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precipitacin no es igual para todas las protenas, lo que permite usar sta
propiedad para la separacin y purificacin de protenas particulares a partir de
mezclas complejas.
Comnmente se usa sulfato de amonio (NH4)2SO4 para tal fin, a causa de su
gran solubilidad (760 g de sulfato de amonio/1000 ml. de agua a una
temperatura de 20C) y porque el in sulfato divalente permite alcanzar altas
fuerzas inicas. La adicin gradual de sta sal permite el fraccionamiento de
una mezcla de protenas, las cuales son precipitadas pero no desnaturalizadas.
La cantidad de protenas en la muestra analizada puede estimarse por diversos
mtodos.
La mayora de las protenas absorben a 280 nm, y a bajas concentraciones, lo hacen
de manera proporcional con su concentracin. Este es un mtodo rpido y sencillo
pero tiene la desventaja es que la muestra debe estar pura, ya que otras molculas
no-proteicas como el DNA, tambin absorben a esa longitud de onda. Por otro lado,
los ensayos colorimtricos involucran la adicin de una sustancia qumica que es
capaz de reaccionar con determinados residuos aminoacdicos. El resultado de estas
reacciones es el cambio de color en la solucin, que es cuantificado mediante una
medida de absorbancia. En general, estos mtodos son ms sensibles que la
cuantificacin por absorbancia directa a 280 nm. Posteriormente, para determinar la
concentracin de protenas totales de la muestra a analizar los resultados de
absorbancia se interpola a un curva de calibracin construida utilizando una protena
estndar, por lo general albmina srica bovina (BSA bovine seric albumin), cuya
concentracin es conocida.
Los ensayos colorimtricos ms utilizados son:
Ensayo de Lowry (750 nm): se trata de una reaccin de redox con los enlaces
peptdicos y con los aminocidos Tyr, Trp y Cys. Es rpido, sencillo y
relativamente sensible. Como desventaja, es afectado por un amplio rango de
compuestos no proteicos como EDTA, sulfato de amonio, Tritn X-100. Sin
embargo existen variables que pueden realizarse para evitar estas
interferencias, que estn disponibles comercialmente.
DESARROLLO
PROTENA
Las protenas son macromolculas formadas por cadenas lineales de aminocidos. El
nombre protena proviene de la palabra griega ("prota"), que significa "lo
primero" o del dios Proteo, por la cantidad de formas que pueden tomar.
Las protenas desempean un papel fundamental en los seres vivos y son las
biomolculas ms verstiles y ms diversas.
Realizan una enorme cantidad de funciones diferentes, entre las que destacan:
Las protenas de todo ser vivo estn determinadas mayoritariamente por su gentica
(con excepcin de algunos pptidos antimicrobianos de sntesis no ribosomal), es
decir, la informacin gentica determina en gran medida qu protenas tiene una
clula, un tejido y un organismo.
Las protenas se sintetizan dependiendo de cmo se encuentren regulados los genes
que las codifican. Por lo tanto, son susceptibles a seales o factores externos. El
conjunto de las protenas expresadas en una circunstancia determinada es
denominado proteosoma.
CARACTERSTICAS
Los prtidos o protenas son biopolmeros, es decir, estn constituidas por gran
nmero de unidades estructurales simples repetitivas (monmeros). Debido a su gran
tamao, cuando estas molculas se dispersan en un disolvente adecuado, forman
siempre dispersiones coloidales, con caractersticas que las diferencian de las
disoluciones de molculas ms pequeas.
Por hidrlisis, las molculas de protena se escinden en numerosos compuestos
relativamente simples, de masa molecular pequea, que son las unidades
fundamentales constituyentes de la macromolcula. Estas unidades son los
aminocidos, de los cuales existen veinte especies diferentes y que se unen entre s
mediante enlaces peptdicos. Cientos y miles de estos aminocidos pueden participar
en la formacin de la gran molcula polimrica de una protena.
