ADN

El cido desoxirribonucleico, abreviado como ADN, es un cido nucleico que contiene

instrucciones genticas usadas en el desarrollo y funcionamiento de todos
los organismos vivos conocidos y algunos virus, y es responsable de su transmisin
hereditaria. El papel principal de la molcula de ADN es el almacenamiento a largo plazo
de informacin. Muchas veces, el ADN es comparado con un plano o una receta, o
un cdigo, ya que contiene las instrucciones necesarias para construir otros componentes
de las clulas, como las protenas y las molculas de ARN. Los segmentos de ADN que
llevan esta informacin gentica son llamados genes, pero las otras secuencias de ADN
tienen propsitos estructurales o toman parte en la regulacin del uso de esta informacin
gentica.
Desde el punto de vista qumico, el ADN es un polmero de nucletidos, es decir,
un polinucletido. Un polmero es un compuesto formado por muchas unidades simples
conectadas entre s, como si fuera un largo tren formado por vagones. En el ADN,
cada vagn es un nucletido, y cada nucletido, a su vez, est formado por un azcar
(la desoxirribosa), una base nitrogenada (que puede
ser adeninaA, timinaT, citosinaC o guaninaG) y un grupo fosfato que acta como
enganche de cada vagn con el siguiente. Lo que distingue a un vagn (nucletido) de
otro es, entonces, la base nitrogenada, y por ello la secuencia del ADN se especifica
nombrando slo la secuencia de sus bases. La disposicin secuencial de estas cuatro
bases a lo largo de la cadena (el ordenamiento de los cuatro tipos de vagones a lo largo
de todo el tren) es la que codifica la informacin gentica: por ejemplo, una secuencia de
ADN puede ser ATGCTAGATCGC... En los organismos vivos, el ADN se presenta como
una doble cadena de nucletidos, en la que las dos hebras estn unidas entre s por unas
conexiones denominadas puentes de hidrgeno.
1

Componentes
Estructura de soporte: La estructura de soporte de una hebra de ADN est formada por
unidades alternas de grupos fosfato y azcar (desoxirribosa).
27
El azcar en el ADN es
una pentosa, concretamente, la desoxirribosa.



cido fosfrico:


Su frmula qumica es H
3
PO
4
. Cada nucletido puede contener uno
(monofosfato: AMP), dos (difosfato: ADP) o tres (trifosfato: ATP) grupos de cido
fosfrico, aunque como monmeros constituyentes de los cidos nucleicos slo
aparecen en forma de nuclesidos monofosfato.
Desoxirribosa:
Es un monosacrido de 5 tomos de carbono (una pentosa) derivado de la ribosa,
que forma parte de la estructura de nucletidos del ADN. Su frmula es C
5
H
10
O
4
.
Una de las principales diferencias entre el ADN y el ARN es el azcar, pues en el
ARN la 2-desoxirribosa del ADN es reemplazada por una pentosa alternativa,
la ribosa.
25

Las molculas de azcar se unen entre s a travs de grupos fosfato, que
forman enlaces fosfodister entre los tomos de carbono tercero (3, tres prima)
y quinto (5, cinco prima) de dos anillos adyacentes de azcar. La formacin
de enlaces asimtricos implica que cada hebra de ADN tiene una direccin. En
una doble hlice, la direccin de los nucletidos en una hebra (3 5) es opuesta
a la direccin en la otra hebra (5 3). Esta organizacin de las hebras de ADN
se denomina antiparalela; son cadenas paralelas, pero con direcciones opuestas.
De la misma manera, los extremos asimtricos de las hebras de ADN se
denominan extremo 5 (cinco prima) y extremo 3 (tres prima),
respectivamente.
Bases nitrogenadas:
Las cuatro bases nitrogenadas mayoritarias que se encuentran en el ADN son
la adenina (A), la citosina (C), la guanina (G) y la timina (T). Cada una de estas
cuatro bases est unida al armazn de azcar-fosfato a travs del azcar para
formar el nucletido completo (base-azcar-fosfato). Las bases son compuestos
heterocclicos y aromticos con dos o ms tomos de nitrgeno, y, dentro de las
bases mayoritarias, se clasifican en dos grupos: las bases
pricas o purinas (adenina y guanina), derivadas de la purina y formadas por dos
anillos unidos entre s, y las bases pirimidnicas o bases
pirimdicas o pirimidinas (citosina y timina), derivadas de la pirimidina y con un solo
anillo.
25
En los cidos nucleicos existe una quinta base pirimidnica,
denominada uracilo (U), que normalmente ocupa el lugar de la timina en el ARN y
difiere de sta en que carece de un grupo metilo en su anillo. El uracilo no se
encuentra habitualmente en el ADN, slo aparece raramente como un producto
residual de la degradacin de la citosina por procesos de desaminacin oxidativa.


