S.

solfataricus
M. jannaschii
P. aerophilum
A. pernix
N. pharaonis
H. marismortui
P. abyssi
A. fulgidus
T. acidophilum
P. torridus
M. hungatei
P. falciparum
N. crassa
O. sativa
C. albicans
S. cerevisiae
C. elegans
G. theta
E. histolytica
D. melanogaster
H. sapiens
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10 20 30 40 50 60 70
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S. solfataricus
M. jannaschii
P. aerophilum
A. pernix
N. pharaonis
H. marismortui
P. abyssi
A. fulgidus
T. acidophilum
P. torridus
M. hungatei
P. falciparum
N. crassa
O. sativa
C. albicans
S. cerevisiae
C. elegans
G. theta
E. histolytica
D. melanogaster
H. sapiens
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80 90 100 110 120 130 140 150 160
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G V E - - T E I L R T V S F V D S P G H E M L M A T M L S G A A I M D G A V L V I A A N E K C P R P Q T K E H L M A L Q I I G I D K I V I A Q N K I D I V S R E R V L E - N Y
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S. solfataricus
M. jannaschii
P. aerophilum
A. pernix
N. pharaonis
H. marismortui
P. abyssi
A. fulgidus
T. acidophilum
P. torridus
M. hungatei
P. falciparum
N. crassa
O. sativa
C. albicans
S. cerevisiae
C. elegans
G. theta
E. histolytica
D. melanogaster
H. sapiens
!& "% "& !' " !( !)
170 180 190 200 210 220 230 240
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S. solfataricus
M. jannaschii
P. aerophilum
A. pernix
N. pharaonis
H. marismortui
P. abyssi
A. fulgidus
T. acidophilum
P. torridus
M. hungatei
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C. albicans
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G. theta
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D. melanogaster
H. sapiens
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250 260 270 280 290 300 310 320 330
D Q E I K V L P G L R V E K Q - - G K V S Y E P I F T K I S S I R F G D E E F K E A K P G G L V A I G T Y L D P S L T K A D N L L G S I I T L A D A E V P - V L WN I R I K Y
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G D E I E I R P G I V T K D D Q - G K I Q C K P I F S N V V S L F A E H N D L K F A V P G G L I G V G T K V D P T L C R A D R L V G Q V V G A K - G N L P S I Y A D I E I N Y
G D E I E I R P G I V T K D D K - G K I Q C K P I F S N I V S L F A E Q N D L K F A V P G G L I G V G T K V D P T L C R A D R L V G Q V V G A K - G H L P N I Y T D I E I N Y
G Q E I E V R P G I V S K T - A T G Q L Q C R P I F S R I D S L F A E K N Q L E Y A V P G G L I G V G T K I D P T L C R G D R L V G H I L G A V - G T L P D I F I E I E I S F
N Q F F E I R P G I F F K R K N - - K I L C N F L H I Q I K T I N V E N R N L P E A T C G G L I G I G T N L D P S L T K G D K L S G Q M M G K S - E S L P P I V S K I L I N Y
G D E I E I R P G F N F R D S K - N Q Q T C K P L F T K I I S L H A E R N E L Q F A V P G G L I G V G T S L D P S L C R A D K L T G Q V A G I V - G S L P P V F V E L Q I K F
G Q E I E V R P G V V T K D S D - G N I T C R P I F S R I V S L F A E Q N E L Q Y A V P G G L I G V G T K I D P T L C R A D R L V G Q V L G A V - G Q L P D I Y Q E L E I S Y
G Q E I E V R P G I V S K D S E - G K L M C K P I F S K I V S L F A E H N D L Q Y A A P G G L I G V G T K I D P T L C R A D R M V G Q V L G A V - G A L P E I F T E L E I S Y



S. solfataricus
M. jannaschii
P. aerophilum
A. pernix
N. pharaonis
H. marismortui
P. abyssi
A. fulgidus
T. acidophilum
P. torridus
M. hungatei
P. falciparum
N. crassa
O. sativa
C. albicans
S. cerevisiae
C. elegans
G. theta
E. histolytica
D. melanogaster
H. sapiens
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340 350 360 370 380 390 400 410
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S. solfataricus
M. jannaschii
P. aerophilum
A. pernix
N. pharaonis
H. marismortui
P. abyssi
A. fulgidus
T. acidophilum
P. torridus
M. hungatei
P. falciparum
N. crassa
O. sativa
C. albicans
S. cerevisiae
C. elegans
G. theta
E. histolytica
D. melanogaster
H. sapiens
E I - - - - - - - - - - - - - - -
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K G G - T V A L E - - - - - - - -
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K E - - - - - - - - - - - - - - -
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Q S L E - - - - - - - - - - - - -
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N K G K P L E L Q E P I - - - - -
A A G V T L E P S T S - - - - - -
Q A G T T L E V P P C P L - - - -
K K G T A L E P I S - - - - - - -
K K G T T L E P I A - - - - - - -
R K G Q T V E P Y K N - - - - - -
S K L N N N M N V F N - - - - - -
V K G T K K V S E - - - - - - - -
F G G K T I T P V L D S Q V A K K
R R G V T I K P T V D D D - - - -
Figure 6: Alignment of e/aIF2 gamma sequences. 72 eukaryotic and 34 archaeal e/aIF2 gamma sequences were
aligned. N-terminal extensions present in eukaryotic sequences are not represented. For the sake of clarity, only some
representative sequences are shown. Residue conservations were however scored for the whole set of aligned
sequences. Strictly conserved residues (no more than two exceptions out of the 106 aligned sequences) are colored in
red. Positions with conservative replacements are in yellow. Residues strictly conserved either in eukaryotic eIF2
gamma or archaeal aIF2 gamma are in green. The numberings and the secondary structure elements of Ss-aIF2
gamma are schematized below the sequences.