Universidad de Sonora

Divisin de Ciencias Biolgicas y de la Salud

DICTUS
Licenciatura en Biologa

Investigacin documental del grupo de Bacterias y Virus


Equipo nmero 1
Garca Morales Jonathan
Gonzlez Salazar Sofa
Len Ruz Jess Alberto
Lpez Virgen Andrs Guadalupe
Quintana Salvador Tania Elizabeth

Grupo 103
Dr. Alejandro Varela Romero







18 de octubre de 2013 Hermosillo, Sonora
Introduccin

A partir de este trabajo exponemos las caractersticas generales biolgicas,
sistemticas, ecolgicas y de preservacin de la manera ms general posible de los
integrantes del dominio Bacteria y los agentes conocidos dentro del grupo de los virus.
Existe una gran diversidad de trminos, caractersticas e incluso especies al hablar de
virus o de bacterias, siendo estos ltimos el dominio con la mayor diversidad de todos,
hablando en cuanto a trminos de nmero de especies descritas y las que an se
encuentran por describir, adems, cabe mencionar que si los virus no poseen ni una
fraccin del nmero de organismos descritos del dominio bacteria (se han descrito ms
de 5000 especies de virus, aunque se estima que existan millones (Annimo, 2013), los
virus se encuentran dispersos en casi todos los ecosistemas de la Tierra y afectan a
casi todo tipo de organismo vivo, desde animales y plantas e incluso hasta las mismas
bacterias que exponemos en este trabajo.
Es dado por hecho que las bacterias son los organismos con mayor diversidad, ya que
se sabe que solamente se conoce y se puede cultivar en un laboratorio el 1% de todas
las bacterias, incluso se sabe que su diversidad es tal, que por 1 gramo de tierra frtil
se pueden encontrar hasta 40 millones de clulas bacterianas, y en una macroescala,
se estima que hay 5x10
30
bacterias en todo el mundo (Annimo, 2013), por lo que es de
suma importancia la formacin de profesionales especializados en la investigacin,
adems de la conservacin bacteriana. A pesar de su gran diversidad, las bacterias
son organismos de complejidad bastante reducida y se pueden describir generalmente
con pocas palabras; son microorganismos unicelulares que se reproducen por fisin
binaria (divisin simple). Muchos tienen vida libre. Contienen informacin gentica,
sistemas de produccin de energa y sistemas biosintticos necesarios para el
crecimiento y reproduccin (Prez C.M, 2004).
Los virus, por otro lado y al contrario de las bacterias, no son poseedores de tanta
diversidad en cuanto a nmero de entidades , adems de que poseen una complejidad
mucho mayor, ya que, al contrario de lo que se puede creer, estos no son organismos
vivos, pues carecen de las caractersticas bsicas de estos, como lo son la nutricin,
reproduccin (s son capaces de efectuar una reproduccin pero en un mbito
parasitario, es decir, necesitan de un organismo vivo o clula para poder duplicarse) e
incluso violan uno de los enunciados de la teora celular (una clula viva siempre
procede de otra clula viva). A pesar del hecho de que no existan, o ms bien se
sospecha que se desconoce, gran cantidad de virus en la naturaleza, como ya se
mencion anteriormente, estos se encuentran presentes en casi todos los ecosistemas
y son capaces de infectar a casi todo organismo vivo, por lo que es evidente su gran
flexibilidad para subexistir en una enorme cantidad de condiciones biolgicas diversas,
pH especfico, variedad de temperaturas, ausencia o presencia de oxgeno (Madigan et
al, 2004)
Primera parte: Virus

Se le puede denominar ms correctamente a un virus como un elemento
gentico que como un ser vivo. Es comn utilizar indistintamente los trminos
virus y bacterias, pero posteriormente indicaremos diferencias entre estos dos
organismos. Los virus se pueden replicar independientemente de los
cromosomas de una clula, aunque sin embargo, no se pueden replicar
independientemente de las clulas. Este es quiz el rasgo ms caracterstico de
los virus, para multiplicarse, deben alcanzar una clula en la cual puedan
replicarse (hospedador), sin embargo, no se debe suponer que los virus no
pueden subsistir en espacios extracelulares. Cabe destacar que los virus no son
los nicos elementos genticos los cuales aprovechan los mecanismos de
metabolismo celular para la replicacin de su material gentico, un ejemplo de
estos son los plsmidos, y como estos ltimos, los virus pueden aportar nuevas
propiedades importantes a la clula hospedadora, estas propiedades, dainas o
beneficiosas, se heredan a la clula hija de la clula hospedadora y cada clula
recibe tambin el genoma vrico, y por lo tanto, la mutacin heredada Su
estructura consta de una superficie viral, con protenas, por dentro una matriz y
dentro de ella la cpsida, donde estn contenida la nucleocpsida y ADN(Figura
1.1) (Betancourth-Garcia y Salazar-Gonzlez C, 2012)







Figura 1.1 Estructura general de un virus.
Fuente: http://conocimientos-
inmunologia.blogspot.mx/2011_01_01_archive.html
Sin embargo, a diferencia de los plsmidos, la estructura extracelular (en el exterior de
la clula, sin hospedador) que poseen les confiere una gran facilidad de que se
transmitan de hospedador a hospedador. Esta misma forma extracelular permite que
algunos virus se repliquen dentro de la misma clula hospedadora, lo cual puede tener
efectos dainos e incluso destructivos en la clula, esto explica por qu algunos virus
sean agentes de enfermedad (figura 1.2).
Al contrario de lo que se cree popularmente, no todos los virus tienen un carcter
daino y destructivo, actualmente son parte importante en estudios de gentica y
bioqumica, ms especficamente en el metabolismo celular, inclusive son grandes
instrumentos en gentica microbiana y en ingeniera gentica.







