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Unidad 1. Biotransformaciones
Ingeniera en Biotecnologa
Quinto semestre
Ingeniera en biorreactores I
Unidad 1. Biotransformaciones
Clave
19143525
Ingeniera de Biorreactores I
Unidad 1. Biotransformaciones
Presentacin de la unidad
Sabas que hoy en da las transformaciones biolgicas de la materia tienen gran auge
y que los bioprocesos son indispensables para la produccin de antibiticos, probiticos,
biopolmeros, biocombustibles?
La respuesta a esta pregunta tiene fundamento en las biotransformaciones, que son
aquellos procesos por los que una sustancia se convierte en otra a travs de una
reaccin bioqumica o un conjunto de ellas. Estos procesos pueden llevarse a cabo en
equipamientos especficos denominados biorreactores.
Para ser capaz de disearlos, es necesario, como punto de partida, que comprendas
cules son las sustancias y factores que pueden o no favorecer dichos bioprocesos; de
ah la importancia del estudio de esta primera unidad.
Para comenzar, debes considerar que la velocidad de una reaccin qumica se aumenta o
disminuye agregando una sustancia llamada catalizador.
En el caso particular de las reacciones qumicas orgnicas, estos biocatalizadores
reciben el nombre de enzimas, las cuales hacen posibles los procesos de degradacin de
algunas sustancias complejas; la transformacin de una en otra o la produccin de
nuevos compuestos a partir de otros ms pequeos (figura 1).
Nuevos compuestos
Sustrato
Enzima
Figura 1. Representacin del proceso de degradacin de una sustancia (sustrato) por una enzima.
Fuente: personas.ya.com, s.f.
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Propsitos de la unidad
El estudio de esta unidad te permitir:
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Competencia especfica
Sacarosa
Fructosa
Enzima
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presentes, dan lugar a la formacin de una sustancia semislida y fcil de almacenar que
conoces con el nombre de queso.
Te imaginas todo lo que puedes llegar a crear a partir de las biotransformaciones? Hoy
da se acepta incluso, que estos procesos sustituirn en gran parte a la sntesis orgnica,
con lo que, se evitarn problemas de contaminacin ambiental, ya que los
biocatalizadores son biodegradables, las condiciones suaves de trabajo implican poco
consumo energtico y por tanto, poco costo y emisin de contaminantes.
A travs del desarrollo del presente tema comprenders la importancia de la biocatlisis
en los procesos industriales, as como las ventajas y desventajas de su uso, lo que te
permitir analizar el empleo de enzimas dentro de los bioprocesos.
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Etapa 1
Etapa 2
Etapa 3
Etapa 4
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Pues bien, las enzimas son complejos protenicos, encargados de disminuir la energa
necesaria para que se realicen reacciones qumicas al interior de los organismos
biolgicos (figura 5).
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Cofactor
Sitio activo
Coenzima
Apoenzima
Holoenzima
Figura 7. Holoenzima-apoenzima. Fuente: Pearson Education, 2006.
Para concluir este tema, es importante enfatizar que los procesos de biotransformacin
o biocatlisis son importantes ya que reducen riesgos de contaminacin, esta es una de
las razones por las que se han convertido en una herramienta valiosa para la sociedad,
especialmente dentro del campo industrial.
La naturaleza proteica de los biocatalizadores permite que las molculas se degraden
fcilmente, recuerda que en contraposicin hay catalizadores qumicos que, al estar
constituidos por metales pesados, son difciles de destruir. Sin duda, las ventajas de los
biocatalizadores no slo se limitan al aspecto ambiental, sino tambin al desarrollo de
diversas reas industriales, tales como: la farmacutica, la alimentara, la de cosmticos,
entre otras.
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Figura 8. La catlisis permite que las reacciones costosas transcurran por caminos mucho ms
sencillos. Fuente: WILEY-VCH, 2008.
