2.1.

1 METABOLISMO DE LAS PROTEINAS

AMINOACIDOS:
Los aminocidos son sustancias compuestas por carbono, oxgeno, hidrgeno y
nitrgeno. Son compuestos cristalinos que contienen un grupo cido dbil,
carboxilo (-COOH) y un grupo bsico dbil, amina (-NH2), unido al carbono a (el
carbono a de un cido orgnico es aquel inmediato al carboxilo). Se les denomina,
por tanto, a-aminocidos y se considera que son neutros.
Los aminocidos son compuestos orgnicos que se combinan para
formar protenas. Los aminocidos y las protenas son los pilares fundamentales
de la vida.
Cuando las protenas se digieren o se descomponen, los aminocidos se acaban.
El cuerpo humano utiliza aminocidos para producir protenas con el fin de ayudar
al cuerpo a:

Descomponer los alimentos.

Crecer.
Reparar tejidos corporales.
Llevar a cabo muchas otras funciones corporales.

Los aminocidos tambin se pueden usar como una fuente de energa por parte
del cuerpo.
Son macromolculas constituidas por la polimerizacin de las unidades
estructurales bsicas denominadas aminocidos (a veces compuestos derivados
de los mismos) que se unen entre s mediante enlaces peptdicos (tipo Amida).
Dos aminocidos unidos entre s por un enlace peptdico forman un dipptido, sin
son 3 seran un tripptido y as sucesivamente. Los compuestos as formados por
menos de 100 aminocido se denominan pptidos (o polipptidos) cuando el
nmero de aminocidos es mayor de 100 el compuesto se denomina protena.
Aminocidos: son compuestos qumicos caracterizados por poseer un grupo
funcional amino (-NH2) y otro cido (-COOH) unidos a una cadena lateral (-R).
Estructura:
La estructura general de un alfa-aminocido se establece por la presencia de un
carbono central (alfa) unido a un grupo carboxilo (rojo en la figura), un grupo
amino (verde), un hidrgeno (en negro) y la cadena lateral (azul):

"R" representa la cadena lateral, especfica para cada aminocido. Tanto el

carboxilo como el amino son grupos funcionales susceptibles de ionizacin
dependiendo de los cambios de pH, por eso ningn aminocido en disolucin se
encuentra realmente en la forma representada en la figura, sino que se
encuentra ionizado.

A pH bajo (cido), los aminocidos se encuentran mayoritariamente en su

forma catinica (con carga positiva), mientras que a pH alto (bsico) se
encuentran en su forma aninica (con carga negativa). Para valores de pH
intermedios, como los propios de los medios biolgicos, los aminocidos se
encuentran habitualmente en una forma de ion dipolar o zwitterin (con un grupo
catinico y otro aninico).
Se resaltan los grupos R. El grupo R en las estructuras de los aminocidos puede
ser un tomo de hidrgeno (p. ej., en la glicina), un grupo hidrocarbonado (p. ej., el
grupo isopropilo en la valina) o un derivado hidrocarbonado (p. ej., el grupo
hidroximetilo en la serina). Derivados fosforilados, hidroxilados o de otro tipo. (El
trmino residuo indica una biomolcula pequea que se ha incorporado a una
macromolcula, p. ej., los residuos de aminocido de una protena.) Por ejemplo,
en el colgeno, la protena del tejido conjuntivo, un gran nmero de los residuos
de prolina estn hidroxilados. Muchos de los aminocidos naturales no son
aminocidos a. Entre los ejemplos ms notables se encuentra la fl-alanina,
precursor de la vitamina cido pantotnico, y el cido y-ami nobutrico (GABA), un
neurotransmisor que se encuentra en el cerebro.
Las molculas de aminocido se utilizan principalmente para la sntesis de largos
polmeros complejos denominados polipptidos. Los polipptidos cortos, con una
longitud inferior a 5O aminocidos, se denominan pptidos. A los polipptidos ms
largos se les suele denominar protenas. Los polipptidos desempean una gran
variedad de funciones en los seres vivos. Entre los ejemplos de molculas
formadas por polipptidos se encuentran las protenas de transporte, las protenas
estructurales y las enzimas.
Los aminocidos individuales estn unidos en pptidos y polipptidos mediante el
enlace peptdico, un enlace amida que se forma en una clase de reaccin de