Caractersticas generales

De manera general, un virus presenta 2 fases: fase extracelular y fase intracelular.
En la primera, el virus es bsicamente una partcula submicroscpica que contiene
cido nucleico rodeado por protena y ocasionalmente otros componentes
extracelulares, como ya es el caso del virus de la influenza que tiene estructuras
llamadas picos en su envoltura proteica, las cuales le confieren propiedades
especficas. El virus en estado extracelular usualmente se le denomina virin, ste es
metablicamente inerte, siendo una cpsula proteica con material gentico en su
interior, sin realizar funciones de respiracin o algn tipo de biosntesis.
La principal utilidad del virin es transportar el genoma vrico de una clula a otra para
que esta pueda ser introducida en una nueva clula hospedadora y as, el virin pueda
entrar en fase intracelular.
Figura 1.2. Fases del virus.
Fuente: http://cienciaexplicada.com/la-accion-destructora-de-los-
virus.html
La fase intracelular de un virus es vital, aqu ocurre la replicacin vrica; se produce el
genoma vrico y se sintetizan componentes que constituyen la cubierta del virus.
Cuando un genoma vrico se introduce y reproduce en una clula hospedadora el
proceso es denominado infeccin.
Como ya se sabe, todas las clulas eucariotas poseen material gentico,
especficamente cido desoxirribonucleico bicatenario (DNA), no obstante, los virus, al
no ser clulas, pueden poseer tanto material gentico ADN como ARN y puede ser
monocatenario o bicatenario. En ocasiones, los virus son clasificados en funcin de si
tienen ADN o ARN, ya que todos los virus contienen uno u otro en su forma de virin.
Por otra parte, existe un tercer grupo que usa ambos, ADN y ARN como material
gentico, pero en diferentes fases de su ciclo reproductivo, un ejemplo de este grupo
son los retrovirus, que contienen un genoma de ARN en el virin pero que se replican a
travs de ADN intermediario (Betancourth-Garcia y Salazar-Gonzlez C, 2012).
Como ya se mencion anteriormente, los virus son incapaces de sintetizar molculas
por si mismo, sin embargo, es interesante sealar que la mayora de los virus (excepto
los que usan la enzima transcriptasa reversa) s cumplen con el dogma central de la
biologa molecular, solamente que no utilizan mecanismos propios para sintetizar ADN
a ARN y ste a protenas, sino que utilizan los mecanismos metablicos y de
traduccin de la clula para reproducir su genoma vrico y sintetizar las protenas
codificadas en ste.

Estructura y morfologa

Lo primero que hay que dejar en claro respecto a la estructura y morfologa (figura 1.3)
de los virus es que estos carecen de una estructura celular (membrana semipermeable,
bicapa lipdica, etc.), adems, cabe destacar que al contrario de otros microorganismos,
los virus no poseen orgnulos, ni citoplasma ni un ncleo celular.








Componentes bsicos de los
virus
Ncleo de
cido nucleico
llamado
genoma
Envoltura
proteica que
rodea al material
gentico,
conocida como
capside
Figura 1.3. Estructura bsica de los virus.
Fuente: http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/b/b4/Estructura_d'un_virus.png
Genoma
Contiene ADN o RNA pero no ambos, adems, el cido nucleico no est fragmentado,
salvo en algunos casos (como en los virus de la influenza, en donde se encuentra en
segmentos separados). En virus con forma icosahdrica, el genoma se encuentra
empaquetado y condensado, mientras que en virus con forma helicoidal el genoma se
encuentra extendido.
Cpside
Su principal funcin es la de proveer proteccin al genoma (su composicin de amino
cidos le dan la propiedad de resistir cambios de temperatura, pH y otras fluctuaciones
ambientales) y forma al virus, adems le confiere las propiedades de simetra helicoidal,
icosadrica y compleja, las cuales se abordarn ms adelante. Generalmente, la
cpside est subdividida en subunidades individuales de protena llamadas
capsmeros, el nmero de estos es caracterstico de cada virus (162 capsmeros son
los que componen la cpside en herpe virus y 252 componen la cpside en los
adenovirus, los cuales son los causantes del resfriado comn). Algunos virus poseen
estructuras parecidas a membranas flexibles conocidas como envolturas, estas estn
compuestas de lpidos derivados de la membrana de la clula hospedadora y protenas,
normalmente glicoprotenas codificadas por el mismo virus (Betancourth-Garcia y
Salazar-Gonzlez C, 2012)
En algunos virus, como es el caso del virus de la influenza, la envoltura contiene
estructuras especialidades y funcionales conocidas como espculas, las cuales
contienen enzimas para ayudar a que el virus se pegue a la clula hospedadora en
sitios activos muy especficos, como protenas de membrana, glicoprotenas, etc.
Bsicamente existen 3 formas virales: helicoidal, icosadrica (tambin llamada
polidrica) y compleja (figura 1.4), y formas virales con envoltura y desnudas (sin
envoltura) (figura 1.5)