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Etapa 2
Etapa 1
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Donde:
k1, k2, k3=constantes microscpicas de velocidad
[E]=concentracin de enzima libre
[S]=concentracin de sustrato
[ES]=concentracin del complejo enzima-sustrato
Dado que la concentracin de enzima permanece constante a lo largo de la reaccin, la
concentracin total de enzima se puede expresar como:
[
[ ]
Donde:
[ET]=concentracin total de enzima
Despejando [E] de la expresin anterior, se tiene que:
[ ]
]
[ ][ ], se tiene:
]
][ ]
])[ ]
[
][ ]
Este modelo cintico adopta la hiptesis del estado estacionario, segn la cual la
concentracin del complejo enzima-sustrato es pequea y constante a lo largo de la
reaccin. Por tanto, la velocidad de formacin del complejo enzima-sustrato (v1) es igual a
la de su disociacin (v2 + v3):
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][ ]
][ ]
][ ]
][ ]
][ ]
][ ]
]) ( )
][ ]
Despejando la [ES]:
][ ]
] ([ ]
][ ]
] ([ ]
][ ]
Sustituyendo
][ ]
[ ]
, se tiene:
][ ]
[ ]
Donde:
km=constante de Michaelis-Menten
Sustituyendo la expresin anterior, en la ecuacin de velocidad de formacin del producto,
se tiene:
[ ]
[
][ ]
[ ]
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El valor de Vmax se puede determinar a partir del valor mximo obtenido de la curva;
mientras que la km corresponde a la concentracin de sustrato a la cual la velocidad de la
reaccin es la mitad de la Vmax.
Otra forma de determinar las constantes cinticas, es a travs de la representacin de
Lineweaver-Burk, en la que se grfica el inverso de la velocidad inicial contra el inverso
de la concentracin de sustrato.
A partir de este grfico, que corresponde con una lnea recta, se toman las siguientes
consideraciones:
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En conclusin, existen mtodos grficos que facilitan el clculo preciso de km y Vmax. Los
cuales se hacen a partir de la manipulacin matemtica de los datos empleados para la
representacin de Michaelis-Menten y de Lineweaver-Burk (figura 12).
Para seguir documentndote y comprendiendo el subtema,
es recomendable que realices la lectura del artculo Anlisis
informtico de cintica enzimtica por medio de macros de
Ms Excel de Maldonado et al. (2004), en el que se presenta
que mediante el empleo de una hoja de clculo, es posible
evaluar la velocidad de la reaccin en un tiempo dado y a
diferentes concentraciones tanto del sustrato como de un
inhibidor. Tambin podrs entender cmo se efectan los
grficos de Michaelis-Menten y de Lineweaver-Burk y el
clculo de Vmax y km.
Posteriormente, te invitamos a revisar los documentos Enzimas de la Universidad del Pas
Vasco (2012) y Enzimas II de la Universidad de Huelva (2012), en los que se exponen: la
nomenclatura, clasificacin y modo de accin de las enzimas; as como, una introduccin
a la cintica enzimtica en la que debers prestar especial atencin a la ecuacin de
Michaelis-Menten y a la representacin de Lineweaver-Burk.
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Todos los fenmenos descritos indican que existen factores que son capaces de modificar
la velocidad de una reaccin enzimtica.
Un claro ejemplo donde se observa la influencia de la temperatura sobre un biocatalizador
en la vida cotidiana, es en la cocina de tu casa. Por ejemplo, un pastel al ser horneado
acelera las reacciones que transforman la mezcla lquida en un producto esponjoso o
cuando los alimentos se guardan en lugares fros, debido a la baja temperatura, se
retardan las reacciones que los descomponen.
Ahora bien, existen sustancias que son capaces de modificar la velocidad de reaccin
enzimtica pero hacindola ms lenta, es decir, la retrasan. A estas sustancias se les
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1.3.1. Especificidad
Tal como se mencion en la introduccin del tema, la velocidad de una biotransformacin,
catalizada por enzimas, se ve modificada por diversos factores fisicoqumicos, entre los
que se encuentra la especificidad.
Los biocatalizadores son especficos para un determinado tipo de sustrato, o bien de
reaccin.
Cuando la enzima slo puede actuar sobre un tipo de sustrato, se dice que muestra
especificidad absoluta. Si puede actuar sobre sustratos con estructuras muy similares,
se dice que muestra especificidad relativa.
De acuerdo a Rebolledo, L. y Rebolledo, I. (s.f.), la especificidad est determinada por el
sitio activo de la enzima, es decir, el sector de la molcula que contiene los grupos
funcionales particulares que le permiten unirse especficamente con el sustrato.
Generalmente el sitio activo se encuentra en una grieta, en una leve depresin en la
superficie de la molcula proteica. La geometra del sitio activo est estrechamente
relacionada con la conformacin tridimensional de la molcula del sustrato.
Las enzimas aceleran las reacciones alterando la conformacin de sus sustratos para que
logren llegar al estado de transicin. El modelo ms simple para entender esta interaccin
enzimasustrato es el modelo de llave-cerradura, en el cual el sustrato encaja
perfectamente en el sitio activo de la enzima.