Timina: 2, 4-dioxo, 5-metilpirimidina.
Timina:
En el cdigo gentico se representa con la letra T. Es un derivado pirimidnico con
un grupo oxo en las posiciones 2 y 4, y un grupo metilen la posicin 5. Forma
el nuclesido timidina (siempre desoxitimidina, ya que slo aparece en el ADN) y
el nucletido timidilato o timidina monofosfato (dTMP). En el ADN, la timina
siempre se empareja con la adenina de la cadena complementaria mediante
2 puentes de hidrgeno, T=A. Su frmula qumica es C
5
H
6
N
2
O
2
y su nomenclatura
2, 4-dioxo, 5-metilpirimidina.


Citosina: 2-oxo, 4-aminopirimidina.
Citosina:
En el cdigo gentico se representa con la letra C. Es un derivado pirimidnico, con
un grupo amino en posicin 4 y un grupo oxo en posicin 2. Forma
el nuclesido citidina (desoxicitidina en el ADN) y el nucletido citidilato o
(desoxi)citidina monofosfato (dCMP en el ADN, CMP en el ARN). La citosina
siempre se empareja en el ADN con la guanina de la cadena complementaria
mediante un triple enlace, CG. Su frmula qumica es C
4
H
5
N
3
O y su
nomenclatura 2-oxo, 4 aminopirimidina. Su masa molecular es de 111,10unidades
de masa atmica. La citosina se descubri en 1894, al aislarla del tejido
del timo de carnero.


Adenina: 6-aminopurina.
Adenina:
En el cdigo gentico se representa con la letra A. Es un derivado de la purina con
un grupo amino en la posicin 6. Forma el nuclesido adenosina (desoxiadenosina
en el ADN) y el nucletido adenilato o (desoxi)adenosina monofosfato (dAMP,
AMP). En el ADN siempre se empareja con la timina de la cadena complementaria
mediante 2 puentes de hidrgeno, A=T. Su frmula qumica es C
5
H
5
N
5
y su
nomenclatura 6-aminopurina. La adenina, junto con la timina, fue descubierta en
1885 por el mdico alemnAlbrecht Kossel.


Guanina:
En el cdigo gentico se representa con la letra G. Es un derivado prico con un
grupo oxo en la posicin 6 y un grupo amino en la posicin 2. Forma el nuclesido
(desoxi)guanosina y el nucletido guanilato o (desoxi)guanosina monofosfato
(dGMP, GMP). La guanina siempre se empareja en el ADN con la citosina de la
cadena complementaria mediante tres enlaces de hidrgeno, GC. Su frmula
qumica es C
5
H
5
N
5
O y su nomenclatura 6-oxo, 2-aminopurina.
Tambin existen otras bases nitrogenadas (las llamadas bases nitrogenadas
minoritarias), derivadas de forma natural o sinttica de alguna otra base mayoritaria. Lo
son por ejemplo la hipoxantina, relativamente abundante en el tRNA, o la cafena, ambas
derivadas de la adenina; otras, como el aciclovir, derivadas de la guanina, son anlogos
sintticos usados en terapia antiviral; otras, como una de las derivadas del uracilo, son
antitumorales.
Las bases nitrogenadas tienen una serie de caractersticas que les confieren unas
propiedades determinadas. Una caracterstica importante es su carcteraromtico,
consecuencia de la presencia en el anillo de dobles enlaces en posicin conjugada. Ello
les confiere la capacidad de absorber luz en la zona ultravioleta del espectro en torno a
los 260 nm, lo cual puede aprovecharse para determinar el coeficiente de extincin del
ADN y hallar la concentracin existente de los cidos nucleicos. Otra de sus
caractersticas es que presentantautomera o isomera de grupos funcionales, debido a
que un tomo de hidrgeno unido a otro tomo puede migrar a una posicin vecina; en
las bases nitrogenadas se dan dos tipos de tautomeras: tautomera lactama-lactima,
donde el hidrgeno migra del nitrgeno al oxgeno del grupo oxo (forma lactama) y
viceversa (forma lactima), y tautomera imina-amina primaria, donde el hidrgeno puede
estar formando el grupo amina (forma amina primaria) o migrar al nitrgeno adyacente
(forma imina). La adenina slo puede presentar tautomera amina-imina, la timina y el
uracilo muestran tautomera doble lactama-lactima, y la guanina y citosina pueden
presentar ambas. Por otro lado, y aunque se trate de molculas apolares, las bases
nitrogenadas presentan suficiente carcter polar como para establecer puentes de
hidrgeno, ya que tienen tomos muy electronegativos (nitrgeno y oxgeno) que
presentan carga parcial negativa, y tomos de hidrgeno con carga parcial positiva, de
manera que se forman dipolos que permiten que se formen estos enlaces dbiles.
Estructura
El ADN es una molcula bicatenaria, es decir, est formada por dos cadenas dispuestas
de forma antiparalela y con las bases nitrogenadas enfrentadas. En su estructura
tridimensional, se distinguen distintos niveles:
34

