TRABAJO COLABORATIVO BIOTECNOLOGA I

GRUPO 201529_5

PRESENTADO A Dr. GUSTAVO ACOSTA

UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A DISTANCIA UNAD ESCUAELA DE CIENCIAS AGRICOLAS PECUARIAS Y DEL MEDIO AMBIENTE ESPECIALIZACION EN BIOTECNOLOGIA AGRARIA 2014

ESTRUCTURA Y FUNCIN DEL ADN La gentica es una ciencia sin historia. Antes de Mendel, hace menos de siglo y medio, no haba nada. Incluso despus de que se redescubriera su trabajo, en 1901, los genetistas slo se interesaron por el sexo, como le haba ocurrido a l mismo. Los genes se iban descubriendo de una forma muy biolgica: mediante cruces entre ratones, moscas o setas, y observando el reparto de rasgos entre sus vstagos. El carcter del material hereditario se ignoraba (Rodriguez, 2007). El primer ADN se extrajo de vendajes llenos de pus. Como estaba lleno de esperma de pez, se llam a la sustancia espermina (sustancia era rica en carbono, hidrogeno, oxigeno, nitrgeno y un porcentaje elevado de fosforo). Este indicio de la importancia que tena qued ignorado porque el ADN pareca ser una cosa muy elemental. Slo tena cuatro subunidades qumicas -repetidas muchas veces en una larga cadena, a diferencia, por ejemplo, de las protenas, que tenan alrededor de 20 constituyentes distintos, con una vasta diversidad de formas y tamaos. Las protenas eran los candidatos ms claros para contener el material gentico, mientras que el ADN era la molcula estpida, tan sencilla que era imposible que desempeara ningn papel fundamental en el organismo (Rodriguez, 2007). En 1966 se descubri el cdigo de todos los aminocidos y de los principios y finales de las frases que dan las instrucciones para fabricar protenas. Watson ayud a aclarar

la forma de leer el mensaje hereditario. Estudi una molcula intermedia, el ARN, que transporta la informacin gentica contenida en el ADN de un lugar a otro en la clula. Con su trabajo obtuvo lo que denomin el dogma central de la biologa molecular, que consiste en que el ADN fabrica el ARN y ste, a su vez, fabrica la protena Lejos de ser una simple lnea de instrucciones, el ADN, en muchas criaturas, posee una estructura muy elaborada. Definicin Los cidos Nucleicos son las biomolculas portadoras de la informacin gentica. Son biopolmeros, de elevado peso molecular, formados por otras subunidades estructurales o monmeros, denominados Nucletidos. Desde el punto de vista qumico, los cidos nucleicos son macromolculas formadas por polmeros lineales de nucletidos, unidos por enlaces ster de fosfato, sin periodicidad aparente. De acuerdo a la composicin qumica, los cidos nucleicos se clasifican en cidos Desoxirribonucleicos (ADN) que se encuentran residiendo en el ncleo celular y algunos organelos, y en cidos Ribonucleicos (ARN) que actan en el citoplasma. ESTRUCTURA Y PROPIEDADES DE LOS CIDOS NUCLICOS Los cidos nucleicos estn formados por largas cadenas de nucletidos, enlazados entre s por el grupo fosfato. El grado de polimerizacin puede llegar a ser altsimo, siendo las molculas ms

grandes que se conocen, con molculas constitudas por centenares de millones de nucletidos en una sola estructura covalente Las Bases Nitrogenadas son las que contienen la informacin gentica. En el caso del ADN las bases son dos Purinas y dos Pirimidinas. Las purinas son A (Adenina) y G (Guanina). Las pirimidinas son T (Timina) y C (Citosina). En el caso del ARN tambin son cuatro bases, dos purinas y dos pirimidinas. Las purinas son A y G y las pirimidinas son C y U (Uracilo). Como son aromticas, tanto las bases pricas como las pirimidnicas son planas, lo cual es importante en la estructura de los cidos nucleicos. Tambin son insolubles en agua y pueden establecer interacciones hidrfobas entre ellas; estas interacciones sirven para estabilizar la estructura tridimensional de los cidos nucleicos. Las bases nitrogenadas absorben luz en el rango ultravioleta (250-280 nm), propiedad que se usa para su estudio y cuantificacin. Bases pricas Estn basadas en el Anillo Purnico. Puede observarse que se trata de un sistema plano de nueve tomos, cinco carbonos y cuatro nitrgenos. Bases pirimidnicas Estn basadas en el Anillo Pirimidnico. Es un sistema plano de seis tomos, cuatro carbonos y dos

