Unidad 3: Taller de Espectroscopia

aplicada a Frmacos
Marco Terico
La elucidacin estructural es fundamental en el descubrimiento y desarrollo de
nuevos frmacos, pues permite, al combinar la informacin obtenida mediante la
aplicacin de diversas tcnicas espectroscpicas y espectromtricas, establecer la
estructura qumica de una molcula, un hecho fundamental para entender la forma
en cmo se da la interaccin entre el frmaco y su diana biolgica. Las tcnicas
espectroscpicas y espectromtricas ms comnmente empleadas en la
elucidacin estructural de frmacos son: Ultravioleta visible (UV VIS), Infrarrojo
(IR), Resonancia Magntica de Protn 1H-RMN, y Carbono 13C-RMN y
Espectrometra de Masas (EM) (ver Tutorial ANEXO).

ESPECTROSCOPIA DE INFRARROJO (IR)

Esta tcnica se fundamenta en el hecho de que los enlaces moleculares
presentan estados vibracionales y rotacionales, que dependen del tipo de
tomos que los constituyen y de su momento dipolar (es un requisito que en
este caso sea distinto de 0). La incidencia de la radiacin IR (: 800 40000
nm aprox) ocasiona que este momento dipolar sufra pequeas alteraciones
(sin ruptura ni generacin de nuevos enlaces) originando fundamentalmente
dos tipos de vibracin: a) Estiramientos (requieren mayor energa) y b)
Flexiones de enlace, que estn asociados con seales de absorcin
especficas que se registran en lo que se denomina Espectro IR
(estiramientos: seales en la regin izquierda del espectro y flexiones: en la
regin derecha del espectro). Todo esto, permite que se puedan establecer
tablas de correlacin entre la frecuencia de la seal generada y el grupo
funcional al cual pertenece el enlace que la genera. La integracin de esta
informacin permite establecer qu tipo de grupos funcionales componen la
molcula que se est analizando (ver Tutorial ANEXO).

ESPECTROSCOPIA O ESPECTROFOTOMETRA DE ULTRAVIOLETAVISIBLE (UV VIS)

En este caso las seales de absorcin, son generadas principalmente por las
transiciones electrnicas ( , , , etc), producidas por la incidencia
de radiacin correspondiente a la regin Ultravioleta y Visible del espectro
electromagntico (: 190 800 nm). Las transiciones de los electrones
(presentes en dobles enlaces) son de gran utilidad en el anlisis de
compuestos insaturados o compuestos que contienen enlaces . Esta tcnica
espectroscpica permite obtener informacin acerca de la presencia de:
insaturaciones, grupos cromforos (sistemas conjugados pi) y grupos
aromticos en la molcula analizada.

ESPECTROMETRA DE RESONANCIA MAGNTICA NUCLEAR (RMN)

En esta tcnica espectroscpica el requisito fundamental es que la estructura
molecular que se pretenda elucidar presente un momento magntico de spin
(ncleo del tomo) distinto de 0, ya que este es el que se ve alterado por la
influencia de un campo magntico controlado generado por una fuente externa
(campo de radiofrecuencia generado por el imn del equipo). Dos modalidades
de RMN comnmente empleadas en la elucidacin estructural de molculas
orgnicas son:

1H-RMN:

La RMN de hidrgeno, permite obtener un espectro en donde las seales

muestran la ubicacin (desplazamiento qumico) y disposicin de los
hidrgenos (especficamente istopos 1H cuyo spin es ) en la molcula
analizada. Esto se da en funcin de la proteccin o desproteccin
electrnica que generan los tomos a los cuales estn directamente
enlazados o los tomos adyacentes, permitiendo conocer los ambientes
qumicos en los que se encuentran los diferentes protones que componen la
molcula (Nota: tenga presente que los electrones son partculas cargadas
que giran y producen un campo magntico secundario que se opone al
campo aplicado). Comnmente se habla de que un espectro de RMN est
compuesto de dos regiones: Campo alto (regin haca la derecha del
espectro) donde se ubican las seales de los H con mayor proteccin

electrnica (H en metilos, metilenos, etc) y Campo bajo (regin a la

izquierda del espectro) donde se ubican las seales de los H con mayor
desproteccin electrnica (aromticos principalmente). Otro tipo de
informacin que brindan estos espectros, es que las seales pueden verse
divididas en funcin de los hidrgenos vecinos, a lo cual se le denomina
acoplamiento. Adicionalmente, el espectro indica la integracin, que es la
intensidad relativa de cada seal, proporcional al nmero de protones que
la componen (ver tutorial ANEXO).

13C-RMN:

En este caso, el principio es el mismo que para 1H-RMN y por lo tanto la

informacin que brindan es muy similar. Las principales diferencias, al
compararlo con el espectro de RMN de protn, radican en:
Los espectros de 13C son ms sencillos, ya que, dependiendo del nmero
de carbonos no equivalentes, las seales aparecen como singletes.
En el espectro de 13C no se observan acoplamientos 13C-13C debido a su
baja abundancia natural.
La escala de los desplazamientos qumicos en 13C es mayor, yendo desde
0 hasta un poco ms de 200 ppm (en 1H-RMN va desde 0 hasta 14 ppm).
La integracin de las seales en el espectro de 13C no es posible, fenmeno
que si ocurre en los espectros de hidrgeno.
Como ventaja fundamental se tiene que el espectro de carbono 13
proporciona informacin directa acerca los tomos de carbono que
componen la molcula, lo que en 1H-RMN se obtendra de forma indirecta.
Adems, el espectro de 13C brinda informacin acerca de carbonilos y de
tomos de carbono cuaternarios. (Ver tutorial ANEXO)

ESPECTROMETRA DE MASAS
Est tcnica se vale de la ionizacin de las molculas a causa del bombardeo
de la molcula con un haz de partculas de alta energa. Los electrones son el
tipo de partcula ms utilizada (ESPECTROMETRA DE IMPACTO
ELECTRNICO). La ionizacin de la molcula genera un patrn de
fragmentacin caracterstico que depende de la estructura qumica de la misma
y sirve, por comparacin con un patrn, para la identificacin de la misma.
Cada fragmento producido genera una seal cuya intensidad y ubicacin
depende de su abundancia relativa (% respecto del fragmento ms abundante)

y de su relacin masa carga, respectivamente. Una ventaja adicional, es que

tambin puede obtenerse el peso molecular antes de conocer con certeza toda
la estructura molecular (ver tutorial ANEXO).
Por ltimo, es importante mencionar que el anlisis integrado de la informacin
que proporcionan dos o ms tcnicas espectroscpicas es mucho ms valioso
que la informacin que brinda cada espectro por aparte para establecer de
manera inequvoca la estructura de una molcula.

TUTORIAL DE ESPECTROSCOPA DE LA UNIVERSIDAD DE MURCIA.

ESPAA:
Link de acceso: http://www.um.es/dete/tutoriales/granada/espec/gra_conte.html