35

1. Estructura primaria:
Secuencia de nucletidos encadenados. Es en estas cadenas donde se encuentra la
informacin gentica, y dado que el esqueleto es el mismo para todos, la diferencia de
la informacin radica en la distinta secuencia de bases nitrogenadas. Esta secuencia
presenta un cdigo, que determina una informacin u otra, segn el orden de las
bases.
2. Estructura secundaria:
Es una estructura en doble hlice. Permite explicar el almacenamiento de la
informacin gentica y el mecanismo de duplicacin del ADN. Fue postulada por
Watson y Crick, basndose en la difraccin de rayos X que haban realizado Franklin
y Wilkins, y en la equivalencia de bases de Chargaff, segn la cual la suma de
adeninas ms guaninas es igual a la suma de timinas ms citosinas.
Es una cadena doble, dextrgira o levgira, segn el tipo de ADN. Ambas cadenas
son complementarias, pues la adenina y la guanina de una cadena se unen,
respectivamente, a la timina y la citosina de la otra. Ambas cadenas son antiparalelas,
pues el extremo 3 de una se enfrenta al extremo 5 de la homloga.
Existen tres modelos de ADN. El ADN de tipo B es el ms abundante y es el que tiene
la estructura descrita por Watson y Crick.
3. Estructura terciaria:
Se refiere a cmo se almacena el ADN en un espacio reducido, para formar
los cromosomas. Vara segn se trate de organismos procariotas o eucariotas:
2. En procariotas el ADN se pliega como una sper-hlice, generalmente en forma
circular y asociada a una pequea cantidad de protenas. Lo mismo ocurre
en orgnulos celulares como las mitocondrias y en los cloroplastos.
3. En eucariotas, dado que la cantidad de ADN de cada cromosoma es muy grande,
el empaquetamiento ha de ser ms complejo y compacto; para ello se necesita la
presencia de protenas, como las histonas y otras protenas de naturaleza no
histnica (en los espermatozoides estas protenas son las protaminas).
34

4. Estructura cuaternaria:
La cromatina presente en el ncleo tiene un grosor de 300 , pues la fibra de
cromatina de 100 se enrolla formando una fibra de cromatina de 300 . El
enrollamiento de losnucleosomas recibe el nombre de solenoide. Dichos solenoides se
enrollan formando la cromatina del ncleo interfsico de la clula eucariota. Cuando la
clula entra en divisin, el ADN se compacta ms, formando as los cromosomas.
Estructuras en doble hlice