nitrgenos. Nucletidos Los nucletidos son los steres fosfricos de los nuclesidos. Estn formados por la unin de un grupo fosfato al carbono 5 de una pentosa. A su vez la pentosa lleva unida al carbono 1 una base nitrogenada. Adems de formar la estructura de los cidos nucleicos los nucletidos tienen otras funciones relevantes: 1. El nuclesido Adenosina tiene funciones de neurotransmisor. 2. ATP es la molcula universal para transferencia de energa; 3. UDP y el CDP sirven como transportadores en el metabolismo de glcidos, lpidos y otras molculas; 4. AMPc, GMPc y el propio ATP cumplen funciones reguladoras; 5. AMP forma parte de la estructura de coenzimas como FAD, NAD+, NADP+ y CoA. Aparte de su carcter como monmeros de cidos nucleicos, la estructura de nucletido est generalizada entre las biomolculas, y particularmente como coenzimas. Entre las ms representativas podemos nombrar: Niacina adenina dinucletido (forma reducida, NADH). Flavina Adenina dinucletido (FAD). Coenzima A (forma acetilada, Acetil-CoA). Uridina difosfato glucosa (UDPG) El ADN cido Desoxirribonucleico (ADN), material gentico de todos los organismos celulares y casi todos los virus. Es el tipo de molcula ms compleja que se conoce. Su

secuencia de nucletidos contiene la informacin necesaria para poder controlar el metabolismo un ser vivo. El ADN lleva la informacin necesaria para dirigir la sntesis de protenas y la replicacin. En casi todos los organismos celulares el ADN est organizado en forma de cromosomas, situados en el ncleo de la clula. Est formado por la unin de muchos desoxirribonucletidos. La mayora de las molculas de ADN poseen dos cadenas antiparalelas (una 5-3 y la otra 3-5) unidas entre s mediante las bases nitrogenadas, por medio de puentes de hidrgeno. La adenina enlaza con la timina, mediante dos puentes de hidrgeno, mientras que la citosina enlaza con la guanina, mediante tres puentes de hidrgeno. El estudio de su estructura se puede hacer a varios niveles, apareciendo estructuras, primaria, secundaria, terciaria, cuaternaria y niveles de empaquetamiento superiores. Estructura Primaria Se trata de la secuencia de desoxirribonucletidos de una de las cadenas. La informacin gentica est contenida en el orden exacto de los nucletidos. Las bases nitrogenadas que se hallan formando los nucletidos de ADN son Adenina, Guanina, Citosina y Timina. Los nucletidos se unen entre s mediante el grupo fosfato del segundo nucletido, que sirve de puente de unin entre el carbono 5' del primer nucletido y el carbono 3' de siguiente nucletido.

Como el primer nucletido tiene libre el carbono 5' y el siguiente nucletido tiene libre el carbono 3', se dice que la secuencia de nucletidos se ordena desde 5' a 3' (5' 3'). Estructura Secundaria Es una cadena doble, dextrgira o levgira, segn el tipo de ADN. Ambas cadenas son complementarias, pues la adenina de una se une a la timina de la otra, y la guanina de una a la citosina de la otra. Estas bases enfrentadas son las que constituyen los Puentes de Hidrgeno. Adenina forma dos puentes de hidrgeno con Timina. Guanina forma tres puentes de hidrgeno con Citosina. Ambas cadenas son antiparalelas, pues el extremo 3 de una se enfrenta al extremo 5 de la otra. Las dos hebras estn enrolladas en torno a un eje imaginario, que gira en contra del sentido de las agujas de un reloj. Las vueltas de estas hlices se estabilizan mediante puentes de hidrgeno. Esta estructura permite que las hebras que se formen por duplicacin de ADN sean copia complementaria de cada una de las hebras existentes. Existen tres modelos de ADN: ADN-B: ADN en disolucin, 92% de humedad relativa, se encuentra en soluciones con baja fuerza inica se corresponde con el modelo de la Doble Hlice. Es el ms abundante y es el descubierto por Watson y Crick. ADN-A: ADN con 75% de humedad, requiere Na, K o Cs como

contraiones, presenta 11 pares de bases por giro completo y 23 de dimetro. Es interesante por presentar una estructura parecida a la de los hbridos ADN-ARN y a las regiones de autoapareamiento ARN-ARN. ADN-Z: doble hlice sinistrorsa (enrollamiento a izquierdas), 12 pares de bases por giro completo, 18 de dimetro, se observa en segmentos de ADN con secuencia alternante de bases pricas y pirimidnicas (GCGCGC), debido a la conformacin alternante de los residuos azcar-fosfato sigue un curso en zig-zag. Estructura terciaria El ADN presenta una estructura terciaria, que consiste en que la fibra de 20 se halla retorcida sobre s misma, formando una especie de super-hlice. Esta disposicin se denomina ADN Superenrollado, y se debe a la accin de enzimas denominadas Topoisomerasas-II. Este enrollamiento da estabilidad a la molcula y reduce su longitud. Estructura cuaternaria La cromatina en el ncleo tiene un grosor de 300. La fibra de cromatina de 100 se empaqueta formando una fibra de cromatina de 300. El enrollamiento que sufre el conjunto de nucleosomas recibe el nombre de Solenoide. Los solenoides se enrollan formando la cromatina del ncleo interfsico de la clula eucariota. Cuando la clula entra en divisin, el ADN se compacta ms, formando los cromosomas. Replicacin del ADN

