Gentica bacteriana.

Variabilidad bacteriana.
Las bacterias tienen que mantener una cierta estabilidad gentica que les
permita seguir funcionando igual que sus progenitores pero tambin tienen
que tener capacidad de cambio para adaptarse al medio. Estas variaciones
pueden afectar al genotipo y al fenotipo (modificaciones), que resultado de
la interaccin del genotipo con el ambiente.
Variaciones genotpicas. Son de aparicin lenta, dominan a la
poblacin lentamente y son irreversibles.
Variaciones fenotpicas/ modificaciones. Son de aparicin brusca.
Cambian las condiciones del entorno y las bacterias adquieren/
pierden alguna caracterstica. Es reversible. Ej: opern lactosa: si
hay lactosa la bacteria produce la maquinaria enzimtica necesaria
para su utilizacin y si no, no.
En caso de las genotpicas, segn la manera en la que la estructura del ADN
sea modificada distinguimos:
Mutaciones: alteracin de la secuencia de bases por errores en la
replicacin.
Recombinacin: intercambio de informacin gentica entre dos
individuos.
Reordenacin: Cambio de lugar de una secuencia de bases.
En las fenotpicas tenemos:
Regulacin alostrica.
Regulacin de la expresin gentica.
Variacin de fases.
Tipos de mutaciones.
La frecuencia de mutaciones es de 10-7-10-10. Existen unas sustancias
denominadas mutgenos que elevan la frecuencia de mutacin.
La alteracin de las bases del ADN como tal no tiene repercusin en el
exterior de la bacteria, sino que lo que hace es provocar un cambio en la
secuencia de aa de una protena que produce una prdida/ganancia de
funcin.
Como el genoma es degenerado, una mutacin puede provocar un codn que
sigue codificando para el mismo aa. Hablamos entonces de mutaciones
silentes, ya que fenotpicamente la bacteria es idntica.
Mutaciones neutras. El cambio de base produce el cambio de un aa por otro
de funcin parecida por lo que, aunque la protena es distinta, la funcin no
se ve alterada
Mutaciones expresadas. El cambio de nucletido produce un cambio de aa
pero la estructura de la protena cambia de tal manera que altera su
funcin. Pueden ser:

No selectivas. Afectan a caractersticas poco importantes, de poco

inters evolutivo.
Selectivas. Permiten su seleccin. Ej: resistencia a antibiticos.
Letales. Impiden el funcionamiento de la bacteria y causan su
muerte.
- No condicionales. Son indetectables porque si se producen la
bacteria no se puede dividir y muere. La poblacin mutada no
existe porque es inviable.
- Condicionales. Slo son letales en determinadas condiciones.
Ej: disminucin de la t mx: la mutacin slo es letal cuando
aumenta demasiado la t.
Cmo son esas alteraciones en el ADN?
Puntuales: una base por otra.
- Transicin (prica por prica, pirimidnica por piridnica).
- Transversin (prica por pirimidnica o viceversa)
Deleiciones: prdida de segmentos de ADN por error en la
replicacin.
Inserciones: ganancia en un determinado punto de un segmento de
ADN que no exista. Se deben a la existencia de unos elementos
genticos: secuencias de insercin, que son secuencias cortas de
nucletidos capaces de salir de un sitio del genoma y ponerse en
otro.
En las puntuales las mutaciones ms importantes son las que generan un
codn sin sentido, ya que se reducira la protena y difcilmente cumplira su
funcin.
En deleiciones e inserciones si el fragmento es muy grande las
consecuencias son graves pero y si el fragmento es pequeo? Por ej. 1, 2,
6 nucletidos. Con 6 nucletidos se cambian 2 codones pero se mantiene el
patrn de lectura, mientras que si se afectan 1 o 2 se pierde el patrn de
lectura. En este caso, cuanto ms cerca est la mutacin del promotor, ms
grave ser la mutacin porque afectar a ms protenas.
Secuencias de insercin.
Son fragmentos de ADN que codifican exclusivamente 2 actividades
enzimticas:
- Transposa: lleva el fragmento de un sitio a otro.
- Resolvasa: define qu tiene que insertar. Cmo lo hace? cmo
funciona? Las secuencias de insercin estn flanqueadas por
dos secuencias repetidas y lo que hace la resolvasa es
reconocerlas y cortarlas.

Mecanismos bacterianos de antimutacin.