Figura 1.4. Formas estructurales de los virus. Fuente: http://personales.csagustin.net/2011-
12/1bac/07/virus.html




Figura 1.5. Formas virales con envoltura y sin envoltura.
Fuente: http://www.biologia.edu.ar/virologia/virologia1.htm





Antes de iniciar el tema de comenzar el tema de las Bacterias es importante revisar la
siguiente tabla que encuadra las diferencias generales entre estas y los virus (tabla 1.1)












Segunda parte: Dominio Bacteria

Historia natural de las bacterias
La Tierra tiene una edad aproximada de 4.600 millones de aos, que ha sido
determinada por mtodos radiactivos. La composicin sedimentaria de las rocas de
Isua, en Groenlandia, tiene un inters evolutivo especial, ya que nuestro conocimiento
de la formacin de las rocas sedimentarias modernas permite afirmar que la presencia
de rocas de ese tipo hace 3.800 millones de aos es una seal de que ya exista agua
lquida en aqul tiempo (figura 2.1)
Se han encontrado fsiles que demuestran la existencia de vida microbiana en rocas
de hasta 3.600 millones de aos. La mayor parte de los microfsiles de las rocas ms
antiguas parecen bacterias sencillas, con forma de bacilos. En determinadas rocas de
Tabla 1.1. Diferencias generales entre virus y bacterias.
Lpez-Virgen y Quintana-Salvador (2013)
esa poca, abundan los microfsiles estromatolticos, que contienen procariotas
morfolgicamente diversos. Aunque los modernos estromatolitos estn constituidos
frecuentemente por cianobacterias filamentosas (que son fottrofos oxignicos), estos
microorganismos no deban estar presentes en los primeros estromatolitos. Debido a
las condiciones de anoxia de la Tierra primitiva, los estromatolitos con una antigedad
igual o superior a 3.000 millones de aos es probable que estuviesen formados
exclusivamente por fottrofos anoxignicos (Madigan et al, 2004)




Dado que en la Tierra primitiva predominaban las condiciones reductoras, es probable
que los primeros organismos llevasen a cabo algn tipo de metabolismo anaerbico.
Sin embargo, nuestro conocimiento de la diversidad metablica sugiere que esta
restriccin debi de durar poco; la actividad metablica de los organismos primitivos
podra haber sido quimioorganotrfica, quimiolitotrfica o fototrfica, ya que todos estos
procesos generadores de energa pueden darse en condiciones anxicas (Madigan et
al, 2004).
Las reacciones generadoras de energa debieron de ser muy sencillas, quizs
requeriran slo una o dos protenas. Un mecanismo potencial que encaja bien en este
supuesto sera uno en el que el hierro ferroso, quizs en forma de carbonato ferroso o
Figura 2.1. Fsiles de estromatolitos, ms antiguos
organismos vivos documentados hasta hoy.
Fuente: http://es.wikipedia.org/wiki/Abiog%C3%A9nesis
sulfuro ferroso, reacciona con sulfuro de hidrgeno para formar pirita e hidrgeno
molecular:
FeCO
3
+ 2H
2
S FeS
2
+ H
2
+ H
2
O + CO
2

FeS + H
2
S FeS
2
+ H
2


Un paso monumental en la evolucin microbiana tuvo lugar con el desarrollo de la
segunda reaccin luminosa de la fotosntesis, que hizo posible usar H
2
O, como dador
de electrones. El primer organismo de este tipo fue un procariota parecido a las
cianobacterias (figura 2.2). El desarrollo de la fotosntesis oxignica tuvo enormes
consecuencias para el ambiente de la Tierra, porque a medida que el O
2
se iba
acumulando, la atmsfera cambiaba de anxica a xica (Madigan et al, 2004)




Filogenia microbiana a partir de la secuenciacin del RNA ribosmico
La secuenciacin molecular ha revelado una filogenia de los seres vivos que antes no
se sospechaba, una filogenia muy diferente a todas las anteriores, que se basaban
principalmente en relaciones fenotpicas. A partir del estudio molecular se han revelado
tres dominios evolutivos que vienen a sustituir a los cinco reinos de Whithaker. As las
lneas evolutivas se dividen en dos procariticas y una eucaritica (figura 2.3) (Rodicio
y Mendoza, 2004)
Figura 2.2. Cianobacterias actuales vistas al microscopio ptico.
Fuente: http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/1/1f/Spirul2.jpg
La comparacin de las secuencias de los ARNr 16S (o de los genes que los codifican)
permite establecer las relaciones filogenticas existentes entre los organismos
procariotas. Este hecho ha tenido una enorme repercusin en taxonoma bacteriana,
dando lugar al sistema de clasificacin vigente y permitiendo la identificacin rpida y
precisa de las bacterias. Hay que tener en cuenta, no obstante, que para la
comparacin de los ARN 16S se deben comparar genomas completos por hibridacin
de ADN-ADN. Un conjunto de cepas que compartan ms del 70% de material gentico
son consideradas una especie, por otro lado, un valor inferior al 50% indicara dos
especies distintas (Rodicio y Mendoza, 2004)




