LE SYSTEME ENDOMEMBRANAIRE DES CELLULES EUCARYOTES LE SYSTEME ENDOMEMBRANAIRE DES CELLULES EUCARYOTES LE SYSTEME ENDOMEMBRANAIRE DES CELLULES EUCARYOTES

LE SYSTEME ENDOMEMBRANAIRE DES CELLULES EUCARYOTES

1. Reticulum endoplasmique (RE) 1. Reticulum endoplasmique (RE) 1. Reticulum endoplasmique (RE) 1. Reticulum endoplasmique (RE)
1.1. Structure du RE 1.1. Structure du RE 1.1. Structure du RE 1.1. Structure du RE
1.2. Organisation moleculaire du RE 1.2. Organisation moleculaire du RE 1.2. Organisation moleculaire du RE 1.2. Organisation moleculaire du RE
1.3. Fonctions du REG 1.3. Fonctions du REG 1.3. Fonctions du REG 1.3. Fonctions du REG
1.3.1. Syntheses proteiques 1.3.1. Syntheses proteiques 1.3.1. Syntheses proteiques 1.3.1. Syntheses proteiques
1.3.2. Assemblage des phospholipides 1.3.2. Assemblage des phospholipides 1.3.2. Assemblage des phospholipides 1.3.2. Assemblage des phospholipides
1.4. Fonctions du REL 1.4. Fonctions du REL 1.4. Fonctions du REL 1.4. Fonctions du REL
1.4.1. Syntheses lipidiques 1.4.1. Syntheses lipidiques 1.4.1. Syntheses lipidiques 1.4.1. Syntheses lipidiques
1.4.2. Role dans le metabolisme des glucides 1.4.2. Role dans le metabolisme des glucides 1.4.2. Role dans le metabolisme des glucides 1.4.2. Role dans le metabolisme des glucides
1.4.3. Role dans la detoxication 1.4.3. Role dans la detoxication 1.4.3. Role dans la detoxication 1.4.3. Role dans la detoxication
1.4.4. Stockage et liberation du calcium 1.4.4. Stockage et liberation du calcium 1.4.4. Stockage et liberation du calcium 1.4.4. Stockage et liberation du calcium
2. Appareil de Golgi 2. Appareil de Golgi 2. Appareil de Golgi 2. Appareil de Golgi
2.1. Structure 2.1. Structure 2.1. Structure 2.1. Structure
2.1.1. Face Cis 2.1.1. Face Cis 2.1.1. Face Cis 2.1.1. Face Cis
2.1.2. Saccules intermediaires 2.1.2. Saccules intermediaires 2.1.2. Saccules intermediaires 2.1.2. Saccules intermediaires
2.1.3. Face Trans 2.1.3. Face Trans 2.1.3. Face Trans 2.1.3. Face Trans
2.2. Fon 2.2. Fon 2.2. Fon 2.2. Fonctions ctions ctions ctions
3. Lysosomes 3. Lysosomes 3. Lysosomes 3. Lysosomes
3.1. Structure et fonctions 3.1. Structure et fonctions 3.1. Structure et fonctions 3.1. Structure et fonctions
3.2. Identification des lysosomes dans la cellule 3.2. Identification des lysosomes dans la cellule 3.2. Identification des lysosomes dans la cellule 3.2. Identification des lysosomes dans la cellule
Le systeme endomembranaire est present uniquement dans les cellules eucaryotes. Il correspond a lensemble
de compartiments intracellulaires limites par une membrane (cytomembrane) et communiquant entre eux et
avec le milieu exterieur par des echanges de vesicules Les compartiments du systeme endomembranaire
comportent des caracteristiques morphologiques et fonctionnelles qui permettent de les subdiviser en groupes
distincts:
- Le reticulum endoplasmique (RE)
- Lappareil de Golgi
- Les lysosomes
1. Reticulum endoplasmique (RE) 1. Reticulum endoplasmique (RE) 1. Reticulum endoplasmique (RE) 1. Reticulum endoplasmique (RE)
1.1. Structure du RE 1.1. Structure du RE 1.1. Structure du RE 1.1. Structure du RE
Fig. 1
Le terme reticulum signifie reseau et le terme endoplasmique signifie a linterieur du cytoplasme. Il sagit
dun ensemble de tubules et de saccules (ou citernes) formant un vaste labyrinthe membraneux. Dans certaines
cellules, le RE peut-etre tres developpe. Cest le cas des cellules exocrines du pancreas, ou il represente plus de
la moitie des membranes cellulaires.