Afectan sobre todo a las mutaciones puntuales.
Reversin espontnea.
Directa o retroceso: una segunda mutacin revierte la mutacin
inicial.
Supresora: una mutacin en un gen distinto al de la primera, inhibe
su efecto.
Reparacin del ADN. Permite recuperar la secuencia de bases inicial.
Fotorreactivacin. Se basa en enzimas especficos. La irradacin
del ADN con luz UV hace que se formen dmeros de T. Estos
dmeros en la replicacin no son reconocidos. Hay un conjunto de
actividades enzimticas que se activa con la luz visible y que
repara el dmero de T.
Sistema de escisin- reparacin. Se basa en el opern Mut. No
es un mecanismo de prevencin de errores, sino de correccin.
Cuando hay un desapareamiento de bases, el sistema del opern
Mut reconoce esas alteraciones en la estructura tridimensional del
ADN, corta una secuencia especfica CAGT en los lugares ms
cercanos al desapareamiento (a ambos lados) mediante una
endonucleasa, los elimina y vuelve a copiar la cadena
correctamente mediante una ADNp.
Cmo sabe cul es la cadena mutada y la original?
Las bacterias tienen un mecanismo de proteccin de las infecciones virales
que consiste en enzimas de restriccin (endonucleasas de restriccin), que
cortan la secuencia alterada la reponen, y as eliminan la secuencia viral.
Esta secuencia la reconocen porque:
- Son secuencias imposibles en la bacteria.
- Despus de la replicacin la cadena original se metila. El enzima
lo que corta son secuencias CAGT no metiladas.
Sistema SOS y de recombinacin homloga. Ambos utilizan el opern Rec
SOS. Cuando hay secuencias largas de ADN monocatenario se activa
una protena que rompe la protena represora del opern Rec. Rec se
activa y detiene la replicacin y segn las circunstancias y la
longitud del ADN afectado tiene dos opciones:
- Reparacin rpida.
- Inhibicin de la actividad 3-5 exonucleasa. De esta forma la
ADNp puede avanzar y rellenar el agujero, aunque la
probabilidad de cometer errores aumenta porque se detiene el
mecanismo de correccin de errores.
Recombinacin homloga. Se utiliza la cadena complementaria a la
del hueco en los dos sitios de la horquilla.

Mecanismo de recombinacin gentica.

Es el intercambio gentico entre dos individuos. En la recombinacin
gentica bacteriana hay un individuo que dona la informacin gentica
(exogenote) y otro que la recibe (endogenote). El 10% de la informacin de
las bacterias proviene de la recombinacin gentica.
Existe una tendencia a que determinadas propiedades se transmitan juntas
por recombinacin (islas genticas). Ej.: islas de patogenicidad: conjunto de
genes que se transmiten juntos y que transforman a una bacteria comensal
en patgena.
Cuando un organismo exogenote se recombina con un endogenote, la
informacin gentica externa tiene que penetrar en la clula y puede sufrir:
- Destruccin por enzimas de restriccin por ser ajeno.
- Recombinacin por el endogenote, que puede ser generalizada
(grandes cantidades de genoma) o especfica de sitio. Durante la
sustitucin de material gentico del husped, la clula receptora se
convierte temporalmente en diploide para una parte del genoma, y
recibe el nombre de merocigote.
- Tambin puede que se replique independientemente (plmidos) y
pasar de una bacteria a otra.

DESTINO DEL EXOGENOTE

1.- Destruccin por ajeno
2. - Recombinacin con el endogenote

Generalizada (Transformacin, Transduccin gen.)

Homloga (legtima)
Heterloga (ilegtima)

Especfica de sitio (Transduccin esp., Conversin gnica)

Reordenacin (Transposicin)

3.- Replicacin (Plsmidos, transposones replicativos)

Mecanismos de recombinacin.

Transformacin: incorporacin de ADN libre del medio.

Transduccin: el genoma pasa de una clula a otra transportado por
un virus. Puede ser generalizada o especfica.
Conjugacin: paso de informacin gentica por contacto directo de
dos clulas.
Transposicin por elementos que cambian de lugar (elementos
transponibles).
Transformacin.
La transformacin en condiciones naturales en la menos relevante, pero es
la ms sencilla y la primera que se descubri.
Hay dos tipos, uno en estreptococcus y otro en haemofilus. No se sabe si el
primero es exclusivo de las gram (+) y el segundo de la gram (-) o son dos
mecanismos posibles para cualquier tipo.
Para la transformacin es necesario un estado de competencia para
transformarse. Ninguna bacteria es competitiva durante toda su vida, slo
en la fase logartmica. Una vez que es competente, une a su membrana el
ADN de entre 5 y 15 kpb. Este ADN unido penetra en la bacteria y una de
las dos cadenas se degrada. Esta degradacin puede suceder al mismo
tiempo que atraviesa la membrana o bien una vez dentro de la bacteria. Si el
ADN que se incorpora tiene suficiente homologa con la bacteria que lo ha
tomado, se forman heteroduples. Por ltimo, se produce la recombinacin
generalizada.

La transformacin bacteriana
Induccin del estado de competencia
Unin de ADN a la membrana (entre 5 y 15 kbp)
Entrada del ADN

Degradacin de una cadena

Apareamiento de secuencias homlogas

Integracin del ADN por recombinacin generalizada

TIPOS DE TRANSFORMACION
Streptococcus >G(+)
Requiere
factor de
competencia

Estado de
competencia
estructural

Une
cualquier
ADN

Degradacin
extracelular
del ADN

ADN transportado
por protenas
de unin

Une slo
ADN
homlogo

Degradacin
intracelular
del ADN

ADN transportado
en transformosoma

Haemophylus >G(-)