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Transistores de
ADN: de cara
al futuro.
Pirosecuenciacin,
cmo funciona?
Desentraando
la hlice: Watson,
Crick y Franklin
i
Carta editorial
Recordando las palabras de Karl Popper (filsofo, socilogo y terico de la ciencia nacido en Austria y ciudadano britnico)
Lo que caracteriza al hombre de ciencia no es la posesin del conocimiento o de verdades irrefutables, sino la investigacin
desinteresada e incesante de la verdad. Presentamos un nmero especial de iBIO, como homenaje a todas aquellas personas
que dedicaron su vida a la investigacin en bsqueda de la verdad del cido desoxirribonucleico (ADN).
Como tema del mes iBIO presenta Los 60 aos del modelo de la doble hlice de Watson y Crick en el cual el M. en C.
Alfonso Vilchis Peluyera y el Dr. Vctor Valds Lpez; dos especialistas en el rea de biologa molecular, genmica evolutiva y
comparada, nos exhiben de forma inigualable, una breve historia de los hechos ms importantes que fueron determinantes
para la formulacin del modelo de la estructura del ADN que propusieron Watson y Crick en 1953 y que sigue vigente hasta
nuestros das.
Hot Science entra en el campo de la biologa sinttica con los Transistores de ADN resultado del trabajo en equipo de
bioingenieros de la Universidad de Standford.
Dentro de nuestra seccin Cmo funciona? Presentaremos, especialmente para los interesados en la tecnologa de la
secuenciacin del ADN (a gran escala), los fundamentos de la Pirosecuenciacin 454 abordando tambin los mtodos que le
antecedieron y la evolucin de los mismos.
Tendremos como Artculo del mes aquel que fue publicado hace 60 aos en Nature, que revolucion la biologa y extendi las
fronteras del conocimiento, abriendo nuevos campos y que sigue repercutiendo en nuestros das en la bsqueda constante de
posibles aplicaciones.
En Y ahora qu? Mariam Lizeth Ruiz Snchez y Pablo Eduardo Santiago Flores, estudiantes de Ingeniera Biotecnolgica, nos
platican cmo su espritu aventurero y el deseo de conocer los llevaron a Polonia y a Blgica respectivamente, conociendo en
su camino a distintas personas que les ayudaron a ampliar su manera de pensar.
Cientficos memorables presenta a tres personajes imprescindibles en esta aventura que llev al descubrimiento de la
estructura de la molcula de la vida, hablaremos de Rosalind Elsie Franklin, James Dewey Watson y Francis Harry Compton
Crick.
En Cpsulas de ciencia tenemos un poco acerca del origen de los nmeros, asimismo este artculo nos plantea la siguiente
pregunta, La matemticas se descubrieron o se inventaron?
En esta ocasin, en nuestra seccin de Arte e ingeniera, se presenta el Protocolo de Figura Latente (PFL) el cual utiliza
muestras de ADN para crear representaciones de otras imgenes prediseadas. Quieren saber de qu se trata? No dejen de
leer esta seccin.
Finalmente, la imagen del mes nos revela una nueva estructura para la molcula que tiene las instrucciones para cada clula;
una representacin del ADN con cuatro cadenas.
Agradecemos a todos nuestros colaboradores y lectores que nos han brindado su apoyo en este proyecto, el cual ha tenido
grandes alcances que sin duda alguna son fruto de la participacin de cada uno de ustedes, haciendo posible este segundo
nmero, ya que al compartir con nosotros sus artculos y sugerencias nos han abierto las puertas a nuevos conocimientos, que
representan un importante acervo cientfico para toda la comunidad.
Lilian Navarro Rojas
Abril 2013
CONTENIDO
DIRECTORIO
Director
Subdirector
CMO FUNCIONA?
07 Pirosecuenciacin GS-FLX (454)
Diseo y Maquetacin
Erick Conchucos ortiz
HOT SCIENCE
09 Transistores de ADN: de cara al futuro
Consejero Editorial
No Durn Figueroa
Y AHORA QU?
12 Movilidad.
Redactores
CIENTFICOS NOTABLES
14 Desentraando la hlice: Watson, Crick y Franklin
CPSULAS DE CIENCIA
18 Nmeros
ARTE E INGENIERA
21 Protocolo de figura latente
Corrector
AGENDA
24 Mayo 2013.
01
Flix Hoppe-Seyler.
