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DEGRADACION DE

COMPUESTOS
NITROGENADOS
BIOQUIMICA II












15 DE ABRIL DE 2014

ELABORADO POR:

Moran Torres Adriana
Rodrguez Capistran Fidel








Fecha de entrega:

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Contenido
DESAMINACION OXIDATIVA.................................................................................................... 2
CICLO DE LA UREA .................................................................................................................... 3
Relacin del ciclo de la urea con el ciclo de Krebs ............................................................. 6
Bases pricas ............................................................................................................................ 7
Formacin de purinas libres a partir de cidos nucleicos .................................................. 7
Sntesis de cido rico ............................................................................................................. 9
























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DESAMINACION OXIDATIVA
El glutamato libera su grupo amino en forma de amoniaco en el hgado. Los
grupos amino de muchos -aminocidos se recogen en el hgado en forma del
grupo amino de molculas de L-glutamato. A continuacin estos grupos amino han
de eliminarse del glutamato para prepararlos para la excrecin. En los
hepatocitos, el glutamato se transporta desde el citosol a la mitocondria, en donde
experimenta desaminacin oxidativa catalizada por la L-glutamato
deshidrogenasa. En los mamferos, esta enzima se encuentra en la matriz
mitocondrial. Es la nica enzima que puede utilizar tanto NAD
+
como NADP
+
como
aceptor de los equivalentes de reduccin. El producto de este proceso de
desa
mina
cin
es el
NH
4
+

y -
cetog
lutara
to
(Figu
ra 1).






FIGURA 1. Reaccin catalizada por la Glutamato deshidrogenasa.
La glutamato deshidrogenasa acta en una importante interseccin de los
metabolismos del carbono y el nitrgeno. Es una enzima alosterica con seis
subunidades idnticas, regulada positivamente por el modulador ADP y
negativamente por GTP. No se ha aclarado con detalle la explicacin metablica
de este patrn de regulacin.

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CICLO DE LA UREA
Aunque el amonaco es un participante universal en la sntesis y degradacin de
los aminocidos, su acumulacin en concentraciones anormales tiene
consecuencias txicas. Por lo tanto, las clulas con un catabolismo activo de los
aminocidos deben ser capaces de biotransformar y/o excretar el amonaco con la
misma rapidez con que ste se genera.
Los animales han creado rutas, adaptadas a sus estilos de vida, para la excrecin
de amonaco, cido rico o urea, como principales productos finales nitrogenados.
La mayor parte de los mamferos excretan el grueso de su nitrgeno en forma de
urea. La urea es muy soluble y, al ser elctricamente neutra, no afecta al pH
cuando se acumula, como ocurre con el amonaco.
En los organismos urotlicos, el amoniaco depositado en las mitocondrias de los
hepatocitos se convierten en urea mediante el ciclo de la urea. Esta ruta fue
descubierta en 1932 por Hans Krebs y un estudiante medico asociado, Kurt
Henseleit. La urea pasa a torrente sanguneo y de ah a los riones y se excreta
en la orina.
La urea se produce a partir de amoniaco en cinco pasos enzimticos.
El ciclo abarca dos compartimientos celulares, e ciclo de la urea comienza al
interior de la mitocondria de los hepatocitos y los tres siguientes pasos en el
citosol.
El primer grupo amino que entra en el ciclo proviene del amoniaco (NH
4
+
) de la
matriz mitocondrial producido en las rutas antes descritas, el cual se utiliza
inmediatamente junto con el CO2 (en forma de HCO3-) producido por la
respiracin mitocondrial, para producir carbamil fosfato en la matriz. Esta reaccin
es dependiente de ATP y es catalizada por la carbamil fosfato sintetasa I.
El carbamil fosfato, acta como un dador activado del grupo carbamil, entra
ahora al ciclo de la urea que consta de cuatro pasos enzimticos (como se
observa en la figura 2).
1.- El carbamil fosfato cede su grupo carbamilo a la ornitina para formar citrulina y
libera Pi. La ornitina acepta material en cada vuelta del ciclo y es catalizada por la
ornitina transcarbamilasa y la citrulina formada pasa al citosol.
2.- El segundo grupo amino se introduce a partir del aspartato mediante un
reaccin de condensacin entre el aspartato y el grupo carbonilo de la citrulina
que forma argininosuccinato sintetasa, catalizada por la argininosuccinato
sintetasa, requiere ATP y tiene lugar a travs de un intemediario citrulil-AMP.

4

3.- El argininosuccinato es cortado por la argininosuccinasa, para formar
arginina libre y fumarato que puede entra en el ciclo del cido ctrico, es la nica
reaccin reversible del ciclo de la urea.
4.- La enzima citoslica arginasa corta la arginina dando la urea y ornitina.
La ornitina es trasportada a la mitocondria para iniciar otra vuelta del ciclo de la
urea.


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FIGURA 2.- Ciclo de la urea y reacciones que introducen grupos aminos en el mismo.