sustitucin nuclefila con participacin de un grupo carbonilo, que se produce

entre el grupo amino de un aminocido y el grupo carboxilo de otro. El carcter
parcial de doble enlace del enlace peptdico da lugar a una disposicin en el plano
de los tomos HN-CO que da a las molculas polipeptdicas una estabilidad
suficiente en condiciones fisiolgicas. El carbono a. Aporta flexibilidad a la cadena
polipeptdica debido a la rotacin libre de los enlaces en este carbono.
La estructura tridimensional final y, como consecuencia, la funcin biolgica, de
los polipptidos se debe, en gran medida, a las interacciones entre los grupos R.
Clasificacin:
Los aminocidos se clasifican en tres grupos:

Aminocidos esenciales.
Aminocidos no esenciales.
Aminocidos condicionales.

Aminocidos esenciales:

Los aminocidos esenciales no los puede producir el cuerpo. En

consecuencia, deben provenir de los alimentos.
Los nueve aminocidos esenciales son: histidina, isoleucina, leucina, lisina,
metionina, fenilalanina, treonina, triptfano y valina.

Aminocidos no esenciales:

"No esencial" significa que nuestros cuerpos producen un aminocido, aun

cuando no lo obtengamos de los alimentos que consumimos.
Estos aminocidos abarcan: alanina, asparagina, cido asprtico y cido
glutmico.

Aminocidos condicionales:

Los aminocidos condicionales por lo regular no son esenciales, excepto en

momentos de enfermedad y estrs.
Ellos abarcan: arginina, cistena, glutamina, tirosina, glicina, ornitina, prolina
y serina.

Existen muchas formas de clasificar los aminocidos; las tres que se presentan a
continuacin son las ms comunes.
Segn las propiedades de su cadena:
Otra forma de clasificar los aminocidos de acuerdo a su cadena lateral.
Los aminocidos se clasifican habitualmente segn las propiedades de su cadena
lateral:

Neutros polares, polares o hidrfilos: serina (Ser, S), treonina (Thr, T), cistena
(Cys, C), glutamina (Gln, Q), asparagina (Asn, N), tirosina (Tyr, Y).

Neutros no polares, apolares o hidrfobos: alanina (Ala, A), valina (Val, V),
leucina (Leu, L), isoleucina (Ile, I), metionina (Met, M), prolina (Pro, P),
fenilalanina (Phe, F), triptfano (Trp, W) y glicina (Gly, G).

Con carga negativa o cidos: cido asprtico (Asp, D) y cido glutmico (Glu,
E).

Con carga positiva o bsicos: lisina (Lys, K), arginina (Arg, R) e histidina (His,
H).

Aromticos: fenilalanina (Phe, F), tirosina (Tyr, Y), triptfano (Trp, W) y prolina
(Pro, P) (ya incluidos en los grupos neutros polares y neutros no polares).
Segn su obtencin
A los aminocidos que deben ser captados como parte de los alimentos se los
llama esenciales; la carencia de estos aminocidos en la dieta limita el desarrollo
del organismo, ya que no es posible reponer las clulas de los tejidos que mueren
o crear tejidos nuevos, en el caso del crecimiento. Para el ser humano, los
aminocidos esenciales son:

Valina (Val, V)

Leucina (Leu, L)

Treonina (Thr, T)

Lisina (Lys, K)

Triptfano (Trp, W)

Histidina (His, H) *

Fenilalanina (Phe, F)

Isoleucina (Ile, I)

Arginina (Arg, R) *

Metionina (Met, M)

A los aminocidos que pueden sintetizarse en el propio organismo se los conoce

como no esenciales y son:

Alanina (Ala, A)

Prolina (Pro, P)

Glicina (Gly, G)

Serina (Ser, S)

Cistena (Cys, C) **

Asparagina (Asn, N)

Glutamina (Gln, Q)

Tirosina (Tyr, Y) **

cido asprtico (Asp, D)

cido glutmico (Glu, E)

Estas clasificaciones varan segn la especie e incluso, para algunos aminocidos,

segn los autores. Se han aislado cepas de bacterias con requerimientos
diferentes de cada tipo de aminocido.
Segn la ubicacin del grupo amino

Alfa-aminocidos: El grupo amino est ubicado en el carbono n. 2 de la

cadena, es decir el primer carbono a continuacin del grupo carboxilo
(histricamente este carbono se denomina carbono alfa). La mayora de las
protenas estn compuestas por residuos de alfa-aminocidos enlazados
mediante enlaces amida (enlaces peptdicos).