Todas las protenas tienen carbono, hidrgeno, oxgeno y nitrgeno y casi todas
poseen tambin azufre. Si bien hay ligeras variaciones en diferentes protenas, el
contenido de nitrgeno representa, por trmino medio, 16% de la masa total de la
molcula; es decir, cada 6,25 g de protena contienen 1 g de N. El factor 6,25 se utiliza
para estimar la cantidad de protena existente en una muestra a partir de la medicin
de N de la misma.
La sntesis proteica es un proceso complejo cumplido por las clulas segn las
directrices de la informacin suministrada por los genes.
Las protenas son largas cadenas de aminocidos unidas por enlaces peptdicos entre
el grupo carboxilo (-COOH) y el grupo amino (-NH2) de residuos de aminocido
adyacentes. La secuencia de aminocidos en una protena est codificada en su gen
(una porcin de ADN) mediante el cdigo gentico. Aunque este cdigo gentico
especifica los 20 aminocidos "estndar" ms la selenocistena y en ciertos Archaea
la pirrolisina, los residuos en una protena sufren a veces modificaciones qumicas
en la modificacin postraduccional: antes de que la protena sea funcional en la clula,
o como parte de mecanismos de control. Las protenas tambin pueden trabajar juntas
para cumplir una funcin particular, a menudo asocindose para formar complejos
proteicos estables.
FUNCIONES
Las protenas ocupan un lugar de mxima importancia entre las molculas
constituyentes de los seres vivos (biomolculas). Prcticamente todos los procesos
biolgicos dependen de la presencia o la actividad de este tipo de molculas. Bastan
algunos ejemplos para dar idea de la variedad y trascendencia de las funciones que
desempean.
Son protenas:
Casi todas las enzimas, catalizadores de reacciones qumicas en organismos
vivientes;
Muchas hormonas, reguladores de actividades celulares;
La hemoglobina y otras molculas con funciones de transporte en la sangre;
Los anticuerpos, encargados de acciones de defensa natural contra infecciones
o agentes extraos;
Los receptores de las clulas, a los cuales se fijan molculas capaces de
desencadenar una respuesta determinada;
La actina y la miosina, responsables finales del acortamiento del msculo
durante la contraccin;
El colgeno, integrante de fibras altamente resistentes en tejidos de sostn.
ESTRUCTURA
Es la manera como se organiza una protena para adquirir cierta forma. Presentan una
disposicin caracterstica en condiciones fisiolgicas, pero si se cambian estas
condiciones como temperatura, pH, etc. pierde la conformacin y su funcin, proceso
denominado desnaturalizacin. La funcin depende de la conformacin y sta viene
determinada por la secuencia de aminocidos.
Para el estudio de la estructura es frecuente considerar una divisin en cuatro niveles
de organizacin, aunque el cuarto no siempre est presente.
Conformaciones o niveles estructurales de la disposicin tridimensional:
Estructura primaria.
Estructura secundaria.
Nivel de dominio.
Estructura terciaria.
Estructura cuaternaria.
A partir del nivel de dominio slo las hay globulares.
tritn X-100, X-450 o incluso el Tween, se han utilizado para favorecer la lisis celular.
Los detergentes inicos son ms reactivos que los detergentes no-inicos y pueden
ocasionar la desnaturalizacin de muchas protenas.
La presencia de detergentes puede afectar tambin a las etapas posteriores de
purificacin, en particular a la precipitacin proteica por tratamiento con sales. Esto
puede superarse en muchos casos con el uso de cromatografa de intercambio inico
o por ultrafiltracin
el tritn X-100 ha sido empleado para la liberacin a gran escala del colesterol
oxidasa a partir de Nocardia sp y el colato sdico se ha utilizado para solubilizar
pululanasa una enzima ligada a membrana, a partir de clulas intactas de Krebsiella
pneumoniae.
