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CENTRO DE CINCIAS
DEPARTAMENTO DE FSICA
GRADUAO EM FSICA
FORTALEZA
2014
Monografia de Bacharelado
apresentada Coordenao da
Graduao do Curso de Fsica, da
Universidade Federal do Cear,
como requisito parcial para a
obteno do Ttulo de Bacharel em
Fsica.
Orientador: Paulo de Tarso
Cavalcante Freire
FORTALEZA
2014
BANCA EXAMINADORA
.
Monografia de final de curso / Joo Paulo Nobre Soares, 2014.
12 f.:il.
Monografia (bacharelado) - Universidade Federal do Cear, Centro
de Cincias,
Departamento de Fsica, Fortaleza, 2014.
Orientao: Paulo de Tarso Cavalcante Freire
I. Espectroscopia vibracional em L-Cistena HCl sob
condies ambientes.
Agradecimentos
Aomeuorientador,Prof.PaulodeTarsoCavalcanteFreire,peladedicao,assistncia
epacinciadurantetodoesseprocesso.
Atodosmeusprofessoresquemeajudaramduranteaminhagraduao.
Aminhameemeusirmosportodaaestruturaqueelesmeforneceram.
Aosmeusamigosdesalapelocompanheirismoeporsempremeajudaremquando
precisei,especialmenteaoDanielLinhares.
AoCNPqpeloapoiofinanceiro.
Resumo
Nestetrabalhofoiestudadoocomportamentodosmodosvibracionaisdeumdos
20aminocidosqueformamasprotenasquesoencontradasnosseresvivos,aLcistena
HCl.MaisespecificamenteforaminvestigadospolicristaisdeLcistena.Asamostras
utilizadasnapesquisaestavamemformadep.Paratalestudofoiutilizadaaespectroscopia
Ramancomocristalsubmetidoacondiesambientes.Aregioespectralestudadafoiade
nmerodeondaentre15cm1e3250cm1.Adicionalmentefoirealizadoumatentativapara
classificarosmodosnormaisdevibraodaLCistenaHClbaseadoemoutrosestudos
realizadossobreomesmoaminocido.
Abstract
Thisworkstudiedthebehaviorofvibrationalmodesofoneofthe20aminoacidsthat
formtheproteinsthatarefoundinlivingorganisms,LCysteineHCl.Thesamplesusedinthe
studywereinthepowderform.Forthisstudy,Ramanspectroscopywasemployedunder
ambientconditions.Thespectralrangestudiedspannedthewavenumberregionbetween15
cm1and3250cm1.Thegraphobtainedfromtheseregionsattemptsweremadetoclassifythe
normalmodesofvibrationofLCysteineHClbasedonotherstudiesonthesameaminoacid.
Lista de Figuras
Figura 1.1: Estrutura geral de um aminocido........................p.12
Figura 1.2: Enantiomeros Cistena..............................p.13
Figura 1.3: Estrutura da L-Cistena..............................p.13
Figura 1.4: Tiol com um grupo sulfrifrila destacado em azul................p.13
Figura 2.1: (a) As rotaes nos 3N graus de liberdade duas para linear; (b) 3 para no
linear.................................................
..p.17
Figura 2.2: Modos de vibrao molecular. Os sinais X e representam para fora e para dentro
do plano, respectivamente..................................p.19
Figura 2.3: Deslocamentos de planos de tomos devido a uma onda longitudinal. Pontos
escuros representam os tomos em sua posio de equilbrio e setas representam os
deslocamentos dos planos.....................................
.......p.20
Figura 2.4: Ramos tico e acstico da relao de disperso par a uma rede diatmica linear.
Mostram-se as frequncias limitadas por K = 0 e K =
...................
a
p.21
Figura 3.1 : L-cistena cloridrato p.............................p.22
Figura 3.2: Espalhamento Raman na geometria de retro-espalhamento..........p.23
Figura 3.3: Espectrmetro Raman T64000 (a direita da figura)..............p.24
Figura 4.1: Espectro Raman do cido L-cistena HCl temperatura ambiente na regio
espectral entre 15 cm1 e 650 cm1................................
..p.25
Figura 4.2: Espectro Raman do cido L-cistena HCl temperatura ambiente na regio
espectral entre 650 cm1 e 1300 cm1..............................
...p.27
Figura 4.3: Espectro Raman do cido L-cistena HCl temperatura ambiente na regio
espectral entre 1300 cm1 e 1950 cm1.............................
