Anlisis y tratamiento de seales espiromtricas mediante

transformada de Fourier para evaluar el funcionamiento

pulmonar y detectar enfermedades de carcter respiratorio

Aplicacin del anlisis de Fourier en el rea mdica.

Universidad de Guadalajara, Guadalajara, Jal.

vila Prez Jonathan de Jess

Gonzales Crdenas Cesar Gerardo
Herrera Len Roseli
Villanueva Muoz Astrid Victoria
19 de Mayo 2015.

Tabla de Contenidos
Resumen.
Introduccin.
1. Marco Terico
1.1 Seales ..........................................................................................................................5
1.2 Analisis de Fourier......................................................................................................6
1.3 Muestreo de seales continuas....................................................................................9
1.4 Seal Espirometrica..................................................................................................11
2. Desarrollo........................................................................................................................1
Captulo 2 Figuras y tablas.................................................................................................2
Ttulo 2.............................................................................................................................2
3. Desarrollo........................................................................................................................2
Ttulo 3.........................................................................................................................2
Captulo 4 Resultados y discussion....................................................................................5
List of References................................................................................................................6
Apndice..............................................................................................................................7
Vita.......................................................................................................................................8

Resumen
Este proyecto tiene como propsito demostrar la importancia de la transformada de Fourier en el
tratamiento digital de bioseales, su empleo en el proceso para obtener resultados utilizados en el
campo de la medicina para monitorear y diagnosticar enfermedades. Este documento presenta el
proceso matemtico por el cual se calculan valores que registra la funcin pulmonar a travs de
un espirmetro.

Introduccin
En el Diccionario de la Real Academia Espaola, se define seal entre otras
acepciones- como
15. f. Fs. Variacin de una corriente elctrica u otra magnitud que se utiliza
para transmitir informacin.

En todo el cuerpo humano se producen una gran variedad de seales elctricas,

provocadas por actividades que tienen su ubicacin en los msculos y nervios que lo
integran. El corazn por ejemplo es conductor de un patrn caracterstico de las variaciones
de voltaje. El registro y anlisis de estos eventos bioelctricos son importantes desde el punto
de vista de la investigacin.
Tanto si la informacin que transmitimos es biolgica

(EEG, EKG, EMG) como

de cualquier otra procedencia (econmica, meteorolgica), las seales con una

variacin continua podrn ser convertidas en series de nmeros se dir que se

digitalizan- y las series de nmeros podrn ser tratadas para extraer la informacin
que contienen. La forma ms universalmente utilizada para tratar seales, sea cual sea
su procedencia es el anlisis de Fourier.
Este trabajo en particular pretende analizar la bioseal que el organismo genera y su
representacin (Espirometrica) para la obtencin de resultados que puedan ser utilizados
para un mejor y ms preciso diagnstico utilizando el anlisis de Fourier.

Seales

Una seal es un medio de transmisin de informacin. Para obtener informacin sobre

la fuente de la seal, o para modificar dicha seal, suele ser necesario aplicar algn
tipo de operaciones. Tambin en el caso de imgenes (seales 2D o 3D) puede ser
necesario aumentar el contraste, suavizar, eliminar ruido, detectar bordes, etc. Se
necesita, pues, aplicar un tratamiento especial para extraer la informacin deseada.
Esta fase de aplicacin suele denominarse preprocesado.

Una vez extrada la informacin, puede ser interesante compararla con las obtenidas
en otros casos, e intentar clasificarla dentro de alguno de estos tipos (patologas, etc.).
En este supuesto, el procesado digital realiza una tarea de ayuda al diagnstico. Otra
ocasin en que es necesario aplicar un tratamiento a la seal es cuando se desea
transmitir o almacenar eficientemente gran cantidad de informacin con vistas a un
mejor aprovechamiento del ancho de banda de transmisin disponible o a una
optimizacin de los dispositivos de memoria masiva, requirindose una compresin
de los datos que permita reducir el tiempo de transmisin, la cantidad de datos a
transmitir y/o almacenar, y su correcta reconstruccin.

Anlisis de Fourier

El anlisis de Fourier surgi a partir del intento de ste matemtico francs por hallar
la solucin a un problema prctico, la conduccin del
calor en un anillo de hierro. Demostr que se puede
obtener una funcin discontinua a partir de la suma de
funciones continuas. Esta tesis fue defendida por Fourier
ante la Academia Francesa, lo que motiv severas
objeciones de los matemticos ms importantes de su
poca como Lagrange, Laplace, etc.