El ADN existe en muchas conformaciones.
27
Sin embargo, en organismos vivos slo
se han observado las conformaciones ADN-A, ADN-B y ADN-Z. La conformacin que
adopta el ADN depende de su secuencia, la cantidad y direccin
de superenrollamiento que presenta, la presencia demodificaciones qumicas en las
bases y las condiciones de la solucin, tales como la concentracin
de iones de metales y poliaminas.
36
De las tres conformaciones, la forma "B" es la
ms comn en las condiciones existentes en las clulas.
37
Las dos dobles hlices
alternativas del ADN difieren en su geometra y dimensiones.
La forma "A" es una espiral que gira hacia la derecha, ms amplia que la "B", con una
hendidura menor superficial y ms amplia, y una hendidura mayor ms estrecha y
profunda. La forma "A" ocurre en condiciones no fisiolgicas en formas deshidratadas
de ADN, mientras que en la clula puede producirse en apareamientos hbridos de
hebras ADN-ARN, adems de en complejos enzima-ADN.
38

39

Los segmentos de ADN en los que las bases han sido modificadas
por metilacin pueden sufrir cambios conformacionales mayores y adoptar la forma
"Z". En este caso, las hebras giran alrededor del eje de la hlice en una espiral que
gira a mano izquierda, lo opuesto a la forma "B" ms frecuente.
40
Estas estructuras
poco frecuentes pueden ser reconocidas por protenas especficas que se unen a
ADN-Z y posiblemente estn implicadas en la regulacin de la transcripcin.
41

Estructuras en cudruplex


En los extremos de los cromosomas lineales existen regiones especializadas de ADN
denominadas telmeros. La funcin principal de estas regiones es permitir a la clula
replicar los extremos cromosmicos utilizando la enzima telomerasa, puesto que las
enzimas que replican el resto del ADN no pueden copiar los extremos 3' de los
cromosomas.
43
Estas terminaciones cromosmicas especializadas tambin protegen
los extremos del ADN, y evitan que los sistemas de reparacin del ADN en la clula
los procesen como ADN daado que debe ser corregido.
44
En las clulas humanas,
los telmeros son largas zonas de ADN de hebra sencilla que contienen algunos miles
de repeticiones de una nica secuencia TTAGGG.
45

Estas secuencias ricas en guanina pueden estabilizar los extremos cromosmicos
mediante la formacin de estructuras de juegos apilados de unidades de cuatro
bases, en lugar de los pares de bases encontrados normalmente en otras estructuras
de ADN. En este caso, cuatro bases guanina forman unidades con superficie plana
que se apilan una sobre otra, para formar una estructura cudruple-G estable.
46
Estas
estructuras se estabilizan formando puentes de hidrgeno entre los extremos de las
bases y la quelatacin de un metal inico en el centro de cada unidad de cuatro
bases.
47
Tambin se pueden formar otras estructuras, con el juego central de cuatro
bases procedente, o bien de una hebra sencilla plegada alrededor de las bases, o
bien de varias hebras paralelas diferentes, de forma que cada una contribuye con una
base a la estructura central.
Adems de estas estructuras apiladas, los telmeros tambin forman largas
estructuras en lazo, denominadas lazos telomricos o lazos-T (T-loops en ingls). En
este caso, las hebras simples de ADN se enroscan sobre s mismas en un amplio
crculo estabilizado por protenas que se unen a telmeros.
48
En el extremo del lazo T,
el ADN telomrico de hebra sencilla se sujeta a una regin de ADN de doble hebra
porque la hebra de ADN telomrico altera la doble hlice y se aparea a una de las dos
hebras. Esta estructura de triple hebra se denomina lazo de desplazamiento o lazo D













cido ribonucleico
.


ARN mensajero.
El cido ribonucleico (ARN o RNA) es un cido nucleico formado por una cadena
de ribonucletidos. Est presente tanto en las clulasprocariotas como en las eucariotas, y es el
nico material gentico de ciertos virus (virus ARN). El ARN celular es lineal y de hebra sencilla,
pero en el genoma de algunos virus es de doble hebra.
En los organismos celulares desempea diversas funciones. Es la molcula que dirige las etapas
intermedias de la sntesis proteica; el ADN no puede actuar solo, y se vale del ARN para transferir
esta informacin vital durante la sntesis de protenas (produccin de las protenas que necesita la
clula para sus actividades y su desarrollo). Varios tipos de ARN regulan la expresin gnica,
mientras que otros tienen actividadcataltica. El ARN es, pues, mucho ms verstil que el ADN.
Tipos de ARN
El ARN mensajero (ARNm) es el tipo de ARN que lleva la informacin del ADN a
los ribosomas, el lugar de la sntesis de protenas. La secuencia de nucletidos del ARNm
determina la secuencia de aminocidos de la protena.
21
Por ello, el ARNm es
denominado ARN codificante.
No obstante, muchos ARN no codifican protenas, y reciben el nombre de ARN no
codificantes; se originan a partir de genes propios (genes ARN), o son los intrones
rechazados durante el proceso de splicing. Son ARN no codificantes el ARN de
transferencia (ARNt) y el ARN ribosmico (ARNr), que son elementos fundamentales en el
proceso de traduccin, y diversos tipos de ARN reguladores.
22