..p.28
Figura 4.4: Espectro Raman do cido L-cistena HCl temperatura ambiente na regio
espectral entre 1950 cm1 e 2600
cm1................................p.29
Figura 4.5: Espectro Raman do cido L-cistena HCl temperatura ambiente na regio
espectral entre 2600 cm1 e 3250
cm1................................p.30
Lista de Tabelas
Tabela 4: Legenda indicando o significado de cada abreviatura do modos de vibraes..p.
24
Tabela 4.1: Classificao dos modos de vibrao Raman ativos da L-cistena HCl observados
temperatura ambiente no intervalo entre 15 cm 1 e 650 cm1...............
p.25
Tabela 4.2: No intervalo espectral de 650 cm-1 a 1300 cm-1 da L-cistena HCl foram
encontrados 13 modos que esto visveis na figura 4.2 e listados na tabela
4.2.............p.26
Tabela 4.3: Classificao dos modos de vibrao Raman ativos da L-cistena HCl observados
temperatura ambiente no intervalo entre 1300 cm 1 e 1950 cm1............p.27
Tabela 4.4: Classificao dos modos de vibrao Raman ativos da L-cistena HCl observados
temperatura ambiente no intervalo entre 1950 cm 1 e 2600 cm1............p.28
Tabela 4.5: Classificao dos modos de vibrao Raman ativos da L-cistena HCl observados
temperatura ambiente no intervalo entre 2600 cm 1 e 3250 cm1............p.29
Sumrio
Introduo.......................................................................................................11
1. Aminocidos...................................................................................................12
1.1 Enantimeros............................................................................................12
1.2 Cistena.....................................................................................................13
2. Espectroscopia Raman...................................................................................14
2.1 Teoria clssica do espalhamento Raman..................................................15
2.2 Vibraes moleculares..............................................................................16
2.3 Classificaes das vibraes.....................................................................18
Concluses e Perspectivas..............................................................................31
Referncias Bibliogrficas.....................................................................................32
13
Introduo
Osaminocidos so unidades estruturais bsicas que compem as protenas.
investigaramseaspropriedadesvibracionaisdocristaldeLcistenaHClatravsde
espectroscopiaRamaneocomportamentodestesobtemperaturaambiente.
14
Princpios tericos
1. Aminocidos
Os aminocidos so molculas orgnicas formadas por tomos de carbono(C),
1.1 Enantimeros
Enantimetros so molculas orgnicas que so chamadas assim devido a sua
forma, pois para cada enantimero, existe uma forma igual porm invertida, como se fosse o
reflexo de um espelho.
15
Quando a luz incide sobre uma amostra, os ftons que a compem podem ser
absorvidos, espalhados pela matria ou at mesmo passar atravs sem sofrer nenhuma
alterao[2]. Quando uma soluo que contm um enantimero submetida a isso, ela pode
desviar o plano para a direita ou para a esquerda. Se o plano desviado para a esquerda, diz
que a substncia levorrotatria ou levogira, representada pelo prefixo L. Se o plano for
desviado para a direita dextrorotatria ou dextrogira, representada pelo prefixo D.
1.2 Cistena
A cistena (C3H7NO2S) um dos aminocidos codificados pelo cdigo
gentico, sendo, portanto, um dos componentes das protenas dos seres vivos. Em sua
estrutura possui um composto organossulfurado que contm um grupo SH, tambm
conhecido como tiol. Alguns alimentos ricos em cistena so alho, cebola, aveia.
16
2. Espectroscopia Raman
A espectroscopia Raman uma tcnica onde usada uma fonte de luz
monocromtica a qual, ao atingir a amostra, ela espalhada, gerando luz com a mesma
energia ou de energia diferente da incidente. Caso a luz gerada possua a mesma energia da luz
incidente o espalhamento chamado de elstico e se a energia for diferente chamado de
espalhamento inelstico. A partir do espalhamento inelstico podemos obter muitas
informaes importantes sobre a composio e ligaes qumicas da amostra a partir dessa
diferena de energia.
Na prtica, um feixe de radiao laser monocromtico de baixa potncia
utilizado para iluminar pequenas reas do objeto e quando incide com a superfcie,
espalhado em todas as direes sendo apenas uma pequena parcela dessa radiao espalhada
inelsticamente. Esse fenmeno foi observado pela primeira vez por Chandrasekhara Venkata
Raman, na ndia, por isso chamamos de efeito Raman.