Mtodos fsicos de lisis celular
Choque osmtico.
El choque
osmtico ha sido utilizado en la extraccin de enzimas hidroliticas y
protenas ligadas del espacio periplsmico de cierto nmero de bacterias Gramnegativas, incluyendo a Salmonella typhimurium y E. coli. El mtodo implica el lavado
del cultivo de bacterias en una solucin tampn para tratar de eliminar los restos del
medio de cultivo y posteriormente, por ejemplo, resuspenderlo en tapm con sacarosa
al 20%. Tras equilibrarse, las clulas se recogen y resuspenden rpidamente en agua
a una temperatura aproximada de 4C. Solamente un 4-8% de la protena total
bacteriana se libera por choque osmtico pero si la enzima requerida se localiza en la
regin peri plasmtica, el choque osmtico puede producir un incremento de 14 a 20
veces en la purificacin con otras tcnicas de extraccin.
El empleo del choque osmtico se est viendo favorecido con el incremento en el
nmero de protenas recombinantes que se secretan al periplasma.
Homogeneizacin con abrasivos.
Inicialmente esta tcnica se utilizaba para la homogeneizacin de pastas celulares en
un mortero con polvo abrasivo tal como cristal, almina o kieselguhr. El sistema ha
sido desarrollado y mecanizado utilizando dispositivos desarrollados originalmente
para la homogeneizacin hmeda y la dispersin de pigmentos en las industrias de
impresin y pintura. Un producto tpico, el Dynomill (w. a. Bachofen, Suiza) se emplea
para liberar protenas de una amplia variedad de microorganismos. Consiste en una
cmara que contiene bolsa de vidrio y varios discos fijos y rotatorios. La suspensin
celular se bombea en la cmara, y la rpida agitacin es suficiente para romper incluso
las bacterias ms resistentes. La cmara de desintegracin est refrigerada para
eliminar el calor que se genera.
Un elevado nmero de factores influyen en la proporcin de clulas lisadas, entre ellos
el tamao y concentracin de bolas de vidrio, el tipo, la concentracin y la edad de las
clulas, la velocidad de agitacin, el flujo a travs de la cmara, la temperatura de
ruptura y la disposicin de los discos del agitador, habindose investigado todos ellos
para levaduras y para bacterias.
Tamizacin slida
El mtodo implica la extrusin del material celular congelado a travs de un orificio de
pequeo dimetro y a una presin elevada, manteniendo la temperatura prxima a
-20C. Se ha descrito un proceso semicontinuo, basado en una prensa X a escala de
ligados a los
En este sentido, etapas en las que se produce una concentracin del producto, como
es la cromatografa de afinidad, hidrofobica o de intercambio inico deben realizarse
antes que aquellas que causan una dilucin, como es el caso de la filtracin a travs
de geles. La cromatografa de interaccin hidrofobica puede realizarse posteriormente
a una de intercambio inico con un cambio mnimo en el tampn, puesto que la
mayora de las protenas se unen mas fuertemente a un soporte hidrofobica a fuerzas
inicas altas.
LA CROMATOGRAFA DE AFINIDAD ES CAPAZ, POR SI SOLA, PARA LLEVAR A
CABO LA PURIFICACIN DE PROTENAS A ESCALA DE LABORATORIO.
Eleccin de la matriz
Quizs la decisin mas importante que se debe tomar cuando se disea un proceso de
purificacin a gran escala sea la concerniente a la seleccin del tipo de matriz de
cromatografa. Una matriz de cromatografa a gran escala deber ser hidrofilica,
macroporosa, rgida, con partculas esfricas, qumicamente estable, ligandos
delicados y de fcil modificacin.
Tabla 2 ejemplos de matrices para cromatografas a gran escalas. Este listado no es
exhaustivo, pero se pretende dar ideas acerca de la cantidad de material disponible.