Taxonoma, nomenclatura y el Bergeys Manual
Por el pequeo tamao bacteriano es complicado basarse en caractersticas
fenotpicas para su clasificacin. Por ello, el anlisis genotpico ha sido la base para
Figura 2.3. Dominios de Woese. Separa a las especies por medio de estudios
moleculares y celulares.
Fuente: http://agustinasnaturales.webnode.es/biologia%202%C2%BA%20bto/imagenes-como-articulos/
clasificar a los organismos pertenecientes en el dominio Bacteria. Siguiendo el sistema
binomial de nomenclatura, a todas las bacterias se les asigna un nombre genrico y
otro de especie. (Madigan et al, 2004)
Las reglas de la nomenclatura bacteriana se encuentran en una publicacin llamada
The International Code of Bacteria, que indica las normas que deben seguirse para
designar organismos aislados por primera vez como nuevos gneros o especies.
(Madigan et al, 2004)
Cuando se asla un nuevo organismo y se cree que es distinto a todos los dems, hay
que decidir si es lo suficientemente distinto como para ser descrito como nueva especie
o inclusive como nuevo gnero. Toda atribucin taxonmica formal como gnero o
especie, se publica y deposita un cultivo axnico en una coleccin de cultivos
aprobada, normalmente en la American Type Culture Collection (ATCC; coleccin
americana de cultivos tipos) (Madigan et al, 2004)
La cepa depositada sirve como cepa tipo de la nueva especie y como estndar para
comparar otras cepas que se crea que puedan ser la misma.
Las colecciones de cultivo conservan el cultivo depositado, generalmente congelndolo
a temperaturas bajas (de -80C a -90C) o liofilizndolo. Esta prctica difiere de las
utilizadas en botnica o zoologa. Estas disciplinas utilizan especmenes preservados
(muertos, bien como material de herbario seco o animales fijados qumicamente)
(Madigan et al, 2004)
Si la descripcin del nuevo organismo se publica en una revista diferente al
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSM), publicacin
oficial de los registros de taxonoma y clasificacin de procariotas, debe enviarse a esta
revista una separata del trabajo publicado y el nombre validado, antes de que sea
aceptado formalmente como un nuevo taxn microbiolgico. En cada nmero, el IJSEM
publica una lista de nombres aprobados para su inclusin en el Manual de Bergey de
bacteriologa sistemtica. (Madigan et al, 2004)
Aunque no existe una fuente oficialmente reconocida en el campo de la taxonoma
microbiana, el Bergeys Manual es la referencia ms indicada. Este es un compendio
de informacin estndar y molecular de todas las especies reconocidas de procariotas
en el momento de su publicacin y contiene un buen nmero de tablas, figuras y otra
informacin sistemtica til a efectos de identificacin. A partir del 2001, se le ha
incorporado muchos de los conceptos surgidos de los estudios de secuenciacin del
RNA ribosmico y los mezcla con una abundante informacin de la taxonoma clsica
(Madigan et al, 2004)
Caractersticas biolgicas bsicas de las bacterias
En general, las bacterias constituyen organismos nicos de carcter unicelular
procariota, esto significa que estn formados por una sola clula que adems no posee
un ncleo definido. Esta caracterstica es el sustento de la clasificacin taxonmica de
procariotas y eucariotas (tabla 2.1)












Morfologa
Su tamao aproximado es de 1-3 micras, aunque se han encontrado algunas bacterias
realmente gigantes, las cuales han llegado a medir cerca de un milmetro.Existen
algunas bacterias que tienen forma de esfera (coco), otras ms bien curvada u
ondulada como un espiral (espirilos) y otras con forma de bastoncillo (bacilos), siendo
estas ltimas las ms frecuentes (figura 2.4).




Tabla 2.1. Principales diferencias entre eucariotas y procariotas.
Fuente: http://www.saberespractico.com/estudios/secundaria-bachiller/diferencias-entre-celulas-
procariotas-y-eucariotas/
Figura 2.4. Formas generales de bacterias.
Fuente:http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/f/fe/Bacterial_morp
hology_diagram-es.svg
Una forma de clasificar a las bacterias es de acuerdo a su nutricin. A partir de esta,
podemos decir que las hay hetertrofas y auttrofas.
Muchas de las auttrofas fabrican materia orgnica gracias a la energa de la luz solar,
lo que significa que son fotosintticas, igual que las plantas. Otras obtienen la energa
necesaria para mantenerse con vida gracias a reacciones qumicas en las que
intervienen sustancias inorgnicas que obtienen del ambiente, estas son llamadas
quimiosintticas (Solomon et al, 2013).
Algunas bacterias necesitan oxgeno para vivir pero en cambio, otras pueden vivir sin
tener contacto con el aire en momento alguno y en determinados casos, incluso
pueden morir si se las expone al oxgeno. Estas son las llamadas anaerbicas y para
respirar, realizan un complejo proceso conocido como la respiracin anaerbica
(Solomon et al, 2013),
Segn la especie de bacteria y sus caractersticas fisiolgicas tienen una morfologa o
estructura especfica. Aunque en general podemos decir que existen elementos que
son comunes para todas ellas as como algunos que varan de organismo en
organismo (figura 2.5)
As es como pueden dividirse los elementos bacterianos en obligados (comunes en
todas ellas) y facultativos (son prescindibles para la vida) (Solomon et al, 2013)

Elementos obligados

Pared celular
Membrana citoplasmtica
Citoplasma
Ribosomas
Nucleoide o cromosoma bacteriano

Elementos facultativos

Cpsula
Flagelos
Fimbrias o pili
Plsmidos y transposones









Generalidades de la filogenia Bacteria
Al menos se conocen 17 linajes principales (phyla) de Bacteria que derivan del estudio
de cultivos de laboratorio, y otros muchos han sido identificados al secuenciar genes de
rRNA de Bacteria hbitats naturales. El phylum filogentico ms antiguo contiene al
gnero Aquifex y gneros relacionados; todos ellos son quimiolitotrofos, oxidantes de
hidrgeno e hipertermoflicos.











