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Faculdade de Cincias
Departamento de Biologia Animal
Universidade de Lisboa
Faculdade de Cincias
Departamento de Biologia Animal
ndice
NDICE
AGRADECIMENTOS
RESUMO
ABSTRACT
1. INTRODUO
1.1 - POLIPLOIDIA
1.1.1 - CAUSAS DA POLIPLOIDIA
1.1.2 - TOLERNCIA POLIPLOIDIA NA NATUREZA
1.2 - COMPLEXO SQUALIUS ALBURNOIDES
1.3 - DESENVOLVIMENTO INICIAL
1.4 - EPIGENTICA
1.4.1 - MODIFICAO DE HISTONAS
1.4.2 - PROTENA DA HETEROCROMATINA 1 (HP1)
9
9
10
10
12
13
14
14
2. MATERIAIS E MTODOS
15
15
15
16
17
18
18
19
Seces de barbatana e fgado
19
Cultura de fibroblastos
20
Sangue
20
Embries
20
2.3 ANLISE DE IMAGENS
21
2.3.1 DETERMINAO DA QUEBRA DE SINCRONIA MITTICA (TRANSIO MATERNO-ZIGTICA - MBT) 21
2.3.2 DETERMINAO DOS RCIOS NCLEO-CITOPLASMA (NCR)
23
2.3.3 ANLISE DOS PADRES DE HETEROCROMATINIZAO
24
2.3.4 ANLISE ESTATSTICA
25
ALBURNOIDES ADULTOS E DETERMINAO DA CONSTITUIO GENMICA
2.1.2 - CRUZAMENTOS E OBTENO DE EMBRIES
2.1.3 - OBSERVAO DO DESENVOLVIMENTO INICIAL
2.2 - ESTUDO DO SILENCIAMENTO GNICO ATRAVS DE HISTONAS MODIFICADAS
2.2.1 - OBTENO DE AMOSTRAS
2.2.2 - IMUNOHISTOQUMICA PARA DETECO DE SILENCIAMENTO GENTICO
3. RESULTADOS
26
42
5. BIBLIOGRAFIA
45
Agradecimentos
Em primeiro lugar quero agradecer aos meus orientadores ngela Incio e
Gabriel Martins (Psre) pela pacincia e apoio em todos os momentos durante a
realizao deste projecto, principalmente nos de maior aflio e stress.
Um dos meus maiores agradecimentos vai para a Isa Matos, a minha coorientadora sem ela este trabalho tinha sido quase impossvel. Obrigado por toda a
motivao e ajuda que me deste ao longo deste ano.
Agradeo aos meus dois grupos Biologia do Desenvolvimento e Gentica
Evolutiva: Ana Catarina, Ana Rita, Andr, Isa, Joana, Lus, Maria Ana, Marianne,
Miguel Machado, Mnica, Patrcia, Raquel Vaz, Raquel Jacinto, Rifes e Tiago por
toda a ajuda prestada e opinies dadas durante os Labmeeting que me ajudaram
bastante.
Ao grupo de citogentica: Carla, Catarina, Josefina, Max e Miguel Santos por
estarem sempre disponveis. Obrigado Max pelo o ensinamento de culturas e cedncia
de clulas. Miguel obrigado pelas ajudas no citmetro e pacincia quando perguntava
as diferenas entre formas.
Patrcia (a minha amiga PA), Raqueis e Catarina por me terem ajudado
nos maus momentos e em tudo o que precisei (a nvel laboratorial e pessoal).
Obrigado Joana Pinho pelas conversas e discusses que tivemos ao longo
destes 2 anos de mestrado, mal ns sabamos que aps a mtica primeira aula de DE
amos ficar to prximas (vs conseguimos!).
Maria Fernandes por todo o apoio (desde da Holanda) e ajuda em obter os
to desejados papers.
s Professoras Gabriela Rodrigues, Slveig Thorsteinsdttir, Manuela Coelho
e Maria Joo Collares-Pereira por estarem sempre disponveis para qualquer dvida e
ajuda.
Professora Manuela Silva do Instituto Superior de Agronomia, pela ajuda e
cedncia de anticorpos para teste.
Um grande agradecimento Professora Lia Ascenso, pela disponibilidade e oferta do
reagente de Schiff.
D. Branca, por ter sempre mais um cantinho para o meu material ir a
autoclavar em cima da hora. E pelas inmeras conversas que tivemos e que me
souberam sempre to bem.
Telma Laurentino por me ter ajudado nas lavagens dos aqurios e dar
comida dos peixinhos enquanto eu no podia. Ao Joo por me ter cedido informaes
teis para este trabalho.
Ana Margarida Rodrigues por me ensinar o mtodo de Feulgen e a ter
cuidado com o reagente de Schiff.
