QUIMICA ORGANICA II

9. AMINOACIDOS, PEPTIDOS Y PROTEINAS

Aminocidos: clasificacin qumica. Mtodos generales de
sntesis. Configuracin. Racemizacin. Propiedades
fsicas. Punto isoelctrico. Propiedades funcionales
generales: accin del calor, del cido nitroso, acilacin,
accin del anhdrido actico, etc. Reacciones de
caracterizacin.
Pptidos: Nomenclatura. Unin peptdica. Anlisis
estructural. Mtodo de Sanger y de Edman, hidrazinlisis.
Sntesis de pptidos en solucin y en fase slida: grupos
protectores.
Aminocidos
alfa -aminocido: glicina
beta-aminocido
gama-aminocido: GABA
Estructura general de un -aminocido:
Los aminocidos son compuestos bifuncionales, contienen un grupo amino bsico y
un grupo carboxilo cido. Se nombran segn la posicin relativa de dichos grupos:
Tienen valor como bloques biolgicos porque pueden formar pptidos entre el NH
2
de un aminocido y el COOH de otro mediante enlaces amida
Nombre Abreviaturas Frmula estructural
Aminocidos con cadenas laterales no polares

Glicina

Gly
(G)



Alanina

Ala
(A)



Valina

Val
(V)



Leucina

Leu
(L)



Isoleucina

Ile
(I)



Metionina

Met
(M)



Prolina

Pro
(P)



Fenilalanina

Phe
(F)



Triptofano

Trp
(W)

Aminocidos:
clasificacin qumica
Nombre Abreviaturas Frmula estructural
Aminocidos con cadenas laterales polares

Asparagina

Asn
(N)



Glutamina

Gln
(Q)



Serina

Ser
(S)



Treonina

Thr
(T)



Tirosina

Tyr
(Y)




Cistena

Cys
(C)


Aminocidos:
clasificacin qumica
Nombre Abreviaturas Frmula estructural
Aminocidos con cadenas laterales cidas

Acido Asprtico

Asp
(D)




Acido Glutmico

Glu
(E)


Aminocidos con cadenas laterales bsicas

Lisina

Lys
(K)



Arginina

Arg
(R)



Histidina

His
(H)



