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Principios de Bioqumica

Principios de la termodinmica

Interacciones a nivel atmico

Molculas bsicas: caractersticas

Macroestructuras subcelulares
Esquema general:
Principios de la Termodinmica

Definicin de Termodinmica:
Campo de la fsica que describe y relaciona las
propiedades fsicas de la materia de los
sistemas macroscpicos, as como sus
intercambios energticos.

Sistemas macroscpicos:
Conjunto de materia que se puede aislar
espacialmente y que coexiste con un entorno
infinito e imperturbable.
Principios de la Termodinmica

Termodinmica microscpica:

La temperatura representa una medida de la


energa cintica media de las molculas de un
sistema.

Cuando dos sistemas estn en contacto, se


transfiere energa entre sus molculas como
resultado de las colisiones.

La energa cintica de las molculas tambin


corresponde al calor, y, junto con la energa
potencial relacionada con las interacciones entre
las molculas, constituye la energa interna de un
sistema.
Principios de la Termodinmica

Tipos de sistemas:
Segn el intercambio que se permita entre el
sistema y el universo, ste puede ser:

Abiertos: intercambio de materia y energa.

Cerrados: intercambio de energa, no de materia.

Aislados: impide intercambio de energa y materia.


Principios de la Termodinmica

Estado de un sistema:
Se puede describir mediante propiedades
medibles que se conocen como variables de
estado.
Algunos ejemplos de variables son:

Temperatura.

Presin.

Volumen.

Entropa.

Entalpa.
Principios de la Termodinmica

Tipos de variables:
Las variables de estado pueden ser de dos tipos:
intensivas o extensivas. Las propiedades de
estos grupos son:
Intensivas:

Independiente de la cantidad de materia.

No aditivas.
Extensivas:

Dependiente de la cantidad de materia.

Aditivas.
Principios de la Termodinmica

Principio cero:
Si dos sistemas distintos estn en equilibrio
termodinmico con un tercero, tambin
tienen que estar en equilibrio entre s.
S1
S2
S3
Principios de la Termodinmica

Primer principio:
La energa ni se crea ni se destruye, slo se
transforma. [hay que tener en cuenta que
dejamos de lado la relacin E=mc].
Criterio de signos
Criterio de signos
SISTEMA
Q > 0
W > 0
W < 0
Q < 0
Principios de la Termodinmica
Trabajo de expansin/compresin de los gases
P
int
P
ext
dV
V1
V2
Principios de la Termodinmica
Energa interna (U)
(Suma de energas a nivel molecular)
Funcin de estado
Propiedad extensiva
U = Q + W
1
er
Principio de la
Termodinmica
Cmo podemos aumentar U
de un sistema cerrado?
Calentndolo calor
Realizando un trabajo
Principios de la Termodinmica

El cambio de entalpa ( H) es el calor de


reaccin, es decir el calor desprendido o
consumido en el curso de una reaccin.

Si se rompen los enlaces ms dbiles y se


forman enlaces ms fuertes se desprende calor,
y la reaccin es exotrmica (valor negativo de
H).

Si se rompen enlaces fuertes y se forman


enlaces ms dbiles, entonces se consume
energa en la reaccin, y sta es endotrmica
(valor positivo de H).
Principios de la Termodinmica

Segundo principio:
El desorden o entropa (S), de un sistema
aislado nunca puede decrecer.
Entropa
(S)
(
Funcin de estado
Propiedad extensiva
Slido Lquido Gas
S S
Principios de la Termodinmica

Tercer principio:
La entropa (S) de un sistema totalmente
estructurado ideal (por ejemplo diamante
perfecto) a cero grados Kelvin es de cero.
Temperatura (T)
T
E
n
t
r
o
p
a

(
S
)
E
Principios de la Termodinmica

Energa libre de Gibbs:


Energa
libre de
Gibbs
Entalpa Entropa Temperatura
Energa libre
de Gibbs (G)
d
Funcin de estado
Propiedad extensiva
Unidades: J
Principios de la Termodinmica

Constante de equilibrio y energa libre:


Principios de la Termodinmica

Energtica de una reaccin:


Principios de la Termodinmica
Principios de la Termodinmica
HCl
Principios de la Termodinmica
Principios de la Termodinmica
Interacciones entre tomos

Enlaces fuertes:

Inico

Covalente

Metlico

Enlaces dbiles:

Van der Waals

In-dipolo

Hidrfobas

Puentes de hidrgeno
Interacciones entre tomos

Enlaces fuertes: inico


Interacciones entre tomos

Enlaces fuertes: covalente


Interacciones entre tomos

Enlaces dbiles: Van der Waals


Interacciones entre tomos

Enlaces dbiles: In - dipolo


Interacciones a nivel atmico

Enlaces dbiles: Hidrfobo


Las dos molculas de
hidrocarburo estn separadas,
y cada una tiene su propia
"jaula" de molculas de agua
ordenadas alrededor
Las dos molculas de
hidrocarburo estn juntas,
compartiendo una "jaula" de
molculas de agua comn. El
nmero total de molculas de
agua que forman el clatrato es
menor, por lo que parte de las
molculas que estaban fijas
est libres en la disolucin.
Interacciones entre tomos

Enlaces dbiles: Puente de hidrgeno


Molculas bsicas: caractersticas

Cadenas hidrocarbonadas

Glcidos

Lpidos

cidos grasos

Fosfolpidos

Aminocidos

Pptidos

Nucletidos

cidos nuclicos
Molculas bsicas: caractersticas

Cadena hidrocarbonada:
Molculas bsicas: caractersticas

Glcidos:
Molculas bsicas: caractersticas

cidos grasos:
Molculas bsicas: caractersticas

Fosfolpidos:
Molculas bsicas: caractersticas

Aminocidos:
Molculas bsicas: caractersticas

Aminocidos:
Molculas bsicas: caractersticas

Pptidos (enlace peptdico):


Molculas bsicas: caractersticas

Pptidos (protenas):
Molculas bsicas: caractersticas

Pptidos (protenas):
Molculas bsicas: caractersticas

Nucletidos:
Molculas bsicas: caractersticas

Nucletidos:
Molculas bsicas: caractersticas

Nucletidos:
Molculas bsicas: caractersticas

cidos nuclicos (enlace fosfodister):


Molculas bsicas: caractersticas

cidos nuclicos (apareamiento de bases):


Macroestructuras subcelulares

Bicapa lipdica

Membrana plasmtica

Reconocimiento

Protenas transmembrana

Pared celular

Cromatina
Macroestructuras subcelulares

Bicapa lipdica:
Macroestructuras subcelulares

Bicapa lipdica (membrana plasmtica):


Macroestructuras subcelulares

Bicapa lipdica (reconocimiento):


Macroestructuras subcelulares

Protenas transmembrana:
Macroestructuras subcelulares

Pared celular bacteriana:


Macroestructuras subcelulares

Cromatina:
Aplicacin: opern Lac
Aplicacin: opern Lac