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Escola Superior Agrria - Instituto Politcnico de

Coimbra
Manuela Abelho 2013/2014
Microbiologia Ambiental
Licenciatura em Engenharia do Ambiente
1.6 Microrganismos terrestres
Sumrio
1.6.1 Microrganismos do solo
1.6.2 Microrganismos associados a plantas vasculares
1.6.2.1 No exterior: filosfera e rizosfera
1.6.2.2 No interior: simbioses (fixao de azoto, micorrizas,
actinorrizas) e patognicos
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Microbiologia ambiental 1.6
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Caractersticas dos ambientes terrestres e
dos seus microrganismos 1
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Dominados por materiais slidos inertes; substncias orgnicas,
incluindo microrganismos, so geralmente uma pequena parte do
solo
Quando presente, a gua ocorre predominantemente como uma
fina pelcula na superfcie das partculas, onde os microrganismos
tm um bom contacto com os gases do ar, incluindo oxignio
No solo o oxignio est mais acessvel aos microrganismos do que
na gua, visto que a taxa de difuso do oxignio no ar 10000
superior sua difuso na gua
Microrganismos que crescem nestes ambientes com grande fluxo
de oxignio desenvolveram complexos mecanismos fsicos e
fisiolgicos para lidarem com o oxignio potencialmente txico;
alguns fungos desenvolveram mesmo estruturas impermeveis ao
oxignio
Caractersticas dos ambientes terrestres e
dos seus microrganismos 2
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Os solos podem conter zonas saturadas de gua que se tornam
anaerbias; podem ser consideradas como ambientes aquticos
isolados
Existe uma enorme variedade de ambientes terrestres: secos,
frios, temperados, tropicais e zonas geotermicamente aquecidas
Insectos e outros artrpodes, nemtodes e outros organismos do
solo interagem com os microrganismos influenciando os ciclos de
nutrientes e outros processos
Subsolo: comunidade diversa de microrganismos, mantida por
fontes de nutrientes como
(1) materiais lixiviados da superfcie,
(2) decomposio de restos enterrados de plantas, e
(3) sntese de metano
Caractersticas dos ambientes terrestres e
dos seus microrganismos 3
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Os fungos so importantes no funcionamento das plantas:
Ocorrem no seu interior e na sua superfcie e podem ter efeitos
negativos ou positivos;
A maioria das razes das plantas tem fungos
Os microrganismos do solo interagem com as plantas e com a
atmosfera:
Produtos microbianos importantes: xido ntrico e metano,
ambos gases com efeito de estufa
Produzem clorometano e cianeto, geralmente considerados
poluentes antropognicos