Matriz
ejemplo
proveedor
Dextrosa con enlaces entrecruzados
Sephadex
1
Poliacrilamida con enlaces entrecruzados
Biogel-P
2
Agarosa
Sefarosa
1
Biogel-A
2
Ultrogel-A
3
Agarosa con enlaces entrecruzados
Sefarosa CL
1
Sefarosa FF
1
Superosa
1
Compuesto de poliacrilamida y dextrosa
Sephacry1
1
Compuesto de poliacrilamida y agarosa
UltragelAcA
3
Compuesto de dextrosa y agarosa
Superdex
1
Polmeros etilenglicol-metacrilato
Trisacry1
3
celulosa
Fractogel
4
Cellex
2
DE-52, CM-52
5
Sephacel
1
Cellufina
6
Polmeros orgnicos rgidos
Monobeads
1
TSK-PW
4
POROS
7
Slice porosa
Zorbax
8
Aquapore
9
Porosidad
Tipo de Matriz
Adsorci
n
noespecfic
a
Baja
Rigide
z
Estabilida
d
Facilidad
de
modificaci
n
Coste
relativo
Buena
Bajo/medio
Buena
Medio
Buena
Buena
Medio
Medio
Buena
Medio
Buena
Medio/alto
Buena
Medio
Buena
Medio
Buena
Deficiente
Buena
Bajo
Alto
Alto
Algunos geles, como los basados en agarosa o celulosa, son productos naturales;
otros, como aquellos basados en dextranos entrecruzados o agarosa, son productos
Naturales modificados; un tercer grupo esta basado en componentes totalmente
sintticos tales como la poliacrilamida, el polihidroxietilmetacrilato o el poliestireno.
Los geles pueden clasificarse adems en macroporosos, como los geles de agarosa o
de celulosa, o microporos como los geles de dextrano o de poliacrilamida con enlaces
entrecruzados. Los geles macroporosos son de mayor utilidad en la cromatografa de
afinidad o de intercambio ionico o para el fraccionamiento de molculas de gran
tamao, virus, protenas muy grandes, o micro protenas.
Los geles de microporosos son ms aplicados para el fraccionamiento de restos de
protenas. Los primeros geles con consistan en matrices de dextrano con enlaces
entrecruzados, celulosa, poliacrilamida, o agarosa, eran muy blandos no se
adecuaban fcilmente a procesos cromatogrficos a gran escala. La nueva generacin
de geles macroporosos a un que formados por un elevado numero de enlaces
entrecruzados, son matrices de agarosa o de poliacrilamida-agarosa, son mucho mas
rgidos y adecuados para purificacin a gran escala. Poseen un tamao de partcula
ms pequeo y mejor controlado, lo que permite una reproducibilidad mayor cuando
se usan grandes velocidades de flujo.
Gel filtracin
(2)
(3)
-CH2-N+-(CH3)3
-O-CH2-CH2-N+(C2H5)3
-O-CH2-CH2-N+(C2H5)2
Los intercambiadores celulsicos inicos son ideales para diversas operaciones como
primera etapa en varios procesos.
1 M KC1 + 2 mM NADH
1 M KC1 + 2 mM NADH
Gradiente 0-0,7 mM KC1
Carboxipeptidasa G2
Procin rojo H-8BN
Adsorbido en presencia
de 0,2 mM Zn2+ y tris
C1H 0,1 M, eluido con
10 mM EDTA pH 5,8y
despus, con tris-C1H
0,1 M pH 7.3
20 mM octanoato sdico
3 M NaCl, pH 8,6
Los colorantes son, a menudo, estructuras del tipo de la antraquinona, que unen
protenas por la interaccin con los dominios de unin a nucletidos de las
deshidrogenasas. Han sido aislados muchos otro tipos de protenas con estos
colorantes, por lo que se piensa que la interaccin especfica para cada caso debe ser
mas variable y, en las mayora de los casos, desconocida.
