Laboratorio de Bioqumica Metablica

Previo 2 Introduccin al metabolismo

1. Qu es el metabolismo?
Se denomina metabolismo
al conjunto de reacciones qumicas
enzimticamente catalizadas que tienen lugar en la clula. Aunque el
metabolismo no es un mero conjunto de reacciones, sino una actividad qumica
altamente ordenada y llena de sentido cuyo objetivo es la correcta
manipulacin de la materia y la energa por parte de la clula para as
mantener el estado vital.
2. Explique cada una de las fases del metabolismo.
El metabolismo se divide en dos fases principales: el catabolismo y el
anabolismo.
El catabolismo es la fase degradativa del metabolismo, en la cual molculas
orgnicas complejas y relativamente grandes como los polisacridos o las
protenas se degradan para dar lugar a molculas de estructura ms simple y
menor tamao tales como el cido lctico, CO 2, agua, amonaco o urea. Este
proceso degradativo va acompaado de la liberacin de la energa qumica
inherente a la estructura de las molculas orgnicas que se degradan; es por lo
tanto un proceso exergnico. Muchas reacciones del catabolismo suponen una
oxidacin, es decir, una prdida de electrones, de los sustratos orgnicos que
se degradan. En resumen, el catabolismo es un proceso degradativo, oxidante
y exergnico.
En contrapartida, el anabolismo es la fase constructiva del metabolismo, en la
cual tiene lugar la sntesis de los componentes moleculares de las clulas tales
como los cidos nucleicos, las protenas, los polisacridos y los lpidos a partir
de molculas precursoras de estructura ms sencilla y menor tamao. Este
proceso biosinttico requiere energa qumica para poder ser llevado a cabo, es
decir, es un proceso endergnico. La construccin de biomolculas orgnicas
altamente hidrogenadas requiere electrones para reducir a sus precursores
relativamente oxidados. En resumen, el anabolismo es un proceso constructivo,
reductor y endergnico.
3. Cul es la importancia de las enzimas dentro del metabolismo global?
Cada reaccin qumica de la clula se halla catalizada por una enzima, que es
especfica para esa reaccin. Sin las enzimas, las reacciones qumicas que se
realizan en nanosegundos, se llevaran a cabo en aos.
4. Qu significa IN VIVO e IN VITRO? De un ejemplo.
In Vivo (latn: dentro de lo vivo) significa que ocurre o tiene lugar dentro de
un organismo. En ciencia se refiere a experimentacin hecha dentro o en el

tejido vivo de un organismo vivo, por oposicin a uno parcial o muerto. Pruebas
con animales y los ensayos clnicos son formas de investigacin in vivo .
Es a menudo ms apropiado para la observacin de efectos finales y totales
para un experimento en el sujeto viviente. Aunque en la biologa molecular, in
vivo se refiere a experimentacin a nivel celular, donde estas pueden ser rotas
y analizadas.
Tambin puede ser referencia a cualquier tipo de experimentacin por
oposicin aquella que se hace in vitro, por ejemplo, los experimentos de
propagacin de plantas que se hacen en viveros se consideran in vivo,
contrario a lo que sucede cuando se propagan plantas en tubos de ensayo, que
se considera in vitro. En ambos casos el sujeto de experimentacin esta in vivo.
In Vitro (latn: dentro del vidrio) se refiere a una tcnica para realizar un
determinado experimento en un tubo de ensayo, o generalmente en un
ambiente controlado fuera del organismo vivo.
Muchos experimentos en biologa celular son llevados a cabo fuera del
organismo, en clulas. Porque las condiciones a veces pueden no corresponder
a las condiciones dentro del organismo, los experimentos in vitro pueden ser
poco exactos.
Este tipo de investigacin apunta a describir los efectos de una variable
experimental en un subconjunto de las partes constitutivas de un organismo.
Tiende a enfocarse en rganos, tejidos, clulas, componentes celulares,
protenas y/o biomolculas. Es ms apropiada para deducir un mecanismo de
accin, con menos variables y reacciones amplificadas.
5. Cul es la composicin de la saliva?
Aproximadamente el 99% de la saliva es agua. E uno por ciento restante
consiste en molculas orgnicas grandes (protenas, glicoprotenas y lpidos),
de molculas orgnicas pequeas (glucosa, rea) y de electrolitos (sodio,
potasio, calcio, cloro y fosfatos).
6. Cules son las funciones de la saliva?
- La saliva tiene muchas funciones tales como proteger la integridad de la
mucosa
- Eliminar restos alimenticios y bacterias de la cavidad bucal.
- Neutralizar cidos.
- Acidificar bases y proveer de los iones necesarios para la remineralizacin de
los tejidos dentarios.
- Tiene propiedades antibacterianas, antifungicidas y antivirales.
- Tambin los componentes de la saliva facilita la masticacin, la deglucin, la
fonacin as como las funciones sensoriales de la cavidad bucal.
7. Qu es la Dilisis y como se realiza?