O solo como ambiente para os
microrganismos: concentrao de gases
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Oxignio difunde-se mais rapidamente no ar do que na gua
geralmente no ocorre falta de O
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nos solos, excepto em zonas
saturadas de gua
Concentrao dos gases presentes no solo depende muito das
suas condies de humidade
a concentrao de oxignio diminui e a concentrao de dixido
de aumenta com a quantidade de humidade presente nos solos
Outro factor importante a presena de razes de plantas
tal como os microrganismos tambm consomem O
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e libertam
CO
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, influenciando a disponibilidade de gases no ambiente da
raiz
Concentrao de oxignio e de dixido de carbono
num solo tropical sob condies hmidas e secas
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% Oxignio % Dixido de carbono
Profundidade do solo (cm) Hmido Seco Hmido Seco
10 13.7 20.7 6.5 0.5
25 12.7 19.8 8.5 1.2
45 12.2 18.8 9.7 2.1
90 7.6 17.3 10.0 3.7
120 7.8 16.4 9.6 5.1
Alteraes na quantidade de gua afectam as concentraes de gases presentes nos
interstcios do solo.
Alteraes mais acentuadas nos pequenos poros onde se encontra a maioria das bactrias.
Em maiores profundidades existe menos oxignio, principalmente nos solos mais hmidos
e menos permeveis
Importncia dos microrganismos
no solo
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1.Fertilidade dos solos
Fixao de azoto atmosfrico, sozinhos ou em simbiose com
plantas
Solubilizao de fosfatos em formas utilizveis pelas plantas e
outros organismos
2.Estrutura dos solos
Produo de polissacardeos que promovem a agregao das
partculas
3.Reciclagem de nutrientes
Decomposio/mineralizao de nutrientes
Microrganismos no solo
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Populaes microbianas do solo so muito elevadas: 3-10
toneladas/ha
Bactrias
superfcies das partculas expostas a poros de 2-6 mm de
dimetro (menor probabilidade de serem consumidas por
protozorios)
necessitam que a gua e os nutrientes se localizem nas suas
proximidades
Protozorios
na superfcie exterior das partculas inorgnicas e orgnicas
predadores (de bactrias), mantendo a estrutura e o
funcionamento das comunidades microbianas
Microrganismos no solo
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Fungos filamentosos
ocupam geralmente reas mais abertas onde dispem de
elevados nveis de oxignio;
fazem a ligao entre partculas ou agregados de partculas de
solo
Algas e cianobactrias
ocupam camadas superficiais; colonizadores primrios;
algumas cianobactrias fixam azoto atmosfrico
Os fungos do solo
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So os mais abundantes em biomassa
Importantes na decomposio da matria orgnica
Penicillium; Mucor; Rhizopus; Fusarium; Cladosporium; Aspergillus;
Trichoderma,
No so apenas os cogumelos macroscpicos, mas
principalmente o emaranhado de hifas subterrneas

Exemplo: Armillaria bulbosa fungo associado s razes das
rvores; um nico indivduo (principalmente a sua parte
subterrnea) pode cobrir 100 ha, pesar 100 toneladas e ter
1500 anos de idade
O maior e
mais antigo
organismo
da terra?
Armillaria bulbosa
http://www.nature.com/nature/journal/v356/n6368/a
bs/356428a0.html
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Vrias centenas de metros de hifas/g solo
http://www.fs.fed.us/pnw/news/fungus.htm
http://www.crystalfalls.org/humongou.htm
As bactrias do solo
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Numericamente muito abundantes: 10
8
-10
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clulas/g solo seco

Muitos gneros e muitas espcies:
Bacillus; Clostridium; Arthrobacter; Pseudomonas; Rhizobium;
Azotobacter; Nitrobacter,

Maioria das bactrias do solo so quimioheterotrficas, muito
importantes na decomposio de matria orgnica
recalcitrante: celulose, lenhina, quitina, pesticidas
Nocardia; Streptomyces; Micromonospora,

O cheiro a terra molhada:
bactrias
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Gnero Streptomyces (bactria do grupo do Actinomicetes
ou bactrias filamentosas
Produz um composto odorfero (geosmina) que d ao solo
o seu odor caracterstico a terra molhada
http://transe
ctpoints.blog
spot.com/20
07/02/test.ht
ml
http://op
enwetw
are.org/
wiki/Str
eptomy
ces:Oth
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Filosfera:
superfcies areas das plantas e seu interior
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Microrganismos que vivem sobre as superfcies das plantas
expostas radiao solar
Sobrevivem com elevados nveis de radiao UV porque
possuem um sistema de reparao do DNA
Exemplo: Sphingomonas sp.
Gram-negatvas, bacilos, quimioheterotrficas, aerbias
obrigatrias
Rizosfera:
ambiente que rodeia a raiz das plantas
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As razes das plantas libertam para o solo lcoois, etileno,
acares, aminocidos, cidos orgnicos, polissacardeos e
enzimas, criando um ambiente propcio aos microrganismos

Muitos microrganismos da rizosfera promovem o
crescimento da planta atravs da produo de sinais
qumicos (auxinas, giberlinas, citoquininas,)
e.g. Pseudomonas e Aerobacter