En los ltimos aos se han empleado de forma ms amplia la cromatografa de
inmunoafinidad debido a la mayor disponibilidad de anticuerpos monoclonales. Por
ejemplo, el interferon leucocitario recombinante y las tres hormonas pituitarias
humanas han sido purificadas usando esta tcnica.
Puesto que la cromatografa de afinidad presenta una alta selectividad, es por lo que
se pueden purificar protenas varios miles de veces en un solo paso. A menudo, es
posible separar formas activas e inactivas de una protena, mediante el uso de un
anticuerpo o pseudosubstrato, o eliminar una pequea cantidad de impureza de un
producto puro. Existen otros muchos ejemplos sobre la utilidad de esta metodologa en
procesos a gran escala, entre ellos estn los descritos por Hill y Hirtenstein y Clonis
Se pueden usar iones metlicos inmovilizados, como Zn2+ o Ni2+, para separar
protenas. Esta separacin depende de la interaccin entre el ion metlico y los
residuos de histidina de la superficie proteica. El ion se inmoviliza quelandolo a un
grupo iminodiacetato que, a su vez, est unido a una matriz adecuada, normalmente
agarosa. Las protenas unidas se pueden eluir usando un ligando competitivo, como
por ejemplo el imidazol.
Los criterios para elegir una matriz de cromatografa de afinidad son similares a
aquellos que se usan para cromatografa de intercambio inico. Como resultado de
ello, las ms usadas matrices macroporosas, como Sefarosa o Trisacryl. La matriz ha
de ser activada qumicamente para unir covalentemente al ligando. Existen muchos
mtodos para hacerlo, pero el ms habitual es el de bromuro de ciangeno. Tambin
se pueden adquirir matrices activadas de los proveedores de productos de
cromatografa si no se desea hacerlo por uno mismo. Los colorantes tienen la
ULTRAFILTRACION
CONCLUSION
La electroforesis constituye parte importante del procedimiento rutinario del anlisis de los cidos
nucleicos y protenas. Y as como el microscopio permite visualizar microorganismos y estructuras
similares, la electroforesis nos ayuda a observar los cidos nucleicos y protenas (de los cual se trato este
trabajo) al final del procedimiento.
El principio bsico de la electroforesis consiste en la migracin de las molculas a travs de un gel u otro
tipo de matriz de naturaleza porosa, en el cual, por accin de un campo elctrico, sern separadas de
acuerdo a su tamao o peso molecular. Para controlar el avance de la separacin de las molculas en la
matriz y establecer un patrn de fragmentos, las molculas debern ser teidas con diferentes colorantes.
Estos pasos facilitan la visualizacin de las molculas a manera de simples bandas las cuales sern
posteriormente analizadas e interpretadas.
En biologa molecular, la mayora de los estudios bsicos y aplicados requieren el uso de la electroforesis;
sin embargo, este procedimiento presenta variaciones de acuerdo al tipo de estudio que se piensa
ejecutar. En la electroforesis de tipo vertical, se analizan tanto molculas de ADN como protenas,
mientras que en la electroforesis
horizontal generalmente se trabaja con ADN o ARN. De otro lado, existen otros mtodos electroforticos
que presentan ciertas modificaciones, as tenemos la electroforesis en campo pulsado, mayormente
usada para separar fragmentos
muy grandes de ADN (ADN genmico), la electroforesis bidimensional para un anlisis ms sofisticado de
las protenas etc.
Es importante sealar que la electroforesis en asociacin con otras tcnicas tales como PCR, e
hibridacin, brinda una gran ayuda en el campo de la salud. Gracias a esta tcnica es posible visualizar
las bandas de ARN o ADN de patgenos, detectar cambios o mutaciones a nivel gentico, visualizar una
nueva protena, entre otros.
REFERENCIAS:
CAPITULO 17
Etapas posteriores de procesamiento: extraccin y purificacin de protenas
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