Beta-aminocidos: El grupo amino est ubicado en el carbono n. 3 de la

cadena, es decir en el segundo carbono a continuacin del grupo carboxilo.

Gamma-aminocidos: El grupo amino est ubicado en el carbono n. 4 de la

cadena, es decir en el tercer carbono a continuacin del grupo carboxilo.

Enlace Peptdico:
En las protenas, los aminocidos estn unidos uno seguido de otro, sin
ramificaciones, por medio del enlace peptdico, que es un enlace amido entre el
grupo -carboxilo de un aminocido y el grupo -amino del siguiente. Este enlace
se forma por la deshidratacin de los aminocidos en cuestin. Esta reaccin es
tambin una reaccin de condensacin, que es muy comn en los sistemas
vivientes:

Tres aminocidos pueden ser unidos por dos enlaces peptdicos para formar un
tripptido, de manera similar se forman los tetrapptidos, pentapptidos y dems.
Los enlaces peptdicos no se rompen con condiciones que afectan la estructura
tridimensional de las protenas como la variacin en la temperatura, la presin, el
pH o elevadas concentraciones de molculas como el SDS (dodecil sulfato de
sodio, un detergente), la urea o las sales de guanidinio. Los enlaces peptdicos
pueden romperse de manera no enzimtica, al someter simultneamente a la
protena a elevadas temperaturas y condiciones cidas extremas.

Caractersticas del enlace peptdico.

-El enlace peptdico es plano y por tanto no existe rotacin alrededor del enlace.
-El enlace peptdico posee un carcter de doble enlace, lo que significa que es
ms corto que un enlace sencillo y, por tanto, es rgido y plano
Esta caracterstica previene la libre rotacin alrededor del enlace entre el carbono
carbonlico y el Nitrgeno del enlace peptdico. Aun as, los enlaces entre los
carbonos a y los a aminos y a carboxilo, pueden rotar libremente; su nica
limitacin est dada por el tamao del grupo R. Es precisamente esta capacidad
de rotacin la que le permite a las protenas adoptar una inmensa gama de
configuraciones.
PROTEINAS:
ESTRUCTURA DE LAS PROTENAS
La organizacin de una protena viene definida por cuatro niveles estructurales
denominados: estructura primaria, estructura secundaria, estructura terciaria y
estructura cuaternaria. Cada una de estas estructuras informa de la disposicin de
la anterior en el espacio.
-Estructura primaria.
La estructura primaria es la secuencia de aminocidos de la protena. Nos indica
qu aminocidos componen la cadena polipeptdica y el orden en que dichos
aminocidos se encuentran. La funcin de una protena depende de su secuencia
y de la forma que sta adopte.

- Estructura Secundaria.
La estructura secundaria es la disposicin de la secuencia de aminocidos en el
espacio. Los aminocidos, a medida que van siendo enlazados durante la sntesis
de protenas y gracias a la capacidad de giro de sus enlaces, adquieren una
disposicin espacial estable, la estructura secundaria.
Existen dos tipos de estructura secundaria:
1. La a(alfa)-hlice
2. La conformacin beta

Esta
estructura
se
forma
al
enrollarse
helicoidalmente sobre s misma la estructura
primaria. Se debe a la formacin de enlaces de
hidrgeno entre el -C=O de un aminocido y el -NHdel cuarto aminocido que le sigue.