02
ADN y no protena.
[El principio
transformante capaz de
modificar las caractersticas
genticas de bacterias, era
ADN y no protena.]
03
X.
modelo.
complementarias
04
antiparale-
la incorporacin y multiplicacin
gentico.
macionales de la filogenia y de la
el aislamiento, la identificacin y
ontogenia.
la amplificacin de secuencias de
ADN.
la informacin contenida en el
05
el plsmido lo introducen en la
ao 2001.
po de la biologa despus de la
nuestro genoma.
06
CMO FUNCIONA?
Pirosecuenciacin
GS-FLX (454)
Reaccin de Pirosecuenciacin.
HGP.
eficientes y baratos.
alternativa
pirosecuenciacin.
secuenciacin
desarrollada
conocida
como
La Secuenciacin 454
involucra 3 pasos principales:
Generacin de la librera de
componentes radioactivos.
muestras.
investigaciones
requeran
de adaptadores, posteriormente se
secuenciacin se promovi la
mejora
las
mediante
de
de
que
estos
la
mtodos,
implementacin
didesoxinucletidos
con
cuales
son
transferidas
datos
profundidad
son
analizados
con
herramientas
dentro
generacin,
de
esta
disminuyendo
funcionarn
como
la
secuenciacin
de
una
perlas
por
Las
07
nicas
de
ADN
PCR en emulsin
Pacific
Biosciences
desarrollado
capaz
una
ha
tecnologa
de
leer
hasta
1000
nucletidos
de
golpe,
todo
Polimerasa
Molde
invertidos en el HGP.
Sin duda alguna los mtodos de
secuenciacin
han
permitido
PPi y APS
Luciferasa
transcriptmica,
ATP
ATP sulfurilasa
Luz
Venter JC, Adams MD, Myers EW, Li PW, Mural RJ, et al. (2001). The sequence of the human genome.Science 291:130451
National Human Genome Research Institute (2010)The Human Genome Project Completion, consultado el jueves 18 de abril, http://www.genome.gov/11006943
Sanger, F., Nicklen S., Coulson, AR. (1977) DNA sequencing with chain-terminating inhibitors. Proc Natl. Acad. Sci. USA, 74: 5463-5467
Mardis Elaine R. (2008) (Departments of Genetics and Molecular Microbiology and Genome Sequencing Center,Washington University School of
Medicine) Next-Generation DNA Sequencing Methods Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 9:387402
Roche Diagnostics Corporation. (s.f.). 454 Sequencing: The technology. Recuperado el 16 de Abril de 2013, de http://454.com/products/technology.asp
08
HOT SCIENCE
09
comparadas
protena.
un equipo de bioingenieros de la
con
las
de
un
reacciones.
industria: el Transcriptor.
El objetivo no es sustituir a
los
la
simplemente
Qu aplicaciones
surgir?
pueden
Lu,
Se
caractersticas biolgicas.
alcanzadas
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extremadamente
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Grupo
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velocidades
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Seal
control 1
Seal
control 2
Integrasa A
Integrasa B
interruptor de encendido-apagado,
con el Transcriptor se controla
el flujo de la ARN polimerasa
mientras viaja a lo largo de una
cadena de ADN mediante un
grupo
de
enzimas
llamadas
integrasas.
Los cientficos utilizaron en su
estudio
la
RNA
Pol
Entrada
10
bacteria
Escherichia
RNA
Pol
del
microorganismo
el
funcionamiento de un transistor
en
el
que
hebras
de
de
Massachusetts
hacer
que
abrir
convencional
no
Director
Tecnolgico
sabe
sino
computacin
frente,
ordenadores,
ADN
Salida
HOT SCIENCE
tareas como avisar al organismo
mejorarlas.
Segn
estrategias
cada clula.
construir
Departamento de Bioingeniera
Transcriptor
de la Universidad de Stanford,
biolgico
biocomputador.
An
es
necesario
agrupaciones
de
del
las
compuertas
los
investigadores,
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Los
investigadores
el almacenamiento y transferencia
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Fundacin
Townshend
bioengineering.stanford.edu.
El
departamento
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de Ingeniera y la Facultad de
Medicina.
11
Y AHORA QUE?
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Turqua, Kazajst
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Por: Mariam Lize
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12
Y AHORA QUE?
