Sady Garca B. Departamento Acadmico de Suelos AG 2003 Microbiologa del Suelo Fuentes de carbono del suelo en relacin a las reservas atmosfricas y flujos anuales Carbono (Pg) Fuente Materia orgnica del suelo 1200 a 1600 Biomasa viva 420 a 830 C-CO 2 en la atmsfera 740 Flujo anual Produccin primaria neta (fotosntesis neta + respiracin de las plantas) 40 a 80 Respiracin terrestre del suelo (liberacin de C-CO 2 a la atmsfera) 50 a 70 Pg = 10 15 g. Definicin La materia orgnica del suelo corresponde a la fraccin orgnica no viviente del suelo, es decir a la suma de sustancias que contienen carbono orgnico. La MOS se integra de manera exclusiva por residuos de plantas y animales no totalmente descompuestos, adems de restos de microorganismos y sustancias que estos producen en su actividad en el suelo. Consiste de sustancias hmicas y no hmicas. Clasificacin de los compuestos orgnicos del suelo Compuestos organicos del suelo Organismos vivos (Edafon) Materia organica del suelo Materiales no alterados Sustancias no humicas Sustancias humicas Compuestos transformados (Humus) El humus del suelo El material orgnico denominado humus del suelo es una mezcla heterognea de compuestos orgnicos complejos. Estos compuestos se forman por la alteracin bioqumica de restos vegetales, pero tambin de animales y microorganismos del suelo. En el humus ocurren dos procesos: descomposicin y sntesis. Fracciones del humus del suelo El humus del suelo se compone de dos tipos de sustancias: Sustancias no hmicas. Sustancias hmicas. Sustancias no hmicas Las sustancias no hmicas corresponden restos de animales, plantas y microorganismos no alterados bioqumicamente. Incluyen compuestos que pertenecen a clases bioqumicas conocidas (ej: carbohidratos, aminocidos, protenas, lignina, grasas, ceras, resinas, cidos orgnicos, etc.). En esta fraccin no se puede reconocer la forma de los organismos originales, pues se ha integrado al suelo. Representa entre 20 30% de la materia orgnica de los suelos. Carbohidratos Constituyen entre 5 a 25% de la materia orgnica del suelo. Los restos de plantas contribuyen con azucares simples, hemicelulosa, celulosa. Algunas formas son fcilmente degradadas. Se clasifican en: Monosacridos (azucares simples). Oligosacridos (de 2 a 8 monmeros). Polisacridos (mas de 8 monmeros). Monosacridos Oligosacridos Almidn Constituye un polisacrido de reserva de las plantas. Sirve como producto para el almacn de energa en granos de cereal (semillas), tallos, races, rizomas y tubrculos. Es un polmero lineal o ramificado de la glucosa. Presenta dos sub-unidades: Amilosa (cadena lineal 1-4) de 200 2500 unidades de glucosa y 1000,000 d de peso Amilopectina (cadena con ramificacin 1-6 cada 15 25 unidades) y 200 millones d. Sub-unidades del almidn Celulosa Constituye un polisacrido estructural de los tejidos vegetales. Esta presente en las paredes celulares y en los tejidos de sostn mecnico de las plantas. Es un polmero lineal de la celobiosa. La celobiosa esta constituida por dos unidades de glucosa unidas por enlace 1-4. Las cadenas estn formadas por 7000 15000 unidades de glucosa y no se ramifican. Celobiosa Celulosa Hemicelulosas Son heteropolisacridos estructural de los tejidos vegetales. Generalmente acompaa a la celulosa. Ademas de glucosa, presenta xilosa, manosa, galactosa, rhamnosa y arabinosa. La xilosa es el monmero mas abundante. Pueden presentarse cidos manurnico y galacturnico. Todos unidos por enlace 1-4. Las cadenas presentan de 700 3000 unidades de azcar y pueden ramificarse. Hemicelulosa Sustancias pcticas Componentes importantes de las paredes celulares de las plantas. La pectina esta compuesta de cadenas de cido galacturnico a menudo esterificadas con un grupo metil (cido metilgalacturnico) Ocurren principalmente en la lamina media, donde cementan las paredes celulares. Su peso molecular se estima en 40000 d. La invasin de races por Rhizobium y micorrizas se asocia a su degradacin. cidos urnicos Azcares aminados Constituyentes de paredes celulares de bacterias y hongos. Presentes tambin en exoesqueletos de insectos y artrpodos en el suelo. La glucosamina y galactosamina pueden formar polimeros de alto peso molecular como el peptidoglicano y la quitina. Azcares aminados Contribucin del los tipos individuales de azucares a la materia orgnica del suelo Azcar % de la materia orgnica Azcares aminados 2 6 cidos urnicos 1 5 Hexosas 4 12 Pentosas < 5 Celulosa Hasta 15 Otros Trazas Lignina Es el tercer componente mas comn en los residuos vegetales, especialmente leosos. Es componente de las paredes celulares. Su contenido varia con la edad y parte de la planta. La lignina esta compuesta de unidades de fenilpropeno que contienen un anillo bencnico (6C) y una cadena lineal (3C). 