Les cytomembranes du RE forment un feuillet continu et delimitent un compartiment interne: la lumiere du
RE. Le contenu luminal est donc isole du cytosol. Les cytomembranes du RE sont en continuite avec
lenveloppe nucleaire. Lenveloppe nucleaire nest en fait quune portion differenciee du RE dotee de pores.
Lenveloppe nucleaire est toujours lisse interieurement (vers le noyau) et porte generalement des ribosomes sur
sa face externe.
Il existe 2 types de RE:
- Granulaire ou Rugueux (REG ou RER): Recouvert de ribosomes sur la face cytosolique (dou son nom). Il
forme un reseau serre de citernes aplaties et paralleles.
- Agranulaire ou Lisse (REA ou REL): Depourvu de ribosomes. Il est generalement tubulaire.
Les 2 types de RE peuvent exister dans la meme cellule et sont bien sur en communication.
Remarque Le REG peut-etre partiellement degranule. Cet etat est transitoire et lon parle RE de transition Ex:
des cellules hepatiques en cas de jeune prolonge.
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1.2. Organisation moleculaire du RE 1.2. Organisation moleculaire du RE 1.2. Organisation moleculaire du RE 1.2. Organisation moleculaire du RE
Nous verrons que la diversite morphologique du RE est en rapport avec ses multiples fonctions.
Les cytomembranes du RE possedent moins de lipides (30%) que la membrane plasmique (60%). Elles
presentent egalement moins de cholesterol. De plus, les chaines dacides gras des phospholipides sont moins
longues, ce qui confere a ces cytomembranes une epaisseur moindre que celle de la membrane plasmique. Les
cytomembranes du RE sont riches en proteines (70%). Parmi les proteines des cytomembranes du RE on
trouve:
Les proteines de la MP, mais en proportion plus faible et souvent sous forme inachevees
Des proteines specifiques du RE: en rapport avec ses diverses fonctions.
Parmi ces proteines specifiques on trouve des enzymes:
du metabolisme des acides gras
de la synthese des phospholipides et des steroides
de la synthese des glycolipides et des glycoproteines
Les cavites du RE sont comparables a une solution aqueuse de proteines de composition variable en fonction
du type cellulaire. Exemples: - Zymogene dans les cellules acineuses du pancreas exocrine
- Procollagene dans les fibroblastes
- Immunoglobulines dans les plasmocytes
1.3. Fonctions du REG 1.3. Fonctions du REG 1.3. Fonctions du REG 1.3. Fonctions du REG
Le REG intervient dans les syntheses proteiques (dou la presence de ribosomes sur sa face cytosolique) et
dans lassemblage des phospholipides (grace a trois enzymes affleurant sur sa face cytosolique).
1.3.1. Syntheses proteiques 1.3.1. Syntheses proteiques 1.3.1. Syntheses proteiques 1.3.1. Syntheses proteiques
Lelaboration des proteines debute dans le cytosol (traduction). Certaines proteines restent dans le cytosol (ex:
enzymes de la glycolyse), mais dautres sont inteARNlisees pendant lelongation dans le RE. Parmi les
proteines inteARNlisees on distingue des proteines hydrophiles (qui se retrouvent dans la lumiere du RE) et
des proteines transmembranaires amphiphiles (qui seront inserees dans les cytomembranes du RE).