Ciertos ARN no codificantes, denominados ribozimas, son capaces
de catalizar reacciones qumicas como cortar y unir otras molculas de ARN,
23
o
formar enlaces peptdicos entreaminocidos en el ribosoma durante la sntesis de
protenas.
24

ARN implicados en la sntesis de protenas


ARN mensajero
El ARN mensajero (ARNm o RNAm) lleva la informacin sobre la secuencia
de aminocidos de la protena desde el ADN, lugar en que est inscrita, hasta
el ribosoma, lugar en que se sintetizan las protenas de la clula. Es, por tanto, una
molcula intermediaria entre el ADN y la protena y apelativo de "mensajero" es del todo
descriptivo. En eucariotas, el ARNm se sintetiza en el nucleoplasma del ncleo celular y
donde es procesado antes de acceder al citosol, donde se hallan los ribosomas, a travs
de los poros de la envoltura nuclear.
ARN de transferencia
Los ARN de transferencia (ARNt o tRNA) son cortos polmeros de unos 80 nucletidos
que transfiere un aminocido especfico al polipptido en crecimiento; se unen a lugares
especficos del ribosoma durante la traduccin. Tienen un sitio especfico para la fijacin
del aminocido (extremo 3') y unanticodn formado por un triplete de nucletidos que se
une al codn complementario del ARNm mediante puentes de hidrgeno.
22

ARN ribosmico o ribosomal
El ARN ribosomico o ribosomal (ARNr o RNAr) se haya combinado con protenas para
formar los ribosomas, donde representa unas 2/3 partes de los mismos. En procariotas, la
subunidad mayor del ribosoma contiene dos molculas de ARNr y la subunidad menor,
una. En los eucariotas, la subunidad mayor contiene tres molculas de ARNr y la menor,
una. En ambos casos, sobre el armazn constituido por los ARNr se asocian protenas
especficas. El ARNr es muy abundante y representa el 80% del ARN hallado en
el citoplasma de las clulas eucariotas.
25
Los ARN ribosmicos son el componente
cataltico de los ribosomas; se encargan de crear los enlaces peptdicos entre los
aminocidos del polipptido en formacin durante la sntesis de protenas; actan, pues,
como ribozimas.
ARN reguladores
Muchos tipos de ARN regulan la expresin gnica gracias a que son complementarios de
regiones especficas del ARNm o de genes del ADN.
ARN de interferencia
Los ARN interferentes (ARNi o iRNA) son molculas de ARN que suprimen la expresin
de genes especficos mediante mecanismos conocidos globalmente
como ribointerferencia o interferencia por ARN. Los ARN interferentes son molculas
pequeas (de 20 a 25 nuclotidos) que se generan por fragmentacin de precursores ms
largos. Se pueden clasificar en tres grandes grupos:
26

Micro ARN
Los micro ARN (miARN o RNAmi) son cadenas cortas de 21 22 nucletidos hallados en
clulas eucariotas que se generan a partir de precursores especficos codificados en
el genoma. Al transcribirse, se pliegan en horquillas intramoleculares y luego se unen a
enzimas formando un complejo efector que puede bloquear la traduccin del ARNm o
acelerar su degradacin comenzando por la eliminacin enzimtica de la cola poli A.
27

28

ARN interferente pequeo
Los ARN interferentes pequeos (ARNip o siARN), formados por 20-25 nucletidos, se
producen con frecuencia por rotura de ARN virales, pero pueden ser tambin de origen
endgeno.
29

