Protenas

YALEYVIS BUELVAS MONTES

M.Sc
Universidad de Cartagena
AMINOCIDOS
Las diferencias entre los aminocidos estn dadas por
los grupos R o cadenas terminales.
Segn la esencialidad
20 aminocidos proteicos codificables: Clasificacin
Esenciales
No sintetizados por el hombre
obtenidos de la dieta
No Esenciales
son sintetizados por el hombre
Origen animal
Protenas de alto
valor biolgico
Origen vegetal
Protenas de bajo
valor biolgico
INCOMPLETAS
AMINOCIDOS
20 aminocidos proteicos codificables: Clasificacin
ESENCIALES
Valina
Leucina
Metionina
Treonina
Isolecina
Triptfano
Lisina
Fenilalanina
Arginina (gatos,
aves, peces)
Taurina (gato)
SEMIESENCIALES
Tirosina
Arginina
Prolina
Histidina
NO ESENCIALES
Glutamato
Glutamina
Glicina
Serina
Alanina
Aspartato
Asparagina
AMINOCIDOS
AA con cadenas hidroflicas cargadas
AMINOCIDOS
AA con cadenas polares NO cargadas
AMINOCIDOS
AA con cadenas no-polares hidrofbicas
AMINOCIDOS
1. Estereoisomera
2. Carcter cido-base
Propiedades de los aminocidos
ASIMETRA DEL CARBONO
Compuestos slidos
Incoloros
Cristalizables
Elevado punto de fusin (> 200 C)
Solubles en agua
Con actividad ptica
Con un comportamiento anftero
Grupo R
Cadena lateral
Hidrgeno
CARBONO
O QUIRAL
Grupo
amino
Grupo
carboxilo
Las estructuras de los aminocidos son pticamente activas: pueden rotar el plano de luz
polarizada en diferente direccin dependiendo del estereoismero que se trate
Los aminocidos proteicos son L-aminocidos
Levorrotatorio (L)
Rotan el plano hacia la izquierda
Dextrorrotatorio (D)
Rotan el plano hacia la derecha
Propiedades de los aminocidos
L-Alanina D-Alanina
AMINOCIDOS
AMINOCIDOS
Cdigo de tres letras y de una letra para los AA
Glicina Gly G
Alanina Ala A
Serina Ser S
Treonina Thr T
Cisteina Cys C
Valina Val V
Isoleucina Ile I
Leucina Leu L
Prolina Pro P
Fenilalanina Phe F
Tirosina Tyr Y
Metionina Met M
Triptofano Trp W
Asparagina Asn N
Glutamina Gln Q
Histidina His H
Acido asprtico Asp D
Acido glutmico Glu E
Lisina Lys K
Arginina Arg R
ESTRUCTURAS PROTEICAS
PEPTIDO
POCOS RESIDUOS DE AMINOACIDOS UNIDOS
MEDIANTE UN ENLACE PEPTIDICO
ENLACE PEPTDICO: es un enlace amida formado por la condensacin entre el grupo -
carboxlico y el grupo amino liberando una molcula de agua
4 monmeros de aminocidos
Monmero 1 Monmero 2 Monmero 3 Monmero 4
Pptido
Residuo 1 Residuo 2 Residuo 3 Residuo 4
PEPTIDOS
Amino
terminal
Carboxi
terminal
Nomenclatura
Los pptidos se nombran empezando por el extremo amino terminal que esta colocado del
lado izquierdo
aa principal grupo carboxilo
Ser-Tyr-Cys
Seril tirosil cistena
Cadenas
laterales
Esqueleto
Enlace
peptidico
Enlace
peptidico
son macromolculas formadas por cadenas lineales de aminocidos biopolmeros
estn determinadas genticamente, es decir, los genes determinan que protenas
tendr un individuo
Protenas
Funciones de la protenas
FUNCIONES DE LAS PROTENAS
Funcin Tipo de protena
Ejemplos Uso
Catlisis Enzimas
Defensa Inmunoglobulinas, Toxinas,
Antgenos de superficie
Transporte Transportadores de membrana,
transportadores circulantes
Soporte Fibras
Movimiento Msculo
Regulacin Osmtica, Gnicos, Hormonas
Almacenamiento Unin de iones
Polimerasa
Proteasas
Sintesis DNA
y RNA
Solubilidad son solubles, al incrementar el pH y/o temperatura se disminuye
la solubilidad
Especificidad cada protena tiene una funcin especfica determinada por su