Obrigado a todos os que frequentaram a sala da microscopia e que sofreram
com o frio devido manuteno dos meus bebs.
s minhas amigas Andreia, Isabel, Mariline e Sofia (as minhas amoras!) por
entenderem as minhas inmeras ausncias nos to desejados encontros s as 5.
Mariline obrigado por me teres feito companhia nas longas horas de recolhas
de embries para no estar sozinha (viva ao skype!).
Sofia obrigado por acreditares sempre em mim, por toda a fora, ajuda e
motivao que sempre me deste nestes ltimos 6 anos.
Quero tambm agradecer a um dos melhores professores que tive na vida, que
para alm de um excelente professor, um grande amigo. Obrigado Professor/amigo
Joo Ramalho Santos por todo o apoio e ajuda sempre que precisei.
E no me posso esquecer da Dr. Ana Barbosa, por tudo o que me ensinou e
por nunca se ter esquecido de mim, sem dvida um orgulho em a ter conhecido.
Aos meus Pais por tudo o que fizeram para me ver feliz e me terem apoiado
sempre em todas as minhas decises (e me ouvirem sempre que precisava de
reclamar!), e claro por terem pago todos estes anos de estudos.
minha mana (que sempre acreditou em mim!) e cunhado pelo apoio que
sempre me foi dado.
minha sobrinha Carlota por ter sempre aquele sorriso gigante quando me v
e por ver em mim um dolo.
Aos meus avs, a quem muitas vezes me esquecia de ligar para mandar um
beijinho e dizer que os adoro.
Obrigado aos meus tios e primos (no vou colocar os nomes, so imensos e vocs
sabem quem so!).
Ao Pedro por me mostrares sempre uma melhor maneira de ver as coisas que
no so sempre to ms como parecem e por estares ao meu lado em todos os
momentos.
Teresa e Miguel por terem aceite a ideia de viver na sua casa em Lisboa e
estarem sempre disponveis para ajudar, e por me receberem sempre to bem.
Aos meus cunhados Paulo e Cludia pelas boas visitas e momentos bons e
diferentes que proporcionaram. Ao Mateus, meu sobrinho mais novo. E claro
obrigado ao Joo Francisco, o meu irmo.
No posso deixar de agradecer a mim mesma, pois todo o trabalho existe por algum
motivo. Sem mim que era totalmente impossvel.
A todos um grande obrigado!
Resumo
A poliploidia um processo proeminente em plantas e embora menos
frequente, tem sido importante na histria evolutiva de alguns vertebrados. Ao
contrrio do que acontece nas plantas o conhecimento das razes que possibilitam o
sucesso evolutivo da poliploidia em vertebrados permanece pouco explorado.
A poliploidia pode ter consequncias em diversos processos celulares, como
por exemplo no desenvolvimento inicial e na regulao da expresso gnica. Um dos
grupos de vertebrados onde a poliploidia mais tolerada em peixes, sendo um
exemplo o complexo Squalius alburnoides. Este um excelente organismo modelo
para estudar o efeito da poliploidia no desenvolvimento e epigentica em vertebrados,
pois alm de ser um exemplo de sucesso evolutivo tambm um complexo que
apresenta diferentes ploidias (2n, 3n e 4n).
Alguns estudos (Newport&Kirschner, 1982; Edgar, 1986) sugerem que
organismos com diferentes quantidades de material gentico apresentam diferenas no
desenvolvimento podendo mesmo afectar estdios importantes durante o
desenvolvimento inicial, tal como divergncias temporais na ocorrncia da transio
materno-zigtica (MBT) e o aparecimento dos diversos rgos. Esses mesmos estudos
sublinham que o mecanismo que poder controlar essa transio seja baseado no rcio
ncleo-citoplasma (NCR), mas tal no foi formalmente demonstrado.
Como os organismos poliplides contm mais DNA, e assumindo que o
tamanho do citoplasma igual entre ploidias (quer no zigoto, blastmeros ou clulas
adultas), o primeiro objectivo deste trabalho foi testar se os embries poliplides
exibem uma MBT mais precoce.
Devido ao facto de existirem poucos vertebrados poliploides na natureza,
neste trabalho tentmos tambm compreender o sucesso evolutivo do Squalius
alburnoides e abundncia das formas triploides. Um estudo anteriormente realizado
neste complexo, concluiu a existncia de um mecanismo de compensao de dosagem
o qual reduz a quantidade de transcritos nas formas triploides para o observado em
formas diploides. Levando a outro objectivo neste trabalho o de compreender que tipo
de mecanismo de silenciamento gnico lhe poder estar associado. Para isso, estudouse o padro heterocromtico no ncleo de diferentes ploidias atravs da marcao do
DNA nuclear (DAPI/ToPro3) e de dois marcadores tpicos de represso gnica, a
protena da heterocromatina 1 (Hp1) e a histona modificada qual se associa, a H3K9
tri-metilada. Este trabalho pretendeu esclarecer alguns aspectos da epigentica deste
complexo, como por exemplo perceber se a heterocromatinizao e/ou modificao
de histonas est envolvida no silenciamento gnico em triploides em vrios tecido
analisados e em que fase do desenvolvimento inicial surge.