-Estructura terciaria.
La estructura terciaria informa sobre la disposicin de la estructura secundaria de
un polipptido al plegarse sobre s misma originando una conformacin globular.
En definitiva, es la estructura primaria la que determina cul ser la secundaria y
por tanto la terciaria.
Esta conformacin globular facilita la solubilidad en agua y as realizar funciones
de transporte, enzimticas, hormonales, etc.
Esta conformacin globular se mantiene estable gracias a la existencia de enlaces
entre los radicales R de los aminocidos. Aparecen varios tipos de enlaces:
*el puente disulfuro entre los radicales de aminocidos que tiene azufre.
* Los puentes de hidrgeno.
* Los puentes elctricos.
* Las interacciones hifrfobas.
-Estructura Cuaternaria.
Esta estructura informa de la unin, mediante enlaces dbiles (no covalentes) de
varias cadenas polipeptdicas con estructura terciaria, para formar un complejo
proteico. Cada una de estas cadenas polipeptdicas recibe el nombre de
protmero.
Clasificacin:
Las protenas se clasifican segn varios criterios:
A- Atendiendo a su composicin: pueden ser:
~ Simples: compuestas solo por aminocidos
~ Conjugadas: formadas por un componente proteico
(aminocidos) y un componente no proteico (grupo prosttico). Segn este grupo
prosttico se dividen a su vez en:
o Nucleoprotenas: formadas por la asociacin con cidos nucleicos.
o Fosfoprotenas: asociadas con fsforo.
o Cromoprotenas: tiene como grupo prosttico un colorante (Hb)
o Glucoprotenas: unidas a un compuesto hidrocarbonado.
o Lipoprotenas: unidas a lpidos en proporcin variable.
B- Segn su disposicin espacial: se clasifican en fibrosas y globulares. Las
protenas formadas por cadenas polipeptdicas paralelas a un eje y unidas por un
puente disulfuro y de hidrgeno recibe el nombre de protenas fibrosas (colgeno).

Aquellas formadas por una o ms hlices alfa enrolladas sobre s mismas sobre
una estructura compacta se denomina globulares (la mayor parte de los enzimas,
de las hormonas y de los anticuerpos).
C- Segn su funcin biolgica: se clasifican en:
~ Protena estructural: mantienen unidas las estructuras. Por ejemplo el colgeno
~ De transporte: transportan molculas o iones en el organismo. P.E.: albmina.
~ Catalizadores biolgicos: son enzimas. P.E.: catalasa, fosfato deshidrogenasa.
~ Mensajeros qumicos: hormonas como la calcetonina insulina
~ Defensa inmunolgico: son protenas que activan como anticuerpos como por
ejemplo la Ig G e Ig M.
D- Localizacin: pueden ser de 2 tipos: hsticas (tejido) y hemticas (sangre)
Sntesis Proteica:
La sntesis de protenas se lleva a cabo en dos etapas: la primera etapa
(transcripcin) ocurre dentro del ncleo de las clulas eucariotas, aqu la
secuencia se transcribe en una molcula de ARN, el cual es denominado ARN
mensajero (ARNm) y la segunda etapa (traduccin - sntesis de protena
propiamente dicha) el ARNm pasa del ncleo al citoplasma donde el mensaje es
traducido por los ribosomas que arman una protena.
Transcripcin
Para formar la cadena de ARN a partir del ADN se debe tener en cuenta que cada
nucletido del ADN se ensambla con un determinado nucletido del ARN.
La molcula helicoidal de ADN se desenrolla y deja accesible la cadena a partir de
la cual se inicia la sntesis (armado) del ARN. La enzima (polimerasa del ARN) que
controla la reaccin detecta una regin de la secuencia del ADN, llamada
promotor, que marca el punto de inicio de la sntesis. Los nucletidos se aaden
uno por uno en orden complementario, de esta manera la adenina del ADN se
combina con el uracilo del ARN (A U), en el mismo orden, la timina se ensambla
con la adenina (T A), y la citosina se combina con la guanina y viceversa (C G,
G C). Hay por lo tanto complementariedad entre el ARN y el ADN de donde se
copia. Al conservar la informacin impresa en esta parte del genoma (dotacin
gentica), el ARN se constituye en portador de las instrucciones que determinan la
secuencia de aminocidos de una protena.
Dichas instrucciones, en clave, se descifran leyendo los nucletidos de tres en tres
("tripletes"), y cada triplete de nucletido, que determina uno de los 20
aminocidos existentes, recibe el nombre de codn. Durante la traduccin, a
medida que se "leen" los codones, se van aadiendo los aminocidos
correspondientes a la protena que se est formando.