En muchos casos, las conformaciones tanto de la enzima como del sustrato son
modificadas cuando logran unirse: es el llamado modelo de encaje inducido. Esta
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1.3.2. Desnaturalizacin
Otros de los factores que afectan la actividad enzimtica es la temperatura. Los aumentos
de temperatura aceleran las reacciones enzimticas, por cada 10C de incremento, la
velocidad de reaccin se duplica. Sin embargo, cuando la temperatura es muy elevada,
dichos biocatalizadores se desnaturalizan, es decir, sufren un cambio en su estructura,
por lo que se observa prdida de actividad cataltica hasta la anulacin.
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Otros factores que intervienen en esta modificacin son: el pH, los cambios de
concentracin, la velocidad de agitacin o la presencia de agentes desnaturalizantes
(figura 14).
1.3.3. pH
Los aminocidos que forman a las enzimas estn ionizados, es decir, se encuentran
cargados positiva o negativamente, dependiendo el pH del medio. Los biocatalizadores al
contener ambas cargas a lo largo de su cadena, experimentan fuerzas de atraccin y
repulsin que permiten el mantenimiento de la estructura tridimensional de la protena.
Cualquier modificacin del pH, por encima o debajo del ptimo, afecta drsticamente la
actividad enzimtica.
De acuerdo a Merino, P. J. y a Noriega, B. M. J. (s.f.), dependiendo del pH del medio en el
que se encuentren las enzimas pueden no tener carga, o por el contrario estar cargados,
bien positiva o negativamente. Estas cargas sirven para estabilizar la conformacin
natural de la protena y cuando el pH las cambia, tambin se modifica la estructura,
llevando en ltimo extremo a la desnaturalizacin de la protena, y en el caso de las
enzimas a la prdida de actividad.
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1.3.4. Temperatura
La velocidad de una reaccin enzimtica vara al aumentar la temperatura. Esto es, la
velocidad de una reaccin enzimtica se incrementa al aumentar la temperatura dentro de
un determinado rango, alcanzando un valor mximo a la denominada temperatura
ptima. A valores superiores la actividad disminuye debido a que el enzima, como
cualquier otra protena, sufre procesos de desnaturalizacin y, por lo tanto, de inactivacin
(Tena, A. M. y Jorrn, N. J. V, s.f.) (figura 16).
1.3.5. Inhibicin
La actividad enzimtica disminuye por accin de sustancias que se unen fuertemente al
sitio activo y bloquea la entrada del sustrato. Dichas sustancias reciben el nombre de
inhibidores, (figura 17) los cuales pueden ser:
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Figura 17. Efecto del inhibidor en la actividad enzimtica. Fuente: Luengo, L., s.f.
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[ ]
[ ]
(
[]
)(
[]
En la inhibicin acompetitiva (figura 20) el inhibidor se enlaza al centro activo pero solo
despus de que el sustrato lo haya hecho y, por tanto, el inhibidor y el sustrato no
compiten.
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Impedimento del paso de sustrato al centro activo por bloqueo durante la unin
al soporte.
Los grupos reactivos del soporte reaccionan con algn grupo del centro activo
de la enzima esencial para la actividad cataltica.
Durante la unin al soporte se puede originar cambio en la estructura
tridimensional de la enzima.
Las condiciones del proceso pueden causar desnaturalizacin.
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Figura 21. Simulacin del efecto de la inmovilizacin en la actividad enzimtica. Fuente: Tripod,
s.f.
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Vo (m/s)
2.5
4.0
6.3
10
7.6
20
9.0
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Autoevaluacin
Con el propsito de apoyarte a identificar tus reas de oportunidad, es importante que
realices la autoevaluacin. Lee cuidadosamente las preguntas que a continuacin se
presentan y selecciona la opcin que consideres correcta.
Al concluir, verifica tus repuestas en el Apndice de respuestas. En caso de obtener ms
de 6 respuestas incorrectas, se recomienda revisar nuevamente los temas.
1. Son aquellos procesos que emplean enzimas para la conversin de sustratos y
obtener un producto de amplia utilidad.
a) Biotransformacin
b) Qumicos convencionales
c) Fisicoqumicos convencionales
d) Fisicoqumicos no convencionales
2. Indica cuales de las siguientes aseveraciones son verdaderas (V) y cuales falsas (F).
I.
Los biocatalizadores son molculas de naturaleza proteica.
II.
Para el desarrollo de un bioproceso se debe seleccionar un organismo que sea
capaz de producir una cantidad baja de metabolitos secundarios que faciliten la
generacin del producto de inters.