As diferenas encontradas apontam para diferentes nveis de
heterocromatinizao nos triploides, o que presumivelmente est associado a
silenciamento gentico. Foi interessante verificar tambm que estas diferenas so
visveis em blastmeros apenas depois da MBT.
Nos triploides as citocineses mostraram um atraso quando comparadas com as
os diploides hbridos e a MBT foi atingida precocemente, facto observado pela quebra
de sincronia das citocineses e cariocineses precoce em triploides. No entanto os
nossos dados preliminares no nos permitem estabelecer uma relao entre a
ocorrncia precoce da MBT e o NCR dos blastmeros.
Palavras-chave: Squalius alburnoides, poliploidia, rcio ncleo-citoplasmtico,
transio-mdia-da-blstula, heterocromatina
Abstract
Polyploidy occurs prominently in plants and though less frequent, it has been
important in the evolutionary history of some vertebrates. The reasons that allow the
evolutionary success of some polyploid vertebrates remain poorly understood.
However, polyploidy can be surprisingly stable given the apparent polyploid ancestry
of many eukaryotic genomes. The diploid-polyploid complex Squalius alburnoides is
an excellent non-model organism to study polyploidy and its effects in cellular
processes.
Previous studies suggest the existence of a nucleo-cytoplasmic ratio(NCR)
effect controlling timing of early cleavages and mid-blastula transition in other
organisms. We explored the S. alburnoides complex, to test this. The results clearly
show that triploid embryos reach mid-blastula transition earlier than diploid embryos,
though a clear relationship between estimated NCRs and times of MBT could not
be established. In fact, though triploids have an estimated 50% increase in DNA
content/cell, the average zygote volume and blastomere size at MBT are nearly twice
those of diploids. We also found no significant differences in NCRs from adult
tissues, and in the case of blood evidence or a larger cytoplasm, but less than the
expected 50% increase. Analysis of heterochromatinisation patterns did reveal
significant differences between triploids and diploids, in adult tissues. Interestingly,
we did find evidence that HP1 may appear only after MBT.
This work allowed us to analyze the complex phenomena of early development
and epigenetics in this interesting species complex and provided further evidence that
alterations of DNA contents can affect the pace of early development. However
further analysis to support some of the preliminary observations are necessary.
Keywords: Squalius alburnoides, polyploid, ncleo-cytoplasmatic ratio, mid-blastula
transition, heterochromatin
1. Introduo
1.1 - Poliploidia
A poliploidia resulta de uma alterao gentica na qual ocorre um aumento do
nmero de cromossomas para um mltiplo de n, mas diferente de 2n (Moisieniak et
al., 2010).
Os organismos eucariotas so geralmente diploides (2n) (Storchova&Pellman,
2004), no entanto a poliploidia comum em plantas, com uma frequncia estimada
entre 30 e 80% (Masterson, 1994) e ocorre esporadicamente em vertebrados
sobretudo nos inferiores, como rpteis, anfbios e peixes (Lewis, 1980).
Os organismos poliploides podem ser classificados em duas categorias:
autopoliplides ou alopoliplides. No caso dos autopoliplides h multiplicao do
mesmo genoma, enquanto que os alopoliplides so hbridos.
Contudo um processo que pode ser surpreendentemente estvel, havendo
evidncias de que muitos genomas eucariotas tm poliploidia ancestral (Comai,
2005).
1.1.1 - Causas da poliploidia
Uma causa possvel para a poliploidia a poliespermia, aqui o ocito
fertilizado por mais do que um espermatozoide, podendo ocorrer tanto em plantas
como em animais, sendo uma das vias que mais leva a ocorrncia de triploides
humanos (Uchida et al., 1985). A ausncia de citocinese provoca tambm uma
duplicao do genoma, podendo ocorrer durante as primeiras divises do zigoto ou
mais tarde em tecidos adultos, resultando em mosaicos.
A ausncia de reduo meitica uma das causas mais frequentes da
poliploidia. Neste caso, os gmetas no reduzidos ficam com o dobro do genoma
esperado e quando fertilizados por um gmeta reduzido ocorre a formao de um
zigoto com maior ploidia. Se ocorrer a fertilizao por outro gmeta tambm no
reduzido o nvel de ploidia do zigoto ainda maior. Nos casos de alopoliploidia os
hbridos produzem uma taxa elevada de gmetas no reduzidos (Ramsey&Schemske,
2002). Aqui, a hibridao apresenta um papel importante na evoluo das plantas e
animais (Mallet, 2007), particularmente em peixes. Neste grupo a hibridao um
processo generalizado, existindo vrios factores que explicam esta incidncia tais
como, fertilizao externa, mecanismos de isolamento comportamental fracos,
abundncia desigual das duas espcies parentais, competio pelo habitat de desova,
diminuio de complexidade do habitat e susceptibilidade a contacto entre as
diferentes espcies (Chvez & Turgeon 2007, Scribner et al. 2001).