NB : Les mecanismes qui assurent linteARNlisation des proteines le RE ainsi que les modalites de
linteARNlisation ne seront pas abordes dans ce cours, ils sont au programme de la 2eme annee de licence.
1.3.2. Assemblage des phospholipides 1.3.2. Assemblage des phospholipides 1.3.2. Assemblage des phospholipides 1.3.2. Assemblage des phospholipides
Fig. 2. RE.
Le REG synthetise des cytomembranes: il assemble les phospholipides a partir de composants cytosoliques.
Lassemblage est realise par 3 enzymes qui affleurent sur sa face cytosolique. Lassemblage se fait donc en 3
etapes successives.
Etape 1: Une Acyl-transferase synthetise dans la monocouche externe un diacyl-glycerol-P a partir de 2 acyl-
CoA (longue chaine carbonee associee avec un coenzyme A) et dun glycerol-P.
Etape 2 : Le diacyl glycerol-P est dephosphoryle par une phosphatase.
Etape 3 : Une choline transferase permet lamarrage dune choline-P (liberee dun nucleoside diphosphate).
Dans cet exemple, le phospholipide ainsi assemble (une phosphatidyl-choline) a trois destinations possibles:
- il reste dans la monocouche externe, ou il se deplace par diffusion.
- il bascule dans la monocouche interne. Cette translocation fait intervenir une translocase (flippase).
- il est preleve par des proteines cytosoliques, qui le transportent dans une poche hydrophobe jusquaux
membranes presentant un deficit de ce phospholipide. Les membranes presentant un deficit sont generalement
celles qui ne sont pas directement alimentees par les membranes des vesicules membranaires (a savoir:
mitochondries et chloroplastes).
1.4. Fonctions du REL 1.4. Fonctions du REL 1.4. Fonctions du REL 1.4. Fonctions du REL
1.4.1. Syntheses lipidiques 1.4.1. Syntheses lipidiques 1.4.1. Syntheses lipidiques 1.4.1. Syntheses lipidiques
Les enzymes du RE jouent un role important dans la synthese des lipides (Ex: Steroides). Les cellules qui
synthetisent et secretent les hormones steroides (folliculine dans les ovaires; testosterone dans les testicules)
sont riches en REL: cette caracteristique structurale est conforme a leur fonction.
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1.4.2. Role dans le metabolisme des glucides 1.4.2. Role dans le metabolisme des glucides 1.4.2. Role dans le metabolisme des glucides 1.4.2. Role dans le metabolisme des glucides
Les cellules hepatiques stockent les glucides sous forme de glycogene (polysaccharide). Pour etre utilise par la
cellule le glycogene est hydrolyse en glucose-6- phosphate. Or, le glucose-6- phosphate est une forme ionique
(donc hydratee) ne pouvant sortir de la cellule pour entrer dans le sang. Cest une enzyme des cytomembranes
du REL qui va transformer le glucose-6- phosphate en glucose et permettre ainsi son exportation vers le sang.
Dans les cellules hepatiques, les cytomembranes du REL jouent donc un role important dans la regulation de la
glycemie.
1.4.3. Role dans la detoxication 1.4.3. Role dans la detoxication 1.4.3. Role dans la detoxication 1.4.3. Role dans la detoxication
Le REL assure la detoxification de substances exogenes toxiques telles que les pesticides, les medicaments, les
hydrocarbures aromatiques issus notamment de la combustion des cigarettes, les additifs alimentaires tels que
les colorants et les conservateurs...
Cette detoxication est realisee par des complexes multienzymatiques, comprenant notamment les enzymes des
cytochromes P450, inseres dans la membrane du REL (cas des hepatocytes). Ces enzymes sont capables de
transformer des milliers de substrats hydrophobes en derives plus hydrophiles qui seront plus facilement
excretes hors de la cellule.
Ces enzymes peuvent egalement rendre actif un medicament (apres metabolisation).
Ce systeme de detoxication a des limites et peut meme presenter un danger, puisque dans certains cas la
metabolisation dun compose inactif peut aboutir a des derives tres toxiques.