Figura 2.5. Estructura bsica de una bacteria.
Fuente: http://www.medicinaunsa.edu.pe/wp-
content/uploads/2013/07/Celula-Procariota-Estructura.jpg
Figura 2.6. rbol filogentico de Bacteria.
Fuente: Brock. Biologa de los microorganismos. Dcima edicin. Primera pgina.
Phylum 1: Proteobacteria
Como grupo, se trata de bacterias Gram negativas, muestran una gran diversidad
metablica y representan la mayora de las bacterias con importancia clnica, industrial
o agrcola. Empezamos la descripcin con las Proteobacterias fototrficas: las bacterias
rojas (Madigan et al, 2004)
Gneros claves
Bacteria rojas fototrficas
Bacteria nitrificantes
Bacteria oxidantes del azufre y del hierro
Metanotrofos y metilotrofos
Bacteria aerbicas de vida libre fijadoras de nitrgeno
Bacteria entricas
Pseudomonas

Organismos representativos
(a) (b)













Figura 2.7
(a) Nitrobacter winogradskyi y (b) Salmonella typhimurium.
Fuentes: http://newsimg.bbc.co.uk/media/images/38607000/jpg/_38607153_salmon_ifr_300.jpg
y http://202.114.65.51/fzjx/wsw/newindex/tuku/MYPER/pic/b04/660-d.jpg
Phylum 2: Bacteria Gram positivas
Se denominan bacterias Gram positivas a aquellas bacterias que se tien de azul
oscuro o violeta por la tincin de Gram. La envoltura celular de las bacterias Gram-
positivas comprende la membrana citoplasmtica y una pared celular compuesta por
una gruesa capa de pptidoglicano, que rodea a la anterior. La pared celular se une a
la membrana citoplasmtica mediante molculas de cido lipoteicoico (Annimo)
Gneros claves
Staphylococcus
Streptococcus
Bacillus
Lactobacillus
Clostridium
Mycobacterium
Streptomyces

Organismos representativos
(a) (b)












Figura 2.8. (a) Sthaphylococcus aureus y (b) Mycobacterium tuberculosis.
Fuentes: de http://textbookofbacteriology.net/MTBCDC.jpg y
http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/5/57/Staphylococcus_aureus_01.jpg

Phylum 3: Cianobacterias y proclorofitos
Comprende las bacterias capaces de realizar fotosntesis oxignica y, en algn sentido,
a sus descendientes por endosimbiosis, los plastos. Son las nicas procariotas que
llevan a cabo ese tipo de fotosntesis, por ello tambin se les denomina oxifotobacterias
(Oxyphotobacteria).. Los anlisis genticos recientes han venido a situar a las
cianobacterias entre las bacterias gramnegativas. (Annimo, 2010).
Gneros clave
Synechoccus
Prochlorothrix
Prochlorococcus


Organismos representativos
(a) (b)










Phylum 4: Clamidias
Clamidia es un grupo de bacterias de tamao pequeo, en relacin a otras bacterias, y
forma cocos agrupados en cadenas. Su principal caracterstica es el ciclo replicativo
intracelular, lo cual las convierte en parsitos obligados. Son bacterias intracelulares,
Figura 2.9. (a)Synechococcus lividus y (b)Prochloron didemni.
Fuentes: http://202.114.65.51/fzjx/wsw/newindex/tuku/MYPER/pic/b02/656.1.jpg y
http://cfb.unh.edu/phycokey/Choices/Chloroxybacteria/PROCHLORON/prochloron_02_600x4
16_mcgill.jpg
pues no poseen toda la maquinaria necesaria para su crecimiento. Este crecimiento
intracelular permite a las Clamidias producir una infeccin crnica, al evitar la apoptosis
de la clula a la que infecta (Annimo 2010)
Gneros clave
Chlamydia

Organismos representativos
(a) (b)










Phylum 5: Plantomices
Son bacterias nicas morfolgicamente hablando. Poseen prostecas que funcionan
como rgano de fijacin. Carecen de peptidoglucano y sus paredes celulares estn
hechas de grandes cantidades de cistena y prolina. Esta ausencia de peptidoglucano
les provee inmunidad ante penicilinas y cefalosporinas (Annimo, 2010)

Gneros clave
Plantomyces
Pirellula
Gemmata
Figura 2.10. (a)Chlamydia trachomatis y (b)Chlamydia pneumoniae.
Fuente: http://www.yamagiku.co.jp/pathology/image/135/5.jpg

Organismos representativos

(a) (b)










Phylum 6: Verrucomicrobios
Este filo contiene slo unas pocas especies, siendo Verrucomicrobia spinosum la que
ha dado nombre al grupo.
Las especies identificadas han sido aisladas del agua dulce, del suelo, agua de mar y
heces humanas. Algunas Verrucomicrobia, todava no cultivadas, se han encontrado en
asociacin con huspedes eucariotas, incluyendo protistas y nematodos (Annimo)
Ciertas evidencias sugieren que muchas son abundantes e importantes para el medio
ambiente.