10
11
PP
PAA
PPA
PPAA
PA
AA
PP
PA
PPA
PA
PAA
PP
PPP
PPA
AA
PAA
AA
AAA
PA
PPA
PAA
PA
PA
PPAA
PAA
PAAA
PPA
PPPA
PPAA
PPAA
PA
PPAA
PAA
PAAA
PPA
PPPA
PPAA
12
13
14
2. Materiais e Mtodos
2.1 - Desenvolvimento inicial em Squalius alburnoides
2.1.1 - Amostragem, identificao, manuteno, estimulao hormonal de
Squalius alburnoides adultos e determinao da constituio genmica
A amostragem para todas as formas de Squalius alburnoides foi efectuada em
diversas bacias do sul (Tejo e Guadiana), enquanto que a amostragem de Squalius
pyrenaicus foi efectuada numa bacia isolada (Cheleiros, Sintra) e tambm numa bacia
do sul (Almargem). Para a sua captura foi utilizada a pesca elctrica, que consiste no
uso de corrente elctrica para atordoar os peixes e assim facilitar a sua captura,
poucos minutos aps a descarga os peixes voltam ao seu comportamento normal.
Os peixes foram mantidos em aqurios de vidro de 60 l expostos a um ciclo de
14 horas de luz e 10 horas de escurido, a uma temperatura constante de 20C. A
alimentao foi base de flocos e foi enriquecida com Artemia salina e Daphnia
congeladas, cerca de 4 vezes ao dia.
Foi realizada estimulao hormonal atravs de injeco de um anlogo da
hormona gonodotropina (Ovaprim, Western Chemical), para promover a maturao e
desova, que depois se fez por instigao da ovulao e espermiao em peixes
maduros. A injeco foi administrada na cavidade abdominal a uma concentrao de
0,5 l por grama, de acordo com instrues do fabricante e ao longo de quatro
semanas, antes e depois da poca de cruzamento (Dezembro-Janeiro e Julho) com o
objectivo de antecipar e prolongar a mesma.
A ploidia dos peixes capturados foi determinada por citometria de fluxo atravs
do protocolo Prspero & Collares-Pereira (2000), executada com recurso a barbatanas
ou sangue dos indivduos em questo.
A determinao da constituio genmica dos peixes capturados foi realizada
atravs de um PCR quantitativo conforme descrito em Incio et al., 2010. Neste caso,
o DNA genmico utilizado foi obtido a partir de cortes de barbatana utilizando o
mtodo de extraco com recurso a solventes orgnicos descritos por Miller et al.,
1998. Nos casos em que no foi possvel a extraco logo aps o corte, as barbatanas
foram armazenadas em etanol 100%.
Durante o corte da barbatana os peixes foram fotografados, de forma a
possibilitar o seu posterior reconhecimento atravs do padro de escamas especfico
para cada individuo (Morgado-Santos et al., 2010).
15
Ploidia
Descendncia
xito
2n
PA
PP (fmea) x AA (macho)
2n
PA
2n
PA
PA (fmea) x AA (macho)
3n
PAA
3n
PAA
3n
PAA
4n
PAAA
2n
AA
PP (fmea) x PP (macho)
2n
PP
16
17
18
19
20
21
22
Figura 5. Relao das fases mitticas com as cores de cada esfera durante a marcao na
reconstruo 3D.
23
Para estimativa dos NCRs a partir de clulas adultas usei imagens obtidas ao
microscpio medi as reas (de projeco) dos ncleos e citoplasmas desenhando uma
ROI (Region Of Interest) volta do ncleo e da clula (Figura 7.A), tendo depois
sido excluda a rea do ncleo rea total da clula usando a funo XOR para
obter a rea de projeco do citoplasma, conforme a figura 7.C. As estimativas do
NCR assim obtidas consistiram no rcio entre as duas reas; um aumento do NCR
corresponderia a um aumento do ncleo (cujo tamanho est presumivelmente
relacionado com a ploidia) sempre maior do um possvel aumento do citoplasma.
Uma anlise semelhante foi feita para fibroblastos, no entanto como no foi
possvel obter culturas de confluncias equivalentes e como a confluncia afecta a
rea total da clula no reportmos as medies do citoplasma, apenas as do ncleo
pois a sua rea no alterada pela confluncia.