1.4.4. Stockage et liberation du calcium 1.4.4. Stockage et liberation du calcium 1.4.4. Stockage et liberation du calcium 1.4.4. Stockage et liberation du calcium
Fig. 3. RE.
Toutes les cellules renferment des vesicules ou des citernes specialisees du REL servant au stockage du
calcium. Le REL peut presenter une concentration en calcium 10 a 100 fois plus elevee que dans le cytosol. Le
stockage et la liberation du calcium font intervenir 3 types de molecules:
- une pompe a calcium qui est une ATPase calcium dependante. Elle transporte le calcium du
cytosol vers la lumiere du REL. Lenergie du transport provient de lhydrolyse de lATP en
ADP+Pi.
- des proteines contenues dans la lumiere du RE et specialisees dans la fixation du calcium (ex: la
calsequestrine que lon trouve dans le reticulum sarcoplasmique et qui joue donc un role
important lors de la contraction musculaire).
- un canal de liberation du calcium situe dans la membrane du REL.
En controlant la concentration cytosolique en calcium (par capture et liberation), le RE participe a de tres
nombreuses fonctions cellulaires telles que: la contraction musculaire, la division cellulaire, la secretion,
lendocytose, la transmission synaptique... Le calcium est alors utilise comme un veritable messager
intracellulaire.
2. Apparei 2. Apparei 2. Apparei 2. Appareil de Golgi l de Golgi l de Golgi l de Golgi
Ce composant du systeme endomembranaire fut decouvert en 1898 par Camillo Golgi. A la sortie du reticulum
endoplasmique beaucoup de vesicules de transition se dirigent vers lappareil de Golgi. Dans lappareil de
Golgi, le materiel en provenance du RE est modifie puis exporte vers dautres compartiments.
Dans la cellule animale, lappareil de Golgi est localise a proximite du noyau pres du centrosome.
2.1. Structure 2.1. Structure 2.1. Structure 2.1. Structure Fig. 1G.
Lappareil de Golgi est forme par un ensemble\ de dictyosomes. Le dictyosome est un empilement de saccules
membraneux discoidaux et aplatis. Chaque dictyosome est entoure de nombreuses vesicules. Chaque
dictyosome peut-etre subdivise en 3 compartiments: face cis, saccules intermediaires et face trans.
2.1.1. Face cis 2.1.1. Face cis 2.1.1. Face cis 2.1.1. Face cis
La face cis est habituellement convexe. Elle est situee pres du RE puisquelle recoit les vesicules de transition
issues du RE. La lame de REG dou sont issues les vesicules de transition est degranulee. Les vesicules de
transition contiennent le materiel proteique elabore dans le REG. Les vesicules de transition fusionnent avec la
cytomembrane du saccule cis golgien et dechargent leur contenu dans la lumiere du saccule.
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2.1.2. Saccules intermediai 2.1.2. Saccules intermediai 2.1.2. Saccules intermediai 2.1.2. Saccules intermediaires res res res
Le materiel luminal transite de saccule en saccule par lintermediaire des vesicules laterales. Chaque saccule
possede des enzymes particulieres qui modifient legerement la proteine issue du RE (en ajoutant generalement
des oligosaccharides).
Lappareil de Golgi affine les proteines par etapes:
- chaque saccule intermediaire correspond a une etape
- chaque etape est importante et les etapes doivent se succeder dans lordre.