En bioqumica, la dilisis es el proceso de separar las molculas en una

solucin por la diferencia en sus ndices de difusin a travs de una membrana
semipermeable. Consiste en el movimiento de solutos (iones, urea, cido rico,
etc. ) y de solventes (agua) a travs de los poros de una membrana
semipermeable siguiendo los fenmenos de difusin, osmosis y filtracin.
La dilisis es una tcnica comn de laboratorio, y funciona con el mismo
principio que la dilisis mdica. Se realiza teniendo una solucin de varios tipos
de molculas, la cual es puesta en un bolso semipermeable de dilisis, como
por ejemplo, en una membrana de la celulosa con poros, y el bolso es sellado.
El bolso de dilisis sellado se coloca en un envase con una solucin diferente, o
agua pura. Las molculas lo suficientemente pequeas como para pasar a
travs de los poros (a menudo agua, sales y otras molculas pequeas)
tienden a moverse hacia adentro o hacia afuera del bolso de dilisis en la
direccin de la concentracin ms baja. Molculas ms grandes (a menudo
protenas, ADN, o polisacridos) que tiene dimensiones significativamente
mayores que el dimetro del poro son retenidas dentro del bolso de dilisis.
Una razn comn de usar esta tcnica puede ser para quitar la sal de una
solucin de la protena. La tcnica no distinguir efectivamente entre protenas
8. Qu le ocurre a una muestra de saliva al dializarla?
La saliva pierde iones y sales pero no protenas, por ejemplo para estudiar
enzimas de la saliva.
9. Cul es la estructura del almidn y cules son sus productos de hidrolisis?
Lo que llamamos almidn no es realmente un polisacrido, sino la mezcla de
dos, la amilosa y la amilopectina. Ambos estn formados por unidades de
glucosa, en el caso de la amilosa unidas entre ellas por enlaces 1-4 lo que da
lugar a una cadena lineal. En el caso de la amilopectina, aparecen
ramificaciones debidas a enlaces 1-6.
La amilosa es una cadena tericamente lineal, pero en la prctica existen
algunas sustituciones iguales a las de la amilopectina, una cada varios
centenares de molculas, que no modifican sus propiedades.
En la amilopectina, las ramificaciones aparecen cada 20 o 30 glucosas. Las
cadenas de las ramificaciones se ramifican a su vez, y aunque la estructura no
est totalmente aclarada, parece probable que se encuentren no ramificadas al
azar, sino formando una estructura que podramos llamar "fractal", alrededor
de una cadena central, que es la nica que tiene un extremo reductor.
Los productos de la hidrolisis del almidn son productos grandes, maltosa y
glucosa

10.Explique la reaccin del iodo con el almidn y sus productos de hidrolisis.