O NCR foi estimado tambm a partir de medies de clulas de barbatana in
toto observadas no microscpio confocal. Sempre que foi possvel identificar clulas
isoladas (o que diminuiu drasticamente o nmero de clulas medidas) foi medida a
ROI do seu ncleo e citoplasma apenas numa das fatias pticas visveis.
2.3.3 Anlise dos padres de heterocromatinizao
Para a quantificao da marcao do anticorpo para a heterocromatina das
diferentes ploidias e tecidos utilizou-se o software ImageJ 1.44K. Primeiro
seleccionou-se uma ROI nuclear contornando o ncleo e obteve-se a intensidade
mdia da fluorescncia para cada marcador de heterocromatinizao (Figura 8.A),
Para normalizar esse valor (de forma a compensar diferenas devidas a variaes na
marcao que ocorrem de amostra para amostra), alargou-se a ROI nuclear de
24
25
3. Resultados
3.1 Descrio do desenvolvimento inicial em S. alburnoides
3.1.1 Descrio dos estdios e comparao com estdios modelo de
Danio rerio
De uma forma geral foi possvel identificar os estdio tipo j descritos por
Kimmel et al. (1995), apesar do desenvolvimento de S. alburnoides ser notoriamente
mais lento, uma vez que ambos se desenvolvem a temperaturas muito diferentes (28C
para D. rerio, e 20C para S. alburnoides). Embora no tenhamos feito uma anlise
das condies ptimas de cultura de S. alburnoides, durante a realizao de um
cruzamento foram testados 30 embries para diferentes temperaturas (20, 22 e ~25)
e a temperatura ptima rondou entre 20-22, pois foi onde houve menor taxa de
mortalidade. Optou-se por manter os embries mesma temperatura a que foram
mantidos os aqurios 20C. Devido escassez de amostras e a mortandade verificada
durante as filmagens no foi possvel recolher exemplos de todos em estdios.
A anlise dos tempos de clivagens foi alvo de uma anlise mais detalhada e
est relatada na seco determinao da MBT tabela III. No foram observadas
diferenas bvias nos estdios de desenvolvimento posteriores MBT nas diferentes
formas. A gastrulao (50% epibolia) foi identificada s 15.4 h, quer em PAA quer
em PA e AA (~10 h de atraso relativamente ao Danio rerio). A formao de primeiro
smito foi identificada num PAA s 30h, o surgimento de 10 smitos ocorre em todas
as formas por volta das 37h e antes da ecloso (tal como em Danio rerio) o estdio
observado Long Pec, que ocorre por volta das 68h e a ecloso ocorre ~72 h (maior
detalhe na Tabela V). O vitelo parece durar mais tempo em S. alburnoides, na fase
Protruding mouth o volume do vitelo maior que o equivalente estdio em D. rerio.
O aparecimento de melancitos tambm diferente, em D. rerio comeam a ser
visveis s 33h (Kimmel et al., 1995), enquanto em S. alburnoides s foi detectado no
incio do 5 dia, apenas um embrio amostrado. Na figura 13 podemos verificar as
diferenas temporais entre os diferentes estdios tipo de D. rerio comparativamente
com S. alburnoides
A descrio de estdios tipo proposta por Kimmel pode ser usada para
identificar estdios em S. alburnoides, com as devidos ajustes (Figura 9) para os
tempos de ocorrncia assim como a diferena no tamanho e durao do vitelo, e
aparecimento de melanforos.
26
27
II
III
IV
VI
VII
VIII
IX
XI
99
140
178
213
248
283
319
357
395
420
480
Tempo(min)
Formas
PAA(n=2:21)
PA(n=1:6)
99
41
38
35
35
35
36
38
38
MBT
MBT
83
36
34
32
32
32
33
35
35
36
MBT
82
44
39
37
36
37
38
35
33
34
MBT
120
46
32
34
36
42
46
50
50
54
56
AA(n=1:4)
PAA(nofrtil)
1
28
60
120
180
240
300
360
420
480
540
I
II
PAA
III
IV
Formas
V
PA
VI
VII
VIII
IX
AA
X
XI
Figura 10. Durao das diferentes clivagens para as diferentes formas. Note-se, por exemplo que s
4h (240min), os triploides estavam ainda a meio da V clivagem, enquanto os PA e AA estavam j na
VI. Curiosamente, os 4 embries AA analisados mostraram tempos de clivagens mais longos que os
PA, mais consistentes com os tempos observados nos PAA. Apesar disso, ao contrrio que que
aconteceu com os PAA, nos AA foi possvel identificar o fim da X clivagem (~410min) o que mostra
que os blastmeros se mantiveram sincronizados por mais tempo nesta forma.