Fixao de azoto:
Azotobacter, Azospirillum, Acetobacter

Promovem o crescimento das plantas atravs da
produo de sinais qumicos (auxinas, giberlinas,
citoquininas,)
Pseudomonas aeruginosa Aerobacter aerogenes
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Fixadores de azoto
Acetobacter sp. Azotobacter sp.
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No interior das clulas das plantas:
Fungos e bactrias endfitos
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Benficos:
alguns fungos endfitos podem torn-las menos susceptveis ao
ataque dos insectos
Parasitas:
alguns fungos tornam as plantas estreis
Cana do acar, batateira, algodo tm bactrias endfitas
que podem ser patognicas
Mas em muitos casos no se conhecem efeitos negativos ou
positivos

Fixao simbitica (mutualismo) de
azoto atmosfrico
Rhizobium sp. e
plantas leguminosas
O rizbio penetra nas clulas
da raiz das leguminosas,
formando ndulos
Dentro da raiz transforma-se
num bacteride, a forma capaz
de fixar azoto mas incapaz de
se reproduzir
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Formao de um ndulo pelo Rhizobium
1. Rhizobium livre
2. Rhizobium atrado pelo pelo
radicular
3. Incio da infeco por Rhizobium
no pelo radicular
4. Pelos radiculares infectados por
Rhizobium
5 e 6. O cordo de infeco de
Rhizobium invade a matriz de clulas
corticais da raiz da leguminosa
7. Rhizobium reproduz-se nas clulas
haplides da raiz e perde a sua
parede celular
8. D-se a hipertrofia radical e
aparece o ndulo
9. Rhizobium sem parede
(bacteride) fixa azoto
10. O ndulo com leghemoglobina
fixa N
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Ndulos da raiz
Bacterides (MO
contraste de fase)
Micorrizas
Associaes
simbiticas
(mutualismo)
entre fungos
e razes das
plantas
superiores
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Existem mais de 5000 espcies de fungos,
principalmente basidiomicetes, envolvidas em
simbioses micorrzicas

As micorrizas melhoram a competitividade das
plantas, aumentando a sua absoro de gua e
de nutrientes, principalmente fsforo

Existem vrios tipos de micorrizas dentro de
dois grupos:
Endomicorrizas
Ectomicorrizas



Endomicorrizas
Exemplos:
Trigo,
feijoeiro,
tomateiro,
laranjeira, etc.
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O fungo (geralmente um zigomicete) no
sobrevive sem a planta; penetra nas clulas
da raiz e cresce l dentro
Um dos tipos so as micorrizas
arbusculares (AM)
Crescem formando uma estrutura
intracelular semelhante a um arbusto; hifas
no septadas
Os outros tipos de endomicorrizas tm hifas
septadas e existem por exemplo nas
orqudeas
Micorrizas arbusculares
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rvore filogentica do filo Glomeromycota, baseada na
anlise das sequncias das subunidades dos ribossomas
As micorrizas arbusculares so formadas por fungos da
classe Glomeromycetes (Filo Zygomycota), que
recentemente passou a ser o filo Glomeromycota
(http://www.mycolog.com/CHAP3b.htm)

Ectomicorrizas
Micorrizas formadoras de manto
Formam um
manto que
cobre a ponta
da raiz
As hifas
tambm
penetram no
interior da raiz
mas no no
interior das
clulas
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Associaes simbiticas de bactrias
actinomicetes do gnero Frankia com
razes de plantas de oito famlias no-
leguminosas
Formam ndulos onde se d a fixao de
azoto
Exemplo: amieiro (Alnus glutinosa)
Actinorrizas



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Frankia sp.
O gnero Frankia tem uma associao simbitica com rvores, como o amieiro
As rvores com esta associao simbitica so mais ricas em azoto
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Microrganismos patognicos
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Alguns fungos e bactrias podem causar vrias doenas que
diminuem a produtividade das culturas
Puccinia graminis ferrugem do trigo
Phytophthora infestans doena das batatas
http://www.bbc.co.uk/history/british/victorians/famine_01.shtml)
Agrobacterium tumefaciens crescimento de tumores nas
plantas
Ferrugem do trigo
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Doena da batata
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Tumores
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