Las molculas de amilosa son helicoidales, con la zona interior hidrfoba
(lipfila), y son capaces de formar complejos con porciones lineales hidrfobas
de molculas que se ajustan a las dimensiones del tubo hidrfobico. El yodo
(como I3-) es capaz de formar complejos tanto con amilosa como con
amilopectina. El complejo se forma cuando se introduce el yodo en el interior
hidrfobico de segmentos de hlice. En el caso de la amilosa, los largos
segmentos helicoidales permiten la formacin de largas cadenas de poli (I3-),
que dan lugar al color azul caracterstico que indica presencia de almidn. La
amilopectina se colorea de color rojo purpura con el yodo, debido a que las
ramas de amilopectina son demasiado cortas para la formacin de largas
cadenas de poli (I3-).

Bibliografia
Metabolismo y fases
http://www.bionova.org.es/biocast/documentos/tema15.pdf
enzimas
http://www.cneq.unam.mx/cursos_diplomados/diplomados/medio_superior/SEIE
M/1a/01/00/02_material/1a_generacion/mod4/biolo_celula/Metabolismo.pdf
in vivo e in vitro
http://sgpwe.izt.uam.mx/files/users/uami/cfmc/Bioquimica_III/in_vivo_e_in_vitro.
pdf
la saliva
https://bioquimiodonto.files.wordpress.com/2010/11/saliva-presentacionbiokimika.pdf
carbohidratos almidon
http://es.slideshare.net/josedario13/carbohidratos-almidon

Previo 3 Fermentacin Alcohlica

1. Qu es la respiracin aerbica? Explique.

La respiracin celular aerobica es el conjunto de reacciones en las cuales el
cido pirvico producido por la gluclisis se transforma en CO2 y H2O, y en el
proceso, se producen 36 molculas de ATP. En las eucariotas este proceso
ocurre en la mitocondria en dos etapas llamadas Ciclo de Krebs (o ciclo de
cido ctrico) y la cadena de transporte de electrones. En la cadena se
producen 34 molculas de ATP a partir de una molcula inicial de glucosa.
2. Qu es la respiracin anaerbica? Explique.
La respiracin celular anaerbica ocurre en ausencia de oxgeno. Este
mecanismo no es tan eficiente como la respiracin aerbica, ya que solo
produce 2 molculas de ATP, pero al menos permite obtener alguna energa a
partir del piruvato que se produjo en la glucolisis.
3. Qu es la fermentacin? Cuntos tipos hay?
Es un proceso catablico de oxidacin incompleta, totalmente anaerbico,
siendo el producto final un compuesto orgnico. Estos productos finales son los
que caracterizan los diversos tipos de fermentaciones.

Los tipos de fermentacin que existen son:

Alcohlica: Se lleva a cabo fundamentalmente por levaduras del gnero

Saccharomyces, que son hongos unicelulares que, en dependencia de la
especie, se utilizan en la produccin de pan, cervezas o vinos.

Lctica: es una ruta metablica anaerbica que ocurre en el citosol de la

clula, en la cual se oxida parcialmente la glucosa para obtener energa
y donde el producto de desecho es el cido lctico.

Actica: es la fermentacin bacteriana por Acetobacter, un gnero de

bacterias aerbicas, que transforma el alcohol en cido actico. La
fermentacin actica del vino proporciona el vinagre debido a un exceso
de oxgeno y es considerado uno de los fallos del vino.

Butrica: es la conversin de los glcidos en cido butrico por accin de

bacterias de la especie Clostridium butyricum en ausencia de oxgeno.
Se produce a partir de la lactosa con formacin de cido butrico y gas.
Es caracterstica de las bacterias del gnero Clostridium y se caracteriza
por la aparicin de olores ptridos y desagradables.

4. Qu organismo es Saccharomyces cerevisiae? Qu tipo de carbohidratos

puede metabolizar?