Aminocidos:
clasificacin qumica
Aminocidos: mtodos generales de sntesis
Sustitucin nucleoflica de cidos alfa-carboxlicos
Sntesis de Strecker
CH
3
CH
O
CH
3
CH
NH
HCN
CH
3
C
NH
2
CN
H
CH
3
C
NH
3
HCOO
-
+
NH
3
H
2
O
-
1. H
+
, H
2
O
2. calor
imina 2-aminopropanonitrilo Alanina
Aminocidos: mtodos generales de sntesis
Alquilacin de acetamidomalonato de dietilo
1. Na
+
EtO
-
2. BrCH
2
CO
2
Et
C
HN
O
CO
2
Et
CO
2
Et EtO
2
CCH
2
HN
O
CO
2
Et H C
CO
2
Et
1. H
+
2. calor
3. -CO
2
HOCCH
2
CHCOH
O O
NH
2
Acido (R,S)-asprtico
Aminocidos: mtodos generales de sntesis
Gabriel-malnica: ruta inequvoca
EtO OEt
O O
EtO OEt
O O
Br
Br
2
N
-
K
+
O
O
N
O
O
EtO
O
EtO
O
Na
+
EtO
-
N
O
O
EtO
O
EtO
O
Na
+
-
Cl
OEt
O
N
O
O
EtO
O
EtO
O
OEt
O
1. H
+
2. calor
3. -CO
2
H
2
N
HO
O
O
OH
OH
OH
O
O
+
Acido Asprtico
Aminocidos: configuracin
COOH
H H
2
N
CH
3
COOH
H H
2
N
CH
2
COOH
H H
2
N
CH
2
OH
COOH
H HO
CH
2
OH
S-Alanina
L-Alanina
S-Fenilalanina
L-Fenilalanina
S-Serina
L-Serina
estereoqumica similar
a L-Gliceraldehdo
Slo la glicina es aquiral: H
2
NCH
2
COOH
Los carbonos de los dems aminocidos son centros de quiralidad: son posibles
dos enantimeros
La naturaleza slo utiliza el enantimero S para la construccin de protenas
Proyecciones de Fischer de aminocidos naturales: similitud con los azcares L
Los mtodos generales de sntesis de aminocidos producen una mezcla racmica
(partes iguales de compuestos S y R), que debe resolverse en enantimeros puros
Aminocidos: resolucin
Mtodo qumico: formacin de diasteremeros y su posterior separacin
Los diasteremeros tienen diferentes propiedades fsicas
+
HCOOH
(CH
3
)
2
CHCHCOOH
NHCH
O
(R,S)-N-formilvalina
+
H
2
O (CH
3
)
2
CHCHCOO
-
NH
3
+
(R,S)-Valina
COO
-+
BH
H
CH(CH
3
)
2
HCN
O
H
S
C
NHCH
CH(CH
3
)
2
H
O
R
HB
+-
OO
mezcla de sales diasteroisomricas
cristalizacin fraccionada
L-Brucina (B, alcaloide pticam. activo
MeOH, 0 C
hidrlisis
COO
-
H
CH(CH
3
)
2
H
3
N
+
S
(S)-Valina
COO
-
NH
3
+
CH(CH
3
)
2
H
R
(R)-Valina
Aminocidos: resolucin
RCHCOH
O
NH
2
(CH
3
CO)
2
O
RCHCOH
O
H
2
O
carboxi-
peptidasa
mezcla R, S mezcla R, S
C
COOH
H
2
N H
R
C
COOH
H NHCOCH
3
R
NHCOCH
3
+
Aminocido S Aminocido R
Mtodo biolgico: mediante el uso de enzimas
DL-leucina
Ac
2
O
N-acetil-DL-leucina
acilasa renal
porcina
L-leucina
+
N-acetil-D-leucina
Aminocidos: propiedades fsicas
Los aminocidos son sales internas iones dipolares, por lo que:
Son sustancias cristalinas con puntos de fusin elevados y descomposicin
Poseen momentos dipolares grandes
Son solubles en agua
Poco solubles en alcoholes
Son insolubles en solventes aprticos poco polares (benceno, cloroformo, etc.)
En solucin acuosa, la acidez y la basicidad de los grupos carboxilo y amino
resultan ms bajas que lo normal
Aminocidos: punto isoelctrico
,
El punto isoelctrico pI es el pH en el cual la concentracin del ion dipolar es mxima
Es caracterstico para cada aminocido
Los aminocidos con cadena lateral neutra tienen pKa
1
y pKa
2
Los aminocidos existen en
forma de sal interna, ion
dipolar zwitterion
pI = 1/2 (pKa1 + pKa2)
Las diferencias en el pI son tiles para fines de identificacin y tienen gran
importancia en el aislamiento y purificacin de protenas mediante electroforesis
Aminocidos: propiedades funcionales generales
Accin del calor
Los aminocidos funden con descomposicin
Por deshidratacin dan dicetopiperazinas
Accin del cido nitroso
Transforma cuantitativamente cada grupo amino en N
2
(mtodo de Van Slyke)
Valoracin volumtrica de los grupos amino en aminocidos y protenas
N
N O
O R
R
H
H
R OH
NH
2
O
R OH
O
NaNO
2
H
+
H
2
O
N
2
+ +
Aminocidos: propiedades funcionales generales
Acilacin
El grupo amino reacciona con diversos agentes acilantes (Ej. Anhidrido actico)
R OH
NH
2
O
Ac
2
O
R OH
NHAc
O
Mtodo de Schotten-Baumann (N-benzoil y p-toluensulfonil amidas)
R OH
N
O
H
Ph
O
R O
-
NH
3
O
R O
-
NH
2
O
+
-
OH
R O
-
N
O
H
Ph
O
Ph Cl
O
H
+
Aminocidos: obtencin y estabilidad de steres y haluros de aminocidos
R O
-
NH
3
O
+
ClH
R OH . Cl
-
NH
3
O
+
EtOH
R OEt .Cl
-
NH
3
O
+
Esterificacin
Se utiliza EtOH MeOH anhidros, se calienta a temperatura de reflujo y se mantiene
el medio saturado con ClH (anhidro)
Los steres se conservan como clorhidratos, stos son slidos solubles en agua
Al alcalinizar la solucin, la base se separa como aceite y en pocas horas da un
slido cristalino: dicetopiperazina
N
N O
O R
R
H
H
R OEt .Cl
-
NH
3
O
+
-
OH
R OEt
O
NH
2
Reaccin de aminlisis
intermolecular
Aminocidos: obtencin y estabilidad de steres y haluros de aminocidos
Preparacin de haluros de acilo
Si se intenta transformar el carboxilo de un aminocido por accin de cloruro de
tionilo, pentacloruro de fsforo, etc. se produce intensa descomposicin, o bien se
obtiene slo la dicetopiperazina
S es posible obtener el cloruro de cido de una amida de un aminocido:
R OH
O
N
Ph
O
H
PCl
5
R Cl
O
N
Ph
O
H
Este cloruro de cido es un
nuevo agente acilante
Aminocidos: propiedades qumicas particulares de algunos aminocidos
Dos unidades de cistena forman un
sulfuro:
Diagrama de dos sulfuros en la insulina
bovina
cistina
Aminocidos: propiedades qumicas particulares de algunos aminocidos
La cistina genera cistena por reductores fuertes
La tirosina posee propiedades de fenol: reacciona con sales de diazonio
Por fusin, el cido glutmico se deshidrata, dando una lactama
OH
NH
2
HO O
O
O
NH
O
HO O
cido
piroglutmico
Aminocidos: reacciones de caracterizacin
Reaccin de la ninhidrina
color
prpura
Complejos de cobre
R O
N
O
Cu
++
H
2
O
NH
2
R
O
Las soluciones alcalinas de
aminocidos en presencia de sales
cpricas se colorean intensamente de
azul, por formacin del quelato
La formacin de estos complejos
tambin permite el aislamiento o el
dosaje de aminocidos
color azul