A primera vista, parece que el problema de analizar formas de ondas complejas

representa una tarea formidable. Sin embargo, si la forma de la onda es peridica, se
puede representar con una precisin arbitraria, mediante la superposicin de un
nmero suficientemente grande de ondas senoidales que forman una serie armnica.

Toda funcin f(t) peridica de periodo P, se puede representar en forma de una suma
infinita de funciones armnicas, es decir,

donde el periodo P=2/, y a0 a1 ...ai ... y b1 b2 .... bi .... son los denominados
coeficientes de Fourier.
Conocida la funcin peridica f(t), calculamos los coeficientes ai y bi del siguiente
modo

Las integrales tienen como lmite inferior -P/2 y como lmite superior P/2.

En el programa interactivo, transformamos la funcin peridica de periodo P, en otra

funcin peridica de periodo 2, mediante un simple cambio de escala en el eje t.
Escribiendo x= t, tendremos el periodo P de t convertido en el periodo 2 de x, y la
funcinf(t) convertida en

definida en el intervalo que va de - a +. La serie se expresa en la forma ms simple

donde

Si la funcin g(x) tiene simetra, algunos de los coeficientes resultan nulos.

Si g(x) es una funcin par, g(x)=g(-x), los trminos bi son nulos
Si g(x) es impar g(x)=-g(-x), los coeficientes ai son nulos.
8

Muestreo de seales continas.

Las seales

biolgicas

-EKG, EEG, EMG o potencial de

membrana- varan

de

manera continua, as como su representacin como seales elctricas. Sin embargo

de ese modo no pueden ser registradas en un archivo en un ordenador, ni se
puede hacer ningn tratamiento con la informacin que contienen. Para ello deber
tomarse una serie de muestras valores de la seal en un instante de tiempo- en
forma de series de nmeros, y sta debe ser representativa de la seal, y no perder
la informacin que contiene.

La forma habitual de hacer esta transformacin es tomar

muestras a intervalos

regulares de tiempo. A este proceso lo llamaremos muestrear o digitalizar la seal. La

velocidad a que se toman esas muestras, medida normalmente en nmero de
muestras por segundo, se llamar velocidad de muestreo, y su eleccin es muy
9

importante para no perder la informacin que contiene la seal, y tambin para no

generar un archivo de datos demasiado grande.

En los grficos de abajo pueden verse diferentes seales

que representan el muestreo hecho.

y diferentes puntos

En algunos casos es muy claro que

los

puntos no representan bien la seal.

Figura 1. Muestreo de seales

Column One

Column Two

10

SEAL ESPIROMETRICA
La espirometra es prueba fundamental para la evaluacin de la funcin
pulmonar y recurso til para el diagnstico y vigilancia de alteraciones
respiratorias crnicas, como asma y enfermedad pulmonar obstructiva crnica
(EPOC), trastornos que afectan a millones de personas en el mundo.

Este examen que mide el tamao de los pulmones y el calibre de los bronquios,
consiste en soplar, lo ms fuerte posible, a travs del tubo o boquilla del
espirmetro, aparato que ayuda a calcular los volmenes y capacidades
pulmonares, en general su funcionamiento es para medir la capacidad de tus
pulmones y qu tan bien estn funcionando, de tal manera que, de acuerdo a
ciertos parmetros, ayuda a determinar la presencia de algunas enfermedades
que comprometen estos rganos, y de igual forma evaluar el progreso de las
mismas.

Por tanto, sirve para:

Determinar causas de falta de aire, tos o sibilancia.

Monitorear la respuesta al tratamiento de problemas respiratorios.

11

Evaluar la funcin pulmonar antes y despus de una ciruga que

implique trasplante o sea de otra ndole.

Estimar el riesgo de EPOC y dar seguimiento a personas

fumadoras y con exposicin a sustancias en su lugar de trabajo.

Facilitar el tratamiento antitabaco en personas fumadoras, segn

los resultados.

Diagnosticar asma o en qu grado se padece (leve, moderado,

severo).

Detectar fibrosis qustica.