29
AA
PA
PAA
Horas
(p.f)
5,5
5,5
6,0
6,0
6,0
4,5
5,0
5,0
5,5
6,0
6,0
5,0
5,5
5,5
6,0
Blastmeros
vsiveis
189
176
95
158
95
58
345
295
195
405
322
20
77
24
230
0,0
0,0
36
39
27
0
1
8
0
39
60
0
14
3
39
0,0
0,0
14
4
4
0
0
0
0
5
2
20
4
2
37
0,0
0,0
10
74
30
58
6
10
0
99
54
0
8
4
92
ndicede
Assincronia
0,0
0,0
0,73
0,56
0,68
0,00
0,02
0,06
0,0
0,37
0,37
0,00
0,39
0,46
0,76
30
Figura 11. Reconstrues 3D de embries fixados e corados pelo mtodo de Feulgen. Embora o
mtodo seja para marcao de DNA, o citoplasma tambm era visvel o que permite ver a forma dos
blastmeros. Em alguns casos so mostradas tambm as esferas coloridas que assinalam as diferentes
fases mitticas identificadas de acordo com a figura 5 nos materiais e mtodos. A) Embrio triploides
PAA fixado s 5h (p.f.); A) detalhe mostrando trs anafases; B) Embrio PA s 5h; B detalhe
mostrando profases. Nesta imagem esto representadas tambm as bolhas coloridas que identificam a
fase de cada ncleo analisado. (barras=300m).
Figura 12. Demonstrao da forma PAA s 5.5h (p.f), que ao contrrio das imagens
anteriores foi encontrada assincronia. (escala=125 m)
Figura 13. Demonstrao de sincronia nos embries diploide AA (A) e PA (B) s 5.5 h (p.f).
(escala=50m)
31
ndicedeassincronia
0,8
0,7
0,6
0,5
PAA
0,4
PA
0,3
0,2
AA
0,1
0,0
4.5h
5h
5.5h
6h
Tempo(p.f)
de salientar que aps a anlise das cariocineses estes embries (fixados e corados)
pareciam estar adiantados em relao aos embries filmados. Por exemplo, de acordo
com os filmes, s 5h os PAA deviam ter 64 blastmeros e estar a fazer a VII
clivagem, enquanto os PA deviam ter 128 blastmeros e estar a fazer a VIII
clivagem. A contagem das figuras mitticas mostrou consistentemente mais ncleos
nos diploides que os esperados, embora isto seja espectvel pois as cariocineses
antecedem as citocineses, o tamanho dos blastmeros visveis nas reconstrues 3D, e
a diferena no nmero de ncleos sugerem que estes embries estariam efectivamente
avanados. As possveis causas desta diferena so discutidas mais a baixo. De
qualquer das formas, estas observaes confirmaram a tendncia para os triploides
(PAA) mostrarem uma quebra de sincronia mais precoce.
32
Figura 16. Relao entre o nmero de cromossomas e o volume do zigoto (VOLzig) e ITC (ndice
de tamanho celular de blastmeros em MBT). Apesar de haver uma relao aparentemente linear
entre a ploidia e o tamanho do zigoto ou blastmeros, os zigotos de embries AA apresentaram um
volume inesperadamente elevado (crculo tracejado). Este valor afectou significativamente as
estimativas de NCR apresentadas.
PA
PAA
AA
Dimetro
zigoto(um)
DNA
50
911.1
75
1069.3
50
1056.9
VOLzig
(um3)
+08
3.96E
+08
6.40E
+08
6.18E
NCRzig
dimetro
nblastmeros
blastoderme
estimado
ITC
(um)
9
704.9
1024
0.74
126.2E
9
784.0
512
1.53
117.2E
768.1
1024
0.75
NCRMBT
72.6
49.0
66.7
33
Embora parea existir uma relao linear entre a ploidia e o tamanho do zigoto e
dos blastmeros em MBT (Figura 16), os embries AA apresentavam valores de
zigotos anormalmente grandes, facto para o qual no encontrmos um explicao e
pelo qual decidimos comparar apenas os NCRs de PAA e PA.
Para a primeira diviso estimamos um valor abstracto de NCRzig para o zigoto, e
para a MBT estimmos um NCRMBT, uma vez que j havia separao entre o
citoplasma dos blastmeros e do vitelo (de acordo com as frmulas descritas nos
matrias e mtodos). Curiosamente em ambos os casos os PAA parecem ter valores
de NCR abstratos menores que os PA, o que no nos permite concluir que uma MBT
precoce em triploides devida de um aumento no NCR.
De seguida fomos determinar os NCRs em clulas de tecidos adultos para
tentar confirmar um padro de NCR. Nas clulas de barbatana observadas ao
microscpio confocal, o tamanho nuclear maior nos triploides (Figura 17)
comparativamente com os ncleos diploides (AA, PA e PP), sendo esta uma diferena
estatisticamente significativa (p<0.05). A anlise dos tamanhos nucleares de
eritrcitos mostrou tambm um aumento do tamanho em triploides (p<0.05), e o
mesmo se verificou com os ncleos de fibroblastos em cultura embora neste caso
tivssemos apenas para comparao a forma triploide (PAA) e a forma diploide (PP)
(Figura 18).