2.1.3. Face trans 2.1.3. Face trans 2.1.3. Face trans 2.1.3. Face trans
La face trans est generalement concave. Elle donne naissance a des vesicules de secretions qui sacheminent
vers dautres sites. Ces jeunes grains de secretion sont appeles vacuoles de condensation
2.2. Fonctions de l 2.2. Fonctions de l 2.2. Fonctions de l 2.2. Fonctions de l appareil de Golgi appareil de Golgi appareil de Golgi appareil de Golgi
On peut comparer lappareil de Golgi a un centre daffinage, de triage, dentreposage et dexpedition. En
dautres termes on parle dadressage de tri, de concentration et dexportation des molecules. Ladressage est
une sorte detiquetage des molecules. Au niveau de chaque saccule les proteines se voient ajouter des sucres. Le
motif sucre final constitue letiquette de la proteine. En fonction de leur destinee les proteines sont etiquetees
differemment. Letiquetage permet donc de trier les molecules. Au niveau de la face trans, les molecules sont
concentrees et exportees vers dautres compartiments cellulaires. Pour lexportation, on distingue 3 voies
principales:
- la voie des secretions controlees (regulees),
- la voie des lysosomes
- la voie des secretions constitutives (ex:matrices extracellulaires) (Fig. 2G.). Le revetement
proteique (clathrine, coatomere) des vesicules secretoires est dailleurs different en fonction du type de
secretion.
3. Lysosomes 3. Lysosomes 3. Lysosomes 3. Lysosomes
3.1. Structure 3.1. Structure 3.1. Structure 3.1. Structure
Les lysosomes sont des organites en forme de sacs globuleux limites par une cytomembrane et contenant de
tres nombreuses hydrolases acides. Les lysosomes resultent de la fusion entre les prolysosomes
(=prelysosomes) porteurs dhydrolases et differentes vacuoles predigestives contenant le substrat a hydrolyser.
Les lysosomes sont le site de la digestion intracellulaire. On denombre une quarantaine dhydrolases differentes
qui assurent lhydrolyse de toutes les grandes familles de molecules. On trouve ainsi:
- des phosphatase acide
- des proteases,
- des nucleases,
- des glycosidases,
- des lipases,
- des sulfatases.
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Toutes ces enzymes ne coexistent pas dans la meme cellule: le nombre et la nature des hydrolases varient avec
le type cellulaire. Cependant, pratiquement tous les lysosomes contiennent de la phosphatase acide et cest
grace a cette enzyme que lon pourra identifier les lysosomes dans une cellule.
La membrane des lysosomes presente 3 categories importantes de proteines tres adaptees a la fonction de
lorganite (Fig. l.L.):
- des glycoproteines qui la protegent des hydrolases. Les oligosaccharides constituent un ecran de
protection.
- des ATPases H dependantes, qui maintiennent le pH du lysosome a 5.
- des permeases qui facilitent la diffusion des produits dhydrolyse dans le cytosol. On trouve ainsi des
permeases specifiques pour acides amines, oses, nucleosides...
3.2 Fonctions 3.2 Fonctions 3.2 Fonctions 3.2 Fonctions Fig. 2. L.
Dans la cellule animale, les lysosomes sont representes par les endolysosomes, les phagolysosomes et les
autophagolysosomes. Dans la cellule vegetale, les lysosomes sont representes par les endolysosomes, les
autophagolysosomes et par une vacuole (vacuome) comparable a un lysosome geant.
- Les endolysosomes Les endolysosomes Les endolysosomes Les endolysosomes resultent de la fusion entre endosomes (phenomene de pinocytose) et
prolysosomes.
- Les phagolysosomes Les phagolysosomes Les phagolysosomes Les phagolysosomes resultent de la fusion entre phagosomes (phenomene de phagocytose) et
prolysosomes. Les macrophages et les granulocytes sont des globules blancs specialises dans la phagocytose.
Grace aux phagolysosomes, ils assurent la defense et le nettoyage de lorganisme.
Remarque : les endolysosomes et les phagolysosomes sont des vacuoles heterophagiques (cest-a-dire a substrat
exogene). Ce type de nutrition est essentiel chez de nombreux protozoaires (ex: chez les cilies). Chez les
crustaces, certaines cellules digestives (intestin, hepatopancreas) presentent une immense vacuole qui
correspond a un endolysosome geant dans lequel est lyse et accumule le substrat intestinal avant que la cellule
neclate et ne libere le lysat dans la lumiere (Fig. 3. L.).