Levadura es un nombre genrico que agrupa a una variedad de hongos,

incluyendo tanto especies patgenas para plantas y animales, como especies
no solamente inocuas sino de gran utilidad.
Dentro del gnero Saccharomyces, la especie cerevisiae constituye la levadura
y el microorganismo eucariote ms estudiado. Este organismo se conoce
tambin como la levadura de panadera. El inters alimentario de
Saccharomyces cerevisiae se debe a la capacidad de dicho organismo de
esponjar el pan y por otra parte por el producto final que se obtiene de la
fermentacin alcohlica (la cerveza y el vino). Estos procesos ocurren debido a
la metabolizacin de los azcares de la masa o el mosto (esencialmente
glucosa, fructosa, sacarosa o maltosa) para generar dixido de carbono y
alcohol etlico o etanol.
5. Investiga las rutas metablicas que realiza Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae es un microorganismo que puede llevar a cabo un
metabolismo respiratorio o fermentativo de acuerdo a la concentracin de
oxgeno. En condiciones aerobias aumenta la biomasa y produce poco alcohol,
pero en anaerobiosis el crecimiento celular es lento y la produccin de etanol
es alta.
6. Explica con detalle la gluclisis. Incluye frmulas y enzimas que participan.
La gluclisis (o gliclisis) es una va catablica a travs de la cual tanto clulas
de los animales como vegetales, hongos y bacterias oxidan diferentes
molculas de glcidos y obtienen energa.

7. Cules son los posibles destinos metablicos del piruvato?

8. Qu regulacin presenta la glucolisis?

Probablemente el mecanismo de control ms efectivo para el funcionamiento
de la glucolisis es el ejercido por el ADP. La fosforilacin oxidativa requiere de
ADP para poder funcionar y ste es el que controla la velocidad respiratoria. En
la glucolisis el control por ADP es ms evidente, dado que esta sustancia
participa en dos de las reacciones como sustrato. El papel regulador del ADP se
refiere ms bien al hecho de que cuando mayor se la cantidad de ste, mayor
ser la velocidad de la glucolisis, y viceversa.
9. La tasa de fermentacin se afecta con la temperatura?
La temperatura al igual que el pH tiene un rol fundamental en la seleccin de
las especies de levadura que llevaran a cabo la fermentacin alcohlica, as
como tambin del comportamiento de las poblaciones de cada una de las
especies involucradas. En el contexto general, las levaduras presentan
desarrollos poblacionales exitosos en el rango de temperaturas que varia entre
los 10 y 32C. Sin embargo dependiendo del rango donde se lleve a cabo la
fermentacin existir predominancia de una u otra especie.
10.Qu efecto provoca el NaF sobre la glucolisis? Afecta a alguna enzima en
especial? Cul y Cmo?

El fluoruro de sodio en disolucin acuosa y en el interior de la clula es capaz

de formar un complejo con el catin magnesio y el anin fosfato inhibiendo la
enzima enolasa, responsable de la reaccin de formacin de 2fosfoenolpiruvato a partir de 2-fosfoglicerato (desprendindose una molcula
de agua). En presencia de elevadas concentraciones del inhibidor fluoruro, ste
compite activamente con el sustrato propio de la enzima por el centro activo,
reducindose la produccin de piruvato y restringindose el proceso catablico
de respiracin/fermentacin.

Bibliografa
Respiracin celular
http://javeriana.edu.co/biblos/tesis/ciencias/tesis285.pdf

bioqumica. 2004 editorial Limusa. Antonio Pea

glucolisis
http://www.fagro.edu.uy/~bioquimica/docencia/material
%20nivelacion/GLUCOLISIS.pdf

Revista Eureka sobre enseanza y divulgacin de las ciencias 10(1), 133-138,

2013 Estudio de la inhibicin de la respiracin/fermentacin en clulas de
levadura por fluoruro de sodio

Jos Pedro Lpez Prez, Raquel Boronat

Gil
http://reuredc.uca.es/index.php/tavira/article/viewFile/330/pdf_117