Os processos do espalhamento inelstico so classificados de duas formas: se a
frequncia da radiao espalhada for menor que a frequncia da radiao incidente, o
processo ir absorver energia, esse espalhamento denominado de Stokes e a frequncia final
do fton dada por 0 - . Caso a radiao espalhada tenha uma frequncia maior do que a
radiao incidente, o processo cedeu energia, que foi retirada do meio espalhador e
transformada em energia do campo de radiao. Esse processo chamado de anti-Stokes e a
frequncia final do fton dada por 0 + , onde 0 a frequncia inicial do fton.
No espalhamento de Raman Stokes a molcula absorve um fton de energia
hv0 excitando-a para um estado intermedirio. Com isso ela imediatamente passa para um
estado de maior energia do que o inicial, emitindo ou espalhando um fton de energia. No
caso do espalhamento anti-Stokes a partcula j est em um estado vibracional excitado,
depois de emitir um fton, ele pode cair para um estado menos energtico. Significando que
alguma energia vibracional da molcula foi convertida em energia do fton espalhado. A
17
Figura 1.5: (a) Espalhamento Raman Stokes; (b) Espalhamento Raman anti-Stokes.
p E
(2.1.1)
E = E 0 cos(20t)
(2.1.2)
p E cos(2 t)
0
0
(2.1.3)
18
sistema.Consideramosqueosmovimentosdevibraopossamserdescritosemmodos
normais,comfrequnciasbemdefinidas.Iremossuporqueapolarizabilidadesejadependente
dessasvibraes.Assimpodemosescreveraequao:
(2.1.4)
1
p 0 E 0 cos( 2 0t ) E 0 n [cos 2 ( n )t cos 2 ( n )]
2
(2.1.
5)
( )(
(2.1.6
)( )
Px
xx xy xz E x
P y = yx yy yz . E y ,
Pz
zx zy zz E z
onde o tensor formado pelas componentes ij, um tensor simtrico, isto quer dizer que: xy =
yx, xz = zx e yz = zy.
Escrevendo em torno da posio de equilbrio em termos de Qk na forma de uma
srie de Taylor:
ij =
ij
ij
Qk
Qk
0
1 ij
2 k ,l Qk Ql
(2.1.7
Qk Ql
0
19
2 v t
) e
q=q 0 cos
E=E 0 cos(2 0 t )
(2.1.8
)
1
E 0 [cos2 ( i ) cos2 ( i )t ]
2
Qi
p 0 E 0 cos( 2 0 )
i
(2.1.9
)
20
Figura 2.1: (a) As rotaes nos 3N graus de liberdade duas para linear; (b) 3 para no linear.
1
n
2
E( h
(2.2.
1)
(2.2.
2)
21
Adeformaoaxial,ouestiramento,sooscilaesradiaisquefazcomquea
distnciaentreosncleosaumenteoudiminua,ondealgumasligaespodemseestirarem
fase(stretchingsimtrico)ouforadefase(stretchingantissimtrico).Jadeformaoangular
envolvemudanadosngulosentreasligaes,oucomonadedeformaoantissimtrica,
foradoplano.
Figura 2.2: Modos de vibrao molecular. Os sinais X e representam para fora e para dentro do
plano, respectivamente.
22
Figura 2.3: Deslocamentos de planos de tomos devido a uma onda longitudinal. Pontos escuros
representam os tomos em sua posio de equilbrio e setas representam os deslocamentos dos planos[6].
=2
f
a
sen
m
2
()
(2.3.
1)
23
Figura 2.4: Ramos tico e acstico da relao de disperso para uma rede diatmica linear.
Mostram-se as frequncias limitadas por K = 0 e K =
[7].
a
24
3. Procedimento experimental
Neste captulo ser descrito como se realizou o procedimento experimental
durante o desenvolvimento desse trabalho. Na primeira seo sero mostradas as amostras que
foram utilizadas no experimento e na segunda seo o equipamento utilizado para obter mais
informaes sobre a amostra.
25
26
27
Abreviatura
Significado
Str. sim.
Estiramentosimtrico(Streching)
Str. assim.
Estiramentosimtrico(Streching)
Sci
Tesoura(Scissor)
Toro(Twist)
Dobramento(Bending)
Balano(Rocking)
Sacudida(Wagging)
28
Tabela 4.1: Classificao dos modos de vibrao Raman ativos da L-cistena HCl observados
temperatura ambiente no intervalo entre 15 cm 1 e 650 cm1.