Pronosticar esperanza de vida del paciente, ya que relaciona la

dificultad para respirar con la calidad de vida de los enfermos.

12

Las partes real e imaginaria de la transformada de Fourier

F( ) son:

R ( )= f ( t ) cost dt ,

X ( )= f ( t ) sint dt .

F ( )=R ( ) jX ()

X ( )=a sin ( bt +c ) sin ( t ) dt

sinsin=

1
[ cos ( )cos ( + ) ]
2

1
a cos ( bt +ct )cos ( bt +c +t) dt
2

1
1
a cos [ ( b ) t +c ] dt a cos [ t ( b+ ) +c ] dt
2
2
u=t ( b+ )
du=( b+ ) dt

1
1

a cos ( c+ u ) du+ a cos [( b ) t +c ] dt

2
2 ( b+ )
s=c+u
ds=du

1
1

a [ sin (s ) ] + a cos [ ( b ) t+ c ] dt
2
2 ( b+ )
p=t ( b )
dp=( b ) dt

a sin ( s)
1

+
a cos ( c + p ) dp
2 ( b+ ) 2(b)
v =c+ p
dv=dp
13

a sin ( s)
1
+
a cos ( v ) dv
2(b)
2 ( b+ )

a sin ( s ) a sin ( v )
a ( b+ ) sin ( v )+ a ( b ) sin ( s)

+
+ constante=
+ const
2 ( b+ ) 2 ( b )
2(b)(b+)
Sustituir v y s por sus valores correspondientes:
a ( b+ ) sin ( c + p ) +a ( b ) sin ( c +u)

+ const
2(b)(b+ )
a ( b+ ) sin [ c +t (b) ] + a ( b ) sin [ c +t (b+ ) ]

+const
2( b)(b+)
a sin [ c+ ( b ) t ] a sin [ c+ ( b+ ) t ]

+ const .
2 ( b )
2 ( b+ )
1 sin [ c+ ( b ) t ] sin [ c+ ( b+ ) t ]
a

+ const .
2
( b )
( b+ )

a sin ( bt +c ) cos ( t ) dt

sincos =

1
[ sin ( )+sin ( + ) ]
2

1
[ sin ( bt+ ct ) +sin ( bt+ c+ t ) ] dt
2

1
1
a sin [ ( b ) t+ c ] dt + a sin [ ( b+ ) t+ c ] dt
2
2
u= ( b+ ) t
p=( b ) t
du=( b+ ) dt
dp=( b ) dt

1
1
a sin ( c + p ) dp+
a sin ( c+u ) du
2( b)
2(b+ w)
s=c+u
v =c+ p
ds=du
dv=dp

1
1
a sin ( v ) dv +
a sin ( s ) ds
2(b)
2(b+ w)
a cos ( v) a cos ( s )

+const
2(b) 2 ( b+ )
Sustituir por los valores correspondientes:
a cos ( c+ p) a cos ( c +u )

+ const
2(b)
2 ( b+ )

14

a cos [ c+ ( b ) t ] a cos [ c + ( b+ ) t ]

+const
2(b)
2 ( b+ )

15

Lista de referencias
Andrews, S. Fastqc, (2010). A quality control tool for high throughput sequence data.
Augen, J. (2004). Bioinformatics in the post-genomic era: Genome, transcriptome, proteome, and
information-based medicine. Addison-Wesley Professional.
Blankenberg, D., Kuster, G. V., Coraor, N., Ananda, G., Lazarus, R., Mangan, M., ... & Taylor, J.
(2010). Galaxy: a webbased genome analysis tool for experimentalists. Current protocols
in molecular biology, 19-10.
Bolger, A., & Giorgi, F. Trimmomatic: A Flexible Read Trimming Tool for Illumina NGS Data.
URL http://www. usadellab. org/cms/index. php.
Giardine, B., Riemer, C., Hardison, R. C., Burhans, R., Elnitski, L., Shah, P., ... & Nekrutenko, A.
(2005). Galaxy: a platform for interactive large-scale genome analysis. Genome research,
15(10), 1451-1455.

16

Apndice
Las tablas y figuras pueden ir en el apndice como se mencion anteriormente. Tambin
es posible usar el apndice para incluir datos en bruto, instrumentos de investigacin y material
adicional.

17

Vita
Ac se incluye una breve biografa del autor de la tesis.

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