Gneros clave
Verrucomicrobium y Prosthecobacter


Figura 2.11 (a) Plantomyces brasiliensis y (b) Pirellula staleyi.
Fuente: http://microbewiki.kenyon.edu/
Organismo representativo










Phylum 7: Flavobacterias
Conformado por una amplia mezcla de tipos fisiolgicos desde anaerobios hasta
anaerobios estrictos pasando por los anaerobios facultativos.
Son no esporulados, sacarolticos, presentando fermentacin hasta acetato y
succinato. Son las de mayor cantidad en el intestino grueso humano, pudiendo llegar a
1011 clulas por gramo de heces. Son diferentes a las dems bacterias ya que
sintetizan esfingolpidos (Annimo)
Gneros clave
Bacteroides
Flavobacterium






Figura 2.12 Verrucomicrobium spinosum
Fuente:http://www.biomedcentral.com/content/figures/1471-
2180-9-5-2-l.jpg
Organismos representativos
(a) (b)










Phylum 8: Grupo cytophaga
Bacilos largos aerobios que se mueven por deslizamiento.
Producen enzimas hidrolticas, celulasas, quitinasas, proteasas, pero no de modo
extracelulares. Quedan pegadas a las clulas (Annimo)
Principales degradadoras de celulosa en aerobiosis. Tambin degradan el agar. Viven
en agua y suelos. Algunas especies son parsitas de peces (Annimo)
Gneros clave
Cytophaga
Sporocytophaga
Flexibacter





Figura 2.13. (a) Flavobacterium psychrophilum y (b) Flavobacterium
meningosepticum
Fuente:http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Flavobacterium
Organismos representativos
(a) (b)









Phylum 9: Bacteria verdes del azufre
Grupo de bacterias que realizan la fotosntesis anoxignica. Son fotolitoauttrofas
obligadas que usan sulfuro de hidrgeno (H
2
S) o azufre (S) como donantes de
electrones (por comparacin, las plantas durante la fotosntesis usan agua como
donante de electrones y producen oxgeno). Las estructuras donde se almacenan los
pigmentos fotosintticos estn unidas a la membrana y se conocen como clorosomas o
vesculas clorobiales (Madigan et al, 2004).
Gneros clave
Chlorobium
Prosthechochloris

Organismo representativo




Figura 2.15. Chlorobium tepidum.
Fuente: http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Chlorobium
Figura 2.14. (a)Flexibacter maritimus y (b)Cytophaga
hutchinsonii.
Fuente:http://www.standardsingenomics.org y http://microbewiki.kenyon.edu/
Phylum 10: Espiroquetas
Bacterias Gram-negativas que tienen clulas alargadas y enrolladas. Segn la especie
pueden tener de dos a 100 endoflagelos por clula. La movilidad de las espiroquetas es
diferente al resto de las bacterias mviles. Pueden emplear tres tipos de movimiento,
en medio lquido, rotacin alrededor de su eje, contracciones flexulosas y movimiento
helicoidal (Annimo, 2010)
Gneros clave
Spirochaeta
Treponema
Leptospira
Borrelia

(a) (b)









Phylum 11: Deinococcus
Tambin llamado Deinococcus-Thermus, este un pequeo filo de bacterias Gram
positivas altamente resistentes a los cambios en el medio ambiente. Hay dos grupos
principales: Deinococcales y Thermales incluye varios gneros resistentes al calor.
Thermus aquaticus tuvo un papel importante durante el desarrollo de la reaccin en
cadena de la polimerasa, en donde los sucesivos ciclos de calentamiento del ADN
hacen ventajoso utilizar molculas termoestables (Madigan et al, 2004).
Gneros clave
Figura 2.16.(a)Spirochaeta halophila y (b)Treponema pallidum.
Fuente: http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/1/16/TreponemaPallidum.jpg
y http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Spirochaeta
Deinococcus
Thermu

Organismos representativos
(a) (b)










Phylum 12: Bacteria verdes no del azufre
Obtienen energa mediante fotosntesis. No tienen enlaces ster ni ter y tampoco
poseen peptidoglucano. Las bacterias de este grupo son aerobias facultativas, pero no
producen oxgeno durante la fotosntesis (Madigan et al, 2004).
Gneros clave
Chloroflexus
Thermomicrobium





Figura 2.17.(a)Deinococcus radiodurans y (b)Thermus thermophilus
Fuentes: http://www.astrobio.net/albums/origins/akb.jpg y
http://farm5.staticflickr.com/4048/4478768673_3a89cc85a4_z.jpg
Organismo representativo





Phylum 13 y 14: Bacteria hipertermfilas muy ramificadas
Son hipertermfilos que crecen a temperaturas superiores a 80C. Crecen a menudo
cerca de los volcanes subacuticos o fuentes hidrotermales. Generalmente Gram
negativos y no esporulados, adems pueden utilizar H
2,
S
0
y S
2
O
2-
3
como donadores de
electrones y O
2
NO
-
3
como aceptores (Madigan et al, 2004).
Gneros clave
Thermotoga
Thermodesulfobacterium
Aquifex