1
Modo
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
Nmerodeonda(cm )
70
81
108
157
194
289
355
388
457
526
611
Identificao
rede
rede
rede
(SH)
b(CCC)
(NH3)
b(CCN)
r(CO2)
str(CS)
29
Figura 4.1: Espectro Raman do cido L-cistena HCL temperatura ambiente na regio espectral entre 15 cm1
e 650 cm1.
Modo
12
Nmerodeonda(cm )
683
Identificao
str(CS)
30
739
777
847
869
929
990
1059
1111
1140
1209
1224
1272
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
r(CH2)
b(CO2)
str(CC)
b(SH)
r(NH3)
r(NH3)
b(CH)
t(CH2)
Figura 4.2: Espectro Raman L-cistena HCl temperatura ambiente na regio espectral entre 650
1
cm cm e 1300 cm cm1.
31
Tabela 4.3: Classificao dos modos de vibrao Raman ativos da L-Cistena HCl observados
temperatura ambiente no intervalo entre 1300 cm 1 e 1950 cm1.
1
Modo
25
26
27
28
29
30
Nmerodeonda(cm )
1315
1350
1403
1428
1579
1743
Identificao
str. sim.(CO2)
b. assim.(NH3)
str. assim.(CO2)
Figura 4.3: Espectro Raman L-cistena HCl temperatura ambiente na regio espectral entre 1300
cm1 e 1950 cm1.
Modo
31
Nmerodeonda(cm )
2566
Identificao
str (SH)
32
Figura 4.4: Espectro Raman L-cistena HCl temperatura ambiente na regio espectral entre 1950
cm1 e 2600 cm1.
Modo
32
33
Nmerodeonda(cm )
2947
2995
Identificao
str (CH)
str. assim.(CH2)
33
Figura 4.5: Espectro Raman L-cistena HCl temperatura ambiente na regio espectral entre 2600
cm1 e 3250 cm1.
34
Concluses e Perspectivas
NestetrabalhofoiestudadoocomportamentodosespectrosRamandospolicristais
doaminocidoLcistenaHCLsobacondiodetemperaturaambiente.Apartirdo
experimentoutilizandoespectroscopiaRamanfoipossvelidentificareclassificaramaioria
dosmodosnormaisdevibraodaLcistenaHCLnointervaloentre15cm1at3250cm1
possibilitandoumamelhorcompreensodoaminocidoutilizado.
Apsesseestudopossvelutilizaressesresultadosparaumtipodepesquisaainda
maisavanadaondeaoinvsdeanalisarocristalsobcondiesambientespoderemos
verificaroqueacontecequandovariamosatemperaturaeapressoparatalvezencontrar
algumpolimorfismo.
35
Referncias Bibliogrficas
1
ALLINGER, N.D. Qumica orgnica, 3ed. Rio de Janeiro: Editora Guanabara Dois,
captulo 6, 1983.
2
3
4
5
6
7
SMITH,E.;DENT,G.ModernSpectroscopy:APracticalApproach.[S.l.]:John
Willeyandsons,2005.
PATAI, SAUL The chemistry of the thiol group Saul Patai, Ed. Wiley, London, 1974.
FERRARO,J.R.;NAKAMOTO,K.;BROWN,C.W.IntroductoryRaman
Spectroscopy.[S.l.]:Elsevier,2003.
CAMPBELL, MARY K. Bioqumica. 3 edio, Artmed, 2006.
AMABIS, JOS MARINHO. Biologia. Volume 1. Editora Moderna.
PAUL M. DEWICK (2009). Medicinal natural products: a biosynthetic approach. John
Wiley and Sons.
MOGGACH, S. A., ALLAN, D. R., MORRISON, C. A., S. PARSONS and SAWYER ,L.
Acta Cryst. Section B. 61, 58, (2005).
(2006).
10 CHVEZ,M.I.A.DeposioecaracterizaodefilmesdeSiO2crescidospela
tcnicadePECVDabaixatemperatura.Dissertao(Mestrado)EscolaPolitcnica
daUniversidadedeSoPaulo.
11 FERNANDES,C.R.EspalhamentoRamandependentedatemperaturaemcristais
decidoDLasprtico.Dissertao(Mestrado)UniversidadeFederaldoCear,
2010.
12 KITTEL,C.IntroduoFsicadoEstadoSlido.RiodeJaneiro:LTC,2006.
13 LONG, D. A. The Raman Effect. [S.l.]: John Willey and sons, 2002.