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Existen numerosas razones para afirmar que las enzimas son protenas, todas las
enzimas son protenas; sin excepciones, aunque no todas las protenas son enzimas. La
mayor parte de enzimas son de localizacin celular (solubles o en membranas) o
extracelular (enzimas digestivas); algunas de naturaleza ribonucleica y denominadas
ribozimas.
La existencia de actividades catalticas de origen biolgico fue descrita en el siglo
XIX.En el ao 1878, Khne propuso el trmino enzima (etimolgicamente "en la
levadura") y Bchner en 1897, demostr que las enzimas podan operar en ausencia de
clulas intactas.
Entre las similitudes que comparten las enzimas y las protenas, las ms relevantes son:
Virtualmente todas las reacciones qumicas tienen una barrera energtica que separa a
los reactivos, reactantes o substratos de los productos. Esta barrera se denomina
energa libre de activacin que es la diferencia en energa que existe entre los reactivos
y los productos. El lugar donde la energa libre de activacin es mxima, se denomina
Velocidad de reaccin.
Las molculas que reaccionarn en un evento qumico, deben contener suficiente
energa para sobrepasar la energa de activacin del estado de transicin en su camino
para transformase en los productos. En ausencia de la enzima, solo una pequea porcin
de la poblacin de estas molculas posee la energa suficiente para realizar la transicin
hacia los productos. La velocidad de la reaccin estar determinada por el nmero de
molculas que se encuentren en ese estado energtico particular. En general, al
disminuir la energa de activacin, la mayora de las molculas tienen energa suficiente
para pasar sobre el estado de transicin y por tanto aumenten la velocidad de la
reaccin.
Va de reaccin alterna
Una enzima permite que una reaccin se lleve a cabo rpidamente bajo las condiciones
que reinan en la clula. Lo anterior se realiza al disminuir la energa de activacin. La
enzima no modifica la energa contenida en los reactivos o producto; de la misma
forma, no altera el equilibrio de la reaccin
El sitio activo de las enzimas no es un receptculo pasivo para la unin del substrato,
por el contrario es una maquinaria molecular muy compleja que emplea una amplia
diversidad de mecanismos qumicos que facilitan la interconversin de los substratos y
los productos. Dentro de los factores que estn relacionados con la eficiencia cataltica
de las enzimas estn los siguientes:
Otros factores
El sitio activo posee grupos catalticos que incrementan la probabilidad de que se forme
el estado de transicin. En algunas enzimas, estos grupos pueden participar en una
catlisis tipo cido-base en la cual algunos residuos de aminocidos proveen o aceptan
protones. En otras enzimas, la catlisis involucra la formacin temporal de un
complejo covalente enzima-substrato.
REGULACIN DE ACTIVIDAD ENZIMTICA:
La interconversin de biomolculas dentro de la clula se da a partir de vas o rutas
metablicas, secuencias de reacciones qumicas catalizadas por enzimas que llevan a la
produccin de los diferentes componentes celulares. Estas vas pueden ser denominadas
anablicas cuando estn destinadas a la sntesis de un compuesto a partir de precursores
ms pequeos, o catablicas, cuando proceden en el sentido de degradar compuestos.
Algunas vas pueden ser consideradas como anfiblicas, cuando pueden proceder en
uno u otro sentido, y generalmente comparten algunas enzimas. Consideremos el
camino anfiblico: donde E1, E2 y E3 son las enzimas que catalizan cada una de las
reacciones. Como vemos es imposible controlar el flujo en una sola direccin sin afectar
la otra. Por eso, lo que se observa en general es que las etapas regulatorias de una va
metablica anfiblica estn organizadas de la siguiente manera:
Es decir que siempre habr por lo menos una enzima nicamente perteneciente a una de
las direcciones metablicas. Adems, por lo general estas reacciones son irreversibles
(G<<0)
Las necesidades fisiolgicas de cada clula hacen que las vas metablicas sean capaces
de cambiar rpidamente de velocidad o sentido. En realidad, no todas las vas
metablicas funcionan a su mxima capacidad al mismo tiempo y ms an, existen rutas
que en ciertas fases del ciclo celular son anuladas por completo. La situacin contraria
implicara un despilfarro de metabolitos y energa para las clulas (ver ciclos ftiles). El
control del funcionamiento de las diferentes rutas metablicas se realiza modulando la
actividad de una o ms enzimas claves de la va (enzimas regulatorias). Esta regulacin
no se da en todas las enzimas de la va, sino casi siempre en aquellas que son nicas
para la va (ver ejemplo anterior). Los seres vivos han desarrollado diferentes estrategias
para lograr la regulacin mencionada: - Compartamentalizacin - Regulacin de la
cantidad absoluta de enzima - Regulacin de la actividad enzimtica: mediada por
metabolitos modificacin covalente modificacin de la estructura cuaternaria
unin a otras protenas activacin proteoltica irreversible Isoenzimas.