Organismos representativos
(a) (b)








Phylum 15 y 16: Nitrospira y defferibacter
Figura 2.19. (a)Aquifex aeolicus y (b)Thermotoga martima.
Fuente: http://www.genomenewsnetwork.org/articles/02_02/extremo_art.shtml y
http://wishart.biology.ualberta.ca/BacMap/includes/species/Aquifex_aeolicus.png
Figura 2.18.Chloroflexus aurantiacus
Fuente: http://www.esacademic.com/pictures/eswiki/67/Chlorofl.jpg
Ambos gneros se han descrito por secuencia directa de RNA y an se conoce poco.
Fisiolgicamente, ambos grupos son o bien quimiolittrofos o quimiorgantrofos y son
desde mesfilos hasta termfilos (Madigan et al, 2004).
Nitrospira est relacionada con bacterias nitrificantes, pero es filogenticamente
diferente y adems carece de un sistema de membranas internas. Se piensa que la
capacidad de nitrificacin se adquiri de forma lateral (Madigan et al, 2004).
Defferibacter es similar a los gneros Geovibrio y Flexistipes. Defferibacter y Geovibrio
muestran respiracin verstil con bastantes aceptores de electrones como iones frrico
y manganoso (Madigan et al, 2004).
Teniendo actualmente como organismos representativos a: Nitrospira moscoviensis
y Defferibacter abyssi (No se encontraron imgenes de estos organismos)

Ecologa bacteriana
La ecologa es la ciencia que explora las interrelaciones entre los organismos y su
medio ambiente bitico y abitico. Por lo tanto, la ecologa microbiana es la ciencia que
especficamente examina las relaciones entre los microorganismos y su medio
ambiente bitico y abitico.
Estudiar la ecologa de cualquier organismo nos permite entender muchas cosas, no
slo relacionadas al organismo en cuestin sino del ecosistema al que pertenece, los
datos ecolgicos nos dan informacin sobre la historia de los organismos y de su
ecosistema as como de las cadenas trficas y los procesos demogrficos. Todo esto
ha permitido formular teoras sobre los cambios ecolgicos que ha sufrido y sufrir
nuestro planeta. En otras palabras, entender la ecologa nos ayuda a comprender cmo
interaccionan los organismos con su ambiente y cmo ambos cambian debido a estas
interacciones, comprender la ecologa significa entender los sutiles cambios en el
tiempo que constantemente llevan a la adaptacin de los organismos. As, comprender
la ecologa es entender, en parte, la evolucin (Souza V et al, 2007)
La biomasa de microorganismos terrestres en la superficie de nuestro planeta ha sido
estimada como igual a la de todas las plantas marinas y terrestres y tal vez sea el
constituyente principal de la biomasa de la Tierra. A pesar de que la diversidad
genmica de los microorganismos en el agua y en el suelo puede ser distinta, el
nmero mximo de individuos que integran el taxn dominante es similar:
aproximadamente 104-105 individuos por gramo o mililitro. Este hallazgo sugiere que
debe existir algn mecanismo o mecanismos que controlen la densidad de los taxa y
que estos deben funcionar de manera ms o menos similar en todos los ambientes,
Figura 2.20. Mtodo de siembra por estra para obtencin de cultivos puros. Es
importante realizar ms de una estra para garantizar la pureza de la cepa.
Fuente: http://aulavirtual.usal.es/aulavirtual/demos/microbiologia/unidades/documen/uni_02/56/cap309.htm
mientras que los mecanismos que controlan la diversidad total de la comunidad
bacteriana funcionan de modos distintos en agua y suelo. Existen algunas ideas sobre
los mecanismos que controlan la diversidad procarionte y ambas tienen que ver con la
ecologa (Valeria Souza et al, 2007)

Mtodos de recoleccin de cepas
Las bacterias comnmente se encuentran en cultivos mixtos, es decir, donde hay un
gran nmero de especies diferentes. Para identificarlas y clasificarlas se requiere de un
cultivo axnico. Para ello se toma una pequea cantidad de muestra con un asa de
platino y se reparte sobre la superficie del medio de cultivo. Sobre el medio quedan
separadas e inmovilizadas las clulas bacterianas. Tras la incubacin en condiciones
adecuadas, cada clula viable origina una colonia visible resultado de sucesivas
divisiones celulares. A partir de colonias separadas suficientemente es posible obtener
un cultivo puro de cada uno de los tipos de bacterias presentes en la muestra original
(figura 2.20). Debe considerarse que este mtodo debe realizarse con materiales y
reas estriles (Annimo, 2013)












Posteriormente se debe hacer una tincin Gram de nuestra cepa para comprobar si
efectivamente tenemos organismos de una sola especie (figura 2.21). Esto es muy
importante antes de considerarla como una cepa tipo (Annimo, 2013)
Las colecciones de cultivo conservan el cultivo depositado, generalmente congelndolo
a temperaturas bajas (de -80C a -90C) o liofilizndolo. Esta prctica difiere de las
utilizadas en botnica o zoologa. Estas disciplinas utilizan especmenes preservados
(muertos, bien como material de herbario seco o animales fijados qumicamente)
(Annimo, 2013)