estructura primaria
Efecto Tampn actan como amortiguadores de pH debido a su carcter
anftero
Propiedades de las protenas
Niveles estructurales de las protenas
Es la manera en como se organiza para adquirir cierta forma
comprende cuatro niveles de organizacin, aunque el cuarto no siempre esta presente
Estructura
Primaria
Estructura
Secundaria
Estructura
Terciaria
Estructura
Cuaternaria
Residuos de aa hlice Cadena polipeptdica Subunidades ensambladas
NIVELES ESTRUCTURALES DE LAS
PROTENAS
Existen cuatro estructuras proticas:
1. Primaria: orden de los residuos de aminocidos unidos por enlace
peptdico en la protena secuencia de aminocidos
Estructura primaria de la Lisozima:
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWES
GYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGA
VNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWV
AWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
1. Primaria: secuencia de aminocidos
ESTRUCTURAS PROTEICAS
2. Secundaria: patrones regulares repetidos en
diferentes puntos de la cadena polipeptdica
Hlices
Lminas
ESTRUCTURAS PROTEICAS
Atraccin
electrosttica
Puentes de Hidrgeno
Interaccin hidrofbica
Coordinacin con iones
metlicos
Hlice
Lmina
ESTRUCTURAS PROTEICAS
3. Terciaria: es la forma tridimensional del
polipptido completo
El determinante primario de esta estructura es la
interaccin entre los grupos R por:
Enlaces o puentes disulfuro (entre Cistenas)
Interacciones hidrofbicas
Enlaces inicos
Fuerza de Van der Waals
Puentes de H
ESTRUCTURAS PROTEICAS
ESTRUCTURA
TERCIARIA
Motivo:
combinaciones simples
de algunos elementos
de estructura
secundaria
(SCOP: Structural
Classification Of
Protein)
Dominio formada
por varios motivos,
que tiene un
plegamiento propio e
independiente
3. Terciaria: es la
forma tridimensional
del polipptido
completo
Interacciones no-covalentes entre Protenas y otras Molculas
UNIONES NO COVALENTES
ENTRE PROTENAS Y OTRAS
MOLECULAS
A travs de grupos R
Estructura terciaria de algunas protenas
Citocromo c
Lisozima Ribonucleasa
4. Cuaternarias: es la estructura final de la proteina,
dada por la asociacin de los diferentes polipptidos
ESTRUCTURAS PROTEICAS
Hemoglobina
4. Cuaternarias
ESTRUCTURAS PROTEICAS
Se puede predecir la
configuracin de una proteina a
partir de la secuencia?
SI!
NO!
Pero...
Antes: muy difcil
Ahora: en una semana se publican unas
cuantas estructuras terciarias de
protenas. Por:
Biotecnologa ha permitido purificar
protenas a mayor escala
Avances computacionales para el anlisis
de datos atmicos = BIOINFORMTICA,
PROTEMICA
PDB = Protein Data Bank http://www.rcsb.org/pdb/
30263 modelos
Proceso mediante el cual las protenas pierden sus estructuras menos la primaria
pierde solubilidad en el agua y precipita
se produce por
cambios de temperatura
variaciones de pH
sales de metales pesados
radiacin UV
rayos X
En algunos casos, las protenas desnaturalizadas pueden volver a su estado original a travs de
un proceso llamado renaturalizacin
Desnaturalizacin
Denaturacin es la Prdida de la Estructura Terciaria y la Funcin de una Protena
DENATURACIN
Protenas a veces se unen a los ligandos
equivocados (vaca loca)
Denaturadas
Recin sintetizada y no plegada correctamente
Cmo lo evita la clula?
Chaperoninas (o chaperonas) son proteinas
especializadas que evitan que esto ocurra.