III.
La composicin de los biocatalizadores permite que las molculas se degraden
fcilmente.
IV.
Las ventajas de los biocatalizadores slo se limitan al aspecto ambiental.
V.
Los biocatalizadores, actan sobre un sustrato, al unirse a l, a travs del sitio
activo, con lo que se forma el complejo enzima-sustrato, que posteriormente da
lugar al producto de inters.
a) 1V, 2V, 3F, 4F, 5V
b) 1F, 2V, 3F, 4V, 5V
c) 1V, 2F, 3V, 4F, 5V
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Desarrollo
En el artculo propuesto para el desarrollo de la presente evidencia, se muestra el estudio
de cintica de la Ficina, una enzima proteoltica que hidroliza pptidos, amidas y steres.
Se describe el mecanismo de la reaccin cataltica, as como, la deduccin de la
ecuacin de Michaelis-Menten.
Para realizar este trabajo, considera la rbrica de evaluacin.
1. Leer el documento Estudio cintico de la actividad proteoltica de la enzima Ficina
(Bertoluzzo et al., 2008). Realiza una ficha tcnica del artculo, la cual debe incluir:
a) La funcin de la Ficina.
b) Las fuentes de obtencin de la Ficina de ltex.
c) La informacin que proporciona la cintica de Michaelis-Menten.
d) Las etapas de las reacciones catalizadas enzimticamente.
2. Identifica la Tabla 1. Velocidad inicial para distintas concentraciones de BAPNA, en
el artculo proporcionado y calcula los siguientes cocientes: 1/[BAPNA] y 1/V0 para
cada uno de los datos proporcionados en la Tabla 1. Registra los resultados
obtenidos en el siguiente cuadro:
[BAPNA]
M
V0
Ab/s
1/[BAPNA]
1/V0
3. Grafica los datos [BAPNA] contra V0, que corresponden a los ejes de las abscisas y
de las ordenadas, respectivamente e indica si la cintica obtenida corresponde a la
propuesta por Michaelis-Menten. Justifica tu respuesta.
4. Elabora el grfico de Lineweaver-Burk, donde los datos de 1/[BAPNA] y 1/V0,
corresponden a los ejes de las abscisas y de las ordenadas, respectivamente.
5. Efecta la lnea de tendencia o regresin lineal.
6. Escribe la ecuacin del grfico.
7. Identifica el valor de la pendiente (m), ya que m=km/Vmax; y el de la interseccin con
el eje y (b).
8. Calcula las contantes cinticas km y Vmax. Recuerda que:
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Cierre de la unidad
A lo largo de la unidad abordaste aspectos relacionados con las biotransformaciones y el
modo en que son catalizadas para incrementar o disminuir la velocidad de la reaccin.
De esta forma, has logrado:
Para saber ms
Puedes consultar el video realizado por Gonzlez et al. (2010), de Investigadores del 4to.
Grado de PEDECIBA Qumica. El propsito de este documental es profundizar en el
concepto de biocatlisis, sus aplicaciones, usos y fuentes de diversas enzimas con fines
tecnolgicos
(http://www.youtube.com/watch?feature=player_detailpage&v=VgqJ88vBc2E).
Posteriormente, es recomendable que consultes el video desarrollado por el Instituto de
Biotecnologa de la UNAM, campus Morelos (2009), en el que se presenta como la
biocatlisis es importante para reducir, en el ambiente, los impactos negativos
ocasionados por sustancias provenientes de diversos procesos industriales
(http://www.youtube.com/watch?v=kXyCaS6HQ7g&feature=player_detailpage).
Enseguida puedes consultar el problemario propuesto por el Departamento de Bioqumica
y Biologa Molecular de la Universidad de Alcal (2010), en que se podrs visualizar y
analizar paso a paso la resolucin de problemas relacionados con la ecuacin de
Michaelis-Menten, y el clculo de las constantes cinticas km y Vmax
(http://www2.uah.es/sancho/farmacia/problemas%20cinetica%20enzimatica%201011%20con%20respuestas.pdf).
La consulta de la liga: http://csm.jmu.edu/biology/courses/bio220/aotw3.html en el
apartado The model/kinetics_model.xls de Jonathan Monroe (2004), te permitir
descargar los clculos en formato Excel de cintica enzimtica, que te ayudar a
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Fuentes de consulta
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Rebolledo, L., Rebolledo, I. (s.f.). Enzimas. Recuperado de:
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Complementarias:
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