Principales colecciones de cepas en el mundo
Actualmente existen diversos centros en los que se almacenan grandes colecciones de
cepas bacterianas con fines de estudio, o bien, de importancia industrial. Aqu se
enlistan algunas de las principales colecciones.
Institucin Tamao de la coleccin Ubicacin
American Type Culture
Collection (ATCC)
18,000 cepas Estados Unidos
United Kingdom National
Culture Collection (UKNCC)
8,000 cepas Reino Unido
Coleccin Espaola De
Cultivos Tipo (CECT)
5,000 cepas Espaa
CINVESTAV 3,500 cepas Mxico

Figura 2.21. Tincin Gram de una cepa pura de Serratia marcescens. Se puede apreciar
que slo tenemos organismos Gram negativos en la muestra.
Fuente: http://webeye.ophth.uiowa.edu/eyeforum/cases/34-setoninfection.htm
OBJETIVO DE LA INVESTIGACIN DOCUMENTAL
El reconocimiento de los caracteres diagnsticos del grupo de inters y su comparacin
con los otros grupos de la diversidad biolgica actual. Adems describir la
biodiversidad del grupo de inters a nivel general con ejemplo de una especie por
subgrupo.

MATERIALES Y MTODOS
Para alcanzar los objetivos planteados nosotros utilizamos diversos recursos para
obtener la informacin necesaria sobre el grupo Bacteria. La base de toda la
investigacin fue citada de tres importantes obras:
Brock. Biologa de los Microorganismos (dcima edicin), Biologa por Solomon et al
(novena edicin) e Introduccin a la Microbiologa por Tortora et al (novena edicin).
Dicha informacin se complement a su vez con recursos electrnicos consultados en
diversas pginas web.
La informacin citada es variada, desde la biologa general de los organismos
bacterianos, su ecologa, mtodos de aislamiento, sistemtica y taxonoma, hasta
introduccin al estudio de los virus. Se organiz toda la informacin de una manera
sencilla y sistematizada, en la que adems, se presentan imgenes y tablas para su
comprensin.
Al final, se establecieron todos los datos generales sobre ambos grupos para as
diferenciarlos de los dems organismos y a su vez de los otros filos dentro de su
dominio.
Cabe resaltar que la presentacin en PowerPoint est adaptada de este texto, aunque
con algunas modificaciones ya que tiene un fin ms didctico.

Actividad didctica
Adicionalmente, como actividad para los alumnos aplicaremos un sencillo examen
escrito sobre la identificacin de los elementos (estructurales y qumicos), que
componen a bacterias y virus. En dicho examen tambin habr una seccin libre donde
cada estudiante podr redactar algunos ejemplos de la informacin aprendida durante
la exposicin de ambos grupos (origen, ecologa, estructura, importancia mdica,
nutricin, etc).
Posteriormente se calificar el examen para obtener datos concretos sobre el proceso
enseanza-aprendizaje de la presentacin.

LITERATURA CITADA
Annimo. Bacterias. http://www.biopedia.com.

Annimo. 2010. Diversidad bacteriana. http://www.biodiversidad.gob.mx. 2010.

Annimo. Ecologa microbiana. http://www.iib.unsam.edu.ar.

Annimo. 2013. Tcnicas de cultivo. Aislamiento. Obtencin de cultivos puros.
http://www.pomif.com. 2013.

Betancourth-Garcia C. A. y Salazar-Gonzlez C. 2012. Virologa: Aspectos
importantes y bsicos para introducirse en el estudio de los virus. Acadmica
Espaola, primera edicin. Espaa.

Bravo Y. 2012. Introduccin a la microbiologa.
http://www.slideshare.net/yerkob/introduccin-a-la-microbiologa-13959937. 13 de
agosto de 2012.

Collier L., Oxford J. 2011. Virologa Humana. McGraw Hill. 5ta Edicin. Mxico.

Dewhurst S. 1998. Introduccin a la virologa. http://www.biologia.edu.ar. 2007.

Eldra P. Solomon, Linda R. Berg y Diana W. Martin. 2013. Biologa. Cegage
Learnin, novena edicin. Mxico.

Gerard J. Tortora, Berdell R. Funke y Christine L. Case. 2007. Introduccin a la
microbiologa. Panamericana, novena edicin. Argentina.

Jeffares D. y Poole A. 2009. Fueron las Bacterias las Primeras Formas de Vida
en la Tierra? http://www.actionbioscience.org. 2013.

Madigan, M. T., Martinko, J. M., y Parker, J. 2003. Brock Biologa de los
Microorganismos. Prentice-Hall, 10 edicin. Espaa.

Rodicio M. del R. y Mendoza M. del C. 2004. Identificacin bacteriana mediante
secuenciacin del ARNr 16S: fundamento, metodologa y aplicaciones en
microbiologa clnica. Departamento de Biologa Funcional. rea de
Microbiologa. Universidad de Oviedo. Espaa. 22(4):238-45.

Sciarini E. G. Clasificacin de la biodiversidad. http://cienciasnaturales-
bio.blogspot.mx/2007/03/reinos.html.

Souza V et al. 2007. Ecologa microbiana: una nueva ciencia para un nuevo siglo.
http://www.inecc.gob.mx. 15 de noviembre de 2007.