ES EL PROCESO POR EL CUAL LA INFORMACION CONTENIDA EN EL DNA ES PERPETUADA, el cual tiene unas caractersticas como las siguientes Caractersticas La replicacin del DNA es semi conservadora. Cada Cadena de DNA acta como molde para la sntesis de una nueva cadena. El resultado son dos molculas de DNA nuevas, cad a una con una cadena nueva y otra vieja. Este proceso se denomina repli cacin semiconservadora. - La sntesis del DNA progresa in variablemente en direccin 5'a 3 y por lo tanto es semidiscontinua. - La replicacin empieza en un p unto de origen y normalmente a vanza de forma bidireccional formando una doble horquilla - La replicacin es muy precisa. La replicacin tiene lugar con u n grado extraordinario de fidelidad. En n ucletidos incorporados. - El DNA es sintetizado por DNA polimerasas. Se conocen nume rosos tipos, de Polimerasas tanto en procari otes como en eucariotes, pero su mecanismo de accin es similar en todos los casos: todas ellas actan sintetizando una doble cadena complementaria a la doble cade na de DNA preexistente y todas ellas requieren un cebador inicial, ca dena corta de RNA, para poder proceder a la sntesis de DNA.

Origen de esta replicacin Los orgenes de replicacin so n los puntos fijos, situados en la doble hlice de DNA, a partir de los cuales se lleva cabo la replica cin, que avanza de forma secuencial fo rmando estructuras con forma de horquilla. La cantidad de DNA que se p uede sintetizar a partir de un nico origen de replicacin se deno mina replicn o unidad funcion al de replicacin. El genoma bacteriano es un r eplicn nico circular. En organismos eucariotas, la r eplicacin del ADN se inicia e n mltiples orgenes a la vez (ha y uno cada 20 kb aproximada mente), es decir, hay multitud de replic ones.

mediante el cual se copia el genoma, constituido fundamentalmente por el cido desoxirribonucleico (DNA). RECONOCIMIENTO La Unin protenas-ADNen cuestin de reconocimiento qumico. Que se divide en: Transcripcin

Genoma humano contiene 105 promotores, 104 veces ms ADN no especfico que promotores. Ej.: TFIID. Replicacin (eucariotas):

ORC (complejo de reconocimiento del origen) por TFIID Genoma humano 2 000 Orgenes Recombinacin

La maquinaria tiene ventaja porque utiliza un ADN como gua. Selectividad de sitio de la protena estndar. Este se cuenta con suficiente selectividad de unin el TFIID y el ORC como para llegar a su destino apropiado sin ayuda de otros factores La estructura de la cromatina, ayuda a la regulacin de la afinidad relativa de una protena para lugares especficos y no especficos. Mutaciones en activadores tienen efectos paralelos en replicacin. Activadores de transcripcin desempean papeles similares en los promotores y los orgenes de replicacin.

Mecanismos paralelos entre: Replicacin de ADN Recombinacin y Transcripcin La replicacin del DNA es indispensable para la transmisin de la informacin gentica y permite copiar el genoma con gran exactitud. La generacin de nuevas clulas, desde los organismos procariontes hasta los humanos, requiere de mecanismos que dupliquen con exactitud el material gentico antes de cada divisin celular. La replicacin es el proceso

Las ARSs de levaduras contienen un lugar de unin para el Abf1 Facilita la ocupacin del origen de replicacin. Lgico pensar que es por unin del Abf1 al ORC. Un origen en el cual el ORC se une sin la ayuda del Abf1. Los ORC de levaduras tienen suficiente unin selectiva como para encontrar los orgenes sin ayuda. Algunos promotores son ocupados por el TFIID incluso sin activadores. Depende de la secuencia promotor y/o cromatina Desnaturalizacin Necesaria para la asociacin de las polimerasas. Requiere: - Helicasas separar las hebras. Necesita Factores que ayudan a reclutarlas hasta el origen como son las - SSB estabilizar las hebra simples (experimentos con RPA). Recombinacin Las SSB estabilizan el bucle D uniendo la hebra desplazada. Helicasa para apoyar la sntesis de ADN (no abre la burbuja). del

ayudar a 1iniciacin/ciclo.