- Les autophagolysosomes Les autophagolysosomes Les autophagolysosomes Les autophagolysosomes resultent de la fusion entre autophagosomes et prolysosomes. Un
autophagosome est une vacuole autophagique (substrat endogene). Cest-a-dire une vacuole qui sequestre un
territoire cytoplasmique ou un organite. La vacuole autophagique se forme a partir dune lame de REL. Cette
lame de REL entoure et isole une plage cytoplasmique senile qui sera ensuite decomposee dans
lautophagolysosome.
Apres diffusion des produits de la digestion dans le cytosol, les lysosomes accumulent des dechets (corps
residuels). Ces corps residuels sont essentiellement des pigments (a cause dune absence dhydrolases
specifiques) et des membranes (a cause dune insuffisance des phospholipases). Dans quelques cas, les corps
residuels peuvent etre exocytes (ex: macrophage).
Mais le plus souvent, ils saccumulent dans les cellules et leur abondance est le signe dune senescence
cellulaire.
Le dysfonctionnement lysosomal cause des pathologies severes. Exemples: (1) Dans les macrophages, des
aiguilles de silice (cas de la silicose), des cristaux dacide urique (cas de la goutte) et des fibres damiante (cas de
lasbestose sont a lorigine de la perforation des membranes des phagolysosomes. Le cytoplasme des
macrophages est alors lyse. Les cristaux sont reabsorbes par de nouveaux macrophages et ainsi de suite
produisant des destructions importantes (ex: destruction des zones periarticulaires dans le cas de la goutte ou
des alveoles pulmonaires dans le cas de la silicose).
Il existe des maladies resultant dune surcharge lysosomale. En dautres termes par une accumulation dans le
lysosorne de substrat non lyse. Ce sont des maladies genetiques. Le probleme provient generalement dun
defaut detiquetage des hydrolases qui ne sont donc pas dirigees vers le lysosome (ex: mucolipidose).
- Le vacuome Le vacuome Le vacuome Le vacuome accumule des dechets. Dans les cellules vegetales, lexocytose est limitee aux secretions de
petits polysaccharides et de glycoproteines destines a la paroi: le stockage des dechets est donc obligatoire.
Cependant, le vacuome stocke aussi des substances de reserve et surtout de leau et des ions, permettant la
turgescence cellulaire. La turgescence donne aux vegetaux leur port aerien qui epanouit les fleurs et tend les
feuilles pour mieux les exposer au soleil. Elle aide les cellules et toute la plante dans leurs croissances pour
contrebalancer la forte resistance de la paroi. Enfin, elle permet la circulation de la seve brute qui doit remonter
des racines. Dans les graines, les vacuoles peuvent se deshydrater et stocker des substances, principalement des
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proteines, qui seront decomposees lors de la germination apres rehydratation et reactivation des hydrolases (ex:
grains daleurone).
3.3. Identification des lysosomes dans la cellule 3.3. Identification des lysosomes dans la cellule 3.3. Identification des lysosomes dans la cellule 3.3. Identification des lysosomes dans la cellule
Laspect du lysosome nest pas suffisant pour lidentifier dans la cellule. On effectue donc un test cytochimique
specifique: la detection de lactivite de la phosphatase acide (seule hydrolase presente dans tous les lysosomes).
Ce test permet de marquer les lysosomes dans les coupes. En microscopie electronique a transmission (MET)
on reperera un precipite noir (opaque aux electrons).
Le principe du test est schematise sur la figure 4.L.
Etape 1 : On fournit a la cellule un substrat phosphate (ex: glycerophosphate) pour accentuer la reaction.
Etape 2 : Le substrat est hydrolyse dans les lysosomes par la phosphatase acide (a pH5) liberant ainsi le
groupement phosphate (HPO4
2-)
Etape 3: On fournit a la cellule du nitrate de plomb. Le plomb forme des liaisons ioniques avec HPO4
2-formant
ainsi un precipite visualisable au MET.