Traduccin
Queda claro que el ARNm es el que lleva la informacin que se decodificar en la
sntesis (armado) de protenas, determina el orden en que se unirn los
aminocidos. La sntesis de protenas o traduccin tiene lugar en los ribosomas
del citoplasma celular. Los aminocidos son transportados por el ARN de
transferencia (ARNt) especfico para cada uno de ellos, y son llevados hasta
ARNm, dnde se aparean el codn de ste y el anticodn del ARNt, por
complementariedad de bases, y de sta forma se sitan en la posicin que les
corresponde. Una vez finalizada la sntesis de una protena, el ARNm queda libre
y puede ser ledo de nuevo. De hecho, es muy frecuente que antes de que finalice
una protena ya est comenzando otra, con lo cual, una misma molcula de
ARNm, est siendo utilizada por varios ribosomas simultneamente, esta
estructura se conoce con el nombre de polirribosoma (polisoma).

El
trabajo
los ARNt
consiste

de
en

tomar del citosol a los aminocidos y conducirlos al ribosoma en el orden marcado

por los nucletidos del ARNm, que son los moldes del sistema. La sntesis de las
protenas comienza con la unin entre s de dos aminocidos y contina por el
agregado de nuevos aminocidos -de a uno por vez- en uno extremos de la
cadena.
Como se ha explicado, la clave de la traduccin reside en el cdigo gentico,
compuesto por combinaciones de tres nucletidos consecutivos -o tripletes- en el
ARNm. Los distintos tripletes se relacionan especficamente con tipos de
aminocidos usados en la sntesis de las protenas. Cada triplete constituye un
codn, existen en total 64 codones (cuatro nucletidos se combinan de a tres, as
que: 43 = 64), 61 de los cuales sirven para cifrar aminocidos y 3 para marcar el
cese de la traduccin.

Ciclo de la Urea
El ciclo de la urea comienza en el interior de las mitocondrias de los hepatocitos.

Reacciones:
1. El primer grupo amino que ingresa al ciclo proviene del amonaco libre
intramitocondrial. El amonaco producido en las mitocondrias, se utiliza junto con

el bicarbonato (producto de la respiracin celular), para producir carbamoil-fosfato.

Reaccin dependiente de ATP y catalizada por la carbamoil-fosfato-sintetasa I.
Enzima alostrica y modulada (+) por el N-acetilglutamato.
2. El carbamoil-fosfato cede su grupo carbamoilo a la ornitina, para formar
citrulina y liberar Pi. Reaccin catalizada por la ornitina transcarbamoilasa. La
citrulina se libera al citoplasma.
3. El segundo grupo amino procedente del aspartato (producido en la mitocondria
por transaminacin y posteriormente exportado al citosol) se condensa con la
citrulina para formar argininosuccinato. Reaccin catalizada por la
argininosuccinato sintetasa citoplasmtica. Enzima que necesita ATP y produce
como intermediario de la reaccin citrulil-AMP.
4. El argininosuccinato se hidroliza por la arginino succinato liasa, para formar
arginina libre y fumarato.
5. El fumarato ingresa en el ciclo de Krebs y la arginina libre se hidroliza en el
citoplasma, por la arginasa citoplasmtica para formar urea y ornitina.
6. La ornitina puede ser transportada a la mitocondria para iniciar otra vuelta del
ciclo de la urea.
En resumen, el ciclo de la urea consta de dos reacciones mitocondriales y cuatro
citoplasmticas

El ciclo de la urea rene dos grupos amino y un bicarbonato, para formar una
molcula de urea:

1. La sntesis de la urea requiere 4 Pi de alta energa. 2 ATP para formar el

carbamoil - P y un ATP para producir argininosuccinato. En la segunda reaccin el
ATP se hidroliza a AMP y PPi, que puede ser nuevamente hidrolizado para dar 2
Pi.
2. Se ha calculado que los animales ureotlicos pierden cerca del 15% de la
energa procedente de los aminocidos en la produccin de urea.
3. Algunos animales compensan est perdida (bovinos) por transferencia de la
urea al rumen, donde los microorganismos la utilizan como fuente de amonaco

para la sntesis de aminocidos. Este proceso incluso disminuye el consumo de

agua.
La conexin entre ambos ciclos, de la urea y de los cidos tricarboxlicos, reducen
el coste energtico de la sntesis de urea. El ciclo de la urea conlleva la conversin
de oxalacetato en fumarato y la posterior conversin del fumarato hasta
oxalacetato producir un NADH, que podr generar 3 ATP en la respiracin
mitocondrial, lo que reduce el coste de la sntesis de urea.
Funcin:
Las protenas o prtidos2 son
de aminocidos.