500 a 600 unidades condensadas al azar y con enlaces cruzados. Ejemplos de unidades de fenilpropeno que son los bloques bsicos de la lignina CH CH OH CH 2 OH Alcohol cumarilico CH CH OH CH 2 OH Alcohol coniferilico OCH 3 CH CH OH CH 2 OH Alcohol sinapilico OCH 3 CH 3 O Estructura de la lignina Aminocidos, pptidos y protenas Los aminocidos son compuestos simples que contienen carbono y nitrgeno. Los -aminocidos pueden formar cadenas cortas (pptidos) y muy largas (protenas) Las protenas son molculas de gran importancia en la clula. Pueden participar en reacciones enzimticas (protenas solubles) o formar membranas (protenas estructurales). Aminocidos y pptidos Estructura de las protenas Lpidos Los lpidos son un grupo variado de compuestos que incluyen desde molculas simples hasta complejas. Los cidos grasos constituyen las molculas simples. Esteroles, terpenos, hidrocarburos polinucleares, clorofila, grasas, ceras y resinas son molculas pesadas. Representan de 2 a 6% del humus del suelo. Fosfolpidos Otros lpidos en el suelo cidos nucleicos Los cidos nucleicos son el almacn de informacin gentica de las clulas, provienen de las plantas, animales y microorganismos del suelo. Los cidos nucleicos constituyen molculas muy complejas y de alto peso molecular, por ello suelen ser estables en el suelo. Representan menos de 1% del humus del suelo. N N NH N NH 2 N NH NH N NH 2 O N NH NH 2 O NH NH O O C H 3 BASES NITROGENADAS PURINICAS PIRIMIDINICAS ADENINA GUANINA CITOSINA TIMINA NH NH O O URACILO ADN Componentes de los residuos de las plantas Muestra Porcentaje del peso seco Protena Hemicelulosa Celulosa Lignina Alfalfa (tallos) 15 18 8 11 13 33 6 16 Ryegrass (maduro) 12 20 16 23 19 26 4 6 Leucaena 22 14 21 13 Trigo (paja) 3 21 26 27 33 18 21 Abedul (madera) 0.6 1 27 40 45 51 18 21 Pino (aserrn) 0.5 1 24 30 42 49 25 30 Acioa 10 2.2 30 48 Fuente: Haider (1992) y Tian et al. (1992) Composicin de las paredes celulares de dos hongos del suelo Porcentaje del peso seco de la pared Aspergillus nidulans Phytophthora heveae Polmeros (13)-glucano 22 --- (13)-glucano 21 54 Quitina 19.1 --- Celulosa --- 36 Protena 10.5 4.6 6.7 Monmeros Glucosa 53 85 90 Galactosa 2.7 0.5 1.0 Manosa 2.0 0.5 1.0 Glucosamina 19.1 2.3 Lpidos 4.6 2.5 Actividad de descomposicin de los microorganismos Las condiciones que favorecen la rpida descomposicin de los residuos vegetales y la multiplicacin de los microorganismos incluyen: Residuos vegetales con bajo contenido de lignina y tamao de partcula pequeo. Adecuado nitrgeno disponible o residuo con baja relacin C/N. pH del suelo cercano a neutro para permitir diversas poblaciones microbianas activas. Adecuada humedad y aireacin del suelo, y Temperatura clida del suelo con ptimo de 30 a 45 C. Efecto de la celulosa y del nitrgeno sobre la poblacin microbiana del suelo Suelo Tratamientos N x 10 3 /g de suelo Hongos Bacterias Actinomicetos Sin encalado Ninguno 115.7 3900 1260 (pH 5.1) NO 3 - (0.1%) 115.7 3900 1260 Celulosa (1%) 160.0 3600 600 Celulosa + NO 3 - 4800.0 2480 400 Encalado Ninguno 25.4 7700 2760 (pH 6.5) NO 3 - (0.1%) 25.4 7700 2760 Celulosa (1%) 47.0 17400 2200 Celulosa + NO 3 - 290.0 47000 3200 Fuente: Alexander (1980) Tasa de descomposicin de los compuestos orgnicos del suelo Los compuestos orgnicos varan ampliamente en su tasa de descomposicin. La siguiente lista es propuesta: 1. Azucares, almidn y aminocidos (rpida) 2. Protenas simples (solubles) 3. Protenas estructurales. 