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Relacin del ciclo de la urea con el ciclo de Krebs
Dado que el fumarato producido en la reaccin de la argininosuccinasa es tambin
un intermediario del ciclo del cido ctrico, los ciclos estn interconectados en un
proceso conocido como doble ciclo de Krebs. Pero cada ciclo puede funcionar
independientemente y la comunicacin entre ellos depende del transporte de
intermediarios claves entre la mitocondria y el citosol. Varias enzimas del ciclo del
cido ctrico, incluidas la fumarasa y la malato deshidrogenasa, tambin se hallan
como isozimas en el citosol.
El fumarato generado en la sntesis citoslica de arginina puede convertirse en
malato en el citosol y estos intermediarios pueden seguir siendo metabolizados en
el citosol o ser transportados a las mitocondrias para su utilizacin en el ciclo del
cido ctrico. El aspartato formado en las mitocondrias por transaminacion entre
oxalacetato y glutamato puede ser transportado al citosol, en donde acta como
dador de nitrgeno en la reaccin del ciclo de la urea catalizada por la
argininosuccinato sintetasa. Estas reacciones, que constituyen la desviacin del
aspartato-argininosuccinato, proporcionan vnculos metablicos entre las rutas
separadas por las que se transforman los grupos amino y los esqueletos
carbonados de los aminocidos, como se observa en la figura 2.
FIGURA 3.- Conexiones entre el ciclo de la urea y el ciclo del cido ctrico.

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Bases pricas
Las bases nitrogenadas que forman parte de los cidos nucleicos son de dos
tipos, pricas y pirimidinas. Las bases pricas derivadas de la purina (fusin de un
anillo pirimidnico y uno de imidazol) son la Adenina (6-aminopurina) y la Guanina
(2-amino- 6-hidroxipurina).









Formacin de purinas libres a partir de cidos nucleicos
La mayora de los organismos pueden sintetizar los nucletidos a partir de los nuclesidos o las
bases de los que disponen por haberlos ingerido con los alimentos o por haberlos obtenido
mediante la degradacin enzimtica de los cidos nucleicos. Estos procesos se denominan rutas de
salvamento, ya que en ellas se utilizan los compuestos de purina y pirimidina preformados que, de
lo contrario, se perderan mediante la biodegradacin.
DEGRADACIN DE LOS CIDOS NUCLEICOS
La degradacin puede producirse intracelularmente (a travs del recambio de las especies de RNA
mensajero inestables o a travs de las rutas de reparacin del DNA), como consecuencia de la
muerte celular o, en los animales, por la digestin de los cidos nucleicos ingeridos en el alimento.
En los animales, la hidrlisis extracelular de los cidos nucleicos ingeridos constituye la principal
va de obtencin de bases y nuclesidos. Los procesos de degradacin son comparables a los que
intervienen en la digestin proteica. La fragmentacin se inicia en los enlaces internos, en este
caso los enlaces fosfodister. La catlisis se produce mediante las endonucleasas, como la
ribonucleasa o la desoxirribonucleasa pancreticas, que actan digiriendo los cidos nucleicos en
el intestino delgado. La fragmentacin endonucleoltica da lugar a oligonucletidos, que
posteriormente se fragmentan de forma exonucleoltica (en enlaces prximos a los extremos de
las molculas) por la accin de enzimas inespecificas denominadas fosfodiesterasas. Los productos
son mononucletidos, nuclesidos 5'- o 3'-monofosfato, segn las especificidades de las enzimas
en cuestin. Los nucletidos pueden fragmentarse posteriormente de forma hidroltica, mediante
FIGURA 4.- Estructura de las bases puricas.

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un grupo de fosfomonoesterasas denominadas nucleotidasas, para dar ortofosfato y el
correspondiente nuclesido. Aunque se produce la ruptura hidroltica del nuclesido resultante, la
va ms comn de ruptura hacia la base implica la accin de la nuclesido fosforilasa. Como la
glucgeno fosforilasa, las nuclesido fosforilasas rompen un enlace glucosdico mediante la
adicin de los elementos del fosfato inorgnico, dando lugar a la correspondiente base ms ribosa-
1-fosfato (o desoxirribosa-1- fosfato si el sustrato es un desoxirribonudesido).
Estas reacciones son fcilmente reversibles, de manera que una nuclesido fosforilasa puede
catalizar tambin el primer paso de la sntesis de salvamento de nucletidos a partir de las
nucleobases libres.
En la figura 5 se muestran las relaciones entre el catabolismo de los acidos nucleicos (en amarillo)
y la nueva sntesis de nucletidos mediante las rutas de salvamento (en azul).






FIGURA 5.- Reutilizacin de las bases pricas y pirimidicas.

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Sntesis de cido rico
El catabolismo de los nucletidos de purina da lugar a cido rico, a travs de las
rutas que se muestran en la Figura 5. Las rutas especficas utilizadas varan en
los diversos organismos y en distintos tejidos del mismo organismo. As, por
ejemplo, el AMP, o bien se desamina para producir cido inosnico (IMP), o se
hidroliza para producir adenosina. La desanimacin es especialmente activa en el
msculo, mientras que la hidrlisis predomina en la mayor parte de los dems
tejidos animales. En las rutas de degradacin, la adenosina se desamina por la
adenosina desaminasa (ADA) para dar inosina. Tanto la inosina como la
guanosina pueden formarse por hidrlisis de los respectivos nuclesidos
monofosfato, sobre los que acta la nuclesido de purina fosforilasa (PNP)
para dar hipoxantina y guanina, respectivamente. La guanina se desamina a
xantina por la guanina desaminasa, una enzima abundante en el cerebro y en el
hgado de los mamferos. La hipoxantina se oxida a xantina, y la xantina a cido
rico, por la accin de la xantina oxidasa. Esta enzima, que oxida otros varios
compuestos nitrogenados heterocclicos, contiene unido FAD, molibdeno y hierro
no hemo. Los electrones obtenidos de la oxidacin de los sustratos se transfieren
a cada uno de estos transportadores, que finalmente reducen el oxgeno a H
2
0
2
,
sobre el que acta la catalasa. El catabolismo de las purinas en los primates
termina en el cido rico, que se excreta.

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CATABOLISMO DE LOS NUCLEOTIDOS DE PURINA HASTA ACIDO URICO

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