Figura 17.. Demonstrao dos tamanhos nucleares (normalizados para PP) para as diferentes
ploidias no sangue e barbatana, sendo que PAA estatisticamente diferente (*) dos outros.
34
*
*
Figura 18. Demonstrao dos tamanhos nucleares (normalizado para PP) para as diferentes
ploidias nos fibroblastos, sendo PAA diferente de PP.
Figura 19. Demonstrao dos tamanhos do citoplasma para as clulas da barbatana e sangue
nas diferentes ploidias.
35
Figura 20. Valores do NCR (normalizado para PP) para as clulas da barbatana e do sangue,
havendo diferenas entre AA para o sangue e em PP para a barbatana.
1,2
1,0
0,8
0,6
0,4
0,2
0,0
PAA
PP
Formas
Figura 21. Intensidade mdia de H3K9 nuclear para as diferentes formas, normalizado para a
intensidade mdia do diploide.
36
Intensidademdia
1,4
1,2
*
*
1,0
0,8
0,6
0,4
0,2
0,0
PAA
PP
Formas
Figura 22. Intensidade mdia de HP1 nuclear para as diferentes formas, normalizado para a
intensidade mdia do diploide, havendo diferenas estatsticas entre eles..
Heterogeneidademdia
1,2
1,0
*
*
0,8
0,6
0,4
0,2
0,0
PAA
Formas
PP
Heterogeneidademdia
2,5
2,0
1,5
*
1,0
0,5
0,0
PAA
Formas
PP
Figura 24. Heterogeneidade mdia de Hp1 nuclear, normalizada para os diploides, com
diferenas significativas nos triploides (asterisco).
37
DAPIPAA
HP1PAA
DAPIPAA
Figura 25. Imagens de cultura de fibroblastos PAA com marcao para H3K9, HP1 e
respectiva marcao nuclear (DAPI). (escala= 5 m)
H3K9PAA
DAPIPP
HP1PP
DAPIPP
Figura 26. Imagens de cultura de fibroblastos PAA com marcao para H3K9, HP1 e
respectiva marcao nuclear (DAPI). (escala= 5 m)
3.2.2 Crebro
O estudo da verificao de diferenas da marcao de Hp1 no ncleo foi
tambm realizado em clulas do crebro. Sendo executada a mesma anlise que no
caso dos fibroblastos.
Neste caso, abordamos mais uma forma para os diplides (PA), para alm das
analisadas anteriormente. Aqui verificou-se que a intensidade nuclear de Hp1
diferente entre ploidias, essa intensidade mais elevada no caso dos triploides (Figura
27). Esta diferena estatisiticamente significativa, verificando-se essas diferenas
38
Intensidademdia
1,2
1,0
0,8
0,6
0,4
0,2
0,0
PAA
PA
PP
Formas
Figura 27. Anlise da intensidade mdia da marcao nuclear de Hp1 nas diferentes ploidias,
normalizado para a intensidade mdia de PP), mostrando uma diferena significativa do
triploides (asterisco).
Heterogeneidademdia
2,5
2,0
1,5
1,0
0,5
0,0
PAA
PA
Formas
PP
Figura 28. Heterogeneidade mdia nuclear de HP1 para clulas de crebro nas diferentes
formas (normalizado para os PP), mostrando diferenas significativas no triplide (asterisco).
3.2.3 Sangue
O mesmo tipo de anlise foi efectuada em esfregaos de sangue, aps
observao da marcao de HP1. Desta forma, conseguimos abranger todas as formas
diplides (AA, PA e PP) do nosso estudo, enquanto que relativamente aos triploides a
mesma forma (PAA) foi utilizada. Esta anlise veio demonstrar que as diferenas j
anteriormente detectadas nos triploides (PAA) so outra vez significativas para este
tecido (Figura 29).
39
IntensidadeHp1
1,2
1,0
0,8
0,6
0,4
0,2
0,0
AA
PA
PAA
PP
Formas
Figura 30. Intensidade mdia da marcao nuclear de Hp1 entre as diferentes formas,
normalizadas para a intensidade mdia em PP, mostrando diferenas significativas nos
triploides (asterisco).
HeterogeneidadeHp1
1,6
1,4
1,2
1,0
0,8
0,6
0,4
0,2
0,0
AA
PA
PAA
PP
Formas
Figura 31. Heterogeneidade nuclear de HP1 nas diferentes formas, normalizada para a
heterogeneidade mdia de PP, mostrando diferenas significativas entre triploides e os
diploides PA e PP (asteriscos), mas no entre triploides e os diploides AA.
