La flora normal es el conjunto de microorganismos que se encuentran en sitios particulares del
cuerpo humano, en individuos sanos. Esta flora se asocia con el husped dentro de las categoras de simbiontes o mutualistas, que producen un beneficio al husped y comensales, que establecen una relacin neutral con el husped. Otra manera de clasificar la flora normal es en flora transitoria y la flora residente. La flora normal aparece desde el momento del nacimiento, cuando el producto de la gestacin es expuesto a la flora del canal del parto de la madre, del ambiente, y de la piel. La flora normal ejerce un efecto exclusorio, pues bloquea el establecimiento de patgenos extraos con capacidad de infectar el husped, ejemplos de esto son la flora vaginal y la intestinal. Tracto digestivo: Encontramos bacterias aerobias, protozoarios, hongos e inclusive bacterifagos. La cantidad de bacterias que se tienen normalmente en el tubo digestivo es variable. La flora transitoria del intestino engloba bacterias que en condiciones normales no pueden colonizar al tracto digestivo por la resistencia a la colonizacin del mismo. Flora habitual: Steptococcus, E.coli, Saccharomyces boulardii, Candida sp, bacteroides, Klebsiella, Candida, Sthaphylococcus aureus y epidermis. Bacteroides, y Fusobacterium, entre los bacilos Gram negativos, y especies de Peptostreptococcus, Sarcina y Veillonella entre los cocos. Los bacilos Gram positivos estn representados por especies de Bifidobacterium, Actinomyces, Bacillus, Lactobacillus y Clostridium. Klebsiella, Proteus, Enterobacter y Citrobacter. Vas respiratorias: El aparato respiratorio es dividido en dos sectores anatmicos: alto y bajo. En el sujeto normal solamente el rbol respiratorio alto (fosas nasales y faringe) presenta flora normal; los senos paranasales, odo medio, trquea, bronquios pulmonares y pleura son estriles.
A nivel de la faringe Streptococcus, en las fosas nasales se encuentran grmenes de tipo cutneo: Staphylococcus epidermidis y especies de Corynebacterium y S. aureus , tambin se pueden encontrar: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus, Lactobacillus, Propionibacterium, Corynebacterium, Moraxella, Peptoestreptococcus spp., Bifidobacterium spp. y Actinomyces spp,
Piel: La piel del ser humano es un extenso y heterogneo territorio con grandes variaciones en cuanto a estructura y condiciones ambientales, lo que determina diferencias en la densidad y composicin de la flora, segn el rea considerada. La flora basal se compone de Staphylococcus spp. en general S. epidermidis, Micrococcus spp. y Corynebacterium spp. Propionibacterium acnes es un bacilo Gram positivo anaerobio que se encuentra colonizando glndulas sebceas. La flora transitoria est integrada por S. aureus y menor cantidad de bacilos Gram negativos (Enterobacterias, Acinetobacter) en regiones como axilas, ingle y perineo. Conjuntiva: Carece de una flora basal ya que no se dan interacciones estables entre esta mucosa y los grmenes. El saco conjuntival puede contener cierta cantidad de microorganismos que proceden de la piel circundante o que provienen de contactos mano-ojo. Los grmenes que pueden encontrarse son Staphylococcus spp., Corynebacterium spp., Streptococcus hemolticos y Bacillus spp, Serratia y Pseudomonas.
Flora Vaginal: Fue una de las primeras en ser reconocida en 1892 por Dderlein quien describi el patrn normal que se observa en la mujer en edad genital activa. La composicin de la flora depende del contenido de estrgenos. Lactobacillus spp, Streptococcus spp., Enterococcus spp., pueden encontrarse en bajo nmero Actinomyces, bacilos Gram negativos anaerobios como Bacteroides y distintas especies enterobacterias. Streptococcus agalactiae (grupo B),lactobacillus, s. epidermis, propionibacterium spp.