimentos de la clula estn organizados de la siguiente manera: 1. Ncleo y citosol. El ncleo esta cercado por una membrana doble conocida como envoltura nuclear y lo comunica con el citosol a travs de poros nucleares que perforan la envoltura. El poro nuclear posee uno o ms canales llenos de agua a travs de los cuales las pequeas molculas hidrosolubles pasan libremente, en cambio, las molculas ms grandes como protenas y RNA y otros complejos macromoleculares no pueden pasar libremente y de manera no selectiva. 2. Orgnulos de la va excretora y endcita todos ellos de membrana sencilla (lisosomas, ribosomas, aparato de golgi, endosomas, etc.). Proporciona un sistema de regulacion de la digestin de las macromolculas mediante va cenoctica, el sistema membranoso interno permite que la clula pueda realizar la liberacin al exterior las protenas y glcidos acabados de sintetizar. Tambin llamado transporte transmembranal. 3. Mitocondrias y cloroplstidos. Ambos estan cercados por membranas internas y externas y ambos orgnulos se especializan en la sntesis de ATP. Los cloroplastos contienen tambin un tercer sistema de membranas, la membrana tilacoides. La mayora de las protenas de los cloroplastos y las mitocondrias estn codificada por genes del ncleo y se importan desde el citosol. Estas protenas tienen un cdigo seal en su N-terminal que les permite ingresar a la mitocondria o el cloroplasto.

aa = Aminocido (s) ER = Retculo endoplsmico e- = Electrones

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