Cuando un sistema o proceso es capaz de variar su comportamiento como respuesta a
cambios que se produzcan en su entorno, de forma que la respuesta directa o
indirectamente tiende a modificar el estmulo para volver a la situacin inicial se dice
que este sistema est regulado.
COMPONENTES DE UN SISTEMA DE REGULACIN.
(S) Seal, que existe generalmente como la concentracin de una sustancia especfica
cuya variacin la convierte en estmulo (E), que es captado por el receptor (R).
El transductor (T) convierte al estmulo en una seal interna del sistema que bien puede
trasmitirse al amplificador (A) que aumenta la intensidad de la seal o pasar de manera
directa al efector (E) que da lugar a la aparicin de la respuesta. Esta respuesta, tarde o
temprano, modifica el estmulo inicial, cerrando el ciclo de regulacin.
REGULACIN ALOSTRICA.
Cada vez es ms numerosa la cantidad de enzimas que al estudiarse el comportamiento
de la velocidad de reacciones, por ellas catalizadas en funcin de la concentracin de
sustratos, se obtienen curvas diferentes a la hiperblica de Michaellis y Menten, que en
la mayora de los casos tienen un aspecto sigmoidal (en forma de S alargada). Estas
curvas se desplazan a lo largo del eje de las abcisas cuando se aade a la reaccin
algunas sustancias especficas como se muestra en la grfica para la enzima
Fosfofructoquinasa. Para la misma concentracin de sustrato ( So) pueden obtenerse
diferentes velocidades de reaccin al variar la concentracin de las sustancias aadidas,
luego una caracterstica esencial de estas enzimas es presentar una actividad variable.
Las enzimas que as se comportan reciben el nombre de alostrica.
La grfica que se muestra a continuacin representa la modificacin de la actividad de
una enzima alostrica. La fosfofructoquinasa es una enzima alostrica como se deduce
del comportamiento de su velocidad al variar la concentracin de sustrato. La presencia
de ATP desplaza la curva hacia la derecha y por tanto acta como un inhibidor. La
concentracin de ADP desplaza la curva hacia la izquierda, actuando como un activador.
Se han propuesto varios modelos para explicar las causas del comportamiento de las
enzimas alostricas, existiendo dos modelos principales: el simtrico o concertado y el
secuencial.
Segn el modelo simtrico o concertado las enzimas alostricas existen en dos estados
conformacionales interconvertibles, que se denominaron ( R ) relajado y (T) tenso.
Estas enzimas son oligomricas, formadas por varias subunidades (estructura
cuaternaria) y todas estas se encuentran en el mismo estado conformacional, de ah el
nombre de simtrico.
A la enzima puede unirse no solo el sustrato, sino algunas sustancias especficas
(ligandos), pero la enzima presentar diferente afinidad para cada uno de ellos de
acuerdo al estado conformacional en que se encuentre.
Si el sustrato puede unirse al estado R y no al T, entonces R representa la conformacin
activa, pues no puede haber transformacin sin unin, lo que indica que en el estado R
existe una conformacin del centro activo que facilita la unin del sustrato, mientras que
en el estado T la unin del sustrato al centro activo no es posible.