Unas ayudan al proceso de plegamiento
Otras evitan plegamiento hasta el momento adecuado
Chaperonas: Protegen a las Protenas de Plegarse Inapropiadamente
Tratamiento Punto de clivaje
Tripsina Lys, Arg (C)
Quimotripsina Phe, Trp, Tyr (C)
Pepsina Phe, Trp, Tyr (C)
Endoproteinasa Lys C Lys (C)
Bromuro de Cianogeno Met (C)
Asp-N-Proteasa Asp, Glu (N)
Proteasas
Protenas
Holoprotenas
Heteroprotenas
Globulares Fibrilares
Fosfoprotenas
Glucoprotenas
Lipoprotenas
Nucleoprotenas
Cromoprotenas
Albuminas: salinas diluida y agua
Globulinas: Sol salinas
Globulinas: Insolubles en agua, EtOH, Sal,
sol en ac y base
Prolaminas: sol EtOH 50-80%
Segn su composicin qumica
Protenas Conjugadas
Lipoprotenas Lpidos
1
-lipoproteinas de la
sangre
Glicoprotenas Carbohidratos Inmunoglobulina G
Fosfoprotenas Grupos fosfatos Casena de la leche
Hemoprotenas Grupo hemo (Fe porfitrinas) Hemoglobina
Flavoproteinas Nucleotidos de flavina Succinato dehidrogenasa
Metaloproteinas Hierro Ferritina
Zinc Alcohol deshidrogenasa
Calcio Calmodulina
Molibdeno Dinitrogenasa
Cpbre Citocromo c oxidasa
Clasificacin
Segn su forma
Fibrosas: presentan cadenas polipptidas largas y una atpica estructura secundaria
insolubles en agua y en soluciones acuosas
Queratina, Colgeno y Fibrina
Globulares: se caracterizan por doblar sus cadenas en una forma esfrica apretada o
compacta dejando grupos hidrfobos hacia adentro de la protenas y
grupos hidrfilos hacia afuera
son solubles en solventes polares como el agua
Enzimas, Anticuerpos, Hormonas, Protenas de Transporte
Mixtas: posee una parte fibrilar (en el centro de la protena) y otra parte globular (en
los extremos)
Albmina
1. Fibroso: una de las dos dimensiones en mucho mayor que la otra
forma alargada, funcin estructural
Colgeno
-Queratina del cabello
Fibroina de la seda
Subunidad fundamental es una estructura secundaria repetida
Insolubles en agua alta concentracin de residuos de aa con grupos hidrofbicos
Propiedades y estructura secundaria de las protenas fibrosas
Estructura Caracterstica Ejemplo
-hlice, entrecruzadas por puentes
disulfuro
Duras, estructuras protectoras
insolubles de flexibildad y dureza
variable
-queratina del cabello, uas
Conformaciones Suaves, filamentos flexibles,
altamente fuertes sin tensiones
Fibroina de la seda, colgeno de
tendones
- queratina
estn en cabello, uas, capa mas externa de la piel,
hacen parte de los filamentos intermediarios junto con protenas del citoesqueleto
Rico en aa hidrofobicos como Ala, Val, Leu, Ile, Met, Phe
-hlice de la queratina
Doble cadena
superenrollada
Protofilamento
Protofibrilla
32 protofibillas
Filamento
intermediario
Colgeno
estn en tejido conectivo de tendones, cartlagos, matriz orgnica de la huesos y cornea de los ojos
es la nica con estructura secundaria distinta a -hlice
3 aa por vuelta en 5.2 cadenas 3 cadenas
35%Gly, 11%Ala, 21%Pro e OH-Pro
Gly-X-Pro Gly-X-OHPro
Enfermedades del Colgeno
Escorbuto fragilidad capilar, hemorragias, lesiones cutneas, dficit de vitamina C
Sndrome de Osteognesis imperfecta mutacin de Gly 988/Cys en el colgeno tipi I, huesos
quebradizos, deformaciones en el esqueleto (nios de cristal)
Sndrome de Ehler_Danlos piel hiper-extensible, exceso de movilidad en las articulaciones, rotura
de arterias y vejiga
Latirismo inhibicin de la lisis oxidasa, deformacin de columna vertebral, desmineralizacin de
huesos, hemorragias articulares
Fibroina de la seda
producida por insectos y araas
conformaciones Ala, Gly
2. Globular: no hay predominio de dimensin entre las cadenas polipeptdicas
se suceden estructuras secundarias al azar
forma esferoidal
Diversidad de estructuras determinan diversidad en sus funciones
enzimas, protenas transportadoras, reguladoras, motoras, inmunoglobulinas, etc.
Forma globular nativa
Hlice
Conformacin
Mioglobina
primera en determinar su estructura terciaria por estudios con Rayos X
protena que transporta oxigeno en los msculos
almacena oxigeno y facilita su difusin durante la contraccin muscular
una cadena de 153 aa y una protoporfirina de hierro (grupo hemo)
Grupo Hemo
His
Fe
+3
No activa
no transporta oxigeno
Fe
+2
activa
transporta oxigeno
Hemoglobina
primera protena oligomrica con estructura cuaternaria
4 polipptidos y cuatro grupos hemo
Parte proteca: globina 2 cadenas (141 residuos)
2 cadenas (146 residuos)
Dmero de -protmeros como tetrmero
Deoxyhemoglobina hemoglobina sin molculas de oxigeno unidas al grupo hemo
Protenas con similaridad en la secuencia primaria de residuos de aa
y/o
similar estructura y funcin
ESTAN EN LA MISMA FAMILIA PROTEICA