4. Hemicelulosa 5. Celulosa 6. Grasas, ceras, etc. 7. Lignina. (lenta) Algunos gneros de microorganismos capaces de descomponer celulosa Hongos Bacterias Actinomicetos Alternaria Polyporus Achromobacter Clostridium Micromonospora Aspergillus Rhizoctonia Angiococcus Cytophaga Nocardia Chaetomiun Rhizopus Bacillus Polyangium Streptomyces Coprinus Trametes Cellfacicula Pseudomonas Streptosporangium Fomes Trichoderma Cellulomonas Sorangium Fusarium Trichothecium Cellvibrio Sporocytophaga Mycrothecium Verticillium Vibrio Penicillium Zygorhynchus Fuente: Alexander (1980) Algunos gneros de hongos con capacidad de descomponer lignina Agaricus Clavaria Armillaria Porta Coprinus Clitocybe Cortinellus Collybia Fomes Nycena Ganoderma Marasmius Sustancias hmicas Las sustancias hmicas son una serie de sustancias pardas a negras de peso molecular relativamente alto formadas por reacciones secundarias de sntesis. Se forman de manera exclusiva en el suelo y en algunos ambientes similares (compost). Representa 60 80% de la materia orgnica de los suelos. Fracciones hmicas del suelo Acido flvico: material amarillo que permanece en solucin despus de removerlo del acido hmico por acidificacin a pH 2. Acido hmico: material pardo oscuro a negro que puede ser extrado del suelo por varios reactivos (ej: lcali diluido tal como NaOH 0.5M) y que es precipitado por acidificacin a pH 1 a 2. Humina: fraccin de la materia orgnica del suelo que no puede ser extrada del suelo con lcali diluido. Estructura del cido flvico Estructura del cido hmico Anlisis elemental y funcional de los cidos flvico y hmico Muestra Anlisis elemental (%) C H N S O Ceniza cido flvico 49.5 4.5 0.8 0.3 44.9 2.4 cido hmico 56.4 5.5 4.1 1.1 32.9 0.9 Muestra Anlisis funcional (meq g -1 ) OCH 3 COOH OH fenolico Acidez total cido flvico 0.5 9.1 3.3 12.4 cido hmico 1.0 4.5 2.1 6.6 Fuente: Haider (1992) Anlisis de grupos constituyentes de los cidos flvico y hmico Muestra Grupos constituyentes (%) C carboxlico C aromtico C-O, C-N-C C aliftico Rango 12.0 14.8 11.3 17.7 47.3 51.9 21.3 24.6 Promedio 13.4 14.3 49.3 23.0 Fuente: Haider (1992) Comparacin de las propiedades qumicas de los materiales hmicos y la lignina Caracterstica Material hmico Lignina Color Negro Pardo claro Contenido de -OCH 3 (metoxilo) Bajo Alto Contenido de N 3 6% 0% Carboxilo e hidroxilo fenlico Alto Bajo Acidez intercambiable total (cmol Kg -1 ) 150 0.5 N -amino Presente 0 Contenido de vainillina <1% 15 25% Teoras de la formacin del humus del suelo Varias teoras existen para explicar la formacin del humus del suelo. Las siguientes han sido presentadas en orden ms o menos cronolgico. Teora de la alteracin vegetal o teora de la lignina-protena de Waskman La lignina es utilizada en forma incompleta por los microorganismos, y el residuo se vuelve parte del humus del suelo. La lignina es modificada por hidroxilacin y oxidacin del metoxilo (-OCH 3 ) a carboxilo (-COOH), el cual reacciona con compuestos amino para producir cidos hmicos que son oxidados a cidos flvicos. Teora de los azcares reductores (reaccin de pardeado) Azcares reductores y aminocidos son formados como productos intermedios del metabolismo microbiano y pasan por condensacin no enzimtica para producir humus. Polimerizacin de compuestos cclicos en melanina N HO CH 2 -CH-COOH NH 2 HO CH 2 -CH-COOH NH 2 N n Tirosina Oxihidroindol Indol Melanina Formacin de quinonas a partir de azucares simples C CH 3 O HC O C H 3 C O OH CH O O O O HOH H 2 H 2 HOH Triosas Condensacion -H 2 O Quinona CH Teora de las quinonas derivadas de lignina (Flaig) Los compuestos fenlicos liberados durante la descomposicin de la lignina pasan por conversin enzimtica a quinonas las cuales se condensan con compuestos amino para producir humus. Teora de la sntesis microbiana (Martin y Haider; Kononova) Polifenoles son sintetizados por hongos a partir de fuentes de carbono diferentes a la lignina, tales como celulosa. Los polifenoles son luego oxidados enzimticamente a quinonas que se condensan con compuestos amino para producir humus. Teoras de la formacin del humus del suelo El pensamiento actual es que las dos ultimas teoras, que involucran polifenoles, y posiblemente una combinacin de ambas, es correcta en suelos aerbicos. En suelos pobremente drenados donde se forma turba, la alteracin vegetal es aparentemente la ruta dominante.