30
Tras la transcripcin se ensambla en un complejo proteico denominado
RISC (RNA-induced silencing complex) que identifica el ARNm complementario que es
cortado en dos mitades que son degradadas por la maquinaria celular, bloquean as la
expresin del gen.
ARN asociados a Piwi
Los ARN asociados a Piwi
34
son cadenas de 29-30 nucletidos, propias de animales; se
generan a partir de precursores largos monocatenarios (formados por una sola cadena),
en un proceso que es independiente de Drosha y Dicer. Estos ARN pequeos se asocian
con una subfamilia de las protenas "Argonauta" denominada protenas Piwi. Son activos
las clulas de la lnea germinal; se cree que son un sistema defensivo contra
los transposones y que juegan algn papel en la gametognesis.
35

36

ARN antisentido
Un ARN antisentido es la hebra complementaria (no codificadora) de un hebra ARNm
(codificadora). La mayora inhiben genes, pero unos pocos activan la transcripcin.
37
El
ARN antisentido se aparea con su ARNm complementario formando una molcula de
doble hebra que no puede traducirse y es degradada enzimticamente.
38
La introduccin
de un transgen codificante para un ARNm antisentido es una tcnica usada para bloquear
la expresin de un gen de inters. Un mARN antisentido marcado radioactivamente puede
usarse para mostrar el nivel de transcripcin de genes en varios tipos de clulas. Algunos
tipos estructurales antisentidos son experimentales, ya que se usan como terapia
antisentido.
ARN largo no codificante
Muchos ARN largos no codificantes (ARNnc largo o long ncARN) regulan la expresin
gnica en eucariotas;
39
uno de ellos es el Xist que recubre uno de los dos cromosomas
X en las hembras de los mamferos inactivndolo (corpsculo de Barr).
40

Riboswitch
Un riboswitch es una parte del ARNm (cido ribonucleico mensajero) al cual pueden
unirse pequeas molculas que afectan la actividad del gen.
41

42

43
Por tanto, un ARNm
que contenga un riboswitch est directamente implicado en la regulacin de su propia
actividad que depende de la presencia o ausencia de la molcula sealizadora. Tales
riboswitchs se hallan en la regin no traducida 5' (5'-UTR), situada antes del codn de
inicio (AUG), y/o en la regin no traducida 3' (3'-UTR), tambin llamada secuencia de
arrastre,
14
situada entre el codn de terminacin (UAG, UAA o UGA) y la cola poli A.
43

ARN con actividad cataltica


.
Ribozimas
El ARN puede actuar como biocatalizador. Ciertos ARN se asocian a protenas
formando ribo ncleo protenas y se ha comprobado que es la subunidad de ARN la que
lleva a cabo las reacciones catalticas; estos ARN realizan las reacciones in vitro en
ausencia de protena. Se conocen cinco tipos de ribosomas; tres de ellos llevan a cabo
reacciones de auto modificacin, como eliminacin de intrones o autocorte, mientras que
los otros (ribonucleasa P y ARN ribosmico) actan sobre substratos distintos.
14
As, la
ribonucleasa P corta un ARN precursor en molculas de ARNt,
44
mientras que el ARN
ribosmico realiza el enlace peptdico durante la sntesis proteica ribosomal.
Espliceosoma
Los intrones son separados del pre-ARNm durante el proceso conocido como splicing por
los espliceosomas, que contienen numerosos ARN pequeos nucleares (ARNpn o
snRNA).
45
En otros casos, los propios intrones actan como ribozimas y se separan a si
mismos de los exones.
46

ARN pequeo nucleolar
Los ARN pequeos nucleolares (ARNpno o snoRNA), hallados en el nuclolo y en
los cuerpos de Cajal, dirigen la modificacin de nucletidos de otros ARN;
22
el proceso
consiste en transformar alguna de las cuatro bases nitrogenadas tpicas (A, C, U, G) en
otras. Los ARNpno se asocian con enzimas y los guan aparendose con secuencias
especficas del ARN al que modificarn. Los ARNr y los ARNt contienen muchos
nucletidos modificados.
47

48

ARN mitocondrial
La mitocondrias tienen su propio aparato de sntesis proteica, que incluye ARNr (en los
ribosomas), ARNt y ARNm. Los ARN mitocondriales (ARNmt o mtARN) representan el 4%
del ARN celular total. Son transcritos por una ARN polimerasa mitocondrial especfica.