asegurar

Las mutaciones Son un grupo de trastornos que estn producidos por un fallo en el sistema de fosforilacin oxidativa, la ruta final del metabolismo energtico mitocondrial, con la consiguiente deficiencia en la biosntesis del trifosfato de adenosina Las caractersticas genticas del DNA mitocondrial, herencia materna, poliplasmia y segregacin mittica, confieren a estas enfermedades propiedades muy particulares. Las manifestaciones clnicas de estas enfermedades son muy heterogneas y afectan a distintos rganos y tejidos por lo que su correcto diagnstico implica la obtencin de datos clnicos, morfolgicos, bioqumicos y genticos. Para ir entendiendo el autor hace un resumen de la mitocondria y sus principales funciones. Las mitocondrias son organelos subcelulares que se encuentran en el citoplasma de las clulas eucariotas, cuya funcin principal es la produccin de la energa celular en forma de trifosfato de adenosina Una de las particularidades de estos organelos es la de poseer un sistema gentico propio con toda la maquinaria necesaria para su expresin, para replicar, transcribir y traducir la informacin gentica que contiene. El cido desoxirribonucleico mitocondrial humano es una molcula circular compuesta por 16

Bien caracterizado en procariotas pero poco en eucariotas. Transcripcin Helicasa abre la hlice (TFIIH). Estabilizador de hebra simple se utiliza los candidatos (RPA,TFIIE) un origen funcional/ciclo

569 pares de bases1 que contiene informacin para 37 genes: dos cidos ribonucleicos ribosmicos (rRNA), componentes de los ribosomas especficos mitocondriales, 22 de transferencia (tRNA), que son capaces de leer todo el cdigo gentico, y 13polipptidos que forman parte de cuatro de los cinco complejos multienzimticos del sistema de fosforilacin oxidativa. El doctor Solano describe y designa con el nombre de enfermedades mitocondriales a un grupo de trastornos cuya caracterstica comn es un defecto en la produccin de ATP Genoma cambiante Una mutacin es el cambio, en general irreversible, de una caracterstica del genoma. Este cambio, que por otro lado puede no ser observado inmediatamente a nivel del fenotipo, se transmite como un nuevo rasgo hereditario y se presenta bajo las formas ms variadas y sutiles. Las mutaciones son muy frecuentes en los mamferos y presentan un inters considerable para los genetistas, adems de su intrnseco valor evolutivo, por ser generadoras de diversidad gentica. Durante el transcurso del desarrollo embrionario temprano, las clulas del organismo se multiplican a una velocidad muy rpida y por lo tanto pueden surgir muchas mutaciones. Dentro de esas mutaciones, muchas provocan la muerte de las clulas que las portan y son eliminadas del organismo

Los agentes qumicos La genetista escocesa Charlotte Auerbach fue la primera en demostrar, en la dcada de 1960, el peligro que representaba la utilizacin de un agente qumico (el gas mostaza) para las personas, debido a su fuerte actividad mutagnica. Hoy en da, se conocen varios productos qumicos que son mutagnicos, clasificndose segn su modo de accin en

Tipos de alteraciones de funcin del gen por mutaciones

la

El ADN es la molcula de la vida, y es la que lleva codificada la informacin gentica caracterstica de los diferentes seres vivos. Mediante ese cdigo, regula el funcionamiento de cada tipo de clula; controla la transmisin de esa informacin, tanto en el tiempo como en el lugar de actuacin de la misma Alteraciones del cdigo gentico por mutaciones es por la combinaciones de 3 de las 4 bases A, G, T y C, codifican los distintos aminocidos y, mediante diferentes combinaciones de aminocidos de la cadena del ADN, se codifican las distintas protenas. Cualquier cambio que se produzca en la combinacin de las bases (o de los tripletes), puede modificar el cdigo del ADN y alterar la expresin de la protena. Por ejemplo, si en un triplete TCA, que codifica el aminocido serina, se produce un cambio de la T por una C, el aminocido que ahora codifica el triplete CCA es una prolina, que es muy diferente de la serina, por lo que se altera la protena. Estas alteraciones se consideran mutaciones gnicas. Sin embargo, no todas las mutaciones van

a ser patolgicas, ni van a tener el mismo efecto en la protena. Teniendo en cuenta cmo los distintos cambios (mutaciones) afectan a la funcin de la protena, esas mutaciones las podemos separar en 2 grupos: las que no alteran la funcin, que pueden ser de 2 tipos: mutaciones silenciosas y mutaciones conservadoras. Las que alteran la funcin, que pueden ser de varios tipos: mutaciones no conservadoras, mutaciones sin sentido y las que se producen por cambios (ausencia o ganancia) de un nmero de bases que no sea mltiplo de 3.

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http://www.arrakis.es/~ibrabi da/vigcorte.html, Ingeniera gentica