Adems del centro activo, existen en las subunidades otros sitios de unin especficos
para los ligandos, pero tambin cada sitio presenta una conformacin adecuada para
cada ligando solo en un de sus dos conformaciones, nunca en las dos. Estos sitios son
muy especficos, en lo cual se parecen al centro activo pero en ellos no se producen la
transformacin del ligando; los ligandos se unen a estos sitios por fuerzas no covalentes
y de forma muy reversible; cuando la concentracin de un ligando aumenta en el medio
se favorece su asociacin, y al disminuir ocurre la disociacin. La existencia de estos
sitios es lo que determin la denominacin de alostrico; por tanto las enzimas
alostricas son aquellas que presentan otros sitios diferentes al centro activo, que al
igual que este son sitios de reconocimiento molecular.
Veamos un ejemplo: Una enzima con 3 ligandos, uno de los cuales es el sustrato (S), los
dems son el ligando A que slo puede unirse al estado R y el I que slo lo hace al
estado T.
En ausencia de los 3 ligandos la enzima existe en un equilibrio entre los dos estados
conformacionales, caracterizados por una constante de equilibrio que recibe el nombre
de constante alostrica (L).
Se observa que existen 4 formas para el estado activo y slo la forma R est en
equilibrio con T, por lo que los incrementos de velocidad son considerables.
A las sustancias que como A se unen al estado activo y con ellos favorecen un
incremento de la velocidad de reaccin se les llama efectores positivos o activadores
alostricos.
Si en vez de A, al sistema en equilibrio se le aade el ligando I este se une al estado T ,
formando el complejo TI que provoca un desplazamiento del equilibrio en el sentido
contrario al anterior, con lo cual la concentracin del estado T aumenta y la del R
disminuye, mientras mayor sea la concentracin de I aadido, mayor ser la fraccin de
enzimas en estado T, lo que provoca una disminucin en la velocidad de reaccin, pues
es menor el nmero de centros activos con la formacin favorable para la unin con el
sustrato.
A las sustancias que como I se unen al estado inactivo y que provocan una disminucin
de la velocidad de la reaccin se les conoce como efectores negativos o inhibidores
alostricos.
Modelo secuencial:
Cintica enzimtica
En primer lugar el sustrato (S) y la enzima (E) se unen y forman un complejo enzimasustrato (ES). Una vez formado el complejo ES, este o bien se disocia en enzima ms el
sustrato o se transforma el sustrato en producto formado el complejo enzima-producto
(EP), que se disocia para dar enzima (E) ms producto (P).
El proceso fue modelizado por Michaelis y Menten y le permitio obtener una ecuacin,
ecuacin de Michaelis-Mente en donde la velocidad de la accin de un enzima es
funcin de la cantidad de sustrato presente, la cantidad de enzima y las caractersticas
del enzima, la afinidad del enzima por el sustrato y el poder cataltico del enzima:
La Km nos da una idea la afinidad que tiene el enzima por su sustrato, cuanto mayor es
Km menor es la afinidad (predominan las formas E y S libres), cuanto menor es Km
mayor es la afinidad (predomina la forma ES).
La velocidad mxima Vmx estima el nmero de centros activos del enzima. Recordar
que hemos definido la Vmx como la velocidad que obtendramos cuando todo el
enzima se encuentra unido al sustrato. A la constante k2 (poder cataltico del enzima) se
la reconoce con el nombre de nmero de recambio, es el nmero de molculas de
sustrato convertidas en producto por unidad de tiempo. Por lo que la Vmx depende de
dos cosas, la cantidad de enzima presente y la capacidad cataltica del enzima, es decir
la velocidad con que transforma al sustrato.
La representacin grfica de la velocidad en fucin de la concentracin de sustrato:
Del estudio del modelo se desprende que la velocidad de transformacin de sustrato en
producto en una reaccin enzimtica depende:
En la ingeniera gentica las llamadas enzimas de restriccin, que son aquellas capaces
de identificar una determinada secuencia de nucletidos en una molcula de ADN, son
utilizadas para realizar manipulacin gentica como en el caso de deteccin de ADN en
criminalstica.
BIBLIOGRAFIA