40
IntensidadeHp1
2,500
2,000
1,500
PrMBT
1,000
PsMBT
0,500
0,000
AA
PA
PAA
Formas
Figura 32. Representao das intensidades mdias da marcao de HP1 nuclear em embries
pr e ps-MBT (5h e 9h), normalizadas para os valores de PA, mostrando diferenas
significativas entre embries pr- e ps MBT, e aps MBT no triploide em relao aos
diploides.
Figura 33. Marcao de HP1 nuclear em embries de diferentes ploidias antes (5h) e depois
da MBT (9h). Verde = HP1, vermelho = DNA.
41
4. Discusso
Este trabalho procurou analisar se a poliploidia originava efeitos durante o
desenvolvimento inicial e nos mecanismos de epigentica do complexo Squalius
alburnoides.
Relativamente ao desenvolvimento foram realizadas observaes de vrios
embries para as diferentes ploidias e formas do complexo, verificou-se que existe
uma perda de assincronia mais cedo nos triploides do que nos diploides nos dois
mtodos utilizados para esse efeito. No entanto, na anlise realizada com base nos
vdeos com recurso a cimogramas verificou-se a perda de sincronia IX clivagem
nos triploides e X clivagem para diploides, ambas por volta das 6,5 h. O outro
mtodo realizado para verificar esta perda de sincronia demonstrou que nos triploides
ocorre s 5,5h, e no caso dos diploides s 6h ps fertilizao, embora no possamos
excluir a possibilidade destas diferenas serem devidas a diferentes temperaturas nos
dois mtodos de cultura usados. No entanto, em ambos os casos verificou-se que a
sincronia surge mais cedo nos triploides, tal como tinha sido previsto no trabalho de
Newport e Kirschner. As diferenas entre mtodos devem-se provavelemente ao facto
de durante a filmagem terem ocorrido oscilaes de temperatura na sala, e uma
diminuio da temperatura provocar atraso no desenvolvimento.
Esta ocorrncia poderia ter sido verificada com a anlise dos embries
marcados pelo mtodo de Feulgen, no entanto, aps as desidrataes no processo do
mesmo os blastmeros sofreram grandes alteraes e a sua anlise poderia cair em
erro. Para confirmar isto ter que se analisar formas mais precoces, uma vez que
anlise para j incidiu apenas sobre embries perto da MBT.
A criao de uma tabela com os tempos e estdios respectivos, um dado
importante para estudos futuros de S. alburnoides, assim como a verificao de que
possvel identificar os mesmos estdios tipo descritos por Kimmel et al., 1995.
Relativamente ao efeito do NCR durante o desenvolvimento, as anlises
realizadas relativamente aos dimetros obtidos para o zigoto no momento da MBT
embora mostrem diferenas no tamanho do PAA e PA, ela no altamente
significativa (p=0.03), o que sugere que os embries regulam o tamanho das suas
blastodermes, apesar do seu tamanho inicial maior (para o qual contribui
massivamente a reserva do vitelo). Salvaguardando que os triploides fizeram menos
uma clivagem e as blastodermes tenham tamanhos equivalentes, os blastmeros dos
triploides so quase o 2x maiores. Para confirmar estes valores seriam necessrias
medidas mais directas do volume dos blastmeros para que a determinao do NCR.
Dessa forma talvez fosse possvel determinar um NCR mais rigoroso e que apontasse
para uma confirmao do efeito do NCR no controlo da MBT.
Ficamos com dvidas sobre o significado do maior tamanho dos zigotos de
diploides AA. Para comprovar estas diferenas, mais cruzamentos e de diferentes
fmeas e machos deveriam de ser feitos, assim como uma anlise rigorosa do tamanho
tpico de ocitos nas diferentes formas. Este aspecto foi abordado por Ribeiro et al
(2003), embora e os dados apresentados no sejam comparveis com as nossas
observaes.
42
43
Relativamente aos resultados para a marcao por H3K9, estes no foram to claros,
possivelmente por que esta marcao se mostra pouco especifica, apresentado
extenses para o citoplasma (Imagem H3K9- ver material suplementar)
A heterogeneidade da marcao heterocromtica nuclear mostrou-se
consistentemente maior nas formas triploides. Mais uma vez estes resultados
suportam a existncia de silenciamento nos triploides via mecanismos
heterocromticos, na medida em que expectvel a existncia de mais focus em
ncleos sujeito a silenciamento gnico. Por outro lado no h evidncias de grandes
marcaes heterocromticas na periferia desses ncleos, suportando as evidncias
dadas por Pala et al. 2008 de que no existe um silenciamento de um haploma inteiro,
pois nesse caso estes iria tendencialmente localizar-se na periferia (Francastel et al.,
2000).
44
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