molculas

formadas

por

cadenas

lineales

Por sus propiedades fsico-qumicas, las protenas se pueden clasificar en

protenas simples (holoproteidos), formadas solo poraminocidos o sus derivados;
protenas conjugadas (heteroproteidos), formadas por aminocidos acompaados
de sustancias diversas, y protenas derivadas, sustancias formadas
por desnaturalizacin y desdoblamiento de las anteriores. Las protenas son
necesarias para la vida, sobre todo por su funcin plstica (constituyen el 80 %
del protoplasma deshidratado de toda clula), pero tambin por sus
funciones biorreguladoras (forman parte de las enzimas) y de defensa
(los anticuerpos son protenas).
Las protenas ocupan un lugar de mxima importancia entre las molculas
constituyentes de los seres vivos (biomolculas). Prcticamente todos los
procesos biolgicos dependen de la presencia o la actividad de este tipo de
molculas. Bastan algunos ejemplos para dar idea de la variedad y trascendencia
de las funciones que desempean. Son protenas:
-Casi todas las enzimas, catalizadores de reacciones qumicas en organismos
vivientes;
-Muchas hormonas, reguladores de actividades celulares;
-La hemoglobina y otras molculas con funciones de transporte en la sangre;
-Los anticuerpos, encargados de acciones de defensa natural contra infecciones o
agentes patgenos;
-Los receptores de las clulas, a los cuales se fijan molculas capaces de
desencadenar una respuesta determinada;
-La actina y la miosina, responsables finales del acortamiento del msculo durante
la contraccin;
-El colgeno, integrante de fibras altamente resistentes en tejidos de sostn.
Funciones de reserva. Como la ovoalbmina en el huevo, o la casena de la leche.
Todas las protenas realizan elementales funciones para la vida celular, pero
adems cada una de stas cuenta con una funcin ms especfica de cara a
nuestro organismo.
Debido a sus funciones, se pueden clasificar en:

1. Catlisis: Est formado por enzimas proteicas que se encargan de realizar

reacciones qumicas de una manera ms rpida y eficiente. Procesos que resultan
de suma importancia para el organismo. Por ejemplo la pepsina, sta enzima se
encuentra en el sistema digestivo y se encarga de degradar los alimentos.
2. Reguladoras: Las hormonas son un tipo de protenas las cuales ayudan a que
exista un equilibrio entre las funciones que realiza el cuerpo. Tal es el caso de la
insulina que se encarga de regular la glucosa que se encuentra en la sangre.
3. Estructural: Este tipo de protenas tienen la funcin de dar resistencia y
elasticidad que permite formar tejidos as como la de dar soporte a otras
estructuras. Este es el caso de la tubulina que se encuentra en el citoesqueleto.
4. Defensiva: Son las encargadas de defender al organismo. Glicoprotenas que
se encargan de producir inmunoglobulinas que defienden al organismo contra
cuerpos extraos, o la queratina que protege la piel, as como el fibringeno y
protrombina que forman cogulos.
5. Transporte: La funcin de estas protenas es llevar sustancias a travs del
organismo a donde sean requeridas. Protenas como la hemoglobina que lleva el
oxgeno por medio de la sangre.
6. Receptoras: Este tipo de protenas se encuentran en la membrana celular y
llevan a cabo la funcin de recibir seales para que la clula pueda realizar su
funcin, como acetilcolina que recibe seales para producir la contraccin.

Tipos

Ejemplos

Localizacin o funcin

Enzimas

cido-graso-sintetosa Cataliza la sntesis de cidos grasos.

Reserva

Ovoalbmina

Clara de huevo.

Transportadoras

Hemoglobina

Transporta el oxgeno en la sangre.

Protectoras en la sangre Anticuerpos

Bloquean a sustancias extraas.

Hormonas

Insulina

Regula el metabolismo de la glucosa.

Estructurales

Colgeno

Tendones, cartlagos, pelos.

Contrctiles

Miosina

Constituyente de las fibras musculares