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siempre me gust la idea de
poder comunicarme en un
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extranjero, se apo deraba
cada vez ms de m.
13
CIENTFICOS MEMORABLES
Desentraando la hlice:
Watson, Crick
y Franklin.
Por: Alejandro Galindo Garca,
Erick N. Snchez Snchez
y Susan Karen Prez Salazar
la construccin de modelos.
cinco aos.
Franklin.
14
humanidad.
su
Construyeron
llamado traduccin.
investigacin.
15
CIENTFICOS MEMORABLES
thampton, Inglaterra, siendo el
concentrado ms en bioqumica
acridina.
estallido de la guerra.
una de otra.
en el Laboratorio de Investigacin
de pequeos virus.
College de Londres.
neral.
Se convirti en un estudiante de
16
de ltat en Paris
coidal.
del descubrimiento.
Referencias:
- Aydon Cyril. 2008. Scientific Curiosity:
Everything you want to know about Science. UK.
First Pulished.
- Nobelprize.org : The official web site of the nobel
prize. (s.f.). Recuperado el 20 de Abril de 2013, de
Official web site of the Nobel Prize: http://www.
nobelprize.org/nobel_organizations/nobelmedia/
nobelprize_org/
- Medicine, N. L. (Septiembre de 1998). Profiles in
Science: The Rosalind Franklin Papers. Recuperado
el 15 de Marzo de 2013, de National Library of
Medicine: http://profiles.nlm.nih.gov/ps/retrieve/
Narrative/KR/p-nid/287
17
CPSULAS DE CIENCIA
nmero dos debi haber existido un
proceso ms complejo para entender
las manifestaciones como los contrastes y las correspondencias, existiendo
Por: Luis Yair Martnez Crdoba
Lord Kelvin
especfico.
les.
formando conjuntos.
18
Nmeros.
muchos, cifra usada en cantidades de
idiosincrasias.
19
CPSULAS DE CIENCIA
fuera para regresar al nido. Un da,
no independiente de la experiencia,
realidad fsica?
rostro humano.
generarn complejidad.
Texto recomendado:
20
ARTE E INGENIERA
Protocolo de
figura latente
Por: Alexis Cruz Herrera
El Protocolo de Figura Latente (PFL) toma forma mediante una
instalacin audiovisual que usa muestras de ADN para crear representaciones de imgenes prediseadas. La instalacin incluye un
experimento cientfico en vivo, resultando en una videograbacin
que muestra el proceso de formacin.
el ADN que seran hechos por cada enzima posible y simula varias
Las tcnicas utilizadas en el PFL, se fundamentan en la restriccin
21
Estructuras moleculares de
los cidos nuclicos.
Una estructura para el ADN.
ria.
fatos en el eje.
mstrong.
22
y guanina-citosina.
XX.
ntico.
la proporcin en la cantidad de
College en Londres.
Referencias:
23
AGENDA
Mayo 2013
El
Ins'tuto
Politcnico
Nacional,
la
Unidad
Profesional
Interdisciplinaria
de
Biotecnologa
y
el
Gobierno
del
Distrito
Federal
(Delegacin
Gustavo
A.
Madero).
Te
invitan
a:
La
Feria
de
la
Ciencias:
Curiosidades
cienLcas
El
evento
est
abierto
a
todo
el
publico
y
se
desarrollarn
experimentos,
conferencias
y
talleres.
El
evento
ser
en
la
explanada
de
la
cabecera
municipal
ubicada
en
5
de
Febrero,
Esq.
Vicente
Villada,
Delegacin
Gustavo
A.
Madero
TALLER
DE
AJEDREZ
HORARIO
Martes
16:00-19:00
y
Jueves
10:00-13:00
(TALLER
En
Tutoras)
DE AJEDREZ
nete
al
grupo
de
Facebook
Chessupibios
Horario:
Informes
roslia_g@hotmail.com
Martes 16:00-19:00
y
Jueves 10:00-13:00
En Tutoras
nete al grupo de Facebook Chessupibios
Informes roslia_g@hotmail.com
24
25
SEIBT | Ao 1 | Nmero 2
Portada:
Escultura ADN (DNA sculpture), Museo de las
Ciencias Prncipe Felipe, Valencia, Espaa.
Arquitecto: Santaigo Calatrava, 2000.